| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 298069 = | 104 (0.920) | 5 (0.050) | 5/250 | 15.9 | 4.8% | intergenic (+208/‑220) | tarK/tarF_1 | Teichoic acid ribitol‑phosphate polymerase TarK/Teichoic acid glycerol‑phosphate transferase |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 298125 = | 101 (0.970) | intergenic (+264/‑164) | tarK/tarF_1 | Teichoic acid ribitol‑phosphate polymerase TarK/Teichoic acid glycerol‑phosphate transferase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 116 total aligned reads displayed.
TGATTTTTCATGCATAAGGCGATTCAATCAAAAGCAATCACCTTCCAACTGAATTGTCATTTTGTAAAATAAAATAATCGATCCAATCGTTATCTAATTCATAAATGTGTAAACACATACGTTATGAATGGATAACGATTTTTTGTTATGTTAAAGTGGTACATTAATCATGTATTTCGTATGATAATTAACGACAAGTGTAATGGTTAAATGTATTTTATGATGAAATGCTATAATAGGCATGGTTACAATGAGCTTGCTCATACATATTAATATAATTA > USA300TCH1516_ALE/297985‑298265 | tGATTTTTCATGCATAAGGCGATTCAATCAAAAGCAATCACCTTCCAACTGAATTGTCATTTTGTAAAATAAAATAATCGATCCAATCGTTATCTAATTCATAAATGTGTAAACACATACGTTATGAATGGATAACGAttt < 2:187235/141‑1 (MQ=255) gATTTTTCATGCATAAGGCGATTCAATCAAAAGCAATCACCTTCCAACTGAATTGTCATTTTGTAAAATAAAATAATCGATCCAATCGTTATCTAATTCATAAATGTGTAAACACATACGTTATGAATGGATAACGAtttt < 1:362989/141‑1 (MQ=255) ttttCATGCATAAGGCGATTCAATCAAAAGCAATCACCTTCCAACTGAATTGTCATTTTGTAAAATAAAATAATCGATCCAATCGTTATCTAATTCATAAATGTGTAAACACATACGTTATGAATGGATAACGATTGTTtg > 2:220212/1‑141 (MQ=255) tttCATGCATAAGGCGATTCAATCAAAAGCAATCACCTTCCAACTGAATTGTCATTTTGTAAAATAAAATAATCGATCCAATCGTTATCTAATTCATAAATGTGTAAACACATACGTTATGAATGGATAACGATTTTTtgt > 2:125085/1‑141 (MQ=255) tttCATGCATAAGGCGATTCAATCAAAAGCAATCACCTTCCAACTGAATTGTCATTTTGTAAAATAAAATAATCGATCCAATCGTTATCTAATTCATAAATGTGTAAACACATACGTTATGAATGGATAACGATTTTTtgt > 1:600106/1‑141 (MQ=255) tCATGCATAAGGCGATTCAATCAAAAGCAATCACCTTCCAACTGAATTGTCATTTTGTAAAATAAAATAATCGATCCAATCGTTATCTAATTCATAAATGTGTAAACACATACGTTATGAATGGATAACGATTTTTtgtta > 1:717227/1‑141 (MQ=255) aTGCATAAGGCGATTCAATCAAAAGCAATCACCTTCCAACTGAATTGTCATTTTGTAAAATAAAATAATCGATCCAATCGTTATCTAATTCATAAATGTGTAAACACATACGTTATGAATGGATAACGATTTTTtgttatg < 1:647585/141‑1 (MQ=255) tAAGGCGATTCAATCAAAAGCAATCACCTTCCAACTGAATTGTCATTTTGTAAAATAAAATAATCGATCCAATCGTTATCTAATTCATAAATGTGTAAACACATACGTTATGAATGGATAACGATTTTTTGTTATGTTaaa > 1:835863/1‑141 (MQ=255) ggCGATTCAATCAAAAGCAATCACCTTCCAACTGAATTGTCATTTTGTAAAATAAAATAATCGATCCAATCGTTATCTAATTCATAAATGTGTAAACACATACGTTATGAATGGATAACGATTTTTTGTTATGTTAAAGTg < 4:180580/141‑1 (MQ=255) gCGATTCAATCAAAAGCAATCGCCTGGCAACTGAATTGTCATTTTGTAAAATAAAATACTCGATCCAATCGTTATCTAATTCATAAATGTGTAAACACATACGTTATGAATGGATAACGATTTTTTGTTATGTTAAAGTgg < 4:15785/141‑1 (MQ=255) cGATTCAATCAAAAGCAATCACCTTCCAACTGAATTGTCATTTTGTAAAATAAAATAATCGATCCAATCGTTATCTAATTCATAAATGTGTAAACACATACGTTATGAATGGATAACGATTTTTTGTTATGTTAAAGTGGt < 2:812743/141‑1 (MQ=255) gATTCAATCAAAAGCAATCACCTTCCAACTGAATTGTCATTTTGTAAAATAAAATAATCGATCCAATCGTTATCTAATTCATAAATGTGTAAACACATACGTTATGAATGGATAACGATTTTTTGTTATGTTAAAGTGGTa > 2:47096/1‑141 (MQ=255) aTTCAATCAAAAGCAATCACCTTCCAACTGAATTGTCATTTTGTAAAATAAAATAATCGATCCAATCGTTATCTAATTCATAAATGTGTAAACACATACGTTATGAATGGATAACGATTTTTTGTTATGTTAAAGTGGTAc < 4:351497/141‑1 (MQ=255) ttCAATCAAAAGCAATCACCTTCCAACTGAATTGTCATTTTGTAAAATAAAATAATCGATCCAATCGTTATCTAATTCATAAATGTGTAAACACATACGTTATGAATGGATAACGATTTTTTGTTATGTTAAAGTGGTACa < 3:363869/141‑1 (MQ=255) ttCAATCAAAAGCAATCACCTTCCAACTGAATTGTCATTTTGTAAAATAAAATAATCGATCCAATCGTTATCTAATTCATAAATGTGTAAACACATACGTTATGAATGGATAACGATTTTTTGTTATGTTAAAGTGGTACa > 2:109712/1‑141 (MQ=255) tcaatcaaAAGCAATCACCTTCCAACTGAATTGTCATTTTGTAAAATAAAATAATCGATCCAATCGTTATCTAATTCATAAATGTGTAAACACATACGTTATGAATGGATAACGATTTTTTGTTATGTTAAAGTGGTACAt > 2:112207/1‑141 (MQ=255) atcaaAAGCAATCACCTTCCAACTGAATTGTCATTTTGTAAAATAAAATAATCGATCCAATCGTTATCTAATTCATAAATGTGTAAACACATACGTTATGAATGGATAACGATTTTTTGTTATGTTAAAGTGGTACATTaa < 2:835863/141‑1 (MQ=255) atcaaAAGCAATCACCTTCCAACTGAATTGTCATTTTGTAAAATAAAATAATCGATCCAATCGTTATCTAATTCATAAATGTGTAAACACATACGTTATGAATGGATAACGATTTTTTGTTATGTTAAAGTGGTACATTaa > 3:366083/1‑141 (MQ=255) tcaaAAGCAATCACCTTCCAACTGAATTGTCATTTTGTAAAATAAAATAATCGATCCAATCGTTATCTAATTCATAAATGTGTAAACACATACGTTATGAATGGATAACGATTTTTTGTTATGTTAAAGTGGTACATTAAt > 2:355860/1‑141 (MQ=255) aaGCAATCACCTTCCAACTGAATTGTCATTTTGTAAAATAAAATAATCCATCCAATCGTTATCTAATTCATAAATGTGTAAACACATACGTTATGAATGGATAACGATTTTTTGTTATGTTAAAGTGGTACATTAATCATg < 3:392846/141‑1 (MQ=255) aGCAATCACCTTCCAACTGAATTGTCATTTTGTAAAATAAAATAATCGATCCAATCGTTATCTAATTCATAAATGTGTAAACACATACGTTATGAATGGATAACGATTTTTTGTTATGTTAAAGTGGTACATTAATCATGt < 2:648780/141‑1 (MQ=255) cAATCACCTTCCAACTGAATTGTCATTTTGTAAAATAAAATAATCGATCCAATCGTTATCTAATTCATAAATGTGTAAACACATACGTTATGAATGGATAACGATTTTTTGTTATGTTAAAGTGGTACATTAATCATGTAt < 1:22600/141‑1 (MQ=255) aTCACCTTCCAACTGAATTGTCATTTTGTAAAATAAAATAATCGATCCAATCGTTATCTAATTCATAAATGTGTAAACACATACGTTATGAATGGATAACGATTTTTTGTTATGTTAAAGTGGTACATTAATCATGTAttt > 2:786816/1‑141 (MQ=255) tCACCTTCCAACTGTATTGTCATTTTGTAAAATAAAATAATCGATCCAATCGTTATCTAATTCATAAATGTGTAAACACATACGTTATGAATGGATAACGATTTTTTGTTATGTTAAAGTGGTACATTAATCATGTATTTc < 2:257020/141‑1 (MQ=255) tCACCTTCCAACTGAATTGTCATTTTGTAAAATAAAATAATCGATCCAATCGTTATCTAATTCATAAATGTGTAAACACATACGTTATGAATGGATAACGATTTTTTGTTATGTTAAAGTGGTACATTAATCATGTATTTc < 4:382915/141‑1 (MQ=255) cACCTTCCAACTGAATTGTCATTTTGTAAAATAAAATAATCGATCCAATCGTTATCTAATTCATAAATGTGTAAACACATACGTTATGAATGGATAACGATTTTTTGTTATGTTAAAGTGGTACATTAATCATGTATTTCg < 2:656581/141‑1 (MQ=255) cACCTTCCAACTGAATTGTCATTTTGTAAAATAAAATAATCGATCCAATCGTTATCTAATTCATAAATGTGTAAACACATACGTTATGAATGGATAACGATTTTTTGTTATGTTAAAGTGGTACATTAATCATGTATTTCg > 1:583405/1‑141 (MQ=255) cACCTTCCAACTGAATTGTCATTTTGTAAAATAAAATAATCGATCCAATCGTTATCTAATTCATAAATGTGTAAACACATACGTTATGAATGGATAACGATTTTTTGTTATGTTAAAGTGGTACATTAATCATGTATTTCg > 2:588137/1‑141 (MQ=255) aCCTTCCAACTGAATTGTCATTTTGTAAAATAAAATAATCGATCCAATCGTTATCTAATTCATAAATGTGTAAACACATACGTTATGAATGGATAACGATTTTTTGTTATGTTAAAGTGGTACATTAATCATGTATTTCGt > 1:645556/1‑141 (MQ=255) aCCTTCCAACTGAATTGTCATTTTGTAAAATAAAATAATCGAGCCAATCGTTATCTAATTCATAAATGTGTAAACACATACGTTATGAATGGATAACGATTTTTTGTTATGTTAAAGTGTTACATTAATCATGTATTTCGt < 1:6812/141‑1 (MQ=255) aCCTTCCAACTGAAATGTCATTTTGTAAAATAAAATAATCGATCCAATCGTTATCTAATTCATAAATGTGTAAACACATACGGTATGAATGGATAACGATTTTTTGTTATGTTACCGTGGTACATTATTCATGTATTTCGt > 4:224891/1‑141 (MQ=255) cTTCCAACTGAATTGTCATTTTGTAAAATAAAATAATCGATCCAATCGTTATCTAATTCATAAGTGTGTAAACACATACGTTATGAATGGATAACGATTTTTTGTTATGTTAAAGTGGTACATTAATCATGTATTTCGTAt < 1:100696/141‑1 (MQ=255) cTTCCAACTGAATTGTCATTTTGTAAAATAAAATAATCGATCCAATCGTTATCTAATTCATAAATGTGTAAACACATACGTTATGAATGGATAACGATTTTTTGTTATGTTAAAGTGGTACATTAATCATGTATTTCGTAt < 1:854933/141‑1 (MQ=255) ttCCAACTGAATTGTCATTTTGTAAAATAAAATAATCGATCCAATCGTTATCTAATTCATAAATGTGTAAACACATACGTTATGAATGGATAACGATTTTTTGTTATGTTAAAGTGGTACATTAATCATGTATTTCGTATg > 2:195062/1‑141 (MQ=255) ttCCAACTGAATTGTCATTTTGTAAAATAAAATAATCGATCCAATCGTTATCTAATTCATAAATGTGTAAACACATACGTTATGAATGGATAACGATTTTTTGTTATGTTAAAGTGGTACATTAATCATGTATTTCGTATg < 2:349839/141‑1 (MQ=255) aCTGAATTGTCATTTTGTAAAATAAAATACTCGATCCAATCGTTATCTAATTCATAAATGTGTAAACACATACGTTATGAATGGATAACGATTTTTTGTTATGTTAAAGTGGTACATTAATCATGTATTTCGTATGATAAt < 1:433981/141‑1 (MQ=255) aCTGAATTGTCATTTTGTAAAATAAAATAATCGATCCAATCGTTATCTAATTCATAAATGTGTAAACACATACGTTATGAATGGATAACGATTTTTTGTTATGTTAAAGTGGTACATTAATCATGTATTTCGTATGATAAt < 3:55958/141‑1 (MQ=255) tGAATTGTCATTGTGTAAAATAAAATAATCGATCCAATCGTTATCTAATTCATAAATGTGTAAGCACATACGTTATGGATGGATAACGATTTTTTGTTATGTTAAAGTGGTACATTATTCATGTATTTCGTATGATAATTa < 2:381599/141‑1 (MQ=255) gAATTGTCATTTTGTAAAATAAAATAATCGATCCAATCGTTATCTAATTCATAAATGTGTAAACACATACGTTATGAATGGATAACGATTTTTTGTTATGTTAAAGTGGTACATTAATCATGTATTTCGTATGATAATTaa < 1:257645/141‑1 (MQ=255) gAATTGTCATTTTGTAAAATAAAATAATCGATCCAATCGTTATCTAATTCATAAATGTGTAAACACATACGTTATGAATGGATAACGATTTTTTGTTATGTTAAAGTGGTACATTAATCATGTATTTCGTATGATAATTaa > 2:238725/1‑141 (MQ=255) aaTTGTCATTTTGTAAAATAAAATAATCGATCCAATCGTTATCTAATTCATAAATGTGTAAACACATACGTTATGAATGGATAACGATTTTTTGTTATGTTAAAGTGGTACATTAATCATGTATTTCGTATGATAATTAAc > 2:45548/1‑141 (MQ=255) tGTCATTTTGTAAAATAAAATAATCGATCCAATCGTTATCTAATTCATAAATGTGTAAACACATACGTTATGAATGGATAACGATTTTTTGTTATGTTAAAGTGGTACATTAATCATGTATTTCGTATGATAATTAACGAc < 1:125085/141‑1 (MQ=255) tGTCATTTTGTAAAATAAAATAATCGATCCAATCGTTATCTAATTCATAAATGTGTAAACACATACGTTATGAATGGATAACGATTTTTTGTTATGTTAAAGTGGTACATTAATCATGTATTTCGTATGATAATTAACGAc < 2:214326/141‑1 (MQ=255) gTCATTTTGTAAAATAAAATAATCGATCCAATCGTTATCTAATTCATAAATGTGTAAACACATACGATATGAAAGGATAACGAATTTTTGTTAAGTTAAAGTGGTAAATTAATCATCTATTTAGTATGATAAATAAAGaaa > 1:274287/1‑139 (MQ=255) aTTTTGTAAAATAAAATAATCGATCCAATCGTTATCTAATTCATAAATGTGTAAACACATACGTTATGAATGGATAACGATTTTTTGTTATGTTAAAGTGGTACATTAATCATGTATTTCGTATGATAATTAACGACAAgt < 1:189771/141‑1 (MQ=255) tGTAAAATAAAATAATCGATCCAATCGTTATCTAATTCATAAATGTGTAAACACATACGTTATGAATGGATAACGATTTTTTGTTATGTTAAAGTGGTACATTAATCATGTATTTCGTATGATAATTAACGACAAGTGTaa < 4:398761/141‑1 (MQ=255) aaataaaataATCGATCCAATCGTTATCTAATTCATAAATGTGTAAACACATACGTTATGAATGGATAACGATTTTTTGTTATGTTAAAGTGGTACATTAATCATGTATTTCGTATGATAATTAACGACAAGTGTAATGGt > 1:166477/1‑141 (MQ=255) aaataaaataATCGATCCAATCGTTATCTAATTCATAAATGTGTAAACACATACGTTATGAATGGATAACGATTTTTTGTTATGTTAAAGTGGTACATTAATCATGTATTTCGTATGATAATTAACGACAAGTGTAATGGt < 2:83082/141‑1 (MQ=255) aataaaataaTCGATCCAATCGTTATCTAATTCATAAATGTGTAAACACATACGTTATGAATGGATAACGATTTTTTGTTATGTTAAAGTGGTACATTAATCATGTATTTCGTATGATAATTAACGACAAGTGTAATGGtt > 4:211230/1‑141 (MQ=255) ataaaataaTCGATCCAATCGTTATCTAATTCATAAATGTGTAAAAACATACGTTATGAATGGATCACGATTTTTTGTTATGTTAAAGTGGTACATTAATCATGTATTTCGTATGATAATTAAAGACAAGTGTAATGGTTa > 2:283130/1‑141 (MQ=255) taaaataaTCGATCCAATCGTTATCTAATTCATAAATGTGTAAACACATACGTTATGAATGGATAACGATTTTTTGTTATGTTAAAGTGGTACATTAATCATGTATTTCGTATGATAATTAACGACAAGTGTAATGGTTaa < 3:152927/141‑1 (MQ=255) aaaataaTCGATCCAATCGTTATCTAATTCATAAATGTGTAAACACATACGTTATGAATGGATAACGATTTTTTGTTATGTTAAAGTGGTACATTAATCATGTATTTCGTATGATAATTAACGACAAGTGTAATGGTTaaa < 4:150219/141‑1 (MQ=255) aaataaTCGATCCAATCGTTATCTAATTCATAAATGTGTAAACACATACGTTATGAATGGATAACGATTTTTTGTTATGTTAAAGTGGTACATTAATCATGTATTTCGTATGATAATTAACGACAAGTGTAATGGTTAAAt < 2:436086/141‑1 (MQ=255) aataatCGATCCAATCGTTATCTAATTCATAAATGTGTAAACACATACGTTATGAATGGATAACGATTTTTTGTTATGTTAAAGTGGTACATTAATCATGTATGTCGTATGATAATTAACGACAAGTGTAATGGTTAAATg < 1:664327/141‑1 (MQ=255) ataatCGATCCAATCGTTATCTAATTCATAAATGTGTAAACACATACGTTATGAATGGATAACGATTTTTTGTTATGTTAAAGTGGTACATTAATCATGTATTTCGTATGATAATTAACGACAAGTGTAATGGTTAAATGt > 1:19375/1‑141 (MQ=255) tctaTCCACTCCTTATCTAATTAATAAATGTGTAAACACATACGTTAAGAATGGATAACTATTTTTTGTTATGCTAAAGTGGTACATTAATCATGTATCTCGTATCATAATTAACGACAAGTGTAATGGTTAAATGTAttt < 1:791064/138‑1 (MQ=255) aaTCGTTATCTAATTCATAAATGTGTAAACACATACGTTATGAATGGATAACGATTTTTTGTTATGTTAAAGTGGTACATTAATCATGTATTTCGTATGATAATTAACGACAAGTGTAATGGTTAAATGTATTTTatgatg < 1:588137/141‑1 (MQ=255) aaTCGTTATCTAATTCATAAATGTGTAAACACATACGTTATGAATGGATAACGATTTTTTGTTATGTTAAAGTGGTACATTAATCATGTATTTCGTATGATAATTAACGACAAGTGTAATGGTTAAATGTATTTTatgatg < 1:47096/141‑1 (MQ=255) aTCGTTATCTAATTCATAAATGTGTAAACACATACGTTATGAATGGATAACGATTTTTTGTTATGTTAAAGTGGTACATTAATCATGTATTTCGTATGATAATTAACGACAAGTGTAATGGTTAAATGTATTTTAtgatga > 3:83504/1‑141 (MQ=255) tctttATCTAATTCATAAACGTGTAGAGACGTGCGGGGGAAACCGATATCCATTTCGTCTTATATTAAAGGGGTACATTAATCATGTATTTCGTATGATAATTAACGACAAGTGTAATGGTTAAATGTATTTTATGATGaa < 1:547278/138‑1 (MQ=255) tCGTTATCTAATTCATAAATGTGTAAACACATACGTTATGAATGGATAACGATTTTTTGTTATGTTAAAGTGGTACATTAATCATGTATTTCGTATGATAATTAACGACAAGTGTAATGGTTAAATGTATTTTATGATGaa < 4:222181/141‑1 (MQ=255) tttATCTAATTCATAAATGTGTAAACACATACGTTATGAATGGATAACGATTTTTTGTTATGTTAAAGTGGTACATTAATCATGTATTTCGTATGATAATTAACGACAAGTGTAATGGTTAAATGTATTTTATGATGAAAt < 2:207101/140‑1 (MQ=255) ttATCTAATTCATAAATGTGTAAACACATACGTTATGAATGGATAACGATTTTTTGTTATGTTAAAGTGGTACATTAATCATGTATTTCGTATGATAATTAACGACAAGTGTAATGGTTAAATGTATTTTATGATGAAATg < 3:375603/141‑1 (MQ=255) ttATCTAATTCATAAATGTGTAAACACATACGTTATGAATGGATAACGATTTTTTGTTATGTTAAAGTGGTACATTAATCATGTATTTCGTATGATAATTAACGACAAGTGTAATGGTTAAATGTATTTTATGATGAAATg < 1:219672/141‑1 (MQ=255) ttATCTAATTCATAAATGTGTAAAAACATACGTTATGAATGGATAACGATTTTTTGTTATGTTAAAGTGGTACATTAATCATGTATTTCGTATGATAATTAACGACAAGTGTAATGGTTAAATGTATTTTATGATGAAATg < 2:307813/141‑1 (MQ=255) aTCTAATTCATAAATGTGCAAATACCGAAGTGATGAAAGGATGACGATTTTTTGTGATGTTAAAGTAGTACATTAATCATGTATTTCGTATGATAATTAACGACAACTGTATTGGTTAAATGTATTTTATTATGAAATgtt < 4:186419/141‑3 (MQ=255) cTAATTCATAAATGTGTAAACACATACGTTATGAATGGATAACGATTTTTTGTTATGTTAAAGTGGTACATTAATCATGTATTTCGTATGATAATTAACGACAAGTGTAATGGTTAAATGTATTTTATGATGAAATGCtat < 2:183993/141‑1 (MQ=255) cTAATTCATAAATGTGTAAACACATACGTTATGAATGGATAACGATTTTTTGTTATGTTAAAGTGGTACATTAATCATGTATTTCGTATGATAATTAACGACAAGTGTAATGGTTAAATGTATTTTATGATGAAATGCtat > 4:203223/1‑141 (MQ=255) aaTTCATAAATGTGTAAACACATACGTTATGAATGGATAACGATTTTTTGTTATGTTAAAGTGGTACATTAATCATGTATTTCGTATGATAATTAACGACAAGTGTAATGGTTAAATGTATTTTATGATGAAATGCTataa < 4:83504/141‑1 (MQ=255) ttCATAAATGTGTAAACACATACGTTATGAATGGATAACGATTTTTTGTTATGTTAAAGTGGTACATTAATCATGTATTTCGTATGATAATTAACGACAAGTGTAATGGTTAAATGTATTTTATGATGAAATGCTataata < 2:330077/141‑1 (MQ=255) ttCATAAATGTGTAAACACATACGTTATGAATGGATAACGATTTTTTGTTATGTTAAAGTGGTACATTAATCATGTATTTCGTATGATAATTAACGACAAGTGTAATGGTTAAATGTATTTTATGATGAAATGCTataata < 2:799232/141‑1 (MQ=255) tCATAAATGTGTAAACACATACGTTATTAATGGATGACGATGTTTTGTTATGGTACAGTGGTACATTACTCATGTATTTCGTATGATAATTAACGACAAGTGTAATGGTTAAATGTATTTTATGATGAAATGCTgtaatcg < 4:393164/141‑3 (MQ=255) tAAATGTGTAAACACATACGTTATGAATGGATAACGATTTTTTGTTATGTTAAAGTGGTACATTAATCATGTATTTCGTATGATAATTAACGACAAGTGTAATGGTTAAATGTATTTTATGATGAAATGCTATAATAGGCa > 2:210335/1‑141 (MQ=255) tAAATGTGTAAACACATACGTTATGAATGGATAACGATTTTTTGTTATGTTAAAGTGGTACATTAATCATGTATTTCGTATGATAATTAACGACAAGTGTAATGGTTAAATGTATTTTATGATGAAATGCTATAATAGGCa < 1:911847/141‑1 (MQ=255) gtAAACACATACGTTATGAATGGATAACGATTTTTTGTTATGTTAAAGTGGTACATTAATCATGTATTTCGTATGATAATTAACGACAAGTGTAATGGTTAAATGTATTTTATGATGAAATGCTATAATAGGCATGGTTAc < 2:513838/141‑1 (MQ=255) tAAACACATACGTTATGAATGGATAACGATTTTTTGTTATGTTAAAGTGGTACATTAATCATGTATTTCGTATGATAATTAACGACAAGTGTAATGGTTAAATGTATTTTATGATGAAATGCTATAATAGGCATGGTTACa < 3:103729/141‑1 (MQ=255) tAAACACATACGTTATGAATGGATAACGATTTTTTGTTATGTTAAAGTGGTACATTAATCATGTATTTCGTATGATAATTAACGACAAGTGTAATGGTTAAATGTATTTTATGATGAAATGCTATAATAGGCATGGTTACa > 2:675055/1‑141 (MQ=255) tAAACACATACGTTATGAATGGATAACGATTTTTTGTTATGTTAAAGTGGTACATTAATCATGTATTTCGTATGATAATTAACGACAAGTGTAATGGTTAAATGTATTTTATGATGAAATGCTATAATAGGCATGGTTACa < 2:269490/141‑1 (MQ=255) aaaCACATACGTTATGAATGGATAACGATTTTTTGTTCTGTCTGATTGGTACATTAATCATGTATTTCGTATGATAATTAACGACAAGTGTAATGGTTAAATGTATTTTATGATGAAATGCTATAATAGGCATGGTTACaa > 3:290286/1‑141 (MQ=255) aaCACATACGTTATGAATGGATAACGATTTTTTGTTATGTTAAAGTGGTACATTAATCATGTATTTCGTATGATAATTAACGACAAGTGTAATGGTTAAATGTATTTTATGATGAAATGCTCTAATAGGCATGGTTACAAt > 1:50314/1‑141 (MQ=255) caTACGTTATGAATGGATAACGATTTTTTGTTATGTTAAAGTGGTACATTAATCATGTATTTCGTATGATAATTAACGACAAGTGTAATGGTTAAATGTATTTTATGATGAAATGCTATAATAGGCATGGTTACAATGAGc < 2:343230/141‑1 (MQ=255) aaTACTTTAAGAATGGATAACGATATTTTGTTATGGTAAAGTGGTACATTAATCATGTATTTCGTATTATAATTAACGACAAGTGTAATGATTAAATTTATTTTATGATGAAATGCTATAATAGTCATGGTTACAATGAGc < 2:74981/140‑1 (MQ=255) cGTTATGAATGGATAACGATTTTTTGTTATGTTAAAGTGGTACATTAATCATGTATTTCGTATGATAATTAACGACAAGTGTAATGGTTAAATGTATTTTATGATGAAATGCTATAATAGGCATGGTTACAATGAGcaagc < 3:125946/141‑5 (MQ=255) gAATGGATAACGATTTTTTGTTATGTTAAAGTGGTACATTAATCATGTATTTCGTATGATAATTAACGACAAGTGTAATGGTTAAATGTATTTTATGATGAAATGCTATAATAGGCATGGTTACAATGAGCTTGCTcatac < 4:119725/141‑1 (MQ=255) gAATGGATAACGATTTTTTGTTATGTTAAAGTGGTACATTAATCATGTATTTCGTATGATAATTAACGACAAGTGTAATGGTTAAATGTATTTTATGATGAAATGCTATAATAGGCATGGTTACAATGAGCTTGCTcatac > 2:221589/1‑141 (MQ=255) ggATAACGATTTTTTTTTTTGTTTAAGTGGTACATTAATCATGTATTTCGTATGATAATTAACGACAAGTGTAATGGTTAAATGTATTTTATGATGAAATGCTATAATAGGCATGGTTACAATGAGCTTGCTCATACatat > 2:305507/1‑141 (MQ=255) ataagtaTTTTTTTTTAATTTAAAGTGGTACATTAATCATGTATTTCGTATAATAAATAACTACAAGTATAATGGTTAAATTTATTTTATGATAAAATGCAATAATAGGCATGGTTACAATGAGCTTGCTCATACATATTa < 4:261911/135‑1 (MQ=255) aTAACGATTTTTTGTTATGTTAAAGTGGTACATTAATCATGTATTTCGTATGATAATTAACGACAAGTGTAATGGTTAAATGTATTTTATGATGAAATGCTATAATAGGCATGGTTACAATGAGCTTGCTCATACATATTa > 1:26856/1‑141 (MQ=255) aTAACGATTTTTTGTTATGTTAAAGTGGTACATTAATCATGTATTTCGTATGATAATTAACGACAAGTGTAATGGTTAAATGTATTTTATGATGAAATGCTATAATAGGCATGGTTACAATGAGCTTGCTCATACATATTa < 2:19375/141‑1 (MQ=255) aCGATTTTTTGTTATGTTAAAGTGGTACATTAATCATGTATTTCGTATGATAATTAACGACAAGTGTAATGGTTAAATGTATTTTATGATGAAATGCTATAATAGGCATGGTTACAATGAGCTTGCTCATACATATTAata > 3:335456/1‑141 (MQ=255) aCGATTTTTTGTTATGTTAAAGTGGTACATTAATCATGTATTTCGTATGATAATTAACGACAAGTGTAATGGTTAAATGTATTTTATGATGAAATGCTATAATAGGCATGGTTACAATGAGCTTGCTCATACATATTAata < 2:599983/141‑1 (MQ=255) aCGATTTTTTGTTATGTTAAAGTGGTACATTAATCATGTATTTCGTATGATAATTAACGACAAGTGTAATGGTTAAATGTATTTTATGATGAAATGCTATAATAGGCATGGTTACAATGAGCTTGCTCATACATATTAata < 2:600106/141‑1 (MQ=255) gATTTTTTGTTATGTTAAAGTGGTACATTAATCATGTATTTCGTATGATAATTAACGACAAGTGTAATGGTTAAATGTATTTTATGATGAAATGCTATAATAGGCATGGTTACAATGAGCTTGCTCATACATATTAAtata < 3:87557/141‑1 (MQ=255) aTTTTTTTTTATTTTAAAGTGGTACATTAATCATGTATTTCGTATGATAATTAACGACAAGTGTAATGGTTAAATGTATTTTATGATGAAATGCTATAATAGGCATGGTTACAATGAGCTTGCTCATACATATTAATATaa > 4:282712/1‑141 (MQ=255) aTTTTTTGTTATGTTAAAGTGGTACATTAATCATGTATTTCGTATGATAATTAACGACAAGTGTAATGGTTAAATGTATTTTATGATGAAATGCTATAATAGGCATGGTTACAATGAGCTTGCTCATACATATTAATATaa < 2:206330/141‑1 (MQ=255) aTTTTTTGTTATGTTAAAGTGGTACATTAATCATGTATTTCGTATGATAATTAACGACAAGTGTAATGGTTAAATGTATTTTATGATGAAATGCTATAATAGGCATGGTTACAATGAGCTTGCTCATACATATTAATATaa < 4:76773/141‑1 (MQ=255) ttttttGTTATGTTAAAGTGGTACATTAATCATGTATTTCGTATGATAATTAACGACAAGTGTAATGGTTAAATGTATTTTATGATGAAATGCTATAATAGGCATGGTTACAATGAGCTTGCTCATACATATTaaaaaaaa < 4:125638/141‑7 (MQ=255) ttttttGTTATGTTAAAGTGGTACATTAATCATGTATTTCGTATGATAATTAACGACAAGTGTAATGGTTAAATGTATTTTATGATGAAATGCTATAATAGGCATGGTTACAATGAGCTTGCTCATACATATTAATATAAt < 1:537619/141‑1 (MQ=255) ttttGTTATGTTAAAGTGGTACATTAATCATGTATTTCGTATGATAATTAACGACAAGTGTAATGGTTAAATGTATTTTATGATGAAATGCTATAATAGGCATGGTTACAATGAGCTTGCTCATACATATTAATATAATTa < 3:167751/141‑1 (MQ=255) ttttGTTATGTTAAAGTGGTACATTAATCATGTATTTCGTATGATAATTAACGACAAGTGTAATGGTTAAATGTATTTTATGATGAAATGCTATAATAGGCATGGTTACAATGAGCTTGCTCATACATATTAATATAATTa > 1:310047/1‑141 (MQ=255) | TGATTTTTCATGCATAAGGCGATTCAATCAAAAGCAATCACCTTCCAACTGAATTGTCATTTTGTAAAATAAAATAATCGATCCAATCGTTATCTAATTCATAAATGTGTAAACACATACGTTATGAATGGATAACGATTTTTTGTTATGTTAAAGTGGTACATTAATCATGTATTTCGTATGATAATTAACGACAAGTGTAATGGTTAAATGTATTTTATGATGAAATGCTATAATAGGCATGGTTACAATGAGCTTGCTCATACATATTAATATAATTA > USA300TCH1516_ALE/297985‑298265 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |