New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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AACACGGTGAACATTACACAGTTGAAAGCGGCCCTGCCGCGTGAGTTGCTGGCGTCGGTGGTGGTCTTCCTGGTGGCCTTGCCGTTGTGCATGGGCATTGCGATCGCTTCTGGCATGCCGCCGGCAAAAGGCCTGATTACTGGGATTATCGGCGGCATTGTCGTCGGTTTCCTTGCTGGATCGCCGCTACAGGTCAGCGGCCCTGCTGCCGGTCTGGCGGTACTGGTGTTCGAGCTGGTACGCCAGCACGGCATGGCCATGCTCGGGCCAATCCTGTTGCTGGCCGGTCTGTTG > NC_002947/106113‑106406 | aaCACGGTGAACATTACACAGTTGAAAGCGGCCCTGCCGCGTGAGTTGCTGGCGTCGGTGGTGGTCTTCCTGGTGGCCTTGCCGTTGTGCATGGGCATTGCGATCGCTTCTGGCATGCCGCCGGCAAAAGGCCTGATTACTGGGATTAt < 2:161487/149‑1 (MQ=255) acacGGTGAACATTACACAGTTGAAAGCGGCCCTGCCGCGTGAGTTGCTGGCGTCGGTGGTGGTCTTCCTGGTGGCCTTGCCGTTGTGCATGGGCATTGCGATCGCTTCTGGCATGCCGCCGGCAAAAGGCCTGATTACTGGGATTATc < 4:127895‑M2/149‑2 (MQ=255) ggTGAACATTACACAGTTGAAAGCGGCCCTGCCGCGTGAGTTGCTGGCGTCGGTGGTGGTCTTCCTGGTGGCCTTGCCGTTGTGCATGGGCATTGCGATCGCTTCTGGCATGCCGCCGGCAAAAGGCCTGATTACTGGGATTATcggcg < 7:164731‑M2/149‑6 (MQ=255) 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tGATTACTGGGATTATCGGCGGCATTGTCGTCGGTTTCCTTGCTGGATCGCCGCTACAGGTCAGCGGCCCTGCTGCCGGTCTGGCGGTACTGGTGTTCGAGCTGGTACGCCAGCACGGCATGGCCATGCTCGGGCCAATCCTGtt > 4:305262/1‑145 (MQ=255) gATTACTGGGATTATCGGCGGCATTGTCGTCGGTTTCCTTGCTGGATCGCCGCTACAGGTCAGCGGCCCTGCTGCCGGTCTGGCGGTACTGGTGTTCGAGCTGGTACGCCAGCACGGCATGGCCATGCTCGGGCCAATCCTGTTGCTgg > 3:270883/1‑149 (MQ=255) aTTACTGGGATTATcggcggcatgccagaagcgatcgcaatgcccatgcacaacggcaaggccaccaggaagaccaccaccgacgccagcaactcacgcggcagggccgctttcaactgtgtaatgttcaccgtgtttctcctttct > 2:91369‑M2/1‑14 (MQ=255) aTTACTGGGATTATCGGCGGCATTGTCGTCGGTTTCCTTGCTGGATCGCCGCTACAGGTCAGCGGCCCTGCTGCCGGTCTGGCGGTACTGGTGTTCGAGCTGGTACGCCAGCACGGCATGGCCATGCTCGGGCCAATCCTGTTGCTgg < 6:314320/148‑1 (MQ=255) aTTACTGGGATTATCGGCGGCATTGTCGTCGGTTTCCTTGCTGGATCGCCGCTACAGGTCAGCGGCCCTGCTGCCGGTCTGGCGGTACTGGTGTTCGAGCTGGTACGCCAGCACGGCATGGCCATGCTCGGGCCAATCCTGTTGCTGGc < 6:287420/149‑1 (MQ=255) aCTGGGATTATCGGCGGCATTGTCGTCGGTTTCCTTGCTGGATCGCCGCTACAGGTCAGCGGCCCTGCTGCCGGTCTGGCGGTACTGGTGTTCGAGCTGGTACGCCAGCACGGCATGGCCATGCTCGGGCCAATCCTGTTGCTGGCCg < 6:79602/148‑1 (MQ=255) ggATTATCGGCGGCATTGTCGTCGGTTTCCTTGCTGGATCGCCGCTACAGGTCAGCGGCCCTGCTGCCGGTCTGGCGGTACTGGTGTTCGAGCTGGTACGCCAGCACGGCATGGCCATGCTCGGGCCAATCCTGTTGCTGGCCGGTc < 2:59881/147‑1 (MQ=255) ggATTATCGGCGGCATTGTCGTCGGTTTCCTTGCTGGATCGCCGCTACAGGTCAGCGGCCCTGCTGCCGGTCTGGCGGTACTGGAGTTCGAGCTGGTACGCCAGCACGGCATGGCCATGCTCGGGCCAATCCTGTTGCTGGCCGGTCTg < 3:58177/149‑1 (MQ=255) gATTATCGGCGGCATTGTCGTCGGTTTCCTTGCTGGATCGCCGCTACAGGTCAGCGGCCCTGCTGCCGGTCTGGCGGTACTGGTGTTCGAGCTGGTACGCCAGCACGGCATGGCCATGCTCGGGCCAATCCTGTTGCTGGCCGGTCTGt < 6:317576/149‑1 (MQ=255) aTTATCGGCGGCATTGTCGTCGGTTTCCTTGCTGGATCGCCGCTACAGGTCAGCGGCCCTGCTGCCGGTCTGGCGGTACTGGTGTTCGAGCTGGTACGCCAGCACGGCATGGCCATGCTCGGGCCAATCCTGTTGCTGGCCGGTCTGtt < 3:311730/149‑1 (MQ=255) aTTATCGGCGGCATTGTCGTCGGTTTCCTTGCTGGATCGCCGCTACAGGTCAGCGGCCCTGCTGCCGGTCTGGCGGTACTGGTGTTCGAGCTGGTACGCCAGCACGGCATGGCCATGCTCGGGCCAATCCTGTTGCTGGCCGGTCTGtt > 3:76903/1‑149 (MQ=255) ttATCGGCGGCATTGTCGTCGGTTTCCTTGCTGGATCGCCGCTACAGGTCAGCGGCCCTGCTGCCGGTCTGGCGGTACTGGTGTTCGAGCTGGTACGCCAGCACGGCATGGCCATGCTCGGGCCAATCCTGTTGCTGGCCGGTCTGtt < 4:104438/148‑1 (MQ=255) ttATCGGCGGCATTGTCGTCGGTTTCCTTGCTGGATCGCCGCTACAGGTCAGCGGCCCTGCTGCCGGTCTGGCGGTACTGGTGTTCGAGCTGGTACGCCAGCACGGCATGGCCATGCTCGGGCCAATCCTGTTGCTGGCCGGTCTGTTg < 8:75235/149‑1 (MQ=255) | AACACGGTGAACATTACACAGTTGAAAGCGGCCCTGCCGCGTGAGTTGCTGGCGTCGGTGGTGGTCTTCCTGGTGGCCTTGCCGTTGTGCATGGGCATTGCGATCGCTTCTGGCATGCCGCCGGCAAAAGGCCTGATTACTGGGATTATCGGCGGCATTGTCGTCGGTTTCCTTGCTGGATCGCCGCTACAGGTCAGCGGCCCTGCTGCCGGTCTGGCGGTACTGGTGTTCGAGCTGGTACGCCAGCACGGCATGGCCATGCTCGGGCCAATCCTGTTGCTGGCCGGTCTGTTG > NC_002947/106113‑106406 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |