New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4681254 | 43 (0.800) | 4 (0.080) | 4/252 | NT | 8.4% | coding (424/780 nt) | gloB | hydroxyacylglutathione hydrolase |
? | NC_002947 | = 4681285 | 46 (0.900) | coding (455/780 nt) | gloB | hydroxyacylglutathione hydrolase |
GAAGGCGATAGGGTGGACGTGCTGGGTGTGACGTTCCAGGTAATGGCGGTACCCGGCCACACCCTGGGGCATATCGCCTTCTTCAGCGACCAGCCAGCAACGCCCATCCTGTTCAGTGGCGACACCCTGTTCGCCGCCGGTTGCGGGCGCATGTTC‑GAAGGTACACCCGAACAGATGCAGCCCGCCCTCGCCCGCCTGGCGGCCCTGCCAGAGCAGACACAAGTGTACTGCGCCCATGAATACACCCTCAGCAACCTGCGCTTCGCCAAGGCTGTGGAACCGACCAACCCGCACG > NC_002947/4681107‑4681401 | gAAGGCGATAGGGTGGACGTGCTGGGTGTGACGTTCCAGGTAATGGCGGTACCCGGCCACACCCTGGGGCATATCGCCTTCTTCAGCGACCAGCCAGCAACGCCCATCCTGTTCAGTGGCGACACCCTGTTCGCCGCCGGTTGCGGgcg > 8:286676/1‑149 (MQ=255) gATAGGGTGGACGTGCTGGGTGTGACGTTCCAGGTAATGGCGGTACCCGGCCACACCCTGGGGCATATCGCCTTCTTCAGCGACCAGCCAGCAACGCCCATCCTGTTCAGTGGCGACACCCTGTTCGCCGCCGGTTGCGGGCGCATGtt > 1:156121/1‑149 (MQ=255) gTGGACGTGCTGGGTGTGACGTTCCAGGTAATGGCGGTACCCGGCCACACCCTGGGGCATATCGCCTTCTTCAGCGACCAGCCAGCAACGCCCATCCTGTTCAGTGGCGACACCCTGTTCGCCGCCGGTTGCGGGCtgcatctgttcgg > 6:4514‑M1/1‑136 (MQ=255) aCGTGCTGGGTGTGACGTTCCAGGTAATGGCGGTACCCGGCCACACCCTGGGGCATATCGCCTTCTTCAGCGACCAGCCAGCAACGCCCATCCTGTTCAGTGGCGACACCCTGTTCGCCGCCGGTTGCGGGCGCATGTTC‑GAAGGTaca > 8:140475/1‑149 (MQ=255) tgACGTTCCAGGTAATGGCGGTACCCGGCCACACCCTGGGGCATATCGCCTTCTTCAGCGACCAGCCAGCAACGCCCATCCTGTTCAGTGGCGACACCCTGTTCGCCGCCGGTTGCGGGCGCATGTTC‑GAAGGTACACCCGAACAGATg < 7:286676/149‑1 (MQ=255) aCGTTCCAGGTAATGGCGGTACCCGGCCACACCCTGGGGCATATCGCCTTCTTCAGCGACCAGCCAGCAACGCCCATCCTGTTCAGTGGCGACACCCTGTTCGCCGCCGGTTGCGGGCtgcatctgttcgggtgtaccttcgaacatgc < 1:127595‑M1/149‑32 (MQ=255) gTTCCAGGTAATGGCGGTACCCGGCCACACCCTGGGGCATATCGCCTTCTTCAGCGACCAGCCAGCAACGCCCATCCTGTTCAGTGGCGACACCCTGTTCGCCGCCGGTTGCGGGCtgcatctgttcgggtgtaccttcgaacatgcgc < 5:4514‑M1/149‑34 (MQ=255) ttCCAGGTAATGGCGGTACCCGGCCACACCCTGGGGCATATCGCCTTCTTCAGCGACCAGCCAGCAACGCCCATCCTGTTCAGTGGCGACACCCTGTTCGCCGCCGGTTGCGGGCGCATGTTc < 8:80836/123‑1 (MQ=255) ttCCAGGTAATGGCGGTACCCGGCCACACCCTGGGGCATATCGCCTTCTTCAGCGACCAGCCAGCAACGCCCATCCTGTTCAGTGGCGACACCCTGTTCGCCGCCGGTTGCGGGCGCATGTTc > 7:80836/1‑123 (MQ=255) ccAGGTAATGGCGGTACCCGGCCACACCCTGGGGCATATCGCCTTCTTCAGCGACCAGCCAGCAACGCCCATCCTGTTCAGTGGCGACACCCTGTTCGCCGCCGGTTGCGGGCtgcatctgttcgggtgtaccttcgaacatgcgccc < 4:9655‑M1/148‑36 (MQ=255) gTAATGGCGGTACCCGGCCACACCCTGGGGCATATCGCCTTCTTCAGCGACCAGCCAGCAACGCCCATCCTGTTCAGTGGCGACACCCTGTTCGCCGCCGGTTGCGGGCGCATGTTC‑GAAGGTa > 7:4209/1‑124 (MQ=255) gTAATGGCGGTACCCGGCCACACCCTGGGGCATATCGCCTTCTTCAGCGACCAGCCAGCAACGCCCATCCTGTTCAGTGGCGACACCCTGTTCGCCGCCGGTTGCGGGCGCATGTTC‑GAAGGTa < 8:4209/124‑1 (MQ=255) gTAATGGCGGTACCCGGCCACACCCTGGGGCATATCGCCTTCTTCAGCGACCAGCCAGCAACGCCCATCCTGTTCAGTGGCGACACCCTGTTCGCCGCCGGTTGCGGGCGCATGTTC‑GAAGGTACACCCGAACAGATGCAGCCCGCCCt > 7:30157/1‑149 (MQ=255) aTGGCGGTACCCGGCCACACCCTGGGGCATATCGCCTTCTTCAGCGACCAGCCAGCAACGCCCACCCTGTTCAGTGGCGACACCCTGTTCGCCGCCGGTTGCGGGCGCATGTTC‑GAAGGTACACCCGAACAGATGCAGCCCGCCCTcgc < 2:138196/149‑1 (MQ=255) cacaCCCTGGGGCATATCGCCTTCTTCAGCGACCAGCCAGCAACGCCCATCCTGTTCAGTGGCGACACCCTGTTCGCCGCCGGTTGCGGGCGCATGTTC‑GAAGGTACACCCGAACAGATGCAGCCCGCCCTCGCCCGCCTGGCGGCCCt < 7:140475/149‑1 (MQ=255) acCCTGGGGCATATCGCCTTCTTCAGCGACCAGCCAGCAACGCCCATCCTGTTCAGTGGCGACACCCTGTTCGCCGCCGGTTGCGGGCGCATGTTC‑GAAGGTACACCCGAACAGATGCAGCCCGCCCTCGCCCGCCTGGCGGCCCTGc > 2:241603/1‑148 (MQ=255) tggCATTTCGCCTTTTTCAGCGACCTGCCAGCAACGCCCATCCTGTTCTGTGGCTTCACCCTGTTTGCTGCTGGTTGTGGGCGTATGTTC‑GAAGGTACACCCTAACAGATGTAGCCCGCCCTCGCTCGCCTGGCGGCCCTGCCAGAGc < 7:50421/147‑1 (MQ=255) tatCGCCTTCTTCAGCGACCAGCCAGCAACGCCCATCCTGTTCAGTGGCGACACCCTGTTCGCCGCCGGTTGCGGGCGCATGTTC‑GAAGGTACACCCGAACAGATGCAGCCCGCCCTCGCCCGCCTGGCGGCCCTGCCAGAGCAGaca > 3:134525/1‑148 (MQ=255) gCCTTCTTCAGCGACCAGCCAGCAACGCCCATCCTGTTCAGTGGCGACACCCTGTTCGCCGCCGGTTGCGGGCGCATGTTC‑GAAGGTACACCCGAACAGATGCAGCCCGCCCTCGCCCGCCTGGCGGCCCTGCCAGAGCAGACACAAgt < 2:325597/149‑1 (MQ=255) ccTTCTTCAGCGACCAGCCAGCAACGCCCATCCTGTTCAGTGGCGACACCCTGTTCGCCGCCGGTTGCGGGCGCATGTTC‑GAAGGTACACCCGAACAGATGCAGCCCGCCCTCGCCCGCCTGGCGGCCCTGCCAGAGCAGACACAAgtg > 2:85506/1‑149 (MQ=255) tcttcAGCGACCAGCCAGCAACGCCCATCCTGTTCAGTGGCGACACCCTGTTCGCCGCCGGTTGCGGGCGCATGTTC‑GAAGGTACACCCGAACAGATGCAGCCCGCCCTCGCCCGCCTGGCGGCCCTGCCAGAGCAGACACAAGTGTAc > 5:218187/1‑149 (MQ=255) tcAGCGACCAGCCAGCAACGCACATCCTGTTCAGTCGCGACACACTGTTCTCCGCCGGTTGCGGGCGCATGTTC‑GAAGGTACACCCGAACAGATGCAGCCCGCCCTCGCCCGCCTGGCGGCCCTGCCAGAGCAGACACAAGTGTACTgc > 6:301820/1‑149 (MQ=255) gACCAGCCAGCAACGCCCATCCTGTTCAGTGGCGACACCCTGTTCGCCGCCGGTTGCGGGCGCATGTTC‑GAAGGTACACCCGAACAGATGCAGCCCGCCCTCGCCCGCCTGGCGGCCCTGCCAGAGCAGACACAAgt < 6:54130/137‑1 (MQ=255) gACCAGCCAGCAACGCCCATCCTGTTCAGTGGCGACACCCTGTTCGCCGCCGGTTGCGGGCGCATGTTC‑GAAGGTACACCCGAACAGATGCAGCCCGCCCTCGCCCGCCTGGCGGCCCTGCCAGAGCAGACACAAgt > 5:54130/1‑137 (MQ=255) aCCAGCCAGCAACGCCCATCCTGTTCAGTGGCGACACCCTGTTCGCCGCCGGTTGCGGGCGCATGTTC‑GAAGGTACACCCGAACAGATGCAGCCCGCCCTCGCCCGCCTGGCGGCCCTGCCAGAGCAGACACAAgt > 6:45722/1‑136 (MQ=255) aCCAGCCAGCAACGCCCATCCTGTTCAGTGGCGACACCCTGTTCGCCGCCGGTTGCGGGCGCATGTTC‑GAAGGTACACCCGAACAGATGCAGCCCGCCCTCGCCCGCCTGGCGGCCCTGCCAGAGCAGACACAAgt < 5:45722/136‑1 (MQ=255) aCCAGCCAGCAACGCCCATCCTGTTCAGTGGCGACACCCTGTTCGCCGCCGGTTGCGGGCGCATGTTC‑GAAGGTACACCCGAACAGATGCAGCCCGCCCTCGCCCGCCTGGCGGCCCTGCCAGAGCAGACACAAGTGTACTGCGCCCAt > 5:120713/1‑149 (MQ=255) ccagccagCAACGCCCATCCTGTTCAGTGGCGACACCCTGTTCGCCGCCGGTTGCGGGCGCATGTTC‑GAAGGTACACCCGAACAGATGCAGCCCGCCCTCGCCCGCCTGGCGGCCCTGCCAGAGCAGACACAAGTGTACTGCGCCCAt > 8:7776/1‑148 (MQ=255) cagccagcAACGCCCATCCTGTTCAGTGGCGACACCCTGTTCGCCGCCGGTTGCGGGCGCATGTTC‑GAAGGTACACCCGAACAGATGCAGCCCGCCCTCGCCCGCCTGGCGGCCCTGCCAGAGCAGACACAAGTGTACTGCGCCCATGa < 1:85506/149‑1 (MQ=255) gcAACGCCCATCCTGTTCAGTGGCGACACCCTGTTCGCCGCCGGTTGCGGGCGCATGTTC‑GAAGGTACACCCGAACAGATGCAGCCCGCCCTCGCCCGCCTGGCGGCCCTGCCAGAGCAGACACAAGTGTACTGCGCCCATGAATacac < 6:218187/149‑1 (MQ=255) cccATCCTGTTCAGTGGCGACACCCTGTTCGCCGCCGGTTGCGGGCGCATGTTC‑GAAGGTACACCCGAACAGATGCAGCCCGCCCTCGCCCGCCTGGCGGCCCTGCCAGAGCAGACACAAGTGTACTGCGCCCATGAATACACCCTCAg < 2:156121/149‑1 (MQ=255) ccATCCTGTTCAGTGGCGACACCCTGTTCGCCGCCGGTTGCGGGCGCATGTTC‑GAAGGTACACCCGAACAGATGCAGCCCGCCCTCGCCCGCCTGGCTGCCCTGCCAGAGCAGACACAAGTGTACTGCGCCCATGa < 4:201459/136‑1 (MQ=255) ccATCCTGTTCAGTGGCGACACCCTGTTCGCCGCCGGTTGCGGGCGCATGTTC‑GAAGGTACACCCGAACAGATGCAGCCCGCCCTCGCCCGCCTGGCGGCCCTGCCAGAGCAGACACAAGTGTACTGCGCCCATGa > 3:201459/1‑136 (MQ=255) cATCCTGTTCAGTGGCGACACCCTGTTCGCCGCCGGTTGCGGGCGCATGTTC‑GAAGGTACACCCGAACAGATGCAGCCCGCCCTCGCCCGCCTGGCGGCCCTGCCAGAGCAGACACAAGTGTACTGCGCCCATGAATACACCCTCAGc > 5:285148/1‑148 (MQ=255) aTCCTGTTCAGTGGCGACACCCTGTTCGCCGCCGGTTGCGGGCGCATGTTC‑GAAGGTACACCCGAACAGATGCAGCCCGCCCTCGCCCGCCTGGCGGCCCTGCCAGAGCAGACACAAGTGTACTGCGCCCATGAATACACCCTCAGCaa < 2:203176/149‑1 (MQ=255) ttCAGTGGCGACACCCTGTTCGCCGCCGGTTGCGGGCGCATGTTCGGAAGGTACACCCGAACAGATGCAGCCCGCCCTCGCCCGCCTGGCGGCCCTGCCAGAGCAGACACAAGTGTACTGCGCCCATGAATACACCCTCAGCAACCTgc > 1:245600/1‑149 (MQ=255) aGTGGCGACACCCTGTTCGCCGCCGGTTGCGGGCGCATGTTC‑GAAGGTACACCCGAACAGATGCAGCCCGCCCTCGCCCGCCTGGCGGCCCTGCCAGAGCAGACACAAGTGTACTGCGCCCATGAATACACCCTCAGCAACCTGCGCtt > 8:68237/1‑149 (MQ=255) aGTGGCGACACCCTGTTCGCCCCCGGTTGCGGGCGCATGTTC‑GAAGGTACACCCGAACAGATGCAGCCCGCCCTCGCCCGCCTGGCGGCCCTGCCAGAGCAGACACAAGTGTACTGCGCCCATGAATACACCCTCAGCAACCTGCGCtt > 5:3645/1‑149 (MQ=255) gACACCCTGTTCGCCGCCGGTTGCGGGCGCATGTTC‑GAAGGTACACCCGAACAGATGCAGCCCGCCCTCGCCCGCCTGGCGGCCCTGCCAGAGCAGACACAAGTGTACTGCGCCCATGAATACACCCTCAGCAACCTGCGCTTCGcc > 1:155198/1‑147 (MQ=255) cTGTTCGCCGCCGGTTGCGGGCGCATGTTC‑GAAGGTACACCCGAACAGATGCAGCCCGCCCTCGCCCGCCTGGCGGCCCTGCCAGAGCAGACACAAGTGTACTGCGCCCATGAATACACCCTCAGCAACCTGCGCTTCGCCAAGGCtgt < 2:155198/149‑1 (MQ=255) ttCGCCGCCGGTTGCGGGCGCATGTTC‑GAAGGTACACCCGAACAGATGCAGCCCGCCCTCGCCCGCCTGGCGGCCCTGCCAGAGCAGACACAAGTGTACTGCGCCCATGAATACACCCTCAGCAACCTGCGCTTCGCCAAGGCtgtg < 7:68237/147‑1 (MQ=255) ttCGCCGCCGGTTGCGGGCGCATGTTC‑GAAGGTACACCCGAACAGATGCAGCCCGCCCTCGCCCGCCTGGCGGCCCTGCCAGAGCAGACACAAGTGTACTGCGCCCATGAATACACCCTCAGCAACCTGCGCTTCGCCAAGGCTGTGGa < 6:120713/149‑1 (MQ=255) gccgccGGTTGCGGGCGCATGTTC‑GAAGGTACACCCGAACAGATGCAGCCCGCCCTCGCCCGCCTGGCGGCCCTGCCAGAGCAGACACAAGTGTACTGCGCCCCTGAATACACCCTCAGCAACCTGCGCTTCGCCAAGGCTGTGGAAc < 1:241603/148‑1 (MQ=255) gccgccGGTTGCGGGCGCATGTTC‑GAAGGTACACCCGAACAGATGCAGCCCGCCCTCGCCCGCCTGGCGGCCCTGCCAGAGCAGACACAAGTGTACTGCGCCCATGAATACACCCTCAGCAACCTGCGCTTCGCCAAGGCTGTGGAAcc < 4:134525/149‑1 (MQ=255) ccgccgGTTGCGGGCGCATGTTC‑GAAGGTACACCCGAACAGATGCAGCCCGCCCTCGCCCGCCTGGCGGCCCTGCCAGAGCAGACACAAGTGTACTGCGCCCATGAATACACCCTCAGCAACCTGCGCTTCGCCAAGGCTGTGGAAcc > 2:7254/1‑148 (MQ=255) cgccgGTTGCGGGCGCATGTTC‑GAAGGTACACCCGAACAGATGCAGCCCGCCCTCGCCCGCCTGGCGGCCCTg > 6:327556/1‑73 (MQ=255) cgccgGTTGCGGGCGCATGTTC‑GAAGGTACACCCGAACAGATGCAGCCCGCCCTCGCCCGCCTGGCGGCCCTg < 5:327556/73‑1 (MQ=255) ggTTGCGGGCGCATGTTC‑GAAGGTACACCCGAACAGATGCAGCCCGCCCTCGCCCGCCTGGCGGCCCTGCCAGAGCAGACACAAGTGTACTGCGCCCATGAATACCCCCTCAGCAACCTGCGCTTCGCCAAGGCTGTGGAACCGACCaa > 4:19667/1‑149 (MQ=255) gggCGCATGTTC‑GAAGGTACACCCGAACAGATGCAgcccgcaaccggcggcgaacagggtgtcgccactgaacaggatgggcgttgctggctggtcgctgaagaaggcgatatgccccagggtgtggccgggtaccgccattacctgg < 4:9655‑M2/148‑114 (MQ=255) gcgcATGTTC‑GAAGGTACACCCGAACAGATGCAgcccgcaaccggcggcgaacagggtgtcgccactgaacaggatgggcgttgctggctggtcgctgaagaaggcgatatgccccagggtgtggccgggtaccgccattacctggaac < 5:4514‑M2/149‑117 (MQ=255) gcgcATGATC‑GAAGGAACACCCGAACAGATGCAGCCCGCACTCGCCCGCCTGGCGCCACTGCCAGAGCAGACACAACTGTACTGCGCCCATCAATACACCCACAGAAACCTGCGCTTCGCCAACGATCTGGAACAGACCAACCCGCACg > 4:144277/1‑149 (MQ=255) | GAAGGCGATAGGGTGGACGTGCTGGGTGTGACGTTCCAGGTAATGGCGGTACCCGGCCACACCCTGGGGCATATCGCCTTCTTCAGCGACCAGCCAGCAACGCCCATCCTGTTCAGTGGCGACACCCTGTTCGCCGCCGGTTGCGGGCGCATGTTC‑GAAGGTACACCCGAACAGATGCAGCCCGCCCTCGCCCGCCTGGCGGCCCTGCCAGAGCAGACACAAGTGTACTGCGCCCATGAATACACCCTCAGCAACCTGCGCTTCGCCAAGGCTGTGGAACCGACCAACCCGCACG > NC_002947/4681107‑4681401 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |