New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5789571 | 65 (1.210) | 7 (0.140) | 6/246 | NT | 9.8% | coding (728/1278 nt) | ynfM | efflux transporter |
? | NC_002947 | = 5789591 | 69 (1.380) | coding (748/1278 nt) | ynfM | efflux transporter |
CTGGCACACGGCGATGCTGACCATTGGCGGCCTGGCCCTGGTGGCCGCGCTGGTATTCTGGAAGGTGCTGCCGGAGTCACGCAATTTCCGCGCACAGACGATGAACCCACGCAGCCTGCTGGACGGCTTTGTCATGCACTTCAAGGACGCCGGCCTGCCCTGGCTGTTCCTTGAAGCCTTCCTGCTGATGGGCGCCTTCGTCACATTGTTCAACTACATCGGCTACCGCCTGCTGGCCGAGCCCTACCACATGAACCAGGCGCTGGTCGGCTTGCTGTCGGTGGTTTACCTGTC > NC_002947/5789425‑5789718 | cTGGCACACGGCGATGCTGACCATTGGCGGCCTGGCCCTGGTGGCCGCGCTGGTATTCTGGAAGGTGCTGCCGGAGTCACGCAATTTCCGCGCACAGACGATGAACCCACGCAGCCTGCTGGACGGCTTTGTCATGCACTTCAAGGACg > 7:222627/1‑149 (MQ=255) tGGCACACGGCGATGCTGACCATTGGCGGCCTGGCCCTGGTGGCCGCGCTGGTATTCTGCAAGGTGCTGCCGGAGTCACGCAATTTCCGCGCACAGACGATGAACCCACGCAGCCTGCTGGACGGCTTTGTCATGCACTTCAAGGACGc > 1:268278/1‑149 (MQ=255) acacGGCGATGCTGACCATTGGCGGCCTGGCCCTGGTGGCCGCGCTGGTATTCTGGAAGGTGCTGCCGGAGTCACGCAATTTCCGCGCACAGACGATGAACCCACGCAGCCTGCTGGACGGCTTTGTCATGCACTTCAAGGACGCCGGc > 6:136695/1‑149 (MQ=255) gATGCTGACCATTGGCGGCCTGGCCCTGGTGGCCGCGCTGGTATTCTGGAAGGTGCTGCCGGAGTCACGCAATTTCCGCGCACAGACGATGAACCCACGCAGCCTGCTGGACGGCTTTGTCATGCACTTCAAGGACGCCGGCCTGCCCt > 6:266398/1‑149 (MQ=255) tGCTGACCATTGGCGGCCTGGCCCTGGTGGCCGCGCTGGTATTCTGGAAGGTGCTGCCGGAGTCACGCAATTTCCGCGCACAGACGATGAACCCACGCAGCCTGCTGGACGGCTTTGTCATGCACTTCAAGGACGCCGGCCTGCCCTgg < 4:273614/149‑1 (MQ=255) gACCATTGGCGGCCTGGCCCTGGTGGCCGCGCTGGTATTCTGGAAGGTGCTGCCGGAGTCACGCAATTTCCGCGCACAGACGATGAACCCACGCAGCCTGCTGGACGGCTTTGTCATGCACTTCAAGGACGCCGGCCTGCCCTGGCTGt > 3:314446/1‑149 (MQ=255) gACCATTGGCGGCCTGGCCCTGGTGGCCGCGCTGGTATTCTGGAAGGTGCTGCCGGAGTCACGCAATTTCCGCGCACAGACGATGAACCCACGCAGCCTGCTGGACGGCTTTGTCATGCACTTCAAGGACGCCGGCCTGCCCTGGCTGt > 2:170989/1‑149 (MQ=255) ccATTGGCGGCCTGGCCCTGGTGGCCGCGCTGGTATTCTGGAAGGTGCTGCCGGAGTCACGCAATTTCCGCGCACAGACGATGAACCCACGCAGCCTGCTGGACGGCTTTGTCATGCACTTCAAGGACGCCGGCCTGCCCTGGCTGTtc > 4:314446‑M2/1‑147 (MQ=255) ccATTGGCGGCCTGGCCCTGGTGGCCGCGCTGGTATTCTGGAAGGTGCTGCCGGAGTCACGCAATTTCCGCGCACAGACGATGAACCCACGCAGCCTGCTGGACGGCTTTGTCATGCACTTCAAGGACGCCGGCCTGCCCTGGCTGTtc > 2:253757‑M2/1‑147 (MQ=255) ctgGCGGCCTGGCCCTGGTGGCCGCGCTGGTATTCTGGAAGGTGCTGCCGGAGTCACGCAATTTCCGCGCACAGACGATGAACCCACGCAGCCTGCTGGACGGCTTTGTCATGCACTTCAAGGACGCCGGCCTGCCCTGGCTGTtcctt > 7:313880‑M2/2‑144 (MQ=255) gcggcCTGGCCCTGGTGGCCGCGCTGGTATTCTGGAAGGTGCTGCCGGAGTCACGCAATTTCCGCGCACAGACGATGAACCCACGCAGCCTGCTGGACGGCTTTGTCATGCACTTCAAGGAacagccagggcaggccggcgtccttgaa < 2:228434‑M1/149‑29 (MQ=255) gcggcCTGGCCCTGGTGGCCGCGCTGGTATTCTGGAAGGTGCTGCCGGAGTCACGCAATTTCCGCGCACAGACGATGAACCCACGCAGCCTGCTGGACGGCTTTGTCATGCACTTCAAGGAacagccagggcaggccggcgtccttg > 6:140347‑M1/1‑121 (MQ=255) gcggcCTGGCCCTGGTGGCCGCGCTGGTATTCTGGAAGGTGCTGCCGGAGTCACGCAATTTCCGCGCACAGACGATGAACCCACGCAGCCTGCTGGACGGCTTTGTCATGCACTTCAAGGAacagccagggcaggacggcgtcattg > 6:315297‑M1/1‑121 (MQ=255) gcggcCTGGCCCTGGTGGCCGCGCTGGTATTCTGGAAGGTGCTGCCGGAGTCACGCAATTTCCGCGCACAGACGATGAACCCACGCAGCCTGCTGGACGGCTTTGTCATGCACTTCAAGGACGCCGGCCTGCCCTGGCTGTtccttg < 4:64453‑M2/147‑7 (MQ=255) cggcCTGGCCCTGGTGGCCGCGCTGGTATTCTGGAAGGTGCTGCCGTAGTCAAGCAATTTCCGCGCACAGACGATGAACCCACGCAGCCTGCTGTACGGCTTTGTCATGCACTTCAAGTAacagccagggcaggccggcgtccttgaag < 5:315297‑M1/149‑30 (MQ=255) ccTGGCCCTGGTGGCCGCGCTGGTATTCTGGAAGGTGCTGCCGGAGTCACGCAATTTCCGCGCACAGACGATGAACCCACGCAGCCTGCTGGACGGCTTTGTCATGCACTTCAAGGAacagccagggcaggccggcgtccttgaagtgc < 3:166837‑M1/149‑33 (MQ=255) gCCCTGGTGGCCGCGCTGGTATTCTGGAAGGTGCTGCCGGAGTCACGCAATTTCCGCGCACAGACGATGAACCCACGCAGCCTGCTGGACGGCTTTGTCATGCACTTCAAGGAacagccagggcaggccggcgtccttgaagtgcatg < 5:140347‑M1/148‑36 (MQ=255) gCCCTGGTGGCCGCGCTGGTATTCTGGAAGGTGCTGCCGGAGTCACGCAATTTCCGCGCACAGACGATGAACCCACGCAGCCTGCTGGACGGCTTTGTCATGCACTTCAAGGAacagccagggcaggccggcgtccttgaagtgcat < 2:316234‑M1/147‑35 (MQ=255) gCCCTGGTGGCCGCGCTGGTATTCTGGAAGGTGCTGCCGGAGTCACGCAATTTCCGCGCACAGACGATGAACCCACGCAGCCTGCTGGACGGCTTTGTCATGCACTTCAAGGACGCCGGCCTGCCCTGGCTGTTCCTTGAAGCCTTc < 8:222627/147‑1 (MQ=255) gCCCTGGTGGCCGCGCTGGTATTCTGGAAGGTGCTGCCGGAGTCACGCAATTTCCGCGCACAGACGATGAACCCACGCAGCCTGCTGGACGGCTTTGTCATGCACTTCAAGGACGCCGGCCTGCCCTGGCTGTTCCTTGAAGCCTTCct > 4:296655/1‑149 (MQ=255) ccTGGTGGCCGCGCTGGTATTCTGGAAGGTGCTGCCGGAGTCACGCAATTTCCGCGCACAGACGATGAACCCACGCAGCCTGCTGGACGGCTTTGTCATGCACTTCAAGGACGCCGGCCTGCCCTGGCTGTTCCTTGAAGCCTTCctgc > 1:150164/1‑149 (MQ=255) ccTGGTGGCCGCGCTGGTATTCTGGAAGGTGCTGCCGGAGTCACGCAATTTCCGCGCACAGACGATGAACCCACGCAGCCTGCTGGACGGCTTTGTCATGCACTTCAAGGACGCCGGCCTGCCCTGGCTGTTCCTTGAAGCCTTCctgc < 6:162863/149‑1 (MQ=255) ccTGGTGGCCGCGCTGGTATTCTGGAAGGTGCTGCCGGAGTCACGCAATTTCCGCGCACAGACGATGAACCCACGCAGCCTGCTGGACGGCTTTGTCATGCACTTCAAGGACGCCGGCCTGCCCTGGCTGTTCCTTGAAGCCTTCctgc > 1:155377/1‑149 (MQ=255) gtggCCGCGCTGGTATTCTGGAAGGTGCTGCCGGAGTCACGCAATTTCCGCGCACAGACGATGAACCCACGCAGCCTGCTGGACGGCTTTGTCATGCACTTCAAGGACGCCGGCCTGCCCTGGCTGTTCCTTGAAGCCTTCCTGCTGa < 5:136695/148‑1 (MQ=255) ggggCCGCGCTGGTATTCTGGAAGGTGCTGCCGGAGTCACGCAATTTCCGCGCACAGACGATGAACCCACGCAGCCTGCTGGACGGCTTTGTCATGCACTTCAAGGACGCCGGCCTGCCCTGGCTGTTCCTTGAAGCCTTCctgctg < 8:52028/145‑1 (MQ=255) gcgcTGGTATTCTGGAAGGTGCTGCCGGAGTCACGCAATTTCCGCGCACAGACGATGAACCCACGCAGCCTGCTGGACGGCTTTGTCATGCACTTCAAGGACGCCGGCCTGCCCTGGCTGTTCCTTGAAGCCTTCCTGCTGATGGgcgc > 7:265476/1‑149 (MQ=255) tGGTATTCTGGAAGGTGCTGCCGGAGTCACGCAATTTCCGCGCACAGACGATGAACCCACGCAGCCTGCTGGACGGCTTTGTCATGCACTTCAAGGACGCCGGCCTGCCCTGGCTGTTCCTTGAAGCCt > 7:32262/1‑129 (MQ=255) tGGTATTCTGGAAGGTGCTGCCGGAGTCACGCAATTTCCGCGCACAGACGATGAACCCACGCAGCCTGCTGGACGGCTTTGTCATGCACTTCAAGGACGCCGGCCTGCCCTGGCTGTTCCTTGAAGCCt < 8:32262/129‑1 (MQ=255) tGGTATTCTGGAAGGTGCTGCCGGAGTCACGCAATTTCCGCGCACAGACGATGAACCCACGCAGCCTGCTGGACGGCTTTGTCATGCACTTCAAGGACGCCGGCCTGCCCTGGCTGTTCCTTGAAGCCTTCCTGCTGATGGGCGCCTTc < 1:170989/149‑1 (MQ=255) tGGTATTCTGGAAGGTGCTGCCGGAGTCACGCAATTTCCGCGCACAGACGATGAACCCACGCAGCCTGCTGGACGGCTTTGTCATGCACTTCAAGGACGCCGGCCTGCCCTGGCTGTTCCTTGAAGCCTTCCTGCTGATGGGCGCCTTc > 4:92082/1‑149 (MQ=255) gTATTCTGGAAGGTGCTGCCGGAGTCACGCAATTTCCGCGCACAGACGATGAACCCACGCAGCCTGCTGGACGGCTTTGTCATGCACTTCAAGGACGCCGGCCTGCCCTGGCTGTTCCTTGAAGCCTTCCTGCTGATGGGCGCCTTCGt < 3:92082/149‑1 (MQ=255) gTAGTCTGGAAGGTGCTGCCGGAGTCACGCAATTTCCGCGCACAGACGATGAACCCACGCAGCCTTCTGGACGGCTTTGTCATGCACTTCAACGACGCCGGCCTGCCCTGGCTGTTCCTTGAAGCCTTCCTGCTGATGGGCGCCTTc < 2:286962/147‑1 (MQ=255) tGGAAGGTGCAGCCGGAGTCACGCAATTTCCGCGCACAGACGATGAACCCACGCAGCCTGCTGGACGGCTTTGTCATGCACTTCAAGGACGCCGGCCTGCCCTGGCTGTTCCTTGAAGCCTTCCTGCTGATGGGCGCCTTCGTCACAtt > 5:134565/1‑149 (MQ=255) gAAGGTGCTGCCGGAGTCACGCAATTTCCGCGCACAGACGATGAACCCACGCAGCCTGCTGGACGGCTTTGTCATGCACTTCAAGGACGCCGGCCTGCCCTGGCTGTTCCTTGAAGCCTTCCTGCTGATGGGCGCCTTCGTCACAtt < 2:310048/147‑1 (MQ=255) gAAGGTGCTGCCGGAGTCACGCAATTTCCGCGCACAGACGATGAACCCACGCAGCCTGCTGGACGGCTTTGTCATGCACTTCAAGGACGCCGGCCTGCCCTGGCTGTTCCTTGAAGCCTTCCTGCTGATGGGCGCCTTCGTCACATTGt > 8:200676/1‑149 (MQ=255) gAAGGTGCTGCCGGAGTCACGCAATTTCCGCGCACAGACGATGAACCCACGCAGCCTGCTGGACGGCTTTGTCATGCACTTCAAGGACGCCGGCCTGCCCTGGCTGTTCCTTGAAGCCTTCCTGCTGATGGGCGCCTTCGTCACATTGt > 2:144046/1‑149 (MQ=255) gAAGGTGCTGCCGGAGTCACGCAATTTCCGCGCACAGACGATGAACCCACGCAGCCTGCTGGACGGCTTTGTCATGCACTTCAAGGACGCCGGCCTGCCCTGGCTGTTCCTTGAAGCCTTCCTGCTGATGGGCGCCTTCGTCACATTGt < 7:310943/149‑1 (MQ=255) aGGTGCTGCCGGAGTCACGCAATTTCCGCGCACAGACGATGAACCCACGCAGCCTGCTGGACGGCTTTGTCATGCACTTCAAGGACGCCGGCCTGCCCTGGCTGTTCCTTGAAGCCTTCCTGCTGATGGGCGCCTTCGTCACATTGTTc < 2:196494/149‑1 (MQ=255) tgctgcCGGAGTCACGCAATTTCCGCGCACAGACGATGAACCCACGCAGCCTGCTGGACGGCTTTGTCATGCACTTCAAGGACGCCGGCCTGCCCTGGCTGTTCCTTGAAGCCTTCCTGCTGATGGGCGCCTTCGTCACATTGTTCAAc < 5:266398/149‑1 (MQ=255) gcCGGAGTCACGCAATTTCCGCGCACAGACGATGAACCCACGCAGCCTGCTGGACGGCTTTGTCATGCACTTCAAGGACGCCGGCCTGCCCTGGCTGTTCCTTGAAGCCTTCCTGCTGATGGGCGCCTTCGTcac > 3:21888/1‑135 (MQ=255) gcCGGAGTCACGCAATTTCCGCGCACAGACGATGAACCCACGCAGCCTGCTGGACGGCTTTGTCATGCACTTCAAGGACGCCGGCCTGCCCTGGCTGTTCCTTGAAGCCTTCCTGCTGATGGGCGCCTTCGTcac < 4:21888/135‑1 (MQ=255) gcCGGAGTCACGCAATTTCCGCGCACAGACGATGAACCCACGCAGCCTGCTGGACGGCTTTGTCATGCACTTCAAGGACGCCGGCCTGCCCTGGCTGTTCCTTGAAGCCTTCCTGCTGATGGGCGCCTTCGTCACATTGTTCAACTACa > 1:34344/1‑149 (MQ=255) ccGGAGTCACGCAATTTCCGCGCACAGACGATGAACCCACGCAGCCTGCTGGACGGCTTTGTCATGCACTTCAAGGACGCCGGCCTGCCCTGGCTGTTCCTTGAAGCCTTCCTGCTGATGGGCGCCTTCGTCACATTGTTCAACTACa > 4:260257/1‑148 (MQ=255) cGGAGTCACGCAATTTCCGCGCACAGACGATGAACCCACGCAGCCTGCTGGACGGCTTTGTCATGCACTTCAAGGACGCCGGCCTGCCCTGGCTGTTCCTTGAAGCCTTCCTGCTGATGGGCGCCTTCGTCACATTGTTCAACTACATc < 3:260257/149‑1 (MQ=255) gAGTCACGCAATTTCCGCGCACAGACGATGAACCCACGCAGCGTGCTGGACGGCTTTGTCATGCACTTCAAGGACGCCGGCCTGCCCTGGCTGTTCCTTGAAGCCTTCCTGCTGATGGGCGCCTTCGTCACATTGTTCAACTACATCgg > 4:293782/1‑149 (MQ=255) tCACGCAATTTCCGCGCACAGACGATGAACCCACGCAGCCTGCTGGACGGCTTTGTCATGCACTTCAAGGACGCCGGCCTGCCCTGGCTGTTCCTTGAAGCCTTCCTGCTGATGGgcgc < 1:140490/119‑1 (MQ=255) aCGCAATTTCCGCGCACAGACGATGAACCCACGCCGCCTGCTGGACGGCTTTGTCATGCACTTCAAGGACGCCGGCCTGCCCTGGCTGTTCCTTGAAGCCTTCCTGCTGATGGGCGCCTTCGTCACATTGTTCCACGACATCGGCTAcc > 4:253218/1‑149 (MQ=255) aCGCAATTTCCGCGCACAGACGATGAACCCACGCAGCCTGCTGGACGGCTTTGTCATGCACTTCAAGGACGCCTGCCTGCCCTGGCTGTTCCTTGAAGCCTTCCTGCTGATGGGCGCCTTCGTCACATTGTTCAACTACATCGGCTAcc < 7:200676/149‑1 (MQ=255) aCGCAATTTCCGCGCACAGACGATGAACCCACGCAGCCTGCTGGACGGCTTTGTCATGCACTTCAAGGACGCCGGCCTGCCCTGGCTGTTCCTTGAAGCCTTCctgct < 5:76726/108‑1 (MQ=255) aCGCAATTTCCGCGCACAGACGATGAACCCACGCAGCCTGCTGGACGGCTTTGTCATGCACTTCAAGGACGCCGGCCTGCCCTGGCTGTTCCTTGAAGCCTTCctgct > 6:76726/1‑108 (MQ=255) gCAATTTCCGCGCACAGACGATGAACCCACGCAGCCTGCTGGACGGCTTTGTCATGCACTTCAAGGACGCCGGCCTGCCCTGGCTGTTCCTTGAAGCCTTCCTGCTGATGGGCGCCTTCGTCACATTGTTCAACTACATCGGCTACCGc < 8:265476/149‑1 (MQ=255) gCAATTTCCGCGCACAGACGATGAACCCACGCAGCCTGCTGGACGGCTTTGTCATGCACTTCAAGGACGCCGGCCTGCCCTGGCTGTTCCTTGAAGCCTTCCTGCTGATGGGCGCCTTCGTCACATTGTTCAACTACATCGGCTACCGc > 5:187916/1‑149 (MQ=255) cAATTTCCGCGCACAGACGATGAACCCACGCAGCCTGCTGGACGGCTTTGTCATGCACTTCAAGGACGCCGGCCTGCCCTGGCTGTTCCTTGAAGCCTTCCTGCTGATGGGCGCCTTCGTCACATTGTTCAACTACATCGGCTTCCGcc > 8:310434/1‑149 (MQ=255) gcACAGACGATGAACCCACGCAGCCTGCTGGACGGCTTTGTCATGCACTTCAAGGACGCCGGCCTGCCCTGGCTGTTCCTTGAAGCCTTCCTGCTGATGGGCGCCTTCGTCACATTGTTCAACTACATCGGCTACCGCCTGCTGGCCGa < 3:64453/149‑1 (MQ=255) cacaGACGATGAACCCACGCAGCCTGCTGGACGGCTTTGTCATGCACTTCAAGGACGCCGGCCTGCCCTGGCTGTTCCTTGAAGCCTTCCTGCTGATGGGCGCCTTCGTCACATTGTTCAACTACATCGGCTACCGCCTGCTGGCCGAg < 1:144046/149‑1 (MQ=255) cacaGACGATGAACCCACGCAGCCTGCTGGACGGCTTTGTCATGCACTTCAAGGACGCCGGCCTGCCCTGGCTGTACCTTGAAGCCTTCCTGCTGATGGGCGCCTTCGTCACAATGTTCAACTACATCGGATGCCGCCTGCTGGcccac > 5:167100/1‑146 (MQ=255) acaGACGATGACCCCACGCAGCCTGCTGGACGGCTTTGTCATGCACTTCAAGGACGCCGGCCTGCCCTGGCTGTTCCTTGAAGCCTTCCTGCTGATGGGCGCCTTCGTCACATTGTTCAACTACATCGGCTACCGCCTGCTGGCCGAGc < 8:177055/149‑1 (MQ=255) acaGACGATGAACCCACGCAGCCTGCTGGACGGCTTTGTCATGCACTTCAAGGACGCCGGCCTGCCCTGGCTGTTCCTTGAAGCCTTCCTGCTGATGGGCGCCTTCGTCACATTGTTCAACTACATCGGCTACCGCCTGCTGGCCGAGc > 2:191274/1‑149 (MQ=255) aGACGATGAACCCACGCAGCCTGCTGGACGGCTTTGTCATGCACTTCAAGGACGCCGGCCTGCCCTGGCTGCTCCTTGAAGCCTTCCTGCTGATGGGCGCCTTCGTCACATTGTTCAACTACATCGGCTACCGCCTGCTGGCCGAGccc > 6:265442/1‑149 (MQ=255) cGATGAACCCACGCAGCCTGCTGGACGGCTTTGTCATGCACTTCAAGGACTCCGGCCTGCCCTGGCTGTTCCTTGAAGCCTTCCTGCTGATGGGCGCCTTCGTCACATTGTTCAACTACATCGGCTACCGCCTGCTGGCCGAGCCCTAc < 2:257306/149‑1 (MQ=255) cGATGAACCCACGCAGCCTGCTGGACGGCTTTGTCATGCACTTCAAGGACGCCGGCCTGCCCTGGCTGTTCCTTGAAGCCTTCCTGCTGATGGGCGCCTTCGTCACATTGTTCAACTACATCGGCTTCCGCCTGCTGGCCGAGCCCTAc < 7:310434/149‑1 (MQ=255) gATGAACCCACGCAGCCTGCTGGACGGCTTTGTCATGCACTTCAAGGACGCCGGCCTGCCCTGGCTGTTCCTTGAAGCCTTCCTGCTGATGGGCGCCTTCGTCACATTGTTCAACTACATCGGCTACCGCCTGCTGGCCGAGCCCTAcc < 2:155377/149‑1 (MQ=255) gATGAACCCACGCAGCCTGCTGGACGGCTTTGTCATGCACTTCAAGGACGCCGGCCTGCCCTGGCTGTTCCTTGAAGCCTTCCTGCTGATGGGCGCCTTCGTCACATTGTTCAACTACATCGGCTACCGCCTGCTGGCCGAGCCCTAcc < 2:150164/149‑1 (MQ=255) aCCCACGCAGCCTGCTGGACGGCTTTGTCATGCACTTCAAGGACGCCGGCCTGCCCTGGCTGTTCCTTGAAGCCTTCCTGCTGATGGGCGCCTTCGTCACATTGTTCAACTACATCGGCTACCGCCTGCTGGc < 1:131801/133‑1 (MQ=255) aCCCACGCAGCCTGCTGGACGGCTTTGTCATGCACTTCAAGGACGCCGGCCTGCCCTGGCTGTTCCTTGAAGCCTTCCTGCTGATGGGCGCCTTCGTCACATTGTTCAACTACATCGGCTACCGCCTGCTGGc > 2:131801/1‑133 (MQ=255) ccACGCAGCCTGCTGGACGGCTTTGTCATGCACTTCAAGGACGCCGGCCTGCCCTGGCTGTTCCTTGAAGCCTTCCTGCTGATGGGCGCCTTCGTCACATTGTTCAACTACATCGGCTACCGCCTGCTGGCCGAGCCCTACCACATGaa < 6:187916/149‑1 (MQ=255) gctgGACGGCTTTGTCATGCACTTCAAGGACGCCGGCCTGCCCTGGCTGTTCCTTGAAGCCTTCCTGCTGATGGGCGCCTTCGTCACATTGTTCAACTACATCGGCTACCGCCTGCTGGCCGAGCCCTACCACATGAACCAGGCGCTgg > 4:305625/1‑149 (MQ=255) tgGACGGCTTTGTCATGCACTTCAAGGACGCCGGCCTGCCCTGGCTGTTCCTTGAAGCCTTCCTGCTGATGGGCGCCTTCGTCACATTGTTCAACTACATCGGCTACCGCCTGCTGGCCGAGCCCTACCACATGAACCAGGCGCTGGTc > 2:151374/1‑149 (MQ=255) gACGGCTTTGTCATGCACTTCAAGGACGCCGGCCTGCCCTGGCTGTTCCTTGAAGCCTTCCTGCTGATGGGCGCCTTCGTCACATTGTTCAACTACATCGGCTACCGCCTGCTGGCCGAGCCCTACCACATGAACCAGGCGCTGGTCgg < 1:327918/149‑1 (MQ=255) ggCTTTGTCATGCACTTCAAGGACGCCGGCCTGCCCTGGCTGTTCCTTGAAGCCTTCCTGCTGATGGGCGCCTTCGTCACATTGTTCAACTACATCGGCTACCGCCTGCTGGCCGAGCCCTACCACATGAACCAGGCGCTGGTCGGCtt > 7:139617/1‑149 (MQ=255) tttGTCATGCACTTCAAGGACGCCGGCCTGCCCTGGCTGTTCCTTGAAGCCTTCCTGCTGATGGGCGCCTTCGTCACATTGTTCAACTACATCGGCTACCGCCTGCTGGCCGAGCCCTACCACATGAACCAGGCGCTGGTCGGCTTGCt > 6:249311/1‑149 (MQ=255) tCATGCACTTCAAGGACGCCGGCCTGCCCTGGCTGTTCCTTGAAGCCTTCCTGCTGATGGGCGCCTTCGTCACATTGTTCAACTACATCGGCTACCGCCTGCTGGCCGAGCCCTACCACATGAACCAGGCGCTGGTCGGCTTGCTGTc < 3:296655/148‑1 (MQ=255) tCATGCACTTCAAGGACGCCGGCCTGCCCTGGCTGCTCCTTGAAGCCTTCCTGCTGATGGGCGCCTTCGTCACATTGTTCAACTACATCGGCTACCGCCTGCTGGCCGAGCCCTACCACATGAACCAGGCGCTGGTCGGCTTGCTGTCg < 5:265442/149‑1 (MQ=255) cATGCACTTCAAGGACGCCGGCCTGCCCTGGCTGTtccttgaagtgcatgacaaagccgtccagcaggctgcgtgggttcatcgtctgtgcgcggaaattgcgtgactccggcagcaccttccagaataccagcgcggccaccagggc < 5:140347‑M2/148‑114 (MQ=255) aTGCACTTCAAGGACGCCGGCCTGCCCTGGCTGTtccttgaagtgcatgacaaagccgtccagcaggctgcgtgggttcatcgtctgtgcgcggaaattgcgtgactccggcagcaccttccagaataccagcgcggccaccagggc < 2:316234‑M2/147‑114 (MQ=255) aTGCACTTCAAGGACGCCGGCCTGCCCTGGCTGTTCCTTGAAGCCTTCCTGCTGATGGGCGCCTTCGTCACATTGTTCAACTACATCGGCTACCGCCTGCTGGCCGAGCCCTACCACATGAACCAGGCGCTGGTCGGCTTGCTGTCggt > 4:102312/1‑149 (MQ=255) tGCACTTCAAGGACGCCGGCCTGCCCTGGCTGTTCCTTGAAGCCTTCCTGCTGATGGGCGCCTTCGTCACATTGTTCAACTACATCGGCTACCGCCTGCTGGCCGAGCCCTACCACATGAACCAGGCTCTGGTCGGCTTGCTGTCggtg > 2:148439/1‑149 (MQ=255) gCACTTCAAGGACGCCGGCCTGCCCTGGCTGTtccttgaagtgcatgacaaagccgtccagcaggctgcgtgggttcatcgtctgtgcgcggaaattgcgtgactccggcagcaccttccagaataccagcgcggccaccagggccagg < 3:166837‑M2/149‑118 (MQ=255) cTTCAAGGACGCCGGCCTGCCCTGGCTGTtacttgaagtgcatgacaaagccgtacagcaggctgcgtgggttcatcgtctgtgcgcggaaattgcttgactacggcagcaccttccagaataccagcgcggccaccagggccaggccg < 5:315297‑M2/149‑121 (MQ=255) ttCAAGGACGCCGGCCTGCCCTGGCTGTtccttgaagtgcatgacaaagccgtccagcaggctgcgtgggttcatcgtctgtgcgcggaaattgcgtgactccggcagcaccttccagaataccagcgcggccaccagggccaggccgc < 2:228434‑M2/149‑122 (MQ=255) ttCAAGGACGCCGGCCTGCCCTGGCTGTTCCTTGAAGCCTTCCTGCTGATGGGCGCCTTCGTCACATTGTTCAACTACATCGGCTACCGCCTGCTGGCCGAGCCCTACCACATGAACCAGGCGCTGGTCGGCTTGCTGTCGGTGGTTTa > 5:192058/1‑149 (MQ=255) ttCAAGGACGCCGGCCTGCCCTGGCTGTTCCTTGAAGCCTTCCTGCTGATGCGCGCCTTCGTCACATTGTTCAACTACATCGGCTACCGCCTGCTGGCCGAGCCCTACCACATGAACCAGGCGCTGGTCGGCTTGCTGTCGGTGGTTTa > 3:205442/1‑149 (MQ=255) cAATGACGCCGTCCTGCCCTGGCTGTtccttgaagtgcatgacaaagccgtccagcaggctgcgtgggttcatcgtctgtgcgcggaaattgcgtgactccggcagcaccttccagaataccagcgcggccaccagggccaggccgc > 6:315297‑M2/1‑26 (MQ=255) cAAGGAacagccagggcaggccggcgtccttgaagtgcatgacaaagccgtccagcaggctgcgtgggttcatcgtctgtgcgcggaaattgcgtgactccggcagcaccttccagaataccagcgcggccaccagggccaggccgc < 4:64453‑M1/147‑142 (MQ=255) cAAGGACGCCGGCCTGCCCTGGCTGTtccttgaagtgcatgacaaagccgtccagcaggctgcgtgggttcatcgtctgtgcgcggaaattgcgtgactccggcagcaccttccagaataccagcgcggccaccagggccaggccgc > 6:140347‑M2/1‑26 (MQ=255) cAAGGACGCCGGCCTGCCCTGGCTGTTCCTTGAAGCCTTCCTGCTGATGGGCGCCTTCGTCACATTGTTCAACTACATCGGCTACCGCCTGCTGGCCGAGCCCTACCACATGAACCAGGCGCTGGTCGGCTTGCTGTCGGTGGTTTAc < 2:34344/148‑1 (MQ=255) aaGGAacagccagggcaggccggcgtccttgaagtgcatgacaaagccgtccagcaggctgcgtgggttcatcgtctgtgcgcggaaattgcgtgactccggcagcaccttccagaataccagcgcggccaccagggccaggccgccag > 7:313880‑M1/1‑5 (MQ=255) aaGGACGCCGGCCTGCCCTGGCTGTTCCTTGAAGCCTTCCTGCTGATGGGCGCCTTCGTCACATTGTTCAACTACATCGGCTACCGCCTGCTGGCCGAGCCCTACCACATGAACCAGGCGCTGGTCGGCTTGCTGTCGGTGGTTTACCt > 2:147773/1‑149 (MQ=255) gAacagccagggcaggccggcgtccttgaagtgcatgacaaagccgtccagcaggctgcgtgggttcatcgtctgtgcgcggaaattgcgtgactccggcagcaccttccagaataccagcgcggccaccagggccaggccgccaatgg > 2:253757‑M1/1‑2 (MQ=255) gAacagccagggcaggccggcgtccttgaagtgcatgacaaagccgtccagcaggctgcgtgggttcatcgtctgtgcgcggaaattgcgtgactccggcagcaccttccagaataccagcgcggccaccagggccaggccgccaatgg > 4:314446‑M1/1‑2 (MQ=255) | CTGGCACACGGCGATGCTGACCATTGGCGGCCTGGCCCTGGTGGCCGCGCTGGTATTCTGGAAGGTGCTGCCGGAGTCACGCAATTTCCGCGCACAGACGATGAACCCACGCAGCCTGCTGGACGGCTTTGTCATGCACTTCAAGGACGCCGGCCTGCCCTGGCTGTTCCTTGAAGCCTTCCTGCTGATGGGCGCCTTCGTCACATTGTTCAACTACATCGGCTACCGCCTGCTGGCCGAGCCCTACCACATGAACCAGGCGCTGGTCGGCTTGCTGTCGGTGGTTTACCTGTC > NC_002947/5789425‑5789718 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |