New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1607270 | 40 (0.740) | 3 (0.060) | 3/250 | NT | 8.2% | coding (264/888 nt) | PP_1408 | (R)‑3‑hydroxydecanoyl‑ACP:CoA transacylase |
? | NC_002947 | = 1607299 | 29 (0.570) | coding (235/888 nt) | PP_1408 | (R)‑3‑hydroxydecanoyl‑ACP:CoA transacylase |
TCGCGCATCGGCTCGTTGATCACTGGCGAGAACGAACTCACCACTGCCTTCTTCACGTACCGCGGCTGGTGCGCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTGCTGATCAGCCGTTCCTGACGGTTGTGCGGCTTGGACTTGCCTGAATACGGCTGGTCGAACAGAACCACGTTGAACTGTGGGTGCAGGTTACGTACCGTCTGGGCGAACGAGGCCGTG > NC_002947/1607124‑1607417 | tCGCGCATCGGCTCGTTGATCACTGGCGAGAACGAACTCACCACTGCCTTCTTCACGTACCGCGGCTGGTGCGCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCt > 7:58177/1‑148 (MQ=255) gcATCGGCTCGTTGATCACTGGCGAGAACGAACTCACCACTGCCTTCTTCACGTACCGCGGCTGGTGCGCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAag > 8:45715/1‑148 (MQ=255) cATCGGCTCGTTGATCACTGGCGAGAACGAACTCACCACTGCCTTCTTCACGTACCGCGGCTGGTGCGCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAagga < 7:101911/149‑1 (MQ=255) cATCGGCTCGTTGATCACTGGCGAGAACGAACTCACCACTGCCTTCTTCACGTACCGCGGCTGGTGCGCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAagga < 8:58177/149‑1 (MQ=255) ggCTCGTTGATCACTGGCGAGAACGAACTCACCACTGCCTTCTTCACGTACCGCGGCTGGTGCTCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGat < 6:177459/149‑1 (MQ=255) gCTCGTTGATCACTGGCGAGAACGAACTCACCACTGCCTTCTTCACGTACCGCGGCTGGTGCGCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGata > 2:293273/1‑149 (MQ=255) gTTGATCACTGGCGAGAACGAACTCACCACTGCCTTCTTCACGTACCGCGGCTGGTGCGCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATg < 4:105397/147‑1 (MQ=255) ttGATCACTGGCGAGAACGAACTCACCACTGCCTTCTTCACGTACCGCGGCTGGTGCGCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATgcgc > 5:143447/1‑149 (MQ=255) tGGCGAGAACGAACTCACCACTGCCTTCTTCACGTACCGCGGCTGGTGCGCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGtct > 7:133942/1‑149 (MQ=255) tGGCGAGAACGAACTCACCACTGCCTACTTCACGTACCGCGGCTGGAGCGCCCGCGCCAGCAGCGTGCATGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTCCCTGCAACTCCTCGCTCAGCTCAAGGAGGATATGCGACTCGGtct > 7:133946/1‑149 (MQ=255) gCGAGAACGAACTCACCACTGCCTTCTTCACGTACCGCGGCTGGTGCGCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTcc < 2:307800/149‑1 (MQ=255) gagaACGAACTCACCACTGCCTTCTTCACGTACCGCGGCTGGTGCGCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCtt > 4:216601/1‑149 (MQ=255) gaacgaacTCACCACTGCCTTCTTCACGTACCGCGGCTGGTGCGCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTgc > 2:42658‑M2/1‑147 (MQ=255) aacgaacTCACCACTGCCTTCTTCACGTACCGCGGCTGGTGCGCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCaaggagaccgaggcgcatatcctccttgagct > 4:57242‑M1/1‑117 (MQ=255) aacTCACCACTGCCTTCTTCACGTACCGCGGCTGGTGCGCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCaaggagaccgaggcgcatatcctccttgagctgatc < 3:57242‑M1/149‑37 (MQ=255) acTCACCACTGCCTTCTTCACGTACCGCGGCTGGTGCGCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTGCTGATCa < 5:182003/149‑1 (MQ=255) acTCACCACTGCCTTCTTCACGTACCGCGGCTGGTGCGCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCACGGTATCCTTgctgat < 5:2818‑M2/147‑7 (MQ=255) cTCACCACTGCCTTCTTCACGTACCGCGGCTGGTGCGCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCaaggagaccgaggcgcatatcctccttgagctgatcga < 2:73627‑M1/149‑39 (MQ=255) tCACCACTGCCTTCTTCACGTACCGCGGCTGGTGCGCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTgc > 2:305594‑M2/1‑139 (MQ=255) tCACCACTGCCTTCTTCACGTACCGCGGCTGGTGCGCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTgc < 1:305594‑M2/141‑3 (MQ=255) tCACCACTGCCTTCTTCACGTACCGCGGCTGGTGCGCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTGCTGATCAGc > 4:122881/1‑149 (MQ=255) accacTGCCTTCTTCACGTACCGCGGCTGGTGCGCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTGCTGATCAGCCg > 2:168385/1‑149 (MQ=255) tGCCTTCTTCACGTACCGCGGCTGGTGCGCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTGCTGATCAGCCGTTCCt > 8:36046/1‑149 (MQ=255) cttcttCACGTACCGCGGCTGGTGCGCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTGCTGATCAGCCGTTCCTGAc < 7:36046/149‑1 (MQ=255) cttcACGTACCGCGGCTGGTGCGCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTGCTGATCAGCCGTTCCTGACg < 6:143447/147‑1 (MQ=255) ttcACGTACCGCGGCTGGTGCGCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTGCTGATCAGCCGTTCCTGACGGtt < 8:133942/149‑1 (MQ=255) tcACGTACCGCGGCTGGTGCGCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTGCTGATCAGCCGTTCCTGACGGTtg > 1:23293/1‑149 (MQ=255) cACGTACCGCGGGTGCTGCGCCAGCGCCAGCAGGGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACTTGGTCTGCCTTGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCGTCGGTCTCCTTGCTGATCAGCCGTTCCTGACGGtt < 8:133946/147‑1 (MQ=255) aCGTACCGCGGCTGGTGCGCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTGCTGATCAGCCGTTCCTGACGGTtgtg > 3:217130/1‑149 (MQ=255) cGTACCGCGGCTGGTGCGCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTGCTGATCAGCCGTTCCTGACGGTTGTGc < 3:216601/149‑1 (MQ=255) gTGCGCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCTGTCTCCTTGCTGATCAGCCGTTCCTGACGGTTGTGCGGCTTGGACtt < 6:160746/147‑1 (MQ=255) gcgccagcgccaGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTGCTGATCAGCCGTTCCTGACGGTTGTGCGGCTTGGACTTGCCt < 4:217130/149‑1 (MQ=255) cgccagcgccagCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTgctga > 2:145379‑M2/1‑105 (MQ=255) cgccagcgccagCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTgctga < 1:145379‑M2/110‑6 (MQ=255) gcgccagcAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTGCTGATCAGCCGTTCCTGACGGTTGTGCGGCTTGGACTTGCCTGAATAc > 5:240592/1‑149 (MQ=255) agcagcGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTGCTGATCAGCCGTTCCTGACGGTTGTGCGGCTTGGACTTGCCTGAATACGGCTg < 6:240592/149‑1 (MQ=255) gcagcGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTGCTGATCAGCCGTTCCTGACgg > 6:343473/1‑116 (MQ=255) gTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTGCTGATCAGCCGTTCCTGACGGTTGTGCGGCTTGGACTTGCCTGAATACGGCTGGTCGaa < 3:122881/149‑1 (MQ=255) ccccACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTGCTGATCATCCGTTCCTGACGGTTGTGCGGCTTGGACTTGCCTGAATACGGCTGGTCGAACAGAACCACGtt < 6:2818/149‑1 (MQ=255) cccACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTGCTGATCAGCCGTTCCTGACGGTTGTGCGGCTTGGACTTGCCTGAATACGGCTGGTCGAACAGAACCACGtt > 3:260106/1‑148 (MQ=255) ccACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTGCTGATCAGCCGTTCCTGACGGTTGTGCGGCTTGGACTTGCCTGAATACGGCTGGTCGAACAGAACCACGTTg > 8:63481/1‑148 (MQ=255) aCGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTGCTGATCAGCCGTTCCTGACGGTTGTGCGGCTTGGACTTGCCTGAATACGGCTGGTCGAACAGAACCACGTTGAAc < 2:23293/149‑1 (MQ=255) aaaGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTGCTGATCAGCCGTTCCTGACGGTTGTGCGGCTTGGACTTGCCTGAATACGGCTGGTCGAACAGAACCACGTTGAACTGTgg < 7:45715/149‑1 (MQ=255) tCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTGCTGATCAGCCGTTCCTGACGGTTGTGCGGCTTGGACTTGCCTGAATACGGCTGGTCGAACAGAACCACGTTGAACTGTGGGTGCAgg > 3:298903/1‑149 (MQ=255) gTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTGCTGATCAGCCGTTCCTGACGGTTGTGCGGCTTGGACTTGCCTGAATACGGCTGGTCGAACAGAACCACGTTGAACTGTGGGTGCAGGTTAc < 1:168385/149‑1 (MQ=255) tCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTGCTGATCAGCCGTTCCTGACGGTTGTGCGGCTTGGACTTGCCTGAATACGGATGGTCGAACAGAACCACGTTGAACTGTGGGTGCAGGTTACGTAc > 6:45029/1‑149 (MQ=255) ccTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTGCTGATCAGCCGTTCCTGACGGTTGTGCGGCTTGGACTTGCCTGAATAc < 4:147072/98‑1 (MQ=255) ccTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTGCTGATCAGCCGTTCCTGACGGTTGTGCGGCTTGGACTTGCCTGAATAc > 3:147072/1‑98 (MQ=255) gAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTGCTGATCAGCCGTTCCTGACGGTTGTGCGGCTTGGACTTGCCTGAATACGGCTGGTCGAACAGAACCACGTTGAACTGTGGGTGCAGGTTACGTACCGTCTggg > 8:223061/1‑149 (MQ=255) tCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTgctgatcgagcacttccaggcagaccacgtgatgtctttttcgtggggtggcgcaagcacgctgctggcgctggcgcaccagccgcggtacgtgaagaaggcagtggtgag < 2:73627‑M2/149‑112 (MQ=255) cGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTGCTGATCAGCCGTTCCTGACGGTTGTGCGGCTTGGACTTGCCTGAATACGGCTGGTCGAACAGAACCACGt < 4:110689/108‑1 (MQ=255) cGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTGCTGATCAGCCGTTCCTGACGGTTGTGCGGCTTGGACTTGCCTGAATACGGCTGGTCGAACAGAACCACGt > 3:110689/1‑108 (MQ=255) gATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTgctgatcgagcacttccaggcagaccacgtgatgtctttttcgtggggtggcgcaagcacgctgctggcgctggcgcaccagccgcggtacgtgaagaaggcagtggtgagtt < 3:57242‑M2/149‑114 (MQ=255) aTCAGCaaggataccgtggcgcatatcctccttgagctgatcgagcacttccaggcagaccacgtgatgtctttttcgtggggtggcgcaagcacgctgctggcgctggcgcaccagccgcggtacgtgaagaaggcagtggtgagt < 5:2818‑M1/147‑142 (MQ=255) tCAGCaaggagaccgaggcgcatatcctccttgagctgatcgagcacttccaggcagaccacgtgatgtctttttcgtggggtggcgcaagcacgctgctggcgctggcg < 1:145379‑M1/110‑106 (MQ=255) tCAGCaaggagaccgaggcgcatatcctccttgagctgatcgagcacttccaggcagaccacgtgatgtctttttcgtggggtggcgcaagcacgctgctggcgctggcg > 2:145379‑M1/1‑5 (MQ=255) aGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTgctgatcgagcacttccaggcagaccacgtgatgtctttttcgtggggtggcgcaagcacgctgctggcgctggcgcaccagccgcggtacgtgaagaaggcagtggtgagttcgtt > 4:57242‑M2/1‑32 (MQ=255) gCaaggagaccgaggcgcatatcctccttgagctgatcgagcacttccaggcagaccacgtgatgtctttttcgtggggtggcgcaagcacgctgctggcgctggcgcaccagccgcggtacgtgaagaaggcagtggtgagttcgttc > 2:42658‑M1/1‑2 (MQ=255) gCaaggagaccgaggcgcatatcctccttgagctgatcgagcacttccaggcagaccacgtgatgtctttttcgtggggtggcgcaagcacgctgctggcgctggcgcaccagccgcggtacgtgaagaaggcagtggtga > 2:305594‑M1/1‑2 (MQ=255) gCaaggagaccgaggcgcatatcctccttgagctgatcgagcacttccaggcagaccacgtgatgtctttttcgtggggtggcgcaagcacgctgctggcgctggcgcaccagccgcggtacgtgaagaaggcagtggtga < 1:305594‑M1/141‑140 (MQ=255) | TCGCGCATCGGCTCGTTGATCACTGGCGAGAACGAACTCACCACTGCCTTCTTCACGTACCGCGGCTGGTGCGCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTGCTGATCAGCCGTTCCTGACGGTTGTGCGGCTTGGACTTGCCTGAATACGGCTGGTCGAACAGAACCACGTTGAACTGTGGGTGCAGGTTACGTACCGTCTGGGCGAACGAGGCCGTG > NC_002947/1607124‑1607417 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |