New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_012417 | = 3069 | 631 (0.350) | 4 (0.000) | 4/246 | NT | 1.3% | intergenic (‑395/–) | USA300HOU_RS14900/– | hypothetical protein/– |
? | NC_012417 | = 3118 | 0 (0.000) | intergenic (‑444/–) | USA300HOU_RS14900/– | hypothetical protein/– | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 1840 total aligned reads displayed.
AATAACTCGATTTTATATATATAGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_012417/2978‑3125 | aaTAACTCGATTTTATATATATAGCTGTAACTTTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTc < 2:151269/141‑1 (MQ=255) aaTAACTCGATTTTATATATATAGCAGTAACTGTGTCTATTACAGTGTTTAAACGTGTCTTTGTGCGTGAAAGGAATATTTGACAATAAAAACCCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTc < 1:82007/141‑1 (MQ=255) tAACTCGATTTTATATATATAGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGACTCTTACATAATACTGCGGCTCtt < 1:155739‑M2/141‑3 (MQ=255) aaacTCGATTTTATATATATAGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTTAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCtt > 2:519676‑M2/2‑139 (MQ=255) aaCTCGATTTTATATATATAGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCttt < 1:276898‑M2/141‑4 (MQ=255) aCTCGATTTTATATATATAGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTTCTTTAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAATGTGTCGAATTTTAAATAATACTGAGTCTCtttt < 2:42658‑M2/141‑5 (MQ=255) aCTCGATTTTATATATATAGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTACGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCtttt < 1:425689‑M2/141‑5 (MQ=255) aCTCGATTTTATATATATAGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCtttt > 1:353237‑M2/1‑137 (MQ=255) aCTCGATTTTATATATATAGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCtttt < 2:277869‑M2/141‑5 (MQ=255) aCTCGATTTTATATATATAGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCtttt > 1:572540‑M2/1‑137 (MQ=255) cTCGATTTTATATATATAGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATCCTGGTGGTCttttt < 1:400887‑M2/141‑6 (MQ=255) cTCGATTTTATATATATAGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCttttt < 2:86130‑M2/141‑6 (MQ=255) cTCGATTTTATATATATAGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGGTCGTGGAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCttttt < 2:317903‑M2/141‑6 (MQ=255) ctattTTATATATATAGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCtttttat < 1:306073‑M2/139‑8 (MQ=255) gATTTTATATATATAGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTATACGTGTTTTTTTGCGTGACAGGAAAATTTGACAATACAAATCCCCAGTTATCTTAGTAAAGTGTCATATCATAAATAATCCAGGGGGTCttttttct < 2:399299‑M2/141‑9 (MQ=255) gATTTTATATATATAGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACATGTTTTTGTACGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATa < 2:391035‑M2/141‑2 (MQ=255) tttATATATATAGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCACAGTTATATTATTAAAGTGTCGAATCTTAAATAATACTGTGGGTCTTTTTATatgc < 2:127831‑M2/141‑5 (MQ=255) ttATATATATAGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATCCTGGGGGTCTTTTTATatgca < 1:562525‑M2/141‑6 (MQ=255) ttATATATATAGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATattgc > 2:197128‑M2/1‑136 (MQ=255) tatatatataGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaa < 2:640200‑M2/141‑7 (MQ=255) tatatatataGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGAGGTCTTATTATatgcaa < 2:34241‑M2/141‑7 (MQ=255) atatatataGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaat < 1:546567‑M2/141‑8 (MQ=255) tatatataGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaata < 1:605036‑M2/141‑9 (MQ=255) tatatataGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaata > 1:1448‑M2/1‑133 (MQ=255) tatatataGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGCGGTCTTTTTATatacaata < 2:260853‑M2/141‑9 (MQ=255) tatatataGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATAATGGGTGTCTTTTTATatgtaata < 2:528579‑M2/141‑9 (MQ=255) tatataGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatata > 1:360134‑M2/1‑131 (MQ=255) atataGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataa > 1:473054‑M2/1‑130 (MQ=255) ataGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCACAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataata > 2:138668‑M2/1‑128 (MQ=255) ataGCGGTAACTGTTGATAATACAGGGTTTAAAAGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAAATAAAAAAAAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataata > 2:563672‑M2/1‑128 (MQ=255) gCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatacta < 1:377278‑M2/141‑17 (MQ=255) cTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAGGACTGGGGGTCTTTTTACatgcaatataatactac > 1:94388‑M2/1‑124 (MQ=255) tGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactact < 1:263832‑M2/141‑19 (MQ=255) aaCTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactaga > 1:462196‑M2/1‑120 (MQ=255) aaCTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactaga > 2:368036‑M2/1‑120 (MQ=255) aCTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaa < 2:298786‑M2/141‑23 (MQ=255) tGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagt > 1:593747‑M2/1‑117 (MQ=255) tatTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataacc > 1:537811‑M2/1‑111 (MQ=255) atTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGTGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccg > 2:553284‑M2/1‑110 (MQ=255) atTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccg > 1:499348‑M2/1‑110 (MQ=255) cAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAACAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaa < 2:329620‑M2/141‑36 (MQ=255) cAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaca < 1:369475‑M2/141‑36 (MQ=255) cAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaa > 1:411891‑M2/1‑106 (MQ=255) tttAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTAACAATAAAATTCTCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaatcaag > 1:21266‑M2/1‑101 (MQ=255) ttAAATGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCTAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaatcaaga > 2:243337‑M2/1‑100 (MQ=255) ttAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaatcaaga < 1:488989‑M2/141‑42 (MQ=255) ttAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaatcaaga < 1:582661‑M2/141‑42 (MQ=255) aCGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaatcaagataat < 1:72003‑M2/141‑46 (MQ=255) cGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaatcaagataata > 1:510347‑M2/1‑95 (MQ=255) gtgtTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaatcaagataataa > 2:592050‑M2/1‑94 (MQ=255) tgtTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAAACCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaatcaagataataaa > 1:522472‑M2/1‑93 (MQ=255) tgtTTTAGAGCGTAAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACACACGACACTCTTTTAATGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaatcaagataataaa > 2:288834‑M2/1‑93 (MQ=255) tttGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaatcaagataataaaacgt > 1:20026‑M2/1‑89 (MQ=255) ttGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCAAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgaaatataatactactagaagtataaccaaaaatcaagataataaaacgtt < 2:376985‑M2/141‑54 (MQ=255) tgtgCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTAGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaatcaagataataaaacgtta < 2:468041‑M2/141‑55 (MQ=255) gtgCGTGAAAGGAAAAGTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaatcaagataataaaacgttaa > 1:322200‑M2/1‑86 (MQ=255) tgGGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaatcaagataataaaacgttaaa > 2:606393‑M2/1‑85 (MQ=255) gCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaatcaagataataaaacgttaaaa < 1:332153‑M2/141‑58 (MQ=255) aaaTTTGAAAAAAACTAATCCGTTTTTTATTACTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaatcaagataataaaacgataaaagctatgacgaa < 2:234198‑M2/141‑69 (MQ=255) aTTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataataatactagaaatataaccgaaaatcaagataataaaacgttaaaaaatataaagaaaa < 2:506923‑M2/141‑71 (MQ=255) tGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaatcaagataataaaacgttaaaagatatgacgaaaagtg > 2:357623‑M2/1‑68 (MQ=255) aCAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaatcaagataataaaacgttaaaagatatgacgaaaagtggg > 2:492348‑M2/1‑66 (MQ=255) aaaaCCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaatcaagataataaaacgttaaaagatatgacgaaaagtgggaaacaac > 1:284507‑M2/1‑59 (MQ=255) aaCGCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaatcaagataataaaacgttaaaagatatgacgaaaagtgggaaacaacgc > 1:221625‑M2/1‑57 (MQ=255) aaCCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaatcaagataataaaacgttaaaagatatgacgaaaagtgggaaacaacgc > 1:626422‑M2/1‑57 (MQ=255) aCCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaatcaagataataaaacgttaaaagatatgacgaaaagtgggaaacaacgcc > 2:310402‑M2/1‑56 (MQ=255) ccccAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaatcaagataataaaacgttaaaagatatgacgaaaagtgggaaacaacgccc < 1:11062‑M2/141‑87 (MQ=255) ccccAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaatcaagataataaaacgttaaaagatatgacgaaaagtgggaaacaacgccc < 1:555414‑M2/141‑87 (MQ=255) ccAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaatcaagataataaaacgttaaaagatatgacgaaaagtgggaaacaacgcccat > 2:167564‑M2/1‑53 (MQ=255) ccAGTTATATTATTAAGGTGTAGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaatcaagataataaaacgttaaaagatatgacgaaaagtgggaaacaacgccatg > 2:220786‑M2/1‑53 (MQ=255) ttATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaatcaagataataaaacgttaaaagatatgacgaaaagtgggaaacaacgcccgtggag < 1:189974‑M2/141‑93 (MQ=255) tattatTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaatcaagataataaaacgttaaaagatatgacgaaaagtgggaaacaacgcccatggagaga > 1:479744‑M2/1‑46 (MQ=255) ttattaAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaatcaagataataaaacgttaaaagatatgacgaaaagtgggaaacaacgcccatggagagaaa > 1:178830‑M2/1‑44 (MQ=255) ttattaAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaatcaagataataaaacgttaaaagatatgacgaaaagtgagaaacaacgcccatgaagagaaa < 2:630007‑M2/141‑98 (MQ=255) attaAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaatcaagataataaaacgttaaaagatatgacgaaaagtgggaaacaacgcccatggagagaaaag < 2:209778‑M2/141‑100 (MQ=255) taAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaatcaagataataaaacgttaaaagatatgacgaaaagtgggaaacaacgcccatggagagaaaagaa < 1:100229‑M2/141‑102 (MQ=255) taAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaatcaagataataaaacgttaaaagatatgacgaaaagtgggaaacaacgcccatggagagaaaagaa > 1:449365‑M2/1‑40 (MQ=255) taAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaatcaagataataaaacgttaaaagatatgacgaaaagtgggaaacaacgcccatgaagagacaagaa < 2:578478‑M2/141‑102 (MQ=255) aGGTGTCGAATATTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaaaataatactactagaagtataaccgaaaatcaagataataaaacgttaaaagatatgacgaaaagtgggaaacaacgcccatggagagaaaagaaaa > 2:413540‑M2/1‑38 (MQ=255) ggTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaatcaagataataaaacgttaaaagatatgacgaaaagtgggaaacaacgcccatggagagaaaagaaaat < 1:29373‑M2/141‑105 (MQ=255) agtgtcGAATATTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaatcaagataataaaacgttaaaagatatgacgaaaagtgggaaacaacgcccatggagagaaaagaaaat > 2:112736‑M2/2‑37 (MQ=255) tgtCGAATCTTAAATAATAGTGGGGGTCAATTTATattcaatataatactactagaagtataaacgaaaatcaagataataaaacgttaaaagatatgacgaaaagtgggaaacaacgcccatggagagaaaagaaaatag > 2:479044‑M2/1‑35 (MQ=255) tgtCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaatcaagataataaaacgttaaaagatatgacgaaaagtgggaaacaacgcccatggagagaaaagaaactag < 1:247113‑M2/141‑107 (MQ=255) tgtCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaatcaagataataaaacgttaaaagatatgacgaaaagtgggaaacaacgcccatggagagaaaagaaaatag < 2:621448‑M2/141‑107 (MQ=255) tgtCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaatcaagataataaaacgttaaaagatatgacgaaaagtgggaaacaacgcccatggagagaaaagaaaatag < 1:13580‑M2/141‑107 (MQ=255) gtCGAATCTTAAATAATACTGGTGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaatcaagataataaaacgttaaaagatatgacgaaaagtgggaaacaacgcccatggagagaaaagaaaataga > 2:179748‑M2/1‑34 (MQ=255) tCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTGTATatgcaagataatactactagaagtataaccgaaaatcaagataataaaacgttaacagatatgacgaaaagtgggaaacaacgcccatggagagaaaagaaaatagat > 2:441030‑M2/1‑33 (MQ=255) cGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTCTctgcgatctaatactactagaagtataaccgaaaatcaagttaataaaatgttaaaagatatgacgaaaagtgggaaacaacgcacatggagagaatagaaaatagata < 2:105394‑M2/141‑110 (MQ=255) aaTCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgcaaatcaagataataaaacgttgttagagaggacgaaaagtgggaaacaacgcccatggagagaaaagaaaatagataat < 1:121604‑M2/141‑112 (MQ=255) aaTCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaatcaagataataaaacgttaaaagatatgacgaaaagtgggaaacaacggccatggagagaaaagaaaatagataat > 2:45565‑M2/1‑30 (MQ=255) aaTCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaatcaagataataaaacgttaaaagatatgacgaaaagtgggaaacaacgcccatggagagaaaagaaaatagataat < 1:16660‑M2/141‑112 (MQ=255) ttAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaatcaagatagtaaaacgttaaaagatatgacgaaaagtgggaaacaacgcccatggagagaaaagaaaatagataatgtaa > 1:344362‑M2/1‑26 (MQ=255) tAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaatcaagataataaaacgttaaaagatatgacgaaaagtgggaaacaacgcccatggagagaaaagaaaatagataatgtaag > 1:237711‑M2/1‑25 (MQ=255) aataatACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaatcaagataataaaacgttaaaagatatgacgaaaagtgggaaacaacgcccatggagagaaaagaaaatagataatgtaagct > 1:640200‑M2/1‑23 (MQ=255) ataataCTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaatcaagataataaaacgttaaaagatatgacgaaaagtgggaaacaacgcccatggagagaaaagaaaatagataatgtaagcta < 1:440327‑M2/141‑120 (MQ=255) ataataCTGGGGGACTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaatcaagataataaaacgttaaaagatatgacgaaaagtggaaaacaacgcccatagaaagaaaagcaaataaataatataaggta < 2:54090‑M2/141‑120 (MQ=255) taataCTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaatcaagataataaaacgttaaaagatatgacgaaaagtgggaaacaacgcccatggagagaaaagaaaatagataatgtaagctat < 1:618201‑M2/141‑121 (MQ=255) taataCTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaatcaagataataaaacgttaaaagatatgacgaaaagtgggaaacaacgcccatggagagaaaagaaaatagataatgtaagctat < 1:3910‑M2/141‑121 (MQ=255) gggTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaatcaagataataaaacgttaaaagatatgacgaaaagtgggaaacaacgcccatggagagaaaagaaaatagataatgtaagctatgcagatata > 1:314084‑M2/1‑12 (MQ=255) ggTCTTTTTATatgcaatataatactagtagatggataaccgaaaatcaagataataaaacgttaaaagatatgacgaaaagtaggaaacaacgcccatgtagagaaaagaaaatagataatgtaagctatgcagatatac < 2:78361‑M2/141‑131 (MQ=255) | AATAACTCGATTTTATATATATAGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_012417/2978‑3125 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |