| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 2256409 | 189 (0.630) | 9 (0.040) | 9/132 | NT | 5.3% | intergenic (+62/+59) | deoD1/dps | Purine nucleoside phosphorylase DeoD‑type 1/General stress protein 20U |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 2256428 | 168 (0.680) | intergenic (+81/+40) | deoD1/dps | Purine nucleoside phosphorylase DeoD‑type 1/General stress protein 20U | |||||
Only 100 of 379 total aligned reads displayed.
TGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCTGTAGATTAGCTTAAGTAAGATTTAAACATCCAATTAT > USA300TCH1516_ALE/2256319‑2256499 | aaaTCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCt > 2:4795688/1‑91 (MQ=255) tCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTggg > 1:3848717/1‑91 (MQ=255) gCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCg > 2:1948528/1‑91 (MQ=255) cTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGGGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGt < 2:3482526/91‑1 (MQ=255) cTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGt < 2:2525400/91‑1 (MQ=255) tttAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTa > 2:5202277/1‑91 (MQ=255) tCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCAtt < 1:274315/91‑1 (MQ=255) acataattggatgtttaaatcttacttaagctaatctacagataagtaataatataaatAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCAtt > 2:4726815‑M1/60‑91 (MQ=255) cataattggatgtttaaatcttacttaagctaatctacagataagtaataatataaatAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCAttt > 2:2734916‑M1/59‑91 (MQ=255) cataattggatgtttaaatcttacttaagctaatctacagataagtaataatataaatAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCAttt > 1:749740‑M1/59‑91 (MQ=255) cGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATaaatggggatacgcccaga < 1:5243003‑M1/91‑20 (MQ=255) cGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCAttt > 1:1428224/1‑91 (MQ=255) cGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCAttt > 2:179555/1‑91 (MQ=255) cAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTat < 1:3393347‑M2/91‑3 (MQ=255) agagTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTatg < 2:793628‑M2/91‑4 (MQ=255) gagTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATaaatggggatacgcccagaatgt < 2:2032119‑M1/91‑24 (MQ=255) gTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATaaatggggatacgcccagaatgtgt < 1:2129955‑M1/91‑26 (MQ=255) aaCTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTatgtgttg < 1:3871002‑M2/91‑9 (MQ=255) aaCTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTatgtgttg > 2:618400‑M2/1‑83 (MQ=255) aaCTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTGAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCAATTatgtgtcg < 2:4654546‑M2/91‑9 (MQ=255) aCTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTatgtgttgg < 1:4576367‑M2/91‑10 (MQ=255) tgtttaaatcttacttaagctaatctacagataagtaataatataaatAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGc > 2:2338286‑M1/49‑91 (MQ=255) ttATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTatgtgttggct > 1:570985‑M2/1‑80 (MQ=255) ttATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTatgtgttggct > 1:3108115‑M2/1‑80 (MQ=255) ttATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTatgtgttggct > 2:5308115‑M2/1‑80 (MQ=255) ttATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTatgtgttggct < 1:1546427‑M2/91‑12 (MQ=255) tttAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTatgtgttggctttt < 2:4326199‑M2/91‑15 (MQ=255) aaTTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTtttattt < 2:1146902/91‑1 (MQ=255) aaTTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTtttattt < 1:2328345/91‑1 (MQ=255) aaTTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTtttattt < 2:1304947/91‑1 (MQ=255) aaTTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTtttattt < 1:1244346/91‑1 (MQ=255) aTTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTtttattta < 1:4326199/91‑1 (MQ=255) gACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTatat > 1:4801033/1‑91 (MQ=255) gACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTatat < 2:3301128/91‑1 (MQ=255) aCTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTAtatt > 2:2147434/1‑91 (MQ=255) aCTTTAATTGCCCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATCCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTCTTATTTAtatt > 2:5829864/1‑91 (MQ=255) cTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTAtatta < 2:3411422/91‑1 (MQ=255) tttAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTAtattat < 1:39872/91‑1 (MQ=255) tttAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTAtattat < 1:3349789/91‑1 (MQ=255) ttAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATattatt > 2:3094582/1‑91 (MQ=255) ttAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATattatt > 2:5528391/1‑91 (MQ=255) aTTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACt < 2:1862166/91‑1 (MQ=255) tGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTa < 2:67185/91‑1 (MQ=255) gCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTAt < 1:5486979/91‑1 (MQ=255) gCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTAt < 2:4576367/91‑1 (MQ=255) ctctTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATc < 1:5027123/91‑1 (MQ=255) ctctTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATc < 1:2401063/91‑1 (MQ=255) tctTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCt > 1:1668541/1‑91 (MQ=255) ctTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCTg > 2:1720238/1‑91 (MQ=255) ttAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCTGTa < 2:2918540/91‑1 (MQ=255) aaCAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCTGTAGa < 1:3229325/91‑1 (MQ=255) aaCAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCTGTAGa < 1:4475154/91‑1 (MQ=255) aCAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCTGTAGAt > 1:2587903/1‑91 (MQ=255) aaTGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCTGTAGATTa > 2:4068451/1‑91 (MQ=255) aaTGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCACATTTATGTGTTGGCTTTTATGTATATTATTACTTATCTGTAGATTa > 2:5150514/1‑91 (MQ=255) aTGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCTGTAGATTAg > 1:3532345/1‑91 (MQ=255) aTGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCTGTAGATTAg > 1:4185165/1‑91 (MQ=255) aTGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCACATatgtgttggctttttgagtttaatcgcactgttaaagagcact < 2:362354‑M2/91‑44 (MQ=255) tGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCTGTAGATTAGc < 2:5013640/91‑1 (MQ=255) gCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCTGTAGATTAGCt < 1:957135/91‑1 (MQ=255) gCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCTGTAGATTAGCt > 1:1939886/1‑91 (MQ=255) cGATTAAACTCAAAAGGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTGTTACTTATCTGTAGATTAGCtt < 2:4475231/91‑1 (MQ=255) cGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCTGTAGATTAGCtt > 2:931068/1‑91 (MQ=255) aTTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCTGTAGATTAGCTtaa < 2:3967738/91‑1 (MQ=255) tAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCTGTAGATTAGCTtaagt < 1:1085683/91‑1 (MQ=255) tAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCTGTAGATTAGCTtaagt < 2:1428224/91‑1 (MQ=255) aaaCTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCTGTAGATTAGCTtaagta > 2:54135/1‑91 (MQ=255) aaaCTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCTGTAGATTAGCTtaagta < 1:299385/91‑1 (MQ=255) aaaCTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCTGTAGATTAGCTtaagta > 1:1717467/1‑91 (MQ=255) aaCTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCTGTAGATTAGCTtaagtaa > 1:5567263/1‑91 (MQ=255) tCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCTGTAGATTAGCTTAAGTAAGAt < 2:5269790/91‑1 (MQ=255) tCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCTGTAGATTAGCTTAAGTAAGAt < 2:2437955/91‑1 (MQ=255) cAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCTGTAGATTAGCTTAAGTAAGAtt > 2:3813019/1‑91 (MQ=255) aaaaaGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCTGTAGATTAGCTTAAGTAAGAttt > 1:880377/1‑91 (MQ=255) aaaaaGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCTGTAGATTAGCTTAAGTAAGAttt > 2:2824367/1‑91 (MQ=255) AAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCTGTAGATTAGCTTAAGTAAGATTTa < 1:2039877‑M1/91‑1 (MQ=255) AAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCTGTAGATTAGCTTAAGTAAGATTTa < 1:1029652‑M1/91‑1 (MQ=255) AAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCTGTAGATTAGCTTAAGTAAGATTTaaa > 1:2653745‑M1/1‑91 (MQ=255) AGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCTGTAGATTAGCTTAAGTAAGATTTAAAc < 1:2262570‑M1/91‑1 (MQ=255) AGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTAGTTATATTATGACTTATCTGTAGATTAGCTTAAGTAAGATTTAAAc > 2:5652370‑M1/1‑91 (MQ=255) gCCAACACATaaatggggatacgcccagaatgtgttggctttttgagtttaatcgcattgttaaagagcaattaaagtcaatttaaataag > 2:202599‑M1/1‑10 (MQ=255) ccAACACATaaatggggatacgcccagaatgtgttggctttttgagtttaatcgcattgttaaagagcaattaaagtcaatttaaataagt > 1:1932328‑M1/1‑9 (MQ=255) cAACACATaaatggggatacgcccagaatgtgttggctttttgagtttagtcgcattgttaaagagcaattaaagtcaatttaaataagtt < 2:2572948‑M1/91‑84 (MQ=255) cAACACATaaatggggatacgcccagaatgtgttggctttttgagtttaatcgcattgttaaagagcaattaaagtcaatttaaataagtt < 1:3666254‑M1/91‑84 (MQ=255) aaCACATaaatggggatacgcccagaatgtgttggctttttgagtttaatcgcattgttaaagagcaattaaagtcaatttaaataagtta > 1:818447‑M1/1‑7 (MQ=255) aaCACATaaatggggatacgcccagaatgtgttggctttttgagtttaatcgcattgttaaagagcaattaaagtcaatttaaataagtta > 1:5665388‑M1/1‑7 (MQ=255) AACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCTGTAGATTAGCTTAAGTAAGATTTAAACATcc > 1:371921‑M1/1‑91 (MQ=255) acacATaaatggggatacgcccagaatgtgttggctttttgagtttaatcgcattgttaaagagcaattaaagtcaatttaaataagttac > 1:4303040‑M1/1‑6 (MQ=255) acacATaaatggggatacgcccagaatgtgttggctttttgagtttaatcgcattgttaaagagcaattaaagtcaatttaaataagttac > 2:4208183‑M1/1‑6 (MQ=255) cacaTaaatggggatacgcccagaatgtgttggctttttgagtttaatcgcattgttaaagagcaattaaagtcaatttaaataagttact > 1:2898286‑M1/1‑5 (MQ=255) cacaTaaatggggatacgcccagaatgtgttggctttttgagtttaatcgcattgttaaagagcaattaaagtcaatttaaataagttact < 1:639932‑M1/91‑87 (MQ=255) cacaTaaatggggatacgcccagaatgtgttggctttttgagtttaatcgcattgttaaagagcaattaaagtcaatttaaataagttact < 1:1896074‑M1/91‑87 (MQ=255) cacaTaaatggggatacgcccagaatgtgttggctttttgagtttaatcgcattgttaaagagcaattaaagtcaatttaaataagttact < 2:1523248‑M1/91‑87 (MQ=255) ACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCTGTAGATTAGCTTAAGTAAGATTTAAACATCCAAt < 1:5391245‑M1/91‑1 (MQ=255) ACATTCTAGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTAGATTATTACTTATCTGTACATTAGCTTAAGTAAGACTTAAACATCCAAt > 1:4654546‑M1/1‑91 (MQ=255) caTaaatggggatacgcccagaatgtgttggctttttgagtttaatcgcattgttaaagagcaattaaagtcaatttaaataagttactct < 2:4050949‑M1/91‑89 (MQ=255) caTaaatggggatacgcccagaatgtgttggctttttgagtttaatcgcattgttaaagagcaattaaagtcaatttaaataagttactct > 1:3678659‑M1/1‑3 (MQ=255) taaatggggatacgcccagaatgtgttggctttttgagtttaatcgcattgttaaagagcaattaaagtcaatttaaataagttactctgc < 2:4113363‑M1/91‑91 (MQ=255) taaatggggatacgcccagaatgtgttggctttttgagtttaatcgcattgttaaagagcaattaaagtcaatttaaataagttactctgc > 1:1380536‑M1/1‑1 (MQ=255) TTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCTGTAGATTAGCTTAAGTAAGATTTAAACATCCAATTAt > 2:3214865‑M1/1‑91 (MQ=255) | TGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCTGTAGATTAGCTTAAGTAAGATTTAAACATCCAATTAT > USA300TCH1516_ALE/2256319‑2256499 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |