New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2988836 = | 31 (0.580) | 6 (0.110) | 6/256 | NT | 14.4% | coding (506/951 nt) | PP_2613 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 2988881 = | 41 (0.790) | coding (461/951 nt) | PP_2613 | hypothetical protein |
TGATTTTGAGCGGGCAGCAATCGGCTTGTTTTCGTGTGTTTTCCATTCATGAGCCGGCCCCCAGTTGACTCGCCATGCCAACCGAGACACCGGGCCAAGCCAGGCCTTGCGATGGTCGTCGTCCAGCGCATTCAGCCAGGCTGCAAGATGGTCCGGTGTGACATGGTGAGTGGCAACGCTGTGGTCAGGGAGCACGACCTGCACCAGGCTGGTGAAGTGGTCTGCCAGCGCTGCCAGGCCAACCTCGGCATCCAGCGCGATGGCTCCACCGATAGGCATCCAGGTC > NC_002947/2988739‑2989024 | tGATTTTGAGCGGGCAGCAATCGGCTTGTTTTCGTGTGTTTTCCATTCATGAGCCGGCCCCCAGTTGACTCGCCATGCCAACCGAGACACCGGGCCAAGCCAGGCCTTGCGATGGTCGTCGTCCAGCGCATTCAGCCAGGCTGCAAGAt > 5:265133/1‑149 (MQ=255) gcctggcagcgctggcagaccacttcaccagcctggtgcaggtcgtgctccctgaccacagcgttgccactcaccatgtcacaccggaccatcttgcAGCCAGGCCTTGCGATGGTCGTCGTCCAGCGCATTCAGCCAGGCTGCAAGa > 7:273119‑M1/98‑148 (MQ=255) gATTTTGAGCGGGCAGCAATCGGCTTGTTTTCGTGTGTTTTCCATTCATGAGCCGGCCCCCAGTTGACTCGCCATGCCAACCGAGACACCGGGCCAAGCCAGGCCTTGCGATGGTCGTCGTCCAGCGCATTCAGCCAGGCTGCAAGATg > 5:342972/1‑149 (MQ=255) gctggcagaccacttcaccagcctggtgcaggtcgtgctccctgaccacagcgttgccactcgccatgccaaccgagacaccgggccaAGCCAGGCCTTGCGATGGTCGTCGTCCAGCGCATTCAGCCAGGCTGCAAGATGGTCCGgtg < 6:3176‑M1/61‑1 (MQ=255) ggCAGCAATCGGCTTGTTTTCGTGTGTTTTCCATTCATGAGCCGGCCCCCAGTTGACTCGCCATGCCAACCGAGACACCGGGCCAAGCCAGGCCTTGCGATGGTCGTCGTCCAGCGCATTCAGCCAGGCTGCAAGATGGTCCGGTGTGa < 4:163451/149‑1 (MQ=255) gcgctggcagaccacttcaccagcctggtgcaggtcgtgctccctgaccacagcgttgccactcaccatgtcacaccgggccaAGCCAGGCCTTGCGATGGTCGTCGTCCAGCGCATTCAGCCAGGCTGCAAGATGGTCCGGTGTGACa > 1:120653‑M1/84‑149 (MQ=255) caATCGGCTTGTTTTCGTGTGTTTTCCATTCATGAGCCGGCCCCCAGTTGACTCGCCATGCCAACCGAGACACCGGGCCAAGCCAGGCCTTGCGATGGTCGTCGTCCAGCGCATTCAGCCAGGCTGCAAGATGGTCCGGTGTGACATgg < 3:220713/149‑1 (MQ=255) accacttcaccagcctggtgcaggtcgtgctccctgaccacagcgttgccactcgccatgccaaccgagacaccgggccaAGCCAGGCCTTGCGATGGTCGTCGTCCAGCGCATTCAGCCAGGCTGCAAGATGGTCCGGTGTGACATgg > 5:3176‑M1/81‑149 (MQ=255) ggCTTGTTTTCGTGTGTTTTCCATTCATGAGCCGGCCCCCAGTTGACTCGCCATGCCAACCGAGACACCGGGCCAAGCCAGGCCTTGCGATGGTCGTCGTCCAGCGCATTCAGCCAGGCTGCAAGATGGTCCGGTGTGACATGGTGAGt < 6:197718/149‑1 (MQ=255) gTTTTCGTGTGTTTTCCATTCATGAGCCGGCCCCCAGTTGACTCGCCATGCCAACCGAGACACCGGGCCAAGCCAGGCCTTGCGATGGTCGTCGTCCAGCGCATTCAGCCAGGCTGCAAGATGGTCCGGTGTGACATGGTGAGTGGc < 7:55561/147‑1 (MQ=255) gtgtgtTTTCCATTCATGAGCCGGCCCCCAGTTGACTCGCCATGCCAACCGAGACACCGGGCCAAGCCAGGCCTTGCGATGGTCGTCGTCCAGCGCATTCAGCCAGGCTGCAAGATGGTCCGGTGTGACATGGTGAGTGGCAACGCtgt > 1:317815/1‑149 (MQ=255) tgtgtTTTCCATTCATGAGCCGGCCCCCTGTTGACTCGCCATGCCAACCGAGACACCGGGCCAAGCCAGGCCTTGCGATGGTCGTCGTCCAGCGCATTCAGCCAGGCTGCAAGATGGTCCGGTGTGACATGGTGAGTGGCAACGCtgtg < 5:249330/149‑1 (MQ=255) tgtTTTCCATTCATGAGCCGGCCCCCAGTTGACTCGCCATGCCAACCGAGACACCGGGCCAAGCCAGGCCTTGCGATGGTCGTCGTCCAGCGCATTCAGCCAGGCTGCAAGATGGTCCGGTGTGACATGGTGAGTGGCAACGCTGTgg < 5:246179/148‑1 (MQ=255) cATTCATGAGCCGGCCCCCAGTTGACTCGCCATGCCAACCGAGACACCGGGCCAAGCCAGGCCTTGCGATGGTCGTCGTCCAGCGCATTCAGCCAGGCTGCAAGATGGTCCGGTGTGACATGGTGAGTGGCAACGCTGTGGTCAGGGa < 3:268613/148‑1 (MQ=255) aTTCATGAGCCGGCCCCCAGTTGACTCGCCATGCCAACCGAGACACCGGGCCAAGCCAGGCCTTGCGATGGTCGTCGTCCAGCGCATTCAGCCAGGCTGCAAGATGGTCCGGTGTGACATGGTGAGTGGCAACGCTGTGGTCAGGGAg > 4:303336/1‑148 (MQ=255) gCCCCCAGTTGACTCGCCATGCCAACCGAGACACCGGGCCAAGCCAGGCCTTGCGATGGTCGTCGTCCAGCGCATTCAGCCAGGCTGCAAGATGGTCCGGTGTGACATGGTGAGTGGCAACGCTGTGGTCAGGGAGCACGACCTGCAc > 4:94349/1‑148 (MQ=255) cccccAGTTGACTCGCCATGCCAACCGAGACACCGGGCCAAGCCAGGCCTTGCGATGGTCGTCGTCCAGCGCATTCAGCCAGGCTGCAAGATGGTCCGGTGTGACATGGTGAGTGGCAACGCTGTGGTCAGGGAGCACGACCTGCAc > 8:297048/1‑147 (MQ=255) aCTCGCCATGCCAACCGAGACACCGGGCCAAGCCAGGCCTTGCGATGGTCGTCGTCCAGCGCATTCAGCCAGGCTGCAAGATGGTCCGGTGTGACATGGTGAGTGGCAACGCTGTGGTCAGGGAGCACGACCTGCACCAGGCTGGTg > 4:116293/1‑147 (MQ=255) aCTCGCCATGCCAACCGAGACACCGGGCCAAGCCAGGCCTTGCGATGGTCGTCGTCCAGCGCATTCAGCCAGGCTGCAAGATGGTCCGGTGTGACATGGTGAGTGGCAACGCTGTGGTCAGGGAGCACGACCTGCACCAGGCTGGTGaa < 7:297048/149‑1 (MQ=255) gCCATGCCAACCGAGACACCGGGCCAAGCCAGGCCTTGCGATGGTCGTCGTCCAGCGCATTCAGCCAGGCTGCAAGATGGTCCGGTGTGACATGGTGAGTGGCAACGCTGTGGTCAGGGAGCACGACCTGCACCAGGCTGGTGAAGTgg > 2:11188/1‑149 (MQ=255) gCCATGCCAACCGAGACACCGGGCCAAGCCAGGCCTTGCGATGGTCGTCGTCCAGCGCATTCAGCCAGGCTGCAAGATGGTCCGGTGTGACATGGTGAGTGGCAACGCTGTGGTCAGGGAGCACGACCTGCACCAGGCTGGTGAAGTgg > 4:328978/1‑149 (MQ=255) ccatgtcacaccggaccatcttgcagcctggctgaatgcgctggacgacgaccatcgcaaggcctggcttgGCCCGGTGTCTCGGT‑TGGCATGGCGAGTGGCAACGCTGTGGTCAGGGAGCACGACCTGCACCAGGCTGGTGAAGTGGt > 5:3176‑M2/72‑149 (MQ=255) aTGCCAACCGAGACACCGGGCCAAGCCAGGCCTTGCGATGGTCGTCGTCCAGCGCATTCAGCCAGGCTGCAAGATGGTCCGGTGTGACATGGTGAGTGGCAACGCTGTGGTCAGGGAGCACGACCTGCACCAGGCTGGTGAAGTGGTCt > 2:36872/1‑149 (MQ=255) tgtcacaccggaccatcttgcagcctggctgaatgcgctggacgacgaccatcgcaaggcctggct‑‑‑‑‑‑TGGCCCGGTGTGACATGGTGAGTGGCAACGCTGTGGTCAGGGAGCACGACCTGCACCAGGCTGGTGAAGTGGTCTGCCAgcgc > 1:120653‑M2/67‑149 (MQ=255) caccggaccatcttgcagcctggctgaatgcgctggacgacgaccatcgcaaggcctggcttgGCCCGGTGTCTCGGT‑TGGCATGGCGAGTGGCAACGCTGTGGTCAGGGAGCACGACCTGCACCAGGCTGGTGAAGTGGTCTGCCAgc < 6:3176‑M2/86‑1 (MQ=255) aaCCGAGACACCGGGCCAAGCCAGGCCTTGCGATGGTCGTCGTCCAGCGCATTCAGCCAGGCTGCAAGATGGTCCGGTGTGACATGGTGAGTGGCAACGCtgtg > 4:99979/1‑104 (MQ=255) aaCCGAGACACCGGGCCAAGCCAGGCCTTGCGATGGTCGTCGTCCAGCGCATTCAGCCAGGCTGCAAGATGGTCCGGTGTGACATGGTGAGTGGCAACGCtgtg < 3:99979/104‑1 (MQ=255) ccGAGACACCGGGCCAAGCCAGGCCTTGCGATGGTCGTCGTCCAGCGCATTCAGCCAGGCTGCAAGATGGTCCGGTGTGACATGGTGAGTGGCAACGCTGTGGTCAGGGAGCACGACCTGCACCAGGCTGGTGAAGTGGTCTGCCAgcg > 6:175268/1‑149 (MQ=255) gaCACCGGGCCAAGCCAGGCCTTGCGATGGTCGTCGTCCAGCGCATTCAGCCAGGCTGCAAGATGGTCCGGTGTGACATGGTGAGTGGCAACGCTGTGGTCAGGGAGCACGACCTGCACCAGGCTGGTGAAGTGGTCTGCCAGCGATGc > 6:341382/1‑149 (MQ=255) gccGGGCCACGCCAGGCCTTGCGATGGTCGTCGTCCAGCGCATTCAGCCAGGCTGCAAGATGGTCCGGTGTGACATGGTGAGTGGCAACGCTGTGGTCAGGGAGCACGACCTGCACCAGGCTGGTGAAGTGGTCt < 6:324732/134‑1 (MQ=255) acCGGGCCAAGCCAGGCCTTGCGATGGTCGTCGTCCAGCGCATTCAGCCAGGCTGCAAGATGGTCCGGTGTGACATGGTGAGTGGCAACGCTGTGGTCAGGGAGCACGACCTGCACCAGGCTGGTGAAGTGGTCTGCCAGCGCTGCCAg < 1:36872/149‑1 (MQ=255) tcttgcagcctggctgaatgcgctggacgacgaccatcgcaaggcctggctGCAAGATGGTCCGGTGTGACATGGTGAGTGGCAACGCTGTGGTCAGGGAGCACGACCTGCACCAGGCTGGTGAAGTGGTCTGCCAGCGCTGCCAGGc > 7:273119‑M2/52‑148 (MQ=255) ggcAGGCCTTGCGATGGTCGTCGTCCAGATCATTCTGCCAGGCTGTATGATGGTGCGTTGTGAGATGGTGAGTGGCAACGCTGTGGTCTGTGAGCACGAGCTGCCCGAGGCTGGTGAAGTGGTGTGCCATGGCTGGCAGGCCAACCTCg < 6:342972/147‑1 (MQ=255) gcctggctgaatgcgctggacgacgaccatcgcaaggcctggctGCAAGATGGTCCGGTGTGACATGGTGAGTGGCAACGCTGTGGTCAGGGAGCACGACCTGCACCAGGCTGGTGAAGTGGTCTGCCAGCGCTGCCAGGCCAACCTCg > 7:281555‑M2/45‑149 (MQ=255) GCCAGGCCTTGCGATGGTCGTCGTCCAGCGCATTCAGCCAGGCTGCAAGATGGTCCGGTGTGACATGGTGAGTGGCAACGCTGTGGTCAGGGAGCACGACCTGCACCAGGCTGGTGAAGTGGTCTGCCAGCGCTGCCAGGCCAACCTCg > 5:175268‑M1/1‑149 (MQ=255) GCCAGGCCTTGCGATGGTCGTCGTCCAGCGCATTCAGCCAGGCTGCAAGATGGTCCGGTGTGACATGGTGAGTGGCAACGCTGTGGTCAGGGAGCACGACCTGCACCAGGCTGGTGAAGTGGTCTGCCAGCGCTGCCAGGCCAACCTCg > 3:303336‑M1/1‑149 (MQ=255) CAGGCCTTGCGATGGTCGTCGTCCAGCGCATTCAGCCAGGCTGCAAGATGGTCCGGTGTGACATGGTGAGTGGCAACGCTGTGGTCAGGGAGCACGACCTGCACCAGGCTGGTGAAGTGGTCTGCCAGCGCTGCCAGGCCAACCTCGGc > 6:265133‑M1/1‑149 (MQ=255) tggctgaatgcgctggacgacgaccatcgcaaggcctggctGCAAGATGGTCCGGTGTGACATGGTGAGTGGCAACGCTGTGGTCAGGGAGCACGACCTGCACCAGGCTGGTGAAGTGGTCTGCCAGCGCTGCCAGGCCAACCTCGGCa < 8:281555‑M2/108‑1 (MQ=255) cTTGCGATGGTCGTCGTCCAGCGCATTCAGCCAGGCTGCAAGATGGTCCGGTGTGACATGGTGAGTGGCAACGCTGTGGTCAGGGAGCACGACCTGCACCAGGCTGGTGAAGTGGTCTGCCAGCGCTGCCAGGCCAACCTCGGCATc > 2:108689/1‑147 (MQ=255) gATGGTCGTCGTCCAGCGCATTCAGCCAGGCTGCAAGATGGTCCGGTGTGACATGGTGAGTGGCAACGCTGTGGTCAGGGAGCACGACCTGCACCAGGCTGGTGAAGTGGTCTGCCAGCGCTGCCAGGCCAACCTCGGCATCCAgcgc > 8:42855/1‑148 (MQ=255) gATGGTCGTCGTCCAGCGCATTCAGCCAGGCTGCAAGATGGTCCGGTGTGACATGGTGAGTGGCAACGCTGTGGTCAGGGAGCACGACCTGCACCAGGCTGGTGAAGTGGTCTGCCAGCGCTGCCAGGCCAACCTCGGCATCCAgcgc > 2:303507/1‑148 (MQ=255) gtcgtcgtcCAGCGCATTCAGCCAGGCTGCAAGATGGTCCGGTGTGACATGGTGAGTGGCAACGCTGTGGTCAGGGAGCACGACCTGCACCAGGCTGGTGAAGTGGTCTGCCAGCGCTGCCAGGCCAACCTCGGCATCCAGCGCGATg < 1:11188/148‑1 (MQ=255) cgtcgtcCAGCGCATTCAGCCAGGCTGCAAGATGGTCCGGTGTGACATGGTGAGTGGCAACGCTGTGGTCAGGGAGCACGACCTGCACCAGGCTGGTGAAGTGGTCTGCCAGCGCTGCCAGGCCAACCTCGGCATCCAGCGCGATGGCt > 6:216878/1‑149 (MQ=255) gtcgtcCAGCGCATTCAGCCAGGCTGCAAGATGGTCCGGTGTGACATGGTGAGTGGCAACGCTGTGGTCAGGGAGCACGACCTGCACCAGGCTGGTGAAGTGGTCTGCCAGCGCTGCCAGGCCAACCTCGGCATCCAGCGCGATGGCTc > 5:254074/1‑149 (MQ=255) gtcgtcCAGCGCATTCAGCCAGGCTGCAAGATGGTCCGGTGTGACATGGTGAGTGGCAACGCTGTGGTCAGGGAGCACGACCTGCACCAGGCTGGTGAAGTGGTCTGCCAGCGCTGCCAGGCCAACCTCGGCATCCAGCGCGATGGCTc > 1:9703/1‑149 (MQ=255) gtcCAGCGCATTCAGCCAGGCTGCAAGATGGTCCGGTGTGACATGGTGAGTGGCAACGCTGTGGTCAGGGAGCACGACCTGCACCAGGCTGGTGAAGTGGTCTGCCAGCGCTGCCAGGCCAACCTCGGCATCCAGCGCGATGGCTCCAc < 5:216878/149‑1 (MQ=255) gcgcATTCAGCCAGGCTGCAAGATGGTCCGGTGTGACATGGTGAGTGGCAACGCTGTGGTCAGGGAGCACGACCTGCACCAGGCTGGTGAAGTGGTCTGCCAGCGCTGCCAGGCCAACCTCGGCATCCAGCGCGATGGCTCCACCGATa < 7:42855/149‑1 (MQ=255) gcgcATTCAGCCAGGCTGCAAGATGGTCCGGTGTGACATGGTGAGTGGCAACGCTGTGGTCAGGGAGCACGACCTGCACCAGGCTGGTGAAGTGGTCTGCCAGCGCTGCCAGGCCAACCTCGGCATCCAGCGCGATGGCTCCACCGATa < 1:108689/149‑1 (MQ=255) cgcATTCAGCCAGGCTGCAAGATGGTCCGGTGTGACATGGTGAGTGGCAACGCTGTGGTCAGGGAGCACGACCTGCACCAGGCTGGTGAAGTGGTCTGCCAGCGCTGCCAGGCCAACCTCGGCATCCAGCGCGATGGCTCCACCGATAg < 3:116293/149‑1 (MQ=255) aTTCAGCCAGGCTGCAAGATGGTCCGGTGTGACATGGTGAGTGGCAACGCTGTGGTCAGGGAGCACGACCTGCACCAGGCTGGTGAAGTGGTCTGCCAGCGCTGCCAGGCCAACCTCGGCATCCAGCGCGATGGCTCCACCGATAGGCa > 2:340620/1‑149 (MQ=255) ttCAGCCAGGCTGCAAGATGGTCCGGTGTGACATGGTGAGTGGCAACGCTGTGGTCAGGGAGCACGACCTGCACCAGGCTGGTGAAGTGGTCTGCCAGCGCTGCCAGGCCAACCTCGGCATCCAGCGCGATGGCTCCACCGATa < 7:293277/144‑1 (MQ=255) ttCAGCCAGGCTGCAAGATGGTCCGGTGTGACATGGTGAGTGGCAACGCTGTGGTCAGGGAGCACGACCTGCACCAGGCTGGTGAAGTGGTCTGCCAGCGCTGCCAGGCCAACCTCGGCATCCAGCGCGATGGCTCCACCGATa > 8:293277/1‑144 (MQ=255) cAGCCAGGCTGCAAGATGGTCCGGTGTGACATGGTGAGTGGCAACGCTGTGGTCAGGGAGCACGACCTGCAcc > 7:116090/1‑73 (MQ=255) cAGCCAGGCTGCAAGATGGTCCGGTGTGACATGGTGAGTGGCAACGCTGTGGTCAGGGAGCACGACCTGCAcc < 8:116090/73‑1 (MQ=255) aGCCAGGCTGCAAGATGGTCCGGTGTGACATGGTGAGTGGCAACGCTGTGGTCAGGGAGCACGACCTGCACCAGGCTGGTGAAGTGGTCTGCCAGCGCTGCCAGGCCAACCTCGGCATCCAGCGCGATGGCTCCACCGATAGGCATc > 5:173914/1‑147 (MQ=255) aGGCTGCAAGATGGTCCGGTGTGACATGGTGAGTGGCAACGCTGTGGTCAGGGAGCACGACCTGCACCAGGCTGGTGAAGTGGTCTGCCAGCGCTGCCAGGCCAACCTCGGCATCCAGCGCGATGGCTCCACCGATAGGCATCCAGTTc < 3:94349/149‑1 (MQ=255) | TGATTTTGAGCGGGCAGCAATCGGCTTGTTTTCGTGTGTTTTCCATTCATGAGCCGGCCCCCAGTTGACTCGCCATGCCAACCGAGACACCGGGCCAAGCCAGGCCTTGCGATGGTCGTCGTCCAGCGCATTCAGCCAGGCTGCAAGATGGTCCGGTGTGACATGGTGAGTGGCAACGCTGTGGTCAGGGAGCACGACCTGCACCAGGCTGGTGAAGTGGTCTGCCAGCGCTGCCAGGCCAACCTCGGCATCCAGCGCGATGGCTCCACCGATAGGCATCCAGGTC > NC_002947/2988739‑2989024 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |