New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2333832 = | 73 (1.360) | 4 (0.080) | 3/256 | NT | 5.8% | coding (764/1185 nt) | fadA | 3‑ketoacyl‑CoA thiolase |
? | NC_002947 | 2333892 = | 60 (1.150) | coding (824/1185 nt) | fadA | 3‑ketoacyl‑CoA thiolase |
GACCCTGGCCGATCTGCAGGGGCTCAAGCCCGTGGTCGAAGGCGGTTGTGTCACGGCCGGCAATGCCAGTCAGCTGTCCGATGGCGCCAGTGCCTGCGTGCTGATGGAAGGTGCGCTGGCGGCGCGCTCGGGCATCGCGGCCCTGGGGCTTTACCGCGGTATCGCCGTGGCTGGCCTGGCCCCCGAGGAAATGGGCATCGGCCCGGTGTTGGCGGTGCCCAAGCTACTGCGCCAGCAGGGCCTGACGGTAGACGATATCGGGCTATGGGAGCTGAATGAGGCGTTTGCCTGC > NC_002947/2333746‑2334037 | gcgcagtagcttgggcaccgccaacaccgggccgatgcccatttcctcgggggccaggccagccacggcgataccgcggtaaagccCCAGTGCCTGCGTGCTGATGGAAGGTGCGCTGGCGGCGCGCTCGGGCATCGCGGCCCTggg > 6:151361‑M1/87‑147 (MQ=255) gcgcagtagcttgggcaccgccaacaccgggccgatgcccatttcctcgggggccaggccagccacggcgataccgcggtaaagccCCAGTGCCTGCGTGCTGATGGAAGGTGCGCTGGCGGCGCGCTCGGGCATCGCGGCCCTggg > 6:119661‑M1/87‑147 (MQ=255) gacCCTGGCCGATCTGCAGGGGCTCAAGCCCGTGGTCGAAGGCGGTTGTGTCACGGCCGGCAATGCCAGTCAGCTGTCCGATGGCGCCAGTGCCTGCGTGCTGATGGAAGGTGCGCTGGCGGCGCGCTCGGGCATCGCGGCCCTGGGGc < 3:7421/149‑1 (MQ=255) ccTGGCCGATCTGCAGGGGCTCAAGCCCGTGGTCGAAGGCGGTTGTGTCACGGCCGGCAATGCCAGTCAGCTGTCCGATGGCGCCAGTGCCTGCGTGCTGATGGAAGGTGCGCTGGCGGCGCGCTCGGGCATCGCGGCCCTGGGGCtt > 1:210095/1‑148 (MQ=255) cTGCAGGGGCTCAAGCCCGTGGTCGAAGGCGGTTGTGTCACGGCCGGCAATGCCAGTCAGCTGTCCGATGGCGCCAGTGCCTGCGTGCTGATGGAAGGTGCGCTGGCGGCGCGCTCGGGCATCGCGGCCCTGGGGCTTTACCGCGGTAt > 4:70488/1‑149 (MQ=255) cTGCAGGGGCTCAAGCCCGTGGTCGAAGGCGGTTGTGTCACGGCCGGCAATGCCAGTCAGCTGTCCGATGGCGCCAGTGCCTGCGTGCTGATGG‑AGGTGCGCTGGCGGCGCGCTCGGGCATCGCGGCCCTGGGGCTTTACCGCGGTATc > 1:88039/1‑149 (MQ=255) tGCAGGGGCTCAAGCCAGTGGTCGAAGGCGGTTGTGTCACGGCCGGCAATGCCAGTCAGCTGTCCGATGGCGCCAGTGCCTGCGTGCTGATGGAAGGTGCGCTGGCGGCGCGCTCGGGCATCGCGGCCCTGGGGCTTTACCGCGGTAta > 5:275783/1‑148 (MQ=255) cAGGGGCTCAAGCCCGTGGTCGAAGGCGGTTGTGTCACGGCCGGCAATGCCAGTCAGCTGTCCGATGGCGCCAGTGCCTGCGTGCTGATGGAAGGTGCGCTGGCGGCGCGCTCGGGCATCGCGGCCCTGGGGCTTTACCGCGGTa < 8:62280/145‑1 (MQ=255) gCTCAAGCCCGTGGTCGAAGGCGGTTGTGTCACGGCCGGCAATGCCAGTCAGCTGTCCGATGGCGCCAGTGCCTGCGTGCTGATGGAAGGTGCGCTGGCGGCGCGCTCGGGCATCGCGGCCCTGGGGCTTTACCGCGGTATCGCCGtgg > 1:336000/1‑149 (MQ=255) tCAAGCCCGTGGTCGAAGGCGGTTGTGTCACGGCCGGCAATGCCAGTCAGCTGTCCGATGGCGCCAGTGCCTGCGTGCTGATGGAAGGTGCGCTGGCGGCGCGCTCGGGCATCGCGGCCCTGGGGCTTTACCGCGGTATCGCCGtggct > 5:117420/1‑149 (MQ=255) aaGCCCGTGGTCGAAGGCGGTTGTGTCACGGCCGGCAATGCCAGTCAGCTGTCCGATGGCGCCAGTGCCTGCGTGCTGATGGAAGGTGCGCTGGCGGCGCGCTCGGGCATCGCGGCCCTGGGGCTTTACCGCGGTATCGCCGtggctgg > 7:12683/1‑149 (MQ=255) aGCCCGTGGTCGAAGGCGGTTGTGTCACGGCCGGCAATGCCAGTCAGCTGTCCGATGGCGCCAGTGCCTGCGTGCTGATGGAAGGTGCGCTGGCGGCGCGCTCGGGCATCGCGGCCCTGGGGCTTTACCGCGGTATCGCCGtggctggc < 2:169791/149‑1 (MQ=255) gCCCGTGGTCGAAGGCGGTTGTGTCACGGCCGGCAATGCCAGTCAGCTGTCCGATGGCGCCAGTGCCTGCGTGCTGATGGAAGGTGCGCTGGCGGCGCGCTCGGGCATCGCGGCCCTGGGGCTTTACCGCGGTATCGCCGTGGctggcc > 1:286114/1‑149 (MQ=255) cccGTGGTCGAAGGCGGTTGTGTCACGGCCGGCAATGCCAGTCAGCTGTCCGATGGCGCCAGTGCCTGCGTGCTGATGGAAGGTGCGCTGGCGGCGCGCTCGGGCATCGCGGCCCTGGGGCTTTACCGCGGTATCGCCGTGGctggcct > 5:46462/1‑149 (MQ=255) cGTGGTCGAAGGCGGTTGTGTCACGGCCGGCAATGCCAGTCAGCTGTCCGATGGCGCCAGTGCCTGCGTGCTGATGGAAGGTGCGCTGGCGGCGCGCTCGGGCATCGCGGCCCTGGGGCTTTACCGCGGTATCGCCGTGGctggcctgg > 4:172548/1‑149 (MQ=255) aaGGCGGTTGTGTCACGGCCGGCAATGCCAGTCAGCTGTCCGATGGCGCCAGTGCCTGCGTGCTGATGGAAGGTGCGCTGGCGGCGCGCTCGGGCATCGCGGCCCTGGGGCTTTACCGCGGTATCGCCGTGGCTGGCCTGGCCCCCGAg < 6:117420/149‑1 (MQ=255) aaGGCGGTTGTGTCACGGCCGGCAATGCCAGTCAGCTGTCCGATGGCGCCAGTGCCTGCGTGCTGATGGAAGGTGCGCTGGCGGCGCGCTCGGGCATCGCGGCCCTGGGGCTTTACCGCGGTATCGCCGTGGCTGGCCAGGCCCCCGAg < 2:288303/149‑1 (MQ=255) cGGTTGTGTCACGGCCGGCAATGCCAGTCAGCTGTCCGATGGCGCCAGTGCCTGCGTGCTGATGGAAGGTGCGCTGGCGGCGCGCTCGGGCATCGCGGCCCTGGGGCTTTACCGCGGTATCGCCGTGGCTGGCCTGGCCCCCGAGGaaa < 2:193604/149‑1 (MQ=255) ttGTGTCACGGCCGGCAATGCCAGTCAGCTGTCCGATGGCGCCAGTGCCTGCGTGCTGATGGAAGGTGCGCTGGCGGCGCGCTCGGGCATCGCGGCCCTGGGGCTTTACCGCGGTATCGCCGTGGCTGGCCTGGCCCCCGAGGAAATgg < 2:286114/149‑1 (MQ=255) ttGTGTCACGGCCGGCAATGCCAGTCAGCTGTCCGATGGCGCCAGTGCCTGCGTGCTGATGGAAGGTGCGCTGGCGGCGCGCTCGGGCATCGCGGCCCTGGGGCTTTACCGCGGTATCGCCGTGGCTGGCCTGGCCCCCGAGGAAATgg < 3:43330/149‑1 (MQ=255) gtgtCACGGCCGGCAATGCCAGTCAGCTGTCCGATGGCGCCAGTGCCTGCGTGCTGATGG‑AGGTGCGCTGGCGGCGCGCTCGGGCATCGCGGCCCTGGGGCTTTACCGCGGTATCGCCGTGGCTGGCCTGGCCCCCGAGGAAATGGGc < 2:88039/148‑1 (MQ=255) tgtCACGGCCGGCAATGCCAGTCAGCTGTCCGATGGCGCCAGTGCCTGCGTGCTGATGGAAGGTGCGCTGGCGGCGCGCTCGGGCATCGCGGCCCTGGGGCTTTACCGCGGTATCGCCGTGGCTGGCCTGGCCCCCGAGGAAATGGGc < 3:70488/148‑1 (MQ=255) tgtCACGGCCGGCAATGCCAGTCAGCTGTCCGATGGCGCCAGTGCCTGCGTGCTGATGGAAGGTGCGCTGGCGGCGCGCTCGGGCATCGCGGCCCTGGGGCTTTACCGCGGTATCGCCGTGGCTGGCCTGGCCCCCGAGGAAATGGGCa > 7:4997/1‑149 (MQ=255) gtCACGGCCGGCAATGCCAGTCAGCTGTCCGATGGCGCCAGTGCCTGCGTGCTGATGGAAGGTGCGCTGGCGGCGCGCTCGGGCATCGCGGCCCTGGGGCTTTACCGCGGTATCGCCGTGGCTGGCCTGGCCCCCGAGGAAATGGGCAt > 3:9493/1‑149 (MQ=255) tCACGGCCGGCAATGCCAGTCAGCTGTCCGATGGCGCCAGTGCCTGCGTGCTGATGGAAGGTGCGCTGGCGGCGCGCTCGGGCATCGCGGCCCTGGGGCTTTACCGCGGTATCGCCGTGGCTGGCCTGGCCCCCGAGGAAATGGGCAt < 4:109408/148‑1 (MQ=255) tCACGGCCGGCAATGCCAGTCAGCTGTCCGATGGCGCCAGTGCCTGCGTGCTGATGGAAGGTGCGCTGGCGGCGCGCTCGGGCATCGCGGCCCTGGGGCTTTACCGCGGTATCGCCGTGGCTGGCCTGGCCCCCGAGGAAATGGGCATc > 2:152570/1‑149 (MQ=255) ggccggcAATGCCAGTCAGCTGTCCGATGGCGCCAGTGCCTGCGTGCTGATGGAAGGTGCGCTGGCGGCGCGCTCGGGCATCGCGGCCCTGGGGCTTTACCGCGGTATCGCCGtggctgg > 7:31424/1‑120 (MQ=255) ggccggcAATGCCAGTCAGCTGTCCGATGGCGCCAGTGCCTGCGTGCTGATGGAAGGTGCGCTGGCGGCGCGCTCGGGCATCGCGGCCCTGGGGCTTTACCGCGGTATCGCCGtggctgg < 8:31424/120‑1 (MQ=255) gccggcAATGCCAGTCAGCTGTCCGATGGCGCCAGTGCCTGCGTGCTGATGGAAGGTGCGCTGGCGGCGCGCTCGGGCATCGCGGCCCTGGGGCTTTACCGCGGTATCGCCGTGGCTGGCCTGGCCCCCGAGGAAATGGGCATCGGccc < 3:172548/149‑1 (MQ=255) ccggcAATGCCAGTCAGCTGTCCGATGGCGCCAGTGCCTGCGTGCTGATGGAAGGTGCGCTGGCGGCGCGCTCGGGCATCGCGGCCCTGGGGCTTTACCGCGGTATCGCCGTGGCTGGCCTGGCCCCCGAGGAAATGGGCATCGGCCCg < 6:46462/149‑1 (MQ=255) ggcAATGCCAGTCAGCTGTCCGATGGCGCCAGTGCCTGCGTGCTGATGGAAGGTGCGCTGGCGGCGCGCTCGGGCATCGCGGCCCTGGGGCTTTACCGCGGTATCGCCGTGGCTGGCCTGGCCCCCGAGGAAATGGGCATCGGCCCGgt < 6:40899/149‑1 (MQ=255) aaTGCCAGTCAGCTGTCCGATGGCGCCAGTGCCTGCGTGCTGATGGAAGGTGCGCTGGCGGCGCGCTCGGGCATCGCGGCCCTGGGGCTTTACCGCGGTATCGCCGTGGCTGGCCTGGCCCCCGAGGAAATGGGCATCGGCCCGGTGtt > 6:330439/1‑149 (MQ=255) aTGCCAGTCAGGTGTCCGATGGCGCCTGTGCCTGCGTGCTGATGGAAGGTGCGCTGGCGGCGCGCTCGGGCATCGCGGCCCTGGGGCTTTACCGCGGTATCGCCGTGGCTGGCCTGGCCCCCGAGGAAATGGGCATCGGCCCGGTGTTg < 1:146860/149‑1 (MQ=255) aTGCCAGTCAGCTGTCCGATGGCGCCAGTGCCTGCGTGCTGATGGAAGGTGCGCTGGCGGCGCGCTCGGGCATCGCGGCCCTGGGGCTTTACCGCGGTATCGCCGTGGCTGGCCTGGCCCCCGAGGAAATGGGCATCGGCCCGGTGTTg < 4:21249/149‑1 (MQ=255) tGCCAGTCAGCTGTCCGATGGCGCCAGTGCCTGCGTGCTGATGGAAGGTGCGCTGGCGGCGCGCTCGGGCATCGCGGCCCTGGGGCTTTACCGCGGTATCGCCGTGGCTGGCCTGGCCCCCGAGGAAATGGGCATCGGCCCGGTGTTgg > 1:171566/1‑149 (MQ=255) cAGTCAGCTGTCCGATGGCGCCAGTGCCTGCGTGCTGATGGAAGGTGCGCTGGCGGCGCGCTCGGGCATCGCGGCCCTGGGGCTTTACCGCGGTATCGCCGTGGCTGGCCTGGCCCCCGAGGAAATGGGCATCGGCCCGGTGTTGGCgg < 3:179190/149‑1 (MQ=255) cAGTCAGCTGTCCGATGGCGCCAGTGCCTGCGTGCTGATGGAAGGTGCGCTGGCGGCGCGCTCGGGCATCGCGGCCCTGGGGCTTTACCGCGGTATCGCCGTGGCTGGCCTGGCCCCCGAGGAAATGGGCATCGGCCCGGTGTTGGCgg > 7:123760/1‑149 (MQ=255) aGTCAGCTGTCCGATGGCGCCAGTGCCTGCGTGCTGATGGAAGGTGCGCTGGCGGCGCGCTCGGGCATCGCGGCCCTGGGGCTTTACCGCGGTATCGCCGTGGCTGGCCTGGCCCCCGAGGAAATGGGCATCGGCCCGGTGTTGGCGGt > 2:161027/1‑149 (MQ=255) gTCAGCTGTCCGATGGCGCCAGTGCCTGCGTGCTGATGGAAGGTGCGCTGGCGGCGCGCTCGGGCATCGCGGCCCTGGGGCTTTACCGCGGTATCGCCGTGGCTGGCCTGGCCCCCGAGGAAATGGGCATCGGCCCGGTGTTGGCGGTg < 5:155286/149‑1 (MQ=255) tCAGCTGTCCGATGGCGCCAGTGCCTGCGTGCTGATGGAAGGTGCGCTGGCGGCGCGCTCGGGCATCGCGGCCCTGGGGCTTTACCTCGGTATCGCCGTGGCTGGCCTGGCCCCCGAGGAAATGGGCATCGGCCCGGTGTTGCCGGTGc < 2:336000/149‑1 (MQ=255) tGTCCGATGGCGCCAGTGCCTGCGTGCTGATGGAAGGTGCGCTGGCGGCGCGCTCGGGCATCGCGGCCCTGGGGCTTTACCGCGGTATCGCCGTGGCTGGCCTGGCCCCCGAGGAAATGGGCATCGGCCCGGTGTTGGCGGTGCCCAAg > 6:129276/1‑149 (MQ=255) tGTCCGATGGCGCCAGTGCCTGCGTGCTGATGGAAGGTGCGCTGGCGGCGCGCTCGGGCATCGCGGCCCTGGGGCTTTACCGCGGTATCGCCGTGGCTGGCCTGGCCCCCGAGGAAATGGGCATCGGCCCGGTGTTGGCGGTGCCCAAg > 3:257991/1‑149 (MQ=255) gATGGCGCCAGTGCCTGCGTGCTGATGGAAGGTGCGCTGGCGGCGCGCTCGGGCATCGCGGCCCTGGGGCTTTACCGCGGTATCGCCGTGGCTGGCCTGGCCCCCGAGGAAATGGGCATCGGCCCGGTGTTGGCGGTGCCCAAGCTACt < 2:210095/149‑1 (MQ=255) cgaggCGCCAGTGCCTGCGTGCTGATGGAAGGTGCGCTGGCGGCGCGCTCGGGCATCGCGGCCCTGGGGCTTTACCGCGGTATCGCCGTGGCTGGCCTGGCCCCCGAGGAAATGGGCATCGGCCCGGTGTTGGCGGTGCCCAAGCTACt > 8:289177/4‑149 (MQ=255) aTGGCGCCAGTGCCTGCGTGCTGATGGAAGGTGCGCTGGCGGCGCGCTCGGGCATCGCGGCCCTGGGGCTTTACCGCGGTATCGCCGTGGCTGGCCTGGCCCCCGAGGAAATGGGCATCGGCCCGGTGTTGGCGGTg < 2:120220/137‑1 (MQ=255) aTGGCGCCAGTGCCTGCGTGCTGATGGAAGGTGCGCTGGCGGCGCGCTCGGGCATCGCGGCCCTGGGGCTTTACCGCGGTATCGCCGTGGCTGGCCTGGCCCCCGAGGAAATGGGCATCGGCCCGGTGTTGGCGGTg > 1:120220/1‑137 (MQ=255) ctgcgcCAGTGCCTGCGTGCTGATGGAAGGTGCGCTGGCGGCGCGCTCGGGCATCGCGGCCCTGGGGCTTTACCGCGGTATCGCCGTGGCTGGCCTGGCCCCCGAGGAAATGGGCATCGGCCCGGTGTTGGCGGTGCCCAAGCTACTg < 3:270410/146‑1 (MQ=255) cgcCAGTGCCTGCGTGCTGATGGAAGGTGCGCTGGCGGCGCGCTCGGGCATCGCGGCCCTGGGGCTTTACCGCGGTATCGCCGTGGCTGGCCTGGCCCCCGAGGAAATGGGCATCGCCCCGGTGATGGCGGTGCCCAAGCTACTg > 4:270410/1‑145 (MQ=255) cccagggccgcgatgcccgagcgcgccgccagcgcaccttccatcagcacgcaggcactggGGCTTTACCGCGGTATCGCCGTGGCTGGCCTGGCCCCCGAGGAAATGGGCATCGGCCCGGTGTTGGCGGTGCCCAAGCTACTgcgc > 6:119661‑M2/62‑147 (MQ=255) cccagggccgcgatgcccgagcgcgccgccagcgcaccttccatcagcacgcaggcactggGGCTTTACCGCGGTATCGCCGTGGCTGGCCTGGCCCCCGAGGAAATGGGCATCGGCCCGGTGTTGGCGGTGCCCAAGCTACTgcgc > 6:151361‑M2/62‑147 (MQ=255) ccagggccgcgatgcccgagcgcgccgccagcgcaccttccatcagcacgcaggcactggGGCTTTACCGCGGTATCGCCGTGGCTGGCCTGGCCCCCGAGGAAATGGGCATCGGCCCGGTGTTGGCGGTGCCCAAGCTACTGCGCcag > 8:145943‑M2/61‑149 (MQ=255) cgcgatgcccgagcgcgccgccagcgcaccttccatcagcacgcaggcactggGGCTTTACCGCGGTATCGCCGTGGCTGGCCTGGCCCCCGAGGAAATGGGCATCGGCCCGGTGTTGGCGGTGCCCAAGCTACTGCGCCAGCAGGGcc < 7:145943‑M2/96‑1 (MQ=255) cTGCGTGCTGATGGAAGGTGCGCTGGCGGCGCGCTCGGGCATCGCGGCCCTGGGGCTTTACCGCGGTATCGCCGTGGCTGGCCTGGCCCCCGAGGAAATGGGCATCGGCCCGGTGTTGGCGGTGCCCAAGCTACTGCGCCAGCAGGGcc > 5:154296/1‑149 (MQ=255) cTGCGTGCTGATGGAAGGTGCGCTGGCGGCGCGCTCGGGCATCGCGGCCCTGGGGCTTTACCGCGGTATCGCCGTGGCTGGCCTGGCCCCCGAGGAAATGGGCATCGGCCCGGTGTTGGCGGTGCCCAAGCTACTGCGCCAGCAGGGcc > 7:193260/1‑149 (MQ=255) cGTGCTGATGGAAGGTGCGCTGGCGGCGCGCTCGGGCATCGCGGCCCTGGGGCTTTACCGCGGTATCGCCGTGGCTGGCCTGGCCCCCGAGGAAATGGGCATCGGCCCGGTGTTGGCGGTGCCCAAGCTACTGCGCCAGCAGGGCCTGa < 8:167479/149‑1 (MQ=255) gTGCTGATGGAAGGTGCGCTGGCGGCGCGCTCGGGCATCGCGGCCCTGGGGCTTTACCGCGGTATCGCCGTGGCTGGCCTGGCCCCCGAGGAAATGGGCATCGGCCCGGTGTTGGCGGTGCCCAAGCTACTGCGCCAGCAGGGCCTGAc < 2:171566/149‑1 (MQ=255) gTGCTGATGGAAGGTGCGCTGGCGGCGCGCTCGGGCATCGCGGCCCTGGGGCTTTACCGCGGTATCGCCGTGGCTGGCCTGGCCCCCGAGGAAATGGGCATCGGCCCGGTGTTGGCGGTGCCCAAGCTACTGCGCCAGCAGGGCCTGAc < 1:104216/149‑1 (MQ=255) cTGATGGAAGGTGCGCTGGCGGCGCGCTCGGGCATCGCGGCCCTGGGGCTTTACCGCGGTATCGCCGTGGCTGGCCTGGCCCCCGAGGAAATGGGCATCGGCCCGGTGTTGGCGGTGCCCAAGCTACTGCGCCAGCAGGGCCTGACGGt < 1:161027/149‑1 (MQ=255) aTGGAAGGTGCGCTGGCGGCGCGCTCGGGCATCGCGGCCCTGGGGCTTTACCGCGGTATCGCCGTGGCTGGCCTGGCCCCCGAGGAAATGGGCATCGGCCCGGTGTTGGCGGTGCCCAAGCTACTGCGCCAGCAGGGCCTGACGGTAGa > 5:79779/1‑149 (MQ=255) ggAAGGTGCGCTGGCGGCGCGCTCGGGCATCGCGGCCCTGGGGCTTTACCGCGGTATCGCCGTGGCTGGCCTGGCCCCCGAGGAAATGGGCATCGGCCCGGTGTTGGCGGTGCCCAAGCTACTGCGCCAGCAGGGCCTGACGGTAGAc < 1:152570/148‑1 (MQ=255) gAAGGTGCGCTGGCGGCGCGCTCGGGCATCGCGGCCCTGGGGCTTTACCGCGGTATCGCCGTGGCTGGCCTGGCCCCCGAGGAAATGGGCATCGGCCCGGTGTTGGCGGTGCCCAAGCTACTGCGCCAGCAGGGCCTGAGGGTAGAGGa > 8:312022/1‑149 (MQ=255) cgcTGGCGGCGCGCTCGGGCATCGCGGCCCTGGGGCTTTACCGCGGTATCGCCGTGGCTGGCCTGGCCCCCGAGGAAATGGGCATCGGCCCGGTGTTGGCGGTGCCCAAGCTACTGCGCCAGCAGGGCCTGACGGTAGACGATATCgg < 8:12683/148‑1 (MQ=255) cggcgCGCTCGGGCATCGCGGCCCTGGGGCTTTACCGCGGTATCGCCGTGGCTGGCCTGGCCCCCGAGGAAATGGGCATCGGCCCGGTGTTGGCGGTGCCCAAGCTACTGCGCCAGCAGGGCCTGACGGTAGACGATATCGGGCTATgg < 6:79779/149‑1 (MQ=255) cggcgCGCGCGGGCAGCGCGGCCCGGGGGCTTAACCCCGGTATCGCCGTGGCTGGCCTGGCCCCCGAGGAAATGGGCATCGGCCCGGTGTTGGCGGTGCCCAAGCTACTGCGCCAGCAGGGCCTGACGGTAGACGATATCGGGCTATgg < 4:257991/149‑1 (MQ=255) gggCATCGCGGCCCTGGGGCTTTACCGCGGTATCGCCGTGGCTGGCCTGGCCCCCTAGGAAATGGGCATCGGCCCGGTGTTGGCGGTGCCCAAGCTACTGCGCCAGCAGGGCCTGACGGTAGACGATATCGGGCTATGGGAGCTGAAt < 5:330439/148‑1 (MQ=255) gCATCGCGGCCCTGGGGCTTTACCGCGGTATCGCCGTGGCTGGCCTGGCCCCCGAGGAAATGGGCATCGGCCCGGTGTTGGCGGTGCCCAAGCTACTGCGCCAGCAGGGCCTGACGGTAGATGATATCGGGCTATGGGAGCTGAATGAg < 1:188448/149‑1 (MQ=255) gCATCGCGGCCCTGGGGCTTTACCGCGGTATCGCCGTGGCTGGCCTGGCCCCCGAGGAAATGGGCATCGGCCCGGTGTTGGCGGTGCCCAAGCTACTGCGCCAGCAGGGCCTGACGGTAGACg > 7:225280/1‑123 (MQ=255) gCATCGCGGCCCTGGGGCTTTACCGCGGTATCGCCGTGGCTGGCCTGGCCCCCGAGGAAATGGGCATCGGCCCGGTGTTGGCGGTGCCCAAGCTACTGCGCCAGCAGGGCCTGACGGTAGACg < 8:225280/123‑1 (MQ=255) gCCCTGGGGCTTTACCGCGGTATCGCCGTGGCTGGCCTGGCCCCCGAGGAAATGGGCATCGGCCCGGTGTTGGCGGTGCCCAAGCTACTGCGCCAGCAGGGCCTGACGGTAGACGATATCGGGCTATGGGAGCTGAATGAGGCGTTtgc > 5:215810/1‑149 (MQ=255) actggGGCTTTACCGCGGTATCGCCGTGGCTGGCCTGGCCCCCGAGGAAATGGGCATCGGCCCGGTGTTGGCGGTGCCCAAGCTACTGCGCCAGCAGGGCCTGACGGTAGACGATATCGGGCTATGGGAGCTGAATGAGGCGTTtgcct < 5:119661‑M2/144‑1 (MQ=255) ctggGGCTTTACCGCGGTATCGCCGTGGCTGGCCTGGCCCCCGAGGAAATGGGCATCGGCCCGGTGTTGGCGGTGCCCAAGCTACTGCGCCAGCAGGGCCTGACGGTAGCCGATATCGGGCTATGGGAGCTGAATGAGGCGTTtgcctg > 8:171218‑M2/5‑149 (MQ=255) gGGCTTTACCGCGGTATCGCCGTGGCTGGCCTGGCCCCCGAGGAAATGGGCATCGGCCCGGTGTTGGCGGTGCCCAAGCTACTGCGCCAGCAGGGCCTGACGGTAGACGATATCGGGCTATGGGAGCTGAATGAGGCGTTtgcctgc < 7:289177‑M2/146‑1 (MQ=255) | GACCCTGGCCGATCTGCAGGGGCTCAAGCCCGTGGTCGAAGGCGGTTGTGTCACGGCCGGCAATGCCAGTCAGCTGTCCGATGGCGCCAGTGCCTGCGTGCTGATGGAAGGTGCGCTGGCGGCGCGCTCGGGCATCGCGGCCCTGGGGCTTTACCGCGGTATCGCCGTGGCTGGCCTGGCCCCCGAGGAAATGGGCATCGGCCCGGTGTTGGCGGTGCCCAAGCTACTGCGCCAGCAGGGCCTGACGGTAGACGATATCGGGCTATGGGAGCTGAATGAGGCGTTTGCCTGC > NC_002947/2333746‑2334037 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |