New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2828149 = | 36 (0.670) | 3 (0.060) | 3/258 | NT | 7.8% | coding (325/1209 nt) | PP_2480 | xanthine dehydrogenase accessory factor |
? | NC_002947 | 2828206 = | 36 (0.680) | coding (382/1209 nt) | PP_2480 | xanthine dehydrogenase accessory factor |
GCGGAAGTGGCGAAAAAGGCTTGGTGGCTGACCGAAGCCGGGCCGGCGCTGCGCAGCTACAGCACCGCAGAGGCGGATGACGCCAGCGAGGAAGCGCTGAGCTTCGGCCTGGGCTGTAACGGCAAGGTTCACGTGCTGTTCGAGCGCCTGCCGGCCGGCCCTTGCGCCTTGGTCGATGCTTTGCTCAGCGTGCGCGACCGCCAGCAGCCTGCGGCCATCGCCACGGTAATCGTCAGCTCGGGCGCGGCTGCGCCACGCTTAGGCGAGCGTTTGTGCTTGATGCCTGGG > NC_002947/2828002‑2828289 | ctgcaggtcggcgctgatttgctcaaccagcaccgagcgcagcaactcgcccgcggcctcctgcccaggcatcaagcacaaacgctcgcctaagcgtggcgcagccgcgcccgagctgacgattaccgtggcgatggccgcaggctgct < 3:14823‑M1/2‑1 (MQ=255) aaaaaGGCTTGGTGGCTGACCGAAGCCGGGCCGGCGCTGCGCAGCTACAGCACCGCAGAGGCGGATGACGCCAGCGAGGAAGCGCTGAGCTTCGGCCTGGGCTGTAACGGCAAGGTTCACGTGCTGTTCGAGCGCCTGCCGGCCGGccc > 6:101161/1‑149 (MQ=255) tgatttgctcaaccagcaccgagcgcagcaactcgcccgcggcctcctgcccaggcatcaagcacaaacgctcgcctaagcgtggcgcagccgcgcccgagctgacgattaccgtggcgatggccgcaggctgctg > 4:49968‑M1/134‑136 (MQ=255) tgatttgctcaaccagcaccgagcgcagcaactcgcccgcggcctcctgcccaggcatcaagcacaaacgctcgcctaagcgtggcgcagccgcgcccgagctgacgattaccgtggcgatggccgcaggctgctg < 3:49968‑M1/3‑1 (MQ=255) aGGCTTGGTGGCTGACCGAAGCCGGGCCGGCGCTGCGCAGCTACAGCACCGCAGAGGCGGATGACGCCAGCGAGGAAGCGCTGAGCTTCGGCCTGGGCTGTAACGGCAAGGTTCACGTGCTGTTCGAGCGCCTGCCGGCCGGCCCTTgc < 6:103749/149‑1 (MQ=255) cTGACCGAAGCCGGGCCGGCGCTGCGCAGCTACAGCACCGCAGAGGCGGATGACGCCAGCGAGGAAGCGCTGAGCTTCGGCCTGGGCTGTAACGGCAAGGTTCACGTGCTGTTCGAGCGCCTGCCGGCCGGCCCTTGCGCCTTGGTCGa < 8:194378/149‑1 (MQ=255) tGACCGAAGCCGGGCCGGCGCTGCGCAGCTACAGCACCGCAGAGGCGGATGACGCCAGCGAGGAAGCGCTGAGCTTCGGCCTGGGCTGTAACGGCAAGGTTCACGTGCTGTTCGAGCGCCTGCCGGCCGGCCCTTGCGCCTTGGTCGAt > 8:164607/1‑149 (MQ=255) cGAAGCCGGGCCGGCGCTGCGCAGCTACAGCACCGCAGAGGCGGATGACGCCAGCGAGGAAGCGCTGAGCTTCGGCCTGGGCTGTAACGGCAAGGTTCACGTGCTGTTCGAGCGCCTGCCGGCCGGCCCTTGCGCCTTGGTCGATGCtt < 5:101161/149‑1 (MQ=255) cGAAGCCGGGCCGGCGCTGCGCAGCTACAGCACCGCAGAGGCGGATGACGCCAGCGAGGAAGCGCTGAGCTTCGGCCTGGGCTGTAACGGCAAGGTTCACGTGCTGTTCGAGCGCCTGCCGGCCGGCCCTTGCGCCTTGGTCGATGCtt > 7:155176/1‑149 (MQ=255) cGAAGCCGGGCCGGCGCTGCGCAGCTACAGCACCGCAGAGGCGGATGACGCCAGCGAGGAAGCGCTGAGCTTCGGCCTGGGCTGTAACGGCAAGGTTCACGTGCTGTTCGAGCGCCTGCCGGCCGGCCCTTGCGCCTTGGTCGATGCtt > 8:57833/1‑149 (MQ=255) gAAGCCGGGCCGGCGCTGCGCAGCTACAGCACCGCAGAGGCGGATGACGCCAGCGAGGAAGCGCTGAGCTTCGGCCTGGGCTGTAACGGCAAGGTTCACGTGCTGTTCGAGCGCCTGCCGGCCGGCCCTTGCGCCTTGGTCGATGCttt > 5:134897/1‑149 (MQ=255) aaGCCGGGCCGGCGCTGCGCAGCTACAGCACCGCAGAGGCGGATGACGCCAGCGAGGAAGCGCTGAGCTTCGGCCTGGGCTGTAACGGCAAGGTTCACGTGCTGTTCGAGCGCCt < 8:176050/115‑1 (MQ=255) aaGCCGGGCCGGCGCTGCGCAGCTACAGCACCGCAGAGGCGGATGACGCCAGCGAGGAAGCGCTGAGCTTCGGCCTGGGCTGTAACGGCAAGGTTCACGTGCTGTTCGAGCGCCt > 7:176050/1‑115 (MQ=255) aaGCCGGGCCGGCGCTGCGCAGCTACAGCACCGCAGAGGCGGATGACGCCAGCGAGGAAGCGCTGAGCTTCGGCCTGGGCTGTAACGGCAAGGTTCACGTGCTGTTCGAGCGCCTGCCGGCCGGCCCTTGCGCCTTGGTCGATGCTTTg > 5:105112/1‑149 (MQ=255) gccgggccggCGCTGCGCAGCTACAGCACCGCAGAGGCGGATGACGCCAGCGAGGAAGCGCTGAGCTTCGGCCTGGGCTGTAACGGCAAGGTTCACGTGCTGTTCGAGCGCCTGCCGGCCGGCCCTTGCGCCTTGGTCGATGCTTTGCt > 1:192291/1‑149 (MQ=255) ggccggCGCTGCGCAGCTACAGCACCGCAGAGGCGGATGACGCCAGCGAGGAAGCGCTGAGCTTCGGCCTGGGCTGTAACGGCAAGGTTCACGTGCTGTTCGAGCGCCTGCCGGCCGGCCCTTGCGCCTTGGTCGATGCTTTGCTCAGc < 4:99126/149‑1 (MQ=255) cggCGCTGCGCAGCTACAGCACAGCAGAGGCGGATGACGCCAGCGAGGAAGCGCTGAGCTTCGGACTGGGCTGTAACGGCAAGGTTCACGTGCTGTTCGAGCGCCTGCCGGCCGGACCTTGCGCCTTGGTCGATGCTTTGCTCAGCGTg > 8:259997/1‑149 (MQ=255) cgcTGCGCAGCTACAGCACCGCAGAGGCGGATGACGCCAGCGAGGAAGCGCTGAGCTTCGGCCTGGGCTGTAACGGCAAGGTTCACGTGCTGTTCGAGCGCCTGCCGGCCGGCCCTTGCGCCTTGGTCGATGCTTTGCTCAGCGTgcgc < 8:300172/149‑1 (MQ=255) cccgcggcctcctgcccaggcatcaagcacaaacgctcgcctaagcgtggcgcagccgcgcccgagctgacgattaccgtggcgatggccgcaggctgCTGCCGGCCGGCCCTTGCGCCTTGGTCGATGCTTTGCTCAGCGTGCGCGAc < 1:315698‑M1/51‑1 (MQ=255) cctcctgcccaggcatcaagcacaaacgctcgcctaagcgtggcgcagccgcgcccgagctgacgattaccgtggcgatggccgcaggctgCTGCCGGCCGGCCCTTGCGCCTTGGTCGATGCTTTGCTCAGCGTGCGCGACCGCcagc > 4:315595‑M1/92‑149 (MQ=255) cAGCACCGCAGAGGCGGATGACGCCAGCGAGGAAGCGCTGAGCTTCGGCCTGGGCTGTAACGGCAAGGTTCACGTGCTGTTCGAGCGCCTGCCGGCCGGCCCTTGCGCCTTGGTCGATGCTTTGCTCAGCGTGCGCGACCGCcagca < 8:155176/147‑1 (MQ=255) cAGCACCGCAGAGGCGGATGACGCCAGCGAGGAAGCGCTGAGCTTCGGCCTGGGCTGTAACGGCAAGGTTCACGTGCTGTTCGAGCGCCTGCCGGCCGGCCCTTGCGCCTTGGTCGATGCTTTGCTCAGCGTGCGCGACCGCcagca < 6:63098/147‑1 (MQ=255) ctgcccaggcatcaagcacaaacgctcgcctaagcgtggcgcagccgcgcccgagctgacgattaccgtggcgatggccgcaggctgCTGCCGGCCGGCCCTTGCGCCTTGGTCGATGCTTTGCTCAGCGTGCGCGACCGCcagcag > 2:315698‑M1/88‑147 (MQ=255) aGCACCGCAGAGGCGGATGACGCCAGCGAGGAAGCGCTGAGCTTCGGCCTGGGCTGTAACGGCAAGGTTCACGTGCTGTTCGAGCGCCTGCCGGCCGGCCCTTGCGCCTTGGTCGATGCTTTGCTCAGCGTGCGCGACCGCCAGCAGcc > 5:138958/1‑149 (MQ=255) aCCGCAGAGGCGGATGACGCCAGCGAGGAAGCGCTGAGCTTCGGCCTGGGCTGTAACGGCAAGGTTCACGTGCTGTTCGAGCGCCTGCCGGCCGGCCCTTGCGCCTTGGTCGATGCTTTGCTCAGCGTGCGCGACCGCcagc > 4:236959/1‑142 (MQ=255) aCCGCAGAGGCGGATGACGCCAGCGAGGAAGCGCTGAGCTTCGGCCTGGGCTGTAACGGCAAGGTTCACGTGCTGTTCGAGCGCCTGCCGGCCGGCCCTTGCGCCTTGGTCGATGCTTTGCTCAGCGTGCGCGACCGCcagc < 3:236959/142‑1 (MQ=255) cGCAGAGGCGGATGACGCCAGCGAGGAAGCGCTGAGCTTCGGCCTGGGCTGTAACGGCAAGGTTCACGTGCTGTTCGAGCGCCTGCCGGCCGGCCCTTGCGCCTTGGTCGATGCTTTGCTCAGCGTGCGCGACCGCCAGCAGCCTGCgg < 6:105112/149‑1 (MQ=255) agagGCGGATGACGCCAGCGAGGAAGCGCTGAGCTTCGGCCTGGGCTGTAACGGCAAGGTTCACGTGCTGTTCGAGCGCCTGCCGGCCGGCCCTTGCGCCTTGGTCGATGCTTTGCTCAGCGTGCGCGACCGCCAGCAGCCTGCGGCCa > 8:196348/1‑149 (MQ=255) tGACGCCAGCGAGGAAGCGCTGAGCTTCGGCCTGGGCTGTAACGGCAAGGTTCACGTGCTGTTCGAGCGCCTGCCGGCCGGCCCTTGCGCCTTGGTCGATGCTTTGCTCAGCGTGCGCGACCGCCAGCAGCCTGCGGCCATCGCCACgg < 7:204556/149‑1 (MQ=255) gCCAGCGAGGAAGCGCTGAGCTTCGGCCTGGGCTGTAACGGCAAGGTTCACGTGCTGTTCGAGCGCCTGCCGGCCGGCCCTTGCGCCTTGGTCGATGCTTTGCTCAGCGTGCGCGACCGCCAGCAGCCTGCGGCCATCGCCACGGTAAt < 7:164607/149‑1 (MQ=255) gCGAGGAAGCCCTGAGCGTCGGCCTGGGCGGTAACGGCAAGGTTCACGTGCTGTTCGAGCGCCTGCCGGCCGGCCCTTGCGCCTTGGTCGATGCTTTGCTCAGCGTGCGCGACCGCCAGCAGCCTGCGGCCATCGCCACGGTAATCGTc < 8:129679/149‑1 (MQ=255) ccTGAGCTTCGGCCTCGGCTGTAACGGCAACGTTCACCTGCTGTTCGAGCGCCTGCCCGCCCGCCCTTGCGCCTTGGTCGATGCATTGCTCAGCGTGCGAGACCGCCAGCAGCCTGCTGCCATCCCCACGGTAATCGTCAGCTCGGgcg > 6:147967/2‑149 (MQ=255) tCGGCCTGGGCTGTAACGGCAAGGTTCACGTGCTGTTCGAGCGCCTGCCGGCCGGCCCTTGCGCCTTGGTCGATGCTTTGCTCAGCGTGCGCGACCGCCAGCAGCCTGCGGCCATCGCCACGGTAATCGTCAGCTCGGGCGCGGCTgcg > 7:176707/1‑149 (MQ=255) ggCCTGGGCTGTAACGGCAAGGTTCACGTGCTGTTCGAGCGCCTGCCGGCCGGCCCTTGCGCCTTGGTCGATGCTTTGCTCAGCGTGCGCGACCGCCAGCAGCCTGCGGCCATCGCCACGGTAATCGTCAGCTCGGGCGCGGCTGCGcc < 6:138958/149‑1 (MQ=255) ggCTGTAACGGCAAGGTTCACGTGCTGTTCGAGCGCCTGCCGGCCGGCCCTTGCGCCTTGGTCGATGCTTTGCTCAGCGTGCGCTACCGCCAGCAGCCTGCGGCCATCGCCACGGTAATCGTCAGCTCGGGCGCGGCTGCGCCACGc < 7:259997/147‑1 (MQ=255) tGTAACGGCAAGGTTCACGTGCTGTTCGAGCGCCTGCCGGCCGGCCCTTGCGCCTTGGTCGATGCTTTGCTCAGCGTGCGCGACCGCCAGCAGCCTGCGGCCATCGCCACGGTAATCGTCAGCTCGGGCGCGGCTGCGCCACGCTTAgg > 6:98978/1‑149 (MQ=255) tAACGGCAAGGTTCACGTGCTGTTCGAGCGCCTGCCGGCCGGCCCTTGCGCCTTGGTCGATGCTTTGCTCAGCGTGCGCGACCGCCAGCAGCCTGCGGCCATCGCCACGGTAATCGTCAGCTCGGGCGCGGCTGCGCCACGCTTAGGc < 6:134897/148‑1 (MQ=255) aaGGTTCACGTGCTGTTCGAGCGCCTGCCGGCCGGCCCTTGCGCCTTGGTCGATGCTTTGCTCAGCGTGCGCGACCGCCAGCAGCCTGCGGCCATCGCCACGGTAATCGTCAGCTCGGGCGCGGCTGCGCCACGCTTAGGCGAGCGttt > 4:143989/1‑149 (MQ=255) ggTTCACGTGCTGTTCGAGCGCCTGCCGGCCGGCCCTTTCGCCTTGGTCGATGCTTTGCTCAGCGTGCGCGACCGCCAGCAGCCTGCGGCCATCGCCACGGTAATCGTCAGCTCGGGCGCGGCTGCGCCACGCTTAGGCGAGCGTTtgt > 7:50515/1‑149 (MQ=255) tCACGTGCTGTTCGAGCGCCTGCCGGCCGGCCCTTGCGCCTTGGTCGATGCTTTGCTCAGCGTGCGCGACCGCCAGCAGCCTGCGGCCATCGCCACGGTAATCGTCAGCTCGGGCGCGGCTGCGCCACGCTTAGGCGAGCGTTTGTGCt > 7:287372/1‑149 (MQ=255) cACGTGCTGTTCGAGCGCCTGCCGGCCGGCCCTTGCGCCTTGGTCGATGCTTTGCTCAGCGTGCGCGACCGCCAGCAGCCTGCGGCCATCGCCACGGTAATCGTCAGCTCGGGCGCGGCTGCGCCACGCTTAGGCGAGCGTTTGTGCt < 7:196348/148‑1 (MQ=255) tGTTCGAGCGCCTGCCGGCCGGCCCTTGCGCCTTGGTCGATGCTTTGCTCAGCGTGCGCGACCGCCAGCAGCCTGCGGCCATCGCCACGGTAATCGTCAGCTCGGGCGCGGCTGCGCCACGCTTAGGCGAGCGTTTGTGCTTGATGCCt > 2:79610/1‑149 (MQ=255) gTTCGAGCGCCTGCCGGCCGGCCCTTGCGCCTTGGTCGATGCTTTGCTCAGCGTGCGCGACCGCCAGCAGCCTGCGGCCATCGCCACGGTAATCGTCAGCTCGGGCGCGGCTGCGCCACGCTTAGGCGAGCGTTTGTGCTTGATGCCTg > 4:41907/1‑149 (MQ=255) cGAGCGCCTGCCGGCCGGCCCTTGCGCCTTGGTCGATGCTTTGCTCAGCGTGCGCGACCGCCAGCAGCCTGCGGCCATCGCCACGGTAATCGTCAGCTCGGGCGCGGCTGCGCCACGCTTAGGCGAGCGTTTGTGCTTGATGCCTggg > 7:30443/1‑148 (MQ=255) CTGCCGGCCGGCCCTTGCGCCTTGGTCGATGCTTTGCTCAGCGTGCGCGACCGCCAGCAGCCTGCGGCCATCGCCACGGTAATCGTCAGCTCGGGCGCGGCTgcgc > 8:208394‑M1/1‑106 (MQ=255) | GCGGAAGTGGCGAAAAAGGCTTGGTGGCTGACCGAAGCCGGGCCGGCGCTGCGCAGCTACAGCACCGCAGAGGCGGATGACGCCAGCGAGGAAGCGCTGAGCTTCGGCCTGGGCTGTAACGGCAAGGTTCACGTGCTGTTCGAGCGCCTGCCGGCCGGCCCTTGCGCCTTGGTCGATGCTTTGCTCAGCGTGCGCGACCGCCAGCAGCCTGCGGCCATCGCCACGGTAATCGTCAGCTCGGGCGCGGCTGCGCCACGCTTAGGCGAGCGTTTGTGCTTGATGCCTGGG > NC_002947/2828002‑2828289 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |