New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2382486 | 42 (0.780) | 4 (0.080) | 4/250 | NT | 8.6% | coding (1411/1671 nt) | PP_2091 | serine/threonine‑protein kinase |
? | NC_002947 | = 2382538 | 45 (0.880) | coding (1359/1671 nt) | PP_2091 | serine/threonine‑protein kinase |
TCGAAGCGCTGCGCCGGGTCGCTCGCCACGGCCTGCAGCAGGTTGTGCTGCAGCCATTCCGGCAGGTCGGGTCGGTAGCGCGCGGCGTTGACCGGCTGGCCGAAGCGCGGGCGCTGGAAGGCCTCTACCTCGCCGTACGGGTAGTGTCCGGTCAGCAGGTGGTACAGGGTCACGCCCACTGCATACAAGTCCTGACGCGGGCTGGGCGGGTGGCCATCGAATGCTTCCGGGGCGATATACGAGGGCGTGCCGGGCAGCTCGTGCAGCGGGTCTTCGGACAGGCCCGGGCAATAA > NC_002947/2382392‑2382685 | tCGAAGCGCTGCGCCGGGTCGCTCGCCACGGCCTGCAGCAGGTTGTGCTGCAGCCATTCCGGCAGGTCGGGTCGGTAGCGCGCGGCGTTGACCGGCTGGCCGAAGCGCGGGCGCTGGAAGGCCTCTACCTCGCCGTACGGGTAGTGTcc < 6:15541‑M2/149‑3 (MQ=255) gAAGCGCTGCGCCGGGTCGCTCGCCACGGCCTGCAGCAGGTTGTGCTGCAGCCATTCCGGCAGGTCGGGTCGGTAGCGCGCGGCGTTGACCGGCTGGCCGAAGCGCGGGCGCTGGAAGGCCTCTACCTCGCCGTACGGGTAGTGTccgg < 1:21999‑M2/149‑5 (MQ=255) gAAGCGCTGCGCCGGGTCGCTCGCCACGGCCTGCAGCAGGTTGTGCTGCAGCCATTCCGGCAGGTCGGGTCGGTAGCGCGCGGCGTTGACCGGCTGGCCGAAGCGCGGGCGCTGGAAGGCCTCTACCTCGCCGTACGGGTAGTGTccgg < 4:187655‑M2/149‑5 (MQ=255) gAAGCGCTGCGCCGGGTCGCTCGCCACGGCCTGCAGCAGGTTGTGCTGCAGCCATTCCGGCAGGTCGGGTCGGTAGCGCGCGGCGTTGACCGGCTGGCCGAAGCGCGGGCGCTGGAAGGCCTCTACCTCGCCGTACGGGTAGTGTccgg < 4:109979‑M2/149‑5 (MQ=255) cggggTCGCTCGCCACGGCCTGCAGCAGGTTGTGCTGCAGCCATTCCGGCAGGTCGGGTCGGTAGCGCGCGGCGTTGACCGGCTGGCCGAAGCGCGGGCGCTGGAAGGCCTCTACCTCGCCGTACGGGTAGTGTCCGGTCAGCAggtgg < 6:159674/147‑1 (MQ=255) tcgctcgcCACGGCCTGCAGCAGGTTGTGCTGCAGCCATTCCGGCAGGTCGGGTCGGTAGCGCGCGGCGTTGACCGGCTGGCCGAAGCGCGGGCGCTGGAAGGCCTCTACCTCGCCGTACGGGTAGTGTCCGGTCAGCAGGTGGTACAg < 3:109979/149‑1 (MQ=255) ctcgcCACGGCCTGCAGCAGGTTGTGCTGCAGCCATTCCGGCAGGTCGGGTCGGTAGCGCGCGGCGTTGACCGGCTGGCCGAAGCGCGGGCGCTGGAAGGCCTCTACCTCGCCGTACGGGTAGTGTCCGGTCAGCAGGTGGTACAGGGt < 4:20356/149‑1 (MQ=255) tcgcCACGGCCTGCAGCAGGTTGTGCTGCAGCCATTCCGGCAGGTCGGGTCGGTAGCGCGCGGCGTTGACCGGCTGGCCGAAGCGCGGGCGCTGGAAGGCCTCTACCTCGCCGTACGGGTAGTGTCCGGTCAGCAGGTGGTACAGGGTc > 7:247552/1‑149 (MQ=255) tcgcCACGGCCTGCAGCAGGTTGTGCTGCAGCCATTCCGGCAGGTCGGGTCGGTAGCGCGCGGCGTTGACCGGCTGGCCGAAGCGCGGGCGCTGGAAGGCCTCTACCTCGCCGTACGGGTAGTGTCCGGTCAGCAGGAGGTACAGGGt > 7:270141/1‑148 (MQ=255) ccACGGCCTGCAGCAGGTTGTGCTGCAGCCATTCCGGCAGGTCGGGTCGGTAGCGCGCGGCGTTGACCGGCTGGCCGAAGCGCGGGCGCTGGAAGGCCTCTACCTCGCCGTACGGGTAGTGTCCGGTCAGCAGGTGGTACAGGGTCACg > 4:215259/1‑149 (MQ=255) aCGGCCTGCAGCAGGTTGTGCTGCAGCCATTCCGGCAGGTCGGGTCGGTAGCGCGCGGCGTTGACCGGCTGGCCGAAGCGCGGGCGCTGGAAGGCCTCTACCTCGCCGTACGGGTAGTGTCCGGTCAGCAGGTGGTACAGGGTCACGcc < 3:215259/149‑1 (MQ=255) ccTGCAGCAGGTTGTGCTGCAGCCATTCCGGCAGGTCGGGTCGGTAGCGCGCGGCGTTGACCGGCTGGCCGAAGCGCGGGCGCTGGAAGGCCTCTACCTCGCCGTACGGGTAGTGTCCGGTCAGCAGGTGGTACAGGGTCACGCCCACt < 5:15541/149‑1 (MQ=255) cagcagGTTGTGCTGCAGCCATTCCGGAAGGTCGGGTCGGTAGCGCGCGGCGTTGACCGGCTGGCCGAAGCGCGGGCGCTGGAAGGCCTCTACCTCGCCGTACGGGTAGTGTCCGGTCAGCAGGTGGTACAGGGTCACGCCCACTGCa > 5:111072/1‑148 (MQ=255) ttGTGCTGCAGCCATTCCGGCAGGTCGGGTCGGTAGCGCGCGGCGTTGACCGGCTGGCCGAAGCGCGGGCGCTGGAAGGCCTCTACCTCGCCGTACGGGTAGTGTCCGGTCAGCAGGTGGTACAGGGTCACGCCCACTGCATACAAGTc < 3:187655/149‑1 (MQ=255) tgctgcAGCCATTCCGGCAGGTCGGGTCGGTAGCGCGCGGCGTTGACCGGCTGGCCGAAGCGCGGGCGCTGGAAGGCCTCTACCTCGCCGTACGGGTAGTGTCCGGTCAGCAGGTGGTACAGGGTCACGCCCACTGCATACAAGTCCt < 4:191318/148‑1 (MQ=255) tgctgcAGCCATTCCGGCAGGTCGGGTCAGTAGCGCGCGGCGTTGACCGGCTGGCCGAAGCGCGGGCGCTGGAAGGCCTCTACCTCGCCGTACGGGTAGTGTCCGGTCAGCAGGTGGTACAGGGTCACGCCCACTGCATACAAGTCCTg < 6:224087/149‑1 (MQ=255) tgcAGCCATTCCGGCAGGTCGGGTCGGTAGCGCGCGGCGTTGACCGGCTGGCCGAAGCGCGGGCGCTGGAAGGCCTCTACCTCGCCGTACGGGTAGTGTCCGGTCAGCAGGTGGTACAGGGTCACGCCCACTGCATACAAGTCCTGAcg > 4:146521/1‑149 (MQ=255) cAGCCATTCCGGCAGGTCGGGTCGGTAGCGCGCGGCGTTGACCGGCTGGCCGAAGCGCGGGCGCTGGAAGGCCTCTACCTCGCCGTACGGGTAGTGTCCGGTCAGCAGGTGGTACAGGGTCACGCCCACTGCATACAAGTCCTGAcgcg > 3:219020/1‑149 (MQ=255) cAGCCATTCCGGCAGGTCGGGTCGGTAGCGCGCGGCGTTGACCGGCTGGCCGAAGCGCGGGCGCTGGAAGGCCTCTACCTCGCCGTACGGGTAGTGTCCGGTCAGCAGGGGGTACAGGGTCACGCGCACTGCATACAAGTCCTGAcgcg > 8:273626/1‑149 (MQ=255) aGCCATTCCGGCAGGTCGGGTCGGTAGCGCGCGGCGTTGACCGGCTGGCCGAAGCGCGGGCGCTGGAAGGCCTCTACCTCGCCGTACGGGTAGTGTCCGGTCAGCAGGTGGTACAGGGTCACGCCCACTGCATACAAGTCCTGACGCgg < 2:274298/149‑1 (MQ=255) ttCCGGCAGGTCGGGTCGGTAGCGCGGGGCGTTGTCCGGCTGGCCGAAGCGCGGGCGCTGGAAGGCCTCTACCTCGCCGTACGGGTAGTGTCCGGTCAGCAGGTGGTACAGGGTCACGCCCACTGCATACAAGTCCTGACGCGGGCTgg < 6:111072/149‑1 (MQ=255) aGGTCGGGTCGGTAGCGCGCGGCGTTGACCGGCTGGCCGAAGCGCGGGCGCTGGAAGGCCTCTACCTCGCCGTACGGGTAGTGTCCGGTCAGCAGGTGGTACAGGGTCACGCCCACTGCATACAAGTCCTGACGCGGGCTGGGCGGGTg < 3:146521/149‑1 (MQ=255) tcgggtcggTAGCGCGCGGCGTTGACCGGCTGGCCGAAGCGCGGGCGCTGGAAGGCCTCTACCTCGCCGTACGGGTAGTGTCCGGTCAGCAGGTGGTACAGGGTCACGCCCACTGCATACAAGTCCTGACGCGGGCTGGGCGGGTGGcc < 3:111833/149‑1 (MQ=255) tcgggtcggTAGCGCGCGGCGTTGACCGGCTGGCCGAAGCGCGGGCGCTGGAAGGCCTCTACCTCGCCGTACGGGTAGTGTCCGGTCAGCAGGTGGTACAGGGTCACGCCCACTGCATACAAGTCCTGACGCGGGCTGGGCGGGTGGc > 8:194869/1‑148 (MQ=255) gggtcggTAGCGCGCGGCGTTGACCGGCTGGCCGAAGCGCGGGCGCTGGAAGGCCTCTACCTCGCCGTACGGGTAGTGTCCGGTCAGCAGGTGGTACAGGGTCACGCCCACTGCATACAAGTCCTGACGCGGGCTGGGCGGGTGGCCAt < 3:90680/149‑1 (MQ=255) gggtcggTAGCGCGCGGCGTTGACCGGCTGGCCGAAGCGCGGGCGCTGGAAGGCCTCTACCTCGCCGTACGGGTAGTGTCCGGTCAGCAGGTGCTACAGGGTCACGCCCACTGCATACAAGTCCTGACGCGGGCTGGGCGGGTGGCCAt > 2:117002/1‑149 (MQ=255) ggtcggTAGCGCGCGGCGTTGACCGGCTGGCCGAAGCGCGGGCGCTGGAAGGCCTCTACCTCGCCGTACGGGTAGTGTCCGGTCAGCAGGTGGTACAGGGTCACGCCCACTGCATACAAGTCCTGACGCGGGCTGGGCGGGTGGCCATc > 3:56958/1‑149 (MQ=255) cggTAGCGCGCGGCGTTGACCGGCTGGCCGAAGCGCGGGCGCTGGAAGGCCTCTACCTCGCCGTACGGGTAGTGTCCGGTCAGCAGGTGGTACAGGGTCACGCCCACTGCATACAAGTCCTGACGCGGGCTGGGCGGGTGGCCATCGaa < 2:73611/149‑1 (MQ=255) ggTAGCGCGCGGCGTTGACCGGCTGGCCGAAGCGCGGGCGCTGGAAGGCCTCTACCTCGCCGTACGGGTAGTGTCCGGTCAGCAGGTGGTACAGGGTCACGCCCACTGCATACAAGTCCTGACGCGGGCTGGGCGGGTGGCCATCGaa < 7:194869/148‑1 (MQ=255) cggcgTTGACCGGCTGGCCGAAGCGCGGGCGCTGGAAGGCCTCTACCTCGCCGTACGGGTAGTGTCCGGTCAGCAGGTGGTACAGGGTCACGCCCACTGCATACAAGTCCTGACGCGGGCTGGGCGGGTGGCCATCGAATGCTTCCggg > 4:30923/1‑149 (MQ=255) gTTGACCGGCTGGCCGAAGCGCGGGCGCTGGAAGGCCTCTACCTCGCCGTACGGGTAGTGTccggtcaacgccgcgcgctaccgacccgacctgccggaatggctgcagcacaacctgctgcaggccgtggcgagcgacccggcgcagc < 2:233604‑M2/149‑89 (MQ=255) tGACCGGCTGGCCGAAGCGCGGGCGCTGGAAGGCCTCTACCTCGCCGTACGGGTAGTGTCCGGTCAGCAGGTGGTACAGGGTCACGCCCACTGCATACAAGTCCTGACGCGGGCTGGGCGGGTGGCCATCGAATGCTTCCGGGGCGata < 3:30923/149‑1 (MQ=255) ccGGCTGGCCGAAGCGCGGGCGCTGGAAGGCCTCTACCTCGCCGTACGGGTAGTGTCCGGTCAGCAGGTGGTACAGGGTCACGCCCACTGCATACAAGTCCTGACGCGGGCTGGGCGGGTGGCCATCGAATGCTTCCGGGGCGATATAc > 4:251610/1‑149 (MQ=255) cGGCTGGCCGAAGCGCGGGCGCTGGAAGGCCTCTACCTCGCCGTACGGGTAGTGTCCGGTCAGCAGGTGGTACAGGGTCACGCCCACTGCATACAAGTc < 8:285265/99‑1 (MQ=255) cGGCTGGCCGAAGCGCGGGCGCTGGAAGGCCTCTACCTCGCCGTACGGGTAGTGTCCGGTCAGCAGGTGGTACAGGGTCACGCCCACTGCATACAAGTc > 7:285265/1‑99 (MQ=255) cGGCTGGCCGAAGCGCGGGCGCTGGAAGGCCTCTACCTCGCCGTACGGGTAGTGTCCGGTCAGCAGGTGGTACAGGGTCACGCCCACTGCATACAAGTCCTGACGCGGGCTGGGCGGGTGGCCATCGAATGCTTCCGGGGCGATATACg > 5:73019/1‑149 (MQ=255) ggCTGGCCGAAGCGCGGGCGCTGGAAGGCCTCTACCTCGCCGTACGGGTAGTGTccggtcaacgccgcgcgctaccgacccgacctgccggaatggctgcagcacaacctgctgcaggccgtggcgagcgacccggcgcagcgcttcga > 1:233604‑M2/1‑54 (MQ=255) gCTGGCCGAAGCGCGGGCGCTGGAAGGCCTCTACCTCGCCGTACGGGTAGTGTccggtcaacgccgcgcgctaccgacccgacctgccggaatggctgcagcacaacctgctgcaggccgtggcgagcgacccggcgcagcgcttc > 8:290602‑M2/1‑53 (MQ=255) gCTGGCCGAAGCGCGGGCGCTGGAAGGCCTCTACCTCGCCGTACGGGTAGTGTccggtcaacgccgcgcgctaccgacccgacctgccggaatggctgcagcacaacctgctgcaggccgtggcgagcgacccggcgcagcgcttc < 7:290602‑M2/146‑94 (MQ=255) gcgcGGGCGCTGGAAGGCCTCTACCTCGCCGTACGGGTAGTGTCCGGTCAGCAGGTGGTACAGGGTCACGCCCACTGCATACAAGTCCTGACGCGGGCTGGGCGGGTGGCCATCGAATGCTTCCGAGGCGATATACGAGGGCGTGCCgg > 4:293336/1‑149 (MQ=255) cgcgGGCGCTGGAAGGCCTCTACCTCGGCTTACGGTTAGTGTCAGTGCAGCAGGTGGTACATGGTCACGCCCACTGCATACAAGTCCTGACGCGGGCTGGGCGGGTGTCCATCGAATGCTTCCGGGGCGATATACGAGGGCGTGCCgg < 8:270141/148‑1 (MQ=255) cgcgGGCGCTGGAAGGCCTCTACCTCGCCGTACGGGTAGTGTCCGGTCAGCAGGTGGTACAGGGTCACGCCCACTGCATACAAGTCCTGACGCGGGCTGGGCGGGTGGCCATCGAATGCTTCCGAGGCGATATACGAGGGCGTGCCggg < 3:293336/149‑1 (MQ=255) cgcgGGCGCTGGAAGGCCTCTACCACGCCGTACGGGTAGTGTCCGGTCAGCAGGTGGTACAGGGTCACGCCCACTGCATACAACTCCTGACGCGGGCTGGGCGGGTGGCCATCGAATGCTTCCGGGGCGATATACGAGGGCGTGCCggg < 4:19117/149‑1 (MQ=255) gAAGGCCTCTACCTCGCCGTACGGGTAGTGTCCGGTCAGCAGGTGGTACAGGGTCACGCCCACTGCATACAAGTCCTGACGCGGGCTGGGCGGGTGGCCATCGAATGCTTCCGGGGCGATATACGAGGGCGTGCCGGGCAGCTCGTg < 6:176461/147‑1 (MQ=255) gCCTCTACCTCGCCGTACGGGTAGTGTCCGGTCAGCAGGTGGTACAGGGTCACGCCCACTGCATACAAGTCCTGACGCGGGCTGGGCGGGTGGCCATCGAATGCTTCCGGGGCGATATACGAGGGCGTGCCGGGCAGCTCGTGCAGCgg < 6:73019/149‑1 (MQ=255) ccTCTACCTCGCCGTACGGGTAGTGTCCGGTCAGCAGGTGGTACAGGGTCACGCCCACTGCATACAAGTCCTGACGCGGGCTGGGCg < 4:121403/87‑1 (MQ=255) ccTCTACCTCGCCGTACGGGTAGTGTCCGGTCAGCAGGTGGTACAGGGTCACGCCCACTGCATACAAGTCCTGACGCGGGCTGGGCg > 3:121403/1‑87 (MQ=255) ccTCTACCTCGCCGTACGGGTAGTGTCCGGTCAGCAGGTGGTACAGGGTCACGCCCACTGCATACAAGTCCTGACGCGGGCTGGGCGGGTGGCCATCGAATGCTTCCGGGGCGATATACGAGGGCGTGCCGGGCAGCTCGTGCAGCggg < 8:247552/149‑1 (MQ=255) tACCTCGCCGTACGGGTAGTGTCCGGTCAGCAGGTGGTACAGGGTCACGCCCACTGCATACAAGTCCTGACGCGGGCTGGGCGGGTGGCCATCGAATGCTTCCGGGGCGATATACGAGGGCGTGCCGGGCAGCTCGTGCAGCGGGTCtt > 4:319949/1‑149 (MQ=255) ccTCGCCGTACGGGTAGGGTCCGGGCAGCAGGTGGTACAGGGTCACGCCCACTGCATACCAGTCCTGACGCGGGCTGGGCGGGTGGCCATCGAATGCTTCCGGGGCGATATACGAGGGCGTGCCGGGCAGCTCGTGCAGCGGGTCTTc < 7:273626/148‑1 (MQ=255) ggTAGTGTCCGGTCAGCAGGTGGTACAGGGTCACGCCCACTGCATACAAGTCCTGACGCGGGCTGGGCGGGTGGCCATCGAATGCTTCCGGGGCGATATACGAGGGCGTGcc < 2:38804/112‑1 (MQ=255) ggTAGTGTCCGGTCAGCAGGTGGTACAGGGTCACGCCCACTGCATACAAGTCCTGACGCGGGCTGGGCGGGTGGCCATCGAATGCTTCCGGGGCGATATACGAGGGCGTGcc > 1:38804/1‑112 (MQ=255) tAGTGTCCGGTCAGCAGGTGGTACAGGGTCACGCCCACTGCATACAAGTCCTGACGCGGGCTGGGCGGGTGGCCATCGAATGCTTCCGGGGCGATATACGAGGGCGTGCCGGGCAGCTCGTGCAGCGGGTCTTCGGACAGGCCCGGGc > 2:288674/1‑148 (MQ=255) tgtCCGGTCAGCAGGTGGTACAGGGTCACGCCCACTGCATACAAGTCCTGACGCGGGCTGGGCGGGTGGCCATCGAATGCTTCCGGGGCGATATACGAGGGCGTGCCGGGCAGCTCGTGCAGCGGGTCTTCGGACAGGCCCGGGCAAt > 7:48190/1‑148 (MQ=255) gtCCGGTCAGCAGGTGGTACAGGGTCACGCCCACTGCATACAAGTCCTGACGCGGGCTGGGCGGGTGGCCATCGAATGCTTCCGGGGCGATATACGAGGGCGTGCCGGGCAGCTCGTGCAGCGGGTCTTCGGACAGGCCCGGGCAAt > 5:69383/1‑147 (MQ=255) tCCGTTCAGCAGGTGGTACAGGGTCACGCCCACTGCATACAAGTCCTGACGCGGGCTGGGCGGGTGGCCATCGAATGCTTCCGGGGCGATATACGAGGGCGTGCCGGGCAGCTCGTGCAGCGGGTCTTCGGACAGGCCCGGGCAATaa < 4:318364/148‑1 (MQ=255) tCCGGTCAGCAGGTGGTACAGGGTCACGCCCACTGCATACAAGTCCTGACGCGGGCTGGGCGGGTGGCCATCGAATGCTTCCGGGGCGATATACGAGGGCGTGCCGGGCAGCTCGTGCAGCGGGTCTTCGGACAGGCCCGGGCAAt > 3:318364/1‑146 (MQ=255) | TCGAAGCGCTGCGCCGGGTCGCTCGCCACGGCCTGCAGCAGGTTGTGCTGCAGCCATTCCGGCAGGTCGGGTCGGTAGCGCGCGGCGTTGACCGGCTGGCCGAAGCGCGGGCGCTGGAAGGCCTCTACCTCGCCGTACGGGTAGTGTCCGGTCAGCAGGTGGTACAGGGTCACGCCCACTGCATACAAGTCCTGACGCGGGCTGGGCGGGTGGCCATCGAATGCTTCCGGGGCGATATACGAGGGCGTGCCGGGCAGCTCGTGCAGCGGGTCTTCGGACAGGCCCGGGCAATAA > NC_002947/2382392‑2382685 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |