New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 942570 = | 33 (0.610) | 3 (0.060) | 3/252 | NT | 11.2% | coding (3052/18933 nt) | PP_0806 | surface adhesion protein |
? | NC_002947 | 943829 = | 16 (0.310) | coding (1793/18933 nt) | PP_0806 | surface adhesion protein |
TGAGGCTGAACACGCCGGTCGGGCCGACCACGGCAGTGCCCAGTTCGGTTCCGTCGGCAGCCACGATGCGCACGGTGCTGCCCGGTTCGGCACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCGGGATTCAGTTCGAT > NC_002947/943716‑943974 | actgaatcccgcacaagactacggagaactgatgcacgtttccgacatcgatgaggtcggcgtttactcggagcccgcacagatcaccgcgcccgacatcaccgcccctgccgTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAggg < 8:141130‑M2/36‑1 (MQ=255) ccgcacaagccaacggcgaactgctggacgtggtcgccatcgatgacggcggcgtttcctcgctgcccgcacagatcaccgcgcccgacatcaccgcccctgccgTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAgg > 8:53885‑M2/106‑140 (MQ=255) ccgcacaagccaacggcgaactgctggacgtggtcgccatcgatgacggcggcgtttcctcgctgcccgcacagatcaccgcgcccgacatcaccgcccctgccgTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAgg < 7:53885‑M2/35‑1 (MQ=255) gATGCGCACGGTGCTGCCCGGTTCGGCACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCaa < 6:283119/149‑1 (MQ=31) gATGCGCACGGTGCTGCCCGGTTCGGCACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCaa < 6:278398/149‑1 (MQ=31) aCGGTGCTGCCCGGTTCGGCACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTc < 4:240169/149‑1 (MQ=32) aCGGTGCTGCCCGGTTCGGCACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTc > 3:71887/1‑149 (MQ=32) cGGTGCTGCCCGGTTCGGCACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTcc < 2:104517/149‑1 (MQ=32) cccGGTTCGGCACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTCCAGCAGTTc < 2:330943/149‑1 (MQ=32) cccGGTTCGGCACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTCCAGCAGTTc > 3:214098/1‑149 (MQ=32) cGGTTCGGCACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTCCAGCAGTTCGc > 1:174615/1‑149 (MQ=32) gTTCGGCACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTCCAGCAGTTCGCCg > 3:206729/1‑149 (MQ=32) ggCACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTc < 3:246811/132‑1 (MQ=32) ggCACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTc > 4:246811/1‑132 (MQ=32) aCGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCtt < 5:511/149‑1 (MQ=32) ggCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTtgt < 4:71887/149‑1 (MQ=32) ggCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTtgt < 7:18979/149‑1 (MQ=32) gTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCggg < 3:15265/149‑1 (MQ=32) aTAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCACCCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCGGGAtt > 8:111859/1‑149 (MQ=17) aaCGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCGGGa < 6:298122/145‑1 (MQ=32) aaCGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCGGGa > 5:298122/1‑145 (MQ=32) aCGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCGGGATTCAg < 4:214098/149‑1 (MQ=32) gCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGTAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCGGGATTCAGtt > 7:147613/1‑149 (MQ=17) gCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCgg > 2:105168/1‑140 (MQ=32) gCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCgg < 1:105168/140‑1 (MQ=32) tgccgTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCGGGATTc > 7:4029‑M2/6‑143 (MQ=255) tgccgTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCGGGATTc < 8:4029‑M2/138‑1 (MQ=255) ccgTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCGGGATTCAGTTCGa < 5:146091‑M2/145‑1 (MQ=255) ccgTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCGGGATTCAGTTCGAt > 2:265952‑M2/4‑149 (MQ=255) | TGAGGCTGAACACGCCGGTCGGGCCGACCACGGCAGTGCCCAGTTCGGTTCCGTCGGCAGCCACGATGCGCACGGTGCTGCCCGGTTCGGCACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCGGGATTCAGTTCGAT > NC_002947/943716‑943974 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |