New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2491753 = | 39 (0.720) | 4 (0.080) | 4/250 | NT | 8.9% | coding (1176/2883 nt) | PP_2185 | formate dehydrogenase subunit alpha |
? | NC_002947 | 2491796 = | 45 (0.880) | coding (1219/2883 nt) | PP_2185 | formate dehydrogenase subunit alpha |
TCACCTCCAGCCGCTGTACCAACGAAGAAGCCTATCTGGTGCAGAAACTGGTGCGCACGGCCTTCGGTAACAACAACGTCGACACCTGCGCACGGGTATGCCATTCGCCCACCGGTTATGGCCTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATTGGCGCCAACCCCACCGATGCGCACCCGGTGTTCGGCTCGCAACTCAAGCGCCGCCTGCGCCAAGGGGCGCG > NC_002947/2491611‑2491881 | tCACCTCCAGCCGCTGTACCAACGAAGAAGCCTATCTGGTGCAGAAACTGGTGCGCACGGCCTTCGGTAACAACAACGTCGACACCTGCGCACGGGTATGCCATTCGCCCACCGGTTATGGCCTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTcggcc > 6:119688/1‑149 (MQ=255) cgcgggcgtgcggcgagtcgaccaggtcgatacgccgtgggtcgaccacgatcagccgcgccccttggcgcaggcggcgcttgagttgcgagccgaacaccgggtgcgcatcggtggggttggcgccaatcaccagcacaacGTcggcc < 3:13036‑M1/7‑1 (MQ=255) aCCTCCAGCCGCTGTACCAACGAAGAAGCCTATCTGGTGCAGAAACTGGTGCGCACGGCCTTCGGTAACAACAACGTCGACACCTGCGCACGGGTATGCCATTCGCCCACCGGTTATGGCCTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTcggccgg > 3:52462/1‑149 (MQ=255) ccTCCAGCCGCTGTACCAACGAAGAAGCCTATCTGGTGCAGAAACTGGTGCGCACGGCCTTCGGTAACAACAACGTCGACACCTGCGCACGGGTATGCCATTCGCCCACCGGTTATGGCCTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTcggccggc < 6:283809/149‑1 (MQ=255) cGCTGTACCAACGAAGAAGCCTATCTGGTGCAGAAACTGGTGCGCACGGCCTTCGGTAACAACAACGTCGACACCTGCGCACGGGTATGCCATTCGCCCACCGGTTATGGCCTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAg < 6:304270/149‑1 (MQ=255) tcgaccaggtcgatacgccgtgggtcgatcacgatcagccgcgccccttggcgcaggcggcgcttgagttgcgagccgaacaccgggtgcgcatcggtggggttggcgccaatcaccagcacaacGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGa < 6:261999‑M1/24‑1 (MQ=255) cAACGAAGAAGCCTATCTGGTGCAGAAACTGGTGCGCACGGCCTTCGGTAACAACAACGTCGACACCTGCGCACGGGTATGCCATTCGCCCACCGGTTATGGCCTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACt > 1:86980/1‑149 (MQ=255) aCGAAGAAGCCTATCTGGTGCAGAAACTGGTGCGCACGGCCTTCGGTAACAACAACGTCGACACCTGCGCACGGGTATGCCATTCGCCCACCGGTTATGGCCTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCg < 3:273447/149‑1 (MQ=255) gatcacgatcagccgcgccccttggcgcaggcggcgcttgagttgcgagccgaacaccgggtgcgcatcggtggggttggcgccaatcaccagcacaacGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTtgtg > 5:261999‑M1/100‑148 (MQ=255) aaaCTGGTGCGCACGGCCTTCGGTAACAACAACGTCGACACCTGCGCACGGGTATGCCATTCGCCCACCGGTTATGGCCTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCt > 2:48970/1‑149 (MQ=255) aCTGGTGCGCACGGCCTTCGGTAACAACAACGTCGACACCTGCGCACGGGTATGCCATTCGCCCACCGGTTATGGCCTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTgg < 4:52462/149‑1 (MQ=255) cTGGTGCGCACGGCCTTCGGTAACAACAACGTCGACACCTGCGCACGGGTATGCCATTCGCCCACCGGTTATGGCCTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGt < 2:195146/149‑1 (MQ=255) tcagccgcgccccttggcgcaggcggcgcttgagttgcgagccgaacaccgggtgcgcatcggtggggttggcgccaatcaccagcacaacGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCg < 6:15511‑M1/41‑1 (MQ=255) tcagccgcgccccttggcgcaggcggcgcttgagttgcgagccgaacaccgggtgcgcatcggtggggttggcgccaatcaccagcacaacGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCg > 5:15511‑M1/92‑132 (MQ=255) gcACGGCCTTCGGTAACAACAACGTCGACACCTGCGCACGGGTATGCCATTCGCCCACCGGTTATGGCCTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGTTGGTGATTGgc > 4:15082/1‑149 (MQ=255) gcACGGCCTTCGGTAACAACAACGTCGACACCTGCGCACGGGTATGCCATTCGCCCACCGGTTATGGCCTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATTGgc < 4:19619/149‑1 (MQ=255) gcACGGCCTTCGGTAACAACAACGTCGACACCTGCGCACGGGTATGCCATTCGCCCACCGGTTATGGCCTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATTGgc > 8:222720/1‑149 (MQ=255) ggCCTTCGGTAACAACAACGTCGACACCTGCGCACGGGTATGCCATTCGCCCACCGGTTATGGCCTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATTGGCGcc > 4:13036/1‑148 (MQ=255) gCCTTCGGTAACAACAACGTCGACACCTGCGCACGGGTATGCCATTCGCCCACCGGTTATGGCCTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATTGGCGCCaa < 8:201218/149‑1 (MQ=255) tCGGTAACAACAACGTCGACACCTGCGCACGGGTATGCCATTCGCCCACCGGTTATGGCCTGAAGCAGACTCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATTGGCGCCAAccc > 7:48246/1‑148 (MQ=255) acaacaacGTCGACACCTGCGCACGGGTATGCCATTCGCCCACCGGTTATGGCCTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATTGGCGCCAACCCCACCGAt < 5:119688/149‑1 (MQ=255) caacaacGTCGACACCTGCGCACGGGTATGCCATTCGCCCACCGGTTATGGCCTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATTGGCGcc > 4:135892/1‑136 (MQ=255) caacaacGTCGACACCTGCGCACGGGTATGCCATTCGCCCACCGGTTATGGCCTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATTGGCGcc < 3:135892/136‑1 (MQ=255) acaacGTCGACACCTGCGCACGGGTATGCCATTCGCCCACCGGTTATGGCCTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATTGGCGCCAACCCCACCGATgcg < 2:86980/149‑1 (MQ=255) caacGTCGACACCTGCGCACGGGTATGCCATTCGCCCACCGGTTATGGCCTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATTGGCGCCAACCCCACCGATgcg > 6:266005/1‑148 (MQ=255) cGTCGACACCTGCGCACGGGTATGCCATTCGCCCACCGGTTATGGCCTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATTGGCGCCAACCCCACCGATGCGCAcc < 1:48970/149‑1 (MQ=255) tCGACACCTGCGCACGGGTATGCCATTCGCCCACCGGTTATGGCCTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATTGGCGCCAACCCCACCGATGCGCACCCg > 5:88516/1‑149 (MQ=255) tCGACACCTGCGCACGGGTATGCCATTCGCCCACCGGTTATGGCCTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATTGGCGCCAACCCCACCGATGCGCACCCg < 3:109078/149‑1 (MQ=255) tCGACACCTGCGCACGGGTATGCCATTCGCCCACCGGTTATGGCCTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATTGGCGCCAACCCCACCGATGCGCACACg > 7:124816/1‑149 (MQ=255) tCGACACCTGCCCACGGGGATGCCATTCGCCCACCGGTTATGGCCTGAAGCAGACCCTGGGGGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATTGGCGCCAACCCCACCGATGCGCACCCg < 5:9196/149‑1 (MQ=255) gACACCTGCGCACGGGTATGCCATTCGCCCACCGGTTATGGCCTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGTCCGACGTTGTGCTGGTGATTGGCGCCAACCCCACCGATGCGCACCCGgt > 4:19480/1‑149 (MQ=255) gcACGGGTATGCCATTCGCCCACCGGTTATGGCCTGAAGCAGACCCTGGGTGCGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATTGGCGCCAACCCCACCGATGCGCACCCGGTGTTCGGCTc > 1:259412/1‑149 (MQ=255) aTTCGCCCACCGGTTATGGCCTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATTGGCGCCAACCCCACCGATGCGCACCCGGTGTTCGGCTCGCAACTCAAgcgc > 3:96777/1‑149 (MQ=255) aTTCGCCCACCGGTTATGGCCTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATTGGCGCCAACCCCACCGATGCGCACCCGGTGTTCGGCTCGCAACTCAAgcgc > 8:111945/1‑149 (MQ=255) ccACCGGTTATGGCCTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATTGGCGCCAACCCCACCGATGCGCACCCGGTGTTCGGCTCGCAACTCAAGCGCCGCCTg > 3:292200/1‑149 (MQ=255) cACCGGTTATGGCCTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATTGGCGCCAACCCCACCGATGCGCACCCGGTGTTCGGCTCGCACCTCAAGCGCCGCCTgc > 8:242313/1‑149 (MQ=255) cACCGGTTATGGCCTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATTGGCGCCAACCCCACCGATGCGCACCCGGTGTTCGGCTCGCAACTCAAGCGCCGCCTgc > 2:17616/1‑149 (MQ=255) ccGGTTATGGCCTGAAGCAGACTCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATTGGCGCCAACCCCACCGATGCGCACCCGGTGTTCGGCTCGCAACTCAAGCGCCGCCTgcgc < 8:48246/149‑1 (MQ=255) cGGTTATGGCCTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATTGGCGCCAACCCCACCGATGCGCACCCGGTGTTCGGCTCGCAACTCAAGCGCCGCCTGCGcc < 3:19480/149‑1 (MQ=255) ttATGGCCTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATTGGCGCCAACCCCACCGATGCGCACCCGGTGTTCGGCTCGCAACTCAAGCGCCGCCTGCGCCAAg < 7:111945/149‑1 (MQ=255) aTGGCCTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATTGGCGCCAACCCCACCGATGCGCACCCGGTGTTCGGCTCGCAACTCAAGCGCCGCCTGCGCCAAggg > 5:324172/1‑149 (MQ=255) gCCTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATTGGCGCCAACCCCACCGATGCGCACCCGGTGTTCGGCTCGCAACTCAAGCGCCGCCTGCGCCAAGGGgcg > 4:37916/1‑149 (MQ=255) cTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGTTGGTGATTGGCGCCAACCCCACCGATGCGCACCCGGTGTTCGGCTCGCAACTCAAGCGCCGCCTGCGCCAAGGGGcgcg < 3:15082/149‑1 (MQ=255) gCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATTGGCGCCAACCCCACCGATGCGCACCCGGTGTTCGGCTCGCAACTCAAGCGCCGCCTgc > 5:15688/1‑131 (MQ=255) | TCACCTCCAGCCGCTGTACCAACGAAGAAGCCTATCTGGTGCAGAAACTGGTGCGCACGGCCTTCGGTAACAACAACGTCGACACCTGCGCACGGGTATGCCATTCGCCCACCGGTTATGGCCTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATTGGCGCCAACCCCACCGATGCGCACCCGGTGTTCGGCTCGCAACTCAAGCGCCGCCTGCGCCAAGGGGCGCG > NC_002947/2491611‑2491881 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |