New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3464991 | 60 (1.110) | 3 (0.060) | 3/256 | NT | 5.5% | coding (804/1062 nt) | aroF‑II | tyr‑sensitive phospho‑2‑dehydro‑3‑deoxyheptonate aldolase |
? | NC_002947 | = 3465038 | 44 (0.840) | coding (757/1062 nt) | aroF‑II | tyr‑sensitive phospho‑2‑dehydro‑3‑deoxyheptonate aldolase |
GCCGGCCAGGCGCTGTTCCAGCACATCATTGAAGACCGCTGGCTGGCGCGCCGGGTCCTTGCCGCTGTTGGCGTGGCTGCAATCGACCATGATCCGTGCCTGCAGACCGG‑CCTTGGCCAACGCCTGGCGGGCCATGGCGATGCTGTTGGCATCATGGTTCGGGCCTTTGTGGCCGCCGCGCAGTACAAGGTGTGTGTCCGGGTTGCCCAAGGTCTCGATGATCGCCGGGTGGCCCTGAGCATCCATACCGAAGTGGCGGTGCGGGTGGGCAGCGCTGCGCATGGCGTCGCTGG > NC_002947/3464892‑3465184 | gCCGGCCAGGCGCTGTTCCAGCACATCATTGAAGACCGCTGGCTGGCGCGCCGGGTCCTTGCCGCTGTTGGCGTGGCTGCAATCGACCATGATCCGTGCCTGCAGACCGG‑CCTTGGCCAACGCCTGGCGGGCCATGGCGATGCTGTTgg > 2:7095‑M2/1‑147 (MQ=255) gCCGGCCAGGCGCTGTTCCAGCACATCATTGAAGACCGCTGGCTGGAGCGCCGGGTCCTAGCCGCTGTTGGCGTGGCTGCAATCGACCATGATCCGTGCCTGCAGACCGG‑CCTTGGCCAACGCCTGTCGGTCCATGGCGATGCTGTTgg < 8:132785‑M2/149‑3 (MQ=255) cTGTTCCATCACATCATTTAAGTCCGCTGGCTGGCGCGCCGGGTCCTTGCCGCTGTTGGCGTGGCTGCAATCGACCATGATCCGTGCCTGCAGACCGG‑CCTTGGCCAACGCCTGGCGGGCCATGGCGATGCTGTTGGCATCATGGTTCg < 4:267659/149‑1 (MQ=255) cTGTTCCAGCACATCATTGAAGACCGCTGGCTGGCGCGCCGGGTCCTTGCCGCTGTTGGCGTGGCTGCAATCGACCATGATCCGTGCCTGCAGACCGG‑CCTTGGCCAACGCCTGGCGGGCCATGGCGATGCTGTTGGCATCATGGTTCg < 5:220430/149‑1 (MQ=255) ttCCAGCACATCATTGAAGACCGCTGGCTGGCGCGCCGGGTCCTTGCCGCTGTTGGCGTGGCTGCAATCGACCATGATCCGTGCCTGCAGACCGG‑CCTTGGCCAACGCCTGGCGGGCCATGGCGATGCTGTTGGCATCATGGTTCggg < 1:243934/148‑1 (MQ=255) ttCCAGCACATCATTGAAGACCGCTGGCTGGCGCGCCGGGTCCTTGCCGCTGTTGGCGTGGCTGCAATCGACCATGATCCGTGCCTGCAGACCGG‑CCTTGGCCAACGCCTGGCGGGCCATGGCGATGCTGTTGGCATCATGGTTCgg < 1:237888/147‑1 (MQ=255) atcatTGAAGACCGCTGGCTGGCGCGCCGGGTCCTTGCCGCTGTTGGCGTGGCTGCAATCGACCATGATCCGTGCCTGCAGACCGG‑CCTTGGCCAACGCCTGGCGGGCCATGGCGATGCTGTTGGCATCATGGTTCGGGCCTTTGTGgc > 4:327032/1‑149 (MQ=255) atTGAAGACCGCTGGCTGGCGCGCCGGGTCCTTGCCGCTGTTGGCGTGGCTGCAATCGACCATGATCCGTGCCTGCAGACCGG‑CCTTGGCCAACGCCTGGCGGGCCATGGCGATGCTGTTGGCATCATGGTTCGGGCCTTTGTGgccgc > 3:152730/1‑149 (MQ=255) atTGAAGACCGCTGGCTGGCGCGCCGGGTCCTTGCCGCTGTTGGCGTGGCTGCAATCGACCATGATCCGTGCCTGCAGACCGG‑CCTTGGCCAACGCCTGGCGGGCCATGGCGATGCTGTTGGCATCATGGTTCGGGCCTTTGTGgccg < 4:94554/148‑1 (MQ=255) aaGACCGCTGGCTGGCGCGCCGGGTCCTTGCCGCTGTTGGCGTGGCTGCAATCGACCATGATCCGTGCCTGCAGACCGG‑CCTAGGCCAACGCCTGGCGGGCCATGGCGATGCTGTTGGCATCATGGTTCGGGCCTTTGTGGCCGCcgcg > 1:83647/1‑149 (MQ=255) gACCGCTGGCTGGCGCGCCGGGTCCTTGCCGCTGTTGGCGTGGCTGCAATCGACCATGATCCGTGCCTGCAGACCGGCCCTTGGCCAACGCCTGGCGGGCCATGGCGATGCTGtt < 1:60502/115‑1 (MQ=255) gACCGCTGGCTGGCGCGCCGGGTCCTTGCCGCTGTTGGCGTGGCTGCAATCGACCATGATCCGTGCCTGCAGACCGG‑CCTTGGCCAACGCCTGGCGGGCCATGGCGATGCTGtt > 2:60502/1‑114 (MQ=255) cGCTGGCTGGCGCGCCGGGTCCTTGCCGCTGTTGGCGTGGCTGCAATCGACCATGATCCGTGCCTGCAGACCGG‑CCTTGGCCAACGCCTGGCGGGCCATGGCGATGCTGTTGGCATCATGGTTCGGGCCTTTGTGGCCGCCGCGCAGTa < 3:264840/149‑1 (MQ=255) gctggctgGCGCGCCGGGTCCTTGCCGCTGTTGGCGTGGCTGCAATCGACCATGATCCGTGCCTGCAGACCGG‑CCTTGGCCAACGCCTGGCGGGCCATGGCGATGCTGTTGGCATCATGGTTCGGGCCTTTGTGGCCGCCGCGCAGTAc < 1:235227/149‑1 (MQ=255) gctggcGCGCCGGGTCCTTGCCGCTGTTGGCGTGGCTGCAATCGACCATGATCCGTGCTCGCAGACCGG‑CCTTTTTCAACGCCTGGCGGGCCATGGCGATGCTGTTGGCATCATGGTTCGGGCCTTTGTGGCCGCCGCGCAGTACAAg < 1:276534/148‑1 (MQ=255) gctggcGCGCCGGGTCCTTGCCGCTGTTGGCGTGGCTGCAATCGACCATGATCCGTGCCTGCAGACCGG‑CCTTGGCCAACGCCTGGCGGGCCATGGCGATGCTGTTGGCATCATGGTTCGGGCGTTTGTGGCCGCCGCGCAGTACAAgg < 5:46530/149‑1 (MQ=255) gctggcGCGCCGGGTCCTTGCCGCTGTTGGCGTGGCTGCAATCGACCATGATCCGTGCCTGCAGACCGG‑CCTTGGCCAACGCCTGGCGGGCCATGGCGATGCTGTTGGCATCATGGTTCGGGCCTTTGTGGCCGCCGCGCAGTACAAg < 5:4293/148‑1 (MQ=255) gctggcGCGCCGGGTCCTTGCCGCTGTTGGCGTGGCTGCAATCGACCATGATCCGTGCCTGCAGACCGG‑CCTTGGCCAACGCCTGGCGGGCCATGGCGATGCTGTTGGCATCATGGTTCGGGCCTTTGTGGCCGCCGCGCAGTACAAg < 3:297428/148‑1 (MQ=255) gctggcGCGCCGGGTCCTTGCCGCTGTTGGCGTGGCTGCAATCGACCATGATCCGTGCCTGCAGACCGG‑CCTTGGCCAACGCCTGGCGGGCCATGGCGATGCTGTTGGCATCATGGTTCGGGCCTTTGTGGCCGCCGCGCAGTACAAg < 6:16940/148‑1 (MQ=255) tggcGCGCCGGGTCCTTGCCGCTGTTGGCGTGGCTGCAATCGACCATGATCCGTGCCTGCAGACCGG‑CCTTGGCCAACGCCTGGCGGGCCATGGCGATGCTGTTGGCATCATGGTTCGGGCCTTTGTGGCCGCCGCGCAGTACAAGgtg > 5:305299/1‑149 (MQ=255) gcgcgcCGGGTCCTTTCCGCTGTTGTCGTGGCTGCAATCGACCATGATCAGTGCCTGCAGACCGG‑CCTTGGCCAACGCCTGGCGGGCCATGGCGATGCTGTTGGCATCATGGTTCGGGCCTTTGTGGCCGCCGCGCAGTACAAGgtg < 6:282994/147‑1 (MQ=255) gcgcgcCGGGTCCTTGCCGCTGTTGGCGTGGCTGCAATCGACCATGATCCGTGCCTGCAGACCGG‑CCTTGGCCAACGCCTGGCGGGCCATGGCGATGCTGTTGGCATCATGGTTCGGGCCTTTGTGGCCGCCGCGCAGTACAAGgtgt < 5:65695/148‑1 (MQ=255) gcgcgcCGGGTCCTTGCCGCTGTTGGCGTGGCTGCAATCGACCATGATCCGTGCCTGCAGACCGG‑CCTTGGCCAACGCCTGGCGGGCCATGGCGATGCTGTTGGCATCATGGTTCGGGCCTTTGTGGCCGCCGCGCAGTACAAGgtgt < 3:35834/148‑1 (MQ=255) cgcgcCGGGTCCTTGCCGCTGTTGGCGTTGATGCAATCGACCATGATCCGTGCCTGCAGACCTG‑CCTTGGCCAACGCCTGGCGGGCCATGGCGATGCTGTTGGCATCATGGTTCGGGCCTTTGTGGCCGCCGCGCAGTACAAGgtgtgt < 2:265424/149‑1 (MQ=255) cTTGCCGCTGTTGGCGTGGCTGCAATCGACCATGATCCGTGCCTGCAGACCGG‑CCTTGGCCAACGCCTGGCGGGCCATGGCGATGCTGTTGGCATCATGGTTCGGGCCTTTGTGGCCGCCGCGCAGTACAAGGTGTGTGTCCGGGTTGc > 4:327834/1‑149 (MQ=255) ttGCCGCTGTTGGCGTGGCTGCAATCGACCATGATCCGTGCCTGCAGACCGG‑CCTTGGCCAACGCCTGGCGGGCCATGGCGATGCTGTTGGCATCATGGTTCGGGCCTTTGTGGCCGCCGCGCAGTACAAGgt < 5:2010/133‑1 (MQ=255) ttGCCGCTGTTGGCGTGGCTGCAATCGACCATGATCCGTGCCTGCAGACCGG‑CCTTGGCCAACGCCTGGCGGGCCATGGCGATGCTGTTGGCATCATGGTTCGGGCCTTTGTGGCCGCCGCGCAGTACAAGgt > 6:2010/1‑133 (MQ=255) ccGCTGTTGGCGTGGCTGCAATCGACCATGATCCGTGCCTGCAGACCGG‑CCTTGGCCAACGCCTGGCGGGCCATGGCGATGCTGTTGGCATCATGGTTCGGGCCTTTGTGGCCGCCGCGCAGTACAAGGTGTGTGTCCGGGTTGCCCaa < 4:152730/149‑1 (MQ=255) cTGTTGGCGTGGCTGCAATCGACCATGATCCGTGCCTGCAGACCGG‑CCTTGGCCAACGCCTGGCGGGCCATGGCGATGCTGTTGGCATCATGGTTCGGGCCTTTGTGGCCGCCGCGCAGTACAAGGTGTGTGTCCGGGTTGc < 8:24931/142‑1 (MQ=255) cTGTTGGCGTGGCTGCAATCGACCATGATCCGTGCCTGCAGACCGG‑CCTTGGCCAACGCCTGGCGGGCCATGGCGATGCTGTTGGCATCATGGTTCGGGCCTTTGTGGCCGCCGCGCAGTACAAGGTGTGTGTCCGGGTTGc > 7:24931/1‑142 (MQ=255) ggCGTGGCTGCAATCGACCATGATCCGTGCCTGCAGACCGG‑CCTTGGCCAACGCCTGGCGGGCCATGGCGATGCTGTTGGCATCATGGTTCGGGCCTTTGTGGCCGCCGCGCAGTACAAGGTGTGTGTCCGGGTTGCCCAAGGTCTCg < 7:259637/148‑1 (MQ=255) gCGTGGCTGCAATCGACCATGATCCGTGCCTGCAGACCGG‑CCTTGGCCAACGCCTGGCGGGCCATGGCGATGCTGTTGGCATCATGGTTCGGGCCTTTGTGGCCGCCGCGCAGTACAAGGTGTGTGTCCGGGTTGCCCAAGGTCTCga < 6:305299/148‑1 (MQ=255) aTGATCCGTGCCTGCAGACCGG‑CCTTGGCCAACGCCTGGCGGGCCATGGCGATGCTGTTGGCATCATGGTTCGGGCCTTTGTGGCCGCCGCGCAGTACAAGGTGTGTGTCCGGGTTGCCCAAGGTCTCGATGATCGCCGGGTGGCCCt > 7:24088/1‑148 (MQ=255) tGATCCGTGCCTGCAGACCGG‑CCTTGGCCAACGCCTGGCGGGCCATGGCGATGCTGTTGGCATCATGGTTCGGGCCTTTGTGGCCGCCGCGCAGTACAAGGTGTGTGTCCGGGTTGCCCAAGGTCTCGATGATCGCCGGGTGGCCCTGa < 8:24088/149‑1 (MQ=255) tCCGTGCCTGCAGACCGG‑CCTTGGCCAACGCCTGGCGGGCCATGGCGATGCTGTTGGCATCATGGTTCGGGCCTTTGTGGCCGCCGCGCAGTACAAGGTGTGTGTCCGGGTTGCCCAAGGTCTCGATGATCGCCGGGTGGCCCTGAGCa > 5:174206/1‑149 (MQ=255) gTGCCTGCAGACCGG‑CCTTGGCCAACGCCTGGCGGGCCATGGCGATGCTGTTggcacggatcatggtcgattgcagccacgccaacagcggcaaggacccggcgcgccagccagcggtcttcaatgatgtgctggaacagcgcctggcc < 3:203226‑M2/149‑98 (MQ=255) gCCTGCAGACCGG‑CCTTGGCCAACGCCTGGCGGGCCATGGCGATGCTGTTggcacggatcatggtcgattgcagccacgccaacagcggcaaggacccggcgcgccagcca < 5:195537‑M2/111‑62 (MQ=255) gCCTGCAGACCGG‑CCTTGGCCAACGCCTGGCGGGCCATGGCGATGCTGTTggcacggatcatggtcgattgcagccacgccaacagcggcaaggacccggcgcgccagcca > 6:195537‑M2/1‑50 (MQ=255) tGCAGACCGG‑CCTTGGCCAACGCCTGGCGGGCCATGGCGATGCTGTTGGCATCATGGTTCGGGCCTTTGTGGCCGCCGCGCAGTACAAGGTGTGTGTCCGGGTTGCCCAAGGTCTCGATGATCGCCGGGTGGCCCTGAGCATCCATAcc > 1:179394/1‑149 (MQ=255) aGACCGG‑CCTTGGCCAACGCCTGGCGGGCCATGGCGATGCTGTTGGCATCATGGTTCGGGCCTTTGTGGCCGCCGCGCAGTACAAGGTGTGTGTCCGGGTTGCCCAAGGTCTCGATGATCGCCGGGTGGCCCTGAGCATCCATACCGaa > 1:148363/1‑149 (MQ=255) aCCGG‑CCTTGGCCAACGCCTGGCGGGCCATGGCGATGCTGTTGGCATCATGGTTCGGGCCTTTGTGGCCGCCGCGCAGTACAAGGTGTGTGTCCGGGTTGCCCAAGGTCTCGATGATCGCCGGGTGGCCCTGAGCATCCATACCGAAGt < 5:48504/149‑1 (MQ=255) aCCGG‑CCTTGGCCAACGCCTGGCGGGCCATGGCGATGCTGTTGGCATCATGGTTCGGGCCTTTGTGGCCGCCGCGCAGTACAAGGTGTGTGTCCGGGTTGCCCAAGGTCTCGATGATCGCCGGGTGGCCCTGAGCATCCATACCGAAGt < 3:327834/149‑1 (MQ=255) ccGG‑CCTTGGCCAACGCCTGGCGGGCCATGGCGATGCTGTTGGCATCATGGTTCGGGCCTTTGTGGCCGCCGCGCAGTACAAGGTGTGTGTCCGGGTTGCCCAAGGTCTCGATGATCGCCGGGTGGCCCTGAGCATCCATACCGAAGTg < 3:327032/149‑1 (MQ=255) cGG‑CCTTGGCCAACGCCTGGCGGGCCATGGCGATGCTGTTGGCATCATGGTTCGGGCCTTTGTGGCCGCCGCGCAGTACAAGGTGTGTGTCCGGGTTGCCCAAGGTCTCGATGATCGCCGGGTGGCCCTGAGCATCCATACCGAAGTgg > 1:310068/1‑149 (MQ=255) ttGGCCAACGCCTGGCGGGCCATGGCGATGCTGTTGGCATCATGGTTCGGGCCTTTGTGGCCCCCGCGCAGTACAAGGTGTGTGTCCGGGTTGCCCAAGGTCTCGATGATCGCCGGGTGGCCCTGAGCATCCATACCGAAGTGGCGGTg > 8:178955/1‑149 (MQ=255) aaCGCCTGGCGGGCCATGGCGATGCTGTTGGCATCATGGTTCGGGCCTTTGTGGCCGCCGCGCAGTACAAGGTGTGTGTCCGGGTTGCCCAAGGTCTCGATGATCGCCGGGTGGCCCTGAGCATCCATACCGAAGTGGCGGTGCGGGTg < 6:164579/149‑1 (MQ=255) tGGCGGGCCATGGCGATGCTGTTGGCATCATGGTTCGGGCCTTTGTGGCCGCCGCGCAGTACAAGGTGTGTGTCCGGGTTGCCCAAGGTCTCGATGATCGCCGGGTGGCCCTGAGCATCCATACCGAAGTGGCGGTGCGGGTGGGCAgc > 3:36534/1‑149 (MQ=255) gCGGGCCATGGCGATGCTGTTGGCATCATGGTTCGGGCCTTTGTGGCCGCCGCGCAGTACAAGGTGTGTGTCCGGGTTGCCCAAGGTCTCGATGATCGCCGGGTGGCCCTGAGCATCCATACCGAAGTGGCGGTGCGGGTGGGCAgcg < 2:179394/148‑1 (MQ=255) aTGGCGATGCTGTTGGCATCATGGTTCGGGCCTTTGTGGCCGCCGCGCAGTACAAGGTGTGTGTCCGGGTTGCCCAAGGTCTCGATGATCGCCGGGTGGCCCTGAGCATCCATACCGAAGTGGCGGTGCGGGTg < 8:211396/134‑1 (MQ=255) aTGGCGATGCTGTTGGCATCATCGTTCGGGCCTTTGTGGCCGCCGCGCAGTACAAGGTGTGTGTCCGGGTTGCCCAAGGTCTCGATGATCGCCGGGTGGCCCTGAGCATCCATACCGAAGTGGCGGTGCGGGTg > 7:211396/1‑134 (MQ=255) gCGATGCTGTTGGCATCATGGTTCGGGCCTTTGTGGCCGCCGCGCAGTACAAGGTGTGTGTCCGGGTTGCCCAAGGTCTCGATGATCGCCGGGTGGCCCTGAGCATCCATACCGAAGTGGCGGTGCGGGTGGGCAGCGCTGCGCATgg < 4:36534/148‑1 (MQ=255) cTGTTGGCATCATGGTTCGGGCCTTTGTGGCCGCCGCGCAGTACAAGGTGTGTGTCCGGGTTGCCCAAGGTCTCGATGATCGCCGGGTGGCCCTGAGCATCCATACCGAAGTGGCGGTGCGGGTGGGCAGCGCTGCGCATGGCGTCGCt < 2:83647/149‑1 (MQ=255) tGTTGGCATCATGGTTCGGGCCTTTGTGGCCGCCGCGCAGTACAAGGTGTGTGTCCGGGTTGCCCAAGGTCTCGATGATCGCCGGGTGGCCCTGAGCATCCATACCGAAGTGGCGGTGCGGGTGGGCAGCGCTGCGCATGGCGTCGCtg > 8:201686/1‑149 (MQ=255) ttggcacggatcatggtcgattgcagccacgccaacagcggcaaggacccggcgcgccagccagcggtcttcaatgatgtgctggaacagcgcctggccggcgaccgttcgttggtcggcgtcatgatcgaagggcacttgttcgat > 4:203226‑M2/1‑2 (MQ=255) ttGGCATCATGGTTCGGGCCTTTGTGGCCGCCGCGCAGTACAAGGTGTGTGTCCGGGTTGCCCAAGGTCTCGATGATCGCCGGGTGGCCCTGAGCATCCATACCGAAGTGGCGGTGCGGGTGGGCAGCGCTGCGCATGGCGTCGCtgg < 6:174206/148‑1 (MQ=255) | GCCGGCCAGGCGCTGTTCCAGCACATCATTGAAGACCGCTGGCTGGCGCGCCGGGTCCTTGCCGCTGTTGGCGTGGCTGCAATCGACCATGATCCGTGCCTGCAGACCGG‑CCTTGGCCAACGCCTGGCGGGCCATGGCGATGCTGTTGGCATCATGGTTCGGGCCTTTGTGGCCGCCGCGCAGTACAAGGTGTGTGTCCGGGTTGCCCAAGGTCTCGATGATCGCCGGGTGGCCCTGAGCATCCATACCGAAGTGGCGGTGCGGGTGGGCAGCGCTGCGCATGGCGTCGCTGG > NC_002947/3464892‑3465184 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |