| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 1430185 = | 323 (0.900) | 15 (0.050) | 9/140 | NT | 5.6% | intergenic (+294/‑566) | ybiT/lysC | putative ABC transporter ATP‑binding protein YbiT/Aspartokinase |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 1430212 = | 228 (0.730) | intergenic (+321/‑539) | ybiT/lysC | putative ABC transporter ATP‑binding protein YbiT/Aspartokinase | |||||
Only 100 of 417 total aligned reads displayed.
AGTCAACTACTGTCAATATAACATTGCAGGGCCTAGGGCATTGATTCATGTCCGAGACTATATTCAATTTAATAGACATTAACTGGGCGTCTCGATGCTA‑ATATTTATAGCATCGAGGTGTCCTTTTTATTTTATTTTTTAACACATCAGCATAGTGAACACCCCTTCTCTAAATTACAAA > USA300TCH1516_ALE/1430095‑1430275 | actcttttaatgcgttgataactgtatttgtaatttagagaaggggtgttcactatgctgatgtgttaaaaaataaaataaaaaggacacc < 1:1583640‑M1/1‑1 (MQ=255)actcttttaatgcgttgataactgtatttgtaatttagagaaggggtgttcactatgctgatgtgttaaaaaataaaataaaaaggacacc < 1:2952416‑M1/1‑1 (MQ=255) gTCAACTACTGTCAATATAACATTGCAGGGCCTAGGGCATTGATTCATGTCCGAGACTATATTCAATTTAATAGACATTAACTGGGCGtct > 2:3946434/1‑91 (MQ=255) ctcttttaatgcgttgataactgtatttgtaatttagggaaggggtgttcactatgctgatgtgttaaaaaataaaataaaaaggacacc < 1:1010556‑M1/1‑1 (MQ=255) ctcttttaatgcgttgataactgtatttgtaatttagagaaggggtgttcactatgctgatgtgttaaaaaataaaataaaaaggacacCt < 1:312939‑M1/2‑1 (MQ=255) ctcttttaatgcgttgataactgtatttgtaatttagagaaggggtgttcactatgctgatgtgttaaaaaataaaataaaaaggacacCt > 2:1094220‑M1/90‑91 (MQ=255) tttaatgcgttgataactgtatttgtaatttagagaaggggtgttcactatgctgatgtgttaaaaaataaaataaaaaggacacCTCGAt < 1:457804‑M1/6‑1 (MQ=255) ctactGTCAATATAACATTGCAGGGCCTAGGGCATTGATTCATGTCCGAGACTATATTCAATTTAATAGACATTAACTGGGCGTCTCGATg < 1:1235974/91‑1 (MQ=255) tactGTCAATATAACATTGCAGGGCCTAGGGCATTGATTCATGTCCGAGACTATATTCAATTTAATAGACATTAACTGGGCGTCTCGATGc > 2:6914073/1‑91 (MQ=255) taatgcgttgataactgtatttgtaatttagagaaggggtgttcactatgctgatgtgttaaaaaataaaataaaaaggacacCTCGATGc < 2:611617‑M1/8‑1 (MQ=255) taatgcgttgataactgtatttgtaatttagagaaggggtgttcactatgctgatgtgttaaaaaataaaataaaaaggacacCTCGATGc < 2:4812830‑M1/8‑1 (MQ=255) actGTCAATATAACATTGCAGGGCCTAGGGCATTGATTCATGTCCGAGACTATATTCAATTTAATAGACATTAACTGGGCGTCTCGATGCt < 2:3988986/91‑1 (MQ=255) actGTCAATATAACATTGCAGGGCCTAGGGCATTGATTCATGTCCGAGACTATATTCAATTTAATAGACATTAACTGGGCGTCTCGATGCt < 2:3235164/91‑1 (MQ=255) aatgcgttgataactgtatttgtaatttagagaaggggtgttcactatgctgatgtgttaaaaaataaaataaaaaggacacCTCGATGCt > 2:4220109‑M1/83‑91 (MQ=255) aatgcgttgataactgtatttgtaatttagagaaggggtgttcactatgctgatgtgttaaaaaataaaagaaaaaggacacCTCGATGCt > 1:6385039‑M1/83‑91 (MQ=255) ctGTCAATATAACATTGCAGGGCCTAGGGCATTGATTCATGTCCGAGACTATATTCAATTTAATAGACATTAACTGGGCGTCTCGATGCTa < 2:2292604/91‑1 (MQ=255) ctGTCAATATAACATTGCAGGGCCTAGGGCATTGATTCATGTCCGAGACTATATTCAATTTAATAGACATTAACTGGGCGTCTCGATGCTa > 1:993348/1‑91 (MQ=255) ctGTCAATATAACATTGCAGGGCCTAGGGCATTGATTCATGTCCGAGACTATATTCAATTTAATAGACATTAACTGGGCGTCTCGATGCTa > 1:1712104/1‑91 (MQ=255) atgcgttgataactgtatttgtaatttagagaaggggtgttcactatgctgatgtgttaaaaaataaaataaaaaggacacCTCGATGCTa < 2:835431‑M1/10‑1 (MQ=255) atgcgttgataactgtatttgtaatttagagaaggggtgttcactatgctgatgtgttaaaaaataaaataaaaaggacacCTCGATGCTa > 1:2807168‑M1/82‑91 (MQ=255) atgcgttgataactgtatttgtaatttagagaaggggtgttcactatgctgatgtgttaaaaaataaaataaaaaggacacCTCGATGCTa > 2:2859851‑M1/82‑91 (MQ=255) atgcgttgataactgtatttgtaatttagagaaggggtgttcactatgctgatgtgttaaaaaataaaataaaaaggacacCTCGATGCTa > 2:6162805‑M1/82‑91 (MQ=255) gTCAATATAACATTGCAGGGCCTAGGGCATTGATTCATGTCCGAGACTATATTCAATTTAATAGACATTAACTGGGCGTCTCGATGCTA‑at > 1:3775514/1‑91 (MQ=255) gTCAATATAACATTGCAGGGCCTAGGGCATTGATTCATGTCCGAGACTATATTCAATTTAATAGACATTAACTGGGCGTCTCGATGCTA‑at > 1:603308/1‑91 (MQ=255) aaTATAACATTGCAGGGCCTAGGGCATTGATTCATGTCCGAGACTATATTCAATTTAATAGACATTAACTGGGCGTCTCGATGCTA‑ATAtt < 1:2309135/91‑1 (MQ=255) ataactgtatttgtaatttagagaaggggtgttcactatgctgatgtgttaaaaaataaaataaaaaggacacCTCGATGCTA‑ATATTtat > 1:3797272‑M1/74‑91 (MQ=255) ataactgtatttgtaatttagagaaggggtgttcactatgctgatgtgttaaaaaataaaataaaaaggacacCTCGATGCTA‑ATATTtat > 1:781017‑M1/74‑91 (MQ=255) ataactgtatttgtaatttagagaaggggtgttcactatgctgatgtgttaaaaaataaaataaaaaggacacCTCGATGCTA‑ATATTtat > 1:6808650‑M1/74‑91 (MQ=255) ataACATTGCAGGGCCTAGGGCATTGATTCATGTCCGAGACTATATTCAATTTAATAGACATTAACTGGGCGTCTCGATGCTA‑ATATTtat < 2:1274137/91‑1 (MQ=255) ataACATTGCAGGGCCTAGGGCATTGATTCATGTCCGAGACTATATTCAATTTAATAGACATTAACTGGGCGTCTCGATGCTA‑ATATTtat < 2:5304144/91‑1 (MQ=255) ataACATTGCAGGGCCTAGGGCATTGATTCATGTCCGAGACTATATTCAATTTAATAGACATTAACTGGGCGTCTCGATGCTA‑ATATTtat < 1:1494008/91‑1 (MQ=255) aaCATTGCAGGGCCTAGGGCATTGATTCATGTCCGAGACTATATTCAATTTAATAGACATTAACTGGGCGTCTCGATGCTA‑ATATTTATAg > 1:4765781/1‑91 (MQ=255) actgtatttgtaatttagagaaggggtgttcactatgctgatgtgttaaaaaataaaataaaaaggacacCTCGATGCTA‑ATATTTATAGc > 1:828404‑M1/71‑91 (MQ=255) cATTGCAGGGCCTAGGGCATTGATTCATGTCCGAGACTATATTCAATTTAATAGACATTAACTGGGCGTCTCGATGCTA‑ATATTTATAGCa < 1:5017022/91‑1 (MQ=255) cATTGCAGGGCCTAGGGCATTGATTCATGTCCGAGACTATATTCAATTTAATAGACATTAACTGGGCGTCTCGATGCTA‑ATATTTATAGCa > 2:742234/1‑91 (MQ=255) cATTGCAGGGCCTAGGGCATTGATTCATGTCCGAGACTATATTCAATTTAATAGACATTAACTGGGCGTCTCGATGCTA‑ATATTTATAGCa > 2:4327958/1‑91 (MQ=255) ttGCAGGGCCTAGGGCATTGATTCATGTCCGAGACTATATTCAATTTAATAGACATTAACTGGGCGTCTCGATGCTA‑ATATTTATAGCATc > 1:2117577/1‑91 (MQ=255) tGCAGGGCCTAGGGCATTGATTCATGTCCGAGACTATATTCAATTTAATAGACATTAACTGGGCGTCTCGATGCTa‑a > 1:3636329/1‑77 (MQ=255) ggCCTAGGGCATTGATTCATGTCCGAGACTATATTCAATTTAATAGACATTAACTGGGCGTCTCGATGCTA‑ATATTTATAGCATCGAGgtg < 2:1854771/91‑1 (MQ=255) ggCCTAGGGCATTGATTCATGTCCGAGACTATATTCAATTTAATAGACATTAACTGGGCGTCTCGATGCTA‑ATATTTATAGCATCGAGgtg > 1:263623/1‑91 (MQ=255) gCCTAGGGCATTGATTCATGTCCGAGACTATATTCAATTTAATAGACATTAACTGGGCGTCTCGATGCTA‑ATATTTATAGCATCGAGgtgt < 1:2238015/91‑1 (MQ=255) ccTAGGGCATTGATTCATGTCCGAGACTATATTCAATTTAATAGACATTAACTGGGCGTCTCGATGCTA‑ATATTTATAGCATCGAGGTGTc > 1:611617/1‑91 (MQ=255) gggCATTGATTCATGTCCGAGACTATATTCAATTTAATAGACATTAACTGGGCGTCTCGATGCTA‑ATATTTATAGCATCGAGGTGTCCttt > 2:3615111/1‑91 (MQ=255) gggCATTGATTCATGTCCGAGACTATATTCAATTTAATAGACATTAACTGGGCGTCTCGATGCTA‑ATATTTATAGCATCGAGGTGTCCttt > 2:3363480/1‑91 (MQ=255) aTTGATTCATGTCCGAGACTATATTCAATTTAATAGACATTAACTGGGCGTCTCGATGCTA‑ATATTTATAGCATCGAGGTGTCCTttttat < 1:5941651/91‑1 (MQ=255) aTTGATTCATGTCCGAGACTATATTCAATTTAATAGACATTAACTGGGCGTCTCGATGCTA‑ATATTTATAGCATCGAGGTGTCCTttttat > 2:7005831/1‑91 (MQ=255) ttGATTCATGTCCGAGACTATATTCAATTTAATAGACATTAACTGGGCGTCTCGATGCTA‑ATATTTATAGCATCGAGGTGTCCTttttatt < 2:2100810/91‑1 (MQ=255) ttGATTCATGTCCGAGACTATATTCAATTTAATAGACATTAACTGGGCGTCTCGATGCTA‑ATATTTATAGCATCGAGGTGTCCTttttatt > 2:1777344/1‑91 (MQ=255) tGATTCATGTCCGAGACTATATTCAATTTAATAGACATTAACTGGGCGTCTCGATGCTA‑ATATTTATAGCATCGAGGTGTCCTttttattt < 2:3775514/91‑1 (MQ=255) gATTCATGTCCGAGACTATATTCAATTTAATAGACATTAACTGGGCGTCTCGATGCTA‑ATATTTATAGCATCGAGGTGTCCTttttatttt < 2:1515402/91‑1 (MQ=255) aTTCATGTCCGAGACTATATTCAATTTAATAGACATTAACTGGGCGTCTCGATGCTA‑ATATTTATAGCATCGAGGTGTCCTttttattttt > 2:6287767/1‑90 (MQ=255) tCATGTCCGAGACTATATTCAATTTAATAGACATTAACTGGGCGTCTCGATGCTA‑ATATTTATAGCATCGAGGTGTCCTTTttattttatt < 2:2621603/91‑1 (MQ=255) cATGTCCGAGACTATATTCAATTTAATAGACATTAACTGGGCGTCTCGATGCTA‑ATATTTATAGCATCGAGGTGTCCTTTTtattttattt < 2:5435820/91‑1 (MQ=255) aTGTCCGAGACTATATTCAATTTAATAGACATTAACTGGGCGTATCGATGCTA‑ATATTTATAGCATCGAGGTGTCCTTTTTattttatttt > 1:4486617/1‑91 (MQ=255) tGTCCGAGACTATATTCAATTTAATAGACATTAACTGGGCGTCTCGATGCTA‑ATATTTATAGCATCGAGGTGTCCTTTTTATTTTAttttt > 2:3009851/1‑91 (MQ=255) gTCCGAGACTATATTCAATTTAATAGACATTAACTGGGCGTCTCGATGCTA‑ATATTTATAGCATCGAGGTGTCCTTTTTATTTTAtttttt < 2:603308/91‑1 (MQ=255) gTCCGAGACTATATTCAATTTAATAGACATTAACTGGGCGTCTCGATGCTA‑ATATTTATAGCATCGAGGTGTCCTTTTTATTTTAtttttt > 1:1874525/1‑91 (MQ=255) gTCCGAGACTATATTCAATTTAATAGACATTAAATGGGCGTCTCGATGCTA‑ATATTTATAGCATCGAGGTGTCCTTTTTATTTTAtttttt > 1:6950000/1‑91 (MQ=255) tCCGAGACTATATTCAATTTAATAGACATTAACTGGGCGTCTCGATGCTA‑ATATTTATAGCATCGAGGTGTCCTTTTTATTTTATTTTTTa < 1:5911810/91‑1 (MQ=255) ccGAGACTATATTCAATTTAATAGACATTAACTGGGCGTCTCGATGCTA‑ATATTTATAGCATCGAGGTGTCCTTTTTATTTTATTTTTTaa < 1:1058445/91‑1 (MQ=255) cGAGACTATATTCAATTTAATAGACATTAACTGGGCGTCTCGATGCTA‑ATATTTATAGCATCGAGGTGTCCTTTTTATTTTATTTTTTAac > 1:399189/1‑91 (MQ=255) cGAGACTATATTCAATTTAATAGACATTAACTGGGCGTCTCGATGCTA‑ATATTTATAGCATCGAGGTGTCCTTTTTATTTTATTTTTTAac > 1:3579075/1‑91 (MQ=255) agaCTATATTCAATTTAATAGACATTAACTGGGCGTCTCGATGCTA‑ATATTTATAGCATCGAGGTGTCCTTTTTATTTTATTTTTTAacac > 2:2225191/1‑91 (MQ=255) agaCTATATTCAATTTAATAGACATTAACTGGGCGTCTCGATGCTA‑ATATTTATAGCATCGAGGTGTCCTTTTTATTTTATTTTTTAacac < 2:5188492/91‑1 (MQ=255) agaCTATATTCAATTTAATAGACATTAACTGGGCGTCTCGATGCTA‑ATATTTATAGCATCGAGGTGTCCTTTTTATTTTATTTTTTAacac > 2:2168862/1‑91 (MQ=255) cTATATTCAATTTAATAGACATTAACTGGGCGTCTCGATGCTA‑ATATTTATAGCATCGAGGTGTCCTTTTTATTTTATTTTTTAACACATc < 2:4735491/91‑1 (MQ=255) atatTCAATTTAATAGACATTAACTGGGCGTCTCGATGCTA‑ATATTTATAGCATCGAGGTGTCCTTTTTATTTTATTTTTTAACACATCAg < 2:4532938/91‑1 (MQ=255) atatTCAATTTAATAGACATTAACTGGGCGTCTCGATGCTA‑ATATTTATAGCATCGAGGTGTCCTTTTTATTTTATTTTTTAACACATCAg > 2:6469695/1‑91 (MQ=255) atatTCAATTTAATAGACATTAACTGGGCGTCTCGATGCTA‑ATATTTATAGCATCGAGGTGTCCTTTTTATTTTATTTTTTAACACATCAg < 1:6482630/91‑1 (MQ=255) ttCAATTTAATAGACATTAACTGGGCGTCTCGATGCTA‑ATATTTATAGCATCGAGGTGTCCTTTTTATTTTATTTTTTAACACATCAGCAt < 2:2726288/91‑1 (MQ=255) cAATTTAATAGACATTAACTGGGCGTCTCGATGCTA‑ATATTTATAGCATCGAGGTGTCCTTTTTATTTTATTTTTTAACACATCAGCATAg < 1:2389289/91‑1 (MQ=255) aaTTTAATAGACATTAACTGGGCGTCTCGATGCTA‑ATATTTATAGCATCGAGGTGTCCTTTTTATTTTATTTTTTAACACATCAGCATAGt < 1:206989/91‑1 (MQ=255) aTAGACATTAACTGGGCGTCTCGATGCTA‑ATATTTATAGCATCGAGGTGTCCTTTTTATTTTATTTTTTAACACATCAGCATAGTGAacac < 2:2401264/91‑1 (MQ=255) aTAGACATTAACTGGGCGTCTCGATGCTA‑ATATTTATAGCATCGAGGTGTCCTTTTTATTTTATTTTTTAACACATCAGCATACTCAacac > 2:5520393/1‑91 (MQ=255) tAGACATTAACTGGGCGTCTCGATGCTA‑ATATTTATAGCATCGAGGTGTCCTTTTTATTTTATTTTTTAACACATCAGCATAGTGAACAcc > 1:532860/1‑91 (MQ=255) gtcATTGACTGGGCGACTTGATGCTA‑CTATTTGTAGCATCGAGGTGTCCTTTTTATTTTCTATTTTAACACATCAGCATAGTGAACAccgc < 1:5844073/89‑3 (MQ=255) gACATTAACTGGGCGTCTCGATGCTA‑ATATTTATAGCATCGAGGTGTCCTTTTTATTTTATTTTTTAACACATCAGCATAGTGAACAcccc > 1:1757115/1‑91 (MQ=255) gACATTAACTGGGCGTCTCGATGCTA‑ATATTTATAGCATCGAGGTGTCCTTTTTATTTTATTTTTTAACACATCAGCATAGTGAACAcccc > 2:6370101/1‑91 (MQ=255) aaataaaaaggacacCTCGATGCTA‑ATATTTATAGCATCGAGGTGTCCTTTTTATTTTATTTTTTAACACATCAGCATAGTGAACACCCCt > 1:2353969‑M1/16‑91 (MQ=255) aCATTAACTGGGCGTCTCGATGCTA‑ATATTTATAGCATCGAGGTGTCCTTTTTATTTTATTTTTTAACACATCAGCATAGTGAACACCCCt < 1:1763264/91‑1 (MQ=255) aCATTAACTGGGCGTCTCGATGCTA‑ATATTTATAGCATCGAGGTGTCCTTTTTATTTTATTTTTTAACACATCAGCATAGTGAACACCCCt < 2:1644178/91‑1 (MQ=255) aCATTAACTGGGCGTCTCGATGCTA‑ATATTTATAGCATCGAGGTGTCCTTTTTATTTTATTTTTTAACACATCAGCATAGTGAACACCCCt > 1:4984044/1‑91 (MQ=255) cATTAACTGGGCGTCTCGATGCTA‑ATATTTATAGCATCGAGGTGTCCTTTTTATTTTATTTTTTAACACATCAGCATAGTGAACACCCCtt < 1:2875361/91‑1 (MQ=255) cATTAACTGGGCGTCTCGATGCTA‑ATATTTATAGCATCGAGGTGTCCTTTTTATTTTATTTTTTAACACATCAGCATAGTGAAAACCCCtt > 2:1875629/1‑91 (MQ=255) aTTAACTGGGCGTCTCGATGCTA‑ATATTTATAGCATCGAGGTGTCCTTTTTATTTTATTTTTTAACACATCAGCATAGTGAACACCCCTtc < 1:1359890/91‑1 (MQ=255) aTTAACTGGGCGTCTCGATGCTA‑ATATTTATAGCATCGAGGTGTCCTTTTTATTTTATTTTTTAACACATCAGCATAGTGAACACCCCTtc > 1:3182309/1‑91 (MQ=255) ttAACTGGGCGTCTCGATGCTA‑ATATTTATAGCATCGAGGTGTCCTTTTTATTTTATTTTTTAACACATCAGCATAGTGAACACCCCTtct < 2:2632453/91‑1 (MQ=255) aaCTGGGCGTCTCGATGCTA‑ATATTTATAGCATCGAGGTGTCCTTTTTATTTTATTTTTTAACACATCAGCATAGTGAACACCCCTTctct > 2:5065265/1‑91 (MQ=255) aCTGGGCGTCTCGATGCTA‑ATATTTATAGCATCGAGGTGTCCTTTTTATTTTATTTTTTAACACATCAGCATAGTGAACACCCCTTCTCTa > 1:5884293/1‑91 (MQ=255) aCTGGGCGTCTCGATGCTA‑ATATTTATAGCATCGAGGTGTCCTTTTTATTTTATTTTTTAACACATCAGCATAGTGAACACCCCTTCTCTa < 1:4355963/91‑1 (MQ=255) cTGGGCGTCTCGATGCTA‑ATATTTATAGCATCGAGGTGTCCTTTTTATTTTATTTTTTAACACATCAGCATAGTGAACACCCCTTCTCTaa > 1:6640141/1‑91 (MQ=255) aggacacCTCGATGCTATAAATAT‑TAGCATCGAGGTGTCCTTTTTATTTTATTTTTTAACACATCAGCATAGTGAACACTCTTTCTCTaaa < 2:4610261‑M1/84‑1 (MQ=255) gggCGTCTCGATGCTA‑ATATTTATAGCATCGAGGTGTCCTTTTTATTTTATTTTTTAACACATCAGCATAGTGAACACCCCTTCTCTAAAt > 2:671291/1‑91 (MQ=255) ggCGTCTCGATGCTA‑ATATTTATAGCATCGAGGTGTCCTTTTTATTTTATTTTTTAACACATCAGCATAGTGAACACCCCTTCTCTAAAtt < 1:5477836/91‑1 (MQ=255) ggCGTCTCGATGCTA‑ATATTTATAGCATCGAGGTGTCCTTTTTATTTTATTTTTTAACACATCAGCATAGTGAACACCCCTTCTCTAAAtt > 1:3431474/1‑91 (MQ=255) gCGTCTCGATGCTA‑ATATTTATAGCATCGAGGTGTCCTTTTTATTTTATTTTTTAACACATCAGCATAGTGAACACCCCTTCTCTAAATTa > 2:4174103/1‑91 (MQ=255) gCGTCTCGATGCTA‑ATATTTATAGCATCGAGGTGTCCTTTTTATTTTATTTTTTAACACATCAGCATAGTGAACACCCCTTCTCTAAATTa > 1:4073795/1‑91 (MQ=255) tctcGATGCTA‑ATATTTATAGCATCGAGGTGTCCTTTTTATTTTATTTTTTAACACATCAGCATAGTGAACACCCCTTCTCTAAATTACaa > 2:3651901/1‑91 (MQ=255) tctcGATGCTA‑ATATTTATAGCATCGAGGTGTCCTTTTGATTTTATTTTTTAACACATCAGCATAGTGAACACCCCTTCTCTAAATTACaa < 1:5792351/91‑1 (MQ=255) CTCGATGCTA‑ATATTTATAGCATCGAGGTGTCCTTTTTATTTTATTTTTTAACACATCAGCATAGTGAACACCCCTTCTCTAAAGTACaaa > 2:3450733‑M1/1‑91 (MQ=255) | AGTCAACTACTGTCAATATAACATTGCAGGGCCTAGGGCATTGATTCATGTCCGAGACTATATTCAATTTAATAGACATTAACTGGGCGTCTCGATGCTA‑ATATTTATAGCATCGAGGTGTCCTTTTTATTTTATTTTTTAACACATCAGCATAGTGAACACCCCTTCTCTAAATTACAAA > USA300TCH1516_ALE/1430095‑1430275 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |