New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3184148 = | 51 (0.950) | 4 (0.080) | 4/256 | NT | 8.4% | coding (636/768 nt) | PP_2794 | short‑chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase |
? | NC_002947 | 3184245 = | 38 (0.730) | coding (733/768 nt) | PP_2794 | short‑chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase |
GGCCGGCCTGGCCCACCTGACCCGCGCCATGGCGCTGGAGTTGGCGCGCCATGGTATCCGGGTGAACGCCCTGGCGCCCGGCTACGTGATGACTGATTTGAACGAGGCCTTCCTGGCCAGCGAGGCCGGTGACAAGTTGCGCTCGCGGATCCCCAGCCGCCGCTTCAGCGTGCCGTCGGA‑CCTGGACGGCGCCTTGCT‑GCTGCTCGCCAGCGATGCCGGGCGGGCGATGAGCGGCGCTGAGATCGTGGTCGATGGCGG > NC_002947/3184001‑3184258 | ggccggccTGGCCCACCTGACCCGCGCCATGGCGCTGGAGTTGGCGCGCCATGGTATCCGGGTGAACGCCCTGGCGCCCGGCTACGTGATGACTGATTTGAACGAGGCCTTCCTGGCCAGCGAGGCCGGTGACAAGTTGCGCTCGCGGa > 1:28003/1‑149 (MQ=255) gccggccTGGCCCACCTGACCCGCGCCATGGCGCTGGAGTTGGCGCGCCATGGTATCCGGGTGAACGCCCTGGCGCCCGGCTACGTGATGACTGATTTGAACGAGGCCTTCCTGGCCAGCGAGGCCGGTGACAAGTTGCGCTCGCGGAt > 6:311340/1‑149 (MQ=255) ccTGGCCCACCTGACCCGCGCCATGGCGCTGGAGTTGGCGCGCCATGGTATCCGGGTGAACGCCCTGGCGCCCGGCTACGTGATGACTGATTTGAACGAGGCCTTCCTGGCCAGCGAGGCCGGTGACAAGTTGCGCTCGCGGATccc > 5:175259/1‑147 (MQ=255) gCCCACCTGACCCGCGCCATGGCGCTGGAGTTGGCGCGCCATGGTATCCGGGTGAACGCCCTGGCGCCCGGCTACGTGATGACTGATTTGAACGAGGCCTTCCTGGCCAGCGAGGCCGGTGACAAGTTGCGCTCGCGGATCCCCAgccg > 2:130225/1‑149 (MQ=255) gCCCACCTGACCCGCGCCATGGCGCTGGAGTTGGCGCGCCATGGTATCCGGGTGAACGCCCTGGCGCCCGGCTACGTGATGACTGATTTGAACGAGGCCTTCCTGGCCAGCGAGGCCGGTGACAAGTTGCGCTCGCGGATCCCCAgccg > 6:50802/1‑149 (MQ=255) ccACCTGACCCGCGCCATGGCGCTGGAGTTGGCGCGCCATGGTATCCGGGTGAACGCCCTGGCGCCCGGCTACGTGATGACTGATTTGAACGAGGCCTTCCTGGCCAGCGAGGCCGGTGACAAGTTGCGCTCGCGGATCCCCAgccgcc > 2:70773/1‑149 (MQ=255) ccACCTGACCCGCGCCATGGCGCTGGAGTTGGCGCGCCATGGTATCCGGGTGAACGCCCTGGCGCCCGGCTACGTGATGACTGATTTGAACGAGGCCTTCCTGGCCAGCGAGGCCGGTGACAAGTTGCGCTCGCGGATCCCCAgccgcc < 6:78217/149‑1 (MQ=255) cTGACCCGCGCCATGGCGCTGGAGTTGGCGCGCCATGGTATCCGGGTGAACGCCCTGGCGCCCGGCTACGTGATGACTGATTTGAACGAGGCCTTCCTGGCCAGCGAGGCCGGTGACAAGTTGCGCTCGCGGATCCCCAGCCGCCGCtt > 8:92352/1‑149 (MQ=255) aCCCGCGCCATGGCGCTGGAGTTGGCGCGCCATGGTATCCGGGTGAACGCCCTGGCGCCCGGCTACGTGATGACTGATTTGAACGAGGCCTTCCTGGCCAGCGAGGCCGGTGACAAGTTGCGCTCGCGGATCCCCAGCCGCCGCTTCa < 1:130225/148‑1 (MQ=255) cccGCGCCATGGCGCTGGAGTTGGCGCGCCATGGTATCCGGGTGAACGCCCTGGCGCCCGGCTACGTGATGACTGATTTGAACGAGGCCTTCCTGGCCAGCGAGGCCGGTGACAAGTTGCGCTCGCGGATCCCCAGCCGCCGCTTCAGc < 1:66428/149‑1 (MQ=255) ccatcatggcaggcacctcatcgacacattgctcaggttttgcacgcacatacctacctcctgttcttgttgttattgcgccacggcgcgttacaggctgctgcacaggtggccgccatcgaccacGATCCCCAGCCGCCGCTTCAGCg < 4:177119‑M1/23‑1 (MQ=255) ccGCGCCATGGCGCTGGAGTTGGCGCGCCATGGTATCCGGGTGAACGCCCTGGCGCCCGGCTACGTGATGACTGATTTGAACGAGGCCTTCCTGGCCAGCGAGGCCGGTGACAAGTTGCGCTCGCGGATCCCCAGCCGCCGCTTCAGCg > 2:333304/1‑149 (MQ=255) ccATGGCGCTGGAGTTGGCGCGCCATGGTATCCGGGTGAACGCCCTGGCGCCCGGCTACGTGATGACTGATTTGAACGAGGCCTTCCTGGCCAGCGAGGCCGGTGACAAGTTGCGCTCGCGGATCCCCAGCCGCCGCTTCAGCGTGCCg > 2:232367/1‑149 (MQ=255) cATGGCGCTGGAGTTGGCGCGCCATGGTATCCGGGTGAACGCCCTGGCGCCCGGCTACGTGATGACTGATTTGAACGAGGCCTTCCTGGCCAGCGAGGCCGGTGACAAGTTGCGCTCGCGGATCCCCAGCCGCCGCTTCAGCGTGCCGt > 8:204217/1‑149 (MQ=255) aTGGCGCTGGAGTTGGCGCGCCATGGTATCCGGGTGAACGCCCTGGCGCCCGGCTACGTGATGACTGATTTGAACGAGGCCTTCCTGGCCAGCGAGGCCGGTGACAAGTTGCGCTCGCGGATCCCCAGCCGCCGCTTCAGCGTGCCGTc < 6:175259/149‑1 (MQ=255) gcTGGAGTTGGCGCGCCATGGTATCCGGGTGAACGCCCTGGCGCCCGGCTACGTGATGACTGATTTGAACGAGGCCTTCCTGGCCAGCGAGGCCGGTGACAAGTTGCGCTCGCGGATCCCCAGCCGCCGCTTCAGCGTGCCGTCGGA‑cc > 7:35476/1‑149 (MQ=255) gAGTTGGCGCGCCATGGTATCCGGGTGAACGCCCTGGCGCCCGGCTACGTGATGACTGATTTGAACGAGGCCTTCCTGGCCAGCGAGGCCGGTGACAAGTTGCGCTCGCGGATCCCCAGCCGCCGCTTCAGCGTGCCGTCGGA‑CCTg < 5:18116/147‑1 (MQ=255) ttGGCGCGCCATGGTATCCGGGTGAACGCCCTGGCGCCCGGCTACGTGATGACTGATTTGAACGAGGCCTTCCTGGCCAGCGAGGCCGGTGACAAGTTGCGCTCGCGGATCCCCAGCCGCCGCTTCAGCGTGCCGTCGGA‑CCTGGACgg > 6:340066/1‑149 (MQ=255) ttGGCGCGCCATGGTATCCGGGTGAACGCCCTGGCGCCCGGCTACGTGATGACTGATTTGAACGAGGCCTTCCTGGCCAGCGAGGCCGGTGACAAGTTGCGCTCGCGGATCCCCAGCCGCCGCTTCAGCGTGCCGTCGGA‑CCTGGACgg > 2:191383/1‑149 (MQ=255) cgcCATGGTATCCGGGTGAACGCCCTGGCGCCCGGCTACGTGATGACTGATTTGAACGAGGCCTTCCTGGCCAGCGAGGCCGGTGACAAGTTGCGCTCGCGGATCCCCAGCCGCCGCTTCAGCGTGCCGTCGGA‑CCTGGACGGCGCCtt < 7:184050/149‑1 (MQ=255) gTATCCGGGTGAACGCCCTGGCGCCCGGCTACGTGATGACTGATTTGAACGAGGCCTTCCTGGCCAGCGAGGCCGGTGACAAGTTGCGCTCGCGGATCCCCAGCCGCCGCTTCAGCGTGCCGTCGGA‑CCTGGACGGCGCCTtgct‑gctg > 1:159392/1‑149 (MQ=255) tCCGGGTGAACGCCCTGGCGCCCGGCTACGTGATGACTGATTTGAACGAGGCCTTCCTGGCCAGCGAGGCCGGTGACAAGTTGCGCTCGCGGATCCCCAGCCGCCGCTTCAGCGTGCCGTCGGA‑CCTGGACGGCGCCTtg > 3:216923/1‑140 (MQ=255) tCCGGGTGAACGCCCTGGCGCCCGGCTACGTGATGACTGATTTGAACGAGGCCTTCCTGGCCAGCGAGGCCGGTGACAAGTTGCGCTCGCGGATCCCCAGCCGCCGCTTCAGCGTGCCGTCGGA‑CCTGGACGGCGCCTtg < 4:216923/140‑1 (MQ=255) tCCGGGTGAACGCCCTGGCGCCCGGCTACGTGATGACTGATTTGAACGAGGCCTTCCTGGCCAGCGAGGCCGGTGACAAGTTGCGCTCGCGGATCCCCAGCCGCCGCTTCAGCGTGCCGTCGGA‑CCTGGACGGCGCCTTgct‑gctgct < 8:35476/148‑1 (MQ=255) ccGGGTGAACGCCCTGGCGCCCGGCTACGTGATGACTGATTTGAACGAGGCCTTCCTGGCCAGCGAGGCCGGTGACAAGTTGCGCTCGCGGATCCCCAGCCGCCGCTTCAGCGTGCCGTCGGA‑CCTGGACGGCGCCTTGCT‑GCTGCTc < 7:65464/148‑1 (MQ=255) cGGGTGAACGCCCTGGCGCCCGGCTACGTGATGACTGATTTGAACGAGGCCTTCCTGGCCAGCGAGGCCGGTGACAAGTTGCGCTCGCGGATCCCCAGCCGCCGCTTCAGCGTGCCGTCGGA‑CCTGGACGGCGCCTTGCT‑GCTGCTCGc < 7:204217/149‑1 (MQ=255) aaCGCCCTGGCGCCCGGCTACGTGATGACTGATTTGAACGAGGCCTTCCTGGCCAGCGAGGCCGGTGACAAGTTGCGCTCGCGGATCCCCAGCCGCCGCTTCAGCGTGCCGTCGGA‑CCTGGACGGCGCCTTGCT‑GCTGCTCGCCAGCg < 2:159392/148‑1 (MQ=255) aaCGCCCTGGCGCCCGGCTACGTGATGACTGATTTGAACGAGGCCTTCCTGGCCAGCGAGGCCGGTGACAAGTTGCGCTCGCGGATCCCCAGCCGCCGCTTCAGCGTGCCGTCGGA‑CCTGGACGGCGCCTTGCT‑GCTGCTCGCCAGCGa > 3:317131/1‑149 (MQ=255) ccTGGCGCCCGGCTACGTGATGACTGATTTGAACGAGGCCTTCCTGGCCAGCGAGGCCGGTGACAAGTTGCGCTCGCGGATCCCCAGCCGCCGCTTCAGCGTGCCGTCGGA‑CCTGGACGGCGCCTTGCT‑GCTGCTCGCCAGCGATGCcg > 6:295578/1‑149 (MQ=255) ccTGGCGCCCGGCTACGTGATGACTGATTTGAACGAGGCCTTCCTGGCCAGCGAGGCCGGTGACAAGTTGCGCTCGCGGATCCCCAGCCGCCGCTTCAGCGTGCCGTCGGA‑CCTGGACGGCGCCTTGCT‑GCTGCTCGCCAGCGATGCcg > 6:201127/1‑149 (MQ=255) tGGCGCCCGGCTACGTGATGACTGATTTGAACGAGGCCTTCCTGGCCAGCGAGGCCGGTGACAAGTTGCGCTCGCGGATCCCCAGCCGCCGCTTCAGCGTGCCGTCGGA‑CCTGGACGGCGCCTTGCT‑GCTGCTCGCCAGCg < 1:245158/141‑1 (MQ=255) tGGCGCCCGGCTACGTGATGACTGATTTGAACGAGGCCTTCCTGGCCAGCGAGGCCGGTGACAAGTTGCGCTCGCGGATCCCCAGCCGCCGCTTCAGCGTGCCGTCGGA‑CCTGGACGGCGCCTTGCT‑GCTGCTCGCCAGCg > 2:245158/1‑141 (MQ=255) ccGGCTACGTGATGACTGATTTGAACGAGGCCTTCCTGGCCAGCGAGGCCGGTGACAAGTTGCGCTCGCGGATCCCCAGCCGCCGCTTCAGCGTGCCGTCGGACCCTGGACGGCGCCTTGCT‑GCTGCTCGCCAGCGATGCCgggcgggc < 1:70773/149‑1 (MQ=255) ggCTACGTGATGACTGATTTGAACGAGGCCTTCCTGGCCAGCGAGGCCGGTGACAAGTTGCGCTCGCGGATCCCCAGCCGCCGCTTCAGCGTGCCGTCGGA‑CCTGGACGGCGCCTTGCT‑GCTGCTCGCCAGCGATGCCGGGCGGGCGAt < 2:28003/149‑1 (MQ=255) ggCTACGTGATGACTGATTTGAACGAGGCCTTCCTGGCCAGCGAGGCCGGTGACAAGTTGCGCTCGCGGATCCCCAGCCGCCGCTTCAGCGTGCCGTCGGA‑CCTGGACGGCGCCTTGCT‑GCTGCTCGCCAGCGATGCCGGGCGGGCGAt > 6:234994/1‑149 (MQ=255) atgaCTGATTTGAACGAGGCCTTCCTGGCCAGCGAGGCCGGTGACAAGTTGCGCTCGCGGATCCCCAGCCGCCGCTTCAGCGTGCCGTCGGA‑CCTGGACGGCGCCTTGCTAGCTGCTCGCCAGCGATGCCGGGCGGGCGATGAgcggc < 1:232367/148‑1 (MQ=255) atgaCTGATTTGAACGAGGCCTTCCTGGCCAGCGAGGCCGGTGACAAGTTGCGCTCGCGGATCCCCAGCCGCCGCTTCAGCGTGCCGTCGGA‑CCTGGACGGCGCCTTGCT‑GCTGCTCGCCAGCGATGCCGGGCGGGCGATGAGCGgcgc < 5:295578/149‑1 (MQ=255) gaCTGATTTGAACGAGGCCTTCCTGGCCAGCGAGGCCGGTGACAAGTTGCGCTCGCGGATCCCCAGCCGCCGCTTCAGCGTGCCGTCGGA‑CCTGGACGGCGCCTTGCT‑GCTGCTCGCCAGCGATGCCGGGCGGGCGATGAGCGGCGCt > 6:291755/1‑148 (MQ=255) aCTGATTTGAACGAGGCCTTCCTGGCCAGCGAGGCCGGTGACAAGTTGCGCTCGCGGATCCCCAGCCGCCGCTTCAGCGTGCCGTCGGA‑CCTGGACGGCGCCTTGCT‑GCTGCTCGCCAGCGATGCCGGGCGGGCGATGAGCGGCGCTg < 1:23197/148‑1 (MQ=255) tGATTTGAACGAGGCCTTCCTGGCCAGCGAGGCCGGTGACAAGTTGCGCTCGCGGATCCCCAGCCGCCGCTTCAGCGTGCCGTCGGA‑CCTGGACGGCGCCTTGCT‑GCTGCTCGCCAGCGATGCCGGGCGGGCGAt < 8:311819/135‑1 (MQ=255) tGATTTGAACGAGGCCTTCCTGGCCAGCGAGGCCGGTGACAAGTTGCGCTCGCGGATCCCCAGCCGCCGCTTCAGCGTGCCGTCGGA‑CCTGGACGGCGCCTTGCT‑GCTGCTCGCCAGCGATGCCGGGCGGGCGAt > 7:311819/1‑135 (MQ=255) aTTTGAACGAGGCCTTCCTGGCCAGCGAGGCCGGTGACAAGTTGCGCTCGCGGATCCCCAGCCGCCGCTTCAGCGTGCCGTCGGA‑CCTGGACGGCGCCTTGCT‑GCTGCTCGCCAGCGATGCCGGGCGGGCGATGAGCGGCGCTgaga < 1:191383/147‑1 (MQ=255) aTTTGAACGAGGCCTTCCTGGCCAGCGAGGCCGGTGACAAGTTGCGCTCGCGGATCCCCAGCCGCCGCTTCAGCGTGCCGTCGGA‑CCTGGACGGCGCCTTGCT‑GCTGCTCGCCAGCGATGCCGGGCGGGCGATGAGCGGCGCTgaga < 5:340066/147‑1 (MQ=255) aTTTGAACGAGGCCTTCCTGGCCAGCGAGGCCGGTGACAAGTTGCGCTCGCGGATCCCCAGCCGCCGCTTCAGCGTGCCGTCGGA‑CCTGGACGGCGCCTTGCT‑GCTGCTCGCCAGCGATGCCGGGCGGGCGATGAGCGGCGCTGAGATc < 7:92352/149‑1 (MQ=255) aTTTGAACGAGGCCTTCCTGGCCAGCGAGGCCGGTGACAAGTTGCGCTCGCGGATCCCCAGCCGCCGCTTCAGCGTGCCGTCGGA‑CCTGGACGGCGCCTTGCT‑GCTGCTCGCCAGCGATGCCGGGCGGGCGATGAGCGGCGCTGAGATc < 5:50802/149‑1 (MQ=255) gAACGAGGCCTTCCTGGCCAGCGAGGCCGGTGACAAGTTGCGCTCGCGGATCCCCAGCCGCCGCTTTAGCGTGCCGTCGGA‑CCTGGACGGCGCCTTGCT‑GCTGCTCGCCAGCGATGcc < 1:253981/118‑1 (MQ=255) gAACGAGGCCTTCCTGGCCAGCGAGGCCGGTGACAAGTTGCGCTCGCGGATCCCCAGCCGCCGCTTCAGCGTGCCGTCGGA‑CCTGGACGGCGCCTTGCT‑GCTGCTCGCCAGCGATGcc > 2:253981/1‑118 (MQ=255) gAACGAGGCCTTCCTGGCCAGCGAGGCCGGTGACAAGTTGCGCTCGCGGATCCCCAGCCGCCGCTTCAGCGTGCCGTCGGA‑CCTGGACGGCGCCTTGCT‑GCTGCTCGCCAGCGATGCCGGGCGGGCGATGAGCGGCGCTGAGATCGTgg > 7:202445/1‑149 (MQ=255) gAACGAGGCCTTCCTGGCCAGCGAGGCCGGTGACAAGTTGCGCTCGCGGATCCCCAGCCGCCGCTTCAGCGTGCCGTCGGA‑CCTGGACGGCGCCTTGCT‑GCTGCTCGCCAGCGATGCCGGGCGGGCGATGAGCGGCGCTGAGATCGTg < 5:201127/148‑1 (MQ=255) gccacggcgcgttacaggctgctgcacaggtggccgccatcgaccacGATCCCCAGCCGCCGCTTCAGCGTGCCGTCGGA‑CCTGGATGGCGCCTTGCT‑GCTGCTCGCCAGCGATGCCGGGCGGGCGATGAGCGGCGCTGAGATCGTGGt > 3:177119‑M1/48‑149 (MQ=255) gAGGCCTTCCTGGCCAGCGAGGCCGGTGACAAGTTGCGCTCGCGGATCCCCAGCCGCCGCTTCAGCGTGCCGTCGGA‑CCTGGACGGCGCCTTGCT‑GCTGCTCGCCAGCGATGCCGGGCGGGCGATGAGCGGCGCTGAGATCGTGGTCGa > 4:255999/1‑149 (MQ=255) ggcgcgttacaggctgctgcacaggtggccgccatcgaccacGATCCCCAGCCGCCGCTTCAGCGTGCCGTCGGA‑CCTGGACGGCGCCTTGCT‑GCTGCTCGCCAGCGATGCCGGGCGGGCGATGAGCGGCGCTGAgatcgtggagatcg < 3:236564‑M1/107‑7 (MQ=255) ggcgcgttacaggctgctgcacaggtggccgccatcgaccacGATCCCCAGCCGCCGCTTCAGCGGGCCGTCGGA‑CCTGGACGGCGCCTTGCT‑GCTGCTCGCCAGCGATGCCGGGCGGGCGATGAGCGGCGCTGAGATCGTg > 4:236564‑M1/43‑142 (MQ=255) cTTCCTGGCCAGCGAGGCCGGTGACAAGTTGCGCTCGGGGATCCCCAGCCGCCGCTTCAGCGTGCCGTCGGA‑CCTGGACGGCGCCTTGCT‑GGTGCTCGCCAGCGATGCCGGGCGGGCGATGAGCGGCGCTGAGATCGTGGTCGATggcg < 1:61262/149‑1 (MQ=255) cTTCCTGGCCAGCGAGGCCGGTGACAAGTTGCGCTCGCGGATCCCCAGCCGCCGCTTCAGCGTGCCGTCGGA‑CCTGGACGGCGCCTTGCT‑GCTGCTCGCCAGCGATGCCGGGCGGGCGATGAGCGGCGCTGAGATCGTGGTCGATggcg < 4:317131/149‑1 (MQ=255) cTTCCTGGCCAGCGAGGCCGGTGACAAGTTGCGCTCGCGGATCCCCAGCCGCCGCTTCAGCGTGCCGTCGGA‑CCTGGACGGCGCCTTGCT‑GCTGCTCGCCAGCGATGCCGGGCGGGCGATGAGCGGCGCTGAGATCGTGGTCGATggcg < 1:333304/149‑1 (MQ=255) ttCCTGGCCAGCGAGGCCGGTGACAAGTTGCGCTCGCGGATCCCCAGCCGCCGCTTCAGCGTGCCGTCGGA‑CCTGGACGGCGCCTTGCT‑GCTGCTCGCCAGCGATGCCGGGCGGGCGATGAGCGGCGCTGAGATCGTGGTCGATggcgg > 6:96098/1‑149 (MQ=255) | GGCCGGCCTGGCCCACCTGACCCGCGCCATGGCGCTGGAGTTGGCGCGCCATGGTATCCGGGTGAACGCCCTGGCGCCCGGCTACGTGATGACTGATTTGAACGAGGCCTTCCTGGCCAGCGAGGCCGGTGACAAGTTGCGCTCGCGGATCCCCAGCCGCCGCTTCAGCGTGCCGTCGGA‑CCTGGACGGCGCCTTGCT‑GCTGCTCGCCAGCGATGCCGGGCGGGCGATGAGCGGCGCTGAGATCGTGGTCGATGGCGG > NC_002947/3184001‑3184258 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |