New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1782480 = | 33 (0.610) | 3 (0.060) | 3/254 | NT | 8.0% | coding (1597/2703 nt) | glnD | uridylyltransferase |
? | NC_002947 | 1782517 = | 37 (0.710) | coding (1560/2703 nt) | glnD | uridylyltransferase |
CACCTGCGGGTCGGACAAGTCCTTGCGCTGAGCGGTGGTCGACATCACCAGGTGGTTCTGCACCAGCCAGACGATCAGGCGGCTGTCCCAGGCCGGCAACTGGTGCCGTTCGCAGAACTTCTGCGCGTCCACTGCACCGATTTCCGAGTGGTCGCCCTGGCGACCCTTGCCGATGTCGTGGTACAGCCCGGCCAGGTAGATCAGCTCGGGTTTGGGCAGGCGCCCCATGAGCTTGCTGGCCAGCGGGAATTTCTCGGACACCGGCGTGTATTGCAGC > NC_002947/1782379‑1782655 | ccagcaagctcatggggcgcctgcccaaacccgagctgatctacctggccgggctgtaccacgacatcggcaagggtcgccagggcgaccactcggaaatcGGTGCCGTTCGCAGAACTTCTGCGCGTCCACTGCACCGATTTCCGAGt > 8:104362‑M1/102‑149 (MQ=255) gggTCGGACAAGTCCTTGCGCTGAGCGGTGGTCGACATCACCAGGTGGTTCTGCACCAGCCAGACGATCAGGCGGCTGTCCCAGGCCGGCAACTGGTGCCGTTCGCAGAACTTCTGCGCGTCCACTGCACCGATTTCCGAGTGGTCGcc > 6:167524/1‑149 (MQ=255) atggggcgcctgcccaaacccgagctgatctacctggccgggctgtaccacgacatcggcaagggtcgccagggcgaccactcggaaatcGGTGCCGTTCGCAGAACTTCTGCGCGTCCACTGCACCGATTTCCGa < 6:86677‑M1/46‑1 (MQ=255) atggggcgcctgcccaaacccgagctgatctacctggccgggctgtaccacgacatcggcaagggtcgccagggcgaccactcggaaatcGGTGCCGTTCGCAGAACTTCTGCGCGTCCACTGCACCGATTTCCGa > 5:86677‑M1/91‑136 (MQ=255) gACAAGTCCTTGCGCTGAGCGGTGGTCGACATCACCAGGTGGTTCTGCACCAGCCAGACGATCAGGCGGCTGTCCCAGGCCGGCAACTGGTGCCGTTCGCAGAACTTCTGCGCGTCCACTGCACCGAt < 4:152825/128‑1 (MQ=255) gACAAGTCCTTGCGCTGAGCGGTGGTCGACATCACCAGGTGGTTCTGCACCAGCCAGACGATCAGGCGGCTGTCCCAGGCCGGCAACTGGTGCCGTTCGCAGAACTTCTGCGCGTCCACTGCACCGAt > 3:152825/1‑128 (MQ=255) cAAGTCCTTGCGCTGAGCGGTGGTCGACATCACCAGGTGGTTCTGCACCAGCCAGACGATCAGGCGGCTGTCCCAGGCCGGCAACTGGTGCCGTTCGCAGAACTTCTGCGCGTCCACTGCACCGATTTCCGAGTGGTCGCCCTGGCGAc > 3:317317/1‑149 (MQ=255) gTCCTTGCGCTGAGCGGTGGTCGACATCACCAGGTGGTTCTGCACCAGCCAGAGAATCATGCGGCTTTACCAGGCCGGCAAAATGTTCCGTTCGCACAACTTCTGCCCCTCCACTGCACCGATTTCCGAGTTGTAGCCCTGGCGACCCt > 1:259380/1‑149 (MQ=255) gTCCTTGCGCTGAGCGGTGGTCGACATCACCAGGTGGTTCTGCACCAGCCAGACGATCAGGCGGCTGTCCCAGGCCGGCAACTGGTGCCGTTCGCAGAACTTCTGCGCGTCCACTGCACCGATTTCCGAGTGGTCGCCCTGGCGACCCt > 5:259405/1‑149 (MQ=255) cgcTGAGCGGTGGTCGACATCACCAGGTGGTTCTGCACCAGCCAGACGATCAGGCGGCTGTCCCAGGCCGGCAACTGGTGCCGTTCGCAGAACTTCTGCGCGTCCACTGCACCGATTTCCGAGTGGTCGCCCTGGCGACCCTTGCCGAt < 1:229693/149‑1 (MQ=255) cgcTGAGCGGTGGTCGACATCACCAGGTGGTTCTGCACCAGCCAGACGATCAGGCGGCTGTCCCAGGCCGGCAACTGGTGCCGTTCGCAGAACTTCTGCGCGTCCACTGCACCGATTTCCGAGTGGTCGCCCTGGCGACCCTTGCCGAt < 3:154399/149‑1 (MQ=255) tGAGCGGTGGTCGACATCACCAGGTGGTTCTGCACCAGCCAGACGATCAGGCGGCTGTCCCAGGCCGGCAACTGGTGCCGTTCGCAGAACTTCTGCGCGTCCACTGCACCGATTTCCGAGTGGTCGCCCTGGCGACCCTTGCCGATGTc > 1:326686/1‑149 (MQ=255) tGAGCGGTGGTCGACATCACCAGGTGGTTCTGCACCAGCCAGACGATCAGGCGGCTGTCCCAGGCCGGCAACTGGTGCCGTTCGCAGAACTTCTGCGCGTCCACTGCACCGATTTCCGAGTGGTCGCCCTGGCGACCCTTGCCGATGTc > 1:331800/1‑149 (MQ=255) aGCGGTGGTCGACATCACCAGGTGGTTCTGCACCAGCCAGACGATCAGGCGGCTGTCCCAGGCCGGCAACTGGTGCCGTTCGCAGAACTTCTGCGCGTCCACTGCACCGATTTCCGAGTGGTCGCCCTGGCGACCCTTGCCGATGTCGt < 5:9672/149‑1 (MQ=255) gCGGTGGTCGACATCACCAGGTGGTTCTGCACCAGCCAGACGATCAGGCGGCTGTCCCAGGCCGGCAACTGGTGCCGTTCGCAGAACTTCTGCGCGTCCACTGCACCGATTTCCGAGTGGTCGCCCTGGCGACCCTTGCCGATGTCGTg < 2:259380/149‑1 (MQ=255) gCGGTGGTCGACATCACCAGGTGGTTCTGCACCAGCCAGACGATCAGGCGGCTGTCCCAGGCCGGCAACTGGTGCCGTTCGCAGAACTTCTGCGCGTCCACTGCACCGATTTCCGAGTGGTCGCCCTGGCGACCCTTGCCGATGTCGTg < 6:259405/149‑1 (MQ=255) tCGACATCACCAGGTGGTTCTGCACCAGCCAGACGATCAGGCGGCTGTCCCAGGCCGGCAACTGGTGCCGTTCGCAGAACTTCTGCGCGTCCACTGCACCGATTTCCGAGTGGTCGCCCTGGCGACCCTTGCCGATGTCGTGGTACAGc > 2:320514/1‑149 (MQ=255) tCACCAGGTGGTTCTGCACCAGCCAGACGATCAGGCGGCTGTCCCAGGCCGGCAACTGGTGCCGTTCGCAGAACTTCTGCGCGTCCACTGCACCGATTTCCGAGTGGTCGCCCTGGCGACCCTTGCCGATGTCGTGGTACAGCCCGGc > 1:254476/1‑148 (MQ=255) gtggtTCTGCACCAGCCAGACGATCAGGCGTCTGTCCCAGGCCGGCAACTGGTGCCGTTCGCAGAACTTCTGCGCGTCCACTGCACCGATTTCCGAGTGGTCGCCCTGGCGACCCTTGCCGATGTCGTGGTACAGCCCGGCCAgg > 1:203962/1‑145 (MQ=255) gtggtTCTGCACCAGCCAGACGATCAGGCGGCTGTCCCAGGCCGGCAACTGGTGCCGTTCGCAGAACTTCTGCGCGTCCACTGCACCGATTTCCGAGTGGTCGCCCTGGCGACCCTTGCCGATGTCGTGGTACAGCCCGGCCAgg > 1:272888/1‑145 (MQ=255) ccagccagACGATCAGGCGGCTGTCCCAGGCCGGCAACTGGTGCCGTTCGCAGAACTTCTGCGCGTCCACTGCACCGATTTCCGAGTGGTCGCCCTGGCGACCCTTGCCGATGTCGTGGTACAGCCCGGCCAGGTAGATCAGCTCGGGt > 1:305614/1‑149 (MQ=255) ccagACGATCAGGCGGCTGTCCCAGGCCGGCAACTGGTGCCGTTCGCAGAACTTCTGCGCGTCCACTGCACCGATTTCCGAGTGGTCGCCCTGGCGACCCTTGCCGATGTCGTGGTACAGCCCGGCCAGGTAGATCAGCTCGGGTTTgg > 7:238091/1‑149 (MQ=255) agACGATCAGGCGGCTGTCCCAGGCCGGCAACTGGTGCCGTTCGCAGAACTTCTGCGCGTCCACTGCACCGATTTCCGAGTGGTCGCCCTGGCGACCCTTGCCGATGTCGTGGTACAGCCCGGCCAGGTAGATCAGCTCGGGTTTggg > 5:195257/1‑148 (MQ=255) agACGATCAGGCGGCTGTCCCAGGCCGGCAACTGGTGCCGTTCGCAGAACTTCTGCGCGTCCACTGCACCGATTTCCGAGTGGTCGCCCTGGCGACCCTTGCCGATGTCGTGGTACAGCCCGGCCAGGTAGATCAGCTCGGGTTTggg > 7:181713/1‑148 (MQ=255) gATCAGGCGGCTGTCCCAGGCCGGCAACTGGTGCCGTTCGCAGAACTTCTGCGCGTCCACTGCACCGATTTCCGAGTGGTCGCCCTGGCGACCCTTGCCGATGTCGTGGTACAGCCCGGCCAGGTAGATCAGCTCGGGTTTGGGCAGgc < 2:254476/149‑1 (MQ=255) gcTGTCCCAGGCCGGCAACTGGTGCCGTTCGCAGAACTTCTGCGCGTCCACTGCACCGATTTCCGAGTGGTCGCCCTGGCGACCCTTGCCGATGTCGTGGTACAGCCCGGCCAGGTAGATCAGCTCGGGTTTGGGCAGgcgc > 2:65681/1‑142 (MQ=255) gcTGTCCCAGGCCGGCAACTGGTGCCGTTCGCAGAACTTCTGCGCGTCCACTGCACCGATTTCCGAGTGGTCGCCCTGGCGACCCTTGCCGATGTCGTGGTACAGCCCGGCCAGGTAGATCAGCTCGGGTTTGGGCAGgcgc < 1:65681/142‑1 (MQ=255) gcTGTCCCAGGCCGGCAACTGGTGCCGTTCGCAGAACTTCTGCGCGTCCACTGCACCGATTTCCGAGTGGTCGCCCTGGCGACCCTTGCCGATGTCGTGGTACAGCCCGGCCAGGTAGATCAGCTCGGGTTTGGGCAGGCGCCCCATGa < 5:167524/149‑1 (MQ=255) aGGCCGGCAACTGGTGCCGTTCGCAGAACTTCTGCGCGTCCACTGCACCGATTTCCGAGTGGTCGCCCTGGCGACCCTTGCCGATGGCGTGGTACAGCCCGGCCAGGTAGATCAGCTCGGGTTTGGGCAGGCGCCCCATGAGCTTGCTg < 6:2396/149‑1 (MQ=255) aGGCCGGCAACTGGTGCCGTTCGCAGAACTTCTGCGCGTCCACTGCACCGATTTCCCAGTGGTCGCCCTGGCGACCCTTGCCGATGTCGTGGTACAGCCCGGCAAGGTAGATCAGCTCGGGTTTGGGCAGGCGCCCCATGAGCTTGCTg > 2:305967/1‑149 (MQ=255) actcggaaatcggtgcagtggacgcgcagaagttctgcgaacggcaccGATTTCCGAGTGGTCGCCCTGGCGACCCTTGCCGATGTCGTGGTACAGCCCGGCCAGGTAGATCAGCTCGGGTTTGGGCAGGCGCCCCATGAGCTTGCTgg > 8:104362‑M2/49‑149 (MQ=255) tcggaaatcggtgcagtggacgcgcagaagttctgcgaacggcaccGATTTCCGAGTGGTCGCCCTGGCGACCCTTGCCGATGTCGTGGTACAGCCCGGCCAGGTAGATCAGCTCGGGTTTGGGCAGGCGCCCCAt > 5:86677‑M2/47‑136 (MQ=255) tcggaaatcggtgcagtggacgcgcagaagttctgcgaacggcaccGATTTCCGAGTGGTCGCCCTGGCGACCCTTGCCGATGTCGTGGTACAGCCCGGCCAGGTAGATCAGCTCGGGTTTGGGCAGGCGCCCCAt < 6:86677‑M2/90‑1 (MQ=255) cAACTGGTGCCGTTCGCAGAACTTCTGCGCGTCCACTGCACCGATTTCCGAGTGGTCGCCCTGGCGACCCTTGCCGATGTCGTGGTACAGCCCGGCCAGGTAGATCAGCTCGGGTTTGGGCAGGCGCCCCATGAGCTTGCTGGCCAGCg < 2:331800/149‑1 (MQ=255) cAACTGGTGCCGTTCGCAGAACTTCTGCGCGTCCACTGCACCGATTTCCGAGTGGTCGCCCTGGCGACCCTTGCCGATGTCGTGGTACAGCCCGGCCAGGTAGATCAGCTCGGGTTTGGGCAGGCGCCCCATGAGCTTGCTGGCCAGCg < 2:326686/149‑1 (MQ=255) cTGGTGCCGTTCGCAGAACTTCTGCGCGTCCACTGCACCGATTTCCGAGTGGTCGCCCTGGCGACCCTTGCCGATGTCGTGGTACAGCCCGGCCAGGTAGATCAGCTCGGGTTTGGGCAGGCGCCCCATGAGCTTGCTGGCCAGCggg > 5:295223/1‑148 (MQ=255) GTGCCGTTCGCAGAACTTCTGCGCGTCCACTGCACCGATTTCCGAGTGGTCGCCCTGGCGACCCTTGCCGATGTCGTGGTACAGCCCGGCCAGGTAGATCTGCTCGGGTTTGGGCAGGCGCCCCATGAGCTTGCTGGCCAGCGGGAAtt < 4:112741‑M1/149‑1 (MQ=255) GTGCCGTTCGCAGAACTTCTGCGCGTCCACTGCACCGATTTCCGAGTGGTCGCCCTGGCGACCCTTGCCGATGTCGTGGTACAGCCCGGCCAGGTAGATCAGCTCGGGTTTGGGCAGGCGCCCCATGAGCTTGCTGGCCAGCGGGAAt > 8:181713‑M1/1‑148 (MQ=255) GCCGTTCGCAGAACTTCTGCGCGTCCACTGCACCGATTTCCGAGTGGTCGCCCTGGCGACCCTTGCCGATGTCGTGGTACAGCCCGGCCAGGTAGATCAGCTCGGGTTTGGGCAGGCGCCCCATGAGCTTGCTGGCCAGCGGGAATTtc < 1:300236‑M1/149‑1 (MQ=255) cGTTCGCAGAACTTCTGCGCGTCCACTGCACCGATTTCCGAGTGGTCGCCCTGGCGACCCTTGCCGATGTCGTGGTACAGCCCGGCCAGGTAGATCAGCTCGGGTTTGGGCAGGCGCCCCATGAGCTTGCTGGCCAGCGGGAATTtctc < 2:305614/149‑1 (MQ=255) gTTCGCAGAACTTCTGCGCGTCCACTGCACCGATTTCCGAGTGGTCGCCCTGGCGACCCTTGCCGATGTCGTGGTACAGCCCGGCCAGGTAGATCAGCTCGGGTTTGGGCAGGCGCCCCATGAGCTTGCTGGCCAGCGGGAATTTCTCg > 6:114325/1‑149 (MQ=255) gCAGAACTTCTGCGCGTCCACTGCACCGATTTCCGAGTGGTCGCCCTGGCGACCCTTGCCGATGTCGTGGTACAGCCCGGCCAGGTAGATCAGCTCGGGTTTGGGCAGGCGCCCCATGAGCTTGCTGGCCAGCgg > 4:278258/1‑135 (MQ=255) gCAGAACTTCTGCGCGTCCACTGCACCGATTTCCGAGTGGTCGCCCTGGCGACCCTTGCCGATGTCGTGGTACAGCCCGGCCAGGTAGATCAGCTCGGGTTTGGGCAGGCGCCCCATGAGCTTGCTGGCCAGCgg < 3:278258/135‑1 (MQ=255) gAACTTCTGCGCGTCCACTGCACCGATTTCCGAGTGGTCGCCCTGGCGACCCTTGCCGATGTCGTGGTACAGCCCGGCCAGGTAGATCAGCTCGGGTTTGGGCAGGCGCCCCATGAGCTTGCTGGCCAGCGGGAATTTCTCGGACACCg < 5:114325/149‑1 (MQ=255) ttCTGCGCGTCCACTGCACCGATTTCCGAGTGGTCGCCCTGGCGACCCTTGCCGATGTCGTGGTACAGCCCGGCCAGGTAGATCAGCTCGGGTTTGGGCAGGCGCCCCATGAGCTTGCTGGCCAGCGGGAATTTCTCGGACACCGGCgt > 8:17616/1‑149 (MQ=255) cgcgTCCACTGCACCGATTTCCGAGTGGTCGCCCTGGCGACCCTTGCCGATGTCGTGGTACAGCCCGGCCAGGTAGATCAGCTCGGGTTTGGGCAGGCGCCCCATGAGCTTGCTGGCCAGCGGGAATTTCTCGGACACCGGCgtgt < 6:195257/146‑1 (MQ=255) gTCCACTGCACCGATTTCCGAGTGGTCGCCCTGGCGACCCTTGCCGATGTCGTGGTACAGCCCGGCCAGGTAGATCAGCTCGGGTTTGGGCAGGCGCCCCATGAGCTTGCTGGCCAGCGGGAATTTCTCGGACACCGGCGTGTATTGCa < 2:279615/149‑1 (MQ=255) gTCCACTGCACCGATTTCCGAGTGGTCGCCCTGGCGACCCTTGCCGATGTCGTGGTACAGCCCGGCCAGGTAGATCAGCTCGGGTTTGGGCAGGCGCCCCATGAGCTTGCTGGCCAGCGGGAATTTCTCGGACACCGGCGTGTATTGCa < 8:238091/149‑1 (MQ=255) cACTGCACCGATTTCCGAGTGGTCGCCCTGGCGACCCTTGCCGATGTCGTGGTACAGCCCGGCCAGGTAGATCAGCTCGGGTTTGGGCAGGCGCCCCATGAGCTTGCTGGCCAGCGGGAATTTCTCGGACACCGGCGTGTATTGCAGc < 1:305967/148‑1 (MQ=255) gATTTCCGAGTGGTCGCCCTGGCGACCCTTGCCGATGTCGTGGTACAGCCCGGCCAGGTAGATCAGCTCGGGTTTGGGCAGGCGCCCCATGAGCTTGCTGGCCAGCGGGAATTtctc < 5:3953/117‑1 (MQ=255) gATTTCCGAGTGGTCGCCCTGGCGACCCTTGCCGATGTCGTGGTACAGCCCGGCCAGGTAGATCAGCTCGGGTTTGGGCAGGCGCCCCATGAGCTTGCTGGCCAGCGGGAATTtctc > 6:3953/1‑117 (MQ=255) | CACCTGCGGGTCGGACAAGTCCTTGCGCTGAGCGGTGGTCGACATCACCAGGTGGTTCTGCACCAGCCAGACGATCAGGCGGCTGTCCCAGGCCGGCAACTGGTGCCGTTCGCAGAACTTCTGCGCGTCCACTGCACCGATTTCCGAGTGGTCGCCCTGGCGACCCTTGCCGATGTCGTGGTACAGCCCGGCCAGGTAGATCAGCTCGGGTTTGGGCAGGCGCCCCATGAGCTTGCTGGCCAGCGGGAATTTCTCGGACACCGGCGTGTATTGCAGC > NC_002947/1782379‑1782655 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |