New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1558475 | 59 (1.100) | 4 (0.080) | 3/248 | NT | 6.6% | coding (426/732 nt) | PP_1369 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 1558529 | 57 (1.130) | coding (372/732 nt) | PP_1369 | hypothetical protein |
GCGCTGGCATTGCCAGTCGCACAGCGTGCGGGACAGTTTGCGACGCCATGCGCTCCGGGCGCTCCAGACCAGGCCTGGCGCATCAATCGCCGTAAAGTCTGGCAAGCGGTACAGATGCTGAGGTGTACTGGTGTATTTCAGTGGCAGGCGGCACAGCGCTTGCCGCGTG‑CCCTGGCTCATGAGCCAG‑GCCGGTGCGACAAACCCTGCCACAGGCCACCCTTGGTCCTCG‑AACAGTG‑CCAGGCCCTCCTGTAGCCGGGTAAGCGCTTCGTTCTCATCAAGGCTGTAGAACTC > NC_002947/1558328‑1558618 | gcgcTGGCATTGCCAGTCGCACAGCGTGCGGGACAGTTTGCGACGCCATGCGCTCCGGGCGCTCCAGACCAGGCCTGGCGCATCAATCGCCGTAAAGTCTGGCAAGCGGTACAGATGCTGAGGTGTACTGGTGTATTTCAGTGGCAggc < 4:306729/149‑1 (MQ=255) gcTGGCATTGCCAGTCGCACAGCGTGCGGGACAGTTTGCGACGCCATGCGCTCCGGGCGCTCCAGACCAGGCCTGGCGCATCAATCGCCGTAAAGTCTGGCAAGCGGTACAGATGCTGAGGTGTACTGGTGTATTTCAGTGGCAggcgg < 3:188170/149‑1 (MQ=255) gCATTGCCAGTCGCACAGCGTGCGTGAAAGTTTGCGACGCCATGCGCTCCGTGCGCTCCAGACCAGGCCTGGCGCATCAATCGACGTAAAGTCTGGCAAGCGGTACAGATGCTGAGGTGTACTGGTGTATTTCAGTGGCAGGCGGcaca < 1:51912/149‑1 (MQ=255) gCATTGCCAGTCGCACAGCGTGCGGGACAGTTTGCGACGCCATGCGCTCCGGGCGCTCCAGACCAGGCCTGGCGCATCAATCGCCGTAAAGTCTGGCAAGCGGTACAGATGCTGAGGTGTACTGGTGTATTTCAGTGGCAGGCGGca > 1:201820/1‑147 (MQ=255) gCATTGCCAGTCGCACAGCGTGCGGGACAGTTTGCGACGCCATGCGCTCCGGGCGCTCCAGACCAGGCCTGGCGCATCAATCGCCGTAAAGTCTGGCAAGCGGTACAGATGCTGAGGTGTACTGGTGTATTTCAGTGGCAGGCGGca < 1:231019/147‑1 (MQ=255) aTTGCCAGTCGCACAGCGTGCGGGACAGTTTGCGACGCCATGCGCTCCGGGCGCTCCAGACCAGGCCTGGCGCATCAATCGCCGTAAAGTCTGGCAAGCGGTACAGATGCTGAGGTGTACTGGTGTATTTCAGTGGCAGGCGGCACAgc > 7:33013/1‑149 (MQ=255) aTTGCCAGTCGCACAGCGTGCGGGACAGTTTGCGACGCCATGCGCTCCGGGCGCTCCAGACCAGGCCTGGCGCATCAATCGCCGTAAAGTCTGGCAAGCGGTACAGATGCTGAGGTGTACTGGTGTATTTCAGTGGCAGGCGGCACAgc > 7:151592/1‑149 (MQ=255) aTTGCCAGTCGCACAGCGTGCGGGACAGTTTGCGACGCCATGCGCTCCGGGCGCTCCAGACCAGGCCTGGCGCATCAATCGCCGTAAAGTCTGGCAAGCGGTACAGATGCTGAGGTGTACTGGTGTATTTCAGTGGCAGGCGGCACAgc > 2:73085/1‑149 (MQ=255) ccAGTCGCACAGCGTGCGGGACAGTTTGCGACGCCATGCGCTCCGGGCGCTCCAGACCAGGCCTGGCGCATCAATCGCCGTAAAGTCTGGCAAGCGGTACAGATGCTGAGGTGTACTGGTGTATTTCAGTGGCAGGCGGCACAGCGCtt < 2:148381/149‑1 (MQ=255) aGTCGCACAGCGTGCGGGACAGTTTGCGACGCCATGCGCTCCGGGCGCTCCAGACCAGGCCTGGCGCATCAATCGCCGTAAAGTCTGGCAAGCGGTACAGATGCTGAGGTGTACTGGTGTATTTCAGTGGCAGGCGGCACAGCGCTTGc > 8:8500/1‑149 (MQ=255) gTCGCACAGCGTGCGGGACAGTTTGCGACGCCATGCGCTCCGGGCGCTCCAGACCAGGCCTGGCGCATCAATCGCCGTAAAGTCTGGCAAGCGGTACAGATGCTGAGGTGTACTGGTGTATTTCAGTGGCAGGCGGCACAGCGCTTGcc > 8:248419/1‑149 (MQ=255) gCACAGCGTGCGGGACAGTTTGCGACGCCATGCGCTCCGGGCGCTCCAGACCAGGCCTGGCGCATCAATCGCCGTAAAGTCTGGCAAGCGGTACAGATGCTGAGGTGTACTGGTGTATTTCAGTGGCAGGCGGCACAGCGCTTGCcgcg > 2:245604/1‑149 (MQ=255) acaGCGTGCGGGACAGTTTGCGACGCCATGCGCTCCGGGCGCTCCAGACCAGGCCTGGCGCATCAATCGCCGTAAAGTCTGGCAAGCGGTACAGATGCTGAGGTGTACTGGTGTATTTCAGTGGCAGGCGGCACAGCGCTTGCCGCGt < 8:291877/148‑1 (MQ=255) ggACAGTTTGCGACGCCATGCGCTCCGGGCGCTCCAGACCAGGCCTGGCGCATCAATCGCCGTAAAGTCTGGCAAGCGGTACAGATGCTGAGGTGTACTGGTGTATTTCAGTGGCAGGCGGCACAGCGCTTGCCGCGTG‑CCCTGGCTCa < 4:212848/149‑1 (MQ=255) gACAGTTTGCGACGCCATGCGCTCCGGGCGCTCCAGACCAGGCCTGGCGCATCAATCGCCGTAAAGTCTGGCAAGCGGTCCAGATGCTGAGGTGTACTGGGGTATTTCAGTGGCAGGCGGCACAGCGCTTGCCGCGTG‑CCCTGGCTCAt < 1:62011/149‑1 (MQ=255) gACAGTTTGCGACGCCATGCGCTCCGGGCGCTCCAGACCAGGCCTGGCGCATCAATCGCCGTAAAGTCTGGCAAGCGGTACAGATGCTGAGGTGTACTGGTGTATTTCAGTGGCAGGCGGCACAGCGCTTGCCGCGTG‑CCCTGGCTCAt < 8:203700/149‑1 (MQ=255) cAGTTTGCGACGCCATGCGCTCCGGGCGCTCCAGACCAGGCCTGGCGCATCAATCGCCGTAAAGTCTGGCAAGCGGTACAGATGCTGAGGTGTACTGGTGTATTTCAGTGGCAGGCGGCACAGCGCTTGCCGCGTG‑CCCTGGCTCATGa < 7:8500/149‑1 (MQ=255) aGTTTGCGACGCCATGCGCTCCGGGCGCTCCAGACCAGGCCTGGCGCATCAATCGCCGTAAAGTCTGGCAAGCGGTACAGATGCTGAGGTGTACTGGTGTATTTCAGTGGCAGGCGGCACAGCGCTTGCCGCGTG‑CCCTGGCTCATGAg > 4:142631/1‑149 (MQ=255) gTTTGCGACGCCATGCGCTCCGGGCGCTCCAGACCAGGCCTGGCGCATCAATCGCCGTAAAGTCTGGCAAGCGGTACAGATGCTGAGGTGTACTGGTGTATTTCAGTGGCAGGCGGCACAGCGCTTGCCGCGTG‑CCCTGGCTCATGAGc < 7:248419/149‑1 (MQ=255) tttGCGACGCCATGCGCTCCGGGCGCTCCAGACCAGGCCTGGCGCATCAATCGCCGTAAAGTCTGGCAAGCGGTACAGATGCTGAGGTGTACTGGTGTATTTCAGTGGCAGGgtttgtcgcaccggcctggctcatgagccagggcacg > 2:233680‑M1/1‑112 (MQ=255) cGCCATGCGCTCCGGGCGCTCCAGACCAGGCCTGGCGCATCAATCGCCGTAAAGTCTGGCAAGCGGTACAGATGCTGAGGTGTACTGGTGTATTTCAGTGGCAGGCGGCACAGCGCTTGCCGCGTG‑CCCTGGCTCATGAGCCAG‑GCCgg < 1:135234/149‑1 (MQ=255) ccATGCGCTCCGGGCGCTCCAGACCAGGCCTGGCGCATCAATCGCCGTAAAGTCTGGCAAGCGGTACAGATGCTGAGGTGTACTGGTGTATTTCAGTGGCAGGCGGCACAGCGCTTGCCGCGTG‑CCCTGGCTCATGAGCCAG‑GCCGGTg < 8:59415/149‑1 (MQ=255) cATGCGCTCCGGGCGCTCCAGACCAGGCCTGGCGCATCAATCGCCGTAAAGTCTGGCAAGCGGTACAGATGCTGAGGTGTACTGGTGTATTTCAGTGGCAGGCGGCACAGCGCTTGCCGCGTG‑CCCTGGCTCATGAGCCAG‑GCCGGTGc > 4:220512/1‑149 (MQ=255) cATGCGCTCCGGGCGCTCCAGACCAGGCCTGGCGCATCAATCGCCGTAAAGTCTGGCAAGCGGTACAGATGCTGAGGTGTACTGGTGTATTTCAGTGGCAGGCGGCACAGCGCTTGCCGCGTG‑CCCTGGCTCATGAGCCAG‑GCCGGTGc < 3:220512/149‑1 (MQ=255) gcgcTCCAGACCAGGCCTGGCGCATCAATCGCCGTAAAGTCTGGCAAGCGGTACAGATGCTGAGGTGTACTGGTGTATTTCAGTGGCAGGCGGCACAGCGCTTGCCGCGTG‑CCCTGGCTCATGAGCCAG‑GCCGGTGCGACAAACcctgc > 7:273774‑M2/1‑144 (MQ=255) tCCAGACCAGGCCTGGCGCATCAATCGCCGTAAAGTCTGGCAAGCGGTACAGATGCTGAGGTGTACTGGTGTATTTCAGTGGCAGGCGGCACAGCGCTTGCCGCGTG‑CCCTGGCTCATGAGCCAG‑GCCGGTGCGACAAACcctgcca < 6:183266‑M2/147‑8 (MQ=255) tCCAGACCAGGCCTGGCGCATCAATCGCCGTAAAGTCTGGCAAGCGGTACAGATGCTGAGGTGTACTGGTGTATTTCAGTGGCAGGCGGCACAGCGCTTGCCGCGTG‑CCCTGGCTCATGAGCCAG‑GCCGGTGCGACAAACCCTGCcaca > 2:143690/1‑149 (MQ=255) cAGACCAGGCCTGGCGCATCAATCGCCGTAAAGTCTGGCAAGCGGTACAGATGCTGAGGTGTACTGGTGTATTTCAGTGGCAGGgtttgtcgcaccggcctggctcatgagccagggcacgcggcaagcgctgtgccgcctgccactg > 6:166053‑M1/1‑84 (MQ=255) cAGACCAGGCCTGGCGCATCAATCGCCGTAAAGTCTGGCAAGCGGTACAGATGCTGAGGTGTACTGGTGTATTTCAGTGGCAGGCGGCACAGCGCTTGCCGCGTG‑CCCTGGCTCATGAGCCAG‑GCCGGTGCGACAAACCCTGCCACAg < 8:152370/148‑1 (MQ=255) cAGACCAGGCCTGGCGCATCAATCGCCGTAAAGTCTGGCAAGCGGTACAGATGCTGAGGTGTACTGGTGTATTTCAGTGGCAGGCGGCACAGCGCTTGCCGCGTG‑CCCTGGCTCATGAGCCAG‑GCCGGTGCGACAAACCCTGCCACAg < 1:73085/148‑1 (MQ=255) gACCAGGCCTGTCGCATCAATCGCCGTAAAGTCTGGCAAGCGGTACAGATGCTGAGGTGTACTGGTGTATTTCAGTGGCAGGgtttgtcgcaccggcctggctcatgagccagggcacgcggtaagcgctgtgccgcctgccactgaaa < 1:233680‑M1/149‑68 (MQ=255) gACCAGGCCTGGCGCATCAATCGCCGTAAAGTCTGGCAAGCGGTACAGATGCTGAGGTGTACTGGTGTATTTCAGTGGCAGGgtttgtcgcaccggcctggctcatgagccagggcacgcggcaagcgctgtgccgcctgccactgaaa < 5:166053‑M1/149‑68 (MQ=255) cAGGCCTGGCGCATCAATCGCCGTAAAGTCTGGCAAGCGGTACAGATGCTGAGGTGTACTGGTGTATTTCAGTGGCAGGCGGCACAGCGCTTGCCGCGTG‑CCCTGGCTCATGAGCCAG‑GCCGGTGCGACAAACCCTGCCACAGGCCAcc > 8:80662/1‑149 (MQ=255) gCCTGGCGCATCAATCGCCGTAAAGTCTGGCAAGCGGTACAGATGCTGAGGTGTACTGGTGTATTTCAGTGGCAGGCGGCACAgc < 6:59861/85‑1 (MQ=255) gCCTGGCGCATCAATCGCCGTAAAGTCTGGCAAGCGGTACAGATGCTGAGGTGTACTGGTGTATTTCAGTGGCAGGCGGCACAgc > 5:59861/1‑85 (MQ=255) gCCTGGCGCATCAATCGCCGTAAAGTCTGGCAAGCGGTACAGATGCTGAGGTGTACTGGTGTATTTCAGTGGCAGGCGGCACAGCGCTTGCCGCGTG‑CCCTGGCTCATGAGCCAG‑GCCGGTGCGACAAACCCTGCCACAGGCCACCCtt > 5:240829/1‑149 (MQ=255) ccTGGCGCATCAATCGCCGTAAAGTCTGGCAAGCGGTACAGATGCTGAGGTGTACTGGTGTATTTCAGTGGCAGGCGGCACAGCGCTTGCCGCGTG‑CCCTGGCTCATGAGCCAG‑GCCGGTGCGACAAACCCTGCCACAGGCCACCCTTg < 8:33013/149‑1 (MQ=255) gcgcATCAATCGCCGTAAAGTCTGGCAAGCGGTACAGATGCTGAGGTGTACTGGTGTATTTCAGTGGCAGGCGGCACAGCGCTTGCCGCGTG‑CCCTGGCTCATGAGCCAG‑GCCGGTGCGACAAACCCTGCCACAGGCCACCCTTGGTcc > 2:185880/1‑149 (MQ=255) gcATCAATCGCCGTAAAGTCTGGCAAGCGGTACAGATGCTGAGGTGTACTGGTGTATTTCAGTGGCAGGCGGCACAGCGCTTGCCGCGTG‑CCCTGGCTCATGAGCCAG‑GCCGGTGCGACAAACCCTGCCACAGGCCACCCTTGGTCCTc < 6:240829/149‑1 (MQ=255) aaTCGCCGTAAAGTCTGGCAAGCGGTACAGATGCTGAGGTGTACTGGTGTATTTCAGTGGCAGGCGGCACAGCGCTTGCCGCGTG‑CCCTGGCTCATGAGCCAG‑GCCGGTGCGACAAACCCTGCCACAGGCCACCCTTGGTCCTCG‑AAc < 5:56417/148‑1 (MQ=255) aTCGCCGTAAAGTCTGGCAAGGGGTACAGATGCTGAGGTTTACTGGTTTATTTCAGTGGCCGGCGGCACAGCGCTTGCCGCGTGCCCCTGGCTCATGAGCCAG‑GCCGGTGCGACAAACCCTGCCACAGGCCACCCTTGGTCCTCG‑AACa < 1:102377/149‑1 (MQ=255) gTAAAGTCTGGCAAGCGGTACAGATGCTGAGGTGTACTGGTGTATTTCAGTGGCAGGCGGCACAGCGCTTGCCGCGTG‑CCCTGGCTCATGAGCCAG‑GCCGGTGCGACAAACCCTGCCACAGGCCACCCTTGGTCCTCG‑AACAGTG‑CCAg < 2:40822/149‑1 (MQ=255) tAAAGTCTGGCAAGCGGTACAGATGCTGAGGTGTACTGGTGTATTTCAGTGGCAGGCGGCACAGCGCTTGCCGCGTG‑CCCTGGCTCATGAGCCAG‑GCCGGTGCGACAAACCCTGCCACAGGCCACCCTTGGTCCTCG‑AACAGTG‑CCa < 2:320186/147‑1 (MQ=255) tAAAGTCTGGCAAGCGGTACAGATGCTGAGGTGTACTGGTGTATTTCAGTGGCAGGCGGCACAGCGCTTGCCGCGTG‑CCCTGGCTCATGAGCCAG‑GCCGGTGCGACAAACCCTGCCACAGGCCACCCTTGGTCCTCG‑AACAGTG‑CCa > 1:320186/1‑147 (MQ=255) aaGTCTGGCAAGCGGTACAGATGCTGAGGTGTACTGGTGTATTTCAGTGGCAGGCGGCACAGCGCTTGCCGCGTG‑CCCTGGCTCATGAGCCAG‑GCCGGTGCGACAAACCCTGCCACAGGCCACCCTTGGTCCTCG‑AACAGTG‑CCTGGcc < 7:80662/149‑1 (MQ=255) gTCTGGCAAGCGGTACAGATGCTGAGGTGTACTGGTGTATTTCAGTGGCAGGCGGCACAGCGCTTGCCGCGTG‑CCCTGGCTCATGAGCCAG‑GCCGGTGCGACAAACCCTGCCACAGTCCACCCTTGGTCCTCG‑AACAGTG‑ccgaaact > 1:122854/1‑142 (MQ=255) tCTGGCAAGCGGTACAGATGCTGAGGTGTACTGGTGTATTTCAGTGGCAGGCGGCACAGCGCTTGCCGCGTG‑CCCTGGCTCATGAGCCAG‑GCCGGTGCGACAAACCCTGCCACAGGCCACCCTTGGTCCTCG‑AACAGTG‑CCAGGCcctc < 3:142631/149‑1 (MQ=255) tGGCAAGCGGTACAGATGCTGAGGTGTACTGGTGTATTTCAGTGGCAGGCGGCACAGCGCTTGCCGCGTG‑CCCTGGCTCATGAGCCAG‑GCCGGTGCGACAAACCCTGCCACAGGCCACCCTTGGTCCTCG‑AACAGTG‑CCAGGc < 5:45374/143‑1 (MQ=255) tGGCAAGCGGTACAGATGCTGAGGTGTACTGGTGTATTTCAGTGGCAGGCGGCACAGCGCTTGCCGCGTG‑CCCTGGCTCATGAGCCAG‑GCCGGTGCGACAAACCCTGCCACAGGCCACCCTTGGTCCTCG‑AACAGTG‑CCAGGc > 6:45374/1‑143 (MQ=255) ggCAAGCGGTACAGATGCTGAGGTGTACTGGTGTATTTCAGTGGCAGGCGGCACAGCGCTTGCCGCGTG‑CCCTGGCTCATGAGCCAG‑GCCGGTGCGACAAACCCTGCCACAGGCCACCCTTGGTCCTCG‑AACAGTG‑CCAGGCCCTCCTg > 5:193833/1‑149 (MQ=255) ggCAAGCGGTACAGAGGCTGAGGTGTACTGGTGTATTTCAGTGGCAGGCGGCACAGCGCTTGCCGCGTG‑CCCTGGCTCATGTGCCAG‑GCCGGTGTGTCAAACCCTGCCACAGGCCACCATTGGTCCTCG‑AACAGTG‑CCAGGCcctcct > 8:285883/1‑148 (MQ=255) tACAGATGCTGAGGTGTACTGGTGTATTTCAGTGGCAGGCGGCACAGCGCTTGCCGCGTG‑CCCTGGCTCATGAGCCAG‑GCCGGTGCGACAAACCCTGCCACAGGCCACCCTTGGTCCTCG‑AACAGTG‑CCAGGCCCTCCTGTAGCCggg > 3:243187/1‑148 (MQ=255) aGATGCTGAGGTGTACTGGTGTATTTCAGTGGCAGGCGGCACAGCGCTTGCCGCGTG‑CCCTGGCTCATGAGCCAG‑GCCGGTGCGACAAACCCTGCCACAGGCCACCCTTGGTCCTCG‑AACAGTG‑CCAGGCCCTCCTGTAGCCGGGTAAg > 2:267882/1‑149 (MQ=255) gATGCTGAGGTGTACTGGTGTATTTCAGTGGCAGGCGGCACAGCGCTTGCCGCGTG‑CCCTGGCTCATGAGCCAGTGCCGGTGCGACAAACCCTGCCACAGGCCAccc < 1:208274/107‑1 (MQ=255) gATGCTGAGGTGTACTGGTGTATTTCAGTGGCAGGCGGCACAGCGCTTGCCGCGTG‑CCCTGGCTCATGAGCCAG‑GCCGGTGCGACAAACCCTGCCACAGGCCAccc > 2:208274/1‑106 (MQ=255) ttGCTGATGTGTACTGGTGTATTTCAGTGGCAGGAGTCACAGCGCTTGCCGCGTG‑CCCTGGCTCATGAGCCAG‑GCCGGTGCGACAAACCGTGGCACAGGCCTCGCTTGGTCCTCG‑AACAGTG‑CCAGGCCCTCCTGTAGCCGGGTAAgc < 2:201820/147‑1 (MQ=255) gCTGAGGTGTACTGGTGTATTTCAGTGGCAGGCGGCACATCGCTTGCCGAGTG‑CCCTGGCTCATGCGCCAG‑GCCGGTGCGACAAACCCTGCCACAGGCCACCCTTGGTCCTCG‑AACAGTG‑ACAGGCCCTACGGTAGCCGGGTAAGCGCt > 1:182892/1‑149 (MQ=255) cTGAGGTGTACTGGTGTATTTCAGTGGCAGGCGGCACAGCGCTTGCCGCGTG‑CCCTGGCTCATGAGCCAG‑GCCGGTGCGACAAACCCTGCCACAGGCCACCCTTGGTCCTCG‑AACAGTG‑CCAGGCCCTCCTGTAGCCGGGTAAGCGCt < 1:185880/148‑1 (MQ=255) tGAGGTGTACTGGTGTATTTCAGTGGCAGGCGGCACAGCGCTTGCCGCGTG‑CCCTGGCTCATGAGCCAG‑GCCGGTGCGACAAACCCTGCCACAGGCCACCCTTGGTCCTCG‑AACAGTG‑CCAGGCCCTCCTGTAGCCGGGTAAGCGCTTc > 7:271105/1‑149 (MQ=255) ggTGTACTGGTGTATTTCAGTGGCAGGCGGCACAGCGCTTGCCGCGTG‑CCCTGGCTCATGAGCCAG‑GCCGGTGCGACAAACCCTGCCACAGGCCACCCTTGGTCCTCG‑AACAGTG‑CCAGGCCCTCCTGTAGCCGGGTAAGCGCTTCGtt < 6:193833/149‑1 (MQ=255) gtgtACTGGTGTATTTCAGTGGCAGGCGGCACAGCGCTTGCCGCGTG‑CCCTGGCTCATGAGCCAG‑GCCGGTGCGACAAACCCTGCCACAGGCCACCCTTGGTCCTCG‑AACAGTG‑CCAGGCCCTCCTGTAGCCGGGAAAGCGCTTCGTtc < 5:183266/149‑1 (MQ=255) gtACTGGTGTATTTCAGTGGCAGGCGGCACAGCGCTTGCCGAGTC‑CCATGGCTCATGAGCAAG‑GCAGGTGCGACAAACCCTGCCACAGGCCACCCTTGGTCCTCG‑AAAAGTG‑CCAGGCCCTCCTGTAGCCGGGTAAGCTCTTCGTtct > 8:60939/1‑148 (MQ=255) gtATTTCAGTGGCAGGCGGCACAGCGCTTGCCGCGTG‑CCCTGGCTCATGAGCCAG‑GCCGGTGCGACAAACCCTGCCACAGGCCACCCTTGGTCCTCG‑AACAGTG‑CCAGGCCCTCCTGTAGCCGGGTAAGCGCTTCGTTCTCATCAAGGc > 7:226307/1‑149 (MQ=255) aTTTCAGTGGCAGGCGGCACAGCGCTTGCCGCGTG‑CCCTGGCTCATGAGCCAG‑GCCGGTGCGACAAACCCTGCCACAGGCCACCCTTGGTCCTCG‑AACAGTG‑CCAGGCCCTCCTGTAGCCGGGTAAGCGCTTCGTTCTCATCAAGGCTg > 2:119375/1‑149 (MQ=255) tttCAGTGGCAGGCGGCACAGCGCTTGCCGCGTG‑CCCTGGCTCATGAGCCAG‑GCCGGTGCGACAAACcctgccactgaaatacaccagtacacctcagcatctgtaccgcttgccagactttacggcgattgatgcgccaggcctggtc < 5:166053‑M2/149‑83 (MQ=255) tttCAGTGGCAGGCGGCACAGCGCTTGCCGCGTG‑CCCTGGCTCATGAGCCAG‑GCCGGTGCGACAAACCCTGCCACAGGCCACCCTTGGTCCTCG‑AACAGTG‑CCAGGCCCTCCTGTAGCCGGGTAAGCGCTTCGTTCTCATCAAGGCTg > 4:145112/1‑148 (MQ=255) tttCAGTGGCAGGCGGCACAGCGCTTACCGCGTG‑CCCTGGCTCATGAGCCAG‑GCCGGTGCGACAAACcctgccactgaaatacaccagtacacctcagcatctgtaccgcttgccagactttacggcgattgatgcgacaggcctggtc < 1:233680‑M2/149‑83 (MQ=255) ttCAGTGGCAGGCGGCACAGCGCTTGCCGCGTG‑CCCTGGCTCATGAGCCAG‑GCCGGTGCGACAAACCCTGCCACAGGCCACCCTTGGTCCTCG‑AACAGTG‑CCAGGCCCTCCTGTAGCCGGGTAAGCGCTTCGTTCTCATCAAGGCTg > 2:216768/1‑147 (MQ=255) tCAGTGGCAGGCGGCACAGCGCTTGCCGCGTG‑CCCTGGCTCATGAGCCAG‑GCCGGTGCGACAAACCCTGCCACAGGCCACCCTTGGTCCTCG‑AACAGTGCCCAGGCCCTCCTGTAGCCGGGTAAGCGCTTCGTTCTCATCAAGGCTGt < 1:245604/148‑1 (MQ=255) tCAGTGGCAGGCGGCAAAGCGCTTGCCGCGTG‑CCCTGGCTCATGAGCCAG‑GCCGGTGCGACAAACCCTGCCACAGGCCACCCTTGGTCCTCG‑AACAGTG‑CCAGGCCCTCCTGAAGCCGGGAAAGCGCTTCGTTCTCATCAAGTCTg > 3:48444/1‑146 (MQ=255) cAGTGGCAGGCGGCACAGCGCTTGCCGCGTG‑CCCTGGCTCATGAGCCAG‑GCCGGTGCGACAAACcctgccactgaaatacaccagtacacctcagcatctgtaccgcttgccagactttacggcgattgatgcgccaggcctggtctg > 6:166053‑M2/1‑64 (MQ=255) aGTGGCAGGCGGCACAGCGCTTGCCGCGTG‑CCCTGGCTCATGAGCCAG‑GCCGGTGCGACAAACCCTGCCACAGGCCACCCTTGGTCCTCGCTACAGTG‑CCAGGCCCTCCTGTAGCCGGGTAAGCGCTTCGTTCTCATCAAGGCTGTAGa < 1:267882/149‑1 (MQ=255) tGGCAGGgtttgtcgcaccggcctggctcatgagccagggcacgcggcaagcgctgtgccgcctgccactgaaatacaccagtacacctcagcatctgtaccgcttgccagactttacggcgattgatgcgccaggcctggtctgga < 6:183266‑M1/147‑141 (MQ=255) gCAGGgtttgtcgcaccggcctggctcatgagccagggcacgcggcaagcgctgtgccgcctgccactgaaatacaccagtacacctcagcatctgtaccgcttgccagactttacggcgattgatgcgccaggcctggtctggagcgc > 7:273774‑M1/1‑5 (MQ=255) aGGCGGCACAGCGCTTGCCGCGTG‑CCCTGGCTCATGAGCCAG‑GCCGGTGCGACAAACCCTGCCACAGGCCACCCTTGGTCCTCG‑AACAGTG‑CCAGGCCCTCCTGTAGCCGGGTAAGCGCTTCGTTCTCATCAAGGCTGTAGAACTc < 6:232009/146‑1 (MQ=255) aGGCGGCACAGCGCTTGCCGCGTG‑CCCTGGCTCATGAGCCAG‑GCCGGTGCGACAAACCCTGCCACAGGCCACCCTTGGTCCTCG‑AACAGTG‑CCAGGCCCTCCTGTAGCCGGGTAAGCGCTTCGTTCTCATCAAGGCTGTAGAACTc > 5:232009/1‑146 (MQ=255) | GCGCTGGCATTGCCAGTCGCACAGCGTGCGGGACAGTTTGCGACGCCATGCGCTCCGGGCGCTCCAGACCAGGCCTGGCGCATCAATCGCCGTAAAGTCTGGCAAGCGGTACAGATGCTGAGGTGTACTGGTGTATTTCAGTGGCAGGCGGCACAGCGCTTGCCGCGTG‑CCCTGGCTCATGAGCCAG‑GCCGGTGCGACAAACCCTGCCACAGGCCACCCTTGGTCCTCG‑AACAGTG‑CCAGGCCCTCCTGTAGCCGGGTAAGCGCTTCGTTCTCATCAAGGCTGTAGAACTC > NC_002947/1558328‑1558618 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |