New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5499350 | 40 (0.740) | 4 (0.080) | 4/254 | NT | 8.7% | coding (128/720 nt) | cobK | precorrin‑6x reductase |
? | NC_002947 | = 5499391 | 46 (0.890) | coding (169/720 nt) | cobK | precorrin‑6x reductase |
TGGGAGGGGTCACTGAAGCCCTGGCGATGGCCCGCCAACTCGGGCCTCGACATGTCTACAGCCTGGCCGGTATCGGCCGCGTGCCCCAGGGCTTGCAATGCCAGGTGCGGGTCGGGGGCTATGGCGGTGTCGAGGGCCTGACCCGTTACCTGCGCGAAGCGGGCATCACCCTGCTGATCGACGCCACCCACCCCTATGCCGCGCAAATCAGCCGCAATGCCGCCAGCGCCGCACGCAACGCCGGCATCCCGTGCTGGGCCTTGCGTCGTCCCGCCTGGCAGGCGCAAGCAG > NC_002947/5499245‑5499535 | tGGGAGGGGTCACTGAAGCCCTGGCGATGGCCCGCCAACTCGGGCCTCGACATGTCTACAGCCTGGCCGGTATCGGCCGCGTGCCCCAGGGCTTGCAATGCCAGGTGCGGGTCGGGGGCTATGGCGGTGTCGAGGGCCTGACCCGTTac < 2:76159‑M2/149‑3 (MQ=255) ggggTCACTGAAGCCCTGGCGATGGCCCGCCAACTCGGGCCTCGACATGTCTACAGCCTGGCCGGTATCGGCCGCGTGCCCCAGGGCTTGCAATGCCAGGTGCGGGTCGGGGGCTATGGCGGTGTCGAGGGCCTGACCCGTTACCTgcg < 1:166037/149‑1 (MQ=255) gggTCACTGAAGCCCTGGCGATGGCCCGCCAACTCGGGCCTCGACATGTCTACAGCCTGGCCGGTATCGGCCGCGTGCCCGAGGGCTTGCAATGCCAGGTGCGGGTCGGGGGCTATGGCGGTGTCGAGGGCCTGACCCGTTACCTgcgc < 2:93084/149‑1 (MQ=255) aaGCCCTGGCGATGGCCCGCCAACTCGGGCCTCGACATGTCTACAGCGTGGCCGGTATCGGCCGCGTGCCCCAGGGCTTGCAATGCCAGGTGCGGGTCGGGGGCTATGGCGGTGTCGAGGGCCTGACCCGTTACCTGCGCGAAGCgg < 7:64011/147‑1 (MQ=255) cccTGGCGATGGCCCGCCAACTCGGGCCTCGACATGTCTACAGCCTGGCCGGTATCGGCCGCGTGCCCCACGGCTTCCAATGCCAGGTGCGGGTCGGGGGCTATGGCGGTGTCGAGGGCATGACCCGTTACCTGCGCGAAGCCGACAt > 6:158414/1‑148 (MQ=255) cTGGCGATGGCCCGCCAACTCGGGCCTCGACATGTCTACAGCCTGGCCGGTATCGGCCGCGTGCCCCAGGGCTTGCAATGCCAGGTGCGGGTCGGGGGCTATGGCGGTGTCGAGGGCCTGACCCGTTACCTGCGCGAAGCGGGCATCAc > 6:251208/1‑149 (MQ=255) gCGATGGCCCGCCAACTCGGGCCTCGACATGTATACAGCCTGGCCGGTATCGGCCGCGTGCCCCAGGGCTTGCAATGCCAGGTGCGGGTCGGGGGCTATGGCGGTGTCGAGGGCCTGACCCGTTACCTGCGCGAAGCGGGCATAACCct > 8:57099/1‑149 (MQ=255) cGATGGCCCGCCAACTCGGGCCTCGACATGTCTACAGCCTGGCCGGTATCGGCCGCGTGCCCCAGGGCTTGCAATGCCAGGTGCGGGTCGGGGGCTATGGCGGTGTCGAGGGCCTGACCCGTTACCTGCGCGAAGCGGGCATCACCctg > 8:171850/1‑149 (MQ=255) gATGGCCCGCCAACTCGGGCCTCGACATGTCTACAGCCTGGCCGGTATCGGCCGCGTGCCCCAGGGCTTGCAATGCCAGGTGCGGGTCGGGGGCTATGGCGGTGTCGAGGGCCTGACCCGTTACCTGCGCGAAGCGGGCATCACCctgc < 6:4911/149‑1 (MQ=255) ggCCCGCCAACTCGGGCCTCGACATGTCTACAGCCTGGCCGGTATCGGCCGCGTGCCCCAGGGCTTGCAATGCCAGGTGCGGGTCGGGGGCTATGGCGGTGTCGAGGGCCTGACCCGTTACCTGCGCGAAGCGGGCATCACCCTGCTGa > 5:297117/1‑149 (MQ=255) gCCCGCCAACTCGGGCCTCGACATGTCTACAGCCTGGCCGGTATCGGCCGCGTGCCCCAGGGCTTGCAATGCCAGGTGCGGGTCGGGGGCTATGGCGGTGTCGAGGGCCTGACCCGTTACCTGCGCGAAGCGGGCATCACCCTGCTGAt < 7:171850/149‑1 (MQ=255) gCCCGCCAACTCGGGCCTCGACATGTCTACAGCCTGGCCGGTATCGGCCGCGTGCCCCAGGGCTTGCAATGCCAGGTGCGGGTCGGGGGCTATGGCGGTGTCGAGGGCCTGACCCGTTACCTGCGCGAAGCGGGCATCACCCTGCTGAt < 1:91905/149‑1 (MQ=255) gCCCGCCAACTCGGGCCTCGACATGTCTACACCCTGGCCGGTATCGGCCGCGTGCCCCAGGGCTTGCAATGCCAGGTGCGGGTCGGGGGCTATGGCGGTGTCGAGGGCCTGACCCGTTACCTGCGCGAAGCGGGCATCACCCTGCTGAt < 8:107892/149‑1 (MQ=255) ccGCCAACTCGGGCCTCGACATGTCTACAGCCTGGCCGGTATCGGCCGCGTGCCCCAGGGCTTGCAATGCCAGGTGCGGGTCGGGGGCTATGGCGGTGTCGAGGGCCTGACCCGTTACCTGCGCGAAGCGGGCATCACCCTGCTGATc > 1:200191/1‑148 (MQ=255) ccGCCAACTCGGGCCTCGACATGTCTACAGCCTGGCCGGTATCGGCCGCGTGCCCCAGGGCTTGCAATGCCAGGTGCGGGTCGGGGGCTATGGCGGTGTCGAGGGCCTGACCCGTTACCTGCGCGAAGCGGGCATCACCCTGCTGATc > 5:152933/1‑148 (MQ=255) ccAACTCGGGCCTCGACATGTCTACAGCCTGGCCGGTATCGGCCGCGTGCCCCAGGGCTTGCAATGCCAGGTGCGGGTCGGGGGCTATGGCGGTGTCGAGGGTCTGACCCGTTACCTGCGCGAAGCGGGCATCACCCTGCTGATCGACg < 1:76159/149‑1 (MQ=255) aaTGTCTACAGCCTGGCCGGTATCGGCCGCGTGCCCCAGTGCTTGCAATGCCAGGTGCGGGTCGGGGGGTATGGCGGTGTCGAGGGCCTTACCCGTTACCTGCGCGAAGCGGGCATCACCCTGCTGATCGACGCCACCCACCCCTATGc < 5:197008/148‑1 (MQ=255) gTCTACAGCCTGGCCGGTATCGGCCGCGTGCCCCAGGGCTTGCAATGCCAGGTGCGGGTCGGGGGCTATGGCGGTGTCGAGGGCCTGACCCGTTacctg < 4:191042‑M2/99‑6 (MQ=255) gTCTACAGCCTGGCCGGTATCGGCCGCGTGCCCCAGGGCTTGCAATGCCAGGTGCGGGTCGGGGGCTATGGCGGTGTCGAGGGCCTGACCCGTTacctg > 3:191042‑M2/1‑94 (MQ=255) gTCTACAGCCTGGCCGGTATCGGCCGCGTGCCCCAGGGCTTGCAATGCCAGGTGCGGGTCGGGGGCTATGGCGGTGTCGAGGGCCTGACCCGTTACCTGCGCGAAGCGGGCATCACCCTGCTGATCGACGCCACCCACCCCTATGCcgc > 2:81663/1‑149 (MQ=255) gCCGGTATCGGCCGCGTGCCCCAGGGCTTGCAATGCCAGGTGCGGGTCGGGGGCTATGGCGGTGTCGAGGGCCTGACCCGTTACCTGCGCGAAGCGGGCATCACCCTGCTGATCGACGCCACCCACCCCTATGCCGCGCAAATCAGCCg < 1:81663/149‑1 (MQ=255) gCCGGTATCGGCCGCGTGCCCCAGGGCTTGCAATGCCAGGTGCGGGTCGGGGGCTATGGCGGTGTCGAGGGCCTGACCCGTTACCTGCGCGAAGCGGGCATCACCCTGCTGATCGACGCCACCCACCCCTATGCCGCGCAAATCAGCCg > 5:312964/1‑149 (MQ=255) ccGGTATCGGCCGCGTGCCCCAGGGCTTGCAATGCCAGGTGCGGGTCGGGGGCTATGGCGGTGTCGAGGGCCTGACCCGTTACCTGCGCGAAGCGGGCATCACCCTGCTGATCGACGCCACCCACCCCTATGCCGCGCAAAt < 2:294315/142‑1 (MQ=255) ccGGTATCGGCCGCGTGCCCCAGGGCTTGCAATGCCAGGTGCGGGTCGGGGGCTATGGCGGTGTCGAGGGCCTGACCCGTTACCTGCGCGAAGCGGGCATCACCCTGCTGATCGACGCCACCCACCCCTATGCCGCGCAAAt > 1:294315/1‑142 (MQ=255) cGGTATCGGCCGCGTGCCCCAGGGCTTGCAATGCCAGGTGCGGGTCGGGGGCTATGGCGGTGTCGAGGGCCTGACCCGTTACCTGCGCGAAGCGGGCATCACCCTGCTGATCGACGCCACCCACCCCTATGCCGCGCAAATCAGCCGc > 7:260742/1‑148 (MQ=255) ggTATCGGCCGCGTGCCCAAGTGCTTGCAATGCCAGGTGCGGGTCGGGGGCTATGGCGGTGTCGAGGGCCTGACCCGTTACCTGCGCGAAGCTGGCATCACCCTGCTGATCGACGACACCCACCCCTATGCCGCGCAAATCAGCCGCaa > 6:275629/1‑149 (MQ=255) ccGCGTGCCCCAGGGCTTGCAATGCCAGGTGCGGGTCGGGGGCTATGGCGGTGTCGAGGGCCTGACCCGTTACCTGCGCGAAGCGGGCATCACCCTGCTGATCGACGCCCCCCACCCCTATGCCGCGCAAATCAGCCGCAATgccgc > 7:226437/1‑147 (MQ=255) cgcgTGCCCCAGGGCTTGCAATGCCAGGTGCGGGTCGGGGGCTATGGCGGTGTCGAGGGCCTGACCCGTTACCTGCGCGAAGCGGGCATCACCCTGCTGATCGACGCCACCCACCCCTATGCCGCGCAAATCAGCCGCAATGCCGCCAg > 6:72030/1‑149 (MQ=255) ccAGGGCTTGCAATGCCAGGTGCGGGTCGGGGGCTATGGCGGTGTCGAGGGCCTGACCCGTTACCTGCGCGAAGCGGGCATCACCCTGCTGATCGACGCCACCCACCCCTATGCCGCGCAAATCAGCCGCAATGCCGCCAGCGCcgcac < 8:260742/149‑1 (MQ=255) aGGGCTTGCAATGCCAGGTGCGGGTCGGGGGCTATGGCGGTGTCGAGGGCCTGACCCGTTACCTGCGCGAAGCGGGCATCACCCTGCTGATCGACGCCACCCACCCCTATGCCGCGCAAATCAGCCGCAATGCCGCTAGCGCcgcacg > 2:230041/1‑148 (MQ=255) ttGCAATGCCAGGTGCGGGTCGGGGGCTATGGCGGTGTCGAGGGCCTGACCCGTTACCTGCGCGAAGCGGGCATCACCCTGCTGATCGACGCCACCCACCCCTATGCCGCGCAAATCAGCCGCAATGCCGCCAGCGCCGCACGCAACGc > 1:153145/1‑149 (MQ=255) gCAATGCCATGTGCGGGTCGGGGGCTATGGCGGTGTCGAGGGCCTGACCCGTTTCCTGCGCGAAGCTGGCATCACCCTGCTGATCGACGCCACCCACCCCTATGCCGCGCAAATCAGCCGCAATGCCGCCAGCGCCGCACGCAACGcc < 5:324641/148‑1 (MQ=255) cAATGCCAGGTGCGGGTCGGGGGCTATGGCGGTGTCGAGGGCCTGACCCGTTacctggcattgcaagccctggggcacgcggccgataccggccaggctgtagacatgtcgaggcccgagttggcgggccatcgccagggcttcagtga < 1:60127‑M2/149‑98 (MQ=255) cAATGCCAGGTGCGGGTCGGGGGCTATGGCGGTGTCGAGGGCCTGACCCGTTACCTGCGCGAAGCGGGCATCACCCTGCTGATCGACGCCACCCACCCCTATGCCGCGCAAATCAGCCGCAATGCCGCCAGCGCCGCACGCAACGCCg < 6:152933/148‑1 (MQ=255) cAATGCCAGGTGCGGGTCGGGGGCTATGGCGGTGTCGAGGGCCTGACCCGTTACCTGCGCGAAGCGGGCATCACCCTGCTGATCGACGCCACCCACCCCTATGCCGCGCAAATCAGCCGCAATGCCGCCAGCGCCGCACGCAACGCCg < 5:72030/148‑1 (MQ=255) aaTGCCAGGTGCGGGTCGGGGGCTATGGCGGTGTCGAGGGCCTGACCCGTTacctggcattgcaagccctggggcacgcggccgataccggccaggctgtagacatgtcgaggcccgagttggcgggc < 6:158735‑M2/128‑78 (MQ=255) aaTGCCAGGTGCGGGTCGGGGGCTATGGCGGTGTCGAGGGCCTGACCCGTTacctggcattgcaagccctggggcacgcggccgataccggccaggctgtagacatgtcgaggcccgagttggcgggc > 5:158735‑M2/1‑51 (MQ=255) tGCCAGGTGCGGGTCGGGGGCTATGGCGGTGTCGAGGGCCTGACCCGTTacctggcattgcaagccctggggcacgcggccgataccggccaggctgtagacatgtcgaggcccgagttggcgggccatcgccagggcttcagtgaccc < 1:116678‑M2/149‑101 (MQ=255) ccAGGTGCGGGTCGGGGGCTATGGCGGTGTCGAGGGCCTGACCCGTTACCTGCGCGAAGCGGGCATCACCCTGCTGATCGACGCCACCCACCCCTATGCCGCGCAAATCAGCCGCAATGCCGCCAGCGCCGCACGCAACGCCGGCATc < 6:297117/148‑1 (MQ=255) cAGGTGCGGGTCGGGGGCTATGGCGGTGTCGAGGGCCTGACCCGTTACCTGCGCGAAGCGGGCATCACCCTGCTGATCGACGCCACCCACCCCTATGCCGCGCAAATCAGCCGCAATGCCGCCAGCGCCGCACGCAACGCCGGCATccc > 2:256855/1‑149 (MQ=255) ggggCTATGGCGGTGTCGAGGGCCTGACCCGTTACCTGCGCGAAGCGGGCATCACCCTGCTGATCGACGCCACCCACCCCTATGCCGCGCAAATCAGCCGCAATGCCGCCAGCGCCGCACGCAACGCCGGCATCCCGTGCTGGGCCTTg > 6:310154/1‑149 (MQ=255) gggCTATGGCGGTGTCGAGGGCCTGACCCGTTACCTGCGCGAAGCGGGCATCACCCTGCTGATCGACGCCACCCACCCCTATGCCGCGCAAATCAGCCGCAATGCCGCCAGCGCCGCACGCAACGCCGGCATCCCGTGCTGGGCCTTGc > 1:135334/1‑149 (MQ=255) ggCTATGGCGGTGTCGAGGGCCTGACCCGTTACCTGCGCGAAGCGGGCATCACCCTGCTGATCGACGCCACCCACCCCTATGCCGCGCAAATCAGCCGCAATGCCGCCAGCGCCGCCCGCACCGCCGGCATCCCGTGCTGGGCCTTGcg > 8:72912/1‑149 (MQ=255) cTATGGCGGTGTCGAGGGCCTGACCCGTTACCTGCGCGAAGCGGGCATCACCCTGCTGATCGACGCCACCCACCCCTATGCCGCGCAAATCAGCCGCAATGCCGCCAGCGCCGCACGCAACGCCGGCATCCCGTGCTGGGCCTTGcgtc < 5:251208/149‑1 (MQ=255) tATGGCGGTGTCGAGGGCCTGACCCGTTACCTGCGCGAAGCGGGCATCACCCTGCTGATCGACGCCACCCACCCCTATGCCGCGCAAATCAGCCGCAATGCCGCCAGCGCCGCACGCAACGCCGGCATCCCGTGCTGGGCCTTGcgtcg > 2:90124/1‑149 (MQ=255) ggTGTCGAGGGCCTGACCCGTTACCTGCGCGAAGCGGGCATCTCCCTGCTGATCGACGCCACCCACCCCTATGCCGCGCAAATCAGCCGCAATGCCGCCAGCGCCGCACGCAACGCCGGCATCCCGTGCTGGGCCTTGCGTCGTCCCGc < 5:275629/149‑1 (MQ=255) tgtCGAGGGCCTGACCCGTTACCTGCGCGAAGCGGGCATCACCCTGCTGATCGACGCCACCCACCCCTATGCCGCGCAAATCACCCGCAATGCCGCCAGCGCCCCACGCAACGCCGGCATCCCGTCATGGGCCTTGCGTCGTCCCGCCt > 8:283800/1‑149 (MQ=255) tCGAGGGCCTGACCCGTTACCTGCGCGAAGCGGGCATCACCCTGCTGATCGACGCCACCCACCCCTATGCCGCGCAAATCAGCCGCAATGCCGCCAGCGCCGCACGCAACGCCGGCATCCCGTGCTGGGCCTTGCGTCGTCCCGCCTgg > 1:215342/1‑149 (MQ=255) gAGGGCCTGACCCGTTACCTGCGCGAAGCGGGCATCACCCTGCTGATCGACGCCACCCACCCCTATGCCGCGCAAATCAGCCGCAATGCCGCCAGCGCCGCACGCAACGCCGGCATCCCGTGCTGGGCCTTGCGTCGTCCCGCCTgg > 1:123373/1‑147 (MQ=255) ggCCTGACCCGTTACCTGCGCGAAGCGGGCATCACCCTGCTGATCGTCGCCACCCACCCCTATGCCGCGCAAATCAGCCGCAATGCCGCCAGCGCCGCACGCAACGCCGGCATCCCGTGCTGGGCCTTGCGTCGTCCCGCCTGGCAGgc < 1:171985/149‑1 (MQ=255) ggCCTGACCCGTTACCTGCGCGAAGCGGGCATCACCCTGCTGATCGACGCCACCCACCCCTATGCCGCGCAAATCAGCCGCAATGCCGCCAGCGCCGCACGCAACGCCGGCATCCCGTGCTGGGCCTTGCGTCGTCCCGCCTGGCAGgc > 2:59330/1‑149 (MQ=255) cTGACCCGTTACCTGCGCGAAGCGGGCATCACCCTGCTGATCGACGCCACCCACCCCTATGCCGCGCAAATCAGCCGCAATGCCGCCAGCGCCGCACGCAACGCCGGCATCCCGTGCTGGGCCTTGCGTCGTCCCGCCTGGCAGgcgc > 8:90530/1‑148 (MQ=255) tGACCCGTTACCTGCGCGAAGCGGGCATCACCCTGCTCATCGACGCCACCCACCCCTATGCCGCGCAAATCAGCCGCAATGCCGCCAGCGCCGCACGCAACGCCGGCATCCCGTGCTGGGCCTTGCGTCGTCCCGCCTGGCAGgcgc > 1:137529/1‑147 (MQ=255) cccGTTACCTGCGCGAAGCGGGCATCACCCTGCTGATCGACGCCACCCACCCCTATGCCGCGCAAATCAGCCGCAATGCCGCCAGCGCCGCACGCAACGCCGGCATCCCGTGCTGGGCCTTGCGTCGTCCCGCCTgg > 7:9781/1‑137 (MQ=255) cccGTTACCTGCGCGAAGCGGGCATCACCCTGCTGATCGACGCCACCCACCCCTATGCCGCGCAAATCAGCCGCAATGCCGCCAGCGCCGCACGCAACGCCGGCATCCCGTGCTGGGCCTTGCGTCGTCCCGCCTgg < 8:9781/137‑1 (MQ=255) ccGTTACCTGCGCGAAGCGGGCATCACCCTGCTGATCGACGCCACCCACCCCTATGCCGCGCAAATCAGCCGCAATGCCGCCAGCGCCGCACGCCACGCCGGCATCCCGTGCTGGGCCTTGCGTCGTCCCGCCTGGCAGGCGCAAGCAg < 1:90124/149‑1 (MQ=255) | TGGGAGGGGTCACTGAAGCCCTGGCGATGGCCCGCCAACTCGGGCCTCGACATGTCTACAGCCTGGCCGGTATCGGCCGCGTGCCCCAGGGCTTGCAATGCCAGGTGCGGGTCGGGGGCTATGGCGGTGTCGAGGGCCTGACCCGTTACCTGCGCGAAGCGGGCATCACCCTGCTGATCGACGCCACCCACCCCTATGCCGCGCAAATCAGCCGCAATGCCGCCAGCGCCGCACGCAACGCCGGCATCCCGTGCTGGGCCTTGCGTCGTCCCGCCTGGCAGGCGCAAGCAG > NC_002947/5499245‑5499535 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |