| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 1205029 = | 279 (0.780) | 14 (0.040) | 6/148 | NT | 5.2% | coding (91/195 nt) | USA300HOU_RS15290 | hypothetical protein |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 1427013 | NA (NA) | intergenic (‑744/+228) | pstS/cvfB | Phosphate‑binding protein PstS/Conserved virulence factor B | |||||
Only 100 of 403 total aligned reads displayed.
GGGACATTAAGTTCTTAGGCAATGTAAAAAGCTGATTTCTATTAATTATTTGATAGAAATCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAATTGCCATTAATACAAAACCTAGCTCTCGTTTAACTTTATTTATTCCTCGAACTGACAT > USA300TCH1516_ALE/1204939‑1205119 | gggtttcactcgaatgtcagttcgaggaataaataaagttaaacgagagctaggttttgtattaatggcacttaatataaggaaaatagca < 2:1067121‑M1/2‑1 (MQ=255) gggtttcactcgaatgtcagttcgaggaataaataaagttaaacgagagctaggttttgtattaatggcacttaatataaggaaaatagca < 2:2665599‑M1/2‑1 (MQ=255) ggtttcactcgaatgtcagttcgaggaataaataaagttaaacgggagctaggttttgtattaatggcacttaatataaggaaaatagcag > 1:6591860‑M1/89‑91 (MQ=255) ggtttcactcgaatgtcagttcgaggaataaataaagttaaacgagagctaggttttgtattaatggcacttaatataaggaaaatagcag > 2:843756‑M1/89‑91 (MQ=255) ggtttcactcgaatgtcagttcgaggaataaataaagttaaacgagagctaggttttgtattaatggcacttaatataaggaaaatagcag > 1:5185343‑M1/89‑91 (MQ=255) ggtttcactcgaatgtcagttcgaggaataaataaagttaaacgagagctaggttttgtattaatggcacttaatataaggaaaatagcag < 2:5678303‑M1/3‑1 (MQ=255) ggtttcactcgaatgtcagttcgaggaataaataaagttaaacgagagctaggttttgtattaatggcacttaatataaggaaaatagcag > 2:5055639‑M1/89‑91 (MQ=255) gACATTAAGTTCTTAGGCAATGTAAAAAGCTGATTTCTATTAATTATTTGATAGAAATCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTAcgg < 2:1168017/91‑3 (MQ=25) gACATTAAGTTCTTAGGCAATGTAAAAAGCTGATTTCTATTAATTATTTGATAGAAATCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAg < 1:4106180/91‑1 (MQ=35) gtttcactcgaatgtcagttcgaggaataaataaagttaaacgagagctaggttttgtattaatggcacttaatataaggaaaatagcagc < 1:4336665‑M1/4‑1 (MQ=255) cATTAAGTTCTTAGGCAATGTAAAAAGCTGATTTCTATTAATTATTTGATAGAAATCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCt < 1:3371491/91‑1 (MQ=35) cATTAAGTTCTTAGGCAATGTAAAAAGCTGATTTCTATTAATTATTTGATAGAAATCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCt > 1:2700293/1‑91 (MQ=35) ttcactcgaatgtcagttcgaggaataaataaagttaaacgagagctaggttttgtattaatggcacttaatataaggaaaatagCAGCTc < 2:5870326‑M1/6‑1 (MQ=255) ttAAGTTCTTAGGCAATGTAAAAAGCTGATTTCTATTAATTATTTGATAGAAATCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATCATGTACAGCTCg > 2:4474116/1‑91 (MQ=25) ttAAGTTCTTAGGCAATGTAAAAAGCTGATTTCTATTAATTATTTGATAGAAATCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCg > 2:90388/1‑91 (MQ=35) ttAAGTTCTTAGGCAATGTAAAAAGCTGATTTCTATTAATTATTTGATAGAAATCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCg > 2:2584578/1‑91 (MQ=35) tAAGTTCTTAGGCAATGTAAAAAGCTGATTTCTATTAATTATTTGATAGAAATCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTcaa < 1:5573557/91‑3 (MQ=25) tAAGTTCTTAGGCAATGTAAAAAGCTGATTTCTATTAATTATTTGATAGAAATCAGCTTTTTTGATATGTATTGTATAATGTACAGCTCGt < 1:5302963/91‑1 (MQ=25) aaGTTCTTAGGCAATGTAAAAAGCTGATTTCTATTAATTATTTGATAGAAATCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGtt > 1:4426880/1‑91 (MQ=35) ctcgaatgtcagttcgaggaataaataaagttaaacgagagctaggttttgtattaatggcaattaatataaggaaaatagCAGCTCGTTg > 2:5457749‑M1/82‑91 (MQ=255) aGTTCTTAGGCAATGTAAAAAGCTGATTTCTATTAATTATTTGATAGAAATCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTg > 2:1524014/1‑91 (MQ=35) tcgaacgtcagttcgaggaataaataaagttaaacgagagctaggttttgtattaatggcacttaatataaggaaaatagCAGCTCGTTGa > 1:3153663‑M1/81‑91 (MQ=255) ttCTTAGGCAATGTAAAAAGCTGATTTCTATTAATTATTTGATAGAAATCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAg < 2:416235/91‑1 (MQ=35) gaatgtcagttcgaggaataaataaagttaaacgagagctaggttttgtattaatggcacttaatataaggaaaatagCAGCTCGTTGAgc > 1:5461444‑M1/79‑91 (MQ=255) cTTAGGCAATGTAAAAAGCTGATTTCTATTAATTATTTGATAGAAATCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAgct < 1:2402644/91‑1 (MQ=35) cTTAGGCAATGTAAAAAGCTGATTTCTATTAATTATTTGATAGAAATCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAgct > 2:3209173/1‑91 (MQ=35) ttAGGCAATGTAAAAAGCTGATTTCTATTAATTATTTGATAGAAATCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAgctg > 1:3427579/1‑91 (MQ=35) ttAGGCAATGTAAAAAGCTGATTTCTATTAATTATTTGATAGAAATCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAgctg > 2:2379005/1‑91 (MQ=35) ttAGGCAATGTAAAAAGCTGATTTCTATTAATTATTTGATAGAAATCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAgctg < 1:5646930/91‑1 (MQ=35) tgtcagttcgaggaataaataaagttaaacgagagctaggttttgtattgatggcacttaatataaggaaaatagCAGCTCGTTGAgctgc > 2:4553087‑M1/76‑91 (MQ=255) tAGGCAATGTAAAAAGCTGATTTCTATTAATTATTTGATAGAAATCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAgctgc < 1:3503218/91‑1 (MQ=35) aGGCAATGTAAAAAGCTGATTTCTATTAATTATTTGATAGAAATCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAgctgct < 2:2304930/91‑1 (MQ=35) ggCAATGTAAAAAGCTGATTTCTATTAATTATTTGATAGAAATCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTa < 1:2154862/91‑1 (MQ=35) ggCAATGTAAAAAGCTGATTTCTATTAATTATTTGATAGAAATCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTa > 1:5406566/1‑91 (MQ=35) gCAATGTAAAAAGCTGATTTCTATTAATTATTTGATAGAAATCAGCTTTTTTGATATGTATTATATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTAt < 2:6688791/91‑1 (MQ=25) aaTGTAAAAAGCTGATTTCTATTAATTATTTGATAGAAATCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTAttt < 1:4789358/91‑1 (MQ=35) tGTAAAAAGCTGATTTCTATTAATTATTTGATAGAAATCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTc > 1:3726313/1‑91 (MQ=33) tGTAAAAAGCTGATTTCTATTAATTATTTGATAGAAATCAGATTTTTTTATTTTTATTTTATAAAGTACAGCTCGTTCAGCTACTAttttt > 2:6489368/1‑90 (MQ=11) gTAAAAAGCTGATTTCTATTAATTATTTGATAGAAATCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTcc > 1:3025789/1‑91 (MQ=32) gATTTCTATTAATTATTTGATAGAAATCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAAt < 1:5954832/91‑1 (MQ=31) aTTTCTATTAATTATTTGATAGAAATCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAAtt > 2:6256736/1‑91 (MQ=32) tttCTATTAATTATTTGATAGAAATCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAATTg < 1:1882886/91‑1 (MQ=33) ttCTATTAATTATTTGATAGAAATCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAATTGc > 2:6619765/1‑91 (MQ=33) cTATTAATTATTTGATAGAAATCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAATTGCCa < 2:1606360/91‑1 (MQ=34) cTATTAATTATTTGATAGAAATCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAATTGCCa < 1:4306570/91‑1 (MQ=34) attaattaTTTGATAGAAATCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAATTGCCAtt < 1:6021885/91‑1 (MQ=34) attaattaTTTGATAGAAATCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAATTGCCAtt < 1:6669759/91‑1 (MQ=34) ttaattaTTTGATAGAAATCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAATTGCCATTa > 1:1156655/1‑91 (MQ=34) taattaTTTGATAGAAATCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAATTGCCATTaa > 2:4930873/1‑91 (MQ=33) aattaTTTGATAGAAATCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAATTGCCATTAAt > 2:4347150/1‑91 (MQ=34) attattTGATAGAAATCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAATTGCCATTAATa < 1:2000368/91‑1 (MQ=34) ttattTGATAGAAATCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAATTGCCATTAATAc > 1:1187126/1‑91 (MQ=34) ttattTGATAGAAATCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAATTGCCATTAATAc > 2:2468452/1‑91 (MQ=34) ttattTGATAGAAATCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAATTGCCATTAATAc > 1:4579150/1‑91 (MQ=34) tattTGATAGAAATCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAATTGCCATTAATACa > 1:2432730/1‑91 (MQ=34) tttGATAGAAATCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAATTGCCATTAATACaaa > 1:6896109/1‑91 (MQ=34) tttGATAGAAATCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAATTGCCATTAATACaaa < 2:3414840/91‑1 (MQ=34) tGATAGAAATCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAATTGCCATTAATACAAAAc > 1:4022151/1‑91 (MQ=34) ctaggttttgtattaatggcacttaatataaggaaaatagCAGCTCAACGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAAGTGCCATTAATACAAAAc < 2:4075393‑M1/51‑1 (MQ=255) aTAGAAATCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAATTGCCATTAATACAAAACCt < 1:67726/91‑1 (MQ=34) tAGAAATCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATGATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAATTGCCATTAATACAAAACCTa > 1:2073796/1‑91 (MQ=21) aGAAATCAGCTTTTTTTATTTTTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAATTGCCATTAATACAAAACCTAg > 2:6048509/1‑91 (MQ=255) aGAAATCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAATTGCCATTAATACAAAACCTAg > 2:1299074/1‑91 (MQ=33) aaaTCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAATTGCCATTAATACAAAACCTAGct < 2:185786/91‑1 (MQ=34) aaaTCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAATTGCCATTAATACAAAACCTAGct > 1:1389355/1‑91 (MQ=34) aaaTCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAATTGCCATTAATACAAAACCTAGct < 1:785426/91‑1 (MQ=34) aaTCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAATTGCCATTAATACAAAACCTAGctc > 2:5284904/1‑91 (MQ=33) aaTCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAATTGCCATTAATACAAAACCTAGctc < 2:4609786/91‑1 (MQ=33) aGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACTGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAATTGCCATTAATACAAAACCTAGCTCTCGt < 2:6927070/91‑1 (MQ=255) aGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAATTGCCATTAATACAAAACCTAGCTCTCGt < 2:5435616/91‑1 (MQ=34) aGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAATTGCCATTAATACAAAACCTAGCTCTCGt > 1:6388270/1‑91 (MQ=34) cTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAATTGCCATTAATACAAAACCTAGCTCTCGttt < 1:1026927/91‑1 (MQ=34) tttttGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAATTGCCATTAATACAAAACCTAGCTCTCGTTTaa > 1:6179992/1‑91 (MQ=33) tttttGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAATTGCCATTAATACAAAACCTAGCTCTCGTTTaa > 2:1117056/1‑91 (MQ=33) tttttGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAATTGCCATTAATACAAAACCTAGCTCTCGTTTaa > 2:3543056/1‑91 (MQ=34) tttttGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAATTGCCATTAATACAAAACCTAGCTCTCGTTTaa > 1:1448076/1‑91 (MQ=34) ttttGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAATTGCCATTAATACAAAACCTAGCTCTCGTTTAAc < 1:1710916/91‑1 (MQ=34) ttGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAATTGCCATTAATACAAAACCTAGCTCTCGTTTAACtt < 2:1920846/91‑1 (MQ=34) ttGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAATTGCCATTAATACAAAACCTAGCTCTCGTTTAACtt < 1:221427/91‑1 (MQ=34) ttGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAATTGCCATTAATACAAAACCTAGCTCTCGTTTAACtt > 1:5689968/1‑91 (MQ=34) ttGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAATTGCCATTAATACAAAACCTAGCTCTCGTTTAACtt < 1:3609729/91‑1 (MQ=34) tGATATGTATTCTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAATTGCCATTAATACAAAACCTAGCTCTCGTTTAACttt < 2:4135817/91‑1 (MQ=18) gATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAATTGCCATTAATACAAAACCTAGCTCTCGTTTAACttta > 2:364617/1‑91 (MQ=34) tGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAATTGCCATTAATACAAAACCTAGCTCTCGTTTAACtttattta < 1:1276029/91‑1 (MQ=34) gTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTCATTGCCATTAATACAAAACCTAGCTCTCGTTTAACTttatttat < 2:6796343/91‑1 (MQ=21) tATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAATTGCCATTAATACAAAACCTAGCTCTCGTTTAACTTtatttatt > 2:3322403/1‑91 (MQ=34) aTTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAATTGCCATTAATACAAAACCTAGCTCTCGTTTAACTTTATTTATTc > 2:2694282/1‑91 (MQ=34) ttttATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAATTGCCATTAATACAAAACCTAGCTCTCGTTTAACTTTATTTATTcc > 1:2761095/1‑91 (MQ=34) tttATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAATTGCCATTAATACAAAACCTAGCTCTCGTTTAACTTTATTTATTCCt < 2:6305000/91‑1 (MQ=34) tttATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAATTGCCATTAATACAAAACCTAGCTCTCGTTTAACTTTATTTATTCCt < 1:4599532/91‑1 (MQ=33) tttATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAATTGCCATTAATACAAAACCTAGCTCTCGTTTAACTTTATTTATTCCt > 1:502895/1‑91 (MQ=34) ttATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAATTGCCATTAATACAAAACCTAGCTCTCGTTTAACTTTATTTATTCCTc < 2:3836704/91‑1 (MQ=34) ataATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAATTGCCATTAATACAAAACCTAGCTCTCGTTTAACTTTATTTATTCCTCGa > 1:3849315/1‑91 (MQ=34) ataATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAATTGCCATTAATACAAAACCTAGCTCTCGTTTAACTTTATTTATTCCTCGa > 1:2976863/1‑91 (MQ=34) ataATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAATTGCCATTAATACAAAACCTAGCTCTCGTTTAACTTTATTTATTCCTCGa < 2:4388956/91‑1 (MQ=34) ataATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAATTGCCATTAATACAAAACCTAGCTCTCGTTTAACTTTATTTATTCCTCGa > 1:612727/1‑91 (MQ=34) aTGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAATTGCCATTAATACAAAACCTAGCTCTCGTTTAACTTTATTTATTCCTCGAACt > 1:4188529/1‑91 (MQ=34) gTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAATTGCCATTAATACAAAACCTAGCTCTCGTTTAACTTTATTTATTCCTCGAACTGa < 2:2196456/91‑1 (MQ=34) gTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAATTGCCATTAATACAAAACCTAGCTCTCGTTTAACTTTATTTATTCCTCGAACTGa > 2:2976989/1‑91 (MQ=34) gTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAATTGCCATTAATACAAAACCTAGCTCTCGTTTAACTTTATTTATTCCTCGAACTGa > 2:3703300/1‑91 (MQ=34) | GGGACATTAAGTTCTTAGGCAATGTAAAAAGCTGATTTCTATTAATTATTTGATAGAAATCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAATTGCCATTAATACAAAACCTAGCTCTCGTTTAACTTTATTTATTCCTCGAACTGACAT > USA300TCH1516_ALE/1204939‑1205119 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |