New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1612788 = | 49 (0.910) | 3 (0.060) | 3/254 | NT | 5.8% | coding (585/693 nt) | ung | uracil‑DNA glycosylase |
? | NC_002947 | 1612843 = | 51 (0.980) | coding (640/693 nt) | ung | uracil‑DNA glycosylase |
TTTACCGACAGGATTATCCAGGTGGTCAGTGAGCAATGCCCGAACGTGGTGTTCCTGCTATGGGGGGCGCATGCACAGAGCAAGCAGAAGCTGATCGACGGTACCAAGCATCTGGTTTTGAAGTCGGTCCATCCTTCGCCGCTGTCGGCGTATCGCGGGTTCATCGGTTGCGGGCATTTCAGCCGTGCCAACAGCTTCCTCGAGCAGCGGGGGCTCGGGCCCATCGACTGGGCACTGCCCCCGCTGTGAGAAACCGCGGTGGGGTACGCAATCGCTCAGGGCGTCAT > NC_002947/1612648‑1612934 | tttACCGACAGGATTATCCAGGTGGTCAGTGAGCAATGCCCGAACGTGGTGTTCCTGCTATGGGGGGCGCATGCACAGAGCAAGCAGAAGCTGATCGACGGTACCAAGCATCTGGTTTTGAAGTCGGTCCATCCTTCGCCGCTGTCgg < 2:29753/148‑1 (MQ=255) aCAGGATTATCCAGGTGGTCAGTGAGCAATGCCCGAACGTGGTGTTCCTGCTATGGGGGGCGCATGCACAGAGCAAGCAGAAGCTGATCGACGGTACCAAGCATCTGGTTTTGAAGTCGGTCCATCCTTCGCCGCTGTCGGCGTATcgc > 4:77141/1‑149 (MQ=255) aTTATCCAGGTGGTCAGTGAGCAATGCCCGAACGTGGTGTTCCTGCTATGGGGGGCGCATGCACAGAGCAAGCAGAAGCTGATCGACGGTACCAAGCATCTGGTTTTGAAGTCGGTCCATCCTTCGCCGCTGTCGGCGTATCGCGGGtt > 5:309765/1‑149 (MQ=255) ttgccattggccagcgcagcgagccgcgcatgagcatgacgccctgagcgattgcgtaccccaccgcggtttctcacagcgggggcagtgcccagtcgatgggcccgagcccccgctgctcgaggaag > 6:305732‑M1/128‑128 (MQ=255) ttgccattggccagcgcagcgagccgcgcatgagcatgacgccctgagcgattgcgtaccccaccgcggtttctcacagcgggggcagtgcccagtcgatgggcccgagcccccgctgctcgaggaag < 5:305732‑M1/1‑1 (MQ=255) ggtggtCAGTGAGCAATGCCCGAACGTGGTGTTCCTGCTATGGGGGGCGCATGCACAGAGCAAGCAGAAGCTGATCGACGGTACCAAGCATCTGGTTTTGAAGTCGGTCCATCCTTCGCCGCTGTCGGCGTATCGCGGGTTCATCGGtt < 3:77141/149‑1 (MQ=255) gtCAGTGAGCAATGCCCGAACGTGGTGTTCCTGCTATGGGGGGCGCATGCACAGAGCAAGCAGAAGCTGATCGACGGTACCAAGCATCTGGTTTTGAAGTCGGTCCATCCTTCGCCGCTGTCGGCGTATCGCGGGTTCATCGGTTGCgg < 6:180277/149‑1 (MQ=255) gCAATGCCCGAACGTGGTGTTCCTGCTATGGGGGGCGCATGCACAGAGCAAGCAGAAGCTGATCGACGGTACCAAGCATCTGGTTTTGAAGTCGGTCCATCCTTCGCCGCTGTCGGCGTATCGCGGGTTCATCGGTTGCGGGCAttt > 5:214318/1‑147 (MQ=255) ccGAACGTGGTGTTCCTGCTATGGGGGGCGCATGCACAGAGCAAGCAGAAGCTGATCGACGGTACCAAGCATCTGGTTTTGAAGTCGGTCCATCCTTCGCCGCTGTCGGCGTATCGCGGGTTCATCGGTTGCGGGCATTTCAGCCGTGc > 2:49923/1‑149 (MQ=255) cgtaCGTGGGGTTCCTGCTATGGGGGGCGCATGCACAGAGCAAGCAGAAGCTGATCGACGGTACCAAGCATCTGGTTTTGAAGTCGGTCCATCGTTCGCCGCTGTCGGCGTATCGCGGGTTCATCGGTTGGGGGCATTTCAGCCGTGcc < 2:324350/146‑1 (MQ=255) aaCGTGGTGTTCCTGCTATGGGGGGCGCATGCACAGAGCAAGCAGAAGCTGATCGACGGTACCAAGCATCTGGTTTTGAAGTCGGTCCATCCTTCGCCGCTGTCGGCGTATCGCGGGTTCATCGGTTGCggg > 1:76003/1‑132 (MQ=255) aaCGTGGTGTTCCTGCTATGGGGGGCGCATGCACAGAGCAAGCAGAAGCTGATCGACGGTACCAAGCATCTGGTTTTGAAGTCGGTCCATCCTTCGCCGCTGTCGGCGTATCGCGGGTTCATCGGTTGCggg < 2:76003/132‑1 (MQ=255) cGTGGTGTTCCTGCTATGGGGGGCGCATGCACAGAGCAAGCAGAAGCTGATCGACGGTACCAAGCATCTGGTTTTGAAGTCGGTCCATCCTTCGCCGCTGTCGGCGTATCGCGGGTTCATCGGTTGCGGGCATTTCAGCCGTGCCAACa < 7:7950/149‑1 (MQ=255) cGTGGTGTTCCTGCTATGGGGGGCGCATGCACAGAGCAAGCAGAAGCTGATCGACGGTACCAAGCATCTGGTTTTGAAGTCGGTCCATCCTTCGCCGCTGTCGGCGTATCGCGGGTTCATCGGTTGCGGGCATTTCAGCCGTGCCAACa < 6:309765/149‑1 (MQ=255) acgccctgagcgattgcgtaccccaccgcggtttctcacagcgggggcagtgcccagtcgatgggcccgagcccccgctgctcgaggaaGCTGTCGGCGTATCGCGGGTTCATCGGTTGCGGGCATTTCAGCCGTGCCAACAGCTTcc > 2:276693‑M1/90‑148 (MQ=255) cTGCTATGGGGGGCGCATGCACAGAGCAAGCAGAAGCTGATCGACGGTACCAAGCATCTGGTTTTGAAGTCGGTCCATCCTTCGCCGCTGTCGGCGTATCGCGGGTTCATCGGTTGCGGGCATTTCAGCCGTGCCAACAGCTTCCTCGa < 1:49923/149‑1 (MQ=255) tGCTATGGGGGGCGCATGCACAGAGCAAGCAGAAGCTTCTCGACGGTACCAAGCATCTGGGTTTGAAGTCGGTCCATCCTTCGCCGCGGTCGGCGTATAGCGGGGTCATCGGTTGCGGGCGTGTGAGTCTTGCGATCAGCATCCTCGag > 4:25603/1‑149 (MQ=255) tATGGGGGGCGCATGCACAGAGCAAGCAGAAGCTGATCGACGGTACCAAGCATCTGGTTTTGAAGTCGGTCCATCCTTCGCCGCTGTCGGCGTATCGCGGGTTCATCGGTTGCGGGCATTTAAGCAGTGCAAACAGCTTCCACgctgct > 8:224940/1‑144 (MQ=255) gagcgattgcgtaccccaccgcggtttctcacagcgggggcagtgcccagtcgatgggcccgagcccccgctgctcgaggaaGCTGTCGGCGTATCGCGGGTTCATCGGTTGCGGGCATTTCAGCCGTGCCAACAGCTTCCt < 8:294974‑M1/60‑1 (MQ=255) gagcgattgcgtaccccaccgcggtttctcacagcgggggcagtgcccagtcgatgggcccgagcccccgctgctcgaggaaGCTGTCGGCGTATCGCGGGTTCATCGGTTGCGGGCATTTCAGCCGTGCCAACAGCTTCCt > 7:294974‑M1/83‑142 (MQ=255) cATGCACTGAGCAAGCAGAAGCTGATGGACGGTACCAAGCATCTGGTTTTGAAGTCGGTCCATCCTTCGCCGCTGTCGGCGTATCGCGGGTTCATCGGTTGCGGGCATTTCAGCCGTGCCAACAGCTTCCTCGAGCAGCGGGGGCTCgg < 4:105034/149‑1 (MQ=255) aTGCACAGAGCAAGCAGAAGCTGATCGACGGTACCAAGCATCTGGTTTTGAAGTCGGTCCATCCTTCGCCGCTGTCGGCGTATCGCGGGTTCATCGGTTGCGGGCATTTCAGCCGTGCCAACAGCTTCCTCGAGCAGCGGGGGCTCggg > 8:294115/1‑149 (MQ=255) acaGAGCAAGCAGAAGCTGATCGACGGTACCAAGCATCTGGTTTTGAAGTCGGTCCATCCTTCGCCGCTGTCGGCGTATCGCGGGTTCATCGGTTGCGGGCATTTCAGCCGTGCCAACAGCTTCCTCGAGCAGCGGGGGCTCGGGCCCa > 5:148949/1‑149 (MQ=255) agagCAAGCAGAAGCTGATCGACGGTACCAAGCATCTGGTTTTGAAGTCGATCCATCCTTCGCCGCTGTCGGCGTATCGCGGGTTCATCGGTTGCGGGCATTTCAGCCGTGCCAACAGCTTCCTCGAGCAGCGGGGGCTCGGGCCCATc < 1:45303/149‑1 (MQ=255) agcaagcaGAAGCTGATCGACGGTACCAAGCATCTGGTTTTGAAGTCGGTCCATCCTTCGCCGCTGTCGGCGTATCGCGGGTTCATCGGTTGCGGGCATTTCAGCCGTGCCAACAGCTTCCTCGAGCAGCGGGGGc < 5:318169/136‑1 (MQ=255) agcaagcaGAAGCTGATCGACGGTACCAAGCATCTGGTTTTGAAGTCGGTCCATCCTTCGCCGCTGTCGGCGTATCGCGGGTTCATCGGTTGCGGGCATTTCAGCCGTGCCAACAGCTTCCTCGAGCAGCGGGGGc > 6:318169/1‑136 (MQ=255) agcaGAAGCTGATCGACGGTACCAAGCATCTGGTTTTGAAGTCGGTCCATCCTTCGCCGCTGTCGGCGTATCGCGGGTTCATCGGTTGCGGGCATTTCAGCCGTGCCAACAGCTTCCTCGAGCAGCGGGGGCTCGGGCCCATCGACTgg < 7:294115/149‑1 (MQ=255) gcaGAAGCTGATCGACGGTACCAAGCATCTGGTTTTGAACTCGGTCGATCCATCGCCGCTGTCGGCGTATCGCGGGTTCATCGGTTGCGGGCATTTCAGCCGTGACAACAGCTTACTCGAGCAGAGGGGGCTCGGGCCCATCGACTgcg > 7:9288/1‑147 (MQ=255) aaGCTGATCGACGGTACCAAGCATCTGGTTTTGAAGTCGGTCCATCCTTCGCCGCTGTCGGCGTATCGCGGGTTCATCGGTTGCGGGCATTTCAGCCGTGCCAACAGCTTCCTCGAGCAGCGGGGGCTCGGGCCCATCGACTGGGCACt > 1:137740/1‑149 (MQ=255) aaGCTGATCGACGGTACCAAGCATCTGGTTTTGAAGTCGGTCCATCCTTCGCCGCTGTCGGCGTATCGCGGGTGCATCGGTTGCGGGCATTTCAGCCGTGCCATCAGCTTCCTCGAGCAGCGGGGGCTCGGGCCCATCGACTGGGCACt < 1:242155/149‑1 (MQ=255) gCTGATCGTCGGTACGAAGCTTCTGGTTTTTAAGTCGGTCCATCGTTCGCCGCTGTCGGCGTATCGCGGGTTCATCGGTTGCGGGCATTTGAGCCGTGCCAAGAGCTTCCTCGAGCAGCGGGGGCTCTGGCCCATCGACTGGGCACTGc < 8:9288/149‑1 (MQ=255) gCTGATCCACGGTACCAAGCATCTGGTTTTGAAGTCGGTCCATCCTTCGCCGCTGTCGGCGAATCGCGGGTACATCGGTTGCGGGCATTTCAGCAGTGCCAACACCTTCCACGAGCAGCGGGGCGTCGGGCCCGTCGGCTGGGCACTGc > 8:317231/1‑149 (MQ=255) aTCGACGGTACCAAGCATCTGGTTTTGAAGTCGGTCCATCCTTCGCCGCTGTCGGCGTATCGCGGGTTCATCGGTTGCGGGCATTTCAGCCGTGCCAACAGCTTCCTCGAGCAGCGGGGGCTCGGGCCCATCGACTGGGCACTGccc < 7:21892/147‑1 (MQ=255) gACGGTACCAAGCATCTGGTTTTGAAGTCGGTCCATCCTTCGCCGCTGTCGGCGTATCGCGGGTTCATCGGTTGCGGGAATTTCAGCCGTGCCAACAGCTTCATCGAGCAGCGGGGGCTCGGGCCCATCGACTGGGCACTGCCCCCGCt > 3:201345/1‑149 (MQ=255) aCGGTACCAAGCATCTGGTTTTGAAGTCGGTCCATCCTTCGCCGCTGTCGGCGTATCGCGGGTTCATCGGTTGCGGGCATTTCAGCCGTGCCAACAGCTTCCTCGAGCAGCGGGGGCTCGGGCCCATCGACTGGGCACTGCCCCCGCtg > 3:79577/1‑149 (MQ=255) cGGTACCAAGCATCTGGTTTTGAAGTCGGTCCATCCTTCGCCGCTGTCGGCGTATCGCGGGTTCATCGGTTGCGGGCATTTCAGCCGTGCCAACAGCTTCCTCGAGCAGCGGGGGCTCGGGCCCATCAACTGGGCACTGCCCCCGCtgt < 6:148949/149‑1 (MQ=255) tACCAAGCATCTGGTTTTGAAGTCGGTCCATCCTTCGCCGCTGTCGGCGTATCGCGGGTTCATCGGTTGCGGGCATTTCAGCCGTGCCAACAGCTTCCTCGAGCAGCGGGGGCTCGGGCCCATCGACTGGGCACTGCCCCCGCtgt > 5:117650/1‑146 (MQ=255) aaGCATCTGGTTTTGAAGTCGGTCCATCCTTCGCCGCTGTCGGCGTATCGCGGGTTCATCGGTTGCGGGCATTTCAGCCGTGCCAACAGCTTCCTCGa < 8:259589/98‑1 (MQ=255) aaGCATCTGGTTTTGAAGTCGGTCCATCCTTCGCCGCTGTCGGCGTATCGCGGGTTCATCGGTTGCGGGCATTTCAGCCGTGCCAACAGCTTCCTCGa > 7:259589/1‑98 (MQ=255) aaGCATCTGGTTTTGAAGTCGGTCCATCCTTCGCCGCTGTCGGCGTATCGCGGGTTCATCGGTTGCGGGCATTTCAGCCGTGCCAACAGCTTCCTCGAGCAGCGGGGGCTCGGGCCCATCGACTGGGCACTGCCCCCGCTGTGAGAAAc > 1:324167/1‑149 (MQ=255) gTTTTGAAGTCGGTCCATCCTTCGCCGCTGTCGGCGTATCGCGGGTTCATCGGTTGCGGGCATTTCAGCCGTGCCAACAGCTTCCTCGAGCAGCGGGGGCTCGGGCCCATCGACTGGGCACTGCCCCCGCTGTGAGAAACCGCGGTggg > 2:301683/1‑149 (MQ=255) gAAGTCGGTCCATCCTTCGCCGCTGTCGGCGTATCGCGGGTTCATCGGTTGCGGGCATTTCAGCCGTGCCAACAGCTTCCTCGAGCAGCGGGGGCTCGGGCCCATCGACTGGGCAc < 4:315765/116‑1 (MQ=255) gAAGTCGGTCCATCCTTCGCCGCTGTCGGCGTATCGCGGGTTCATCGGTTGCGGGCATTTCAGCCGTGCCAACAGCTTCCTCGAGCAGCGGGGGCTCGGGCCCATCGACTGGGCAc > 3:315765/1‑116 (MQ=255) gAAGTCGGTCCATCCTTCGCCGCTGTCGGCGTATCGCGGGTTCATCGGTTGCGGGCATTTCAGCCGTGCCAACAGCTTCCTCGAGCAGCGGGGGCTCGGGCCCATCGACTGGGCACTGCCCCCGCTGTGAGAAACCGCGGTGGGGTACg > 8:176735/1‑149 (MQ=255) aaGTCGGTCCATCCTTCGCCGCTGTCGGCGTATCGCGGGTTCATCGGTTGCGGGCATTTCAGCCGTGCCAACAGCTTCCTCGAGCAGCGGGGGCTCGGGCCCATCGACTGGGCACTGCCCCCGCtgt < 2:335126/127‑1 (MQ=255) aaGTCGGTCCATCCTTCGCCGCTGTCGGCGTATCGCGGGTTCATCGGTTGCGGGCATTTCAGCCGTGCCAACAGCTTCCTCGAGCAGCGGGGGCTCGGGCCCATCGACTGGGCACTGCCCCCGCtgt > 1:335126/1‑127 (MQ=255) aaGTCGGTCCATCCTTCGCCGCTGTCGGCGTATCGCGGGTTCATCGGTTGCGGGCATTTCAGCCGTGCCAACAGCTTCCTCGAGCAGCGGGGGCTCGGGCCCATCGACTGGGCACTGCCCCCGCTGTGAGAAACCGCGGTGGGGTACg > 2:59852/1‑148 (MQ=255) aaGTCGGTCCATCCTTCGCCGCTGTCGGCGTATCGCGGGTTCATCGGTTGCGGGCATTTCAGCCGTGCCAACAGCTTCCTCGAGCAGCGGGGGCTCGGGCCCATCGACTGGGCACTGCCCCCGCTGTGAGAAACCGCGGTGGGGTACg < 6:117650/148‑1 (MQ=255) gTCGGTCCATCCTTCGCCGCTGTCGGCGTATCGCGGGTTCATCGGTTGCGGGCATTTCAGCCGTGCCAACAGCTTCCTCGAGCAGCGGGGGCTCGGGCCCATCGACTGGGCACTGCCCCCGCTGTGAGAAACCGCGGTGGGGTACGCaa < 1:59852/149‑1 (MQ=255) cGGTCCATCCTTCGCCGCTGTCGGCGTATCGCGGGTTCATCGGTTGCGGGCATTTCAGCCGTGCCAACAGCTTCCTCGAGCAGCGGGGGCTCGGGCCCATCGACTGGGCACTGCCCCCGCTGTGAGAAACCGCGGTGGGGTACGCAATc < 4:79577/149‑1 (MQ=255) gTCCATCCTTCGCCGCTGTCGGCGTATCGCGGGTTCATCGGTTGCGGGCATTTCAGCCGTGCCAACAGCTTCCTCGAGCAGCGGGGGCTCGGGCCCATCGACTGGGCACTGCCCCCGCTGTGAGAAACCGCGGTGGGGTACGCAATCg > 5:280912/1‑148 (MQ=255) gTCCATCCTTCGCCGCTGTCGGCGTATCGCGGGTTCATCGGTTGCGGGCATTTCAGCCGTGCCAACAGCTTCCTCGAGCAGCGGGGGCTCGGGCCCATCGACTGGGCACTGCCCCCCCTGTGAGAAACCGCGGTAGGGTACGCAATCGc > 2:237854/1‑149 (MQ=255) cATCCTTCGCCGCTGTCGGCGTATCGCGGGTTCATCGGTTGCGGGCATTTCAGCCGTGCCAACAGCTTCCTCGAGCAGCGGGGGCTCGGGCCCATCGACTGGGCACTGCCCCCGCTGTGAGAAACCGCGGTGGGGTACGCAATCGCTCa < 6:102970/149‑1 (MQ=255) aTCCTTCGCCGCTGTCGGCGTATCGCGGGTTCATCGGTTGCGGGCATTTCAGCCGTGCCAACAGCTTCCTCGAGCAGCGGGGGCTCGGGCCCATCGACTGGGCACTGCCCCCGCTGTGAGAAACCGCGGTGGGGTACGCAATCGCTCAg > 7:171317/1‑149 (MQ=255) gccgcTGTCGGCGTATCGCGGGTTCATCGGTTGCGGGCATTTCAGCCGTGCCAACAGCTTCCTCGAGCAGCGGGGGCTCGGGCCCATCGACTGGGCACTGCCCCCGCTGTGAGAAACCGCGGTGGGGTACGCAATCGCTCAGGGCGtc < 1:133856/148‑1 (MQ=255) ccgcTGTCGGCGTATCGCGGGTTCATCGGTTGCGGGCATTTCAGCCGTGCCAACAGCTTCCTCGAGCAGCGGGGGCTCGGGCCCATCGACTGGGCACTGCCCCCGCTGTGAGAAACCGCGGTGGGGTACGCAATCGCTCAGGGCGtcat > 5:216562/1‑149 (MQ=255) | TTTACCGACAGGATTATCCAGGTGGTCAGTGAGCAATGCCCGAACGTGGTGTTCCTGCTATGGGGGGCGCATGCACAGAGCAAGCAGAAGCTGATCGACGGTACCAAGCATCTGGTTTTGAAGTCGGTCCATCCTTCGCCGCTGTCGGCGTATCGCGGGTTCATCGGTTGCGGGCATTTCAGCCGTGCCAACAGCTTCCTCGAGCAGCGGGGGCTCGGGCCCATCGACTGGGCACTGCCCCCGCTGTGAGAAACCGCGGTGGGGTACGCAATCGCTCAGGGCGTCAT > NC_002947/1612648‑1612934 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |