New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1411164 | 54 (1.000) | 3 (0.060) | 3/254 | NT | 5.9% | coding (771/1437 nt) | PP_1232 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 1411189 | 44 (0.850) | coding (746/1437 nt) | PP_1232 | hypothetical protein |
GCCAGGCCATAACGTGCGGCGTCCAGCTTTGGGTCTTCGTCCAGTTGGGCGCGGAAGCGCTTGGCGGCAAGCCCCGGTGTGCCCTCGTAGATCAGTGCCACCCGGGCGCGGATCAGTTG‑GTAGCGCATGCTGTCTTCAATGCCACCCTTGGGCGCCTGGTCGGCGCGGTTACGGGTGTCGGCAATACGTGATTCGGTCACCGGGTGGGTCAGCAGGAATTCCGGCGGTTTGGCGTCATAGCGATACTGGCGTGCCAGGCGCTCGAACATGGTCGGCATGTTGCGTGGATCGTAGC > NC_002947/1411018‑1411312 | gcCAGGCCATAACGTGCGGCGTCCAGCTTTGGGTCTTCGTCCAGTTGGGCGCGGAAGCGCTTGGCGGCAAGCCCCGGTGTGCCCTCGTAGATCAGTGCCACCCGGGCGCGGATCAGTTG‑GTAGCGCATGCTGTCTTCAATGCCACCCtt > 3:281154‑M2/3‑149 (MQ=255) caggccaTAACGTGCGGCGTCCAGCTTTGGGTCTTCGTCCAGTTGGGCGCGGAAGCGCTTGGCGGCAAGCCCCGGTGTGCCCTCGTAGATCAGTGCCACCCGGGCGCGGATCAGTTG‑GTAGCGCATGCTGTCTTCAATGCCACCCTTgg > 6:141778/1‑149 (MQ=255) caTAACGTGCGGCGTCCAGCTTTGGGTCTTCGTCCAGTTGGGCGCGGAAGCGCTTGGCGGCAAGCCCCGGTGTGCCCTCGTAGATCAGTGCCACCCGGGCGCGGATCAGTTG‑GTAGCGCATGCTGTCTTCAATGCCACCCTTGGGCGcc > 5:93194/1‑149 (MQ=255) aaCGTGCGGCGTCCAGCTTTGGGTCTTCGTCCAGTTGGGCGCGGAAGCGCTTGGCGGCAAGCCCCGGTGTGCCCTCGTAGATCAGTGCCACCCGGGCGCGGATCAGTTG‑GTAGCGCATGCTGTCTTCAATGCCACCCTTGGGCGCCTgg > 4:195789/1‑149 (MQ=255) gTGCGGCGTCCAGCTTTGGGTCTTCGTCCAGTTGGGCGCGGAAGCGCTTGGCGGCAAGCCCCGGTGTGCCCTCGTAGATCAGTGCCACCCGGGCGCGGATCAGTTG‑GTAGCGCATGCTGTCTTCAATGCCACCCTTGGGCGCCTGGTCg > 7:35511/1‑149 (MQ=255) ggcggcCAGCTTTGGGTCTTCGTCCAGTTGGGCGCGGAAGCGCTTGGCGGCAAGCCCCGGTGTGCCCTCGTAGATCAGTGCCACCCGGGCGCGGATCAGTTG‑GTAGCGCATGCTGTCTTCAATGCCACCCTTGGGCGCCTGGTCGgcgc < 5:9699/149‑1 (MQ=255) ggcgTCCAGCTTTGGGTCTTCGTCCAGTTGGGCGCGGAAGCGCTTGGCGGCAAGCCCCGGTGTGCCCTCGTAGATCAGTGCCACCCGGGCGCGGATCAGTTG‑GTAGCGCATGCTGTCTTCAATGCCACCCTTGGGCGCCTGGTCGgcgc < 6:93194/149‑1 (MQ=255) gTCCAGCTTTGGGTCTTCGTCCAGTTGGGCGCGGAAGCGCTTGGCGGCAAGCCCCGGTGTGCCCTCGTAGATCAGTGCCACCCGGGCGCGGATCAGTTG‑GTAGCGCATGCTGTCTTCAATGCCACCCTTGGGCGCCTGGTCGGCGCGGt < 3:276753/149‑1 (MQ=255) ccAGCTTTGGGTCTTCGTCCAGTTGGGCGCGGAAGCGCTTGGCGGCAAGCCCCGGTGTGCCCTCGTAGATCAGTGCCACCCGGGCGCGGATCAGTTG‑GTAGCGCATGCTGTCTTCAATGCCACCCTTGGGCGCCTGGTCGGCGCGGTTa > 1:56602/1‑149 (MQ=255) cAGCTTTGGGTCTTCGTCCAGTTGGGCGCGGAAGCGCTTGGCGGCAAGCCCCGGTGTGCCCTCGTAGATCAGTGCCACCCGGGCGCGGATCAGTTG‑GTAGCGCATGCTGTCTTCAATGCCACCCTTGGGCGCCTGGTCGGCGCGGTTAc > 4:73128/1‑149 (MQ=255) aGCTTTGGGTCTTCGTCCAGTTGGGCGCGGAAGCGCTTGGCGGCAAGCCCCGGTGTGCCCTCGTAGATCAGTGCCACCCGGGCGCGGATCAGTTG‑GTAGCGCATGCTGTCTTCAATGCCACCCTTGGGCGCCTGGTCGGCGCGGTTACg > 7:242885‑M2/1‑148 (MQ=255) cTTTGGGTCTTCGTCCAGTTGGGCGCGGAAGCGCTTGGCGGCAAGCCCCGGTGTGCCCTCGTAGATCAGTGCCACCCGGGCGCGGATCAGTTG‑GTAGCGCATGCTGTCTTCAATGCCACCCTTGGGCGCCTGGTCGGCGCGGTTACggg > 4:10660‑M2/1‑146 (MQ=255) tttGGGTCTTCGTCCAGTTGGGCGCGGAAGCGCTTGGCGGCAAGCCCCGGTGTGCCCTCGTAGATCAGTGCCACCCGGGCGCGGATCAGTTG‑GTAGCGCATGCTGTCTTCAATGCCACCCTTGGGCGCCTGGTCGGCGCGGTTACgggt < 1:244324‑M2/149‑5 (MQ=255) tttGGGTCTTCGTCCAGTTGGGCGCGGAAGCGCTTGGCGGCAAGCCCCGGTGTGCCCTCGTAGATCAGTGCCACCCGGGCGCGGATCAGTTG‑GTAGCGCATGCTGTCTTCAATGCCACCCTTGGGCGCCTGGTCGGCGCGGTTACgggt < 7:226776‑M2/149‑5 (MQ=255) gggTCTTCGTCCAGTTGGGCGCGGAAGCGCTTGGCGGCAAGCCCCGGTGTGCCCTCGTAGATCAGTGCCACCCGGGCGCGGATCAGTTG‑GTAGCGCATGCTGTCTTCAATGCCACCCTTGGGCGCCTGGTCGGCGCGGTTACGGgtgt < 2:56602/148‑1 (MQ=255) gTCTTCGTCCAGTTGGGCGCGGAAGCGCTTGGCGGCAAGCCCCGGTGTGCCCTCGTAGATCAGTGCCACCCGGGCGCGGATCAGTTG‑GTAGCGCATGCTGTCTTCAATGCCACCCTTGGGCGCCTGGTCGGCGCGGTTACGGGTGTCgg < 8:171585/149‑1 (MQ=255) gTCTTCGTCCAGTTGGGCGCGGAAGCGCTTGGCGGCAAGCCCCGGTGTGCCCTCGTAGATCAGTGCCACCCGGGCGCGGATCAGTTG‑GTAGCGCATGCTGTCTTCAATGCCACCCTTGGGCGCCTGGTCGGCGCGGTTACGGGTGTCgg > 4:305002/1‑149 (MQ=255) gTCTTCGTCCAGTTGGGCGCGGAAGCGCTTGGCGGCAAGCCCCGGTGTGCCCTCGTAGATCAGTGCCACCCGGGCGCGGATCAGTTG‑GTAGCGCATGCTGTCTTCAATGCCACCCTTGGGCGCCTGGTCGGCGCGGTTACGGGTGTCgg < 8:226776/149‑1 (MQ=255) gTCTTCGTCCAGTTGGGCGCGGAAGCGCTTGGCGGCAAGCCCCGGTGTGCCCTCGTAGATCAGTGCCACCCGGGCGCGGATCAGTTG‑GTAGCGCATGCTGTCTTCAATGCCACCCTTGGGCGCCTGGTCGGCGCGGTTACGGGTGTCgg < 1:103636/149‑1 (MQ=255) tCTTCGTCCAGTTGGGCGCGGAAGCGCTTGGCGGCAAGCCCCGGTGTGCCCTCGTAGATCAGTGCCACCCGGGCGCGGATCAGTTG‑GTAGCGCATGCTGTCTTCAATGCCACCCTTGGGCGCCTGGTCGGCGCGGTTACGGGTGTCGGc < 1:30828/149‑1 (MQ=255) ttCGTCCAGTTGGGCGCGGAAGCGCTTGGCGGCAAGCCCCGGTGTGCCCTCGTAGATCAGTGCCACCCGGGCGCGGATCAGTTG‑GTAGCGCATGCTGTCTTCAATGCCACCCgtaaccgcgccgaccaggcgcccaagggtggcattg > 2:288188‑M1/1‑112 (MQ=255) cGTCCAGTTGGGCGCGGAAGCGCTTGGCGGCAAGCCCCGGTGTGCCCTCGTAGATCAGTGCCACCCGGGCGCGGATCAGTTG‑GTAGCGCATGCTGTCTTCAATGCCACCCgtaaccgcgccgaccaggcgcccaagggtggcattgaa < 4:295963‑M1/148‑39 (MQ=255) cGTCCAGTTGGGCGCGGAAGCGCTTGGCGGCAAGCCCCGGTGTGCCCTCGTAGATCAGTGCCACCCGGGCGCGGATCAGTTG‑GTAGCGCATGCTGTCTTCAATGCCACCCTTGGGCGCCTGGTCGGCGCGGTTACGGGTGTCGGCaa < 3:195789/147‑1 (MQ=255) gTCCAGTTGGGCGCGGAAGCGCTTGGCGGCAAGCCCCGGTGTGCCCTCGTAGATCAGTGCCACCCGGGCGCGGATCAGTTG‑GTAGCGCATGCTGTCTTCAATGCCACCCTTGGGCGCCTGGTCGGCGCGGTTACGGGTGTCGGCAATAc < 4:260470/149‑1 (MQ=255) gTCCAGTTGGGCGCGGAAGCGCTTGGCGGCAAGCCCCGGTGTGCCCTCGTAGATCAGTGCCACCCGGGCGCGGATCAGTTG‑GTAGCGCATGCTGTCTTCAATGCCACCCTTGGGCGCCTGGTCGGCGCGGTTACGGGTGTCGGCAATAc < 3:73128/149‑1 (MQ=255) tCCAGTTGGGCGCGGAAGCGCTTGGCGGCAAGCCCCGGTGTGCCCTCGTAGATCAGTGCCACCCGGGCGCGGATCAGTTG‑GTAGCGCATGCTGTCTTCAATGCCACCCTTGGGCGCCTGGTCGGCGCGGTTACGGGTGTCGGctggctt > 3:100893/1‑143 (MQ=255) cAGTTGGGCGCGGAAGCGCTTGGCGGCAAGCCCCGGTGTGCCCTCGTAGATCAGTGCCACCCGGGCGCGGATCAGTTG‑GTAGCGCATGCTGTCTTCAATGCCACCCgtaaccgcgccgaccaggcgcccaagggtggcattgaagaca < 1:288188‑M1/148‑43 (MQ=255) gTTGGGCGCGGAAGCGCTTGGCGGCAAGCCCCGGTGTGCCCTCGTAGATCAGTGCCACCCGGGCGCGGATCAGTTG‑GTAGCGCATGCTGTCTTCAATGCCACCCTTGGGCGCCTGGTCGGCGCGGTTACGGGTGTCGGCAATACGTGAt > 2:7259/1‑149 (MQ=255) gcgGAAGCGCTTGGCGGCAAGCCCCGGTGTGCCCTCGTAGATCAGTGCCACCCGGGCGCGGATCAGTTG‑GTAGCGCATGCTGTCTTCAATGCCACCCTTGGGCGCCTGGTCGGCGCGGTTACGGGTGTCGGCAATACGTGATTCGGTCa > 4:293082/1‑149 (MQ=255) gcgcTTGGCGGCAAGCCCCGGTGTGCCCTCGTAGATCAGTGCCACCCGGGCGCGGATCAGTTG‑GTAGCGCATGCTGTCTTCAATGCCACCCTTGGGCGCCTGGTCGGCGCGGTTACGGGTGTCGGCAATACGTGATTCGGTCACCgggt < 5:141778/149‑1 (MQ=255) gcTTGGCGGCAAGCCCCGGTGTGCCCTCGTAGATCAGTGCCACCCGGGCGCGGATCAGTTG‑GTAGCGCATGCTGTCTTCAATGCCACCCTTGGGCGCCTGGTCGGCGCGGTTACGGGTGTCGGCAATACGTGATTCGGTCACCgggtgg < 4:281154/149‑1 (MQ=255) ttGGCGGCAAGCCCCGGTGTGCCCTCGTAGATCAGTGCCACCCGGGCGCGGATCAGTTG‑GTAGCGCATGCTGTCTTCAATGCCACCCTTGGGCGCCTGGTCGGCGCGGTTACGGGTGTCGGCAATACGTGATTCGGTCACCgggtgggt > 4:328132/1‑149 (MQ=255) ttGGCGGCAAGCCCCGGTGTGCCCTCGTAGATCAGTGCCACCCGGGCGCGGATCAGTTG‑GTAGCGCATGCTGTCTTCAATGCCACCCTTGGGCGCCTGGTCGGCGCGGTTACGGGTGTCGGCAATACGTGATTCGGTCACCggg < 2:14264/144‑1 (MQ=255) ttGGCGGCAAGCCCCGGTGTGCCCTCGTAGATCAGTGCCACCCGGGCGCGGATCAGTTG‑GTAGCGCATGCTGTCTTCAATGCCACCCTTGGGCGCCTGGTCGGCGCGGTTACGGGTGTCGGCAATACGTGATTCGGTCACCggg > 1:14264/1‑144 (MQ=255) ggcggcAAGCCCCGGTGTGCCCTCGTAGATCAGTGCCACCCGGGCGCGGATCAGTTG‑GTAGCGCATGCTGTCTTCAATGCCACCCTTGGGCGCCTGGTCGGCGCGGTTACGGGTGTCGGCAATACGTGATTCGGTCACCGGGTGGGTca < 4:36657/149‑1 (MQ=255) cggcAAGCCCCGGTGTGCCCTCGTAGATCAGTGCCACCCGGGCGCGGATCAGTTG‑GTAGCGCATGCTGTCTTCAATGCCACCCTTGGGCGCCTGGTCGGCGCGGTTACGGGTGTCGGCAATACGTGAtt > 1:212291/1‑129 (MQ=255) cggcAAGCCCCGGTGTGCCCTCGTAGATCAGTGCCACCCGGGCGCGGATCAGTTG‑GTAGCGCATGCTGTCTTCAATGCCACCCTTGGGCGCCTGGTCGGCGCGGTTACGGGTGTCGGCAATACGTGAtt < 2:212291/129‑1 (MQ=255) gcAAGCCCCGGTGTGCCCTCGTAGATCAGTGCCACCCGGGCGCGGATCAGTTG‑GTAGCGCATGCTGTCTTCAATGCCACCCTTGGGCGCCTGGTCGGCGCGGTTACGGGTGTCGGCAATACGTGATTCGGTCACCGGGTGGGTcagcag > 4:66559/1‑149 (MQ=255) gcAAGCCCCGGTGTGCCCTCGTAGATCAGTGCCACCCGGGCGCGGATCAGTTG‑GTAGCGCATGCTGTCTTCAATGCCACCCTTGGGCGCCTGGTCGGCGCGGTTACGGGTGTCGGCAATACGTGATTCGGTCACCGGGTGGGTcagcag < 3:328132/149‑1 (MQ=255) gtgtGCCCTCGTAGATCAGTGCCACCCGGGCGCGGATCAGTTG‑GTAGCGCATGCTGTCTTCAATGCCACCCTTGGGCGCCTGGTCGGCGCGGTTACGGGTGTCGGCAATACGTGATTCGGTCACCGGGTGGGTCAGCAGGAATTCcggc < 3:268762/149‑1 (MQ=255) tgtgCCCTCGTAGATCAGTGCCACCCGGGCGCGGATCAGTTG‑GTAGCGCATGCTGTCTTCAATGCCACCCTTGGGCGCCTGGTCGGCGCGGTTACGGGTGTCGGCAATACGTGATTCGGTCACCGGGTGGGTCAGCAGGAATTCcggcg < 3:305002/149‑1 (MQ=255) cccTCGTAGATCAGTGCCACCCGGGCGCGGATCAGTTG‑GTAGCGCATGCTGTCTTCAATGCCACCCTTGGGCGCCTGGTCGGCGCGGTTACGGGTGTCGGCAATACGTGATTCGGTCACCGGGTGGGTCAGCAGGAATTCCGGCGGttt > 6:67288/1‑149 (MQ=255) ccTCGTAGATCAGTGCCACCCGGGCGCGGATCAGTTG‑GTAGCGCATGCTGTCTTCAATGCCACCCTTGGGCGCCTGGTCGGCGCGGTTACGGGTGTCGGCAATACGTGATTCGGTCACCGGGTGGGTCAGCAGGAATTCCGGCGGTTTg < 3:293082/149‑1 (MQ=255) cTCGTAGATCAGTGCCACCCGGGCGCGGATCAGTTG‑GTAGCGCATGCTGTCTTCAATGCCACCCTTGGGCGCCTGGTCGGCGCGGTTACGGGTGTCGGCAATACGTGATTCGGTCACCGGGTGGGTCAGCAGGAATTCCGGCGGTTTgg > 7:251228/1‑149 (MQ=255) gTAGATCAGTGCCACCCGGGCGCGGATCAGTTG‑GTAGCGCATGCTGTCTTCAATGCCACCCTTGGGCGCCTGGTCGGCGCGGTTACGGGTGTCGGCAATACGTGATTCGGTCACCGGGTGGGTCAGCAGGAATTCCGGCGGTTTGGc < 2:244324/147‑1 (MQ=255) gTAGATCAGTGCCACCCGGGCGCGGATCAGTTG‑GTAGCGCATGCTGTCTTCAATGCCACCCTTGGGCGCCTGGTCGGCGCGGTTACGGGTGTCGGCAATACGTGATTCGGTCACCGGGTGGGTCAGCAGGAATTCCGGCGGTTTGGCGt > 7:314217/1‑149 (MQ=255) tAGATCAGTGCCACCCGGGCGCGGATCAGTTG‑GTAGCGCATGCTGTCTTCAATGCCACCCTTGGGCGCCTGGTCGGCGCGGTTACGGGTGTCGGCAATACGTGATTCGGTCACCGGGTGGGTCAGCAGGAATTCCGGCGGTTTGGCGTc < 5:67288/149‑1 (MQ=255) atgaGTGCCACCCGGGGGCGGATCAGTTG‑GTAGCGCATGCTGGCTTCAATGGCACCCTTGGGCGCCTGGTGGGCGGGGTTAGGGGTGTCGGGAATACGTGATTCGGTCTCCGGGTGGGTCAGCAGGTATTCCGGCGGTTTGGCGTCATa < 4:92028/146‑1 (MQ=255) aTCAGTGCCACCCGGGCGCGGATCAGTTGCGTAGCGCATGCTGTCTTCAATGCCACCCtt < 1:203545/60‑1 (MQ=255) aTCAGTGCCACCCGGGCGCGGATCAGTTG‑GTAGCGCATGCTGTCTTCAATGCCACCCtt > 2:203545/1‑59 (MQ=255) aTCAGTGCCACCCGGGCGCGGATCAGTTG‑GTAGCGCATGCTGTCTTCAATGCCACCCTTGGGCGCCTGGTCGGCGCGGTTACGGGTGTCGGCAATACGTGATTCGGTCACCGGGTGGGTCAGCAGGAATTCCGGCGGTTTGGCGTCa > 2:230398/1‑147 (MQ=255) aTCAGTGCCACCCGGGCGCGGATCAGTTG‑GTAGCGCATGCTGTCTTCAATGCCACCCTTGGGCGCCTGGTCGGCGCGGTTACGGGTGTCGGCAATACGTGATTCGGTCACCGGGTGGGTCAGCAGGAATTCCGGCGGTTTGGCGTCa > 6:192249/1‑147 (MQ=255) aCCCGGGCGCGGATCAGTTG‑GTAGCGCATGCTGTCTTCAATGCCACCCTTGGGCGCCTGGTCGGCGCGGTTACGGGTGTCGGCAATACGTGATTCGGTCACCGGGTGGGTCAGCAGGAATTCCGGCGGTTTGGCGTCATAGCGATACTg < 2:100361/149‑1 (MQ=255) aCCCGGGCGCGGATCAGTTG‑GTAGCGCATGCTGTCTTCAATGCCACCCTTGGGCGCCTGCTCGGCGCGGTTACGGGTGTCGGCAATACGTGATTCGGTCACCGGGTGGGTCAGCAGGAATTCCGGCGGTTTGGCGTCATAGCGATACTg > 2:125165/1‑149 (MQ=255) ccGGGCGCGGATCAGTTG‑GTAGCGCATGCTGTCTTCAATGCCACCCTTGGGCGCCTGGTCGGCGCGGTTACGGGTGTCGGCAATACGTGATTCGGTCACCGGGTGTGTCAGCAGGAATTCCGGCGGTTTGGCGTCATAGCGATACTGGc < 1:125165/149‑1 (MQ=255) ccGGGCGCGGATCAGTTG‑GTAGCGCATGCTGTCTTCAATGCCACCCTTGGGCGCCTGGTCGGCGCGGTTACGGGTGTCGGCAATACGTGATTCGGTCACCGGGTGGGTCAGCAGGAATTCCGGCGGTTTGGCGTCATAGCGATACTGGc < 8:251228/149‑1 (MQ=255) tCAGTTG‑GTAGCGCATGCTGTCTTCAATGCCACCCTTGGGCGCCTGGTCGGCGCGGTTACGGGTGTCGGCAATACGTGATTCGGTCACCGGGTGGGTCAGCAGGAAt < 6:39516/107‑1 (MQ=255) cAGTTG‑GTAGCGCATGCTGTCTTCAATGCCACCCTTGGGCGCCTGGTCGGCGCGGTTACGGGTGTCGGCAATACGTGATTCGGTCACCGGGTGGGTCAGCAGGAATTCCGGCGGTTTGGCGTCATAGCGATACTGGCGTGCCAGGCGCt > 4:284748/1‑149 (MQ=255) gTAGCGCATGCTGTCTTCAATGCCACCCTTGGGCGCCTGGTCGGCGCGGTTACGGGTGTCGGCAATACGTGATTCGGTCACCGGGTGGGTCAGCAGGAATTCCGGCGGTTTGGCGTCATAGCGATACTGGCGTGCCAGGCGCTCGAACa < 8:314217/149‑1 (MQ=255) tGCTGTCTTCAATGCCACCCTTGGGCGCCTGGTCGGCGCGGTTACGGGTGTCGGCAATACGTGATTCGGTCACCGGGTGGGTCAGCAGGAATTCCGGCGGTTTGGCGTCATAGCGATACTGGCGTGCCAGGCGCTCGAACATGGTCGGc < 1:230398/149‑1 (MQ=255) tGTCTTCAATGCCACCCTTGGGCGCCTGGTCGGCGCGGTTACgggtggcattgaagacagcatgcgctaccaactgatccgcgcccgggtggcactgatctacgagggcacaccggggcttgccgccaagcgcttccgcgcccaactg < 1:288188‑M2/148‑107 (MQ=255) tCTTCAATGCCACCCTTGGGCGCCTGGTCGGCGCGGTTACGGGTGTCGGCAATACGTGATTCGGTCACCGGGTGGGTCAGCAGGAATTCCGGCGGTTTGGCGTCATAGCGATACTGGCGTGCCAGGCGCTCGAACATGGTCGGCATGtt > 1:154999/1‑149 (MQ=255) tCTTCAATGCCACCCTTGGGCGCCTGGTCGGCGCGGTTACGGGTGTCGGCAATACGTGATTCGGTCACCGGGTGGGTCAGCAGGAATTACGGCGGTTTGGCGTCATAGCGATACTGGCGTGCCAGGCGCTCGAACATGGTCGGCATGtt > 2:125452/1‑149 (MQ=255) ttCAATGCCACCCTTGGGCGCCTGGTCGGCGCGGTTACgggtggcattgaagacagcatgcgctaccaactgatccgcgcccgggtggcactgatctacgagggcacaccggggcttgccgccaagcgcttccgcgcccaactggacg < 4:295963‑M2/148‑111 (MQ=255) cAATGCCACCCTTGGGCGCCTGGTCGGCGCGGTTACgggtggcattgaagacagcatgcgctaccaactgatccgcgcccgggtggcactgatctacgagggcacaccggggcttgccgccaagcgcttccgcgcccaactggacgaa > 2:288188‑M2/1‑36 (MQ=255) aaTGCCACCCTTGGGCGCCTGGTCGGCGCGGTTACGGGTGTCGGCAATACGTGATTCGGTCACCGGGTGGGTCAGCAGGAATTCCGGCGGTTTGGCGTCATAGCGATACTGGCGTGCCAGGCGCTCGAACATGGTCGGCATGTTGCGt < 3:284748/148‑1 (MQ=255) aTGCCACCCTTGGGCGCCTGGTCGGCGCGGTTACGGGTGTCGGCAATACGTGATTCGGTCACCGGGTGGGTCAGCAGGAATTCCGGCGGTTTGGCGTCATAGCGATACTGGCGTGCCAGGCGCTCGAACATGGTCGGCATGTTGCGTgg > 3:308667/1‑149 (MQ=255) ccACCCTTGGGCGCCTGGTCGGCGCGGTTACGGGTGTCGGCAATACGTGATTCGGTCACCGGGTGGGTCAGCAGGAATTCCGGCGGTTTGGCGTCATAGCGATACTGGCGTGCCAGGCGCTCGAACATGGTCGGCATGTTGCGTGGAt < 1:7259/148‑1 (MQ=255) aCCCgtaaccgcgccgaccaggcgcccaagggtggcattgaagacagcatgcgctaccaactgatccgcgcccgggtggcactgatctacgagggcacaccggggcttgccgccaagcgcttccgcgcccaactggacgaagacccaaa < 7:226776‑M1/149‑146 (MQ=255) aCCCgtaaccgcgccgaccaggcgcccaagggtggcattgaagacagcatgcgctaccaactgatccgcgcccgggtggcactgatctacgagggcacaccggggcttgccgccaagcgcttccgcgcccaactggacgaagacccaaa < 1:244324‑M1/149‑146 (MQ=255) cccgtaaccgcgccgaccaggcgcccaagggtggcattgaagacagcatgcgctaccaactgatccgcgcccgggtggcactgatctacgagggcacaccggggcttgccgccaagcgcttccgcgcccaactggacgaagacccaaag > 4:10660‑M1/1‑3 (MQ=255) cccTTGGGCGCCTGGTCGGCGCGGTTACGGGTGTCGGCAATACGTGATTCGGTCACCGGGTGGGTCAGCAGGAATTCCGGCGGTTTGGCGTCATAGCGATACTGGCGTGCCAGGCGCTCGAACATGGTGGGCATGTTGCGTGGATCg > 4:294770/1‑147 (MQ=255) cgtaaccgcgccgaccaggcgcccaagggtggcattgaagacagcatgcgctaccaactgatccgcgcccgggtggcactgatctacgagggcacaccggggcttgccgccaagcgcttccgcgcccaactggacgaagacccaaagct > 7:242885‑M1/1‑1 (MQ=255) | GCCAGGCCATAACGTGCGGCGTCCAGCTTTGGGTCTTCGTCCAGTTGGGCGCGGAAGCGCTTGGCGGCAAGCCCCGGTGTGCCCTCGTAGATCAGTGCCACCCGGGCGCGGATCAGTTG‑GTAGCGCATGCTGTCTTCAATGCCACCCTTGGGCGCCTGGTCGGCGCGGTTACGGGTGTCGGCAATACGTGATTCGGTCACCGGGTGGGTCAGCAGGAATTCCGGCGGTTTGGCGTCATAGCGATACTGGCGTGCCAGGCGCTCGAACATGGTCGGCATGTTGCGTGGATCGTAGC > NC_002947/1411018‑1411312 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |