| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| JC | NC_000913 | 2,866,955 | (TTGCTCT)1→2 | coding (597/993 nt) | rpoS ← | RNA polymerase, sigma S (sigma 38) factor |
| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | 2866949 = | 0 (0.000) | coding (603/993 nt) | rpoS | RNA polymerase, sigma S (sigma 38) factor | |||||
Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
CGTTCACGGGTGAGGCCAATTTCACGACCTACATCTTCCAGTGTTG‑CCGCTTCGTACCCCAGCAAACCGAATCGACGTGCCAGCACTTCACGCTGTTTGGCGTTCAGCTCGAACAGCCATTTGACGATGCTCTGCTTCATATCGTCATCTTGCGTGGTATCTTCCGGACCGTTCTCTTTTTCATCGGCCAGGATGTCCAGCAACGCTTTTTCGGAATCACCACCCAGCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTCGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGATCTCTTCCGCACTTGGTTCATGGTCCAGCTTATGGGACAACTCACGTGCGGTTCGCAGGTAAACGTTCAGCTCCTTTACGATGTGAATCGGCAAACGAATAGTACGGGTTTGGTTCATAATCGCCCGTTCAATCGTCTGGCGAATCCACCAGGTTGCGTATGTTGAGAAGCGGAAACCACGTTCCGGGTCAAACTTCTCTACCGCGCGGATCAGCCCCAGGTTGCCCTCTTCGATAAGGTCCAGCAACGCCAGACCACGATTGCCATAACGGCGGGCAA > NC_000913/2866650‑2867238 | cGTTCACGGGTGAGGCCAATTTCACGACCTACATCTTCCAGTGTTG‑CCGCTTCGTACCCCAGCAAACCGAATCGACGTGCCAGCACTTTACGCTGTTTGGCGTTCAGCTCGAACAGCCATTCGACGATGCTCTGCTTCATACCGTCATCTTGCGTGGTATCTTCCGGACCGTTCTCTTTCTCATCGGCCAGGACGTCCAGCAACGCTTTTTCGGATTCACCACCCAGCGGGGCGTCTACCGAGGTAATGCGCCCGTTAAGACGAAGCATTCGGCTGACGTCATCAACTGGCTTTTCCAGtt > 1:322986‑M1/1‑299 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CGTTCACGGGTGAGGCCAATTTCACGACCTACATCTTCCAGTGTTG‑CCGCTTCGTACCCCAGCAAACCGAATCGACGTGCCAGCACTTCACGCTGTTTGGCGTTCAGCTCGAACAGCCATTTGACGATGCTCTGCTTCATATCGTCATCTTGCGTGGTATCTTCCGGACCGTTCTCTTTTTCATCGGCCAGGATGTCCAGCAACGCTTTTTCGGAATCACCACCCAGCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTCGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGATCTCTTCCGCACTTGGTTCATGGTCCAGCTTATGGGACAACTCACGTGCGGTTCGCAGGTAAACGTTCAGCTCCTTTACGATGTGAATCGGCAAACGAATAGTACGGGTTTGGTTCATAATCGCCCGTTCAATCGTCTGGCGAATCCACCAGGTTGCGTATGTTGAGAAGCGGAAACCACGTTCCGGGTCAAACTTCTCTACCGCGCGGATCAGCCCCAGGTTGCCCTCTTCGATAAGGTCCAGCAACGCCAGACCACGATTGCCATAACGGCGGGCAA > NC_000913/2866650‑2867238 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |