New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1316945 | 39 (0.720) | 4 (0.080) | 4/248 | NT | 9.1% | coding (363/1989 nt) | PP_1150 | membrane protein |
? | NC_002947 | = 1316968 | 43 (0.850) | coding (386/1989 nt) | PP_1150 | membrane protein |
GCACAGTCATGTCGGTGCTGTTCATCGGCCTGTTCGCCCAGACCCCCGGCCTGTTTCTGCTTACCTTGGCGCTTTGGCTGGCGCTGTGTACCGCAGCGTCCACCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGACCACCCC‑CTGCAAGTATTCGACCAGGCC‑‑GTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCTGGGTATTTTCTGTGCAACAGCCAGCAGTGCCTTGCTCTGGCCCATGCGGGTCGAGCA > NC_002947/1316800‑1317091 | gCACAGTCATGTCGGTGCTGTTCATCGGCCTGTTCGCCCAGACCCCCGGCCTGTTTCTGCTTACCTTGGCGCTTTGGCTGGCGCTGTGTACCGCAGCGTCCACCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTa > 5:169081/1‑148 (MQ=255) cacaGTCATGTCGGTGCTGTTCATCGGCCTGTTCGCCCAGACCCCCGGCCTGTTTCTGCTTACCTTGGCGCTTTGGCTGGCGCTGTGTACCGCAGCGTCCACCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTaca > 5:36257/1‑149 (MQ=255) acaGTCATGTCGGTGCTGTTCATCGGCCTGTTCGCCCAGA‑CCCCGGCCTGTTTCTGCTTACCTTGGCGCTTTGGCTGGCGCTGTGTACCGCAGCGTCCACCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACAcc < 4:126159/149‑1 (MQ=255) tCGGTGCTGTTCATCGGCCTGTTCGCCCAGACCCCCGGCCTGTTTCTGCTTACCTTGGCGCTTTGGCTGGCGCTGTGTACCGCAGCGTCCACCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGat > 2:79130/1‑149 (MQ=255) ggatctCATCGGCCTGTTCGCCCAGACCCCCGGCCTGTTTCTGCTTACCTTGGCGCTTTGGCTGGCGCTGTGTACCGCAGCGTCCACCCAGTTGCGCAGCGCCTTGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGatcatc < 1:107415/143‑1 (MQ=255) aTCGGCCTGTTCGCCCAGACCCCCGGCCTGTTTCTGCTTACATTGGCGCTTTGGCTGGCGCTGTGTACCGCAGCGTCCACCCAGTTGCGCAGCGCCTGGTCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCTCAGCGatcatc > 2:107415/1‑141 (MQ=255) tCGGCCGGTTCGCCCAGACCCCCGGCCAGATACTGCTTCCCTTGGCGCTTTGGCTGCCGCTGTGTAGCGCAGCGACCACCCAGTAGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACCCCGCAGGGCGCATCGACtggacc > 8:244989/1‑144 (MQ=255) cGGCCTGTTCGCCCAGACCCCCGGCCTGTTTCTGCTTACCTTGGCGCTTTGGCTGGCGCTGTGTACCGCAGCGTCCACCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTgccgg < 1:255838‑M2/149‑6 (MQ=255) ggCCTGTTCGCCCAGACCCCCGGCCTGTTTCTGCTTACCTTGGCGCTTTGGCTGGCGCTGTGTACCGCAGCGTCCACCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTgccggc > 4:126975‑M2/1‑143 (MQ=255) ccTGTTCGCCCAGACCCCCGGCCTGTTTCTGCTTACCTTGGCGCTTTGGCTGGCGCTGTGTACCGCAGCGTCCACCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCaaggcgatgatcgctgcggtgtagccggcca < 7:175030‑M1/149‑32 (MQ=255) ttCGCCCAGACCCCCGGCCTGTTTCTGCTTACCTTGGCGCTTTGGCTGGCGCTGTGTACCGCAGCGTCCACCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCaaggcgatgatcgctgcggtgtagccggccagca < 7:38500‑M1/148‑35 (MQ=255) ttCGCCCAGACCCCCGGCCTGTTTCTGCTTACCTTGGCGCTTTGGCTGGCGCTGTGTACCGCAGCGTCCACCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCAtt < 1:79130/147‑1 (MQ=255) ttCGCCCAGACCCCCGGCCTGTTTCTGCTTACCTTGGCGCTTTGGCTGGCGCTGTGTACCGCAGCGTCCACCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGa > 1:53804/1‑149 (MQ=255) ttCGCCCAGACCCCCGGCCTGTTTCTGCTTACCTTGGCGCTTTGGCTGGCGCTGTGTACCGCAGCGTCCACCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGa > 5:30324/1‑149 (MQ=255) ccccGGCCTGTTTCTGCTTACCTTGGCGCTTTGGCTGGCGCTGTGTACCGCAGCGTCCACCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGACCACCCC‑CTg > 1:332620/1‑148 (MQ=255) ccGGCCTGTTTCTGCTTACCTTGGCGCTTTGGCTGGCGCTGTGTACCGCAGCGTCCACCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGACCACCCC‑CTGc > 7:40694/1‑147 (MQ=255) cTGTTTCTGCTTACCTTGGCGCTTTGGCTGGCGCTGTGTACCGCAGCGTCCACCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCaaggcgatgatcgctgcggtgtagccggccagc < 5:72313‑M1/129‑34 (MQ=255) cTGTTTCTGCTTACCTTGGCGCTTTGGCTGGCGCTGTGTACCGCAGCGTCCACCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCaaggcgatgatcgctgcggtgtagccggccagc > 6:72313‑M1/1‑96 (MQ=255) gTTTCTGCTTACCTTGGCGCTTTGGCTGGCGCTGTGTACCGCAGCGTCCACCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGACCACCCC‑CTGCAAGTATTc > 7:86494/1‑148 (MQ=255) tttCTGCTTACCTTGGCGCTTTGGCTGGCGCTGTGTACCGCAGCGTCCACCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGACCACCCC‑CTGCAAGTATTc < 6:245751/147‑1 (MQ=255) tttCTGCTTACCTTGGCGCTTTGGCTGGCGCTGTGTACCGCAGCGTCCACCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGACCACCCC‑CTGCAAGTATTCg < 5:263188/148‑1 (MQ=255) cTTACCTTGGCGCTTTGGCTGGCGCTGTGTACCGCAGCGTCCACCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGACCACCCC‑CTGCAAGTATTCGACCAg < 6:30324/147‑1 (MQ=255) ttACCTTGGCGCTTTGGCTGGCGCTGTGTACCGCAGCGTCCACCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGACCACCCC‑CTGCAAGTATTCGACCAGGcc > 5:274536/1‑149 (MQ=255) aCCTTGGCGCTTTGGCTGGCGCTGTGTACCGCAGCGTCCACCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGACCACCCC‑CTGCAAGTATTCGACCAGGCC‑‑Gt > 6:89502/1‑149 (MQ=255) ccTTGGCGCTTTGGCTGGCGCTGTGTACCGCAGCGTCCACCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGACCACCCC‑CTGCAAGTATTCGACCAGGCC‑‑GTg < 2:277963/149‑1 (MQ=255) ttGGCGCTTTGGCTGGCGCTGTGTACCGCAGCGTCCACCCAGTTGCCCAGCGCCTGGGCCTATGCATTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGAACATCACCTTGCCGGCCATTGACCACCCC‑CTCCAAGAATTCAACCAGCCC‑‑GAgga > 4:167656/1‑148 (MQ=255) gcgaTTTGGCTGGCGCTGTGTACCGCAGCGTCCACCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCACCTTGCCGGCCATTGACCACCCC‑CTGCAAGTATTCGACCAGGCC‑‑GTGGCTc < 3:167656/148‑1 (MQ=255) gcTTTGGCTGGCGCTGTGTACCGCAGCGTCCACCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGACCACCCC‑CTGCAAGTATTCGACCAGGCC‑‑GTGGCTCGCt < 5:314130/149‑1 (MQ=255) tttGGCTGGCGCTGTGTACCGCAGCGTCCACCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGACCACCCC‑CTGCAAGTATTCGACCAGGCC‑‑GTGGCTCGCTg > 1:24062/1‑148 (MQ=255) ccGCAGCGTCCACCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGACCACCCC‑CTGCAAGTATTCGACCAGGCC‑‑GTGGCTCGCTGTACCga < 5:245451/136‑1 (MQ=255) ccGCAGCGTCCACCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGACCACCCC‑CTGCAAGTATTCGACCAGGCC‑‑GTGGCTCGCTGTACCga > 6:245451/1‑136 (MQ=255) ccGCAGCGTCCACCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGACCACCCC‑CTGCAAGTATTCGACCAGGCC‑‑GTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCTggg > 6:137059/1‑148 (MQ=255) gTCCACCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGACCACCCC‑CTGCAAGTATTCGACCAGGCC‑‑GTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCTGGGTATTTTCt < 6:36257/149‑1 (MQ=255) cACCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGACCACCCC‑CTGCAAGTATTCGACCAGGCC‑‑GTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCTGGGTATTTTCtgt < 5:89502/148‑1 (MQ=255) ccAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGACCACCCC‑CTGCAAGTATTCGACCAGGCC‑‑GTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCTgg > 7:10999/1‑134 (MQ=255) ccAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGACCACCCC‑CTGCAAGTATTCGACCAGGCC‑‑GTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCTgg < 8:10999/134‑1 (MQ=255) cAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGACCACCCC‑CTGCAAGTATTCGACCAGGCC‑‑GTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCTGGGTATTTTCTGTGCAAcagccag > 2:265223/1‑147 (MQ=255) cAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGACCACCCC‑CTGCAAGTATTCGACCAGGCC‑‑GTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCTGGGTATTTTCTGTGCAACAGCcagca < 8:40694/149‑1 (MQ=255) aGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGACCACCCC‑CTGCAAGTATTCGACCAGGCC‑‑GTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCTGGGTATTTTCTGTGCAACAGCcagcag > 3:318739/1‑149 (MQ=255) cTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGACCACCCC‑CTGCAAGTATTCGACCAGGCC‑‑GTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCTGGGTATTTTCTGTGCAACAGCCAGCAGTGCCt > 2:324545/1‑149 (MQ=255) aTGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGACCACCCC‑CTGCAAGTATTCGACCAGGCC‑‑GTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCTGGGTATTTTCTGTGCAACAGCCAGCAGTGCCTTGCTCTgg < 2:255838/149‑1 (MQ=255) ttagTGCTGGACGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGACCACCCC‑CTGCAAGTATTCGACCAGGCC‑‑GTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCTGGTTATTTTCTGTGCaa > 6:266808/4‑121 (MQ=255) ttCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGACCACCCC‑CTGCAAGTATTCGACCAGGCC‑‑GTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCTGGGTATTTTCTGTGCaa < 5:266808/121‑1 (MQ=255) tGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTgccggccagcacgaaggcataggcccaggcgctgcgcaactgggtggacgctgcggtacacagcgccagccaaagcgccaaggtaagcagaaacaggccgggggtctgggcgaa < 7:38500‑M2/148‑115 (MQ=255) tGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGACCACCCC‑CTGCAAGTATTCGACCAGGCC‑‑GTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCTGGGTATTTTCTGTGCAACAGCCAGCAGTGCCTTGCTCTGGCCCATGCgg < 6:306612/149‑1 (MQ=255) gCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTgccggccagcacgaaggcataggcccaggcgctgcgcaactgggtggacgctgcggtacacagcgccagccaaagcgccaaggtaagcagaaacag > 6:72313‑M2/1‑33 (MQ=255) gCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTgccggccagcacgaaggcataggcccaggcgctgcgcaactgggtggacgctgcggtacacagcgccagccaaagcgccaaggtaagcagaaacag < 5:72313‑M2/129‑97 (MQ=255) tGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTgccggccagcacgaaggcataggcccaggcgctgcgcaactgggtggacgctgcggtacacagcgccagccaaagcgccaaggtaagcagaaacaggccgggggtctgggcgaacagg < 7:175030‑M2/149‑119 (MQ=255) tGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGACCACCCC‑CTGCAAGTATTCGACCAGGCCATGGGGCTGGCTGTACCGAGATCTGGCGGGGTATTTTGTGTGCAACCGCCAGCAGTGCCTTGCTATGGCCCATGCggg > 1:275272/1‑149 (MQ=255) tGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGACCACCCC‑CTGCAAGTATTCGACCAGGCC‑‑GTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCTGGGTATTTTCTGTGCAACAGCCAGCAGTGCCTTGCTCTGGCCCATGCGGGTc > 1:53214/1‑149 (MQ=255) gCCGGCaaggcgatgatcgctgcggtgtagccggccagcacgaaggcataggcccaggcgctgcgcaactgggtggacgctgcggtacacagcgccagccaaagcgccaaggtaagcagaaacaggccgggggtctgggcgaacaggcc > 4:126975‑M1/1‑6 (MQ=255) gCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGACCACCCC‑CTGCAAGTATTCGACCAGGCC‑‑GTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCTGGGTATTTTCTGTGCAACAGCCAGCAGTGCCTTGCTCTGGCCCATGCGGGTCGa < 4:318739/149‑1 (MQ=255) ccGGCaaggcgatgatcgctgcggtgtagccggccagcacgaaggcataggcccaggcgctgcgcaactgggtggacgctgcggtacacagcgccagccaaagcgccaaggtaagcagaaacaggccgggggtctgggcgaacaggccg < 1:255838‑M1/149‑145 (MQ=255) ccGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGACCACCCCTCTGCAAGTATTCGACCAGGCC‑‑GTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCTGGGTATTTTCTGTGCAACAGCCAGCAGTGCCTTGCTCTGGCCCATGCGGGTc > 1:74854/1‑147 (MQ=255) cGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGACCACCCC‑CTGCAAGTATTCGACCAGGCC‑‑GTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCTGGGTATTTTCTGTGCAACAGCCAGCAGTGCCTTGCTCTGGCCCATGCGGGTCGagc < 2:53804/149‑1 (MQ=255) ggCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGACCACCCC‑CTGCAAGTATTCGACCAGGCC‑‑GTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCTGGGTATTTTCTGTGCAACAGCCAGCAGTGCCTTGCTCTGGCCCATGCGGGTCGagca < 3:34174/149‑1 (MQ=255) | GCACAGTCATGTCGGTGCTGTTCATCGGCCTGTTCGCCCAGACCCCCGGCCTGTTTCTGCTTACCTTGGCGCTTTGGCTGGCGCTGTGTACCGCAGCGTCCACCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGACCACCCC‑CTGCAAGTATTCGACCAGGCC‑‑GTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCTGGGTATTTTCTGTGCAACAGCCAGCAGTGCCTTGCTCTGGCCCATGCGGGTCGAGCA > NC_002947/1316800‑1317091 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |