| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | NC_000913 | 2,866,955 | (TTGCTCT)1→2 | coding (597/993 nt) | rpoS ← | RNA polymerase, sigma S (sigma 38) factor |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2866948 | 0 (0.000) | 106 (1.390) +TTGCTCT |
72/468 | 0.0 | 100% | coding (604/993 nt) | rpoS | RNA polymerase, sigma S (sigma 38) factor |
| ? | NC_000913 | 2866949 = | 0 (0.000) | coding (603/993 nt) | rpoS | RNA polymerase, sigma S (sigma 38) factor | |||||
Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
GTGAGGCCAATTTCACGACCTACATCTTCCAGTGTTGCCGCTTCGTACCCCAGCAAACCGAATCGACGTGCCAGCACTTCACGCTGTTTGGCGTTCAGCTCGAACAGCCATTTGACGATGCTCTGCTTCATATCGTCATCTTGCGTGGTATCTTCCGGACCGTTCTCTTTTTCATCGGCCAGGATGTCCAGCAACGCTTTTTCGGAATCACCACCCAGCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTCGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGATCTCTTCCGCACTTGGTTCATGGTCCAGCTTATGGGACAACTCACGTGCGGTTCGCAGGTAAACGTTCAGCTCCTTTACGATGTGAATCG‑GCAAACGAATAGTACGGGTTTGGTTCATAATCGCCCGTTCAATCGTCTGGCGAATCCACCAGGTTGCGTATGTTGAGAAGCGGAAACCACGTTCCGGGTCAAACTTCTCTACCGCGCGGATCAGCCCCAGGTTGCCCTCTTCGATAAGGTCCAGCAACGCCAGACCACGATTGCCATAACGGCGGGCAATTTTTACC > NC_000913/2866659‑2867246 | caatttcacgacctacagcgtccagtgttgccgctgcgtaccccagcaatccgaatcgacgtgccagcacttcacgctgtttggcggtcagctcgaacagccatttgacgatgctctgcttcatatcgtcatcttgcgtggtatcttccggaccgttctctttttcatcggccaggatgtccagcaacgctttttcggaatcaccacccagcggggtgtctaccgaggtaatgcgctcgttaagacgaagcatacggctgacgtcatcaactggcttatccagttgctctTTGCTCTGCGa < 1:749221‑M2/11‑1 (MQ=255) gagacagtacatcttccagtgttgccgcttcgtaccacagcaaaccgaatcgacgtgccagcacttccggctgtttggcgttcagctcgaccagccatttgacgatgctctgcttcatatcgtcatcttgcgtggtatcttccggaccgttctctttttcatcggccaggatgtccagcaacgctttttcggaatcaccacccagcggggtgtctaccgaggtaatgcgctcgttaagacgaagcatacggctgacgtcatcaactggcttatccagttgctctTTGCTCTGCGATctct < 1:451807‑M2/16‑1 (MQ=255) ccgctctgcatcttccagtgttgccgcttcgtatcccagcaaaccgaatcgacgtgccagcacttcacgctgtttggcgttcagcgcgatcagccatttgacgatgctctgcttcatatcgtcctcttgcgtggtatcttccggaccgttctctttttcctcggccatgatgtccagcaacgctttttcggaatcaccacccagcggggtgtctaccgaggtaatgcgctcgttaagacgaagcatacggctgacgtcatcaactggcttatccagttgctctTTGCTCTGCGATCTCTTc < 1:484968‑M2/18‑1 (MQ=255) tcctacatcttccagtgttgccgcttcgtaccccagcaaaccgaatcgacgtgccagcacttcacgctgtttggcgttcagctcgaacagccatttgacgatgctctgcttcatatcgtcatcttgcgtggtatcttccggaccgttctctttttcatcggccaggatgtccagcaacgctttttcggaatcaccacccagcggggtgtctaccgaggtaatgcgctcgttaagacgaagcatacggctgacgtcatcaactggcttatccagttgctctTTGCTCTGCGATCTCTTCCGc < 1:129152‑M2/21‑1 (MQ=255) ccctacatcttccagtgtttccgcttcgtaccccagcaaaccgaatcgacgtgccagcacttcacgctgtttggcgttcagctcgaacagccatttgacgatgctctgcttcatatcgtcatcttgcgtggtatcttccggaccgttctctttttcatcggccaggatgtccagcaacgctttttcggaatcaccacccagcggggtgtctaccgaggtaatgcgctcgttaagacgaagcatacggctgacgtcatcaactggcttatccagttgctctTTGCTCTGCGATCTCTTCCGc < 1:234037‑M2/21‑1 (MQ=255) acctacctcttcccgggttgccgcttcgtaccccagcaaacctaagcgacctgccagcacttcacgctgtttggcgttcagctcgaacagccatttgacgatgctctgcttcatctcgtcatcttgcgtggtatcttccggaccgttctctttttcatcggccaggatgtccagcaacgctttttcggaatcaccacccagcggggtgtctaccgaggtaatgcgctcgttaagacgaagcatacggctgacgtcatcaactggcttatccagttgctctTTGCTCTGCGATCTCTTCCGc < 1:669979‑M2/21‑1 (MQ=255) acctacatcttccagtgttgccgcttcgtaccccagcaaaccgaatcgacgtgccagcacttcacgctgtttggcgttcagctcgaacagccatttgacgatgctctgcttcatatcgtcatcttgcgtggtatcttccgggtcgttctctttttcatcagccaggatgaccagcaacgctttttcggaatcaccacccagctgggtgtctaccgaggtaatgcgctcgttaagacgaagcatacggctgaagtcatcaactggcttatccagttgctctTTGCTCTTCCATATCTTACg > 1:131677‑M2/281‑300 (MQ=255) 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tgccagcacttcacgctgtttggcgttcagctcgaacagccatttgacgatgctctgcttcatatcgtcatcttgcgtggtatcttccggaccgttctctttttcatcggccaggatgtccagcaacgctttttcggaatcaccacccagcggggtgtctaccgaggtaatgcgctcgttaagacgaagcatacggctgacctcatcaactggcttatccagttgctctTTGCTCTGCTATCTCTTCCGCACTTGGTTCATCGTCCAGCTTATCGTACCACTACTGTCCGGTTCTCAGGTa > 1:411225‑M2/230‑301 (MQ=255) cagttcacgctgtttggcgttgagcgcgaacagccatttgacgatgctctgctgcatatcgtcatcttgcgtggtatcctccggaccgttctctttttcatcggccaggatgtccagcaacgctttttcggaataaccacccagcggggtgtctaccgaggtaatgcgctcgttaagacgaagcatacggctgacgtcatcaactggcttatccagttgctctTTGCTCTGCGATCTCTTCCGCACTTGGTTCATGGTCCAGCTTATGGGACAACTCACGTGCGGTTCGCAGGTAAACGt < 1:418795‑M2/77‑1 (MQ=255) cacttcactctgtttgtcgttcagctctaacagccatttgacgatgctctgcttcatatcgtcatcttgcgtggtatcttccggaccgttctctttttcatcggccaggatgtccagcaacgctttttcggaatcaccacccagcggggtgtctaccgaggtaatgcgctcgttaagacgaagcatacggctgacgtcatcaactggcttatccagttgctctTTGCTCTGCGATCTCTTCCGCACTTGGTTCATGGTCCAGCTTATGGGACAACTCACGTGCGGTTCGCAGGTAAACGt < 1:145578‑M2/77‑1 (MQ=255) ccgctgtttggcgttcagctcgaacagccatttgacgatgctctgcttcatatcgtcatcttgcgtggtatcttccggaccgttctctttttcatcggccaggatgtccagcaacgctttttcggaatcaccacccagcggggtgtctaccgaggtaatgcgctcgttaagacgaagcatacggctgacgtcatcaactggcttatccagttgctctTTGCTCTGCGATCTCTTCCGCACTTGGTTCATGGTCCAGCTTATGGGACAACTCACGTGCGGTTCGCAGGTAAACGTTCAGCt > 1:91204‑M2/218‑300 (MQ=255) tggcgttcggctcgaacggccatttgccgattctctgcttcatatcgtcatcttgcgtggtatcttccggaccgttctctttttcatcggccaggatgtccagcaacgctttttcggaatcaccacccagcggggtgtctaccgaggtaatgcgctcgttaagacgaagcatacggctgacgtcatcaactggcttatccagttgctctTTGCTCTGCGATCTCTTCCGCACTTGGTTCATGGTCCAGCTTATGGGACAACTCACGTGCGGTTCGCAGGTAAACGTTCAGCTCCTTTACGa < 1:363017‑M2/92‑1 (MQ=255) ggcgttcagctcgaacagccatttgacgatgctctgcttcatatcgtcatcttgcgtggtatcttccggaccgttctctttttcatcggccaggatgtccagcaacgctttttcggaatcaccacccagcggggtgtctaccgaggtaatgcgctcgttaagacgaagcatacggctgacgtcatcaactggcttatccagttgctctTTGCTCTGCGATCTCTTCCGCACTTGGTTCATGGTCCAGCTTATGGGACAACTCACGTGCGGTTCGCAGGTAAACGTTCAGCTCCTTTACGa < 1:284570‑M2/92‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |