New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5943622 | 29 (0.540) | 5 (0.110) | 4/220 | NT | 15.3% | intergenic (+30/+55) | PP_5210/PP_5211 | alcohol dehydrogenase/ChaC‑related protein |
? | NC_002947 | = 5943643 | 31 (0.690) | intergenic (+51/+34) | PP_5210/PP_5211 | alcohol dehydrogenase/ChaC‑related protein |
GTGTCGCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTG‑GCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGACTGCGCAGTGCATTCAAGGTCTGCTCGACATACTCCCGCGTGGTGCCA > NC_002947/5943497‑5943791 | gtgtCGCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAgg > 3:276293‑M2/1‑147 (MQ=255) gtgtCGCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGACCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCa < 4:114348/147‑1 (MQ=255) tgtCGCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAggg > 8:88649‑M2/1‑146 (MQ=255) tCGCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTGTTGGCCGGTAAACCCCCTCCTAAAGGCGCCCCTGCAgggtt < 6:20085‑M2/149‑6 (MQ=255) gCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAATGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAg < 7:114357‑M2/143‑2 (MQ=255) gCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAATGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAg > 8:114357‑M2/1‑142 (MQ=255) gCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAgggttta > 1:317150‑M2/1‑142 (MQ=255) cAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTTCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAgggtttac > 6:155853‑M2/1‑141 (MQ=255) aGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAgggtttacc > 8:232430‑M2/1‑140 (MQ=255) cTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAgggtttacccgc > 6:319696‑M2/1‑137 (MQ=255) cTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAgggtttacccgc > 5:219858‑M2/1‑137 (MQ=255) tCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAgggtttacccgcgaa > 3:290328‑M2/1‑133 (MQ=255) ccACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAgggtttacccgcgaaga > 5:226640‑M2/1‑132 (MQ=255) aCTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAgggtttacccgcgaagagg < 5:325672‑M2/149‑20 (MQ=255) ccGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGt < 1:82141/149‑1 (MQ=255) aTCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACt > 2:297851/1‑148 (MQ=255) tggagaAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGGGGTCCTTGCCAGGTACGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTc < 5:20085/147‑1 (MQ=38) gagaAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTAGCGGGTAAAACCCCACCAAAAGGCGACCGTGCACGGTTTAACCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCacacatagc > 8:36821/1‑144 (MQ=255) agaAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAg > 6:95318‑M2/1‑104 (MQ=255) agaAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAg < 5:95318‑M2/105‑2 (MQ=255) gCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGa < 3:241927/149‑1 (MQ=255) gCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTg‑g > 6:142558/1‑149 (MQ=255) gCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTg‑g < 6:119849/149‑1 (MQ=255) gCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTg‑g < 5:142558/149‑1 (MQ=255) gCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTg‑g < 1:297851/149‑1 (MQ=255) gCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTG‑GCAACgg < 6:325672/149‑2 (MQ=255) gTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTTCAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTG‑GCAACGCCTGAATCgcgc > 3:240221/1‑149 (MQ=255) gTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGGTGACACTTCGCGCAGATTGTG‑GCAACGCCGGAATCgcgc > 8:230033/1‑149 (MQ=255) gTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTG‑GCAACGCCTGAATCgcgc > 7:95810/1‑149 (MQ=255) gCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGATGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTG‑GCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCgg < 7:36821/149‑1 (MQ=255) aaGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTG‑GCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTg > 3:225144/1‑149 (MQ=255) ggCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGAAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGGCCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTG‑GCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGt < 7:139782/149‑1 (MQ=255) cAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTG‑GCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGa < 8:95810/149‑1 (MQ=255) tAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTG‑GCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTgg < 2:249566/143‑1 (MQ=255) tAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTG‑GCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTgg > 1:249566/1‑143 (MQ=255) atctgCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAGTGGCGAGCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCTCGCAGATTGTGCGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGACt < 1:250047/144‑1 (MQ=38) tcttctCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCTGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTG‑GCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGACTGCGCGGTg > 2:102838/1‑148 (MQ=255) tctTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAgggtttacccgcgaagaggccgctactgccttacctggccagcaccaccaacttacccacagcctgccgttgccccagcttctcgatagcaaccccggcttctgccagtg < 5:170589‑M2/148‑111 (MQ=255) gcgGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTG‑GCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGACTGCGCAGTGCATTc > 6:108132/1‑148 (MQ=255) gggTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAgggtttacccgcgaagaggccgctactgccttacctggccagcaccaccaacttacccacagcctgccgttgccccagcttctcgatagcaaccccggcttctgccagtggataagtc < 5:287407‑M2/149‑119 (MQ=255) gggTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAgggtttacccgcgaagaggccgctactgccttacctggccagcaccaccaacttacccacagcctgccgttgccccagcttctcgatagcaaccccggcttctgccagtggataagtc < 3:64540‑M2/149‑119 (MQ=255) ggTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAgggtttacccgcgaagaggccgctactgccttacctggccagcaccaccaacttacccacagcctgccgttgccccagcttctcgatagcaaccccggcttctgccagtggataagtct < 5:143200‑M2/149‑120 (MQ=255) tAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTG‑GCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGACTGCGCAGTGCATTCAAGGTc > 6:244496/1‑149 (MQ=255) cccGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTG‑GCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGACTGCGCAGTGCATTCAAGGTCTGCt > 6:34483/1‑149 (MQ=255) gCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTG‑GCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGACTGCGCAGTGCATTCAAGGTCTGCTCg > 3:292216/1‑148 (MQ=255) cTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTG‑GCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGACTGCGCAGTGCATTCAAGGTCTGCTCGACa < 5:34483/147‑1 (MQ=255) cTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTG‑GCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGACTGCGCAGTGCATTCAAGGTCTGCTCGACAt > 7:175691/1‑148 (MQ=255) ggCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTG‑GCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGACTGCGCAGTGCATTCAAGGTCTGCTCGACATACTccc > 4:271495/1‑149 (MQ=255) cGACCGTGCAgggtttacccgcgaagaggccgctactgccttacctggccagcaccaccaacttacccacagcctgccgttgccccagcttctcgatagcaaccccggcttctgccagtggataagtctgcgacaccagcggcttcaac > 6:143200‑M2/1‑10 (MQ=255) gACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTG‑GCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGACTGCGCAGTGCATTCAAGGTCTGCTCGACATACTCCcgcg > 7:292334/1‑149 (MQ=255) gACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTG‑GCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGACTGCGCAGTGCATTCAAGGTCTGCTCGACATACTCCcgcg < 4:292216/149‑1 (MQ=255) cGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTG‑GCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGACTGCGCAGTGCATTCAAGGTCTGCTCGACATACTCCCGCgtgg > 5:25507/1‑149 (MQ=255) cAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTG‑GCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGACTGCGCAGTGCATTCaa < 4:249305/119‑1 (MQ=255) cAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTG‑GCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGACTGCGCAGTGCATTCaa > 3:249305/1‑119 (MQ=255) cAGGGGTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTG‑GCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGACTGCGCAGTGCATTCAAGGTCTGCTCGACATACTCCCGCGTGGTGcc < 4:240221/149‑1 (MQ=255) agggtttacccgcgaagaggccgctactgccttacctggccagcaccaccaacttacccacagcctgccgttgccccagcttctcgatagcaaccccggcttctgccagtggataagtctgcgacaccagcggcttcaacttgccctcg > 6:287407‑M2/1‑1 (MQ=255) aGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGCTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTG‑GCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGACTGCGCAGTGCATTCAAGGTCTGCTCGACATACTCCCGCGTGGTGCCa > 1:332710/1‑149 (MQ=255) aGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCCGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTG‑GCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGACTGCGCAGTGCATTCAAGGTCTGCTCTACATACTCCCGCGTGGTGCCa > 8:243162/1‑149 (MQ=255) | GTGTCGCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTG‑GCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGACTGCGCAGTGCATTCAAGGTCTGCTCGACATACTCCCGCGTGGTGCCA > NC_002947/5943497‑5943791 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |