New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2828149 = | 36 (0.670) | 3 (0.060) | 3/258 | NT | 7.8% | coding (325/1209 nt) | PP_2480 | xanthine dehydrogenase accessory factor |
? | NC_002947 | 2828206 = | 36 (0.680) | coding (382/1209 nt) | PP_2480 | xanthine dehydrogenase accessory factor |
CTACAGCACCGCAGAGGCGGATGACGCCAGCGAGGAAGCGCTGAGCTTCGGCCTGGGCTGTAACGGCAAGGTTCACGTGCTGTTCGAGCGCCTGCCGGCCGGCCCTTGCGCCTTGGTCGATGCTTTGCTCAGCGTGCGCGACCGCCAGCAGCCTGCGGCCATCGCCACGGTAATCGTCAGCTCGGGCGCGGCTGCGCCACGCTTAGGCGAGCGTTTGTGCTTGATGCCTGGGCAGGAGGCCGCGGGCGAGTTGCTGCGCTCGGTGCTGGTTGAGCAAATCAGCGCCGACCTGCAG > NC_002947/2828058‑2828352 | cctcctgcccaggcatcaagcacaaacgctcgcctaagcgtggcgcagccgcgcccgagctgacgattaccgtggcgatggccgcaggctgCTGCCGGCCGGCCCTTGCGCCTTGGTCGATGCTTTGCTCAGCGTGCGCGACCGCcagc > 4:315595‑M1/92‑149 (MQ=255) cAGCACCGCAGAGGCGGATGACGCCAGCGAGGAAGCGCTGAGCTTCGGCCTGGGCTGTAACGGCAAGGTTCACGTGCTGTTCGAGCGCCTGCCGGCCGGCCCTTGCGCCTTGGTCGATGCTTTGCTCAGCGTGCGCGACCGCcagca < 8:155176/147‑1 (MQ=255) cAGCACCGCAGAGGCGGATGACGCCAGCGAGGAAGCGCTGAGCTTCGGCCTGGGCTGTAACGGCAAGGTTCACGTGCTGTTCGAGCGCCTGCCGGCCGGCCCTTGCGCCTTGGTCGATGCTTTGCTCAGCGTGCGCGACCGCcagca < 6:63098/147‑1 (MQ=255) ctgcccaggcatcaagcacaaacgctcgcctaagcgtggcgcagccgcgcccgagctgacgattaccgtggcgatggccgcaggctgCTGCCGGCCGGCCCTTGCGCCTTGGTCGATGCTTTGCTCAGCGTGCGCGACCGCcagcag > 2:315698‑M1/88‑147 (MQ=255) aGCACCGCAGAGGCGGATGACGCCAGCGAGGAAGCGCTGAGCTTCGGCCTGGGCTGTAACGGCAAGGTTCACGTGCTGTTCGAGCGCCTGCCGGCCGGCCCTTGCGCCTTGGTCGATGCTTTGCTCAGCGTGCGCGACCGCCAGCAGcc > 5:138958/1‑149 (MQ=255) aCCGCAGAGGCGGATGACGCCAGCGAGGAAGCGCTGAGCTTCGGCCTGGGCTGTAACGGCAAGGTTCACGTGCTGTTCGAGCGCCTGCCGGCCGGCCCTTGCGCCTTGGTCGATGCTTTGCTCAGCGTGCGCGACCGCcagc < 3:236959/142‑1 (MQ=255) aCCGCAGAGGCGGATGACGCCAGCGAGGAAGCGCTGAGCTTCGGCCTGGGCTGTAACGGCAAGGTTCACGTGCTGTTCGAGCGCCTGCCGGCCGGCCCTTGCGCCTTGGTCGATGCTTTGCTCAGCGTGCGCGACCGCcagc > 4:236959/1‑142 (MQ=255) cGCAGAGGCGGATGACGCCAGCGAGGAAGCGCTGAGCTTCGGCCTGGGCTGTAACGGCAAGGTTCACGTGCTGTTCGAGCGCCTGCCGGCCGGCCCTTGCGCCTTGGTCGATGCTTTGCTCAGCGTGCGCGACCGCCAGCAGCCTGCgg < 6:105112/149‑1 (MQ=255) agagGCGGATGACGCCAGCGAGGAAGCGCTGAGCTTCGGCCTGGGCTGTAACGGCAAGGTTCACGTGCTGTTCGAGCGCCTGCCGGCCGGCCCTTGCGCCTTGGTCGATGCTTTGCTCAGCGTGCGCGACCGCCAGCAGCCTGCGGCCa > 8:196348/1‑149 (MQ=255) tGACGCCAGCGAGGAAGCGCTGAGCTTCGGCCTGGGCTGTAACGGCAAGGTTCACGTGCTGTTCGAGCGCCTGCCGGCCGGCCCTTGCGCCTTGGTCGATGCTTTGCTCAGCGTGCGCGACCGCCAGCAGCCTGCGGCCATCGCCACgg < 7:204556/149‑1 (MQ=255) gCCAGCGAGGAAGCGCTGAGCTTCGGCCTGGGCTGTAACGGCAAGGTTCACGTGCTGTTCGAGCGCCTGCCGGCCGGCCCTTGCGCCTTGGTCGATGCTTTGCTCAGCGTGCGCGACCGCCAGCAGCCTGCGGCCATCGCCACGGTAAt < 7:164607/149‑1 (MQ=255) gCGAGGAAGCCCTGAGCGTCGGCCTGGGCGGTAACGGCAAGGTTCACGTGCTGTTCGAGCGCCTGCCGGCCGGCCCTTGCGCCTTGGTCGATGCTTTGCTCAGCGTGCGCGACCGCCAGCAGCCTGCGGCCATCGCCACGGTAATCGTc < 8:129679/149‑1 (MQ=255) ccTGAGCTTCGGCCTCGGCTGTAACGGCAACGTTCACCTGCTGTTCGAGCGCCTGCCCGCCCGCCCTTGCGCCTTGGTCGATGCATTGCTCAGCGTGCGAGACCGCCAGCAGCCTGCTGCCATCCCCACGGTAATCGTCAGCTCGGgcg > 6:147967/2‑149 (MQ=255) tCGGCCTGGGCTGTAACGGCAAGGTTCACGTGCTGTTCGAGCGCCTGCCGGCCGGCCCTTGCGCCTTGGTCGATGCTTTGCTCAGCGTGCGCGACCGCCAGCAGCCTGCGGCCATCGCCACGGTAATCGTCAGCTCGGGCGCGGCTgcg > 7:176707/1‑149 (MQ=255) ggCCTGGGCTGTAACGGCAAGGTTCACGTGCTGTTCGAGCGCCTGCCGGCCGGCCCTTGCGCCTTGGTCGATGCTTTGCTCAGCGTGCGCGACCGCCAGCAGCCTGCGGCCATCGCCACGGTAATCGTCAGCTCGGGCGCGGCTGCGcc < 6:138958/149‑1 (MQ=255) ggCTGTAACGGCAAGGTTCACGTGCTGTTCGAGCGCCTGCCGGCCGGCCCTTGCGCCTTGGTCGATGCTTTGCTCAGCGTGCGCTACCGCCAGCAGCCTGCGGCCATCGCCACGGTAATCGTCAGCTCGGGCGCGGCTGCGCCACGc < 7:259997/147‑1 (MQ=255) tGTAACGGCAAGGTTCACGTGCTGTTCGAGCGCCTGCCGGCCGGCCCTTGCGCCTTGGTCGATGCTTTGCTCAGCGTGCGCGACCGCCAGCAGCCTGCGGCCATCGCCACGGTAATCGTCAGCTCGGGCGCGGCTGCGCCACGCTTAgg > 6:98978/1‑149 (MQ=255) tAACGGCAAGGTTCACGTGCTGTTCGAGCGCCTGCCGGCCGGCCCTTGCGCCTTGGTCGATGCTTTGCTCAGCGTGCGCGACCGCCAGCAGCCTGCGGCCATCGCCACGGTAATCGTCAGCTCGGGCGCGGCTGCGCCACGCTTAGGc < 6:134897/148‑1 (MQ=255) aaGGTTCACGTGCTGTTCGAGCGCCTGCCGGCCGGCCCTTGCGCCTTGGTCGATGCTTTGCTCAGCGTGCGCGACCGCCAGCAGCCTGCGGCCATCGCCACGGTAATCGTCAGCTCGGGCGCGGCTGCGCCACGCTTAGGCGAGCGttt > 4:143989/1‑149 (MQ=255) ggTTCACGTGCTGTTCGAGCGCCTGCCGGCCGGCCCTTTCGCCTTGGTCGATGCTTTGCTCAGCGTGCGCGACCGCCAGCAGCCTGCGGCCATCGCCACGGTAATCGTCAGCTCGGGCGCGGCTGCGCCACGCTTAGGCGAGCGTTtgt > 7:50515/1‑149 (MQ=255) tCACGTGCTGTTCGAGCGCCTGCCGGCCGGCCCTTGCGCCTTGGTCGATGCTTTGCTCAGCGTGCGCGACCGCCAGCAGCCTGCGGCCATCGCCACGGTAATCGTCAGCTCGGGCGCGGCTGCGCCACGCTTAGGCGAGCGTTTGTGCt > 7:287372/1‑149 (MQ=255) cACGTGCTGTTCGAGCGCCTGCCGGCCGGCCCTTGCGCCTTGGTCGATGCTTTGCTCAGCGTGCGCGACCGCCAGCAGCCTGCGGCCATCGCCACGGTAATCGTCAGCTCGGGCGCGGCTGCGCCACGCTTAGGCGAGCGTTTGTGCt < 7:196348/148‑1 (MQ=255) tGTTCGAGCGCCTGCCGGCCGGCCCTTGCGCCTTGGTCGATGCTTTGCTCAGCGTGCGCGACCGCCAGCAGCCTGCGGCCATCGCCACGGTAATCGTCAGCTCGGGCGCGGCTGCGCCACGCTTAGGCGAGCGTTTGTGCTTGATGCCt > 2:79610/1‑149 (MQ=255) gTTCGAGCGCCTGCCGGCCGGCCCTTGCGCCTTGGTCGATGCTTTGCTCAGCGTGCGCGACCGCCAGCAGCCTGCGGCCATCGCCACGGTAATCGTCAGCTCGGGCGCGGCTGCGCCACGCTTAGGCGAGCGTTTGTGCTTGATGCCTg > 4:41907/1‑149 (MQ=255) cGAGCGCCTGCCGGCCGGCCCTTGCGCCTTGGTCGATGCTTTGCTCAGCGTGCGCGACCGCCAGCAGCCTGCGGCCATCGCCACGGTAATCGTCAGCTCGGGCGCGGCTGCGCCACGCTTAGGCGAGCGTTTGTGCTTGATGCCTggg > 7:30443/1‑148 (MQ=255) ctgctggcggtcgcgcacgctgagcaaagcatcgaccaaggcgcaagggccggccggcagCAGCCTGCGGCCATCGCCACGGTAATCGTCAGCTCGGGCGCGGCTGCGCCACGCTTAGGCGAGCGTTTGTGCTTGATGCCTGGGCag > 2:315698‑M2/61‑147 (MQ=255) gctggcggtcgcgcacgctgagcaaagcatcgaccaaggcgcaagggccggccggcagCAGCCTGCGGCCATCGCCACGGTAATCGTCAGCTCGGGCGCGGCTGCGCCACGCTTAGGCGAGCGTTTGTGCTTGATGCCTGGGCaggagg > 4:315595‑M2/59‑149 (MQ=255) CTGCCGGCCGGCCCTTGCGCCTTGGTCGATGCTTTGCTCAGCGTGCGCGACCGCCAGCAGCCTGCGGCCATCGCCACGGTAATCGTCAGCTCGGGCGCGGCTgcgc > 8:208394‑M1/1‑106 (MQ=255) TGCCGGCCGGCCCTTGCGCCTTGGTCGATGCTTTGCTCAGCGTGCGCGACCGCCAGCAGCCTGCGGCCATCGCCACGGTAATCGTCAGCTCGGGCGCGGCTGCGCCACGCTTAGGCGAGCGTTTGTGCTTGATGCCTGGGCAGGAGGcc < 4:269925‑M1/149‑1 (MQ=255) cggccggcCCTTGCGCCTTGGTCGATGCTTTGCTCAGCGTGCGCGACCGCCAGCAGCCTGCGGCCATCGCCACGGTAATCGTCAGCTCGGGCGCGGCTGCGCCACGCTTAGGCGAGCGTTTGTGCTTGATGCCTGGGCAGGAGGCcgcg > 2:196319/1‑149 (MQ=255) ggccggccCTTGCGCCTTGGTCGATGCTTTGCTCAGCGTGCGCGACCGCCAGCAGCCTGCGGCCATCGCCACGGTAATCGTCAGCTCGGGCGCGGCTGCGCCACGCTTAGGCGAGCGTTTGTGCTTGATGCCTGGGCAGGAGGCCGCgg < 7:57833/149‑1 (MQ=255) gtcgcgcacgctgagcaaagcatcgaccaaggcgcaagggccggccggcagCAGCCTGCGGCCATCGCCACGGTAATCGTCAGCTCGGGCGCGGCTGCGCCACGCTTAGGCGAGCGTTTGTGCTTGATGCCTGGGCAGGAGGCCGCggg < 1:315698‑M2/98‑1 (MQ=255) gccggccCTTGCGCCTTGGTCGATGCTTTGCTCAGCGTGCGCGACCGCCAGCAGCCTGCGGCCATCGCCACGGTAATCGTCAGCTCGGGCGCGGCTGCGCCACGCTTAGGCGAGCGTTTGTGCTTGATGCCTGGGCagga > 8:221269/1‑140 (MQ=255) gccggccCTTGCGCCTTGGTCGATGCTTTGCTCAGCGTGCGCGACCGCCAGCAGCCTGCGGCCATCGCCACGGTAATCGTCAGCTCGGGCGCGGCTGCGCCACGCTTAGGCGAGCGTTTGTGCTTGATGCCTGGGCagga < 7:221269/140‑1 (MQ=255) gccCTTGCGCCTTGGTCGATGCTTTGCTCAGCGTGCGCGACCGCCAGCAGCCTGCGGCCATCGCCACGGTAATCGTCAGCTCGGGCGCGGCTGCGCCACGCTTAGGCGAGCGTTTGTGCTTGATGCCTGGGCAGGAGGCCGCGGGCGAg < 8:176707/149‑1 (MQ=255) cgcCTTGGTCGATGCTTTGCTCAGCGTGCGCGACCGCCAGCAGCCTGCGGCCATCGCCACGGTAATCGTCAGCTCGGGCGCGGCTGCGCCACGCTTAGGCGAGCGTTTGTGCTTGATGCCTGGGCAGGAGGCCGCGGGCGAGTtgctgc < 1:79610/149‑1 (MQ=255) gATGCTTTGCTCAGCGTGCGCGACCGCCAGCAGCCTGCGGCCATCGCCACGGTAATCGTCAGCTCGGGCGCGGCTGCGCCACGCTTAGGCGAGCGTTTGTGCTTGATGCCTGGGCAGGAGGCCGCGGGCGAGTTGCTGCGCTCGGTGCt > 4:14823/1‑149 (MQ=255) tGCTTTGCTCAGCGTGCGTGACCGCCAGCAGCCTGCGGCCTTCGCCACGGTAAGCGTCAGCTCGGGCGCGGCTGCGCCACGCTTAGGCTAGCGTTTGTGCTTGATGCCTGGGCAGGAGGCCGCGGGCGAGTTGCTGCGCTCGTTGCTgg < 5:147967/149‑1 (MQ=255) cTTTGCTCAGCGTGCGCGACCGCCAGCAGCCTGCGGCCATCGCCACGGTAATCGTCAGCTCGGGCGCGGCTGCGCCACGCTTAGGCGAGCGTTTGTGCTTGATGCCTGGGCAGGAGGCCGCGGGCGAGTTGCTGCGCTCGGTGCTGGtt < 5:98978/149‑1 (MQ=255) tttGCTCAGCGTGCGCGACCGCCAGCAGCCTGCGGCCATCGCCACGGTAATCGTCAGCTCGGGCGCGGCTGCGCCACGCTTAGGCGAGCGTTTGTGCTTGATGCCTGGGCAGGAGGCCGCGGGCGAGTTGCTGCGCTCGGTGCTGGtt > 5:277799/1‑148 (MQ=255) tttCCTCAGCGTGCGCGACCGCCACCAGCCAGCGGCCATCGCCACGGTAATCGTCAGCTCGCCCCCGGCTGCGCCACGCTAAGGCGAGCCTTTCTGCTTGATGCCTGGGCAGGAGGCCGCGGGCGAGTTGCTGCGCTCGCTGCTCGtt > 1:198618/1‑148 (MQ=255) aGCGTGCGCGACCGCCAGCAGCCTGCGGCCATCGCCACGGTAATCGTCAGCTCGGGCGCGGCTGCGCCACGCTTAGGCGAGCGTTTGTGCTTGATGCCTGGGCAGGAGGCCGCGGGCGAGTTGCTGCGCTCGGTGCTGGTTGAGCAAAt < 3:269925/149‑1 (MQ=255) aGCGTGCGCGACCGCCAGCAGCCTGCGGCCATCGCCACGGTAATCGTCAGCTCGGGCGCGGCTGCGCCACGCTTAGGCGAGCGTTTGTGCTTGATGCCTGGGCAGGAGGCCGCGGGCGAGTTGCTGCGCTCGGTGCTGGTTGAGCAAAt > 2:110969/1‑149 (MQ=255) aGCGTGCGCGACCGCCAGCAGCCTGCGGCCATCGCCACGGTAATCGTCAGCTCGGGCGCGGCTGCGCCACGCTTAGGCGAGCGTTTGTGCTTGATGCCTGGGCAGGAGGCCGCGGGCGAGTTGCTGCGCTCGGTGCTGGTTGAGCAAAt > 8:24381/1‑149 (MQ=255) gcgACCGCCAGCAGCCTGCGGCCATCGCCACGGTAATCGTCAGCTCGGGCGCGGCTGCGCCACGCTTAGGCGAGCGTTTGTGCTTGATGCCTGGGCAGGAGGCCGCGGGCGAGTTGCTGCGCTCGGTGCTGGTTGAGCAAATCAGCGcc > 5:189506/1‑149 (MQ=255) gcgACCGCCAGCAGCCTGCGGCCATCGCCACGGTAATCGTCAGCTCGGGCGCGGCTGCGCCACGCTTAGGCGAGCGTTTGTGCTTGATGCCTGGGCAGGAGGCCGCGGGCGAGTTGCTGCGCTCGGTGCTGGTTGAGCAAATCAGCGcc > 4:295631/1‑149 (MQ=255) gACCGCCAGCAGCCTGCGGCCATCGCCACGGTAATCGTCAGCTCGGGCGCGGCTGCGCCACGCTTAGGCGAGCGTTTGTGCTTGATGc > 8:215368/1‑88 (MQ=255) gACCGCCAGCAGCCTGCGGCCATCGCCACGGTAATCGTCAGCTCGGGCGCGGCTGCGCCACGCTTAGGCGAGCGTTTGTGCTTGATGCCTGGGCAGGAGGCCGCGGGCGAGTTGCTGCGCTCGGTGCTGGTTGAGCAAATCAGCGCCGa < 8:287372/149‑1 (MQ=255) aCCGCCAGCAGCCTGCGGCCATCGCCACGGTAATCGTCAGCTCGGGCGCGGCTGCGCCACGCTTAGGCGAGCGTTTGTGCTTGATGCCTGGGCAGGAGGCCGCGGGCGAGTTGCTGCGCTCGGTGCTGGTTGAGCAAATCAGCGCCGAc < 2:192291/149‑1 (MQ=255) ccAGCAGCCTGCGGCCATCGCCACGGTAATCGTCAGCTCGGGCGCGGCTGCGCCACGCTTAGGCGAGCGTTTGTGCTTGATGCCTGGGCAGGAGGCCGCGGGCGAGTTGCTGCGCTCGGTGCTGGTTGAGCAAATCAGCGCCGACCTgc < 3:143989/149‑1 (MQ=255) cagCAGCCTGCGGCCATCGCCACGGTAATCGTCAGCTCGGGCGCGGCTGCGCCACGCTTAGGCGAGCGTTTGTGCTTGATGCCTGGGCAGGAGGCCGCGGGCGAGTTGCTGCGCTCGGTGCTGGTTGAGCAAATCa > 4:49968‑M2/4‑136 (MQ=255) cagCAGCCTGCGGCCATCGCCACGGTAATCGTCAGCTCGGGCGCGGCTGCGCCACGCTTAGGCGAGCGTTTGTGCTTGATGCCTGGGCAGGAGGCCGCGGGCGAGTTGCTGCGCTCGGTGCTGGTTGAGCAAATCa < 3:49968‑M2/133‑1 (MQ=255) agCAGCCTGCGGCCATCGCCACGGTAATCGTCAGCTCGGGCGCGGCTGCGCCACGCTTAGGCGAGCGTTTGTGCTTGATGCCTGGGCAGGAGGCCGCGGGCGAGTTGCTGCGCTCGGTGCTGGTTGAGCAAATCAGCGCCGACCTgcag < 3:14823‑M2/147‑1 (MQ=255) | CTACAGCACCGCAGAGGCGGATGACGCCAGCGAGGAAGCGCTGAGCTTCGGCCTGGGCTGTAACGGCAAGGTTCACGTGCTGTTCGAGCGCCTGCCGGCCGGCCCTTGCGCCTTGGTCGATGCTTTGCTCAGCGTGCGCGACCGCCAGCAGCCTGCGGCCATCGCCACGGTAATCGTCAGCTCGGGCGCGGCTGCGCCACGCTTAGGCGAGCGTTTGTGCTTGATGCCTGGGCAGGAGGCCGCGGGCGAGTTGCTGCGCTCGGTGCTGGTTGAGCAAATCAGCGCCGACCTGCAG > NC_002947/2828058‑2828352 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |