| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 2256409 | 189 (0.630) | 9 (0.040) | 9/132 | NT | 5.3% | intergenic (+62/+59) | deoD1/dps | Purine nucleoside phosphorylase DeoD‑type 1/General stress protein 20U |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 2256428 | 168 (0.680) | intergenic (+81/+40) | deoD1/dps | Purine nucleoside phosphorylase DeoD‑type 1/General stress protein 20U | |||||
TTACACAAATGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > USA300TCH1516_ALE/2256307‑2256409‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aaaagccaacacatAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTACTCTGC < USA300TCH1516_ALE/2256428‑2256339 TTACACAAATGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAA > 1:4176673/1‑91 TACACAAATGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAA < 2:4084999/91‑1 ACACAAATGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAA > 1:1870987/1‑91 tgtAAATGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAG > 2:3775185/4‑91 CACAAATGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAG > 1:122351/1‑91 CACAAATGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAG > 1:360232/1‑91 CAAATGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCC > 1:2642062/1‑91 AAATGATGGATATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTACTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCA < 1:5831677/91‑1 AAATGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCA < 2:810960/91‑1 AATGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAA > 2:5137516/1‑91 AATGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAA < 2:2444899/91‑1 AATGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAA > 1:4641120/1‑91 ATGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAAC < 2:3725835/91‑1 ATGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAAC > 2:2865962/1‑91 TGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACA > 2:4263194/1‑91 TGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACA < 1:1467200/91‑1 TGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACA < 2:797444/91‑1 GATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACAC > 1:1064781/1‑91 GATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACAC < 2:1249706/91‑1 GATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACAC < 1:3790697/91‑1 GATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACAC < 2:1539436/91‑1 GATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACAC < 2:3393070/91‑1 GATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACAC < 1:2460611/91‑1 GATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACAC < 1:1881547/91‑1 GATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACAC < 1:5513300/91‑1 ATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACA > 1:5857211/1‑91 ATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACA > 1:4384278/1‑91 ATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACA > 2:1182059/1‑91 ATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACA > 1:5573439/1‑91 ATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACA > 2:3127484/1‑91 ATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACA > 1:3587792/1‑91 ATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACA > 2:3618097/1‑91 ATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACA > 2:767139/1‑91 TGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACAT > 2:2328345/1‑91 TGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACAT > 2:2329972/1‑91 TGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACAT > 2:2413875/1‑91 TGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACAT > 2:3679239/1‑91 TGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACAT < 1:572907/91‑1 TGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACAT > 1:5588577/1‑91 TTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAAC > 2:5507933/1‑77 TTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAAC < 1:5507933/77‑1 TAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATAAATGGGGATAC < 1:2467043/91‑1 TAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATAAATGGGGATAC > 1:240877/1‑91 AAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATAAATGGGGATACGCC < 2:830412/91‑1 CGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATAAATGGGGATACGCCCAGA < 1:5243003/91‑1 CGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACAC < 2:2858183/70‑1 CGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACAC > 1:2858183/1‑70 GAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGT < 2:2032119/91‑1 GTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGT < 1:2129955/91‑1 AACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTG < 2:2892970/91‑1 ACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGG < 2:1965074/91‑1 agTGCTCTTTAACAGTGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATATGTGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCAT < 2:362354/89‑1 AAAAGCCAACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAA < 2:4326199/91‑1 AAGCCAACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATA > 1:3916496/1‑91 AGCCAACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAA > 1:570985/1‑91 AGCCAACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAA > 2:5308115/1‑91 AGCCAACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAA > 1:3108351/1‑91 AGCCAACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAA > 1:2102828/1‑91 AGCCAACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAA > 1:3108115/1‑91 AGCCAACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAA < 1:1546427/91‑1 AGCCAACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGGGTTGGCCTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAA < 1:2716128/91‑1 GCCAACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAG > 2:1810265/1‑91 GCCAACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAG < 1:341930/91‑1 GCCAACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAG > 2:202761/1‑91 GCCAACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAG > 2:202599/1‑91 GCCAACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAG < 1:1585069/91‑1 CCAACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGT > 1:1932328/1‑91 CCAACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGT > 2:5133076/1‑91 CCAACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGT < 1:1081275/91‑1 CCAACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGT < 1:4576367/91‑1 CCAACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGT > 1:4422972/1‑91 cgACACATAATTGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTCAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTT < 2:4654546/89‑1 CAACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAGTCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTT < 2:2572948/91‑1 CAACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTT < 1:3666254/91‑1 CAACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTT > 1:1195568/1‑91 CAACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTT > 2:618400/1‑91 CAACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTT < 1:3871002/91‑1 AACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTA > 1:5665388/1‑91 AACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTA > 1:818447/1‑91 ACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTAC > 2:4208183/1‑91 ACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTAC > 1:4303040/1‑91 CACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTACT < 1:3850096/91‑1 CACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTACT < 2:1523248/91‑1 CACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTACT < 1:639932/91‑1 CACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTACT > 2:4641120/1‑91 CACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTACT > 1:2898286/1‑91 CACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTACT < 1:1896074/91‑1 CACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTACT < 2:518291/91‑1 CATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTACTCT > 1:4592923/1‑91 CATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTACTCT < 2:793628/91‑1 CATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTACTCT < 2:4050949/91‑1 CATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTACTCT < 1:2297238/91‑1 CATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTACTCT > 1:3678659/1‑91 CATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTACTCT > 1:3677504/1‑91 ATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTACTCTG < 1:3393347/91‑1 TAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTACTCTGC < 2:4113363/91‑1 TAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTACTCTGC > 1:1380536/1‑91 TAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTACTCTGC < 2:3462325/91‑1 TTACACAAATGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > USA300TCH1516_ALE/2256307‑2256409‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aaaagccaacacatAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTACTCTGC < USA300TCH1516_ALE/2256428‑2256339 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |