New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1374458 | 28 (0.520) | 3 (0.060) | 3/250 | NT | 9.8% | coding (78/1911 nt) | kup | potassium transport system protein Kup |
? | NC_002947 | = 1374490 | 29 (0.570) | coding (110/1911 nt) | kup | potassium transport system protein Kup |
TTCCAGGGCCTGGTGGCAGATTGATTACCAAGGGCCGTGATGGCCGTTTGCGGGAGTGGTCGATGGTTCAGGCAAGCAGTCACGCTGAGAGCGGGCACGAGGGGAAGCAGGGGGCATCGCGGTCGGTGGGCCTGCTGGTGGCGGCGGTCGGGGTGGTTTATGGCGATATCGGCACCAGCCCGTTGTATACCCTCAAGGAAGTCTTTACCGGCGGCTACGGGGTGTCGGTCAACCATGATGGCGTGCTGGGGATCCTCTCGCTGATCCTGTGGTCGCTGCTGTGG > NC_002947/1374319‑1374602 | ttCCAGGGCCTGGTGGCAGATTGATTACCAAGGGCCGTGATGGCCGTTTGCGGGAGTGGTCGATGGTTCAGTCAAGCAGTCACGCTGAGAGCGGGCACGAGGGGAAGCAGGGGGCATCGCGGTCGGTGGGCCTGCTGGTGGCGGCGGTc > 4:213369/1‑149 (MQ=255) gggCCTGGTGGCAGATTGATTACCAAGGGCCGTGATGGCCGTTTGCGGGAGTGGTCGATGGTTCAGGCAAGCAGTCACGCTGAGAGCGGGCACGAGGGGAAGCAGGGGGCATCGCGGTCGGTGGGCCTGCTGGTGGCGGCGGTCGGggt < 3:128021/149‑1 (MQ=255) gCCTGGTGGCAGATTGATTACCAAGGGCCGTGATGGCCGTTTGCGGGAGTGGTCGATGGTTCAGGCAAGCAGTCACGCTGAGAGCGGGCACGAGGGGAAGCAGGGGGCATCGCGGTCGGTGGGCCTGCTGGTGGCGGCGGTCGGggtgg < 4:261450/149‑1 (MQ=255) aGGGCCGTGATGGCCGTTTGCGGGAGTGGTCGATGGGTCAGGCAAGCAGTCACGCTGAGAGCGGGCACGAGGGGAAGCAGGGGGCATCGCGGTCGGTGGGCCTGCTGGTGGCGGCGGTCGGGGTGGTTTATGGCGATATCGGcaccagc > 3:36606‑M2/1‑142 (MQ=255) aGGGCCGTGATGGCCGTTTGCGGGAGTGGGCGATGGTTCAGGCAAGCAGTCACGCTGAGAGCGGGCACGAGGGGAAGCAGGGGGCATCGCGGTCGGTGGGCCTGCTGGTGccgatatcgccataaaccaccccgaccgccgccaccagc < 2:330067‑M1/149‑40 (MQ=255) ggCCGTGATGGCCGTTTGCGGGAGTGGTCGATGGTTCAGGCAAGCAGTCACGCTGAGAGCGGGCACGAGGGGAAGCAGGGGGCATCGCGGTCGGTGGGCCTGCTGGTGGCGGCGGTCGGGGTGGTTTATGGCGATATCGGCACCAGccc > 5:310042/1‑149 (MQ=255) aTGGCCGTTTGCGGGAGTGGTCGATGGTTCAGGCAAGCAGTCACGCTGAGAGCGGGCACGAGGGGAAGCAGGGGGCATCGCGGTCGGTGGGCCTGCTGGTGGCGGCGGTCGGGGTGGTTTATGGCGATATCGGCACCAGCCCGTTGtat < 3:182847/149‑1 (MQ=255) cGTTTGCGGGAGTGGTCGATGGTTCAGGCAAGCAGTCACGCTGAGAGCGGGCACGAGGGGAAGCAGGGGGCATCGCGGTCGGTGGGCCTGCTGGTGGCGGCGGTCGGGGTGGTTTATGGCGATATCGGCACCAGCCCGtt < 1:243062/140‑1 (MQ=255) cGTTTGCGGGAGTGGTCGATGGTTCAGGCAAGCAGTCACGCTGAGAGCGGGCACGAGGGGAAGCAGGGGGCATCGCGGTCGGTGGGCCTGCTGGTGGCGGCGGTCGGGGTGGTTTATGGCGATATCGGCACCAGCCCGtt > 2:243062/1‑140 (MQ=255) gggAGTGGTCGATGGTTCAGGCAAGCAGTCACGCTGAGAGCGGGCACGAGGGGAAGCAGGGGGCATCGCGGTCGGTGGGCCTGCTGGTGGCGGCGGTCGGGGTGGTTTATGGCGATATCGGCACCAGCCCGTTGTATACCCTCAAGGaa < 7:255771/149‑1 (MQ=255) tGGTCGATGGTTCAGGCAAGCAGTCACGCTGAGAGCGGGCACGAGGGGAAGCAGGGGGCATCGCGGTCGGTGGGCCTGCTGGTGGCGGCGGTCGGGGTGGTTTATGGCGATATCGGCACCAGCCCGTTGTATAccc > 7:153983/1‑136 (MQ=255) tGGTCGATGGTTCAGGCAAGCAGTCACGCTGAGAGCGGGCACGAGGGGAAGCAGGGGGCATCGCGGTCGGTGGGCCTGCTGGTGGCGGCGGTCGGGGTGGTTTATGGCGATATCGGCACCAGCCCGTTGTATAccc < 8:153983/136‑1 (MQ=255) gtagATGGTTCAGGCAAGCAGTCACGCTGAGAGCGGGCACGAGGGGAAGCAGGGGGCATCGCGGTCGGTGGGCCTGCTGGTGGCGGCGGTCGGGGTGGTTTATGGCCATATTGTCAc > 3:48750/4‑117 (MQ=255) ggcGATGGTTCAGGCAAGCAGTCACGCTGAGAGCGGGCACGAGGGGAAGCAGGGGGCATCGCGTTCGGTGGGCCTGCTGGTGGCGGCGGTCGGGGTTGTTTATGGCGATATCGGCACCAGCCCGTTGTATACCCTCAAGGAAGTCTTTa < 8:223116/147‑1 (MQ=255) gTCGATGGTTCAGGCAAGCAGTCACGCTGAGAGCGGGCACGAGGGGAAGCAGGGGGCATCGCGGTCGGTGGGCCTGCTGGTGGCGGCGGTCGGGGTGGTTTATGGCGATATCGGCACCAGCCCGTTGTATACCCTCAAGGAAGTCttt < 6:310042/148‑1 (MQ=255) gATGGTTCAGGCAAGCAGTCACGCTGAGAGCGGGCACGAGGGGAAGCAGGGGGCATCGCGGTCGGTGGGCCTGCTGGTGccgatatcgccataaaccaccccgaccgccgccaccagcagg > 7:251814‑M1/1‑79 (MQ=255) gATGGTTCAGGCAAGCAGTCACGCTGAGAGCGGGCACGAGGGGAAGCAGGGGGCATCGCGGTCGGTGGGCCTGCTGGTGccgatatcgccataaaccaccccgaccgccgccaccagcagg < 8:251814‑M1/121‑43 (MQ=255) gATGGTTCAGGCAAGCAGTCACGCTGAGAGCGGGCACGAGGGGAAGCAGGGGGCATCGCGGTCGGTGGGCCTGCTGGTGGCGGCGGTCGGGGTGGTTTATGGCGATATCGGCACCAGCCCGTTGTATACCCTCAAGGAAGTCTTTAcc < 7:134485/148‑1 (MQ=255) cAGGCAAGCAGTCACGCTGAGAGCGGGCACGAGGGGAAGCAGGGGGCATCGCGGTCGGTGGGCCTGCTGGTGGCGGCGGTCGGGGTGGTTTATGGCGATATCGGCACCAGCCCGTTGTATACCCTCAAGGAAGTCTTTACcgg < 3:188897/143‑1 (MQ=255) cAGGCAAGCAGTCACGCTGAGAGCGGGCACGAGGGGAAGCAGGGGGCATCGCGGTCGGTGGGCCTGCTGGTGGCGGCGGTCGGGGTGGTTTATGGCGATATCGGCACCAGCCCGTTGTATACCCTCAAGGAAGTCTTTACcgg > 4:188897/1‑143 (MQ=255) aGTCACGCTGAGAGCGGGCACGAGGGGAAGCAGGGGGCATCGCGGTCGGTGGGCCTGCTGGTGGCGGCGGTCGGGGTGGTTTATGGCGATATCGGCACCAGCCCGTTGTATACCCTCAAGGAAGTCTTTACCGGCGGCTACGGCGTGTc > 4:124815/1‑149 (MQ=255) cGGGCACGAGGGGAAGCAGGGGGCATCGCGGTCGGTGGGCCTGCTGGTGGCGGCGGTCGGGGTGGTTTATGGCGATATCGGCACCAGCCCGTTGTATACCCTCAAGGAAGTCTTTACCGGCGGCTACGGGGTGTCGGTCAACCatgatg > 2:126243/1‑149 (MQ=255) ggCACGAGGGGAAGCAGGGGGCATCGCGGTCGGTGGGCCTGCTGGTGGCGGCGGTCGGGGTGGTTTATGGCGATATCGGCACCAGCCCGTTGTATACCCTCAAGGAAGTCTTTACCGGCGGCTACGGGGTGTCGGTCAACCATGATGGc < 5:49560/149‑1 (MQ=255) cACGAGGGGAAGCAGGGGGCATCGCGGTCGGTGGGCCTGCTGGTGGCGGCGGTCGGGGTGGTTTATGGCGATATCGGCACCAGCCCGTTGTATACCCTCAAGGa < 5:114899/104‑1 (MQ=255) cACGAGGGGAAGCAGGGGGCATCGCGGTCGGTGGGCCTGCTGGTGGCGGCGGTCGGGGTGGTTTATGGCGATATCGGCACCAGCCCGTTGTATACCCTCAAGGa > 6:114899/1‑104 (MQ=255) gAAGCAGGGGGCATCGCGGTCGGTGGGCCTGCTGGTGGCGGCGGTCGGGGTGGTTTATGGCGATATCGGCACCAGCCCGTTGTATACCCTCAAGGAAGTCTTTACCGGCGGCTACGGGGTGTCGGTCAACCATGATGGCGTGCTgggg < 3:319959/148‑1 (MQ=255) gAAGCAGGGGGCATCGCGGTCGGTGGGCCTGCTGGTGGCGGCGGTCGGGGTGGTTTATGGCGATATCGGCACCAGCCCGTTGTATACCCTCAAGGAAGTCTTTACCGGCGGCTACGGGGTGTCGGTCAACCATGATGGCGTGCTgggg > 4:319959/1‑148 (MQ=255) aGCAGGGGGCATCGCGGGCGGTGGGCCTGCTGGTGGCGGCGGTCGGGGTGGTTTATGGCGATATCGGCACCAGCCCGTTGTATACCCTCAAGGAAGTCTTTACCGGCGGCTACGGGGTGTCGGTCAACCATGATGGCGTGCTGGGGacc < 3:213369/149‑3 (MQ=255) gCATCGCGGTCGGTGGGCCTGCTGGTGGCGGCGGTCGGGGTGGTTTATGGCGATATCGGCACCAGCCCGTTGTATACCCTCAAGGAAGTCTTTACCGGCGGCTACGGGGTGTCGGTCAACCatg < 3:120254/124‑1 (MQ=255) gCATCGCGGTCGGTGGGCCTGCTGGTGGCGGCGGTCGGGGTGGTTTATGGCGATATCGGCACCAGCCCGTTGTATACCCTCAAGGAAGTCTTTACCGGCGGCTACGGGGTGTCGGTCAACCatg > 4:120254/1‑124 (MQ=255) gCATCGCGGTCGGTGGGCCTGCTGGTGACGGCGGTCGGGGTGGTTTATGGCGATATCGGCACCAGCCCGTTGTATACCCTCAAGGAAGTCTTTACCGGCGGCTACGGGGTGTCGGTCAACCATGATGGCGTGCTGGGGATCCtctcatg > 1:10017/1‑146 (MQ=255) ccTGCTGGTGGCGGCGGTCGGGGTGGTTTATGGCGATATCGGcaccagcaggcccaccgaccgcgatgccccctgcttcccctcgtgcccgctctcagcgtgactgcttgcctgaaccatc < 8:251814‑M2/121‑80 (MQ=255) ccTGCTGGTGGCGGCGGTCGGGGTGGTTTATGGCGATATCGGcaccagcaggcccaccgaccgcgatgccccctgcttcccctcgtgcccgctctcagcgtgactgcttgcctgaaccatc > 7:251814‑M2/1‑42 (MQ=255) ctgctgGTGGCGGCGGTCGGGGTGGTTTATGGCGATATCGGCACCAGCCCGTTGTATACCCTCAAGGAAGTCTTTACCGGCGGCTACGGGGTGTCGGTCAACCATGATGGCGTGCTGGGGATCCTCTCGCTGATCCTGTGGTCgctgct > 8:108382/1‑149 (MQ=255) gctgGTGccgatatcgccataaaccaccccgaccgccgccaccagcaggcccaccgaccgcgatgccccctgcttcccctcgtgcccgctctcagcgtgactgcttgcctgacccatcgaccactcccgcaaacggccatcacggccct > 3:36606‑M1/1‑7 (MQ=255) gctgGTGGCGGCGGTCGGGGTGGTTTATGGCGATATCGGcaccagcaggcccaccgaccgcgatgccccctgcttcccctcgtgcccgctctcagcgtgactgcttgcctgaaccatcgcccactcccgcaaacggccatcacggccct < 2:330067‑M2/149‑111 (MQ=255) tggtggCGGCGGTCGGGGTGGTTTATGGCGATATCGGCACCAGCCCGTTGTATACCCTCAAGGAAGTCTTTACCGGCGGCTACGGGGTGTCGGTCAACCATGATGGCGTGCTGGGGATCCTCTCGCTGATCCTGTGGTCGCTGCTgtgg < 3:124815/149‑1 (MQ=255) tggtggCGGCGGTCGGGGTGGTTTATGGCGATATCGGCACCAGCCCGTTGTATACCCTCAAGGAAGTCTTTACCGGCGGCTACGGGGTGTCGGTCAACCATGATGGCGTGCTGGGGATCCTCTCGCTGATCCTGTGGTCGCTGCTgtgg < 1:126243/149‑1 (MQ=255) | TTCCAGGGCCTGGTGGCAGATTGATTACCAAGGGCCGTGATGGCCGTTTGCGGGAGTGGTCGATGGTTCAGGCAAGCAGTCACGCTGAGAGCGGGCACGAGGGGAAGCAGGGGGCATCGCGGTCGGTGGGCCTGCTGGTGGCGGCGGTCGGGGTGGTTTATGGCGATATCGGCACCAGCCCGTTGTATACCCTCAAGGAAGTCTTTACCGGCGGCTACGGGGTGTCGGTCAACCATGATGGCGTGCTGGGGATCCTCTCGCTGATCCTGTGGTCGCTGCTGTGG > NC_002947/1374319‑1374602 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |