New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5989267 = | 72 (1.340) | 3 (0.060) | 3/236 | NT | 5.1% | noncoding (16/87 nt) | PP_mr64 | C4 ncRNA |
? | NC_002947 | 5989342 = | 48 (1.000) | coding (53/399 nt) | PP_5247 | hypothetical protein |
GTTCACACCAATCCCAAGGAATTATCCTACAC‑ACCGTGTCGACGCCCGTCTGATTGTCCGGGGAAAGCCAGCTCTCTAGGCTGACCAGGTCGCTGTCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTCCC > NC_002947/5989119‑5989411 | gTTCACACCACACCCAAGGAATTATCCTACAC‑ACCGTGTCGACGCCCGTCTGATTGTCCGGCGAAAGCCAGCTCTCTAGGCTGACCAGGTCGCTGTCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATg < 4:249294/149‑1 (MQ=255) ttcccggtgaataatgggggatggccggcatcgctgcggcttaaagtgcgttgtggggtgttggggaggggtggatcggggacgattcttttcatggcaattccttctccaggattgaactgcaaccacccgtttccacgcagaaggcg > 7:302757‑M1/149‑149 (MQ=255) ttcacggtgaataatgggggatggccggcatcgcagcggctgaaagagcgttgtgtggtgttggggaggggtggatcggggacgattcttttcatggcaattccttctccaggattgaactgcaaccacccgtttccacgcagaaggcg < 7:105212‑M1/1‑1 (MQ=255) acacCAATCCCAAGGAATTATCCTACAC‑ACCGTGTCGACGCCCGTCTGATTGTCCGGGGAAAGCCAGCTCTCTAGGCTGACCAGGTCGCTGTCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAg > 5:261790/1‑149 (MQ=255) acacCAATCCCAAGGAATTATCCTACAC‑ACCGTGTCGACGCCCGTCTGATTGTCCGGGGAAAGCCAGCTCTCTAGGCTGACCAGGTCGCTGTCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAg > 6:126766/1‑149 (MQ=255) cggtgaataatgggggatggccggcatcgcagcggctgaaagagcgttgtgtggtgttggggaggggtggatcggggacgattcttttcatggcaattccttctccaggattgaactgcaaccacccgtttccacgcagaaggcGGCAg < 4:310771‑M1/5‑1 (MQ=255) ggtgaataatgggggatggccggcatcgcagcggctgaaagagcgttgtgtggtgttggggaggggtggatcggggacgattcttttcatggcaattccttctccaggattgaactgcaaccacccgtttccacgcagaaggcGGCAGt < 6:207103‑M1/6‑1 (MQ=255) ggtgaataatgggggatggccggcatcgcagcggctgaaagagcgttgtgtggtgttggggaggggtggatcggggacgattcttttcatggcaattccttctccaggattgaactgcaaccacccgtttccacgcagaaggcGGCAGt < 8:112190‑M1/6‑1 (MQ=255) acCAATCCCAAGGAATTATCCTACACGACCGTGTCGACGCCCGTCTGATTGTCCGGGGAAAGCCAGCTCTCTAGGCTGACCAGGTCGCTGTCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGt > 1:177512/1‑149 (MQ=255) acCAATCCCAAGGAATTATCCTACAC‑ACCGTGTCGACGCCCGTCTGATTGTCCGGGGAAAGCCAGCTCTCTAGGCTGACCAGGTCGCTGTCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGtt > 6:158807/1‑149 (MQ=255) aTCCCAAGGAATTATCCTACAC‑ACCGTGTCGACGCCCGTCTGATTGTCCGGGGAAAGCCAGCTCTCTAGGCTGACCAGCTCGCTGTCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGTCAGTTGTgc > 5:83263/1‑149 (MQ=255) cccAAGGAATTATCCTACAC‑ACCGTGTCGACGCCCGTCTGATTGTCCGGGGAAAGCCAGCTCTCTAGGCTGACCAGGTCGCTGTCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTgcgc > 7:220610/1‑149 (MQ=255) cAAGGAATTATCCTACAC‑ACCGTGTCGACGCCCGTCTGATTGTCCGGGGAAAGCCAGCTCTCTAGGCTGACCAGGTCGCTGTCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGt < 1:310252/149‑1 (MQ=255) atgggggatggccggcatcgcagcggctgaaagagcgttgtgtggtgttggggaggggtggatcggggacgattcttttcatggcaattccttctccaggattgaactgcaaccacccgtttccacgcagaaggcGGCAGTTGTGcgcg > 5:207103‑M1/136‑149 (MQ=255) aaGGAATTATCCTACAC‑ACCGTGTCGACGCCCGTCTGATTGTCCGGGGAAAGCCAGCTCTCTAGGCTGACCAGGTCGCTGTCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGt > 5:163773/1‑148 (MQ=255) aGGAATTATCCTACAC‑ACCGTGTCGACGCCCGTCTGATTGTCCGGGGAAAGCCAGCTCTCTAGGCTGACCAGGTCGCTGTCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGa < 5:30660/149‑1 (MQ=255) tCCTACAC‑ACCGTGTCGACGCCCGTCTGATTGTCCGGGGAAAGCCAGCTCTCTAGGCTGACCAGGTCGCTGTCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGttt > 2:222333/1‑149 (MQ=255) ccTACAC‑ACCGTGTCGACGCCCGTCTGATTGTCCGGGGAAAGCCAGCTCTCTAGGCTGACCAGGTCGCTGTCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTg > 6:273443/1‑149 (MQ=255) 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8:292246/1‑128 (MQ=255) ggAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACggg < 7:292246/128‑1 (MQ=255) gAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACt > 4:257949/1‑104 (MQ=255) gAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTg > 7:112190/1‑146 (MQ=255) aaCCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTTGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGaa < 6:83263/149‑1 (MQ=255) aaCCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGaa < 5:158807/149‑1 (MQ=255) cccGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAgg < 1:172884/149‑1 (MQ=255) ctggATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGTAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCa > 2:276948/3‑130 (MQ=255) ctggATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGTAGTTCTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCa < 1:276948/128‑1 (MQ=255) ccGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAgg > 8:105212/1‑148 (MQ=255) cGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTTCTCACAGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGaa > 8:165356/1‑149 (MQ=255) atgaAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCAt < 6:163773/148‑1 (MQ=255) aGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGaaaa < 3:241299/149‑1 (MQ=255) gCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTg > 6:212108/1‑137 (MQ=255) gCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTg < 5:212108/137‑1 (MQ=255) tGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATc < 7:126197/149‑1 (MQ=255) ttATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGATACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTccc < 4:265002/149‑1 (MQ=255) ttATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTccc < 6:31177/149‑1 (MQ=255) GGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTgg < 6:272519‑M1/115‑1 (MQ=255) | GTTCACACCAATCCCAAGGAATTATCCTACAC‑ACCGTGTCGACGCCCGTCTGATTGTCCGGGGAAAGCCAGCTCTCTAGGCTGACCAGGTCGCTGTCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTCCC > NC_002947/5989119‑5989411 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |