| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 5371490 | 55 (1.020) | 3 (0.060) | 3/256 | NT | 5.6% | coding (447/3231 nt) | carB | carbamoyl‑phosphate synthase large subunit |
| ? | NC_002947 | = 5371541 | 47 (0.900) | coding (396/3231 nt) | carB | carbamoyl‑phosphate synthase large subunit | |||||
CCACGGGTGCAGATTTCTTCGAACTCTTCACGGTTGTAAGCGATACCGCCGCCGGTGCCGCCCATGGTGAACGACGGGCGAATGATGCACGGGAAGCCGAGCTTCTCGAGGACCGCATTGGCCTCTTCCATGCTGTGGGCGA‑TACCGGAGCGCGGGCACTCCAGGCCGATGTCCTTCATGGCCTTGTCGAAGCGCGAACGGTCTTCGGCCTTGTCGATGGTGTCAGCGTTGGCACCGATCATCTCCACGCCGAACTTCTCCAGAACGCCGTGGCGCTCCAGGTCCAGGGCGCAG > NC_002947/5371344‑5371637 | ccACGGGGGCAGATTTCTTCGAACTCTTCACGCCTGTAAGCGATCCCGCCGCCGGCGCCGCCCATGGTCACCGCCGGGCGAATGATGCACGGGAAGCCGAGCTTCTCGAGGACCGCCTTGGCCTCTTCCATGCTGTCGGCGA‑TACCGGa < 2:294757/149‑1 (MQ=255) aCGGGTGCAGATTTCTTCGAACTCTTCACGGTTGTAAGGGATACCGCCGCCGGTGCCGCCCATGGTGAACGACGGGCGAATGATGCACGGGAAGCCGAGCTTCTCGAGGACCGCATTGGCCTCTTCCATGCTGTGGGCGA‑TACCGGAgc < 7:231669/149‑1 (MQ=255) aCGGGTGCAGATTTCTTCGAACTCTTCACGGTTGTAAGCGATACCGCCGCCGGTGCCGCCCATGGTGAACGACGGGCGAATGATGCACGGGAAGCCGAGCTTCTCGAGGACCGAATTGGCCTCTTCCATGCTGTGGGCGA‑TACCGGAgc > 3:27559/1‑149 (MQ=255) cGGGTGCAGATTTCTTCGAACTCTTCACGGTTGTAAGCGATACCGCCGCCGGTGCCGCCCATGGTGAACGACGGGCGAATGATGCACGGGAAGCCGAGCTTCTCGAGGACCGCATTGGCCTCTTCCATGCTGTGGGCGA‑TACCGGAgcg > 2:70823/1‑149 (MQ=255) ggTGCAGATTTCTTCGAACTCTTCACGGTTGTAAGCGATACCGCCGCCGGTGCCACCCATGGTGAACGACGGGCGAATGATGCACGGGAAGCCGAGCTTCTCGAGGACCGCATTGGCCTCTTCCATGCTGTGGGCGA‑TACCGGAGcgcg < 1:18321/149‑1 (MQ=255) gTGCAGATTTCTTCGAACTCTTCACGGTTGTAAGCGATACCGCCGCCGGTGCCGCCCATGGTGAACGACGGGCGAATGATGCACGGGAAGCCGAGCTTCTCGAGGACCGCATTGGCCTCTTCCATGCTGTGGGCGA‑TACCGGAGCGCgg < 1:1931/149‑1 (MQ=255) aGATTTCTTCGAACTCTTCACGGTTGTAAGCGATACCGCCGCCGGTGCCGCCCATGGTGAACGACGGGCGAATGATGCACGGGAAGCCGAGCTTCTCGAGGACCGCATTGGCCTCTTCCATGCTGTGGGCGA‑TACCGGAGCGCGGGCAc > 4:132802/1‑149 (MQ=255) cttcGAACTCTTCCCGGTTGTAAGCGATACCGCCGCCGGGGCCACCCATGGTGAACGACGGGCGAATGATGCCCGGGAAGCCGAGCTTCTCGAGGACCGCATTGGCCTCTTCCATGCTGTGGGCGT‑TACCGGAGCGCGGGCACTCCAg < 7:211574/148‑1 (MQ=255) ttcGAACTCTTCACGGTTGTAAGCGATACCGCCGCCGGTGCCGCCCATGGTGAACGACGGGTGAATGATGCACGGGAAGCCGAGCTTCTCGAGGACCGCATTGGCCTCTTCCATGCTGTGGGCGA‑TACCGGAGCGCGGGCACTCCAGGc > 2:51540/1‑149 (MQ=255) ttcGAACTCATCACCGTTGTAAGCGATACCGCCGCCGGAGCCGCCCATCGTTAACGACGCGCGAATGATGCACGGCAAGCCGAGCTTCTCGAGGACAGCATTCGCCTCTACCAAGCTGAGGGCGA‑AACCGGAGCGCGGGCACTCCAGGc > 4:63950/1‑149 (MQ=255) cGAACTCTTCACGGTTGTAAGCGATACCGCCGCCGGTGCCGCCCATGGTGAACGACGGGCGAATGATGCACGGGAAGCCGAGCTTCTCGAGGACCGCATTGGCCTCTTCCATGCTGTGGGCGA‑TACCGGAGCGCGGGCACTCCAGGcc > 2:199973/1‑148 (MQ=255) gAACTCTTCACGGTTGTAAGCGATACCGCCGCCGGTGCCGCCCATGGTGAACGACGGGTGAATGATGCACGGGAAGCCGAGCTTCTCGAGGACCGCATTGGCCTCTTCCATGCTGTGGGCGA‑TACCGGAGCGCGGGCACTCCAGGCCGa < 1:51540/149‑1 (MQ=255) aaCTCTTCACGGTGGTAACCGATACCGCCGCCGGTGCCGCCCATGGTGAACGACGGGCGAATGATGCACGGGAAGCCGAGCTTCTCGAGGACCGCATTGGCCTCTTCCATGCTGTGGGCGA‑TACCGGAGCGCGGGCACTCCAGGCCGAt < 8:13834/149‑1 (MQ=255) tctTCACGGTTGTAAGCGATACCGCCGCCGGTGCCGCCCATGGTGAACGACGGGCGAATGATGCACGGGAAGCCGAGCTTCTCGAGGACCGCATTGGCCTCTTCCATGCTGTGGGCGA‑TACCGGAGCGCGGGCACTCCAGGCCGATGTc > 3:40747/1‑149 (MQ=255) ttCACGGTTGTAAGCGATACCGCCGCCGGTGCCGCCCATGGTGAACGACGGGCGAATGATGCACGGGAAGCCGAGCTTCTCGAGGACCGCATTGGCCTCTTCCATGCTGTGGGCGA‑TACCGGAGCGCGGGCACTCCAGGCCGATGTc < 4:40747/147‑1 (MQ=255) ttCACGGTTGTAAGCGATACCGCCGCCGGTGCCGCCCATGGTGAACGACGGGCGAATGATGCACGGGAAGCCGAGCTTCTCGAGGACCGCATTGGCCTCTTCCATGCTGTGGGCGA‑TACCGGAGCGCGGGCACTCCAGGCCGATGTCCt > 5:221481/1‑149 (MQ=255) cACGGTTGTAAGCGATACCGCCGCCGGTGCCGCCCATGGTGAACGACGGGCGAATGATGCACGGGAAGCCGAGCTTCTCGAGGACCGCATTGGCCTCTTCCATGCTGTGGGCGA‑TACCGGAGCGCGGGCACTCCAGGCCGATGTCCtt > 1:15730/1‑148 (MQ=255) ggTTGTAAGCGATACCGCCGCCGGTGCCGCCCATGGTGAACGACGGGCGAATGATGCACGGGAAGCTGAGCTTCTCGAGGACCGCATTGGCCTCTTCCATGCTCTGGGCGA‑TACCGGAGCGCGGGCACTCCAGGCCGATGTCCTTCATg < 1:238951/149‑1 (MQ=255) ggTTGTAAGCGATACCGCCGCCGGTGCCGCCCATGGTGAACGACGGGCGAATGATGCACGGGAAGCCGAGCTTCTCGAGGACCGCATTGGCCTCTTCCATGCTGTGGGCGA‑TACCGGAGCGCGGGCACTCCAGGCCGATGTCCTTCATg < 3:28195/149‑1 (MQ=255) gTAAGCGATACCGCCGCCGGTGCCGCCCATGGTGAACGACGGGCGAATGATGCACGGGAAGCCGAGCTTCTCGAGGACCGCATTGGCCTCTTCCATGCTGTGGGCGA‑TACCGttcgcgcttcgacaaggccatgaaggacatcggcctg > 2:192920‑M1/1‑112 (MQ=255) tAAGCGATACCGCCGCCGGTGCCGCCCATGGTGAACGACGGGCGAATGATGCACGGGAAGCCGAGCTTCTCGAGGACCGCATTGGCCTCTTCCATGCTGTGGGCGA‑TACCGGAGCGCGGGCACTCCa > 6:126338/1‑127 (MQ=255) tAAGCGATACCGCCGCCGGTGCCGCCCATGGTGAACGACGGGCGAATGATGCACGGGAAGCCGAGCTTCTCGAGGACCGCATTGGCCTCTTCCATGCTGTGGGCGA‑TACCGGAGCGCGGGCACTCCa < 5:126338/127‑1 (MQ=255) gCGATACCGCCGCCGGTGCCGCCCATTGTGAACGACGGGCGAATGATGCACGGGAAGCCGAGCTTCTCGAGGACCGCATTGGCCTCTTCCATGCTGTGGGCGACTACCGGAGCGCGGGCACTCCAGGCCGATGTCCTTCATGGCCTTGt < 1:70823/149‑1 (MQ=255) gCGATACCGCCGCCGGTGCCGCCCATGGTGAACGACGGGCGAATGATGCACGGGAAGCCGAGCTTCTCGAGGACCGCATTGGCCTCTTCCATGCTGTGGGCGA‑TACCGGAGCGCGGGCACTCCAGGCCGATGTCCTTCATGGCCTTGTc > 1:313264/1‑149 (MQ=255) gATACCGCCGCCGGTGCCGCCCATGGTGAACGACGGGCGAATGATGCACGGGAAGCCGAGCTTCTCGAGGACCGCATTGGCCTCTTCCATGCTGTGGGCGA‑TACCGGAGCGCGGGCACTCCAGGCCGATGTCCTTCATGGCCTTGTCg > 8:191271/1‑148 (MQ=255) gATACCGCCGCCGGTGCCGCCCATGGTGAACGACGGGCGAATGATGCACGGGAAGCCGAGCTTCTCGAGGACCGCATTGGCCTCTTCCATGCTGTGGGCGA‑TACCGGAGCGCGGGCACTCCAGGCCGATGTCCTTCATGGCCTTGTCg > 4:64530/1‑148 (MQ=255) ccgccgccgGTGCCGCCCATGGTGAACGACGGGCGAATGATGCACGGGAAGCCGAGCTTCTCGAGGACCGCATTGGCCTCTTCCATGCTGTGGGCGA‑TACCGGAGCGCGGGCACTCCAGGCCGATGTCCTTCATGGCCTTGTCGAAgc < 3:132802/148‑1 (MQ=255) gTGCCGCCCATGGTGACCGACGGGCGAATGTTGCACGGGAAGCCGAGCTTCTCGAGGACCGCATTGGCCTCTTCCATGCTGTGGGCGA‑TACCTGAGCGCGGGCACTCCAGGCCGATGTCCTTCATGGCCTTGTCGAAGCGCGAACGGTc < 5:237193/149‑1 (MQ=255) gTGCCGCCCATGGTGAACGACGGGCGAATGATGCACGGGAAGCCGAGCTTCTCGAGGACCGCATTGGCCTCTTCCATGCTGTGGGCGA‑TACCGGAGCGCGGGCACTCCAGGCCGATGTCCTTCATGGCCTTGTCGAAgc > 4:207510/1‑139 (MQ=255) gTGCCGCCCATGGTGAACGACGGGCGAATGATGCACGGGAAGCCGAGCTTCTCGAGGACCGCATTGGCCTCTTCCATGCTGTGGGCGA‑TACCGGAGCGCGGGCACTCCAGGCCGATGTCCTTCATGGCCTTGTCGAAgc < 3:207510/139‑1 (MQ=255) gTGCCGCCCATGGTGAACGACGGGCGAATGATGCACGGGAAGCCGAGCTTCTCGAGGACCGCATTGGCCTCTTCCATGCTGTGGGCGA‑TACCGGAGCGCGGGCACTCCAGGCCGATGTCCTTCATGGCCTTGTCGAAGCGCGAACGGTc > 8:247993/1‑149 (MQ=255) gccgccCATGGTGAACGACGGGCGAATGATGCACGGGAAGCCGAGCTTCTCGAGGACCGCATTGGCCTCTTCCATGCTGTGGGCGA‑TACCGttcgcgcttcgacaaggccatgaaggacatcggcctggagtgcccgcgctccggtatc < 1:192920‑M1/149‑59 (MQ=255) ccgccCATGGTGAACGACGGGCGAATGATGCACGGGAAGCCGAGCTTCTCGAGGACCGCATTGGCCTCTTCCATGCTGTGGGCGA‑TACCGGAGCGCGGGCACTCCAGGCCGATGTCCTTCATGGCCTTGTCGAAGCGCGAACGGTCTTc < 6:221481/149‑1 (MQ=255) cgccCATGGTGAACGACGGGCGAATGATGCACGGGAAGCCGAGCTTCTCGAGGACCGCATTGGCCTCTTCCATGCTGTGGGCGA‑TACCGttcgcgcttcgacaaggccatgaaggacatcggcctggagtgcccgcgctccggtatcgc < 5:41295‑M1/149‑61 (MQ=255) ccATGGTGAACGACGGGCGAATGATGCACGGGAAGCCGAGCTTCTCGAGGACCGCATTGGCCTCTTCCATGCTGTGGGCGA‑TACCGGAGCGCGGGCACTCCAGGCCGATGTCCTTCATGGCCTTGTCGAAGCGCGAACGGTCTTCGGcc < 2:313264/149‑1 (MQ=255) aaCGACGGGCGAATGATGCACGGGAAGCCGAGCTTCTCGAGGACCGCATTGGCCTCTTCCATGCTGTGGGCGA‑TACCGGAGCGCGGGCACTCCAGGCCGATGTCCTTCATGGCCTTGTCGAAGCGCGAACGGTCTTCGGCCTTGTCGAt > 5:215170/1‑149 (MQ=255) acgacgGGCGAATGATGCACGGGAAGCCGAGCTTCTCGAGGACCGCATTGGCCTCTTCCATGCTGTGGGCGA‑TACCGGAGCGCGGGCACTCCAGGCCGATGTCCTTCATGGCCTTGTCGAAGCGCGAACGGTCTTCGGCCTTGTCGATg < 3:64530/149‑1 (MQ=255) acgtgagAATGATGCACGTGAAGCCGAGCTTCTCGAGGACCGCATTGGCCTATTCCATGCTGTGGGCGA‑TACCGGAGCGCGGGCACTCCAGGCCGATGTCCTTCATGGCCTTGTCGAAGCGCGAACGGTCTTCGGCCTTGTCGATGgtg < 4:27559/143‑1 (MQ=255) cACGGGAAGCCGAGCTTCTCGAGGACCGCATTGGCCTCTTCCATGCTGTGGGCGA‑TACCGGAGCGCGGGCACTCCAGGCCGATGTCCTTCATGGCCTTGTCGAAGCGCGAACGGTCTTCGGCCTTGTCGATGGTGTCAGCGTTGGCAc < 1:199973/148‑1 (MQ=255) aCGGGAAGCCGAGCTTCTCGAGGACCGCATTGGCCTCTTCCATGCTGTGGGCGA‑TACCGGAGCGCGGGCACTCCAGGCCGATGTCCTTCATGGCCTTGTCGAAGCGCGAACGGTCTTCGGCCTTGTCGATGGTGTCAGCGTTGGCAcc > 6:259168/1‑148 (MQ=255) cGGGAAGCCGAGCTTCTCGAGGACCGCATTGACCTCTTCCATGCTGTGGGCGA‑TACCGGAGCGCGGGCACTCCAGGCCGATGTCCTTCATGGCCTTGTCGAAGCGCGAACGGTCTTCGGCCTTGTCGATGGTGCCAACGCTGACAccat < 8:18648/149‑3 (MQ=255) gggAAGCCGAGCTTCTCGAGGACCGCATTGGCCTCTTCCATGCTGTGGGCGA‑TACCGGAGCGCGGGCACTCCAGGCCGATGTCCTTCATGGCCTTGTCGAAGCGCGAACGGTCTTCGGCCTTGTCGATGGTGTCAGCGTTGGCACCGat > 4:297838/1‑149 (MQ=255) aaGCCGAGCTTCTCGAGGACCGCATTGGCCTCTTCCATGCTGTGGGCGA‑TACCGGAGCGCGGGCACTCCAGGCCGATGTCCTTCATGGCCTTGTCGAAGCGCGAACGGTCTTCGGCCTTGTCGATGGTGTCAGCGTTGGCACCGatcat < 2:15730/149‑1 (MQ=255) ccGAGCTTCTCGAGGACCGCATTGGCCTCTTCCATGCTGTGGGCGA‑TACCGGAGCGCGGGCACTCCAGGCCGATGTCCTTCATGGCCTTGTCGAAGCGCGAACGGTCTTCGGCCTTGTCGATGGTGTCAGCGTTGGCACCGATCAtctc < 8:36149/149‑1 (MQ=255) cGAGCTTCTCGAGGACCGCATTGGCCTCTTCCATGCTGTGGGCGA‑TACCGGAGCGCGGGCACTCCAGGCCGATGTCCTTCATGGCCTTGTCGAAGCGCGAACGGTCTTCGGCCTTGTCGATGGTGTCAGCGTTGGCACCGATCAtctc > 8:5698/1‑148 (MQ=255) cGAGCTTCTCGAGGACCGCATTGGCCTCTTCCATGCTGTGGGCGA‑TACCGGAGCGCGGGCACTCCAGGCCGATGTCCTTCATGGCCTTGTCGAAGCGCGAACGGTCTTCGGCCTTGTCGATGGTGTCAGCGTTGGCACCGATCAtctc < 7:191271/148‑1 (MQ=255) gAGCTTCTCGAGGACCGCATTGGCCTCTTCCATGCTGTGGGCGA‑TACCGGAGCGCGGGCACTCCAGGCCGATGTCCTTCATGGCCTTGTCGAAGCGCGAACGGACTTCGGCCTTGTCGATGGTGTCAGCGTTGGCACCGATCATCTCCa > 3:233015/1‑149 (MQ=255) ttCTCGAGGACCGCATTCGACTATTCCATGCTCTGGGCGA‑TACCGGAGCGCGGGCACTCCACGCCGATGTCCTTCATGGACTTGTCGAAGCGCGAACGGTCTTCGGCCTAGTCCATGGTCTCAGCGTTGGCACCGATCATCTCCAcccc > 2:283241/1‑149 (MQ=255) gACCGCATTGGCCTCTTCCATGCTGTGGGCGA‑TACCGGAGCGCGGGCACTCCAGGCCGATGTCCTTCATGGCCTTGTCGAAGCGCGAACGGTCTTCGGCCTTGTCGATGGTGTCAGCGTTGGCACCGATCATCTCCACGCCGAACTtct > 8:5977/1‑149 (MQ=255) gACCGCATTGGCCTCTTCCATGCTGTGGGCGA‑TACCGGAGCGCGGGCACTCCAGGCCGATGTCCTTCATGGCCTTGTCGAAGCGCGAACGGTCTTCGGCCTTGTCGATGGTGTCAGCGTTGGCACCGATCATCTCCACGCCGAACTtct > 4:277905/1‑149 (MQ=255) gCCTCTTCCATGCTGTGGGCGA‑TACCGGAGCGCGGGCACTCCAGGCCGATGTCCTTCATGGCCTTGTCGAAGCGCGAACGGTCTTCGGCCTTGTCGATGGTGTCAGCGTTGGCACCGATCATCTCCACGCCGAACTTCTCCAGAACGcc > 6:232757/1‑149 (MQ=255) gCCTCTTCCATGCTGTGGGCGA‑TACCGGAGCGCGGGCACTCCAGGCCGATGTCCTTCATGGCCTTGTCGAAGCGCGAACGGTCTTCGGCCTTGTCGATGGTGTCAGCGTTGGCACCGATCATCTCCACGCCGAACTTCTCCAGAACGcc > 7:101603/1‑149 (MQ=255) ctctTCCATGCTGTGGGCGA‑TACCGGAGCGCGGGCACTCCAGGCCGATGTCCTTCATGGCCTTGTCGAAGCGCGAACGGTCTTCGGCCTTGTCGATGGTGTCAGCGTTGGCACCGATCATCTCCACGCCGAACTtc < 2:6827/136‑1 (MQ=255) ctctTCCATGCTGTGGGCGA‑TACCGGAGCGCGGGCACTCCAGGCCGATGTCCTTCATGGCCTTGTCGAAGCGCGAACGGTCTTCGGCCTTGTCGATGGTGTCAGCGTTGGCACCGATCATCTCCACGCCGAACTtc > 1:6827/1‑136 (MQ=255) ctctTCCATGCTGTGGGCGA‑TACCGGAGCGCGGGCACTCCAGGCCGATGTCCTTCATGGCCTTGTCGAAGCGCGAACGGTCTTCGGCCTTGTCGATGGTGTCAGCGTTGGCACCGATCATCTCCACGCCGAACTTCTCCAGAACGCCGt > 1:331872/1‑149 (MQ=255) ttCCATGCTGTGGGCGA‑TACCGGAGCGCGGGCACTCCAGGCCGATGTCCTTCATGGCCTTGTCGAAGCGCGAACGGTCTTCGGCCTTGTCGATGGTGTCAGCGTTGGCACCGATCATCTCCACGCCGaa > 6:78001/1‑129 (MQ=255) ttCCATGCTGTGGGCGA‑TACCGGAGCGCGGGCACTCCAGGCCGATGTCCTTCATGGCCTTGTCGAAGCGCGAACGGTCTTCGGCCTTGTCGATGGTGTCAGCGTTGGCACCGATCATCTCCACGCCGaa < 5:78001/129‑1 (MQ=255) ttCCATGCTGTGGGCGA‑TACCGGAGCGCGGGCACTCCAGGCCGATGTCCTTCATGGCCTTGTCGAAGCGCGAACGGTCTTCGGCCTTGTCGATGGTGTCAGCGTTGGCACCGATCATCTCCACGCCGAACTTCTCCAGAACGCCGTg < 5:232757/147‑1 (MQ=255) ccATGCTGTGGGCGA‑TACCGGAGCGCGGGCACTCCAGGCCGATGTCCTTCATGGCCTTGTCGAAGCGCGAACGGTCTTCGGCCTTGTCGATGGTGTCAGCGTTGGCACCGATCATCTCCACGCCGAACTTCTCCAGAACGCCGTgg < 7:247993/146‑1 (MQ=255) ccATGCTGTGGGCGA‑TACCGGAGCGCGGGCACTCCAGGCCGATGTCCTTCATGGCCTTGTCGAAGCGCGAACGGTCTTCGGCCTTGTCGATGGTGTCAGCGTTGGCACCGATCATCTCCACGCCGAACTTCTCCAGAACGCCGTgg < 8:200293/146‑1 (MQ=255) tGCTGTGGGCGA‑TACCGGAGCGCGGGCACTCCAGGCCGATGTCCTTCATGGCCTTGTCGAAGCGCGAACGGTCTTCGGCCTTGTCGATGGTGTCAGCGTTGGCACCGATCATCTCCACGCCGAACTTCTCCAGAACGCCGTGGCGCtcc < 8:101603/149‑1 (MQ=255) tgtgGGCGA‑TACCGGAGCGCGGGCACTCCAGGCCGATGTCCTTCATGGCCTTGTCGAAGCGCGAACGGTCTTCGGCCTTGTCGATGGTGTCAGCGTTGGCACCGATCATCTCCACGCCGAACTTCTCCAGAACGCCGTGGCGCtccagg > 5:110359/1‑149 (MQ=255) gCGA‑TACCGGAGCGCGGGCACTCCAGGCCGATGTCCTTCATGGCCTTGTCGAAGCGCGAAcggtatcgcccacagcatggaagaggccaatgcggtcctcgagaagctcggcttcccgtgcatcattcgcccgtcgttcaccatgggcg < 5:41295‑M2/149‑90 (MQ=255) gA‑TACCGGAGCGCGGGCACTCCAGGCCGATGTCCTTCATGGCCTTGTCGAAGCGCGAAcggtatcgcccacagcatggaagaggccaatgcggtcctcgagaagctcggcttcccgtgcatcattcgcccgtcgttcaccatgggcggc < 1:192920‑M2/149‑92 (MQ=255) cGGAGCGCGGGCACTCCAGGCCGATGTCCTTCATGGCCTTGTCGAAGCGCGAACGGTCTTCGGCCTTGTCGATGGTGTCAGCGTTGGCACCGATCATCTCCAc < 7:270764/103‑1 (MQ=255) cGGAGCGCGGGCACTCCAGGCCGATGTCCTTCATGGCCTTGTCGAAGCGCGAACGGTCTTCGGCCTTGTCGATGGTGTCAGCGTTGGCACCGATCATCTCCAc > 8:270764/1‑103 (MQ=255) cGGAGCGCGGGCACTCCAGGCCGATGTCCTTCATGGCCTTGTCGAAGCGCGAACGGTCTTCGGCCTTGTCGATGGTGTCAGCGTTGGCACCGATCATCTCCACGCCGAACTTCTCCAGAACGCCGTGGCGCTCCAGGTCCAGGGCGCAg > 3:312871/1‑149 (MQ=255) | CCACGGGTGCAGATTTCTTCGAACTCTTCACGGTTGTAAGCGATACCGCCGCCGGTGCCGCCCATGGTGAACGACGGGCGAATGATGCACGGGAAGCCGAGCTTCTCGAGGACCGCATTGGCCTCTTCCATGCTGTGGGCGA‑TACCGGAGCGCGGGCACTCCAGGCCGATGTCCTTCATGGCCTTGTCGAAGCGCGAACGGTCTTCGGCCTTGTCGATGGTGTCAGCGTTGGCACCGATCATCTCCACGCCGAACTTCTCCAGAACGCCGTGGCGCTCCAGGTCCAGGGCGCAG > NC_002947/5371344‑5371637 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |