| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 514694 = | NA (NA) | 32 (0.170) +TCCTACAGGAAACGCGTTATTAATCTTGTG |
9/100 | NT | 100% | intergenic (+2762/‑4001) | recR/speA_2 | Recombination protein RecR/Arginine decarboxylase |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 558897 = | 0 (0.000) | intergenic (+110/+3692) | USA300TCH1516_00505/gabR | tRNA‑Ile/HTH‑type transcriptional regulatory protein GabR | |||||
Only 100 of 554 total aligned reads displayed.
CAAAGCATATCGTCGTTAGTAACGTCCTTCATCGGCTTCTAGTGCCAAGGCATCCACCGTGCGCCCTTAATAACTTAATCTATGTTTCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < USA300TCH1516_ALE/514783‑514694‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AGTGTTCGAAAGAACACTCACAAGATTAATAACGCGTTTCCTGTAGGATGGAAACATAGATTAAGTTATTAAGGGCGCACGGTGG > USA300TCH1516_ALE/558897‑558981 |||||||||||||||||||||||||||||| CAAAGCATATCGTCGTTAGTAACGTCCTTCATCGGCTTCTAGTGCCAAGGCATCCACCGTGCGCCCTTAATAACTTAATCTATGTTTCCAT > 2:1958848/1‑91CAAAGCATATCGTCGTTAGTAACGTCCTTCATCGGCTTCTAGTGCCAAGGCATCCACCGTGCGCCCTTAATAACTTAATCTATGTTTCCAT > 1:3602663/1‑91 AAAGCATATCGTCGTTAGTAACGTCCTTCATCGGCTTCTAGTGCCAAGGCATCCACCGTGCGCCCTTAATAACTTAATCTATGTTTCCATC > 2:4753219/1‑91 AAGCATATCGTCGTTAGTAACGTCCTTCATCGGCTTCTAGTGCCAAGGCATCCACCGTGCGCCCTTAATAACTTAATCTATGTTTCCATCC > 1:5741464/1‑91 AAGCATATCGTCGTTAGTAACGTCCTTCATCGGCTTCTAGTGCCAAGGCATCCACCGTGCGCCCTTAATAACTTAATCTATGTTTCCATCC < 2:3541413/91‑1 AAGCATATCGTCGTTAGTAACGTCCTTCATCGGCTTCTAGTGCCAAGGCATCCACCGTGCGCCCTTAATAACTTAATCTATGTTTCCATCC > 2:4321095/1‑91 AAGCATATCGTCGTTAGTAACGTCCTTCATCGGCTTCTAGTGCCAAGGCATCCACCGTGCGCCCTAAATAACTTAATCTATGTTTCCATCC > 2:5423229/1‑91 AGCATATCGTCGTTAGTAACGTCCTTCATCGGCTTCTAGTGCCAAGGCATCCACCGTGCGCCCTTAATAACTTAATCTATGTTTCCATCCT < 1:2475065/91‑1 GCATATCGTCGTTAGTAACGTCCTTCATCGGCTTCTAGTGCCAAGGCATCCACCGTGCGCCCTTAATAACTTAATCTATGTTTCCATCCTA > 1:1009659/1‑91 GCATATCGTCGTTAGTAACGTCCTTCATCGGCTTCTAGTGCCAAGGCATCCACCGTGCGCCCTTAATAACTTAATCTATGTTTCCATCCTA > 2:2149886/1‑91 GCATATCGTCGTTAGTAACGTCCTTCATCGGCTTCTAGTGCCAAGGCATCCACCGTGCGCCCTTAATAACTTAATCTATGTTTCCATCCTA > 1:919745/1‑91 GCATATCGTCGTTAGTAACGTCCTTCATCGGCTTCTAGTGCCAAGGCATCCACCGTGCGCCCTTAATAACTTAATCTATGTTTCCATCCTA > 1:830488/1‑91 GCATATCGTCGTTAGTAACGTCCTTCATCGGCTTCTAGTGCCAAGGCATCCACCGTGCGCCCTTAATAACTTAATCTATGTTTCCATCCTA > 1:4122944/1‑91 GCATATCGTCGTTAGTAACGTCCTTCATCGGCTTCTAGTGCCAAGGCATCCACCGTGCGCCCTTAATAACTTAATCTATGTTTCCATCCTA > 2:4968362/1‑91 GCATATCGTCGTTAGTAACGTCCTTCATCGGCTTCTAGTGCCAAGGCATCCACCGTGCGCCCTTAATAACTTAATCTATGTTTCCATCCTA > 1:2370634/1‑91 GCATATCGTCGTTAGTAACGTCCTTCATCGGCTTCTAGTGCCAAGGCATCCACCGTGCGCCCTTAATAACTTAATCTATGTTTCCATCCTA > 1:1851740/1‑91 GCATATCGTCGTTAGTAACGTCCTTCATCGGCTCCTAGTGCCCAGGCATCCACCGTGCGCCCTTCATAACTTAATCTCTGTTTCCCTCCTA > 2:3727143/1‑91 CATATCGTCGTTAGTAACGTCCTTCATCGGCTTCTAGTGCCAAGGCATCCACCGTGCGCCCTTAATAACTTAATCTATGTTTCCATCCTAC > 1:480059/1‑91 CATATCGTCGTTAGTAACGTCCTTCATCGGCTTCTAGTGCCAAGGCATCCACCGTGCGCCCTTAATAACTTAATCTATGTTTCCATCCTAC < 1:4154930/91‑1 TATCGTCGTTAGTAACGTCCTTCATCGGCTTCTAGTGCCAAGGCATCCACCGTGCGCCCTTAATAACTTAATCTATGTTTCCATCCTACAG > 1:4998986/1‑91 TATCGTCGTTAGTAACGTCCTTCATCGGCTTCTAGTGCCAAGGCATCCACCGTGCGCCCTTAATAACTTAATCTATGTTTCCATCCTACAG > 1:5545678/1‑91 TATCGTCGTTAGTAACGTCCTTCATCGGCTTCTAGTGCCAAGGCATCCACCGTGCGCCCTTAATAACTTAATCTATGTTTCCATCCTACAG < 2:513208/91‑1 ATCGTCGTTAGTAACGTCCTTCATCGGCTTCTAGTGCCAAGGCATCCACCGTGCGCCCTTAATAACTTAATCTATGTTTCCATCCTACAGG > 1:2914994/1‑91 ATCGTCGTTAGTAACGTCCTTCATCGGCTTCTAGTGCCAAGGCATCCACCGTGCGCCCTTAATAACTTAATCTATGTTTCCATCCTACAGG < 2:1035044/91‑1 ATCGTCGTTAGTAACGTCCTTCATCGGCTTCTAGTGCCAAGGCATCCACCGTGCGCCCTTAATAACTTAATCTATGTTTCCATCCTACAGG > 1:607433/1‑91 TCGTCGTTAGTAACGTCCTTCATCGGCTTCTAGTGCCAAGGCATCCACCGTGCGCCCTTAATAACTTAATCTATGTTTCCATCCTACAGGA < 2:1393056/91‑1 CGTCGTTAGTAACGTCCTTCATCGGCTTCTAGTGCCAAGGCATCCACCGTGCGCCCTTAATAACTTAATCTATGTTTCCATCCTACAGGAA > 1:4695252/1‑91 CGTCGTTAGTAACGTCCTTCATCGGCTTCTAGTGCCAAGGCATCCACCGTGCGCCCTTAATAACTTAATCTATGTTTCCATCCTACAGGAA > 1:1983069/1‑91 CGTCGTTAGTAACGTCCTTCATCGGCTTCTAGTGCCAAGGCATCCACCGTGCGCCCTTAATAACTTAATCTATGTTTCCATCCTACAGGAA < 1:1480329/91‑1 CGTCGTTAGTAACGTCCTTCATCGGCTTCTAGTGCCAAGGCATCCACCGTGCGCCCTTAATAACTTAATCTATGTTTCCATCCTACAGGAA < 2:1671646/91‑1 TCGTTAGTAACGTCCTTCATCGGCTTCTAGTGCCAAGGCATCCACCGTGCGCCCTTAATAACTTAATCTATGTTTCCATCCTACAGGAAAC < 2:2524504/91‑1 TCGTTAGTAACGTCCTTCATCGGCTTCTAGTGCCAAGGCATCCACCGTGCGCCCTTAATAACTTAATCTATGTTTCCATCCTACAGGAAAC < 2:4003440/91‑1 TCGTTAGTAACGTCCTTCATCGGCTTCTAGTGCCAAGGCATCCACCGTGCGCCCTTAATAACTTAATCTATGTTTCCATCCTACAGGAAAC < 2:3144239/91‑1 gcTAGTAACGGCCTTCATCGGCTTCTAGTGCCAAGGCATCCACCGTGCGCCCTTAATAACATAATCTATGTTTCCATCCTACAGGAAACGC < 2:4659511/89‑1 GTTAGTAACGTCCTTCATCGGCTTCTAGTGCCAAGGCATCCACCGTGCGCCCTTAATAACTTAATCTATGTTTCCATCCTACAGGAAACGC < 1:2727762/91‑1 GTTAGTAACGTCCTTCATCGGCTTCTAGTGCCAAGGCATCCACCGTGCGCCCTTAATAACTTAATCTATGTTTCCAT > 1:2658531/1‑77 TTAGTAACGTCCTTCATCGGCTTCTAGTGCCAAGGCATCCACCGTGCGCCCTTAATAACTTAATCTATGTTTCCATCCTACAGGAAACGCG < 2:4598347/91‑1 TTAGTAACGTCCTTCATCGGCCTCTAGTGCCAAGGCATCCACCGTGCGCCCTTAATAACTTAATCTATGTTTCCATCCTCCAGGAAACGCc > 2:3885621/1‑90 GTAACGTCCTTCATCGGCTTCTAGTGCCAAGGCATCCACCGTGCGCCCTTAATAACTTAATCTATGTTTCCATCCTACAGGAAACGCGTTA < 1:4873507/91‑1 GTAACGTCCTTCATCGGCTTCTAGTGCCAAGGCATCCACCGTGCGCCCTTAATAACTTAATCTATGTTTCCATCCTACAGGAAACGCGTTA > 1:2269726/1‑91 GTAACGTCCTTCATCGGCTTCTAGTGCCAAGGCATCCACCGTGCGCCCTTAATAACTTAATCTATGTTTCCATCCTACAGGAAACGCGTTA > 2:5814745/1‑91 tatCGTCCTTCATCGGCTTCTAGTGCCAAGGCATCCACCGTGCGCCCTTAATAACTTAATCTATGTTTCCATCCTACCGGAAACGCGTTAT < 1:73878/88‑1 TAACGTCCTTCATCGGCTTCTAGTGCCAAGGCATCCACCGTGCGCCCTTAATAACTTAATCTATGTTTCCATCCTACAGGAAACGCGTTAT < 1:3518097/91‑1 TAACGTCCTTCATCGGCTTCTAGTGCCAAGGCATCCACCGTGCGCCCTTAATAACTTAATCTATGTTTCCATCCTACAGGAAACGCGTTAT > 2:2056918/1‑91 TAACGTCCTTCATCGGCTTCTAGTGCCAAGGCATCCACCGTGCGCCCTTAATAACTTAATCTATGTTTCCATCCTACAGGAAACGCGTTAT < 2:826864/91‑1 TAACGTCCTTCATCGGCTTCTAGTGCCAAGGCATCCACCGTGCGCCCTTAATAACTTAATCTATGTTTCCATCCTACAGGAAACGCGTTAT < 1:2069585/91‑1 TAACGTCCTTCATCGGCTTCTAGTGCCAAGGCATCCACCGTGCGCCCTTAATAACTTAATCTATGTTTCCATCCTACAGGAAACGCGTTAT < 2:5290087/91‑1 TAACGTCCTTCATCGGCTTCTAGTGCCAAGGCATCCACCGTGCGCCCTTAATAACTTAATCTATGTTTCCATCCTACAGGAAACGCGTTAT < 2:2797067/91‑1 TAACGTCCTTCATCGGCTTCTAGTGCCAAGGCATCCACCGTGCGCCCTTAATAACTTAATCTATGTTTCCATCCTACAGGAAACGCGTTAT < 1:3801772/91‑1 TAACGTCCTTCATCGGCTTCTAGTGCCAAGGCATCCACCGTGCGCCCTTAATAACTTAATCTATGTTTCCATCCTACAGGAAACGCGTTAT < 2:2969942/91‑1 AACGTCCTTCATCGGCTTCTAGTGCCAAGGCATCCACCGTGCGCCCTTAATAACTTAATCTATGTTTCCATCCTACAGGAAACGCGTTATT < 2:725801/91‑1 AACGTCCTTCATCGGCTTCTAGTGCCAAGGCATCCACCGTGCGCCCTTAATAACTTAATCTATGTTTCCATCCTACAGGAAACGCGTTATT > 2:3632808/1‑91 ACGTCCTTCATCGGCTTCTAGTGCCAAGGCATCCACCGTGCGCCCTTAATAACTTAATCTATGTTTCCATCCTACAGGAAACGCGTTATTA < 2:4456912/91‑1 ACGTCCTTCATCGGCTTCTAGTGCCAAGGCATCCACCGTGCGCCCTTAATAACTTAATCTATGTTTCCATCCTACAGGAAACGCGTTATTA < 2:322433/91‑1 ACGTCCTTCATCGGCTTCTAGTGCCAAGGCATCCACCGTGCGCCCTTAATAACTTAATCTATGTTTCCATCCTACAGGAAACGCGTTATTA < 2:3455899/91‑1 ACGTCCTTCATCGGCTTCTAGTGCCAAGGCATCCACCGTGCGCCCTTAATAACTTAATCTATGTTTCCATCCTACAGGAAACGCGTTATTA > 2:50730/1‑91 ACGTCCTTCATCGGCTTCTAGTGCCAAGGCATCCACCGTGCGCCCTTAATAACTTAATCTATGTTTCCATCCTACAGGAAACGCGTTATTA < 2:888233/91‑1 ACGTCCTTCATCGGCTTCTAGTGCCAAGGCATCCACCGTGCGCCCTTAATAACTTAATCTATGTTTCCATCCTACAGGAAACGCGTTATTA < 1:1080468/91‑1 ACGTCCTTCATCGGCTTCTAGTGCCAAGGCATCCACCGTGCGCCCTTAATAACTTAATCTATGTTTCCATCCTACAGGAAACGCGTTATTA < 1:1727838/91‑1 ACGTCCTTCATCGGCTTCTAGTGCCAAGGCATCCACCGTGCGCCCTTAATAACTTAATCTATGTTTCCATCCTACAGGAAACGCGTTATTA < 1:188008/91‑1 ACGTCCTTCATCGGCTTCTAGTGCCAAGGCATCCACCGTGCGCCCTTAATAACTTAATCTATGTTTCCATCCTACAGGAAACGCGTTATTA > 1:563231/1‑91 ACGTCCTTCATCGGCTTCTAGTGCCAAGGCATCCACCGTGCGCCCTTAATAACTTAATCTATGTTTCCATCCTACAGGAAACGCGTTATTA > 1:3099504/1‑91 ACGTCCTTCATCGGCTTCTAGTGCCAAGGCATCCACCGTGCGCCCTTAATAACTTAATCTATGTTTCCATCCTACAGGAAACGCGTTATTA < 1:3975920/91‑1 GTCCTTCATCGGCTTCTAGTGCCAAGGCATCCACCGTGCGCCCTTAATAACTTAATCTATGTTTCCATCCTACAGGAAACGCGTTATTAAT < 1:1545059/91‑1 GTCCTTCATCGGCTTCTAGTGCCAAGGCATCCACCGTGCGCCCTTAATAACTTAATCTATGTTTCCATCCTACAGGAAACGCGTTATTAAT < 1:4925290/91‑1 CCTTCATCGGCTTCTAGTGCCAAGGCATCCACCGTGCGCCCTTAATAACTTAATCTATGTTTCCATCCTACAGGAAACGCGTTATTAATCT < 1:1654732/91‑1 CCTTCATCGGCTTCTAGTGCCAAGGCATCCACCGTGCGCCCTTAATAACTTAATCTATGTTTCCATCCTACAGGAAACGCGTTATTAATCT > 2:5337500/1‑91 CTTCATCGGCTTCTAGTGCCAAGGCATCCACCGTGCGCCCTTAATAACTTAATCTATGTTTCCATCCTACAGGAAACGCGTTATTAATCTT > 1:3391927/1‑91 CTTCATCGGCTTCTAGTGCCAAGGCATCCACCGTGCGCCCTTAATAACTTAATCTATGTTTCCATCCTACAGGAAACGCGTTATTAATCTT > 2:1582239/1‑91 TTCATCGGCTTCTAGTGCCAAGGCATCCACCGTGCGCCCTTAATAACTTAATCTATGTTTCCATCCTACAGGAAACGCGTTATTAATCTTG < 1:3182208/91‑1 TCATCGGCTTCTAGTGCCAAGGCATCCACCGTGCGCCCTTAATAACTTAATCTATGTTTCCATCCTACAGGAAACGCGTTATTAATCTTGT > 2:4168388/1‑91 CATCGGCTTCTAGTGCCAAGGCATCCACCGTGCGCCCTTAATAACTTAATCTATGTTTCCATCCTACAGGAAACGCGTTATTAATCTTGTG > 1:4477659/1‑91 ATCGGCTTCTAGTGCCAAGGCATCCACCGTGCGCCCTTAATAACTTAATCTATGTTTCCATCCTACAGGAAACGCGTTATTAATCTTGTGA < 2:601648/91‑1 ATCGGCTTCTAGTGCCAAGGCATCCACCGTGCGCCCTTAATAACTTAATCTATGTTTCCATCCTACAGGAAACGCGTTATTAATCTTGTGA > 2:5621197/1‑91 ATCGGCTTCTAGTGCCAAGGCATCCACCGTGCGCCCTTAATAACTTAATCTATGTTTCCATCCTACAGGAAACGCGTTATTAATCTTGTGA > 1:5414324/1‑91 ATCGGCTTCTAGTGCCAAGGCATCCACCGTGCGCCCTTAATAACTTAATCTATGTTTCCATCCTACAGGAAACGCGTTATTAATCTTGTGA < 2:2460207/91‑1 ATCGGCTTCTAGTGCCAAGGCATCCACCGTGCGCCCTTAATAACTTAATATATGTTTCCATCCTACAGGAAACGCGTTATTAATCTTGTGA < 1:5800745/91‑1 TCGGCTTCTAGTGCCAAGGCATCCACCGTGCGCCCTTAATGACTTAATCTATGTTTCCATCCTACAGGAAACGCGTTATTAATCTTGTGAG > 1:3031900/1‑91 TCGGCTTCTAGTGCCAAGGCATCCACCGTGCGCCCTTAATAACTTAATCTATGTTTCCATCCTACAGGAAACGCGTTATTAATCTTGTGAG < 2:3082764/91‑1 TCGGCTTCTAGTGCCAAGGCATCCACCGTGCGCCCTTAATAACTTAATCTATGTTTCCATCCTACAGGAAACGCGTTATTAATCTTGTGAG < 1:2847315/91‑1 TCGGCTTCTAGTGCCAAGGCATCCACCGTGCGCCCTTAATAACTTAATCTATGTTTCCATCCTACAGGAAACGCGTTATTAATCTTGTGAG < 2:3754288/91‑1 CGGCTTCTAGTGCCAAGGCATCCACCGTGCGCCCTTAATAACTTAATCTATGTTTCCATCCTACAGGAAACGCGTTATTAATCTTGTGAGT < 1:1815114/91‑1 CGGCTTCTAGTGCCAAGGCATCCACCGTGCGCCCTTAATAACTTAATCTATGTTTCCATCCTACAGGAAACGCGTTATTAATCTTGTGAGT < 2:4796437/91‑1 CGGCTTCTAGTGCCAAGGCATCCACCGTGCGCCCTTAATAACTTAATCTATGTTTCCATCCTACAGGAAACGCGTTATTAATCTTGTGAGT < 2:5725685/91‑1 CGGCTTCTAGTGCCAAGGCATCCACCGTGCGCCCTTAATAACTTAATCTATGTTTCCATCCTACAGGAAACGCGTTATTAATCTTGTGAGT < 1:2878948/91‑1 CGGCTTCTAGTGCCAAGGCATCCACCGTGCGCCCTTAATAACTTAATCTATGTTTCCATCCTACAGGAAACGCGTTATTAATCTTGTGAGT < 1:3262551/91‑1 CGGCTTCTAGTGCCAAGGCATCCACCGTGCGCCCTTAATAACTTAATCTATGTTTCCATCCTACAGGAAACGCGTTATTAATCTTGTGAGT > 1:4300809/1‑91 GCTTCTAGTGCCAAGGCATCCACCGTGCGCCCTTAATAACTTAATCTATGTTTCCATCCTACAGGAAACGCGTTATTAATCTTGTGAGTGT < 1:4557962/91‑1 GCTTCTAGTGCCAAGGCATCCACCGTGCGCCCTTAATAACTTAATCTATGTTTCCATCCTACAGGAAACGCGTTATTAATCTTGTGAGTGT < 2:1210795/91‑1 CTTCTAGTGCCAAGGCATCCACCGTGCGCCCTTAATAACTTAATCTATGTTTCCATCCTACAGGAAACGCGTTATTAATCTTGTGAGTGTT < 2:4861311/91‑1 CTTCTAGTGCCAAGGCATCCACCGTGCGCCCTTAATAACTTAATCTATGTTTCCATCCTACAGGAAACGCGTTATTAATCTT < 2:4406659/82‑1 CTTCTAGTGCCAAGGCATCCACCGTGCGCCCTTAATAACTTAATCGATGTTTCCATCCTACAGGAAACGCGTTATTAATCTT > 1:4407577/1‑82 TTCTAGTGCCAAGGCATCCACCGTGCGCCCTTAATAACTTAATCTATGTTTCCATCCTACAGGAAACGCGTTATTAATCTTGTGAGTGTTC < 2:2711904/91‑1 TTCTAGTGCCAAGGCATCCACCGTGCGCCCTTAATAACTTAATCTATGTTTCCATCCTACAGGAAACGCGTTATTAATCTTGTGAGTGTTC < 2:2269726/91‑1 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USA300TCH1516_ALE/514783‑514694‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AGTGTTCGAAAGAACACTCACAAGATTAATAACGCGTTTCCTGTAGGATGGAAACATAGATTAAGTTATTAAGGGCGCACGGTGG > USA300TCH1516_ALE/558897‑558981 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |