New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 90510 = | 53 (0.980) | 4 (0.080) | 4/254 | NT | 7.0% | coding (555/618 nt) | PP_0080 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 90563 = | 56 (1.080) | coding (502/618 nt) | PP_0080 | hypothetical protein |
TGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGACAAGC‑GCCGCAACGGCTCAGCCAGCCCAGGCTCCAGCGTGCCTTCGGTACTGCGAAAATGCTCCATGCCTAACCCGGCCAGTTCCTGCGGTGCATTGATCAGCGTCCAGTGCAAGGCACTGCGCTGCAACCCATCAACCACCTGGGCCACGCATTCCCGCTCCACCTCGCTGTACTTGCCC > NC_002947/90422‑90705 | tGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGACAAGC‑GCCGCAACGGCTCAGCCAGCCCAGGCTCCAGCGTGCCTTCg < 8:201199/149‑1 (MQ=255) ggCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGACAAGC‑GCCGCAACGGCTCAGCCAGCCCAGGCTCCAGCGTGCCTTCGGt < 8:220089/149‑1 (MQ=255) gCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGACAAGCATGTGCAACGGAAACGCCAGCCCAGGGGCCAGCTTGCGTTCgg > 1:283442/1‑148 (MQ=255) gCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGACAAGC‑GCCGCAACGGCTCAGCCAGCCCAGGCTCCAGCGTGCCTTCGGTa > 6:297364/1‑149 (MQ=255) ccccGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGACAAGC‑GCCGCAACGGCTCAGCCAGCCCAGGCTCCAGCGTGCCTTCGGTACTGCGAAAATGc < 5:297364/149‑1 (MQ=255) cccGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGATACTGGACAAGC‑GCCGCAACGGCTCAGCCAGCCCAGGCTCCAGCGTGCCTTCGGTACTGCGAAAATGCt > 4:23012/1‑149 (MQ=255) ccGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGACAAGC‑GCCGCAACGGCTCAGCCAGCCCAGGCTCCAGCGTGCCTTCGGTACTGCGAAAATGCTc > 7:59585/1‑149 (MQ=255) ccGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGACAAGC‑GCCGCAACGGCTCAGCCAGCCCAGGCTCCAGCGTGCCTTCGGTACTGCGAAAATGCTc < 5:259946/149‑1 (MQ=255) gCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGACAAGC‑GCCGCAACGGCTCAGCCAGCCCAGGCTCCAGCGTGCCTTCGGTACTGCGAAAATGCTCCAt < 6:23890/149‑1 (MQ=255) gctgatcaatgcaccgcaggaactggccgggttaggcatggagcattttcgcagtaccgaaggcaCGCTGCGATCCTGGACAAGC‑GCCGCAACGGCTCAGCCAGCCCAGGCTCCAGCGTGcc < 4:268554‑M1/57‑1 (MQ=255) gctgatcaatgcaccgcaggaactggccgggttaggcatggagcattttcgcagtaccgaaggcaCGCTGCGATCCTGGACAAGC‑GCCGCAACGGCTCAGCCAGCCCAGGCTCCAGCGTGcc > 3:268554‑M1/66‑122 (MQ=255) tAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGACAAGC‑GCCGCAACGGCTCAGCCAGCCCAGGCTCCAGCGTGCCTTCGGTACTGCGAAAATGCTCCATGCCTaa > 5:160547/1‑149 (MQ=255) cACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCGAGCTCCAGCATGGCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGACACGC‑GCCGCACCGGCTCAGCCCGCCCAGGCTCCAGCGTGCCTTCGGGACTGCGAAAAGGCTCCATGCCTAGCCCgg > 6:248382/1‑149 (MQ=255) aCGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGACAAGC‑GCCGCAACGGCTCAGCCAGCCCAGGCTCCAGCGTGCCTTCGGTACTGCGAAAATGCTCCATGCCTAACCCGGc > 7:286968/1‑149 (MQ=255) aGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGACAAGC‑GCCGCAACGGCTCAGCCAGCCCAGGCTCCAGCGTGCCTTCGGTACTGCGAAAATGCTCCATGCCTAACCCGGCCAGTTCCTg > 4:49276/1‑149 (MQ=255) ggTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGACAAGC‑GCCGCAACGGCTCAGCCAGCCCAGGCTCCAGCGTGCCTTCGGTACTGCGAAAATGCTCCATGCCTAACCCGGCCAGTTCCTGc < 2:79718/149‑1 (MQ=255) tGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGACAAGC‑GCCGCAACGGCTCAGCCAGCCCAGGCTCCAGCGTGCCTTCGGTACTGCGAAAATGCTCCATGCCTAACCCGGCCAGTTCCTGCgg < 3:49276/149‑1 (MQ=255) gctcCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGACAAGC‑GCCGCAACGGCTCAGCCAGCCCAGGCTCCAGCGTGCCTTCGGTACTGCGAAAATGCTCCATGCCTAACCCGGCCAGTTCCTGCGGTGc < 8:83852/147‑1 (MQ=255) tGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGACAAGC‑GCCGCAACGGCTCAGCCAGCCCAGGCTCCAGCGTGCCTTCGGTACTGCGAAAATGCTCCATGCCTAACCCGGCCAGTTCCTGCGGTGCATTGATCAg > 8:248851/1‑149 (MQ=255) gCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGACAAGC‑GCCGCAACGGCTCAGCCAGCCCAGGCTCCAGCGTGCCTTCGGTACTGCGAAAATGCTCCATGCCTAACCCGGCCAGTTCCTGCGGTGCATTGATCAGc > 5:308862/1‑149 (MQ=255) gCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGACAAGC‑GCCGCAACGGCTCAGCCAGCCCAGGCTCCAGCGTGCCTTCGGTACTGCGAAAATGCTCCATGCCTAACCCGGCCAGTTCCTGCGGTGCATTGATCAGc > 1:172839/1‑149 (MQ=255) gCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGACAAGC‑GCCGCAACGGCTCAGCCAGCCCAGGCTCCAGCGTGCCTTCGGTACTGCGAAAATGCTCCATGCCTAACCCGGCCAGTTCCTGCGGTGCATTGATCAGc < 4:229131/149‑1 (MQ=255) cAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGACAAGC‑GCCGCAACGGCTCAGCCAGCCCAGGCTCCAGCGTGCCTTCGGTACTGCGAAAATGCTCCATGCCTAACCCGGCCAGTTCCTGCGGTGCATTGATCAGCg > 2:261487/1‑149 (MQ=255) aaGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGACAAGC‑GCCGCAACGGCTCAGCCAGCCCAGGCTCCAGCGTGCCTTCGGTACTGCGAAAATGCTCCATGCCTAACCCGGCCAGTTCCTGCGGTGCATTGATCAGCGt > 5:172494/1‑149 (MQ=255) aGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGACAAGC‑GCCGCAACGGCTCAGCCAGCCCAGGCTCCAGCGTGCCTTCGGTACTGCGAAAATGCTCCATGCCTAACCCGGCCAGTTCCTGCGGTGCATTGATCAGCGTc < 1:14745/149‑1 (MQ=255) cagctccagcATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGACAAGC‑GCCGCAACGGCTCAGCCATCCCAGGCTCCAGCGTGCCTTCGGTACTGCGAAAATGCTCCATGCCTAACCCGGCCAGTTCCTGCGGTGCATTGATCAGCGTCCAGt < 6:308862/149‑1 (MQ=255) agctgcagcATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGACAAGC‑GCCTCAACGGCTCAGCCAACCCAGGCTCCAGCGTGCCTTCGGTACTGCGAAAATGCTCCATGCCTAACCCGGCCAGTTCCTGCGGTGCATTGATCAGCGTCCAGTg < 7:256168/149‑1 (MQ=255) ctccagcATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGACAAGC‑GCCGCAACGGCTCAGCCAGCCCAGGCTCCAGCGTGCCTTCGGTACTGCGAAAATGCTCCATGCCTAACCCGGCCAGTTCCTGCGGTGCATTGATCAGCg < 5:8998/140‑1 (MQ=255) ctccagcATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGACAAGC‑GCCGCAACGGCTCAGCCAGCCCAGGCTCCAGCGTGCCTTCGGTACTGCGAAAATGCTCCATGCCTAACCCGGCCAGTTCCTGCGGTGCATTGATCAGCg > 6:8998/1‑140 (MQ=255) gcATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGACAAGC‑GCCGCAACGGCTCAGCCAGCCCAGGCTCCAGCGTGCCTTCGGTACTGCGAAAATGc > 1:78334/1‑92 (MQ=255) gcATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGACAAGC‑GCCGCAACGGCTCAGCCAGCCCAGGCTCCAGCGTGCCTTCGGTACTGCGAAAATGc < 2:78334/92‑1 (MQ=255) gcATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGACAAGC‑GCCGCAACGGCTCAGCCAGCCCAGGCTCCAGCGTGCCTTCGGTACTGCGAAAATGCTCCATGCCTAACCCGGCCAGTTCCTGCGGTGCATTGATCAGCGTCCAGTGCAAGGCa < 6:160547/149‑1 (MQ=255) tCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGACAAGC‑GCCGCAACGGCTCAGCCAGCCCAGGCTCCAGCGTGCCTTCGGTACTGCGAAAATGCTCCATGCCTAACCCGGCCAGTTCCTGCGGTGCATTGATCAGCGTCCAGTGCAAGGCACTgc < 8:59585/148‑1 (MQ=255) caccaTCCCCGCTGCGATCCTGGACAAGC‑GCCGCAACGGCTCAGCCAGCCCAGGCTCCAGCGTGCCTTCGGTACTGCGAAAATGCTCCATGCCTAACCCGGCCAGTTCCTGCGGTGCATTGATCAGCGTCCAGTGCCTTGCACTggac < 8:286968/148‑4 (MQ=255) accaTCCCCGCTGCGATCCTGGACAAGC‑GCCGCAACGGCTCAGCCAGCCCAGGCTCCAGCGTGCCTTCGGTACTGCGAAAATGCTCCATGCCTAACCCGGCCAGTTc < 3:101289/107‑1 (MQ=255) accaTCCCCGCTGCGATCCTGGACAAGC‑GCCGCAACGGCTCAGCCAGCCCAGGCTCCAGCGTGCCTTCGGTACTGCGAAAATGCTCCATGCCTAACCCGGCCAGTTc > 4:101289/1‑107 (MQ=255) aTCCCCGCTGCGATCCTGGACAAGC‑GCCGCAACGGCTCAGCCAGCCCAGGCTCCAGCGTGCCTTCGGTACTGCGAAAATGCTCCATGCCTAACCCGGCCAGTTCCTGCGGTGCATTGATCAGCGTCCAGTGCAAGGCACTGCGCTGCaa > 6:37488/1‑149 (MQ=255) aTCCCCGCTGCGATCCTGGACAAGC‑GCCGCAACGGCTCAGCCAGCCCAGGCTCCAGCGTGCCTTCGGTACTGCGAAAATGCTCCATGCCTAACCCGGCCAGTTCCTGCGGTGCATTGATCAGCGTCCAGTGCAAGGCACTGCGCTGCaa > 5:142817/1‑149 (MQ=255) ggcacgctggagcctgggctggctgagccgttgcggcgcttgtccaggatcgcagcgTGCCTTCGGTACTGCGAAAATGCTCCATGCCTAACCCGGCCAGTTCCTGCGGTGCATTGATCAGc > 3:268554‑M2/58‑122 (MQ=255) ggcacgctggagcctgggctggctgagccgttgcggcgcttgtccaggatcgcagcgTGCCTTCGGTACTGCGAAAATGCTCCATGCCTAACCCGGCCAGTTCCTGCGGTGCATTGATCAGc < 4:268554‑M2/65‑1 (MQ=255) ccGCTGCGATCCTGGACAAGC‑GCCGCAACGGCTCAGCCAGCCCAGGCTCCAGCGTGCCTTCGGTACTGCGAAAATGCTCCATGCCTAACCCGGCCAGTTCCTGCGGTGCATTGATCAGCGTCCAGTGCAAGGCACTGCGCTGCAACCCa > 3:196475/1‑149 (MQ=255) ccGCTGCGATCCTGGACAAGC‑GCCGCAACGGCTCAGCCAGCCCAGGCTCCAGCGTGCCTTCGGTACTGCGAAAATGCTCCATGCCTAACCCGGCCAGTTCCTGCGGTGCATTGATCAGCGTCCAGTGCAAGGCACTGCGCTGCAACCCa > 7:245620/1‑149 (MQ=255) agcGCGATCCTGGACAAGC‑GCCGCAACGGCTCAGCCAGCCCAGGCTCCAGCGTGCCTTCGGTACTGCGAAAATGCTCCATGCCTAACCCGGCCAGTTCCTGCGGTGCATTGATCAGCGTCCAGTGCAAg < 4:266615‑M1/126‑1 (MQ=255) agcGCGATCCTGGACAAGC‑GCCGCAACGGCTCAGCCAGCCCAGGCTCCAGCGTGCCTTCGGTACTGCGAAAATGCTCCATGCCTAACCCGGCCAGTTCCTGCGGTGCATTGATCAGCGTCCAGTGCAAg > 3:266615‑M1/4‑129 (MQ=255) GCTGCGATCCTGGACAAGC‑GCCGCAACGGCTCAGCCAGCCCAGGCTCCAGCGTGCCTTCGGTACTGCGAAAATGCTCCATGCCTAACCCGGCCAGTTCCTGCGGTGCATTGATCAGCGTCCAGTGCAAGGCACTGCGCTGCAACCCATc > 7:248851‑M1/1‑149 (MQ=255) aTCCTGGACAAGC‑GCCGCAACGGCTCAGCCAGCCCAGGCTCCAGCGTGCCTTCGGTACTGCGAAAATGCTCCATGCCTAACCCGGCCAGTTCCTGCGGTGCATTGATCAGCGTCCAGTGCAAGGCACTGCGCTGCAACCCATCAaccac < 6:142817/149‑1 (MQ=255) tGGACAAGC‑GCCGCAACGGCTCAGCCAGCCCAGGCTCCAGCGTGCCTTCGGTACTGCGAAAATGCTCCATGCCTAACCCGGCCAGTTCCTGCGGTGCATTGATCAGCGTCCAGTGCAAGGCACTGCGCTGCAACCCATCAACCACCTgg > 6:21203/1‑149 (MQ=255) ggctggctgagccgttgcggcgcttgtccaggatcgcagcgTGCCTTCGGTACTTCGAAAATGCTCCATGCCTAACCCGGCCAGTTCCTg > 1:259236‑M2/42‑90 (MQ=255) ggctggctgagccgttgcggcgcttgtccaggatcgcagcgTGCCTTCGGTACTGCGAAAATGCTCCATGCCTAACCCGGCCAGTTCCTg < 2:259236‑M2/49‑1 (MQ=255) aaGC‑GCCGCAACGGCTCAGCCAGCCCAGGCTCCAGCGTGCCTTCGGTACTGCGAAAATGCTCCATGCCTAACCCGGCCAGTTCCTGCGGTGCATTGATCAGCGTCCAGTGCAAGGCACTGCGCTGCAACCCATCAACCACCTGGGCCAc > 8:269131/1‑149 (MQ=255) gc‑gcCGCAACGGCTCAGCCAGCCCAGGCTCCAGCGTGCCTTCGGTACTGCGAAAATGCTCCATGCCTAACCCGGCCAGTTCCTGCGGTGCATTGATCAGCGTCCAGTGCAAGGCACTGCGCTGCAACCCATCAACCACCTGGGCCACg > 2:334792/1‑148 (MQ=255) gc‑gcCGCAACGGCTCAGCCAGCCCAGGCTCCAGCGTGCCTTCGGTACTGCGAAAATGCTCCATGCCTAACCCGGCCAGTTCCTGCGGTGCATTGATCAGCGTCCAGTGCAAGGCACTGCGCTGCAACCCATCAACCACCTGGGCCACg > 4:33627/1‑148 (MQ=255) c‑gccgcAACGGCTCAGCCAGCCCAGGCTCCAGCGTGCCTTCGGTACTGCGAAAATGCTCCATGCCTAACCCGGCCAGATCCTGCGGTCCATTGATCAGCGTCCAGTCCAAGGCACTCCGCTGCAACCCATCAACAACCTGGGCCACGc > 8:79719/1‑148 (MQ=255) ccgcAACGGCTCAGCCAGCCCAGGCTCCAGCGTGCCTTCGGTACTGCGAAAATGCTCCATGCCTAACCCGGCCAGTTCCTGCGGTGCATTGATCAGCGTCCAGTGCAAGGCACTGCGCTGCAACCCATCAACCACCTGGGCCACGCAtt < 6:172494/149‑1 (MQ=255) gcAACGGCTCAGCCAGCCCAGGCTCCAGCGTGCCTTCGGTACTGCGAAAATGCTCCATGCCTAACCCGGCCAGTTCCTGCGGTGCATTGATCAGCGTCCAGTGCAAGGCACTGCGCTGCAACCCATCAACCACCTGGGCCACGCATTcc > 2:56102/1‑149 (MQ=255) cAACGGCTCAGCCAGCCCAGGCTCCAGCGTGCCTTCGGTACTGCGAAAATGCTCCATGCCTAACCCGGCCAGTTCCTGCGGTGCATTGATCAGCGTCCAGTGCAAGGCACTGCGCTGCAACCCATCAACCACCTGGGCCACGCATTccc < 5:37488/149‑1 (MQ=255) tCAGCCAGCCCAGGCTCCAGCGTGCCTTCGGTACTGCGAAAATGCTCCATGCCTaa < 3:220254/56‑1 (MQ=255) tCAGCCAGCCCAGGCTCCAGCGTGCCTTCGGTACTGCGAAAATGCTCCATGCCTaa > 4:220254/1‑56 (MQ=255) agccagccCAGGCTCCAGCGTGCCTTCGGTACTGCGAAAATGCTCCATGCCTAACCCGGCCAGTTCCTGCGGTGCATTGATCAGCGTCCAGTGCAAGGCACTGCGCTGCAACCCATCAACCACCTGGGCCACGCATTCCCGCTCCACCt < 2:172839/149‑1 (MQ=255) agccagccCAGGCTCCAGCGTGCCTTCGGTACTGCGAAAATGCTCCATGCCTAACCCGGCCAGTTCCTGCGGTGCATTGATCAGCGTCCAGTGCAAGGCACTGCGCTGCAACCCATCAACCACCTGGGCCACGCATTCCCGCTCCACCt < 8:245620/149‑1 (MQ=255) agccCAGGCTCCAGCGTGCCTTCGGTACTGCGAAAATGCTCCATGCCTAACCCGGCCAGTTCCTGCGGTGCATTGATCAGCGTCCAGTGCAAGGCACTGCGCTGCAACCCATCAACCACCTGGGCCACGCATTCCCGCTCCACCTCGCt < 3:278260/149‑1 (MQ=255) ccAGGCTCCAGCGTGCCTTCGGTACTGCGAAAATGCTCCATGCCTAACCCGGCCAGTTCCTGCGGTGCATTGATCAGCGTCCAGTGCAAGGCACTGCGCTGCAACCCATCAACCACCTGGGCCACGCATTCCCGCTc < 4:251012/137‑1 (MQ=255) ccAGGCTCCAGCGTGCCTTCGGTACTGCGAAAATGCTCCATGCCTAACCCGGCCAGTTCCTGCGGTGCATTGATCAGCGTCCAGTGCAAGGCACTGCGCTGCAACCCATCAACCACCTGGGCCACGCATTCCCGCTc > 3:251012/1‑137 (MQ=255) ccAGGCTCCAGCGTGCCTTCGGTACTGCGAAAATGCTCCATGCCTAACCCGGCCAGTTCCTGCGGTGCATTGATCAGCGTCCAGTGCAAGGCACTGCGCTGCAACCCATCAACCACCTGGGCCACGCATTCCCGCTCCACCTCGCTGTa > 8:148517/1‑149 (MQ=255) cAGGCTCCAGCGTGCCTTCGGTACTGCGAAAATGCTCCATGCCTAACCCGGCCAGTTCCTGCGGTGCATTGATCAGCGTCCAGTGCAAGGCACTGCGCTGCAACCCATCAACCACCTGGGCCACGCATTCCCGCTCCACCTCGCTGTAc < 3:23012/149‑1 (MQ=255) tCCAGCGTGCCTTCGGTACTGCGAAAATGCTCCATGCCTAACCCGGCCAGTTCCTGCGGTGCATTGATCAGCGTCCAGTGCAAGGCACTGCGCTGCAACCCATCAACCACCTGGGCCACGCATTCCCGCTCCACCTCGCTGTACTTGcc > 6:297531/1‑149 (MQ=255) cagcgTGCCTTCGGTACTGCGAAAATGCTCCATGCCTAACCCGGCCAGTTCCTGCGGTGCATTGATCAGCGTCCAGTGCAAGGCACTGCGCTGCAACCCATCAACCACCTGGGCCACGCATTCCCGCTCCACCTCGCTGTACTTGccc < 1:261487‑M2/143‑1 (MQ=255) cagagTGCCTTCGGTACTGCGAAAATGCTCCATGCCTAACCCGGCCAGTTCCTGCGGTGCATTGATCAGCGTCCAGTGCAAGGCACTGCGCTGCAACCCATCAACCACCTGGGCCACGCATTCCCGCTCCACCTCGCTGTACTTGcc < 7:40586‑M2/142‑1 (MQ=255) | TGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGACAAGC‑GCCGCAACGGCTCAGCCAGCCCAGGCTCCAGCGTGCCTTCGGTACTGCGAAAATGCTCCATGCCTAACCCGGCCAGTTCCTGCGGTGCATTGATCAGCGTCCAGTGCAAGGCACTGCGCTGCAACCCATCAACCACCTGGGCCACGCATTCCCGCTCCACCTCGCTGTACTTGCCC > NC_002947/90422‑90705 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |