| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_012417 | 1975 = | NA (NA) | 133 (0.020) | 26/138 | NT | 5.3% | intergenic (+208/+118) | USA300HOU_RS14895/USA300HOU_RS14900 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| ? | NC_012417 | 2042 = | 2759 (0.270) | intergenic (+275/+51) | USA300HOU_RS14895/USA300HOU_RS14900 | hypothetical protein/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 7636 total aligned reads displayed.
TGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGA‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTC > NC_012417/1955‑2132 | cgttgagcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttag > 2:2925374‑M2/91‑91 (MQ=255)cgttgagcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttag > 1:588123‑M2/91‑91 (MQ=255)cgttgagcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttag > 1:4314078‑M2/91‑91 (MQ=255) gttgagcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGt < 2:5300571‑M2/2‑1 (MQ=255) gttgagcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGt > 1:3417687‑M2/90‑91 (MQ=255) gttgagcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGt > 2:1687671‑M2/90‑91 (MQ=255) gttgagcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGt > 1:249768‑M2/90‑91 (MQ=255) tgagcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTa < 1:4614712‑M2/4‑1 (MQ=255) tgagcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTa < 1:896023‑M2/4‑1 (MQ=255) gagcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTaa < 2:4384736‑M2/5‑1 (MQ=255) gagcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTaa > 1:677382‑M2/87‑91 (MQ=255) gagcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTaa < 2:2377450‑M2/5‑1 (MQ=255) agcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTAAg > 1:4806329‑M2/86‑91 (MQ=255) gcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatcgctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTAAgg < 2:5417421‑M2/7‑1 (MQ=255) gcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTAAgg < 2:1795892‑M2/7‑1 (MQ=255) gcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTAAgg < 1:566411‑M2/7‑1 (MQ=255) gcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTAAgg > 1:2902942‑M2/85‑91 (MQ=255) gcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTAAgg < 2:5538212‑M2/7‑1 (MQ=255) gcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTAAgg < 1:2103725‑M2/7‑1 (MQ=255) cctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTAAggg > 2:5064669‑M2/84‑91 (MQ=255) ctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTAAGGGt < 1:441316‑M2/9‑1 (MQ=255) ctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTAAGGGt < 1:3208805‑M2/9‑1 (MQ=255) ctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTAAGGGt > 2:4839788‑M2/83‑91 (MQ=255) ctcggaaccctgaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTAAGGGt < 2:5852621‑M2/9‑1 (MQ=255) tcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTAAGGGtt < 1:1500676‑M2/10‑1 (MQ=255) tcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTAAGGGtt < 2:1223666‑M2/10‑1 (MQ=255) cggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTAAGGGTTc > 1:3918493‑M2/81‑91 (MQ=255) cggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTAAGGGTTc < 1:3123633‑M2/11‑1 (MQ=255) cggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTAAGGGTTc < 2:1591037‑M2/11‑1 (MQ=255) ccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTAAGGGTTCCGAGGc > 1:369827‑M2/75‑91 (MQ=255) aatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGt > 2:2466875‑M2/68‑91 (MQ=255) atcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTc > 2:1003795‑M2/67‑91 (MQ=255) tcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgaCATTCGTCTGCAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAg > 1:4127523‑M2/36‑91 (MQ=255) ggtcggcttaatagctcacgctatgccgaCATTCGA‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGaa > 1:5048156‑M2/30‑91 (MQ=255) GCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGA‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGaataaa < 2:2586026‑M2/91‑1 (MQ=255) GCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGA‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGaataaa < 1:1403607‑M2/91‑1 (MQ=255) GCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGA‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGaataaa < 2:3655432‑M2/91‑1 (MQ=255) GCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGA‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGaataaa < 1:1803179‑M2/91‑1 (MQ=255) cttaatagctcacgctatgccgacCATTCGA‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGaataaat > 1:4937590‑M2/25‑91 (MQ=255) ATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGA‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGaataaata < 2:664082‑M2/91‑1 (MQ=255) ATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGA‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGaataaata < 2:427785‑M2/91‑1 (MQ=255) tagctcacgctatgccgacCATTCGA‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTAt > 1:240540‑M2/20‑91 (MQ=255) gTGAGCTATTGAGCCGACCATTCGA‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAGCGTCAATAAAACAATTGGAATAAATAGTATc < 1:5354119/91‑1 (MQ=255) gAGCTATTAAGCCGACCATTCGA‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTa > 2:2272137/1‑91 (MQ=40) gCTATTAAGCCGACCATTCGA‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTaaa < 2:5640788/91‑1 (MQ=255) cTATTAAGCCGACCATTCGA‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAg > 2:882442/1‑91 (MQ=255) cTATTAAGCCGACCATTCGA‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAg > 1:1712183/1‑91 (MQ=255) cTATTAAGCCGACCATTCGA‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAg > 2:4964947/1‑91 (MQ=255) tATTAAGCCGACCATTCGA‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGt < 2:4076314/91‑1 (MQ=255) aTTAAGCCGACCATTCGA‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTa > 2:3962768/1‑91 (MQ=255) ttAAGCCGACCATTCGA‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTaa > 2:1902543/1‑91 (MQ=255) ttAAGCCGACCATTCGA‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTaa > 2:771557/1‑91 (MQ=255) aaGCCGACCATTCGA‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAAcc < 2:38626/91‑1 (MQ=255) aaGCCGACCATTCGA‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAAcc < 1:1209582/91‑1 (MQ=255) aaGCCGACCATTCGA‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAAcc > 2:146224/1‑91 (MQ=255) aaGCCGACCATTCGA‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAAcc < 1:2716546/91‑1 (MQ=255) aaGCCGACCATTCGA‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAAcc > 2:2158205/1‑91 (MQ=255) aGCCGACCATTCGA‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAAccc < 1:1896934/91‑1 (MQ=255) aGCCGACCATTCGA‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAAccc < 2:3544709/91‑1 (MQ=255) ccGACCATTCGA‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGt < 2:4173892/91‑1 (MQ=255) cgtccATTCGA‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTa < 1:3508707/88‑1 (MQ=255) cGACCATTCGA‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTa < 2:4717469/91‑1 (MQ=255) gACCATTCGA‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTAt < 1:3793849/91‑1 (MQ=255) gACCATTCGA‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTAt > 1:2617953/1‑91 (MQ=255) gACCACTCGA‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAAGGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATATAAAGTAACCCGTAt > 2:5745037/1‑91 (MQ=255) ccATTCGA‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTAttt > 1:1315409/1‑91 (MQ=255) ccATTCGA‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTAttt > 1:4527615/1‑91 (MQ=255) ccATTCGA‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTAttt > 2:3021886/1‑91 (MQ=255) CATTCGA‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTa > 1:5155122‑M2/1‑91 (MQ=255) ATTCGA‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTaa > 2:1344293‑M2/1‑91 (MQ=255) ATTCGA‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTaa < 1:4023134‑M2/91‑1 (MQ=255) TTCGA‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAg < 2:2025522‑M2/91‑1 (MQ=255) TCGA‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGa < 1:78863‑M2/91‑1 (MQ=255) TCGA‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGa < 1:3597832‑M2/91‑1 (MQ=255) TCGA‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGa < 1:5472607‑M2/91‑1 (MQ=255) CGA‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGAt < 1:332338‑M2/91‑1 (MQ=255) CGA‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGAt < 2:375984‑M2/91‑1 (MQ=255) CGA‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGAt < 2:2696503‑M2/91‑1 (MQ=255) CGA‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGAt > 2:1108184‑M2/1‑91 (MQ=255) CGA‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGAt > 1:47091‑M2/1‑91 (MQ=255) GA‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGAtt < 1:2810261‑M2/91‑1 (MQ=255) GA‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGAtt < 1:4225597‑M2/91‑1 (MQ=255) a‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTa > 1:5768513/1‑91 (MQ=255) CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTTTACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAACGTAACCCGTATTTACGATTAc > 1:2222656‑M2/1‑91 (MQ=255) AAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACa < 1:111105‑M2/91‑1 (MQ=255) GTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACAtt > 1:1000246‑M2/1‑91 (MQ=255) TTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTg > 2:3219514‑M2/1‑91 (MQ=255) TTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTa < 2:3342920‑M2/91‑1 (MQ=255) tGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTAc > 1:5261121/1‑91 (MQ=255) tGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTAc < 1:5565155/91‑1 (MQ=255) gggATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACa > 2:449176/1‑91 (MQ=255) gggATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACa > 1:2303537/1‑91 (MQ=255) ggATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACAt < 2:3119665/91‑1 (MQ=255) ggATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACAt < 1:3011915/91‑1 (MQ=255) ttGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCt < 2:4616590/91‑1 (MQ=255) ttGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCt < 2:5193508/91‑1 (MQ=255) ttGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCt > 2:2825207/1‑91 (MQ=255) ttGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCt > 1:2009484/1‑91 (MQ=255) tGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCtt > 1:1608343/1‑91 (MQ=255) GTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTc > 2:343959‑M2/1‑91 (MQ=255) | TGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGA‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTC > NC_012417/1955‑2132 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |