| New junction evidence | |||||||||||
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TGGCCGTGCGACTAGAGAAAGGAGAAACACGGTGAACATTACACAGTTGAAAGCGGCCCTGCCGCGTGAGTTGCTGGCGTCGGTGGTGGTCTTCCTGGTGGCCTTGCCGTTGTGCATGGGCATTGCGATCGCTTCTGGCATGCCGCCGGCAAAAGGCCTGATTACTGGGATTATCGGCGGCATTGTCGTCGGTTTCCTTGCTGGATCGCCGCTACAGGTCAGCGGCCCTGCTGCCGGTCTGGCGGTACTGGTGTTCGAGCTGGTACGCCAGCACGGCATGGCCATGCTCGGGCCAA > NC_002947/106088‑106383 | tGGCCGTGCGACTAGAGAAAGGAGAAACACGGTGAACATTACACAGTTGAAAGCGGCCCTGCCGCGTGAGTTGCTGGCGTCGGTGGTGGTCTTCCTGGTGGCCTTGCCGTTGTGCATGGGCATTGCGATCGCTTCTGGCATGCCGCCgg > 5:4774/1‑149 (MQ=255)tGGCCGTGCGACTAGAGAAAGGAGAAACACGGTGAACATTACACAGTTGAAAGCGGCCCTGCCGCGTGAGTTGCTGGCGGCGGTGGTGGTCTTCCTGGTGGCCTTGCCGTTGTGCATGGGCATTGCGATCGCTTCTGGCATGCCGCCgg < 6:172566/149‑1 (MQ=255) ccGTGCGACTAGAGAAAGGAGAAACACGGTGAACAATACACAGTTGAAAGCGGCCCTGCAGCGTGAGTTGCTGGCGTCGGTGGTGGTCTTCCTGGTGGCCTTGCAGTTGTGCATGGGCATTCCGATCGCTTCTGGCATGCCGCCGGCa > 2:231864/1‑148 (MQ=255) aCTAGAGAAAGGAGAAACACGGTGAACATTACACAGTTGAAAGCGGCCCTGCCGCGTGAGTTGCTGGCGTCGGTGGTGGTCTTCCTGGTGGCCTTGCCGTTGTGCATGGGCATTGCGATCGCTTCTGGCATGCCGCCGGCAAAAGGCCt < 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aGGAGAAACACGGTGAACATTACACAGTTGAAAGCGGCCCTGCCGCGTGAGTTGCTGGCGTCGGTGGTGGTCTTCCTGGTGGCCTTGCCGTTGTGCATGGGCATTGCGATCGCTTCTGGCATGCCGCCGGCAAAAGGCCTGATTACTgg < 1:289251/149‑1 (MQ=255) ggAGAAACACGGTGAACATTACACAGTTGAAAGCGGCCCTGCCGCGTGAGTTGCTGGCGTCGGTGGTGGTCTTCCTGGTGGCCTTGCCGTTGTGCATGGGCATTGCGATCGCTTCTGGCATGCCGCCGGCAAAAGGCCTGATTACTgg > 2:301386/1‑148 (MQ=255) gagaAACACGGTGAACATTACACAGTTGAAAGCGGCCCTGCCGCGTGAGTTGCTGGCGTCGGTGGTGGTCTTCCTGGTGGCCTTGCCGTTGTGCATGGGCATTGCGATCGCTTCTGGCATGCCGCCGGCAAAAGGCCTGATTACTGGGa < 1:56023/149‑1 (MQ=255) aaCACGGTGAACATTACACAGTTGAAAGCGGCCCTGCCGCGTGAGTTGCTGGCGTCGGTGGTGGTCTTCCTGGTGGCCTTGCCGTTGTGCATGGGCATTGCGATCGCTTCTGGCATGCCGCCGGCAAAAGGCCTGATTACTGGGATTAt < 2:161487/149‑1 (MQ=255) acacGGTGAACATTACACAGTTGAAAGCGGCCCTGCCGCGTGAGTTGCTGGCGTCGGTGGTGGTCTTCCTGGTGGCCTTGCCGTTGTGCATGGGCATTGCGATCGCTTCTGGCATGCCGCCGGCAAAAGGCCTGATTACTGGGATTATc < 4:127895‑M2/149‑2 (MQ=255) ggTGAACATTACACAGTTGAAAGCGGCCCTGCCGCGTGAGTTGCTGGCGTCGGTGGTGGTCTTCCTGGTGGCCTTGCCGTTGTGCATGGGCATTGCGATCGCTTCTGGCATGCCGCCGGCAAAAGGCCTGATTACTGGGATTATcggcg < 7:164731‑M2/149‑6 (MQ=255) gAACATTACACAGTTGAAAGCGGCCCTGCCGCGTGAGTTGCTGGCGTCGGTGGTGGTCTTCCTGGTGGCCTTGCCGTTGTGCATGGGCATTGCGATCGCTTCTGGCATGCCGCCGGCAAAAGGCCTGATTACTGGGATTATcggcggca < 5:314279‑M2/149‑9 (MQ=255) aaCATTACACAGTTGAAAGCGGCCCTGCCGCGTGAGTTGCTGGCGTCGGTGGTGGTCTTCCTGGTGGCCTTGCCGTTGTGCATGGGCATTGCGATCGCTTCTGGCATGCCGCCGataatcccagtaatcaggccttttgccggcggcat < 1:91369‑M1/149‑36 (MQ=255) aCATTACACAGTTGAAAGCGGCCCTGCCGCGTGAGTTGCTGGCGTCGGTGGTGGTCTTCCTGGTGGCCTTGCCGTTGTGCATGGGCATTGCGATCGCTTCTGGCATGCCGCCGGCAAAAGGCCTGATTACTGGGATTATcggcggcat > 3:46160‑M2/1‑139 (MQ=255) ttACACAGTTGAAAGCGGCCCTGCCGCGTGAGTTGCTGGCGTCGGTGGTGGTCTTCCTGGTGGCCTTGCCGTTGTGCATGGGCATTGCGATCGCTTCTGGCATGCCGCCGGCAAAAGGCCTGATTACTGGGATTATCGGCGGCATTgtc < 3:144201/149‑1 (MQ=255) 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cTGGCATGCCGCCGGCAAAAGGCCTGATTACTGGGATTATCGGCGGCATTGTCGTCGGTTTCCTTGCTGGATCGCCGCTACAGGTCAGCGGCCCTGCTGCCGGTCTGGCGGTACTGGTGTTCGAGCTGGTACGCCAGCACGGCATGGc > 2:327297/1‑148 (MQ=255) ggCATGCCGCCGGCAAAAGGCCTGATTACTGGGATTATCGGCGGCATTGTCGTCGGTTTCCTTGCTGGATCGCCGCTACAGGTCAGCGGCCCTGCTGCCGGTCTGGCGGTACTGGTGTTCGAGCTGGTACGCCAGCACGGCATGGCCAt > 1:59881/1‑149 (MQ=255) gCATGCCGCCGGCAAAAGGCCTGATTACTGGGATTATCGGCGGCATTGTCGTCGGTTTCCTTGCTGGATCGCCGCTACAGGTCAGCGGCCCTGCTGCCGGTCTGGCGGTACTGGTGTTCGAGCTGGTACGCCAGCACGGCATGGcc < 7:42362/146‑1 (MQ=255) cATGCCGCCGGCAAAAGGCCTGATTACTGGGATTATcggcggcatgccagaagcgatcgcaatgcccatgcacaacggcaaggccaccaggaagaccaccaccgacgccagcaactcacgcggcagggccgctttcaa < 7:23262‑M2/138‑103 (MQ=255) cATGCCGCCGGCAAAAGGCCTGATTACTGGGATTATcggcggcatgccagaagcgatcgcaatgcccatgcacaacggcaaggccaccaggaagaccaccaccgacgccagcaactcacgcggcagggccgctttcaa > 8:23262‑M2/1‑36 (MQ=255) aTGCCGCCGataatcccagtaatcaggccttttgccggcggcatgccagaagcgatcgcaatgcccatgcacaacggcaaggccaccaggaagaccaccaccgacgccagcaactcacgcggcagggccgctttcaactgtgtaatgt > 3:46160‑M1/1‑9 (MQ=255) aTGCCGCCGGCAAAAGGCCTGATTACTGGGATTATcggcggcatgccagaagcgatcgcaatgcccatgcacaacggcaaggccaccaggaagaccaccaccgacgccagcaactcacgcggcagggccgctttcaactgtgtaatgtt < 1:91369‑M2/149‑115 (MQ=255) aTGCCGCCGGCAAAAGGCCTGATTACTGGGATTATCGGCGGCATTGTCGTCGGTTTCCTTGCTGGATCGCCGCTACAGGTCAGCGGCCCTGCTGCCgg > 7:256567/1‑98 (MQ=255) aTGCCGCCGGCAAAAGGCCTGATTACTGGGATTATCGGCGGCATTGTCGTCGGTTTCCTTGCTGGATCGCCGCTACAGGTCAGCGGCCCTGCTGCCgg < 8:256567/98‑1 (MQ=255) tGCCGCCGataatcccagtaatcaggccttttgccggcggcatgccagaagcgatcgcaatgcccatgcacaacggcaaggccaccaggaagaccaccaccgacgccagcaactcacgcggcagggccgctttcaactgtgtaatgttc < 5:314279‑M1/149‑142 (MQ=255) gccgccGGCAAAAGGCCTGATTACTGGGATTATCGGCGGCATTGTCGTCGGTTTCCTTGCTGGATCGCCGCTACAGGTCAGCGGCCCTGCTGCCGGTCTGGCGGTACTGGTGTTCGAGCTGGTACGCCAGCACGGCATGGCCATGCTCg > 8:101657/1‑149 (MQ=255) cgccgataatcccagtaatcaggccttttgccggcggcatgccagaagcgatcgcaatgcccatgcacaacggcaaggccaccaggaagaccaccaccgacgccagcaactcacgcggcagggccgctttcaactgtgtaatgttcacc < 7:164731‑M1/149‑145 (MQ=255) cgccgGCAAAAGGCCTGATTACTGGGATTATCGGCGGCATTGTCGTCGGTTTCCTTGCTGGATCGCCGCTACAGGTCAGCGGCCCTGCTGCCGGTCTGGCGGTACTGGTGTTCGAGCTGGTACGCCAGCACGGCATGGCCATGCTCggg < 2:230369/149‑1 (MQ=255) ccgGCAAAAGGCCTGATTACTGGGATTATCGGCGGCATTGTCGTCGGTTTCCTTGCTGGATCGCCGCTACAGGTCAGCGGCCCTGCTGCCGGTCTGGCGGTACTGGTGTTCGAGCTGGTACGCCAGCACGGCATGGCCATGCTCGGGcc < 1:327297/149‑1 (MQ=255) cgGCAAAAGGCCTGATTACTGGGATTATCGGCGGCATTGTCGTCGGTTTCCTTGCTGGATCGCCGCTACAGGTCAGCGGCCCTGCTGCCGGTCTGGCGGTACTGGTGTTCGAGCTGGTACGCCAGCACGGCATGGCCATGCTCGGGCCa < 5:201407/149‑1 (MQ=255) gataatcccagtaatcaggccttttgccggcggcatgccagaagcgatcgcaatgcccatgcacaacggcaaggccaccaggaagaccaccaccgacgccagcaactcacgcggcagggccgctttcaactgtgtaatgttcaccgtgt < 4:127895‑M1/149‑149 (MQ=255) | TGGCCGTGCGACTAGAGAAAGGAGAAACACGGTGAACATTACACAGTTGAAAGCGGCCCTGCCGCGTGAGTTGCTGGCGTCGGTGGTGGTCTTCCTGGTGGCCTTGCCGTTGTGCATGGGCATTGCGATCGCTTCTGGCATGCCGCCGGCAAAAGGCCTGATTACTGGGATTATCGGCGGCATTGTCGTCGGTTTCCTTGCTGGATCGCCGCTACAGGTCAGCGGCCCTGCTGCCGGTCTGGCGGTACTGGTGTTCGAGCTGGTACGCCAGCACGGCATGGCCATGCTCGGGCCAA > NC_002947/106088‑106383 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |