New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5371490 | 55 (1.020) | 3 (0.060) | 3/256 | NT | 5.6% | coding (447/3231 nt) | carB | carbamoyl‑phosphate synthase large subunit |
? | NC_002947 | = 5371541 | 47 (0.900) | coding (396/3231 nt) | carB | carbamoyl‑phosphate synthase large subunit |
GTGCCGCCCATGGTGAACGACGGGCGAATGATGCACGGGAAGCCGAGCTTCTCGAGGACCGCATTGGCCTCTTCCATGCTGTGGGCGATACCGGAGCGCGGGCACTCCAGGCCGATGTCCTTCATGGCCTTGTCGAAGCGCGAACGGTCTTCGGCCTTGTCGATGGTGTCAGCGTTGGCACCGATCATCTCCACGCCGAACTTCTCCAGAACGCCGTGGCGCTCCAGGTCCAGGGCGCAGTTCAGGGCGGTCTGGCCACCCATGGTCGGCAGGACGGCGTCCGGGCGCTCTT > NC_002947/5371398‑5371689 | gTGCCGCCCATGGTGACCGACGGGCGAATGTTGCACGGGAAGCCGAGCTTCTCGAGGACCGCATTGGCCTCTTCCATGCTGTGGGCGATACCTGAGCGCGGGCACTCCAGGCCGATGTCCTTCATGGCCTTGTCGAAGCGCGAACGGTc < 5:237193/149‑1 (MQ=255) gTGCCGCCCATGGTGAACGACGGGCGAATGATGCACGGGAAGCCGAGCTTCTCGAGGACCGCATTGGCCTCTTCCATGCTGTGGGCGATACCGGAGCGCGGGCACTCCAGGCCGATGTCCTTCATGGCCTTGTCGAAGCGCGAACGGTc > 8:247993/1‑149 (MQ=255) ccgccCATGGTGAACGACGGGCGAATGATGCACGGGAAGCCGAGCTTCTCGAGGACCGCATTGGCCTCTTCCATGCTGTGGGCGATACCGGAGCGCGGGCACTCCAGGCCGATGTCCTTCATGGCCTTGTCGAAGCGCGAACGGTCTTc < 6:221481/149‑1 (MQ=255) ccATGGTGAACGACGGGCGAATGATGCACGGGAAGCCGAGCTTCTCGAGGACCGCATTGGCCTCTTCCATGCTGTGGGCGATACCGGAGCGCGGGCACTCCAGGCCGATGTCCTTCATGGCCTTGTCGAAGCGCGAACGGTCTTCGGcc < 2:313264/149‑1 (MQ=255) aaCGACGGGCGAATGATGCACGGGAAGCCGAGCTTCTCGAGGACCGCATTGGCCTCTTCCATGCTGTGGGCGATACCGGAGCGCGGGCACTCCAGGCCGATGTCCTTCATGGCCTTGTCGAAGCGCGAACGGTCTTCGGCCTTGTCGAt > 5:215170/1‑149 (MQ=255) acgacgGGCGAATGATGCACGGGAAGCCGAGCTTCTCGAGGACCGCATTGGCCTCTTCCATGCTGTGGGCGATACCGGAGCGCGGGCACTCCAGGCCGATGTCCTTCATGGCCTTGTCGAAGCGCGAACGGTCTTCGGCCTTGTCGATg < 3:64530/149‑1 (MQ=255) acgtgagAATGATGCACGTGAAGCCGAGCTTCTCGAGGACCGCATTGGCCTATTCCATGCTGTGGGCGATACCGGAGCGCGGGCACTCCAGGCCGATGTCCTTCATGGCCTTGTCGAAGCGCGAACGGTCTTCGGCCTTGTCGATGgtg < 4:27559/143‑1 (MQ=255) cACGGGAAGCCGAGCTTCTCGAGGACCGCATTGGCCTCTTCCATGCTGTGGGCGATACCGGAGCGCGGGCACTCCAGGCCGATGTCCTTCATGGCCTTGTCGAAGCGCGAACGGTCTTCGGCCTTGTCGATGGTGTCAGCGTTGGCAc < 1:199973/148‑1 (MQ=255) aCGGGAAGCCGAGCTTCTCGAGGACCGCATTGGCCTCTTCCATGCTGTGGGCGATACCGGAGCGCGGGCACTCCAGGCCGATGTCCTTCATGGCCTTGTCGAAGCGCGAACGGTCTTCGGCCTTGTCGATGGTGTCAGCGTTGGCAcc > 6:259168/1‑148 (MQ=255) cGGGAAGCCGAGCTTCTCGAGGACCGCATTGACCTCTTCCATGCTGTGGGCGATACCGGAGCGCGGGCACTCCAGGCCGATGTCCTTCATGGCCTTGTCGAAGCGCGAACGGTCTTCGGCCTTGTCGATGGTGCCAACGCTGACAccat < 8:18648/149‑3 (MQ=255) gggAAGCCGAGCTTCTCGAGGACCGCATTGGCCTCTTCCATGCTGTGGGCGATACCGGAGCGCGGGCACTCCAGGCCGATGTCCTTCATGGCCTTGTCGAAGCGCGAACGGTCTTCGGCCTTGTCGATGGTGTCAGCGTTGGCACCGat > 4:297838/1‑149 (MQ=255) aaGCCGAGCTTCTCGAGGACCGCATTGGCCTCTTCCATGCTGTGGGCGATACCGGAGCGCGGGCACTCCAGGCCGATGTCCTTCATGGCCTTGTCGAAGCGCGAACGGTCTTCGGCCTTGTCGATGGTGTCAGCGTTGGCACCGatcat < 2:15730/149‑1 (MQ=255) ccGAGCTTCTCGAGGACCGCATTGGCCTCTTCCATGCTGTGGGCGATACCGGAGCGCGGGCACTCCAGGCCGATGTCCTTCATGGCCTTGTCGAAGCGCGAACGGTCTTCGGCCTTGTCGATGGTGTCAGCGTTGGCACCGATCAtctc < 8:36149/149‑1 (MQ=255) cGAGCTTCTCGAGGACCGCATTGGCCTCTTCCATGCTGTGGGCGATACCGGAGCGCGGGCACTCCAGGCCGATGTCCTTCATGGCCTTGTCGAAGCGCGAACGGTCTTCGGCCTTGTCGATGGTGTCAGCGTTGGCACCGATCAtctc < 7:191271/148‑1 (MQ=255) cGAGCTTCTCGAGGACCGCATTGGCCTCTTCCATGCTGTGGGCGATACCGGAGCGCGGGCACTCCAGGCCGATGTCCTTCATGGCCTTGTCGAAGCGCGAACGGTCTTCGGCCTTGTCGATGGTGTCAGCGTTGGCACCGATCAtctc > 8:5698/1‑148 (MQ=255) gAGCTTCTCGAGGACCGCATTGGCCTCTTCCATGCTGTGGGCGATACCGGAGCGCGGGCACTCCAGGCCGATGTCCTTCATGGCCTTGTCGAAGCGCGAACGGACTTCGGCCTTGTCGATGGTGTCAGCGTTGGCACCGATCATCTCCa > 3:233015/1‑149 (MQ=255) ttCTCGAGGACCGCATTCGACTATTCCATGCTCTGGGCGATACCGGAGCGCGGGCACTCCACGCCGATGTCCTTCATGGACTTGTCGAAGCGCGAACGGTCTTCGGCCTAGTCCATGGTCTCAGCGTTGGCACCGATCATCTCCAcccc > 2:283241/1‑149 (MQ=255) gACCGCATTGGCCTCTTCCATGCTGTGGGCGATACCGGAGCGCGGGCACTCCAGGCCGATGTCCTTCATGGCCTTGTCGAAGCGCGAACGGTCTTCGGCCTTGTCGATGGTGTCAGCGTTGGCACCGATCATCTCCACGCCGAACTtct > 4:277905/1‑149 (MQ=255) gACCGCATTGGCCTCTTCCATGCTGTGGGCGATACCGGAGCGCGGGCACTCCAGGCCGATGTCCTTCATGGCCTTGTCGAAGCGCGAACGGTCTTCGGCCTTGTCGATGGTGTCAGCGTTGGCACCGATCATCTCCACGCCGAACTtct > 8:5977/1‑149 (MQ=255) gCCTCTTCCATGCTGTGGGCGATACCGGAGCGCGGGCACTCCAGGCCGATGTCCTTCATGGCCTTGTCGAAGCGCGAACGGTCTTCGGCCTTGTCGATGGTGTCAGCGTTGGCACCGATCATCTCCACGCCGAACTTCTCCAGAACGcc > 7:101603/1‑149 (MQ=255) gCCTCTTCCATGCTGTGGGCGATACCGGAGCGCGGGCACTCCAGGCCGATGTCCTTCATGGCCTTGTCGAAGCGCGAACGGTCTTCGGCCTTGTCGATGGTGTCAGCGTTGGCACCGATCATCTCCACGCCGAACTTCTCCAGAACGcc > 6:232757/1‑149 (MQ=255) ctctTCCATGCTGTGGGCGATACCGGAGCGCGGGCACTCCAGGCCGATGTCCTTCATGGCCTTGTCGAAGCGCGAACGGTCTTCGGCCTTGTCGATGGTGTCAGCGTTGGCACCGATCATCTCCACGCCGAACTtc > 1:6827/1‑136 (MQ=255) ctctTCCATGCTGTGGGCGATACCGGAGCGCGGGCACTCCAGGCCGATGTCCTTCATGGCCTTGTCGAAGCGCGAACGGTCTTCGGCCTTGTCGATGGTGTCAGCGTTGGCACCGATCATCTCCACGCCGAACTtc < 2:6827/136‑1 (MQ=255) ctctTCCATGCTGTGGGCGATACCGGAGCGCGGGCACTCCAGGCCGATGTCCTTCATGGCCTTGTCGAAGCGCGAACGGTCTTCGGCCTTGTCGATGGTGTCAGCGTTGGCACCGATCATCTCCACGCCGAACTTCTCCAGAACGCCGt > 1:331872/1‑149 (MQ=255) ttCCATGCTGTGGGCGATACCGGAGCGCGGGCACTCCAGGCCGATGTCCTTCATGGCCTTGTCGAAGCGCGAACGGTCTTCGGCCTTGTCGATGGTGTCAGCGTTGGCACCGATCATCTCCACGCCGaa < 5:78001/129‑1 (MQ=255) ttCCATGCTGTGGGCGATACCGGAGCGCGGGCACTCCAGGCCGATGTCCTTCATGGCCTTGTCGAAGCGCGAACGGTCTTCGGCCTTGTCGATGGTGTCAGCGTTGGCACCGATCATCTCCACGCCGaa > 6:78001/1‑129 (MQ=255) ttCCATGCTGTGGGCGATACCGGAGCGCGGGCACTCCAGGCCGATGTCCTTCATGGCCTTGTCGAAGCGCGAACGGTCTTCGGCCTTGTCGATGGTGTCAGCGTTGGCACCGATCATCTCCACGCCGAACTTCTCCAGAACGCCGTg < 5:232757/147‑1 (MQ=255) ccATGCTGTGGGCGATACCGGAGCGCGGGCACTCCAGGCCGATGTCCTTCATGGCCTTGTCGAAGCGCGAACGGTCTTCGGCCTTGTCGATGGTGTCAGCGTTGGCACCGATCATCTCCACGCCGAACTTCTCCAGAACGCCGTgg < 7:247993/146‑1 (MQ=255) ccATGCTGTGGGCGATACCGGAGCGCGGGCACTCCAGGCCGATGTCCTTCATGGCCTTGTCGAAGCGCGAACGGTCTTCGGCCTTGTCGATGGTGTCAGCGTTGGCACCGATCATCTCCACGCCGAACTTCTCCAGAACGCCGTgg < 8:200293/146‑1 (MQ=255) tGCTGTGGGCGATACCGGAGCGCGGGCACTCCAGGCCGATGTCCTTCATGGCCTTGTCGAAGCGCGAACGGTCTTCGGCCTTGTCGATGGTGTCAGCGTTGGCACCGATCATCTCCACGCCGAACTTCTCCAGAACGCCGTGGCGCtcc < 8:101603/149‑1 (MQ=255) tgtgGGCGATACCGGAGCGCGGGCACTCCAGGCCGATGTCCTTCATGGCCTTGTCGAAGCGCGAACGGTCTTCGGCCTTGTCGATGGTGTCAGCGTTGGCACCGATCATCTCCACGCCGAACTTCTCCAGAACGCCGTGGCGCtccagg > 5:110359/1‑149 (MQ=255) gCGATACCGGAGCGCGGGCACTCCAGGCCGATGTCCTTCATGGCCTTGTCGAAGCGCGAAcggtatcgcccacagcatggaagaggccaatgcggtcctcgagaagctcggcttcccgtgcatcattcgcccgtcgttcaccatgggcg < 5:41295‑M2/149‑90 (MQ=255) gATACCGGAGCGCGGGCACTCCAGGCCGATGTCCTTCATGGCCTTGTCGAAGCGCGAAcggtatcgcccacagcatggaagaggccaatgcggtcctcgagaagctcggcttcccgtgcatcattcgcccgtcgttcaccatgggcggc < 1:192920‑M2/149‑92 (MQ=255) cGGAGCGCGGGCACTCCAGGCCGATGTCCTTCATGGCCTTGTCGAAGCGCGAACGGTCTTCGGCCTTGTCGATGGTGTCAGCGTTGGCACCGATCATCTCCAc > 8:270764/1‑103 (MQ=255) cGGAGCGCGGGCACTCCAGGCCGATGTCCTTCATGGCCTTGTCGAAGCGCGAACGGTCTTCGGCCTTGTCGATGGTGTCAGCGTTGGCACCGATCATCTCCAc < 7:270764/103‑1 (MQ=255) cGGAGCGCGGGCACTCCAGGCCGATGTCCTTCATGGCCTTGTCGAAGCGCGAACGGTCTTCGGCCTTGTCGATGGTGTCAGCGTTGGCACCGATCATCTCCACGCCGAACTTCTCCAGAACGCCGTGGCGCTCCAGGTCCAGGGCGCAg > 3:312871/1‑149 (MQ=255) cgGGCACTCCAGGCCGATGTCCTTCATGGCCTTGTCGAAGCGCGAACGGTCTTCGGCCTTGTCGATGGTGTCAGCGTTGGCACCGATCATCTCCACGCCGAACTTCTCCAGAACGCCGTGGCGCTCCAGGTCCAGGGCGCAGTTCAggg < 2:331872/149‑1 (MQ=255) tCCAGGCCGATGTCCTTCATGGCCTTGTCGAAGCGCGAACGGTCTTCGGCCTTGTCGATGGTGTCAGCGTTGGCACCGATCATCTCCACGCCGAACTTCTCCAGAACGCCGTGGCGCTCCAGGTCCAGGGCGCAGTTCAGGGCGGTCTg > 4:204476/1‑149 (MQ=255) ccAGGCCGATGTCCTTCATGGCCTTGTCGAAGCGCGAACGGTCTTCGGCCTTGTCGATGGTGTCAGCGTTGGCACCGATCATCTCCACGCCGAACTTCTCCAGAACGCCGTGGCGCTCCAGGTCCAggg < 2:139063/129‑1 (MQ=255) cAGGCCGATGTCCTTCATGGCCTTGTCGAAGCGCGAAcggtatcgcccacagcatggaagaggccaatgcggtcctcgagaagctcggcttcccgtgcatcattcgcccgtcgttcaccatgggcggcaccggcggcggtatcgcttac > 2:192920‑M2/1‑37 (MQ=255) gCCGATGTCCTTCATGGCCTTGTCGAAGCGCGAACGGTCTTCGGCCTTGTCGATGGTGTCAGCGTTGGCACCGATCATCTCCACGCCGAACTTCTCCAGAACGCCGTGGCGCTCCAGGTCCAGGGCGCAGTTCAGGGCGGTCTGGCCAc > 4:281710/1‑149 (MQ=255) cGATGTCCTTCATGGCCTTGTCGAAGCGCGAACGGTCTTCGGCCTTGACGATGGTGTCAGCGTTGGCACCGATCATCTCCACGCCGAACTTCTCCAGAACGCCGTGGCGCTCCAGGTCCAGGGCGCAGTTCAGGGCGGTCTGGCCAcc > 1:72877/1‑148 (MQ=255) ccTTCATGGCCTTGTCGAAGCGCGAACGGTCTTCGGCCTTGTCGATGGTGTCAGCGTTGGCACCGat > 5:211134/1‑67 (MQ=255) ccTTCATGGCCTTGTCGAAGCGCGAACGGTCTTCGGCCTTGTCGATGGTGTCAGCGTTGGCACCGat < 6:211134/67‑1 (MQ=255) cTTCATGGCCTTGTCGAAGCGCGAACGGTCTTCGGCCTTGTCGATGGTGTCAGCGTTGGCACCGATCATCTCCACGCCGAACTTCTCCAGAACGCCGTGGCGCTCCAGGTCCAGGGCGCAGTTCAGGGCGGTCTGGCCACCCATGGTc < 5:259168/148‑1 (MQ=255) ttCATGGCCTTGTCGAAGCGCGAACGGTCTTCGGCCTTGTCGATGGTGTCAGCGTTGGCACCGATCATCTCCACGCCGAACTTCTCCAGAACGCCGTGGCGCTCCAGGTCCAGGGCGCAGTTCAGGGCGGTCTGGCCACCCATGGTCgg > 5:308995/1‑149 (MQ=255) gCCTTGTCGAAGCGCGAACGGTCTTCGGCCTTGTCGATGGTGTCAGCGTTGGCACCGATCATCTCCACGCCGAACTTCTCCAGAACGCCGTGGCGCTCCAGGTCCAGGGCGCAGTTCAGGGCGGTCTGGCCACCCATGGTCGGCAGGa < 7:5977/148‑1 (MQ=255) ccTTGTCGAAGCGCGAACGGTCTTCGGCCTTGTCGATGGTGACAGCGTTGGCACCGATCATCTCCACGCCGAACTTCTCCAGAACGCCGTGGCGCTCCAGGTCCAGGGCGCAGTTCAGGGCGGTCTGGCCACCCATGGTCGGCAGGACg < 1:113954/149‑1 (MQ=255) ttGTCGAAGCGCGAACGGTCTTCGGCCTTGTCGATGGTGTCAGCGTTGGCACCGATCATCTCCACGCCGAACTTCTCCAGAACGCCGTGGCGCTCCAGGTCCAGGGCGCAGTTCAGGGCGGTCTGGCCACCCATGGTCGGCAGGACGGc > 4:79730/1‑149 (MQ=255) gTCGAAGCGCGAACGGTCTTCGGCCTTGTCGATGGTGTCAGCGTTGGCACCGATCATCTCCACGCCGAACTTCTCCAGAACGCCGTGGCGCTCCAGGTCCAGGGCGCAGTTCAGGGCGGTCTGGCCACCCATGGTCGGCAGGACGGc < 3:204476/147‑1 (MQ=255) aaGCGCGAACGGTCTTCGGCCTTGTCGATGGTGTCAGCGTTGGCACCGATCATCTCCACGCCGAACTTCTCCAGAACGCCGTGGCGCTCCAGGTCCAGGGCGCAGTTCAGGGCGGTCTGGCCACCCATGGTCGGCAGGACGGCGTCCgg < 3:63950/149‑1 (MQ=255) aaGCGCGAACGGTCTTCGGCCTTGTCGATGGTGTCAGCGTTGGCACCGATCATCTCCACGCCGAACTTCTCCAGAACGCCGTGGCGCTCCAGGTCCAGGGCGCAGTTCAGGGCGGTCTGGCCACCCATGGTCGGCAGGACGGCGTCCgg > 4:162264/1‑149 (MQ=255) aaGCGCGAACGGTCTTCGGCCTTGTCGATGGTGTCAGCGTTGGCACCGATCATCTCCACGCCGAACTTCTCCAGAACGCCGTGGCGCTCCAGGTCCAGGGCGCAGTTCAGGGCGGTCTGGCCACCCATGGTCGGCAGGACGGCGTCCgg < 4:258219/149‑1 (MQ=255) aCGGTCTTCGGCCTTGTCGATGGTGTCAGCGTTGGCACCGATCATCTCCACGCCGAACTTCTCCAGAACGCCGTGGCGCTCCAGGTCCAGGGCGCAGTTCAGGGCGGTCTGGCCACCCATGGTCGGCAGGACGGCGTCCGGGCGCTCtt > 4:253028/1‑149 (MQ=255) | GTGCCGCCCATGGTGAACGACGGGCGAATGATGCACGGGAAGCCGAGCTTCTCGAGGACCGCATTGGCCTCTTCCATGCTGTGGGCGATACCGGAGCGCGGGCACTCCAGGCCGATGTCCTTCATGGCCTTGTCGAAGCGCGAACGGTCTTCGGCCTTGTCGATGGTGTCAGCGTTGGCACCGATCATCTCCACGCCGAACTTCTCCAGAACGCCGTGGCGCTCCAGGTCCAGGGCGCAGTTCAGGGCGGTCTGGCCACCCATGGTCGGCAGGACGGCGTCCGGGCGCTCTT > NC_002947/5371398‑5371689 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |