New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1782480 = | 33 (0.610) | 3 (0.060) | 3/254 | NT | 8.0% | coding (1597/2703 nt) | glnD | uridylyltransferase |
? | NC_002947 | 1782517 = | 37 (0.710) | coding (1560/2703 nt) | glnD | uridylyltransferase |
GCGTCTCGTCGCCCACGTGCAGGGCAAAGTCGTTGATCACCTGCGGGTCGGACAAGTCCTTGCGCTGAGCGGTGGTCGACATCACCAGGTGGTTCTGCACCAGCCAGACGATCAGGCGGCTGTCCCAGGCCGGCAACTGGTGCCGTTCGCAGAACTTCTGCGCGTCCACTGCACCGATTTCCGAGTGGTCGCCCTGGCGACCCTTGCCGATGTCGTGGTACAGCCCGGCCAGGTAGATCAGCTCGGGTTTGGGCAGGCGCCCCATGAGCTTGCTGGCCAGCGGG > NC_002947/1782342‑1782625 | gcgTCTCGTCGCCCACGTGCAGGGCAAAGTCGTTGATCACCTGCGGGTCGGACAAGTCCTTGCGCTGAGCGGTGGTCGACATCACCAGGTGGTTCTGCACCAGCCAGACGATCAGGCGGCTGTCCCAGGCCGGCAACTGGTGCCGTTCg < 2:187978/149‑1 (MQ=255) tctcGTCGCCCACGTGCAGGGCAAAGTCGTTGATCACCTGCGGGTCGGACAAGTCCTTGCGCTGAGCGGTGGTCGACATCACCAGGTGGTTCTGCACCAGCCAGACGATCAGGCGGCTGTCCCAGGCCGGCAACTGGTGCCGTTCGCAg < 2:324668/149‑1 (MQ=255) gCCCACGTGCAGGGCAAAGTCGTTGATCACCTGCGGGTCGGACAAGTCCTTGCGCTGAGCGGTGGTCGACATCACCAGGTGGTTCTGCACCAGCCAGACGATCAGGCGGCTGTCCCAGGCCGGCAACTGGTGCCGTTCGCAGAACTTc < 8:35110/148‑1 (MQ=255) gTGCAGGGCAAAGTCGTTGATCACCTGCGGGTCGGACAAGTCCTTGCGCTGAGCGGTGGTCGACATCACCAGGTGGTTCTGCACCAGCCAGACGATCAGGCGGCTGTCCCAGGCCGGCAACTGGTGCCGTTCGCAGAACTTCTGCGCGt > 5:2396/1‑149 (MQ=255) cAGGGCAAAGTCGTTGATCACCTGCGGGTCGGACAAGTCCTTGCGCTGAGCGGTGGTCGACATCACCAGGTGGTTCTGCACCAGCCAGACGATCAGGCGGCTGTCCCAGGCCGGCAACTGGTGCCGTTCGCAGAACTTCTGCGCGTCCa < 5:307618/149‑1 (MQ=255) aaaGTCGTTGATCACCTGCGGGTCGGACAAGTCCTTGCGCTGAGCGGTGGTCGACATCACCAGGTGGTTCTGCACCAGCCAGACGATCAGGCGGCTGTCCCAGGCCGGCAACTGGTGCCGTTCGCAGAACTTCTGCGCGTCCACTGCAc > 6:9672/1‑149 (MQ=255) ccagcaagctcatggggcgcctgcccaaacccgagctgatctacctggccgggctgtaccacgacatcggcaagggtcgccagggcgaccactcggaaatcGGTGCCGTTCGCAGAACTTCTGCGCGTCCACTGCACCGATTTCCGAGt > 8:104362‑M1/102‑149 (MQ=255) gggTCGGACAAGTCCTTGCGCTGAGCGGTGGTCGACATCACCAGGTGGTTCTGCACCAGCCAGACGATCAGGCGGCTGTCCCAGGCCGGCAACTGGTGCCGTTCGCAGAACTTCTGCGCGTCCACTGCACCGATTTCCGAGTGGTCGcc > 6:167524/1‑149 (MQ=255) atggggcgcctgcccaaacccgagctgatctacctggccgggctgtaccacgacatcggcaagggtcgccagggcgaccactcggaaatcGGTGCCGTTCGCAGAACTTCTGCGCGTCCACTGCACCGATTTCCGa < 6:86677‑M1/46‑1 (MQ=255) atggggcgcctgcccaaacccgagctgatctacctggccgggctgtaccacgacatcggcaagggtcgccagggcgaccactcggaaatcGGTGCCGTTCGCAGAACTTCTGCGCGTCCACTGCACCGATTTCCGa > 5:86677‑M1/91‑136 (MQ=255) gACAAGTCCTTGCGCTGAGCGGTGGTCGACATCACCAGGTGGTTCTGCACCAGCCAGACGATCAGGCGGCTGTCCCAGGCCGGCAACTGGTGCCGTTCGCAGAACTTCTGCGCGTCCACTGCACCGAt < 4:152825/128‑1 (MQ=255) gACAAGTCCTTGCGCTGAGCGGTGGTCGACATCACCAGGTGGTTCTGCACCAGCCAGACGATCAGGCGGCTGTCCCAGGCCGGCAACTGGTGCCGTTCGCAGAACTTCTGCGCGTCCACTGCACCGAt > 3:152825/1‑128 (MQ=255) cAAGTCCTTGCGCTGAGCGGTGGTCGACATCACCAGGTGGTTCTGCACCAGCCAGACGATCAGGCGGCTGTCCCAGGCCGGCAACTGGTGCCGTTCGCAGAACTTCTGCGCGTCCACTGCACCGATTTCCGAGTGGTCGCCCTGGCGAc > 3:317317/1‑149 (MQ=255) gTCCTTGCGCTGAGCGGTGGTCGACATCACCAGGTGGTTCTGCACCAGCCAGAGAATCATGCGGCTTTACCAGGCCGGCAAAATGTTCCGTTCGCACAACTTCTGCCCCTCCACTGCACCGATTTCCGAGTTGTAGCCCTGGCGACCCt > 1:259380/1‑149 (MQ=255) gTCCTTGCGCTGAGCGGTGGTCGACATCACCAGGTGGTTCTGCACCAGCCAGACGATCAGGCGGCTGTCCCAGGCCGGCAACTGGTGCCGTTCGCAGAACTTCTGCGCGTCCACTGCACCGATTTCCGAGTGGTCGCCCTGGCGACCCt > 5:259405/1‑149 (MQ=255) cgcTGAGCGGTGGTCGACATCACCAGGTGGTTCTGCACCAGCCAGACGATCAGGCGGCTGTCCCAGGCCGGCAACTGGTGCCGTTCGCAGAACTTCTGCGCGTCCACTGCACCGATTTCCGAGTGGTCGCCCTGGCGACCCTTGCCGAt < 3:154399/149‑1 (MQ=255) cgcTGAGCGGTGGTCGACATCACCAGGTGGTTCTGCACCAGCCAGACGATCAGGCGGCTGTCCCAGGCCGGCAACTGGTGCCGTTCGCAGAACTTCTGCGCGTCCACTGCACCGATTTCCGAGTGGTCGCCCTGGCGACCCTTGCCGAt < 1:229693/149‑1 (MQ=255) tGAGCGGTGGTCGACATCACCAGGTGGTTCTGCACCAGCCAGACGATCAGGCGGCTGTCCCAGGCCGGCAACTGGTGCCGTTCGCAGAACTTCTGCGCGTCCACTGCACCGATTTCCGAGTGGTCGCCCTGGCGACCCTTGCCGATGTc > 1:331800/1‑149 (MQ=255) tGAGCGGTGGTCGACATCACCAGGTGGTTCTGCACCAGCCAGACGATCAGGCGGCTGTCCCAGGCCGGCAACTGGTGCCGTTCGCAGAACTTCTGCGCGTCCACTGCACCGATTTCCGAGTGGTCGCCCTGGCGACCCTTGCCGATGTc > 1:326686/1‑149 (MQ=255) aGCGGTGGTCGACATCACCAGGTGGTTCTGCACCAGCCAGACGATCAGGCGGCTGTCCCAGGCCGGCAACTGGTGCCGTTCGCAGAACTTCTGCGCGTCCACTGCACCGATTTCCGAGTGGTCGCCCTGGCGACCCTTGCCGATGTCGt < 5:9672/149‑1 (MQ=255) gCGGTGGTCGACATCACCAGGTGGTTCTGCACCAGCCAGACGATCAGGCGGCTGTCCCAGGCCGGCAACTGGTGCCGTTCGCAGAACTTCTGCGCGTCCACTGCACCGATTTCCGAGTGGTCGCCCTGGCGACCCTTGCCGATGTCGTg < 2:259380/149‑1 (MQ=255) gCGGTGGTCGACATCACCAGGTGGTTCTGCACCAGCCAGACGATCAGGCGGCTGTCCCAGGCCGGCAACTGGTGCCGTTCGCAGAACTTCTGCGCGTCCACTGCACCGATTTCCGAGTGGTCGCCCTGGCGACCCTTGCCGATGTCGTg < 6:259405/149‑1 (MQ=255) tCGACATCACCAGGTGGTTCTGCACCAGCCAGACGATCAGGCGGCTGTCCCAGGCCGGCAACTGGTGCCGTTCGCAGAACTTCTGCGCGTCCACTGCACCGATTTCCGAGTGGTCGCCCTGGCGACCCTTGCCGATGTCGTGGTACAGc > 2:320514/1‑149 (MQ=255) tCACCAGGTGGTTCTGCACCAGCCAGACGATCAGGCGGCTGTCCCAGGCCGGCAACTGGTGCCGTTCGCAGAACTTCTGCGCGTCCACTGCACCGATTTCCGAGTGGTCGCCCTGGCGACCCTTGCCGATGTCGTGGTACAGCCCGGc > 1:254476/1‑148 (MQ=255) gtggtTCTGCACCAGCCAGACGATCAGGCGTCTGTCCCAGGCCGGCAACTGGTGCCGTTCGCAGAACTTCTGCGCGTCCACTGCACCGATTTCCGAGTGGTCGCCCTGGCGACCCTTGCCGATGTCGTGGTACAGCCCGGCCAgg > 1:203962/1‑145 (MQ=255) gtggtTCTGCACCAGCCAGACGATCAGGCGGCTGTCCCAGGCCGGCAACTGGTGCCGTTCGCAGAACTTCTGCGCGTCCACTGCACCGATTTCCGAGTGGTCGCCCTGGCGACCCTTGCCGATGTCGTGGTACAGCCCGGCCAgg > 1:272888/1‑145 (MQ=255) ccagccagACGATCAGGCGGCTGTCCCAGGCCGGCAACTGGTGCCGTTCGCAGAACTTCTGCGCGTCCACTGCACCGATTTCCGAGTGGTCGCCCTGGCGACCCTTGCCGATGTCGTGGTACAGCCCGGCCAGGTAGATCAGCTCGGGt > 1:305614/1‑149 (MQ=255) ccagACGATCAGGCGGCTGTCCCAGGCCGGCAACTGGTGCCGTTCGCAGAACTTCTGCGCGTCCACTGCACCGATTTCCGAGTGGTCGCCCTGGCGACCCTTGCCGATGTCGTGGTACAGCCCGGCCAGGTAGATCAGCTCGGGTTTgg > 7:238091/1‑149 (MQ=255) agACGATCAGGCGGCTGTCCCAGGCCGGCAACTGGTGCCGTTCGCAGAACTTCTGCGCGTCCACTGCACCGATTTCCGAGTGGTCGCCCTGGCGACCCTTGCCGATGTCGTGGTACAGCCCGGCCAGGTAGATCAGCTCGGGTTTggg > 7:181713/1‑148 (MQ=255) agACGATCAGGCGGCTGTCCCAGGCCGGCAACTGGTGCCGTTCGCAGAACTTCTGCGCGTCCACTGCACCGATTTCCGAGTGGTCGCCCTGGCGACCCTTGCCGATGTCGTGGTACAGCCCGGCCAGGTAGATCAGCTCGGGTTTggg > 5:195257/1‑148 (MQ=255) gATCAGGCGGCTGTCCCAGGCCGGCAACTGGTGCCGTTCGCAGAACTTCTGCGCGTCCACTGCACCGATTTCCGAGTGGTCGCCCTGGCGACCCTTGCCGATGTCGTGGTACAGCCCGGCCAGGTAGATCAGCTCGGGTTTGGGCAGgc < 2:254476/149‑1 (MQ=255) gcTGTCCCAGGCCGGCAACTGGTGCCGTTCGCAGAACTTCTGCGCGTCCACTGCACCGATTTCCGAGTGGTCGCCCTGGCGACCCTTGCCGATGTCGTGGTACAGCCCGGCCAGGTAGATCAGCTCGGGTTTGGGCAGgcgc < 1:65681/142‑1 (MQ=255) gcTGTCCCAGGCCGGCAACTGGTGCCGTTCGCAGAACTTCTGCGCGTCCACTGCACCGATTTCCGAGTGGTCGCCCTGGCGACCCTTGCCGATGTCGTGGTACAGCCCGGCCAGGTAGATCAGCTCGGGTTTGGGCAGgcgc > 2:65681/1‑142 (MQ=255) gcTGTCCCAGGCCGGCAACTGGTGCCGTTCGCAGAACTTCTGCGCGTCCACTGCACCGATTTCCGAGTGGTCGCCCTGGCGACCCTTGCCGATGTCGTGGTACAGCCCGGCCAGGTAGATCAGCTCGGGTTTGGGCAGGCGCCCCATGa < 5:167524/149‑1 (MQ=255) aGGCCGGCAACTGGTGCCGTTCGCAGAACTTCTGCGCGTCCACTGCACCGATTTCCGAGTGGTCGCCCTGGCGACCCTTGCCGATGGCGTGGTACAGCCCGGCCAGGTAGATCAGCTCGGGTTTGGGCAGGCGCCCCATGAGCTTGCTg < 6:2396/149‑1 (MQ=255) aGGCCGGCAACTGGTGCCGTTCGCAGAACTTCTGCGCGTCCACTGCACCGATTTCCCAGTGGTCGCCCTGGCGACCCTTGCCGATGTCGTGGTACAGCCCGGCAAGGTAGATCAGCTCGGGTTTGGGCAGGCGCCCCATGAGCTTGCTg > 2:305967/1‑149 (MQ=255) cAACTGGTGCCGTTCGCAGAACTTCTGCGCGTCCACTGCACCGATTTCCGAGTGGTCGCCCTGGCGACCCTTGCCGATGTCGTGGTACAGCCCGGCCAGGTAGATCAGCTCGGGTTTGGGCAGGCGCCCCATGAGCTTGCTGGCCAGCg < 2:331800/149‑1 (MQ=255) cAACTGGTGCCGTTCGCAGAACTTCTGCGCGTCCACTGCACCGATTTCCGAGTGGTCGCCCTGGCGACCCTTGCCGATGTCGTGGTACAGCCCGGCCAGGTAGATCAGCTCGGGTTTGGGCAGGCGCCCCATGAGCTTGCTGGCCAGCg < 2:326686/149‑1 (MQ=255) cTGGTGCCGTTCGCAGAACTTCTGCGCGTCCACTGCACCGATTTCCGAGTGGTCGCCCTGGCGACCCTTGCCGATGTCGTGGTACAGCCCGGCCAGGTAGATCAGCTCGGGTTTGGGCAGGCGCCCCATGAGCTTGCTGGCCAGCggg > 5:295223/1‑148 (MQ=255) | GCGTCTCGTCGCCCACGTGCAGGGCAAAGTCGTTGATCACCTGCGGGTCGGACAAGTCCTTGCGCTGAGCGGTGGTCGACATCACCAGGTGGTTCTGCACCAGCCAGACGATCAGGCGGCTGTCCCAGGCCGGCAACTGGTGCCGTTCGCAGAACTTCTGCGCGTCCACTGCACCGATTTCCGAGTGGTCGCCCTGGCGACCCTTGCCGATGTCGTGGTACAGCCCGGCCAGGTAGATCAGCTCGGGTTTGGGCAGGCGCCCCATGAGCTTGCTGGCCAGCGGG > NC_002947/1782342‑1782625 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |