| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 1662000 = | 341 (0.950) | 16 (0.050) | 15/136 | NT | 5.7% | intergenic (‑87/+68) | USA300HOU_RS08275/rpmG2_2 | 5‑formyltetrahydrofolate cyclo‑ligase/50S ribosomal protein L33 2 |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 1662039 = | 240 (0.790) | intergenic (‑126/+29) | USA300HOU_RS08275/rpmG2_2 | 5‑formyltetrahydrofolate cyclo‑ligase/50S ribosomal protein L33 2 | |||||
Only 100 of 465 total aligned reads displayed.
TCATTATGTTGTCATGATGAATTATGCGACAATTCTAAAATTTATTATTTCAATTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAG > USA300TCH1516_ALE/1661910‑1662090 | tgaaatgaagaaattctgttcacgtgaaaacaaacaaactttacaccgtgaaacaaaataatcattaaaattaaatttaaattaacaataa > 2:3211766‑M1/91‑91 (MQ=255)tCATTATGTTGTCATGATGAATTATGCGACAATTCTAAAATTTATTATTTCAATTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTa > 1:1403097/1‑91 (MQ=255)tCATTATGTTGTCATGATGAATTATGCGACAATTCTAAAATATATTATTTCAATTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTa > 2:4709493/1‑91 (MQ=255) cATTATGTTGTCATGATGAATTATGCGACAATTCTAAAATTTATTATTTCAATTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTaa < 1:4129798/91‑1 (MQ=255) aaatgaagaaattctgttcacgtgaaaacaaacaaactttacaccgtgaaacaaaataatcattaaaattaaatttaaattaacaataaaa < 1:6244308‑M1/3‑1 (MQ=255) aTTATGTTGTCATGATGAATTATGCGACAATTCTAAAATTTATTATTTCAATTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTaaa < 2:1882718/91‑1 (MQ=255) ttATGTTGTCATGATGAATTATGCGACAATTCTAAAATTTATTATTTCAATTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTaaaa < 1:1043155/91‑1 (MQ=255) aatgaagaaattctgttcacgtgaaaacaaacaaactttacaccgtgaaacaaaataatcattaaaattaaatttaaattaacaataaaaa < 1:612849‑M1/4‑1 (MQ=255) tATGTTGTCATGATGAATTATGCGACAATTCTAAAATTTATTATTTCAATTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTaaaaa > 2:2354032/1‑91 (MQ=255) aTGTTGTCATGATGAATTATGCGACAATTCTAAAATTTATTATTTCAATTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAg < 1:1224455/91‑1 (MQ=255) gttgtCATGATGAATTATGCGACAATTCTAAAATTTATTATTTCAATTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGt > 1:6061227/1‑91 (MQ=255) gttgtCATGATGAATTATGCGACAATTCTAAAATTTATTATTTCAATTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGt > 1:4386669/1‑91 (MQ=255) gttgtCATGATGAATTATGCGACAATTCTAAAATTTATTATTTCAATTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGt > 1:370955/1‑91 (MQ=255) agaaattctgttcacgtgaaaacaaacaaactttacaccgtgaaacaaaataatcattaaaattaaatttaaattaacaataAAAAAGGTg < 1:5687045‑M1/9‑1 (MQ=255) tgtCATGATGAATTATGCGACAATTCTAAAATTTATTATTTCAATTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGa < 2:232058/91‑1 (MQ=255) gtCATGATGAATTATGCGACAATTCTAAAATTTATTATTTCAATTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGaa > 2:5081070/1‑91 (MQ=255) aaattctgttcacgtgaaaacaaacaaactttacaccgtgaaacaaaataatcattaaaattaaatttaaattaacaataAAAAAGGTGaa < 1:5219805‑M1/11‑1 (MQ=255) aaattctgttcacgtgaaaacaaacaaactttacaccgtgaaacaaaataatcattaaaattaaatttaaattaacaataAAAAAGGTGaa < 1:2179417‑M1/11‑1 (MQ=255) tCATGATGAATTATGCGACAATTCTAAAATTTATTATTTCAATTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGaaa > 1:5475032/1‑91 (MQ=255) aattctgttcacgtgaaaacaaactaactttacaccgtgaaacaaaataatcattaaaattaaatttaaattaacaataAAAAAGGTGaaa < 1:6762514‑M1/12‑1 (MQ=255) aattctgttcacgtgaaaacaaacaaactttacaccgtgaaacaaaataatcattaaaattaaatttaaattaacaataAAAAAGGTGaaa < 1:6674162‑M1/12‑1 (MQ=255) aattctgttcacgtgaaaacaaacaaactttacaccgtgaaacaaaataatcattaaaattaaatttaaattaacaataAAAAAGGTGaaa > 1:2046335‑M1/80‑91 (MQ=255) cATGATGAATTATGCGACAATTCTAAAATTTATTATTTCAATTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAAc < 2:573655/91‑1 (MQ=255) atgaATTATGCGACAATTCTAAAATTTATTATTTCAATTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACctct > 1:1472927/1‑91 (MQ=255) gttcacgtgaaaacaaacaaactttacaccgtgaaacaaaataatcattaaaattaaatttaaattaacaataAAAAAGGTGAAACCTCtt < 1:4454343‑M1/18‑1 (MQ=255) aaTTATGCGACAATTCTAAAATTTATTATTTCAATTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTAt > 2:1961473/1‑91 (MQ=255) aTTATGCGACAATTCTAAAATTTATTATTTCAATTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTAtt < 1:1606055/91‑1 (MQ=255) ttATGCGACAATTCTAAAATTTATTATTTCAATTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACATCTTAttt > 2:3002655/1‑91 (MQ=255) gtgaaaacaaacaaactttacaccgtgaaacaaaataatcattaaaattaaatttaaattaacaataAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTg > 2:561702‑M1/68‑91 (MQ=255) aTGCGACAATTCTAAAATTTATTATTTCAATTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTg > 1:6889302/1‑91 (MQ=255) aTGCGACAATTCTAAAATTTATTATTTCAATTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTg > 1:3574123/1‑91 (MQ=255) aTGCGACAATTCTAAAATTTATTATTTCAATTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTg < 2:5436871/91‑1 (MQ=255) gCGACAATTCTAAAATTTATTATTTCAATTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTgag > 1:1671161/1‑91 (MQ=255) aCAATTCTAAAATTTATTATTTCAATTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGAtt < 2:4996097/91‑1 (MQ=255) tCTAAAATTTATTATTTCAATTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCAcc > 1:6929694/1‑91 (MQ=255) tCTAAAATTTATTATTTCAATTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCAcc < 1:2664614/91‑1 (MQ=255) cTAAAATTTATTATTTCAATTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCt > 2:6929950/1‑91 (MQ=255) tAAAATTTATTATTTCAATTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACTTCTTATTTTGAGATTTCACCtt > 2:5698374/1‑91 (MQ=255) aaaaTTTATTATTTCAATTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCttt > 1:6172102/1‑91 (MQ=255) aaaaTTTATTATTTCAATTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCttt > 2:5324274/1‑91 (MQ=255) aaaaTTTATTATTTCAATTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCttt > 1:2376520/1‑91 (MQ=255) aaTTTATTATTTCAATTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCttttt < 1:2325264/91‑1 (MQ=255) aaTTTATTATTTCAATTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCttttt > 1:6400077/1‑91 (MQ=255) aaTTTATTATTTCAATTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCttttt > 2:223945/1‑91 (MQ=255) aaTTTATTATTTCAATTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCttttt < 1:1952430/91‑1 (MQ=255) tttATTATTTCAATTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTa < 2:3376768/91‑1 (MQ=255) tttATTATTTCAATTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTa < 1:4661132/91‑1 (MQ=255) attattTCAATTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTg < 1:5081070/91‑1 (MQ=255) gtgaaacaaaataatcattaaaattaaatttaaattaacaattAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTaa > 2:264361‑M1/44‑91 (MQ=255) ttCAATTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCGTAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGCTTTCACCTTTTTTATTGTTaat > 2:3845576/1‑91 (MQ=255) tCAATTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTaatt < 1:4082336/91‑1 (MQ=255) aTTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTaatttaa > 1:4005106/1‑91 (MQ=255) gAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTaatttaaatt < 2:4735365/91‑1 (MQ=255) gAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTaatttaaatt < 2:5915042/91‑1 (MQ=255) aaataatcattaaaattaaatttaaattaacaataAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTaatttaaatt > 1:834781‑M1/36‑91 (MQ=255) aaaaTCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTaatttaaattt < 2:3945650/91‑1 (MQ=255) aaaTCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTATTTATTGTTaatttaaattta > 2:2021644/1‑91 (MQ=255) aaTCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAatttaaatttaa > 1:30924/1‑91 (MQ=255) tCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAaatttaatt < 2:2946363/91‑1 (MQ=255) cTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAaatttaattt > 2:461555/1‑91 (MQ=255) tttATCATTTCATACGTCTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAAtttaatttta > 1:5289892/1‑91 (MQ=255) tATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAATAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAAtttaattttaat < 2:381660/91‑1 (MQ=255) tATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTaatttaaatt < 1:3848241/81‑1 (MQ=255) tATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAAtttaattttaat < 2:417623/91‑1 (MQ=255) tATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAAtttaattttaat < 1:4890025/91‑1 (MQ=255) aTCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAAtttaattttaatt > 2:6154901/1‑90 (MQ=255) aTCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATg < 1:4206366/91‑1 (MQ=255) tCATTTCATACGTGTGCATAATTAATAAGGTGAAACCTCTTATTTTGCGAATTCACCTTTTTTATTGTTATTTTAAATTTAATTTTAATGa > 2:4900686/1‑91 (MQ=255) tCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGa < 1:2526804/91‑1 (MQ=255) aTTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGatt > 2:5232776/1‑91 (MQ=255) ttCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGattat > 2:5175781/1‑91 (MQ=255) ttCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGattat < 2:806452/91‑1 (MQ=255) tCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGattatt > 1:1779809/1‑91 (MQ=255) tCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGattatt > 2:1779472/1‑91 (MQ=255) aaatttaaattaacaataAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGattatt < 2:362691‑M1/73‑1 (MQ=255) cATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTAttt < 2:6469655/91‑1 (MQ=255) cATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTAttt < 1:3245862/91‑1 (MQ=255) cATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTAttt < 2:4943/91‑1 (MQ=255) tACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTg > 1:3114496/1‑91 (MQ=255) aCGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGt > 2:6628817/1‑91 (MQ=255) cGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGtt > 2:1612014/1‑91 (MQ=255) gtgtGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGttt > 2:122625/1‑91 (MQ=255) tgtgCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTc > 2:15037/1‑91 (MQ=255) tgtgCATAATAAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTc > 2:5827956/1‑91 (MQ=255) tgCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCAc > 2:4096295/1‑91 (MQ=255) cATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCATCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACgg < 2:2511937/91‑1 (MQ=255) cATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACgg > 1:2255988/1‑91 (MQ=255) tAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGgtg > 1:4951341/1‑91 (MQ=255) tAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGgtg > 2:2821808/1‑91 (MQ=255) tAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGgtg < 1:983972/91‑1 (MQ=255) aaTTAAAAAGGTGATACCTCTTATTTTGAGATTTCACCATTTTTATTGTTGATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGgtgt < 1:5820353/91‑1 (MQ=255) aaTTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGgtgt < 1:3439834/91‑1 (MQ=255) aTTAAATAGGTTAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTa < 2:4541241/91‑1 (MQ=255) aTTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTa < 1:1865537/91‑1 (MQ=255) aTTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTa > 2:6355011/1‑91 (MQ=255) aTTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTGAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTa < 1:5358958/91‑1 (MQ=255) ttAATAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTaa < 2:1138752/91‑1 (MQ=255) ttAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTaa > 1:2833930/1‑91 (MQ=255) tAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTaaa > 2:6804615/1‑91 (MQ=255) AAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAg < 2:3296983‑M1/91‑1 (MQ=255) | TCATTATGTTGTCATGATGAATTATGCGACAATTCTAAAATTTATTATTTCAATTGAAAATCTTTTATCATTTCATACGTGTGCATAATTAAAAAGGTGAAACCTCTTATTTTGAGATTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAG > USA300TCH1516_ALE/1661910‑1662090 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |