New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3555324 | 40 (0.740) | 3 (0.060) | 3/250 | NT | 7.2% | coding (940/1203 nt) | PP_3139 | group 1 family glycosyl transferase |
? | NC_002947 | = 3555357 | 39 (0.770) | coding (973/1203 nt) | PP_3139 | group 1 family glycosyl transferase |
GATCGAGGCCTTGATTGCCCGGCACGGCTTGCAGCAGCAAGTGCGTATCACTGGCTGGATCAGCAGTGCGCAGGTACGCGAGGAAATCCTGGCCGCCCGTGCGCTGGTGCTACCCAGCT‑TCGCCGAGGGCTTGCCCGTGGTCATCATGGAGGCCATGGCCTTGCGCCGGCCCGTGCTGACCACCTATGTAGCGGGTATCCCCGAGCTGGTGCGGCCTGGCGAAAACGGCTGGCTGTTCCCAGCCGGTGCCGTGGACGAGTTGGCAACAGCCATGGCCGACTGCCTGGCG > NC_002947/3555182‑3555470 | gATCGAGGCCTTGATTGCCCGGCACGGCTTGCAGCAGCAAGTGCGTATCACTGGCTGGATCAGCAGTGCGCAGGTACGCGAGGAAATCCTGGCCGCCCGTGCGCTGGTGCTACCCAGCT‑TCGCCGAGGGCTTGCCCGTGGTCATCATgg < 7:271034/149‑1 (MQ=255) tCGAGGCCTTGATTGCCCGGCACGGCTTGCAGCAGCAAGTGCGTATCACTGGCTGGATCAGCAGTGCGCAGGTACGCGAGGAAATCCTGGCCGCCCGTGCGCTGGTGCTACCCAGCT‑TCGCCGAGGGCTTGCCCGTGGTCATCATGGAg > 8:232736/1‑149 (MQ=255) gCCTTGATTGCCCGGCACGGCTTGCAGCAGCAAGTGCGTATCACTGGCTGGATCAGCAGTGCGCAGGTACGCGAGGAAATCCTGGCCGCCCGTGCGCTGGTGCTACCCAGCT‑TCGCCGAGGGCTTGCCCGTGGTCATCATGGAGGCCAt > 6:13671/1‑149 (MQ=255) gCCTTGATTGCCCGGCACGGCTTGCAGCAGCAAGTGCGTATCACTGGCTGGATCAGCAGTGCGCAGGTACGCGAGGAAATCCTGGCCGCCCGTGCGCTGGTGCTACCCAGCT‑TCACCGAGGGCTTGCCCGTGGTCATCATGGAGGCCAt > 5:69641/1‑149 (MQ=255) cTTGATTGCCCGGCACGGCTTGCAGCAGCAAGTGCGTATCACTGGCTGGATCAGCAGTGCGCAGGTACGCGAGGAAATCCTGGCCGCCCGTGCGCTGGTGCTACCCAGCT‑TCGCCGAGGGCTTGCCCGTGGTCATCATGGAGGCCATgg < 7:314334/149‑1 (MQ=255) ttGATTGCCCGGCACGGCTTGCAGCAGCAAGTGCGTATCACTGGCTGGATCAGCAGTGCGCAGGTACGCGAGGAAATCCTGGCCGCCCGTGCGCTGGTGCTACCCAGCT‑TCGCCGAGGGCTTGCCCGTGGTCATCATGGAGGCCATGGc > 4:143833/1‑149 (MQ=255) ttGCCCGGCACGGCTTGCAGCAGCAAGTGCGTATCACTGGCTGGATCAGCAGTGCGCAGGTACGCGAGGAAATCCTGGCCGCCCGTGCGCTGGTGCTACCCAGCT‑TCGCCGAGGGCTTGCCCGTGGTCATCATGGAGGCCATGGCCTTg < 5:138844/149‑1 (MQ=255) ccGGCACGGCTTGCAGCAGCAAGTGCGTATCACTGGCTGGATCAGCAGTGCGCAGGTACGCGAGGAAATCCTGGCCGCCCGTGCGCTGGTGCTACCCAGCT‑TCGCCGAGGGCTTGCCCGTGGTCATCATGGAGGCCATGGCCTTGCGcc > 3:202642/1‑149 (MQ=255) ggCACGGCTTGCAGCAGCAAGTGCGTATCACTGGCTGGATCAGCAGTGCGCAGGTACGCGAGGAAATCCTGGCCGCCCGTGCGCTGGTGCTACCCAGCT‑TCGCCGAGGGCTTGCCCGTGGTCATCATGGAGGCCATGGCCTTGCGCCgg > 2:18896/1‑149 (MQ=255) ggCACGGCTTGCAGCAGCAAGTGCGTATCACTGGCTGGATCAGCAGTGCGCAGGTACGCGAGGAAATCCTGGCCGCCCGTGCGCTGGTGCTACCCAGCT‑TCGCCGAGGGCTTGCCCGTGGTCATCATGGAGGCCATGGCCTTGCGCCgg < 2:58347/149‑1 (MQ=255) gCACGGCTTGCAGCAGCAAGTGCGTATCACTGGCTGGATCAGCAGTGCGCAGGTACGCGAGGAAATCCTGGCCGCCCGTGCGCTGGTGCTACCCAGCT‑TCGCCGAGGGCTTGCCCGTGGTCATCATGGAGGCCATGGCCTTGCGCCGGc < 7:238398/149‑1 (MQ=255) gcagcagcaAGTGCGTATCACTGGCTGGATCAGCAGTGCGCAGGTACGCGAGGAAATCCTGGCCGCCCGTGCGCTGGTGCTACCCAGCT‑TCGCCGAGGGCTTGCCCGTGGTCATCATGGAGGCCATGGCCTTGCGCCGGCCCGTGCtga < 5:334087‑M2/149‑4 (MQ=255) gcagcagcaAGTGCGTATCACTGGCTGGATCAGCAGTGCGCAGGTACGCGAGGAAATCCTGGCCGCCCGTGCGCTGGTGCTACCCAGCT‑TCACCGAGGGCTTGCCCGTGGTCATCATGGAGGCCATGGCCTTGCGCCGGCCCGTGCtg > 6:69641‑M2/1‑146 (MQ=255) agcagcaAGTGCGTATCACTGGCTGGATCAGCAGTGCGCAGGTACGCGAGGAAATCCTGGCCGCCCGTGCGCTGGTGCTACCCAGCT‑TCGCCGAGGGCTTGCCCGTGGTCATCATGGAGGCCATGGCCTTGCGCCGGCCCGTGCtgac < 2:183293‑M2/148‑5 (MQ=255) gcagcaAGTGCGTATCACTGGCTGGATCAGCAGTGCGCAGGTACGCGAGGAAATCCTGGCCGCCCGTGCGCTGGTGCTACCCAGCT‑TCGCCGAGGGCTTGCCCGTGGTCATCATGGAGGCCATGGCCTTGCGCCGGCCCGTGCtgacca > 5:126034‑M2/1‑143 (MQ=255) agcaAGTGCGTATCACTGGCTGGATCAGCAGTGCGCAGGTACGCGAGGAAATCCTGGCCGCCCGTGCGCTGGTGCTACCCAGCT‑TCGCCGAGGGCTTGCCCGTGGTCAgcacgggccggcgcaaggccatggcctccatgatgaccacg < 8:290221‑M1/149‑42 (MQ=255) aGTGCGTATCACTGGCTGGATCAGCAGTGCGCAGGTACGCGAGGAAATCCTGGCCGCCCGTGCGCTGGTGCTACCCAGCT‑TCGCCGAGGGCTTGCCCGTGGTCATCATGGAGGCCATGGCCTTGCGCCGGCCCGTGCTGACCACCTATg < 1:18896/149‑1 (MQ=255) gTATCACTGGCTGGATCAGCAGTGCGCAGGTACGCGAGGAAATCCTGGCCGCCCGTGCGCTGGTGCTACCCAGCT‑TCGCCGAGGGCTTGCCCGTGGTCAgcacgggccggcgcaaggccatggcctccatgatgac > 4:260305‑M1/1‑99 (MQ=255) gTATCACTGGCTGGATCAGCAGTGCGCAGGTACGCGAGGAAATCCTGGCCGCCCGTGCGCTGGTGCTACCCAGCT‑TCGCCGAGGGCTTGCCCGTGGTCAgcacgggccggcgcaaggccatggcctccatgatgac < 3:260305‑M1/136‑38 (MQ=255) tATCACTGGCTGGATCAGCAGTGCGCAGGTACGCGAGGAAATCCTGGCCGCCCGTGCGCTGGTGCTACCCAGCT‑TCGCCGAGGGCTTGCCCGTGGTCATCATGGAGGCCATGGCCTTGCGCCGGCCCGTGCTGACCACCTATGTAGCgg < 4:202642/149‑1 (MQ=255) tATCACTGGCTGGATCAGCAGTGCGCAGGTACGCGAGGAAATCCTGGCCGCCCGTGCGCTGGTGCTACCCAGCT‑TCGCCGAGGGCTTGCCCGTGGTCATCATGGAGGCCATGGCCTTGCGCCGGCCCGTGCTGACCACCTATGTAGCgg < 2:9464/149‑1 (MQ=255) tATCACTGGCTGGATCAGCAGTGCGCAGGTACGCGAGGAAATCCTGGCCGCCCGTGCGCTGGTGCTACCCAGCT‑TCGCCGAGGGCTTGCCCGTGGTCATCATGGAGGCCATGGCCTTGCGCCGGCCCGTGCTGACCACCTATGTAGCgg > 5:140165/1‑149 (MQ=255) tCACTGGCTGGATCAGCAGTGCGCAGGTACGCGAGGAAATCCTGGCCGCCCGTGCGCTGGTGCTACCCAGCT‑TCGCCGAGGGCTTGCCCGTGGTCATCATGGAGGCCATGGc < 8:277834/112‑1 (MQ=255) tCACTGGCTGGATCAGCAGTGCGCAGGTACGCGAGGAAATCCTGGCCGCCCGTGCGCTGGTGCTACCCAGCT‑TCGCCGAGGGCTTGCCCGTGGTCATCATGGAGGCCATGGc > 7:277834/1‑112 (MQ=255) ctggctggATCAGCAGTGCGCAGGTACGCGAGGAAATCCTGGCCGCCCGTGCGCTGGTGCTACCCAGCT‑TCGCCGAGGGCTTGCCCGTGGTCATCATGGAGGCCATGGCCTTGCGCCGGCCCGTGCTGACCACCTATGTAGCGGGTAt > 6:230917/1‑148 (MQ=255) ctggctggATCAGCAGTGCGCAGGTACGCGAGGAAATCCTGGCCGCCCGTGCGCTGGTGCTACCCAGCT‑TCGCCGAGGGCTTGCCCGTGGTCATCATGGAGGCCATGGCCTTGCGCCGGCCCGTGCTGACCACCTATGTAGCGGGTAt < 5:230917/148‑1 (MQ=255) ctggATCAGCAGTGCGCAGGTACGCGAGGAAATCCTGGCCGCCCGTGCGCTGGTGCTACCCAGCT‑TCGCCGAGGGCTTGCCCGTGGTCATCATGGAGGCCATGGCCTTGCGCCGGCCCGTGCTGACCACCTATGTAGCGGGTATCCCCg < 7:229318/149‑1 (MQ=255) tggATCAGCAGTGCGCAGGTACGCGAGGAAATCCTGGCCGCCCGTGCGCTGGTGCTACCCAGCT‑TCGCCGAGGGCTTGCCCGTGGTCATCATGGAGGCCATGGCCTTGCGCCGGCCCGTGCTGACCACCTATGTAGCGGGTATCCCCGa < 3:40031/149‑1 (MQ=255) atccagccagTGCGCAGGTACGCGAGGAAATCCTGGCCGCCCGTGCGCTGGTGCTACCCAGCT‑TCGCCGAGGGCTTGCCCGTGGTCATCATGGAGGCCATGGCCTTGCGCCGGCCCGTGCTGACCACCTATGTAGCGGGTATCCCCGAg > 7:270499/8‑149 (MQ=255) gATCAGCAGTGCGCAGGTACGCGAGGAAATCCTGGCCGCCCGTGCGCTGGTGCTACCCAGCT‑TCGCCGAGGGCTTGCCCGTGGTTATCATGGAGGCCATGGCCTTGCGCCGGCCCGTGCTGACCACCTATGTAGCGGGTATCCCCGa < 1:166368/147‑1 (MQ=255) gcagTGCGCAGGTACGCGAGGAAATCCTGGCCGCCGGTGCGCTGGTGCTACCCAGCT‑TCGCCGAGGGCTTGCCCGTGGTCATCATGGAGGCCATGGCCTTGCGCCGGCCCGTGCTGACCACCTATGTAGCGGGTATCCCCGAGCTGGt < 3:276470/148‑1 (MQ=255) cagTGCGCAGGTACGCGAGGAAATCCTGGCCGCCCGTGCGCTGGTGCTACCCAGCT‑TCGCCGAGGGCTTGCCCGTGGTCATCATGGAGGCCATGGCCTTGCGCCGGCCCGTGCTGACCACCTATGTAGCGGGTATCCCCGAGCTGGTGc < 7:232736/149‑1 (MQ=255) gcAGGTACGCGAGGAAATCCTGGCCGCCCGTGCGCTGGTGCTACCCAGCT‑TCGCCGAGGGCTTGCCCGTGGTCATCATGGAGGCCATGGCCTTGCGCCGGCCCGTGCTGACCACCTATGTAGCGGGTATCCCCGAGCTGGTGCGGCCTg < 8:270499/149‑1 (MQ=255) aGGTACGCGAGGAAATCCTGGCCGCCCGTGCGCTGGGGCTACCCAGCT‑TCGCCGAGGGCTTGCCCGTGGTCATCATGGAGGCCATGGCCTTGCGCCGGCCCGTGCTGACCACCTATGTAGCGGGTATCCCCGAGCTGGTGCGGCCTGGc < 5:35005/149‑1 (MQ=255) gAAATCCTGGCCGCCCGTGCGCTGGTGCTACCCAGCTGTCGCCGAGGGCTTGCCCGTGGTCATCATGGAGGCCATGGCCTTGCGCCGGCCCGTGCTGACCACCTATGTAGCGGGTATCCCCGAGCTGGTGCGGCCTGGCGAAAACggct > 1:60900/1‑149 (MQ=255) gAAATCCTGGCCGCCCGTGCGCTGGTGCTACCCAGCT‑TCGCCGAGGGCTTGCCCGTGGTCATCATGGAGGCCATGGCCTTGCGCCGGCCCGTGCTGACCACCTATGTAGCGGGTATCCCCGAGCTGGTGCGGCCTGGCGAAAACggctg < 6:334087/149‑1 (MQ=255) aTCCTGGCCGCCCGTGCGCTGGTGCTACCCAGCT‑TCGCCGAGGGCTTGCCCGTGGTCATCATGGAGGCCATGGCCTTGCGCCGGCCCGTGCTGACCACCTATGTAGCGGGTATCCCCGAGCTGGTGCGGCCTGGCGAAAACggctggct > 3:321509/1‑149 (MQ=255) tCCTGGCCGCCCGTGCGCTGGTGCTACCCAGCT‑TCGCCGAGGGCTTGCCCGTGGTCATCATGGAGGCCATGGCCTTGCGCCGGCCCGTGCTGACCACCTATGTAGCGGGTATCCCCGAGCTGGTGCGGCCTGGCGAAAACGgctggctg > 8:55880/1‑149 (MQ=255) gccCGTGCGCTGGTGCTACCCAGCT‑TCGCCGAGGGCTTGCCCGTGGTCATCATGGAGGCCATGGCCTTGCGCCGGCCCGTGCTGACCACCTATGTAGCGGGTATCCCCGAGCTGGTGCGGCCTGGCGAAAACGGCTGGCTGTTCCCAGc < 2:60900/149‑1 (MQ=255) ccGTGCGCTGGTGCTACCCAGCT‑TCGCCGAGGGCTTGCCCGTGGTCATCATGGAGGCCATGGCCTTGCGCCGGCCCGTGCTGACCACCTATGTAGCGGGTATCCCCGAGCTGGTGCGGCCTGGCGAAAACGGCTGGCTGTTCCCAGCCg > 2:98271/1‑149 (MQ=255) tGGTGCTACCCAGCT‑TCGCCGAGGGCTTGCCCGTGGTCATCATGGAGGCCATGGCCTTGCGCCGGCCCGTGCTGACCACCTATGTAGCGGGTATCCCCGAGCTGGTGCGGCCTGGCGAAAACGGCTGGCTGTTCCCAGCCGGTGCCGTg > 8:275953/1‑149 (MQ=255) tGCTACCCAGCT‑TCGCCGAGGGCTTGCCCGTGGTCATCATGGAGGCCATGGCCTTGCGCCGGCCCGTGCTGACCACCTATGTAGCGGGTATCCCCGAGCTGGTGCGGCCTGGCGAAAACGGCTGGCTGTTCCCAGCCGGTGCCGTGGAc < 3:143833/149‑1 (MQ=255) aCCCAGCT‑TCGCCGAGGGCTTGCCCGTGGTCATCATGGAGGCCATGGCCTTGCGCCGGCCCGTGCTGACCACCTATGTAGCGGGTATCCCCGAGCTGGTGCGGCCTGGCGAAAACGGCTGGCTGTTCCCAGCCGGTGCCGTGGACGAGt > 4:87850/1‑149 (MQ=255) aGCT‑TCGCCGAGGGCTTGCCCGTGGTCATCATGGAGGCCATGGCCTTGCGCCGGCCCGTGCTGACCACCTATGTAGCGGGTATCCCCGAGCTGGTGCGGCCTGGCGAAAACGGCTGGCTGTTCCCAGCCGGTGCCGTGGACGAGTTgg > 4:2848/1‑148 (MQ=255) gCCCGTGGTCATCATGGAGGCCATGGCCTTGCGCCGGCCCGTGCTGACCACCTATGTAGCGGGTATCCCCGAGCTGGTGCGGCCTGGCGAAAACGGCTGGCTGTTCCCCGCCGGTGCCGTGGACGAGTTGGCAACAGCCATGGCCGACt > 5:191333/1‑149 (MQ=255) gCCCGTGGTCATCATGGAGGCCATGGCCTTGCGCCGGCCCGTGCTGACCACCTATGTAGCGGGTATCCCCGAGCTGGTGCGGCCTGGCGAAAACGGCTGGCTGTTCCCAGCCGGTGCCGTGGACGAGTTGGCAACAGCCATGGCCGAc < 5:13671/148‑1 (MQ=255) cGTGGTCATCATGGAGGCCATGGCCTTGCGCCGGCCCGTGCtgaccacgggcaagccctcggcgaagctgggtagcaccagcgcacgggcggccaggatttcctcgcgtacctgcgcactgctgatccagccagtgatacgcacttgct < 8:290221‑M2/149‑109 (MQ=255) cGTGGTCATCATGGAGGCCATGGCCTTGCGCCGGCCCGTGCTGACCACCTATGTAGCGGGTATCCCCGAGCTGGTGCGGCCTGGCGAAAACGGCTGGCTGTTCCCAGCCGGTGCCGTGGACGAGTTGGCAACAGCCATGGCCGACTGcc > 7:36340/1‑149 (MQ=255) tGGTCAgcacgggccggcgcaaggccatggcctccatgatgaccacgggcaagccctcggcgaagctgggtagcaccagcgcacgggcggccaggatttcctcgcgtacctgcgcactgctgatccagccagtgatacgcacttgctgc > 5:126034‑M1/1‑6 (MQ=255) gTCAgcacgggccggcgcaaggccatggcctccatgatgaccacgggcaagccctcggcgaagctgggtagcaccagcgcacgggcggccaggatttcctcgcgtacctgcgcactgctgatccagccagtgatacgcacttgctgct < 2:183293‑M1/148‑145 (MQ=255) gTCATCATGGAGGCCATGGCCTTGCGCCGGCCCGTGCtgaccacgggcaagccctcggcgaagctgggtagcaccagcgcacgggcggccaggatttcctcgcgtacctgcgcactgctgatccagccagtgatac > 4:260305‑M2/1‑37 (MQ=255) gTCATCATGGAGGCCATGGCCTTGCGCCGGCCCGTGCtgaccacgggcaagccctcggcgaagctgggtagcaccagcgcacgggcggccaggatttcctcgcgtacctgcgcactgctgatccagccagtgatac < 3:260305‑M2/136‑100 (MQ=255) gTCATCATGGAGGCCATGGCCTTGCGCCGGCCCGTGCTGACCACCTATGTAGCGGGTATCCCCGAGCTGGTGCGGCCTGGCGAAAACGGCTGGCTGTTCCCAGCCGGTGCCGTGGACGAGTTGGCAACAGCCATGGCCGACTGCCTGgc < 3:87850/149‑1 (MQ=255) tCAgcacgggccggcgcaaggccatggcctccatgatgaccacgggcaagccctcggcgaagctgggtagcaccagcgcacgggcggccaggatttcctcgcgtacctgcgcactgctgatccagccagtgatacgcacttgctgctgc < 5:334087‑M1/149‑147 (MQ=255) cAgcacgggccggcgcaaggccatggcctccatgatgaccacgggcaagccctcggtgaagctgggtagcaccagcgcacgggcggccaggatttcctcgcgtacctgcgcactgctgatccagccagtgatacgcacttgctgctgc > 6:69641‑M1/1‑2 (MQ=255) | GATCGAGGCCTTGATTGCCCGGCACGGCTTGCAGCAGCAAGTGCGTATCACTGGCTGGATCAGCAGTGCGCAGGTACGCGAGGAAATCCTGGCCGCCCGTGCGCTGGTGCTACCCAGCT‑TCGCCGAGGGCTTGCCCGTGGTCATCATGGAGGCCATGGCCTTGCGCCGGCCCGTGCTGACCACCTATGTAGCGGGTATCCCCGAGCTGGTGCGGCCTGGCGAAAACGGCTGGCTGTTCCCAGCCGGTGCCGTGGACGAGTTGGCAACAGCCATGGCCGACTGCCTGGCG > NC_002947/3555182‑3555470 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |