New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 942570 = | 33 (0.610) | 3 (0.060) | 3/252 | NT | 11.2% | coding (3052/18933 nt) | PP_0806 | surface adhesion protein |
? | NC_002947 | 943829 = | 16 (0.310) | coding (1793/18933 nt) | PP_0806 | surface adhesion protein |
GAGGTTGAGGCTGAACACGCCGGTCGGGCCGACCACGGCAGTGCCCAGTTCGGTTCCGTCGGCAGCCACGATGCGCACGGTGCTGCCCGGTTCGGCACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCGACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCGGGATTCAGTTCGATGCTGAAGCTGCCATCGGCGTTG > NC_002947/942424‑942709 | atcgaactgaatcccgcacaagccaacggcgaactgctggacgtggttgccatcgatgacggcggcgtttcctcgctgcccgcacagatcaccgcgcccgacatcaccgcccctgccgcaccgaccgaactggcggtgagcgcggaCgg > 2:265952‑M1/147‑149 (MQ=255) tcgaactgaatcccgcacaagccaacggcgaactgctggacgtggttgccatcgatgacggcggcgtttcctcgctgcccgcacagatcaccgcgcccgacatcaccgcccctgccgcaccgaccgaactggcggtgagcgcggaCgg < 5:146091‑M1/3‑1 (MQ=255) gaatcccgcacaagccaacggcgaactgctggacgtggttgccatcgatgacggcggcgtttcctcgctgcccgcacagatcaccgcgcccgacatcaccgcccctgccgcaccgaccgaactggcggtgagcgcggaCGGCa < 8:4029‑M1/5‑1 (MQ=255) gaatcccgcacaagccaacggcgaactgctggacgtggttgccatcgatgacggcggcgtttcctcgctgcccgcacagatcaccgcgcccgacatcaccgcccctgccgcaccgaccgaactggcggtgagcgcggaCGGCa > 7:4029‑M1/139‑143 (MQ=255) gATGCGCACGGTGCTGCCCGGTTCGGCACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCGa > 6:6466/1‑149 (MQ=31) cgcACGGTGCTGCCCGGTTCGGCACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCGACCAc < 8:9345/149‑1 (MQ=32) gcACGGTGCTGCCCGGTTCGGCACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCGACCACg > 2:13854/1‑149 (MQ=32) ctgcCCGGTTCGGCACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCGACCACGTCcagcag > 5:148064/1‑149 (MQ=32) ccGGTTCGGCACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCGACCACGTCca > 8:262669/1‑141 (MQ=32) ccGGTTCGGCACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCGACCACGTCca < 7:262669/141‑1 (MQ=32) cGGCACGGCGGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCGACCACGTCCAGCAGTTCGCCGtt < 3:210011/148‑1 (MQ=17) gCACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCGACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGc > 6:59825/1‑149 (MQ=32) aCGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCGACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCtt > 6:67955/1‑149 (MQ=32) gCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCGACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTtgtg > 8:47057/1‑149 (MQ=32) ccGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGGCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCGACCACGTCcagca < 6:343426/130‑1 (MQ=17) ggTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCGACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCgg < 5:250543/149‑1 (MQ=32) tGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCGACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCGGGa < 5:322893/149‑1 (MQ=32) aTAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCGACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCGGGAtt > 6:289582/1‑149 (MQ=32) ccctgccgcaccgaccgaactggcggtgagcgcggaCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCTCCGAGTAAACGCCGACCTCATCGATGTCGGAAACGTGCATCAGTTCTCCGTAGTCTTGTGCGGGATTCAGt < 8:141130‑M1/113‑1 (MQ=255) cctgccgcaccgaccgaactggcggtgagcgcggaCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCGACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCgg < 7:53885‑M1/105‑1 (MQ=255) cctgccgcaccgaccgaactggcggtgagcgcggaCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCGACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCgg > 8:53885‑M1/36‑140 (MQ=255) tGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCGACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCGGGATTCAGTTc > 3:323609/1‑148 (MQ=32) ccGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCGACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCGGGATTCAGTTCGa < 1:66251/148‑1 (MQ=32) ccGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCGACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCGGGATTCAGTTCGa < 3:171159/148‑1 (MQ=32) ccGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCGACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCGGGATTCAGTTCGa < 4:103990/148‑1 (MQ=32) ccGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCGACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCGGGATTCAGTTCGATGCt > 7:307763/1‑148 (MQ=32) cgcgCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCGACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCGGGATTCAGTTCGATGCTGa < 4:119257/149‑1 (MQ=32) gcgcTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCGACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCGGGATTCAGtt > 6:208869/1‑139 (MQ=32) gcgcTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCGACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCGGGATTCAGtt < 5:208869/139‑1 (MQ=32) gcgcTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCGACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCGGGATTCAGTTCGATGCTGaa < 4:107984/149‑1 (MQ=32) cTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCCGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCGACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCGGGATTCAGTTCGATGCTGAAGCt < 5:289582/149‑1 (MQ=17) ccAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCGACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCGGGATTCAGTTc < 7:55654/130‑1 (MQ=32) ccAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCGACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCGGGATTCAGTTc > 8:55654/1‑130 (MQ=32) aGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCGACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCGGGATTCAGTTCGATGCTGAAGCTGCCATCGGc > 7:116813/1‑149 (MQ=32) aGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCGACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCGGGATTCAGTTCGATGCTGAAGCTGCCATCGGc < 4:53948/149‑1 (MQ=32) tctcggtcggTGCGGCTGGGGCGGTGTTGTCGGGTGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCGACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCGGGATTCAGTTCGATGCTGAAGCTGCCATCGGc < 8:120331/146‑1 (MQ=12) ggtcggtGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCGACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCGGGATTCAGTTCGATGCTGAAGCTGCCATCGGc > 7:120331/1‑144 (MQ=32) ggtcggtGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCGACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCGGGATTCAGTTCGATGCTGAAGCTGCCATCGGCGTTg < 5:6466/148‑1 (MQ=32) ggtcggtGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCGACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCGGGATTCAGTTCGATGCTGAAGCTGCCATCGGCGTTg < 3:43100/148‑1 (MQ=32) ggtcggtGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCGACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCGGGATTCAGTTCGATGCTGAAGCTGCCATCGGCGTTg < 4:112025/148‑1 (MQ=32) | GAGGTTGAGGCTGAACACGCCGGTCGGGCCGACCACGGCAGTGCCCAGTTCGGTTCCGTCGGCAGCCACGATGCGCACGGTGCTGCCCGGTTCGGCACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCGACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCGGGATTCAGTTCGATGCTGAAGCTGCCATCGGCGTTG > NC_002947/942424‑942709 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |