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tCTATG‑TATCCAAACTGGGGGCAATATA‑AACGCTCTGATTTAATCGGACAATCTTCTTATATTAAAAATAATGATGTCGTAATATTCAATGAAGCATTTGATAATGGTGCATCAGACAAATTATTAAGTAATGTGaaaaa < 2:218183/140‑1 (MQ=255) tCTATG‑TATCCAAACTGGGGGCAATATA‑AACGCGCTGATTTAATCGGACAATCTTCTTATATTAAAAATAATGATGTCGTAATATTCAATGAAGCATTTGATAATGGTGCATCAGACAAATTATTAAGTAATGTGaaaaa < 2:68050/140‑1 (MQ=255) cTAtgtatccaaactggagacttttaacataaaattacttatcattcaaaaagtaaaacagcataatatcaaggtttataactttatcattatcaataatacctcatataaaataaaattttagggactttttagggact < 2:209439‑M2/140‑138 (MQ=255) tATG‑TATCCAAACTGGGGGCAATATA‑AACGCGCTGATTTAATCGGACAATCTTCTTATATTAAAAATAATGATGTCGTAGTATTCAATGAAGCATTTGATAATGTTGCATCAGACATATTATTAGGTAAGTTGAAGAAAg > 1:282216/1‑140 (MQ=255) tATG‑TATCCAAACTGGGGGCAATATA‑AACGCGCTGATTTAATCGGACAATCTGCTTATATTAAAAATAATGATGTCGGAATATTCAATGTAGGATGTGATAATGGTGCATCAGACAAATTCTGAAGTAATGTGAAAAAAg > 1:110663/1‑140 (MQ=255) | CTACATCCGTGTATTCTCATTTGTTAGAAGAAAAATTTAATGAAGAGGACAAAAAAACAACTAAAATTTTAGAAAGTATGTAATTTAGGGACCCATTAGGGACTCCAAACCCAATAAATACTGTTGTTACAAGGTTTCTATG‑TATCCAAACTGGGGGCAATATA‑AACGCGCTGATTTAATCGGACAATCTTCTTATATTAAAAATAATGATGTCGTAATATTCAATGAAGCATTTGATAATGGTGCATCAGACAAATTATTAAGTAATGTGAAAAAAG > USA300TCH1516_ALE/2128204‑2128481 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |