New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4013887 = | 41 (0.760) | 4 (0.080) | 4/246 | NT | 9.0% | coding (229/519 nt) | PP_3541 | MgtC family transporter |
? | NC_002947 | 4013931 = | 43 (0.860) | coding (185/519 nt) | PP_3541 | MgtC family transporter |
GCCGTGCCGATGGCAGCCGTCATCCATAGCCCGGCAGCGGTCGTCAGGCCCTTCACATGACTGGTGTTCTGGCCGTTACCCTTCAGAATGGTACCCGCACCGAGAAAACCGATACCGGCAACGATGCCCTGGATCACCCGACTGAGTGCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGAACAGGGCAGCGCCCAGCGACACCAGCATGTGGGTACGCACCCCGGCAGACTTGCCCTTGTGTTCGCGCTCGAAGCCCAGTACT‑GCGCCAAGCACAGCAGCCATCAGCAA > NC_002947/4013739‑4014034 | gccgCGCCGATGGCAGCCGTCATCCATAGCCCGGCAGCGGTCGTCAGGCCCTTCACATGACTGGTGTTCTGGCCGTTACCCTTCAGAATGGTACCCGCACCGAGAAAACCGATACCGGCAACGATGCCCTGGATCACCCGACTGAGTGc < 1:235303/149‑1 (MQ=255) gatgtcaccgatgagcgcgaggtgacgcaaatccttgtgcgcttgctgatggctgctgtgcttggcgcagtactgggcttcgagcgcgaacacaagggcaagtctgccggggtgcgtacccacatgctggtgtcgctgggcgctgcCCt > 4:214141‑M1/147‑149 (MQ=255) cgTGCCGATGGCAGCCGTCATCCATAGCCCGGCAGCGGTCGTCAGGCCCTTCACATGACTGGTGTTCTGGCCGTTACCCTTCAGAATGGTACCCGCACCGAGAAAACCGATACCGGCAACGATGCCCTGGATCACCCGACTGAGTGCCt < 4:267272/149‑1 (MQ=255) cgTGCCGATGGCAGCCGTCATCCATAGCCCGGCAGCGGTCGTCAGGCCCTTCACATGACTGGTGTTCTGGCCGTTACCCTTCAGAATGGTACCCGCACCGAGAAAACCGATACCGGCAACGATGCCCTGGATCACCCGACTGAGTGCCt > 4:45820/1‑149 (MQ=255) atgtcaccgatgagcgcgaggggacgcaaatccttgtgcgcttgctgatggctgctgtgcttggcgcagtactgggcttcgagcgcgaacacaagggcaagtctgccggggtgcgtacctacatgctggtgtcgctgggcgctgcCCTg > 1:25060‑M1/146‑149 (MQ=255) caccgatgagcgcgaggtgacgcaaatccttgtgcgcttgctgatggctgctgtgcttggcgcagtactgggcttcgagcgcgaacacaagggcaagtctgccggggtgcgtacccacatgctggtgtcgctgggcgctgcCCTGTTCa < 3:51998‑M1/8‑1 (MQ=255) gATGGCAGCCGTCATCCATAGCCCGGCAGCGGTCGTCAGGCCCTTCACATGACTGGTGTTCTGGCCGTTACCCTTCAGAATGGTACCCGCACCGAGAAAACCGATACCGGCAACGATGCCCTGGATCACCCGACTGAGTGCCTGTTCAt < 6:57969/149‑1 (MQ=255) accgatgagcgcgaggtgacgcaaatccttgtgcgcttgctgatggctgctgtgcttggcgcagtactgggcttcgagcgcgaacacaagggcaagtctgccggggtgcgtacccacatgctggtgtcgctgggcgctgcCCTGTTCAt < 2:242673‑M1/9‑1 (MQ=255) gCAGCCGTCATCCATAGCCCGGCAGCGGTCGTCAGGCCCTTCACATGACTGGTGTTCTGGCCGTTACCCTTCAGAATGGTACCCGCACCGAGAAAACCGATACCGGCAACGATGCCCTGGATCACCCGACTGAGTGCCTGTTCATCGGc < 5:310949/149‑1 (MQ=255) gtgacgcaaatccttgtgcgcttgctgatggctgctgtgcttggcgcagtactgggcttcgagcgcgaacacaagggcaagtctgccggggtgcgtacccacatgctggtgtcgctgggcgctgcCCTg > 8:67259‑M1/126‑129 (MQ=255) gtgacgcaaatccttgtgcgcttgctgatggctgctgtgcttggcgcagtactgggcttcgagcgcgaacacaagggcaagtctgccggggtgcgtacccacatgctggtgtcgctgggcgctgcCCTg < 7:67259‑M1/4‑1 (MQ=255) cATAGCCCGGCAGCGGTCGTCAGGCCCTTCACATGACTGGTGTTCTGGCCGTTACCCTTCAGAATGGTACCCGCACCGAGAAAACCGATACCGGCAACGATGCCCTGGATCACCCGACTGAGTGCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCt > 6:193631/1‑149 (MQ=255) tAGCCCGGCAGCGGTCGTCAGGCCCTTCACATGACTGGTGTTCTGGCCGTTACCCTTCAGAATGGTACCCGCACCGAGAAAACCGATACCGGCAACGATGCCCTGGATCACCCGACTGAGTGCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCg < 5:193631/149‑1 (MQ=255) acgcaaatccttgtgcgcttgctgatggctgctgtgcttggcgcagtactgggcttcgagcgcgaacacaagggcaagtctgccggggtgcgtacccacatgctggtgtcgctggccgctgcCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCg < 5:314077‑M1/27‑1 (MQ=255) gCCCGGCAGCGGTCGTCAGGCCCTTCACATGACTGGTGTTCTGGCCGTTACCCTTCAGAATGGTACCCGCACCGAGAAAACCGATACCGGCAACGATGCCCTGGATCACCCGACTGAGTGCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGt < 2:254968/149‑1 (MQ=255) gtcgtcAGGCCCTTCACATGACTGGTGTTCTGGCCGTTACCCTTCAGAATGGTACCCGCACCGAGAAAACCGATACCGGCAACGATGCCCTGGATCACCCGACTGAGTGCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGaa > 8:8037/1‑149 (MQ=255) gcttgctgatggctgctgtgcttggcgcagtactgggcttcgagcgcgaacacaagggcaagtctgccggggtgcgtacccacatgctggtgtcgctgggcgctgcCCTg < 5:220164‑M1/4‑1 (MQ=255) gcttgctgatggctgctgtgcttggcgcagtactgggcttcgagcgcgaacacaagggcaagtctgccggggtgcgtacccacatgctggtgtcgctgggcgctgcCCTg > 6:220164‑M1/107‑110 (MQ=255) gcttgctgatggctgctgtgcttggcgcagtactgggcttcgagcgcgaacacaagggcaagtctgccggggtgcgtacccacatgctggtgtcgctgggcgctgcCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGAACAg > 2:305876‑M1/107‑149 (MQ=255) cttgctgatggctgctgtgcttggcgcagtactgggcttcgagcgcgaacacaagggcaagtctgccggggtgcgtacccacatgctggtgtcgctgggcgctgcCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGAACAgg > 6:314077‑M1/106‑149 (MQ=255) gctgatggctgctgtgcttggcgcagtactgggcttcgagcgcgaacacaagggcaagtctgccggggtgcgtacccacatgctggtgtcgctgggcgctgcCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGAACAGGGc > 3:145442‑M1/103‑148 (MQ=255) ccTTCACATGACTGGTGTTCTGGCCGTTACCCTTCAGAATGGTACCAGCACCGAGAAAACCGATACCGGCAACGATGCCCTCGATCACCCGACTGAGTGCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGAACAGGGCAgcg > 2:176233/1‑149 (MQ=255) acaTGACTGGTGTTCTGGCCGTTACCCTTCAGAATGGTACCCGCACCGAGAAAACCGATACCGGCAACGATGCCCTGGATCACCCGACTGAGTGCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGAACAGGGCAGCGCCCAg > 8:232443/1‑149 (MQ=255) caTGACTGGTGTTCTGGCCGTTACCCTTCAGAATGGTACCCGCACCGAGAAAACCGATACCGGCAACGATGCCCTGGATCACCCGACTGAGTGCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGAACAGGGCAGCGCCCAGc < 3:45820/149‑1 (MQ=255) tGGTGTTCTGGCCGTTACCCTTCAGAATGGTACCCGCACCGAGAAAACCGATACCGGCAACGATGCCCTGGATCACCCGACTGAGTGCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGAACAGGGCAGCGCCCAGCGacac > 7:159180/1‑148 (MQ=255) gCCGTTACCCTTCAGAATGGGACCCGCACCGAGAAAACCGATACCGGCAACGATGCCCTGGATCACCCGACTGAGTGCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGAACAGGGCAGCGCCCAGCGACACCAGCAtgt < 4:238232/146‑1 (MQ=255) ccTTCAGAATGGTACCCGCACCGAGAAAACCGATACCGGCAACGATGCCCTGGATCACCCGACTGAGTGCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGAACAGGGCAGCGCCCAGCGACACCAGCATGTGGGTACGCAcc > 8:294171/1‑149 (MQ=255) cTTCAGAATGGTACCCGCACCGAGAAAACCGATACCGGCAACGATGCCCTGGATCACCCGACTGAGTGCCt > 2:191710/1‑71 (MQ=255) cTTCAGAATGGTACCCGCACCGAGAAAACCGATACCGGCAACGATGCCCTGGATCACCCGACTGAGTGCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGAACAGGGCAGCGCCCAGCGACACCAGCATGTGGGTCCGCAccc > 4:51998/1‑149 (MQ=255) cTTCAGAATGGTACCCGCACCGAGAAAACCGATACCGGCAACCATGCCCTGGATCACCCGACTGAGTGCCt < 1:191710/71‑1 (MQ=255) ttCAGAATGGTACCCGCACCGAGAAAACCGATACCGGCAACGATGCCCTGGATCACCCGACTGAGTGCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGAACAGGGCAGCGCCCAGCGACACCAGCATGTGGGTACGCAcccc > 4:269426/1‑149 (MQ=255) ttCAGAATGGTACCCGCACCGAGAAAACCGATACCGGCAACGATGCCCTGGATCACCCGACTGAGTGCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGAACAGGGCAGCGCCCAGCGACACCAGCATGTGGGTACGCAcccc > 4:69672/1‑149 (MQ=255) aaTGGTACCCGCACCGAGAAAACCGATACCGGCAACGATGCCCTGGATCACCCGACTGAGTGCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGc > 2:317416/1‑97 (MQ=255) aaTGGTACCCGCACCGAGAAAACCGATACCGGCAACGATGCCCTGGATCACCCGACTGAGTGCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGc < 1:317416/97‑1 (MQ=255) aTGGTACCCGCACCGAGAAAACCGATACCGGCAACGATGCCCTGGATCACCCGACTGAGTGCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGAACAGGGCAGCGCCCAGCGACACCAGCATGTGGCTACGCACCCCGGCAGa > 5:142611/1‑149 (MQ=255) tGGTACCCGCACCGAGAAAACCGATACCGGCAACGATGCCCTGGATCACCCGACTGAGTGCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGAACAGGGCAGCGCCCAGCGACACCAGCATGTGGGTACGCACCCCGGCAGAc < 7:294171/149‑1 (MQ=255) ccGCACCGAGAAAACCGATACCGGCAACGATGCCCTGGATCACCCGACTGAGTGCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGAACAGGGCAGCGCCCAGCGACACCAg > 3:249433/1‑118 (MQ=255) ccGCACCGAGAAAACCGATACCGGCAACGATGCCCTGGATCACCCGACTGAGTGCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGAACAGGGCAGCGCCCAGCGACACCAg < 4:249433/118‑1 (MQ=255) ccGCACCGAGAAAACCGATACCGGCAACGATGCCCTGGATCACCCGACTGAGTGCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGAACAGGGCAGCGCCCAGCGACACCAGCATGTGGGTACGCACCCCGGCAGACTTGccc > 2:20817/1‑149 (MQ=255) ccGCACCGAGAAAACCGATACCGGCAACGATGCCCTGGATCACCCGACTGAGTGCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGAACAGGGCAGCGCCCAGCGACACCAGCATGTGGGTACGCACCCCGGCAGACTTGccc < 5:149977/149‑1 (MQ=255) gCACCGAGAAAACCGATACCGGCAACGATGCCCTGGATCACCCGACTGAGTGCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGAACAGGGCAGCGccc < 2:12286/105‑1 (MQ=255) aCCGAGAAAACCGATACCGGCAACGATGCCCTGGATCACCCGACTGAGTGCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGAACAGGGCAGCGCCCAGCGACACCAGCATGTGGGTACGCACCCCGGCAAACTTGACCttca > 6:235886/1‑147 (MQ=255) aCCGAGAAAACCGATACCGGCAACGATGCCCGGGATCACCCGACTGAGTGCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGAACAGGGCAGCGCCCAGCGACACCAGCATGTGGGTACGCACCCCGGCAGACTTGCCCTtgt < 7:232443/149‑1 (MQ=255) agaAAACCGATACCGGCAACGATGCCCTGGATCACCCGACTGAGTGCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGAACAGGGCAGCGCCCAGCGACACCAGCATGTGGGTACGCACCCCGGCAGACTTGCCCTTGTGTTc > 2:171526/1‑149 (MQ=255) aaaaCCGATACCGGCAACGATGCCCTGGATCACCCGACTGAGTGCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGAACAGGGCAGCGCCCAGCGACACCAGCATGTGGGTACGCACCCCGGCAGACTTGCCCTTGTGTTcgc > 6:63969/1‑149 (MQ=255) aTACCGGCAACGATGCCCTGGATCACCCGACTGAGTGCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGAACAGGGCAGCGCCCAGCGACACCAGCATGTGGGTACGCACCCCGGCAGACTTGCCCTTGTGTTCGCGCTCGaa < 7:8037/149‑1 (MQ=255) cGGCAACGATGCCCTGGATCACCCGACTGAGTGCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGAACAGGGCAGCGCCCAGCGACACCAGCATGTGGGTACGCACCCCGGCAGACTTGCCCTTGTGTTCGCGCTCGAAGcc > 4:69300/1‑148 (MQ=255) cGGCAACGATGCCCTGGATCACCCGACTGAGTGCCTGATCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGAACAGGGCAGCGCCCAGCGACACCAGCATGTGGGTACGCACCCCGGCAGACTTGCCCTTGTGTTCGCGCTCGAAGcc > 5:125602/1‑148 (MQ=255) aaCGATGCCCTGGATCACCCGACTGAGTGCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGAACAGGGCAGCGCCCAGCGACACCAGCATGTGGGTACGCACCCCGGCAGACTTGCCCTTGTGttt > 5:111157/1‑131 (MQ=255) aaCGATGCCCTGGATCACCCGACTGAGTGCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGAACAGGGCAGCGCCCAGCGACACCAGCATGTGGGTACGCACCCCGGCAGACTTGCCCTTGTGttt < 6:111157/132‑2 (MQ=255) aaCGATGCCCTGGATCACCCGACTGAGTGCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGAACAGGGCAGCGCCCAGCGACACCAGCATGTGGGTACGCACCCCGGCAGACTTGCCCTTGTGTTCGCGCTCGAAGCCCAGTa < 2:225930/149‑1 (MQ=255) gATCACCCGACTGAGTGCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGAACAGGGCAGCGCCCAGCGACACCAGCATGTGGGTACGCACCCCGGCAGACTTGCCCTTGTGTTCGCGCTCGAAGCCCAGTACT‑GCGCCAAg < 3:69300/147‑1 (MQ=255) aCCCGACTGAGTGCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGAACAGGGCAGCGCCCAGCGACACCAGCATGTGGGTACGCACCCCGGCAGACTTGCCCTTGTGTTCGCGCTCGAAGCCCAGTACT‑GCGCCAAGCAcag < 1:171526/148‑1 (MQ=255) aCCCGACTGAGTGCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGAACAGGGCAGCGCCCAGCGACACCAGCATGTGGGTACGCACCCCGGCAGACTTGCCCTTGTGTTCGCGCTCGAAGCCCAGTACT‑GCGCCAAGCAcag > 2:8723/1‑148 (MQ=255) aCCCGACTGAGTGCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGAACAGGGCAGCGCCCAGCGACACCAGCATGTGGGTACGCACCCCGGCAGACTTGCCCTTGTGTTCGCGCTCGAAGCCCAGTACT‑GCGCCAAGCAcag > 2:260961/1‑148 (MQ=255) cccGACTGAGTGCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCGGCATGAACAGGGCAGCGCCCAGCGACACCAGCATGTGGGTACGCACCCCGGCAGACTTGCCCTTGTGTTCGCGCTCGAAGCCCAGTACT‑GCGCCAAGCAcag > 1:241335/1‑147 (MQ=255) cccGACTGAGTGCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGAACAGGGCAGCGCCCAGCGACACCAGCATGTGGGTACGCACCCCGGCAGACTTGCCCTTGTGTTCGCGCTCGAAGCCCAGTACT‑GCGCCAAGCAcag > 2:281655/1‑147 (MQ=255) ccGACTGAGTGCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGAACAGGGCAGCGCCCAGCGACACCAGCATGTGGGTACGCACCCCGGCAGACTTGCCCTTGTGTTCGCGCTCGAAGCCCAGTACT‑GCGCCAAGCAcagcag > 1:170758/1‑149 (MQ=255) aGTGCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGAACAGGGCAGCGCCCAGCGACACCAGCATGTGGGTACGCACCCCGGCAGACTTGCCCTTGTGTTCGCGCTCGAAGCCCAGTACT‑GCGCCAAGCACAGCAGCCATc < 1:281655/147‑1 (MQ=255) gTGCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGAACAGGGCAGCGCCCAGCGACACCAGCATGTGGGTACGCACCCCGGCAGACTTGCCCTTGTGTTCGCGCTCGAAGCCCAGTACT‑GCGCCAAGCACAGCAGCCATCAg > 1:242673/1‑148 (MQ=255) gTGCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGAACAGGGCAGCGCCCAGCGACACCAGCATGTGGGTACGCACCCCGGCAGACTTGCCCTTGTGTTCGCGCTCGAAGCCCAGTACT‑GCGCCAAGCACAGCAGCCATCAGc < 2:170758/149‑1 (MQ=255) tGCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGAACAGGGCAGCGCCCAGCGACACCAGCATGTGGGTACGCACCCCGGCAGACTTGCCCTTGTGTTCGCGCTCGAAGCCCAGTACT‑GCGCCAAGCACAGCAGCCATCAGc > 4:211137/1‑148 (MQ=255) CCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGAACAGGGCAGCGCCCAGCGACACCAGCATGTGGGTACGCACCCCGGCAGACTTGCCCTTGTGTTCGCGCTCGAAGCCCAGTACTCGCGCCAAGCACAGCAGCCATCAGCaa > 1:176233‑M1/1‑149 (MQ=255) CCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGAACAGGGCAGCGCCCAGCGACACCAGCATGTGGGTACGCACCCCGGCAGACTTGCCCTTGTGTTCGCGCTCGAAGCCCAGTACT‑GCGCCAAGCACAGCAGCCATCAGCaa > 3:269426‑M1/1‑148 (MQ=255) | GCCGTGCCGATGGCAGCCGTCATCCATAGCCCGGCAGCGGTCGTCAGGCCCTTCACATGACTGGTGTTCTGGCCGTTACCCTTCAGAATGGTACCCGCACCGAGAAAACCGATACCGGCAACGATGCCCTGGATCACCCGACTGAGTGCCTGTTCATCGGCCCCCGCCATGCTCGGTGCCAGCATGAACAGGGCAGCGCCCAGCGACACCAGCATGTGGGTACGCACCCCGGCAGACTTGCCCTTGTGTTCGCGCTCGAAGCCCAGTACT‑GCGCCAAGCACAGCAGCCATCAGCAA > NC_002947/4013739‑4014034 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |