New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4955816 | 49 (0.910) | 3 (0.060) | 3/248 | NT | 5.7% | coding (939/1374 nt) | fliI | flagellum‑specific ATP synthase |
? | NC_002947 | = 4955847 | 53 (1.050) | coding (908/1374 nt) | fliI | flagellum‑specific ATP synthase |
GTAATGGCCTTCCTCAGCCAGCCGACGCGACAGTACAAAGTGGCCGTCAAGC‑ACGCCCCGCGCCGAGTCGGCGATCGGGTCTTGCTGATCGTCGCCTTCAGACAGCACGGTATAGAACGCAGTGATCGAACCACCGCCAGGTTCGCCATTGCCTGCCCGCTCCACCAGCTTGGGCAGCTTGGCG‑AACACCGAGGGCGGGTAACCCCGGGTGGCTGGCGGCTCGCCGATGGCCAGGGCAATTTCCCGCTGGGCCTGGGCGAAACGGGTCAACGAGTCCATCAGCAACAGCACATTC > NC_002947/4955669‑4955963 | gTAATGGCCTTCCTCAGCCAGCCGACGCGACAGTACAAAGTGGCCGTCAAGCAACGCCCCGCGCCCAGTCGGCGATCGGGTCTTGCTGATCGTCGCCTTCAGACAGCCCGGTATAGAACGCAGTGATCGAACCACCGCCAGGTTCGCCA > 1:84347‑M1/1‑149 (MQ=255) tAATGGCCTTCCTCAGCCAGCCGACGCGACAGTACAAAGTGGCCGTCAAGC‑ACGCCCCGCGCCGAGTCGGCGATCGGGTCTTGCTGATCGTCGCCTTCAGACAGCACGGTATAGAACGCAGTGATCGAACCACCGCCAGGTTCGCCAtt < 6:68647/149‑1 (MQ=255) tGGCCTTCCTCAGCCAGCCGACGCGACAGTACAAAGTGGCCGTCAAGC‑ACGCCCCGCGCCGAGTCGGCGATCGGGTCTTGCTGATCGTCGCCTTCAGACAGCACGGTATAGAACGCAGTGATCGAACCACCGCCAGGTTCGCCATtgcc > 6:222125/1‑149 (MQ=255) tCAGCCAGCCGACGCGACAGTACAAAGTGGCCGTCAAGC‑ACGCCCCGCGCCGAGTCGGCGATCGGGTCTTGCTGATCGTCGCCTTCAGACAGCACGGTATAGAACGCAGTGATCGAACCACCGCCAGGTTCGCCATTGCCTGCCCGCTc > 8:134034/1‑149 (MQ=255) tCAGCCAGCCGACGCGACAGTACAAAGTGGCCGTCAAGC‑ACGCCCCGCGCCGAGTCGGCGATCGGGTCTTGCTGATCGTCGCCTTCAGACAGCACGGTATAGAACGCAGTGATCGAACCACCGCCAGGTTCGCCATTGCCTGCCCGCTc > 7:80225/1‑149 (MQ=255) gccagccGACGCGACAGTACAAAGTGGCCGTCAAGC‑ACGCCCCGCGCCGAGTCGGCGATCGGGTCTTGCTGATCGTCGCCTTCAGACAGCACGGTATAGAACGCAGTGATCGAACCACCGCCAGGTTCGCCATTGCCTGCCCGCTccac < 7:134034/149‑1 (MQ=255) gcgACAGTACAAAGTGGCCGTCAAGC‑ACGCCCCGCGCCGAGTCGGCGATCGGGTCTTGCTGATCGTCGCCTTCAGACAGCACGGTATAGAACGCAGTGATCGAACCACCGCCAGGTTCGCCATTGCCTGCCCGCTCCACCAGCTTGGGc < 1:327841/149‑1 (MQ=255) gACAGTACAAAGTGGCCGTCAAGC‑ACGCCCCGCGCCGAGTCGGCGATCGGGTCTTGCTGATCGTCGCCTTCAGACAGCACGGTATAGAACGCAGTGATCGAACCACCGCCAGGTTCGCCATTGCCTGCCCGCTCCACCAGCTTGGGCAg > 5:223895/1‑149 (MQ=255) aGTACAAAGTGGCCGTCAAGC‑ACGCCCCGCGCCGAGTCGGCGATCGGGTCTTGCTGATCGTCGCCTTCAGACAGCACGGTATAGAACGCAGTGATCGAACCACCGCCAGGTTCGCCATTGCCTGCCCGCTCCACCAGCTTGGGCAGCTt < 8:137160‑M2/149‑2 (MQ=255) cAAAGTGGCCGTCAAGC‑ACGCCCCGCGCCGAGTCGGCGATCGGGTCTTGCTGATCATCGCCTTCAGACAGCACGGTATAGAACGCAGTGATCGAACCACCGCCAGGTTCGCCATTGCCTGCCCGCTCCACCAGCTTGGGCAGCTtggc > 8:84040‑M2/1‑144 (MQ=255) aGTGGCCGTCAAGC‑ACGCCCCGCGCCGAGTCGGCGATCGGGTCTTGCTGATCGTCGCCTTCAGACAGCACGGTATAGAACGCAGTGATCGAACCACCGCCAGGTTCGCCAagctgcccaagctggtggagcgggcaggcaatggcgaac < 6:129829‑M1/149‑40 (MQ=255) gTGGCCGTCAAGC‑ACGCCCCGCGCCGAGTCGGCGATCGGGTCTTGCTGATCGTCGCCTTCAGACAGCACGGTATAGAACGCAGTGATCGAACCACCGCCAGGTTCGCCATTGCCTGCCCGCTCCACCAGCTTGGGCAGCTTGGCG‑Aaca < 4:19803/149‑1 (MQ=255) ccGTCAAGC‑ACGCCCCGCGCCGAGTCGGCGATCGGGTCTTGCTGATCGTCGCCTTCAGACAGCACGGTATAGAACGCAGTGATCGAACCACCGCCAGGTTCGCCATTGCCTGCCCGCTCCACCAGCTTGGGCAGCTTGGCG‑AACAcc > 2:104759/1‑147 (MQ=255) ccGTCAAGC‑ACGCCCCGCGCCGAGTCGGCGATCGGGTCTTGCTGATCGTCGCCTTCAGACAGCACGGTATAGAACGCAGTGATCGAACCACCGCCAGGTTCGCCATTGCCTGCCCGCTCCACCAGCTTGGGCAGCTTGGCG‑AACACCGa < 1:104759/149‑1 (MQ=255) gTCAAGC‑ACGCCCCGCGCCGAGTCGGCGATCGGGTCTTGCTGATCGTCGCCTTCAGACAGCACGGTATAGAACGCAGTGATCGAACCACCGCCAGGTTCGCCATTGCCTGCCCGCTCCACCAGCTTGGGCAGCTTGGCG‑AACACCGAgg < 7:137160/149‑1 (MQ=255) aGC‑ACGCCCCGCGCCGAGTCGGCGATCGGGTCTTGCTGATCGTCGCCTTCAGACAGCACGGTATAGAACGCAGTGATCGAACCACCGCCAGGTTCGCCATTGCCTGCCCGCTCCACCAGCTTGGGCAGCTTGGCG‑AACACCGAGGGCgg < 5:222125/149‑1 (MQ=255) gC‑ACGCCCCGCGCCGAGTCGGCGATCGGGTCTTGCTGATCGTCGCCTTCAGACAGCACGGTATAGAACGCAGTGATCGAACCACCGCCAGGTTCGCCATTGCCTGCCCGCTCCACCAGCTTGGGCAGCTTGGCG‑AACACCGAg < 4:285756/143‑1 (MQ=255) gC‑ACGCCCCGCGCCGAGTCGGCGATCGGGTCTTGCTGATCGTCGCCTTCAGACAGCACGGTATAGAACGCAGTGATCGAACCACCGCCAGGTTCGCCATTGCCTGCCCGCTCCACCAGCTTGGGCAGCTTGGCG‑AACACCGAg > 3:285756/1‑143 (MQ=255) gC‑ACGCCCCGCGCCGAGTCGGCGATCGGGTCTTGCTGATCGTCGCCTTCAGACAGCACGGTATAGAACGCAGTGATCGAACCACCGCCAGGTTCGCCATTGCCTGCCCGCTCCACCAGCTTGGGCAGCTTGGCG‑AACACCGAGGGCggg > 6:43483/1‑149 (MQ=255) cGCCCCGCGCCGAGTCGGCGATCGGGTCTTGCTGATCGTCGCCTTCAGACAGCACGGTATAGAACGCAGTGATCGAACCACCGCCAGGTTCGCCATTGCCTGCCCGCTCCACCAGCTTGGGCAGCTTGGCG‑AACACCGAGGGCGGGTa < 2:191575/148‑1 (MQ=255) cGCCCCGCGCCGAGTCGGCGATCGGGTCTTGCTGATCGTCGCCTTCAGACAGCACGGTATAGAACGCAGTGATCGAACCACCGCCAGGTTCGCCATTGCCTGCCCGCTCCACCAGCTTGGGCAGCTTGGCG‑AACACCGAGGGCGGGTa > 1:191575/1‑148 (MQ=255) cccGCGCCGAGTCGGCGATCGGGTCTTGCTGATCGTCGCCTTCAGACAGCACGGTATAGAACGCAGTGATCGAACCACCGCCAGGTTCGCCATTGCCTGCCCGCTCCACCAGCTTGGGCAGCTTGGCG‑AACACCGAGGGCGGGTAAccc > 3:283946/1‑149 (MQ=255) gAGTCGGCGATCGGGTCTTGCTGATCGTCGCCTTAAGACAGCCCGGTATAGCACGCAGTGATAGAACCACCGCCAGGTTCGCCATTGCCTGCCCGCTCCCCCAGATTGCGCAGCTTGGCG‑AACACCGAGGGCGGGTAACCCCGGGtggc > 6:17496/1‑149 (MQ=255) gCGATCGGCTCTTGCTGATCGTCGCCTTCAGACAGCACGGTATAGAACGCAGTGATCGAACCACCGCCAGGTTCGCCATTGCCTGCCCGCTCCACCAGCTTGGGCAGCTTGGCG‑AACACCGAGGGCGGGTAACCCCGGGTGGCTggcgg > 4:197073/1‑149 (MQ=255) gATCGGGTCTTGCTGATCGTCGCCTTCAGACAGCACGGTATAGAACGCAGTGATCGAACCACCGCCAGGTTCGCCAagctgcccaagctggtggagcgggcaggcaatgg > 6:14826‑M1/1‑76 (MQ=255) gATCGGGTCTTGCTGATCGTCGCCTTCAGACAGCACGGTATAGAACGCAGTGATCGAACCACCGCCAGGTTCGCCAagctgcccaagctggtggagcgggcaggcaatgg < 5:14826‑M1/110‑35 (MQ=255) gATCGGGTCTTGCTGATCGTCGCCTTCAGACAGCACGGTATAGAACGCAGTGATCGAACCACCGCCAGGTTCGCCATTGCCTGCCCGCTCCACCAGCTTGGGCAGCTTGGCG‑AACACCGAGGGCGGGTAACCCCGGGTGGCTGGCGGCt > 5:161855/1‑149 (MQ=255) gATCGGGTCTTGCTGATCGTCGCCTTCAGACAGCACGGTATAGAACGCAGTGATCGAACCACCGCCAGGTTCGCCATTGCCTGCCCGCTCCACCAGCTTGGGCAGCTTGGCG‑AACACCGAGGGCGGGTAACCCCGGGTGGCTGGCGGCt < 5:17496/149‑1 (MQ=255) ttGCTGATCGTCGCCTTCAGACAGCACGGTATAGAACGCAGTGATCGAACCACCGCCAGGTTCGCCATTGCCTGCCCGCTCCACCAGCTTGGGCAGCTTGGCG‑AACACCGAGGGCGGGTAACCCCGGGTGGCTGGCGGCTCGCCGATgg > 6:24795/1‑149 (MQ=255) gCTGATCGTCGCCTTCAGACAGCACGGTATAGAACGCAGTGATCGAACCACCGCCAGGTTCGCCATTGCCTGCCCGCTCCACCAGCTTGGGCAGCTTGGCG‑AACACCGAGGGCGGGTAACCCCGGGTGGCTGGCGGCTCGCCGATGGc > 7:70772/1‑148 (MQ=255) cTGATCGTCGCCTTCAGTCAGCACGGTATAGAACGCAGTGATCGAACCACCGCCAGGTTCGCCATTGCCTGGCCGCTCCACCAGCTTGGGCAGCTTGGCGCTACACCGAGGGCGGGTAACCCCGGGTGGCTGGCGGCTCGCCGATGGc < 1:75027/148‑1 (MQ=255) gATCGTCGCCTTCAGACAGCACGGTATAGAACGCAGTGATCGAACCACCGCCAGGTTCGCCATTGCCTGCCCGCTCCACCAGCTTGGGCAGCTTGGCG‑AACACCGAGGGCGGGTAACCCCGGGTGGCTGGCGGCTCGCCGATGGCCAgg > 1:298715/1‑149 (MQ=255) gATCGTCGCCTTCAGACAGCACGGTATAGAACGCAGTGATCGAACCACCGCCAGGTTCGCCATTGCCTGCCCGCTCCACCAGCTTGGGCAGCTTGGCG‑AACACCGAGGGCGGGTAACCCCGGGTGGCTGGCGGCTCGCCGATGGCCAgg > 3:182977/1‑149 (MQ=255) tcgtcgCCTTCAGACAGCACGGTATAGAACGCAGTGATCGAACCACCGCCAGGTTCGCCATTGCCTGCCCGCTCCACCAGCTTGGGCAGCTTGGCG‑AACACCGAGGGCGGGTAACCCCGGGTGGCTGGCGGCTCGCCGATGGCCAGGGc < 4:283946/149‑1 (MQ=255) cgtcgCCTTCAGACAGCACGGTATAGAACGCAGTGATCGAACCACCGCCAGGTTCGCCATTGCCTGCCCGCTCCACCAGCTTGGGCAGCTTGGCG‑AACACCGAGGGCGGGTAACCCCGGGTGGCTGGCGGCTCGCCGATGGCCAGGGc > 2:216161/1‑148 (MQ=255) gtcgCCTTCAGACAGCACGGTATAGAACGCAGTGATCGAACCACCGCCAGGTTCGCCATTGCCTGCCCGCTCCACCAGCTTGGGCAGCTTGGCG‑AACACCGAGGGCGGGTAACCCCGGGTGGCTGGCGGCTCGCCGATGGCCAGGGCaa > 1:119422/1‑149 (MQ=255) gCCTTCAGACAGCACGGTATAGAACGCAGTGATCGAACCACCGCCAGGTTCGCCATTGCCTGCCCGCTCCACCAGCTTGGGCAGCTTGGCG‑AACACCGAGGGCGGGTAACCCCGGGTGGCTGGCGGCTCGCCGATGGCCAGGGCAAttt > 8:1798/1‑149 (MQ=255) gCCTTCAGACAGCACGGTATAGAACGCAGTGATCGAACCACCGCCAGGTTCGCCATTGCCTGCCCGCTCCACCAGCTTGGGCAGCTTGGCG‑AACACCGAGGGCGGGTAACCCCGGGTGGCTGGCGGCTCGCCGATGGCCAGGGCAAttt > 4:112380/1‑149 (MQ=255) ttCAGACAGCACGGTATAGAACGCAGTGATCGAACCACCGCCAGGTTCGCCATTGCCTGCCCGCTCCACCAGCTTGGGCAGCTTGGCG‑AACACCGAGGGCGGGTAACCCCGGGTGGCTGGCGGCTCGCCGATGGCCAGGGCAATTTccc > 2:188762/1‑149 (MQ=255) cAGACAGCACGGTATAGAACGCAGTGATCGAACCACCGCCAGGTTCGCCATTGCCTGCCCGCTCCACCAGCTTGGGCAGCTTGGCG‑AACACCGAGGGCGGGTAACCCCGGGTGGCTGGCGGCTCGCCGATGGCCAGGGCAATTTCCCg < 6:49705/148‑1 (MQ=255) cAGACAGCACGGTATAGAACGCAGTGATCGAACCACCGCCAGGTTCGCCATTGCCTGCCCGCTCCACCAGCTTGGGCAGCTTGGCG‑AACACCGAGGGCGGGTAACCCCGGGTGGCTGGCGGCTCGCCGATGGCCAGGGCAATTTCCCGc > 3:68749/1‑149 (MQ=255) aCAGCACGGTATAGAACGCAGTGATCGAACCACCGCCAGGTTCGCCATTGCCTGCCCGCTCCACCAGCTTGGGCAGCTTGGCG‑AACACCGAGGGCGGGTAACCCCGGGTGGCTGGCGGCTCGCCGATGGCCAGGGCAATTTCCCGctgg < 8:231303/149‑1 (MQ=255) aGCACGGTATAGAACGCAGTGATCGAACCACCGCCAGGTTCGCCATTGCCTGCCCGCTCCACCAGCTTGGGCAGCTTGGCG‑AACACCGAGGGCGGGTAACCCCGGGTGGCTGGCGGCTCGCCGATGGCCAGGGCAATTTCCCGctgggc < 8:70772/149‑1 (MQ=255) cACGGTATAGAACGCAGTGATCGAACCACCGCCAGGTTCGCCATTGCCTGCCCGCTCCACCAGCTTGGGCAGCTTGGCG‑AACACCGAGGGCGGGTAACCCCGGGTGGCTGGCGGCTCGCCGATGGCCAGGGCAATTTCCCGctgggcct < 3:112380/149‑1 (MQ=255) cGGTATAGAACGCAGTGAGCGAACCACCGCCAGGTTCGCCATTGCCTGCCCGCTCCACCAGCTTGGGCAGCTTGGCG‑AACACCGAGGGCGGGTAACCCCGGGTGGCTGGCGGCTCGCCGATGGCCAGGGCAATTTCCCGctgggcctgg < 4:253141/149‑1 (MQ=255) aGAACGCAGTGATCGAACCACCGCCAGGTTCGCCATTGCCTGCCCGCTCCACCAGCTTGGGCAGCTTGGCG‑AACACCGAGGGCGGGTAACCCCGGGTGGCTGGCGGCTCGCCGATGGCCAGGGCAATTTCCCGCTGGGCCTGGGCGaaa > 2:246438/1‑149 (MQ=255) aCGCAGTGATCGAACCACCGCCAGGTTCGCCATTGCCTGCCCGCTCCACCAGCTTGGGCAGCTTGGCG‑AACACCGAGGGCGGGTAACCCCGGGTGGCTGGCGGCTCGCCGATGGCCAGGGCAATTTCCCGCTGGGCCTGGGCGAAACgg < 6:223895/149‑1 (MQ=255) cGCAGTGATCGAACCACCGCCAGGTTCGCCATTGCCTGCCCGCTCCACCAGCTTGGGCAGCTTGGCG‑AACACCGAGGGCGGGTAACCCCGGGTGGCTGGCGGCTCGCCGATGGCCAGGGCAATTTCCCGctgggc < 4:147760/135‑1 (MQ=255) cGCAGTGATCGAACCACCGCCAGGTTCGCCATTGCCTGCCCGCTCCACCAGCTTGGGCAGCTTGGCG‑AACACCGAGGGCGGGTAACCCCGGGTGGCTGGCGGCTCGCCGATGGCCAGGGCAATTTCCCGctgggc > 3:147760/1‑135 (MQ=255) cAGTGATCGAACCACCGCCAGGTTCGCCATTGCCTGCCCGCTCCACCAGCTTGGGCAGCTTGGCG‑AACACCGAGGGCGGGTAACCCCGGGTGGCTGGCGGCTCGCCGATGGCCAGGGCAATTTCCCGCTGGGCCTGGGCGAAACGGGTc < 8:80225/149‑1 (MQ=255) gTGATCGAACCACCGCCAGGTTCGCCATTGCCTGCCCGCTCCACCAGCTTGGGCAGCTTGGCG‑AACACCGAGGGCGGGTAACCCCGGGTGGCTGGCGGCTCGCCGATGGCCAGGGCAATTTCCCGCTGGGCCTGGGCGAAACGGGTCaa < 1:216161/149‑1 (MQ=255) tGATCGAACCACCGCCAGGTTCGCCATTGCCTGCCCGCTCCACCAGCTTGGGCAGCTTGGCG‑AACACCGAGGGCGGGTAACCCCGGGTGGCTGGCGGCTCGCCGATGGCCAGGGCAATTTCCCGCTGGGCCTGGGCGAAACGGGTCAAc < 2:298715/149‑1 (MQ=255) tGATCGAACCACCGCCAGGTTCGCCATTGCCTGCCCGCTCCACCAGCTTGGGCAGCTTGGCG‑AACACCGAGGGCGGGTAACCCCGGGTGGCTGGCGGCTCGCCGATGGCCAGGGCAATTTCCCGCTGGGCCTGGGCGAAACGGGTCAAc < 5:43483/149‑1 (MQ=255) tGATCGAACCACCGCCAGGTTCGCCATTGCCTGCCCGCTCCACCAGCTTGGGCAGCTTGGCG‑AACACCGAGGGCGGGTAACCCCGGGTGGCTGGCGGCTCGCCGATGGCCAGGGCAATTTCCCGCTGGGCCTGGGCGAAACGGGTCAAc < 3:197073/149‑1 (MQ=255) aaCCACCGCCAGGTTCGCCATTGCCTGCCCGCTCCACCAGCTTGGGCAGCTTGGCG‑AACACCGAGGGCGGGTAACCCCGGGTGGCTGGCGGCTCGCCGATGGCCAGGGCAATTTCCCGCTGGGCCTGGGCGAAACGGGTCAACGAGTcc < 1:246438/149‑1 (MQ=255) accaccGCCAGGTTCGCCATTGCCTGCCCGCTCGACCAGCTTGGGCAGCTTGGCG‑AACACCGAGGGCGGGTAACCCCGGGTGGCTGGCGGCTCGCCGATGGCCAGGGCAATTTCCCGCTGGGCCTGGGCGAAACGGGTCAACGAGTCCa < 2:84347/149‑1 (MQ=255) cGCCAGGTTCGCCATTGCCTGCCCGCTCCACCAGCTTGGGCAGCTTGGCG‑AACACCGAGGGCGGGTAACCCCGGGTGGCTGGCGGCTCGCCGATGGCCAGGGCAATTTCCCGCTGGGCCTGGGCGAAACGGGTCAACGAGTCCATCAg > 4:202818/1‑148 (MQ=255) gTTCGCCATTGCCTGCCCGCTCCACCAGCTTGGGCAGCTtggcgaacctggcggtggttcgatcactgcgttctataccgtgctgtctgaaggcgacgatcagcaagacccgatcgccgactcggcgcggggcgtgcttgacggccact < 6:129829‑M2/149‑111 (MQ=255) gCCAagctgcccaagctggtggagcgggcaggcaatggcgaacctggcggtggttcgatcactgcgttctataccgtgctgtctgaaggcgatgatcagcaagacccgatcgccgactcggcgcggggcgtgcttgacggccactttg > 8:84040‑M1/1‑4 (MQ=255) ccATTGCCTGCCCGCTCCACCAGCTTGGGCAGCTtggcgaacctggcggtggttcgatcactgcgttctataccgtgctgtctgaaggcgacgatcagcaagacccgatc > 6:14826‑M2/1‑34 (MQ=255) ccATTGCCTGCCCGCTCCACCAGCTTGGGCAGCTtggcgaacctggcggtggttcgatcactgcgttctataccgtgctgtctgaaggcgacgatcagcaagacccgatc < 5:14826‑M2/110‑77 (MQ=255) aagctgcccaagctggtggagcgggcaggcaatggcgaacctggcggtggttcgatcactgcgttctataccgtgctgtctgaaggcgacgatcagcaagacccgatcgccgactcggcgcggggcgtgcttgacggccactttgtact < 8:137160‑M1/149‑149 (MQ=255) | GTAATGGCCTTCCTCAGCCAGCCGACGCGACAGTACAAAGTGGCCGTCAAGC‑ACGCCCCGCGCCGAGTCGGCGATCGGGTCTTGCTGATCGTCGCCTTCAGACAGCACGGTATAGAACGCAGTGATCGAACCACCGCCAGGTTCGCCATTGCCTGCCCGCTCCACCAGCTTGGGCAGCTTGGCG‑AACACCGAGGGCGGGTAACCCCGGGTGGCTGGCGGCTCGCCGATGGCCAGGGCAATTTCCCGCTGGGCCTGGGCGAAACGGGTCAACGAGTCCATCAGCAACAGCACATTC > NC_002947/4955669‑4955963 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |