New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2403799 = | 58 (1.080) | 5 (0.100) | 4/244 | NT | 8.1% | coding (426/1209 nt) | PP_2106 | ammonium transporter |
? | NC_002947 | 2403860 = | 60 (1.210) | coding (487/1209 nt) | PP_2106 | ammonium transporter |
GGTCAAGTGTTTCTTCCTGCTGACCTTCGCGGCGGCGATTCCGGCGATCATCTCCGGGGGCATTGCCGAGCGGGCGC‑GGTTCGTGCCGCAGTTGTGCGCTACGGCGTTGATCGTGGCGTTCGTCTATCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAATCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCCATGGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTTGCTGGGCGCGCGCCGTGGG > NC_002947/2403652‑2403943 | agcccagcgccagaaagggaatgctcgatggcgcaaaagccaccaaacgcccatcgcggtaccgcccacggcgcgcgcccagcaacagcaccgccgccagcgccagccagccccccatggcgtgtaccaccacagacccggcaaagtcg < 6:329176‑M1/1‑1 (MQ=255) gcccagcgccagaaagggaatgctcgatggcgcaaaagccaccaaacgcccatcgcggtaccgcccacggcgcgcgcccagcaacagcaccgccgccagcgccagccagccccccatggcgtgtaccaccacagacccggcaaagtcGt > 8:7637‑M1/148‑149 (MQ=255) gcccagcgccagaaagggaatgctcgatggcgcaaaagccaccaaacgcccatcgcggtaccgcccacggcgcgcgcccagcaacagcaccgccgccagcgccagccagccccccatggcgtgtaccaccacagacccggcaaagtcGt > 3:42398‑M1/148‑149 (MQ=255) cccagcgccagaaagggaatgctcgatggcgcaaaagccaccaaacgcccatcgcggtaccgcccacggcgcgcgcccagcaacagcaccgccgccagcgccagccagccccccatggcgtgtaccaccacagacccggcaaagtcGTg > 5:166631‑M1/147‑149 (MQ=255) cAAGTGTTTCTTCCTGCTGACCTTCGCGGCGGCGATTCCGGCGATCATCTCCGGGGGCATTGCCGAGCGGGCGC‑GGTTCGTGCCGCAGTTGTGCGCTACGGCGTTGATCGTGGCGTTCGTCTATCCGTTCTTCGAGGGtgtggtgtgg > 4:225504/1‑148 (MQ=255) cAAGTGTTTCTTCCTGCTGACCTTCGCGGCGGCGATTCCGGCGATCATCTCCGGGGGCATTGCCGAGCGGGCGC‑GGTTCGTGCCGCAGTTGTGCGCTACGGCGTTGATCGTGGCGTTCGTCTATCCGTTCTTCGAGGGtgtggtgtgg > 4:221171/1‑148 (MQ=255) cagcgccagaaagggaatgctcgatggcgcaaaagccaccaaacgcccatcgcggtaccgcccacggcgcgcgcccagcaacagcaccgccgccagcgccagccagccccccatggcgtgtaccaccacagacccggcaaagtcGTgg < 7:171403‑M1/4‑1 (MQ=255) cagcgccagaaagggaatgctcgatggcgcaaaagccaccaaacgcccatcgcggtaccgcccacggcgcgcgcccagcaacagcaccgccgccagcgccagccagccccccatggcgtgtaccaccacagacccggcaaagtcGTgg < 4:303592‑M1/4‑1 (MQ=255) cagcgccagaaagggaatgctcgatggcgcaaaagccaccaaacgcccatcgcggtaccgcccacggcgcgcgcccagcaacagcaccgccgccagcgccagccagccccccatggcgtgtaccaccacagacccggcaaagtcGTgg < 2:292829‑M1/4‑1 (MQ=255) aaGTGTTTCTTCCTGCTGACCTTCGCGGCGGCGATTCCGGCGATCATCTCCGGGGGCATTGCCGAGCGGGCGC‑GGTTCGTGCCGCAGTTGTGCGCTACGGCGTTGATCGTGGCGTTCGTCTATCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGaa > 2:269807/1‑149 (MQ=255) gtgtTTCTTCCTGCTGACCTTCGCGGCGGCGATTCCGGCGATCATCTCCGGGGGCATTGCCGAGCGGGCGC‑GGTTCGTGCCGCAGTTGTGCGCTACGGCGTTGATCGTGGCGTTCGTCTATCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACg < 4:314249/149‑1 (MQ=255) tttCTTCCTGCTGACCTTCGCGGCGGCGATTCCGGCGATCATCTCCGGGGGCATTGCCGAGCGGGCGC‑GGTTCGTGCCGCAGTTGTGCGCTACGGCGTTGATCGTGGCGTTCGTCTATCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGt > 2:312318/1‑148 (MQ=255) gaaagggaatgctcgatggcgcaaaagccaccaaacgcccatcgcggtaccgcccacggcgcgcgcccagcaacagcaccgccgccagcgccagccagccccccatggcgtgtaccaccacagacccggcaaagtcGTGGAACGGTaa < 4:187600‑M1/12‑1 (MQ=255) ttcCTGCTGACCTTCGCGGCGGCGATTCCGGCGATCATCTCCGGGGGCATTGCCGAGCGGGCGC‑GGTTCGTGCCGCAGTTGTGCGCTACGGCGTTGATCGTGGCGTTCGTCTATCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAATCt > 3:113348/1‑149 (MQ=255) ttcCTGCTGACCTTCGCGGCGGCGATTCCGGCGATCATCTCCGGGGGCATTGCCGAGCGGGCGC‑GGTTCGTGCCGCAGTTGTGCGCTACGGCGTTGATCGTGGCGTTCGTCTATCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAATCt < 3:124513/149‑1 (MQ=255) tgctgACCTTCGCGGCGGCGATTCCGGCGATCATCTCCGGGGGCATTGCCGAGCGGGCGC‑GGTTCGTGCCGCAGTTGTGCGCTACGGCGTTGATCGTGGCGTTCGTCTATCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACg > 7:254656/1‑138 (MQ=255) tgctgACCTTCGCGGCGGCGATTCCGGCGATCATCTCCGGGGGCATTGCCGAGCGGGCGC‑GGTTCGTGCCGCAGTTGTGCGCTACGGCGTTGATCGTGGCGTTCGTCTATCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACg < 8:254656/138‑1 (MQ=255) ctgACCTTCGCGGCGGCGATTCCGGCGATCATCTCCGGGGGCATTGCCGAGCGGGCGC‑GGTTCGTGCCGCAGTTGTGCGCTACGGCGTTGATCGTGGCGTTCGTCTATCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAATCTGGGcc > 1:248909/1‑148 (MQ=255) ctgACCTTCGCGGCGGCGATTCCGGCGATCATCTCCGGGGGCATTGCCGAGCGGGCGC‑GGTTCGTGCCGCAGTTGTGCGCTACGGCGTTGATCGTGGCGTTCGTCTATCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAATCTGGGc < 4:246536/147‑1 (MQ=255) ccTTCGCGGCGGCGATTCCGGCGATCATCTCCGGGGGCATTGCCGAGCGGGCGC‑GGTTCGTGCCGCAGTTGTGCGCTACGGCGTTGATCGTGGCGTTCGTCTATCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAATCTGGGCCTACAg > 4:216115/1‑149 (MQ=255) cTTCGCGGCGGCGATTCCGGCGATCATCTCCGGGGGCATTGCCGAGCGGGCGCGGGTTCGTGCCGCAGTTGTGCGCTACGGCGTTGATCGTGGCGTTCGTCTATCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAATCTGGGCCTACAg > 1:259341/1‑149 (MQ=255) ttCGCGGCGGCGATTCCGGCGATCATCTCCGGGGGCATTGCCGAGCGGGCGC‑GGTTCGTGCCGCAGTTGTGCGCTACGGCGTTGATCGTGGCGTTCGTCTATCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAATCTGGGCCTACAGGc > 4:22857/1‑149 (MQ=255) cgatggcgcaaaagccaccaaacgcccatcgcggtaccgcccacggcgcgcgcccagcaacagcaccgccgccagcgccagccagccccccatggcgtgtaccaccacagacccggcaaagtcGt > 3:321759‑M1/124‑125 (MQ=255) cgatggcgcaaaagccaccaaacgcccatcgcggtaccgcccacggcgcgcgcccagcaacagcaccgccgccagcgccagccagccccccatggcgtgtaccaccacagacccggcaaagtcGt < 4:321759‑M1/2‑1 (MQ=255) cggcggcgATTCCGGCGATCATCTCCGGGGGCATTGCCGAGCGGGCGC‑GGTTCGTGCCGCAGTTGTGCGCTACGGCGTTGATCGTGGCGTTCGTCTATCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAATCTGGGCCTACAGGCTTgg < 1:269807/149‑1 (MQ=255) gcaaaagccaccaaacgcccatcgcggtaccgcccacagcgcgcgcccagcaacagcaccgccgccagcgccagccagccccccatggcgtgtaccaccacagacccggcaaagtcGTGGAACGGTAATCTGGGCCTACAGGCTTGGCt < 4:92155‑M1/33‑1 (MQ=255) gATCATCTCCGGGGGCATTGCCGAGCGGGCGC‑GGTTCGTGCCGCAGTTGTGCGCTACGGCGTTGATCGTGGCGTTCGTCTATCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAATCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCg < 3:216115/149‑1 (MQ=255) atcTCCGGGGGCATTGCCGAGCGGGCGC‑GGTTCGTGCCGCAGTTGTGCGCTACGGCGTTGATCGTGGCGTTCGTCTATCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAGCGGTAATCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGgcgc > 8:120572/1‑149 (MQ=255) tcCGGGGGCATTGCCGAGCGGGCGC‑GGTTCGTGCCGCAGTTGTGCGCTACGGCGTTGATCGTGGCGTTCGTCTATCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAATCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCAcc > 5:104415/1‑149 (MQ=255) ggCATTGCCGAGCGGGCGC‑GGTTCGTGCCGCAGTTGTGCGCTACGGCGTTGATCGTGGCGTTCGTCTATCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAATCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCa > 3:297367/1‑149 (MQ=255) ccgcccacagcgcgcgcccagcaacagcaccgccgccagcgccagccagccccccatggcgtgtaccaccacagacccggcaaagtcGTGGAACGGTAATCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCAc > 3:92155‑M1/88‑148 (MQ=255) ttGCCGAGCGGGCGC‑GGTTCGTGCCGCAGTTGTGCGCTACGGCGTTGATCGTGGCGTTCGTCTATCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAATCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGa < 7:141902/148‑1 (MQ=255) ttGCCGAGCGGGCGC‑GGTTCGTGCCGCAGTTGTGCGCTACGGCGTTGATCGTGGCGTTCGTCTATCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAATCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGATCCACGa > 8:141902/1‑148 (MQ=255) cgcccacggcgcgcgcccagcaacagcaccgccgccagcgccagccagccccccatggcgtgtaccaccacagacccggcaaagtcGTGGAACGGTAATCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGa > 3:187600‑M1/87‑149 (MQ=255) gggCGC‑GGTTCGTGCCGCAGTTGTGCGCTACGGCGTTGATCGTGGCGTTCGTCTATCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAATCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCggg < 3:225504/149‑1 (MQ=255) gggCGC‑GGTTCGTGCCGCAGTTGTGCGCTACGGCGTTGATCGTGGCGTTCGTCTATCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAATCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCggg < 3:221171/149‑1 (MQ=255) ggCGC‑GGTTCGTGCCGCAGTTGTGCGCTACGGCGTTGATCGTGGCGTTCGTCTATCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAATCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGt < 4:297367/149‑1 (MQ=255) gcgcgcccagcaacagcaccgccgccagcgccagccagccccccatggcgtgtaccaccacagacccggcaaagtcGTGGAACGGTAATCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCAc > 7:184536‑M1/77‑137 (MQ=255) gcgcgcccagcaacagcaccgccgccagcgccagccagccccccatggcgtgtaccaccacagacccggcaaagtcGTGGAACGGTAATCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCAc < 8:184536‑M1/61‑1 (MQ=255) gcgc‑GGTTCGTGCCGCAGTTGTGCGCTACGGCGTTGATCGTGGCGTTCGTCTATCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAATCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTc > 3:168575/1‑149 (MQ=255) ggTTCGTGCCGCAGTTGTTCGCTACGGCGTTGATCGTGGCGTTCGTCTATCCGTTCTTCGAGGGTGGGGTGTGGAACGGTAATCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGt < 7:130853/144‑1 (MQ=255) ggTTCGTGCCGCAGTTGTGCGCTACGGCGTTGATCGTGGCGTTCGTCTATCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAATCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCtgtg < 3:142636/149‑1 (MQ=255) ggTTCGTGCAGCAGTTGTGCGCTGCGGAGTTTATAGTGGCGTTCGTCGATCCGTTCTTCGAGTGTGTGGTGTGGAACGGTAATCTTGGCCTACATGCATGGCTGCAGGCACGCTTCGCCGCCGCGTTCCAAGACTTTTCCGGGtaaga > 8:130853/1‑144 (MQ=255) cGTGCCGCAGTTGTGCGCTACGGCGTTGATCGTGGCGTTCGTCTATCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAATCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTgtggtg < 4:121777/148‑1 (MQ=255) cGTGCCGCAGTTGTGCGCTACGGCGTTGATCGTGGCGTTCGTCTATCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAATCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTgtggtg < 1:312318/148‑1 (MQ=255) cGTGCCGCAGTTGTGCGCTACGGCGTTGATCGTGGCGTTCGTCTATCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAATCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTgtggtg < 8:31920/148‑1 (MQ=255) gTGCCGCAGTTGTGCGCTACGGCGTTGATCGTGGCGTTCGTCTATCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAATCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGtggtgg < 2:102788/148‑1 (MQ=255) cGCAGTTGTGCGCTACGGCGTTGATCGTGGCGTTCGTCTATCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAATCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTacac < 4:168575/149‑1 (MQ=255) cAGTTGTGCGCTACGGCGTTGATCGTGGCGTTCGTCTATCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAATCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGc > 5:146210/1‑149 (MQ=255) cAGTTGTGCGCTACGGCGTTGATCGTGGCGTACGTCTATCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAATCTGTGCCTACAGTCTTGGCTGCATGCACGATTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGc > 4:35729/1‑149 (MQ=255) gcgcTACGGCGTTGATCGTGGCGTTCGTCTATCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAATCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCCATgggg > 5:47239/1‑149 (MQ=255) cTACGGCGTTGATCGTGGCGTTCGTCTATCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAATCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCCATGGGGggc < 2:15765/149‑1 (MQ=255) tACGGCGTTGATCGTGGCGTTCGTCTATCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAATCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGc < 8:125773/117‑1 (MQ=255) tACGGCGTTGATCGTGGCGTTCGTCTATCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAATCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGc > 7:125773/1‑117 (MQ=255) gTTGATCGTGGCGTTCGTCTATCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAATCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCCATGGGGGGctggctgg < 2:248909/149‑1 (MQ=255) tCGTGGCGTTCGTCTATCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGTACGGTAATCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCCATGGGGggctgg < 1:305054/140‑1 (MQ=255) ggCGTTCGTCTATCCGTTCTTCGAGGGTGGGCTGTGGAACGGTAATCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCCATGGGGGGCTGGCTGGCGCTggcgg < 8:298747/149‑1 (MQ=255) gTTCGTCTATCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAATCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCCATGGTGGGCTGGCTGGCGCAGGcggggg > 4:25083/1‑149 (MQ=255) cGTCTATCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAATCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCCATGGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGc > 8:171403/1‑149 (MQ=255) tCTATCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAATCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCCATGGGGGGCTGGCTGGCGCTGGcggcgg < 1:187636/144‑1 (MQ=255) tCTATCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAATCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCCATGGGGGGCTGGCTGGCGCTGGcggcgg > 2:187636/1‑144 (MQ=255) aTCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAATCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTgtggtg < 4:239941/104‑1 (MQ=255) aTCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAATCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTgtggtg > 3:239941/1‑104 (MQ=255) aTCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAATCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCCATGGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTTg > 2:88389/1‑149 (MQ=255) tCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAATCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCCATGGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTTGc < 3:75945/149‑1 (MQ=255) tCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAATCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCCATGGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTTGc > 4:75945/1‑149 (MQ=255) cGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAATCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCCATGGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTTGCTg < 6:47239/149‑1 (MQ=255) gTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAATCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCCATGGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTTGCTgg < 4:113348/149‑1 (MQ=255) gTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAATCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCCATGGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTTGCTgg > 6:150797/1‑149 (MQ=255) ttcGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAATCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCCATGGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTTGCTGGgcgc > 4:219569/1‑149 (MQ=255) ttcGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAATCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCCATGGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTTGCTGGgcgc > 3:111417/1‑149 (MQ=255) cGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAATCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCCATGGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTTGCTGGgcgcgc > 6:37376/1‑149 (MQ=255) gAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAATCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCCATGGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTTGc < 7:305594/139‑1 (MQ=255) gAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAATCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCCATGGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTTGc > 8:305594/1‑139 (MQ=255) gtgtggtgtgGACCGGTAATCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCCATGGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTTGCTGGGCGCGCGCCGt < 7:120572/149‑1 (MQ=255) gtggtgtggAACGGTAATCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCCATGGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTTg > 7:51486/1‑132 (MQ=255) gtggtgtggAACGGTAATCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCCATGGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTTg < 8:51486/132‑1 (MQ=255) tggtgtggAACGGTAATCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCCATGGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTTGCTGGGCGCGCGCCGTggg < 5:150797/149‑1 (MQ=255) tggtgtggAACGGTAATCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCCATGGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTTGCTGGGCGCGCGCCGTggg < 4:111417/149‑1 (MQ=255) | GGTCAAGTGTTTCTTCCTGCTGACCTTCGCGGCGGCGATTCCGGCGATCATCTCCGGGGGCATTGCCGAGCGGGCGC‑GGTTCGTGCCGCAGTTGTGCGCTACGGCGTTGATCGTGGCGTTCGTCTATCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAATCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCCATGGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTTGCTGGGCGCGCGCCGTGGG > NC_002947/2403652‑2403943 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |