New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2360516 | 37 (0.690) | 3 (0.060) | 3/256 | NT | 7.2% | coding (641/1134 nt) | PP_2075 | membrane protein |
? | NC_002947 | = 2360555 | 42 (0.800) | coding (602/1134 nt) | PP_2075 | membrane protein |
GGTAGCTGGGTGCTCAGGCGGGGGCGGGGGACGGCGTGTGGGCCTTCTTCCATATAACGACGGATGAATTCCCACTCATCACGCAGTTCGCTGCCGCCTTGGCCTTGTTTGCCCAGCAGGGCCATTTCCATGTGAGGCAGGCCGGTGCGGCTGGGGTGCCAGACCAGGCCGAGCCGCGTGCCCACGCTGAGTGAGTCATCTTCTGGGTCGATGGCTGTGCTTCCGGTTGTTTTCCACGGGAAAGTGACGATGCCGCCGCAGTATTTCGGTCGATGTAGGTGAAC > NC_002947/2360378‑2360661 | ggTAGCTGGGTGCTCAGGCGGGGGCGGGGGACGGCGTGTGGGCCTTCTTCCATATAACGACGGATGAATTCCCACTCATCACGCAGTTCGCTGCCGCCTTGGCCTTGTTTGCCCAGCAGGGCCATTTCCATGTGAGGCAGGCCGGTGCg > 4:137816/1‑149 (MQ=255) gggACGGCGTGTGGGCCTTCTTCCATATAACGACGGATGAATTCCCACTCATCACGCAGTTCGCTGCCGCCTTGGCCTTGTTTGCCCAGCAGGGCCATTTCCATGTGAGGCAGGCCGGTGCGGCTGGGGTGCCAGACCAGGCCGAGCcg > 5:307566/1‑149 (MQ=255) ggACGGCGTGTGGGCCTTCTTCCATATAACGACGGATGAATTCCCACTCATCACGCAGTTCGCTGCCGCCTTGGCCTTTTTTGCCCAGCAGGGCCATTTCCATGTGAGGCAcgcggctcggcctggtctggcaccccagccgcaccggc < 4:232645‑M1/149‑39 (MQ=255) ggACGGCGTGTGGGCCTTCTTCCATATAACGACGGATGAATTCCCACTCATCACGCAGTTCGCTGCCGCCTTGGCCTTGTTTGCCCAGCAGGGCCATTTCCATGTGAGGCAGGCCGGTGCGGCTGGGGTGCCAGACCAGGCCGAGCcgc < 1:285727/149‑1 (MQ=255) gCGTGTGGGCCTTCTTCCATATAACGACGGATGAATTCCCACTCATCACGCAGTTCGCTGCCGCCTTGGCCTTGTTTGCCCAGCAGGGCCATTTCCATGTGAGGCAGGCCGGTGCGGCTGGGGTGCCAGACCAGGCCGAGCCGCGtgcc < 5:207980‑M2/149‑5 (MQ=255) tgGGCCTTCTTCCATATAACGACGGATGAATTCCCACTCATCACGCAGTTCGCTGCCGCCTTGGCCTTGTTTGCCCAGCAGGGCCATTTCCATGTGAGGCAcgcggctcggcctggtctggcaccccagccgcaccggcctgcc > 1:137768‑M1/1‑101 (MQ=255) tgGGCCTTCTTCCATATAACGACGGATGAATTCCCACTCATCACGCAGTTCGCTGCCGCCTTGGCCTTGTTTGCCCAGCAGGGCCATTTCCATGTGAGGCAcgcggctcggcctggtctggcaccccagccgcaccggcctgcc < 2:137768‑M1/144‑44 (MQ=255) cttcCATATAACGACGGATGAATTCCCACTCATCACGCAGTTCGCTGCCGCCTTGGCCTTGTTTGCCCAGCAGGGCCATTTCCATGTGAGGCAGGCCGGTGCGGCTGGGGTGCCAGACCAGGCCGAGCCGCGTGCCCACGCtgagtgag > 5:209148/1‑149 (MQ=255) tataACGACGGATGAATTCCCACTCATCACGCAGTTCGCTGCCGCCTTGGCCTTGTTTGCCCAGCAGGGCCATTTCCATGTGAGGCAGGCCGGTGCGGCTGGGGTGCCAGACCAGGCCGAGCCGCGTGCCCACGCTGAGTGAGTCAtct > 3:171164/1‑149 (MQ=255) gATGAATTCCCACTCATCACGCAGTTCGCTGCCGCCTTGGCCTTGTTTGTCCAGCAGGGCCATTTCCATGTGAGGCAGGCCGGTGCGGCTGGGGTGCCAGACCAGGCCGAGCCGCGTGCCCACGCTGAGTGAGTCATCTTCTGGGTCGa > 4:7308/1‑149 (MQ=255) tGAATTCCCACTCATCACGCAGTTCGCTGCCGCCTTGGCCTTGTTTGCCCAGCAGGGCCATTTCCATGTGAGGCAGGCCGGTGCGGCTGGGGTGCCAGACCAGGCCGAGCCGCGTGCCCACGCTGAGTGAGTCATCTTCTggg < 8:146667/143‑1 (MQ=255) tGAATTCCCACTCATCACGCAGTTCGCTGCCGCCTTGGCCTTGTTTGCCCAGCAGGGCCATTTCCATGTGAGGCAGGCCGGTGCGGCTGGGGTGCCAGACCAGGCCGAGCCGCGTGCCCACGCTGAGTGAGTCATCTTCTggg > 7:146667/1‑143 (MQ=255) tGAATTCCCACTCATCACGCAGTTCGCTGCCGCCTTGGCCTTGTTTGCCCAGCAGGGCCATTTCCATGTGAGGCAGGCCGGTGCGGCTGGGGTGCCAGACCAGGCCGAGCCGCGTGCCCACGCTGAGTGAGTCATCTTCTGGGTCGATg > 2:86057/1‑149 (MQ=255) aTTCCCACTCATCACGCAGTTCGCTGCCGCCTTGGCCTTGTTTGCCCAGCAGGGCCATTTCCATGTGAGGCAGGCCGGTGCGGCTGGGGTGCCAGACCAGGCCGAGCCGCGTGCCCACGCTGAGTGAGTCATCTTCTGGGTCGATGGCt > 6:247019/1‑149 (MQ=255) ttCCCACTCCTCACGCAGTTCGCTGCCGCCTTGGCCTTGTTTGCCCTGCAGGGCCATTTCCCTGTGAGGCAGGCCGGTGCGGCTGGGGTGCCAGACCAGGCCGAGCCGCGTGCCCACGATGAGGGAGTCATCTTCTGGGTCGATGGCtg < 2:112167/149‑1 (MQ=21) cccACTCATCACGCAGTTCGCTGCCGCCTTGGCCTTGTTTGCCCAGCAGGGCCATTTCCATGTGAGGCAGGCCGGTGCGGCTGGGGTGCCAGACCAGGCCGAGCCGCGTGCCCACGCTGAGTGAGTCATCTTCTGGGTCGATGGCtgt < 6:15398/148‑1 (MQ=255) ccACTCATCACGCAGTTCGCTGCCGCCTTGGCCTTGTTTGTCCAGCAGGGCCATTTCCATGTGAGGCAGGCCGGTGCGGCTGGGGTGCCAGACCAGGCCGAGCCGCGTGCCCACGCTGAGTGAGTCATCTTCTGGGTCGATGGCtgtg < 3:7308/148‑1 (MQ=255) cACTCATCACGCAGTTCGCTGCCGCCTTGGCCTTGTTTGCCCAGCAGGGCCATTTCCATGTGAGGCAGGCCGGTGCGGCTGGGGTGCCAGACCAGGCCGAGCCGCGTGCCCACGCTGAGTGAGTCAtc < 3:289042/128‑1 (MQ=255) cACTCATCACGCAGTTCGCTGCCGCCTTGGCCTTGTTTGCCCAGCAGGGCCATTTCCATGTGAGGCAGGCCGGTGCGGCTGGGGTGCCAGACCAGGCCGAGCCGCGTGCCCACGCTGAGTGAGTCAtc > 4:289042/1‑128 (MQ=255) atcaCGCAGTTCGCTGCCGCCTTGGCCTTGTTTGCCCAGCAGGGCCATTTCCATGTGAGGCAGGCCGGTGCGGCTGGGGTGCCAGACCAGGCCGAGCCGCGTGCCCACGCTGAGTGAGTCATCTTCTGGGTCGATGGCTGTGCTTCCgg < 6:207980/149‑1 (MQ=255) aCGCAGTTCGCTGCCGCCTTGGCCTTGTTTGCCCAGCAGGGCCATTTCCATGTGAGGCAGGCCGGTGCGGCTGGGGTGCCAGACCAGGCCGAGCCGCGTGCCCACGCTGAGTGAGTCATCTTCTGGGTCGATGGCTGTGCTTCCGgttg < 6:209148/149‑1 (MQ=255) aCGCAGTTCGCTGCCGCCTTGGCCTTGTTTGCCCAGCAGGGCCATTTCCATGTGAGGCAGGCCGGTGCGGCTGGGGTGCCAGACCAGGCCGAGCCGCGTGCCCACGCTGAGTGAGTCATCTTCTGGGTCGATGGCTGTGCTTCCGgttg > 2:38314/1‑149 (MQ=255) ttCGCTGCCGCCTTGGCCTTGTTTGCCCAGCAGGGCCATTTCCATGTGAGGCAGGCCGGTGCGGCTGGGGTGCCAGACCAGGCCGAGCCGCGTGCCCACGCTGAGTGAGTCATCTTCTGGGTCGATGGCTGTGCTTCCGGTTGTTTTc > 5:55173/1‑148 (MQ=255) cGCTGCCGCCTTGGCCTTGTTTGCCCAGCAGGGCCATTTCCATGTGAGGCAGGCCGGTGCGGCTGGGGTGCCAGACCAGGCCGAGCCGCGTGCCCACGCTGAGTGAGTCATCTTCTGGGTCGATGGCTGTGCTTCCGGTTGTTTTCCa < 1:86057/148‑1 (MQ=255) cTGCCGCCTTGGCCTTGTTTGCCCAGCAGGGCCATTTCCATGTGAGGCAGGCCGGTGCGGCTGGGGTGCCAGACCAGGCCGAGCCGCGTGCCCACGCTGAGTGAGTCATCTTCTGGGTCGATGGCTGTGCTTCCGGTTGTTTTCCACgg < 4:171164/149‑1 (MQ=255) ccgccTTGGCCTTGTTTGCCCAGCAGGGCCATTTCCATGTGAGGCAGGCCGGTGCGGCTGGGGTGCCAGACCAGGCCGAGCCGCGTGCCCACGCTGAGTGAGTCATCTTCTGGGTCGATGGCTGTGCTTCCGgttgtt > 5:118036/1‑138 (MQ=255) ccgccTTGGCCTTGTTTGCCCAGCAGGGCCATTTCCATGTGAGGCAGGCCGGTGCGGCTGGGGTGCCAGACCAGGCCGAGCCGCGTGCCCACGCTGAGTGAGTCATCTTCTGGGTCGATGGCTGTGCTTCCGgttgtt < 6:118036/138‑1 (MQ=255) cttggccttgTTTGCCCAGCAGGGCCATTTCCATGTGAGGCAGGCCGGTGCGGCTGGGGTGCCAGACCAGGCCGAGCCGCGTGCCCACGCTGAGTGAGTCATCTTCTGGGTCGATGGCTGTGCTTCCGGTTGTTTTCCACGGGAAAGTg < 3:137816/149‑1 (MQ=255) ccttgTTTGCCCAGCAGGGCCATTTCCATGTGAGGCAGGCCGGTGCGGCTGGGGTGCCAGACCAGGCCGAGCCGCGTGCCCACGCTGAGTGAGTCATCTTCTGGGTCGATGGCTGTGCTTCCGGTTGTTTTCCACGGGAAAGTGACGAt > 7:160317/1‑149 (MQ=255) ccttgTTTGCCCAGCAGGGCCATTTCCATGTGAGGCAGGCCGGTGCGGCTGGGGTGCCAGACCAGGCCGAGCCGCGTGCCCACGCTGAGTGAGTCATCTTCTGGGTCGATGGCTGTGCTTCCGGTTGTTTTCCACGGGAAAGTGACGAt > 5:179314/1‑149 (MQ=255) ttgTTTGCCCAGCAGGGCCATTTCCATGTGAGGCAGGCCGGTGCGGCTGGGGTGCCAGACCAGGCCGAGCCGCGTGCCCACGCTGAGTGAGTCATCTTCTGGGTCGATGGCTGTGCTTCCGGTTGTTTTCCACGGGAAAGTGACGATgc > 8:110222/1‑149 (MQ=255) gCCCAGCAGGGCCATTTCCATGTGAGGCAGGCCGGTGCGGCTGGGGTGCCAGACCAGGCCGAGCCGCGTGCCCACGCTGAGTGAGTCATCTTCTGGGTCGATGGCTGTGCTTCCGGTTGTTTTCCACGGGAAAGTGACGATGccgccg < 5:247019/148‑1 (MQ=255) ggCCATTTCCATGTGAGGCAGGCCGGTGCGGCTGGGGTGCCAGACCAGGCCGAGCCGCGTGCCCACGCTGAGTGAGTCATCTTCTGGGTCGATGGCTGTGCTTCCGGTTGTTTTCCACGGGAAAGTGACGATGCCGCCGCAGTATTTCg > 8:172721/1‑149 (MQ=255) cATTTCCATGTGAGGCAGGCCGGTGCGGCTGGGGTGCCAGACCAGGCCGAGCCGCGTGCCCACGCTGAGTGAGTCATCTTCTGGGTCGATGGCTGTGCTTCCGGTTGTTTTCCACGGGAAAGTGAAGATGCAGCCGCAGTATTTAGGTc > 6:234922/1‑149 (MQ=255) aTTTCCATGTGAGGCAGGCCGGTGCGGCTGGGGTGCCAGACCAGGCCGAGCCGCGTGCCCACGCTGAGTGAGTCATCTTCTGGGTCGATGGCTGTGCTTCCGGTTGTTTTCCACGGGAAAGTGACGATGCCGCCGCAGTATTTCGGTc > 3:17984/1‑148 (MQ=255) tttCCATGTGAGGCAGGCCGGTGCGGCTGGGGTGCCAGACCAGGCCGAGCCGCGTGCCCACGCTGAGTGAGTCATCTTCTGGGTCGATGGCTGTGCTTCCGGTTGTTTTCCACGGGAAAGTGACGATGCCGCCGCAGTATTTCGGTCGa > 7:115777/1‑149 (MQ=255) cATGTGAGGCAGGCCGGTGCGGCTGGGGTGCCAGACCAGGCCGAGCCGCGTGCCCACGCTGAGTGAGTCATCTTCTGGGTCGATGGCTGTGCTTCCGGTTGTTTTCCACGGGAAAGTGACGATGCCGCCGCAGTATTTCGGTCGATGt < 8:160317/148‑1 (MQ=255) aTGTGAGGCAGGCCGGTGCGGCTGGGGTGCCAGACCAGGCCGAGCCGCGTGCCCACGCTGAGTGAGTCATCTTCTGGGTCGATGGCTGTGCTTCCGGTTGTTTTCCACGGGAAAGTGACGATGCCGCCGCAGTATTTCGGTCGATGTAg < 6:179314/149‑1 (MQ=255) aTGTGAGGCAGGCCGGTGCGGCTGGGGTGCCAGACCAGGCCGAGCCGCGTGCCCACGCTGAGTGAGTCATCTTCTGGGTCGATGGCTGTGCTTCCGGTTGTTTTCCACGGGAAAGTGACGATGCCGCCGCAGTATTTCGGTCGATGTAg < 6:307566/149‑1 (MQ=255) tgtgAGGCAGGCCGGTGCGGCTGGGGTGCCAGACCAGGCCGAGCCGCGTGCCCACGCTGAGTGAGTc > 8:258748/1‑67 (MQ=255) tgtgAGGCAGGCCGGTGCGGCTGGGGTGCCAGACCAGGCCGAGCCGCGTGCCCACGCTGAGTGAGTc < 7:258748/67‑1 (MQ=255) ggcaggcCGGTGCGGCTGGGGTGCCAGACCAGGCCGAGCCGCGtgcctcacatggaaatggccctgctgggcaaacaaggccaaggcggcagcgaactgcgtgatgagtgggaattcatccgtcgttatatggaagaaggccca < 2:137768‑M2/144‑102 (MQ=255) ggcaggcCGGTGCGGCTGGGGTGCCAGACCAGGCCGAGCCGCGtgcctcacatggaaatggccctgctgggcaaacaaggccaaggcggcagcgaactgcgtgatgagtgggaattcatccgtcgttatatggaagaaggccca > 1:137768‑M2/1‑43 (MQ=255) ggCAcgcggctcggcctggtctggcaccccagccgcaccggcctgcctcacatggaaatggccctgctgggcaaacaaggccaaggcggcagcgaactgcgtgatgagtgggaattcatccgtcgttatatggaagaaggcccacacgc < 5:207980‑M1/149‑146 (MQ=255) | GGTAGCTGGGTGCTCAGGCGGGGGCGGGGGACGGCGTGTGGGCCTTCTTCCATATAACGACGGATGAATTCCCACTCATCACGCAGTTCGCTGCCGCCTTGGCCTTGTTTGCCCAGCAGGGCCATTTCCATGTGAGGCAGGCCGGTGCGGCTGGGGTGCCAGACCAGGCCGAGCCGCGTGCCCACGCTGAGTGAGTCATCTTCTGGGTCGATGGCTGTGCTTCCGGTTGTTTTCCACGGGAAAGTGACGATGCCGCCGCAGTATTTCGGTCGATGTAGGTGAAC > NC_002947/2360378‑2360661 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |