| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 2150647 = | 286 (0.800) | 16 (0.050) | 11/136 | NT | 6.0% | intergenic (+310/+57) | agrA/scrK | Accessory gene regulator A/Fructokinase |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 2150691 = | 257 (0.850) | intergenic (+354/+13) | agrA/scrK | Accessory gene regulator A/Fructokinase | |||||
Only 100 of 508 total aligned reads displayed.
TTTTTAACAAAATATACTAAATTTGAAATTGACAGTTTCCATAAATAAAATGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACCTCTTGTAATGTTGGC > USA300TCH1516_ALE/2150557‑2150737 | tttttAACAAAATATACTAAATTTGAAATTGACAGTTTCCATAAATAAAATGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAA < 1:40117‑M1/91‑1 (MQ=255)ttgctgcaatagtgacaacgaagtatggtgctattaatagtttgccaacattacaagaggttgaacaagcattttaaataattcatttata > 2:1768597‑M1/91‑91 (MQ=255) ttttAACAAAATATACTAAATTTGAAATTGACAGTTTCTATAAATAAAATGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAA > 1:6734940‑M1/1‑91 (MQ=255) ttttAACAAAATATACTAAATTTGAAATTGACAGTTTCCATAAATAAAATGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAA > 2:1948965‑M1/1‑91 (MQ=255) tttAACAAAATATACTAAATTTGAAATTGACAGTTTCCATAAATAAAATGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAA < 1:4373568‑M1/91‑1 (MQ=255) gctgcaatagtgacaacgaagtatggtgctattaatagtttgccaacattacaagaggttgaacaagcattttaaataattcatttataaa < 1:1549152‑M1/3‑1 (MQ=255) gctgcaatagtgacaacgaagtatggtgctattaatagtttgccaacattacaagaggtagaacaagcattttaaataattcatttataaa < 1:6512526‑M1/3‑1 (MQ=255) ttAACAAAATATACTAAATTTGAAATTGACAGTTTCCATAAATAAAATGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAA > 1:6858771‑M1/1‑91 (MQ=255) ctgcaatagtgacaacgaagtatggtgctattaatagtttgccaacattacaagaggttgaacaagcattttaaataattcatttataaaa < 1:1758040‑M1/4‑1 (MQ=255) tAACAAAATATACTAAATTTGAAATTGACAGTTTCCATAAATAAAATGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAAC > 2:5264116‑M1/1‑91 (MQ=255) caatagtgacaacgaagtatggtgctattaatagtttgccaacattacaagaggttgaacaagcattttaaataattcatttatAAAACAg > 2:5599269‑M1/85‑91 (MQ=255) aCAAAATATACTAAATTTGAAATTGACAGTTTCCATAAATAAAATGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAG > 1:1859233‑M1/1‑91 (MQ=255) atagtgacaacgaagtatggtgctattaatagtttgccaacattacaagaggttgaacaagcattttaaataattcatttatAAAACAgtg < 1:5004392‑M1/9‑1 (MQ=255) atagtgacaacgaagtatggtgctattaatagtttgccaacattacaagaggttgaacaagcatcttaaataattcatttatAAAACAgtg < 2:6884889‑M1/9‑1 (MQ=255) aaaTATACTAAATTTGAAATTGACAGTTTCCATAAATAAAATGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGT < 2:4884289‑M1/91‑1 (MQ=255) aaaTATACTAAATTTGAAATTGACAGTTTCCATAAATAAAATGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGT < 2:2296947‑M1/91‑1 (MQ=255) atatACTAAATTTGAAATTGACAGTTTCCATAAATAAAATGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAG > 1:1251024‑M1/1‑91 (MQ=255) atatACTAAATTTGAAATTGACAGTTTCCATAAATAAAATGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAG < 2:6624461‑M1/91‑1 (MQ=255) atatACTAAATTTGAAATTGACAGTTTCCATAAATAAAATGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAG > 1:351465‑M1/1‑91 (MQ=255) tataCTAAATTTGAAATTGACAGTTTCCATAAATAAAATGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGc < 2:2465336/91‑1 (MQ=255) taCTAAATTTGAAATTGACAGTTTCCATAAATAAAATGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGcac > 1:2886065/1‑91 (MQ=255) taCTAAATTTGAAATTGACAGTTTCCATAAATAAAATGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGcac > 2:6081776/1‑91 (MQ=255) acaacgaagtatggtgctattaatagtttgccaacattacaagaggttgaacaagcattttaaataattcatttatAAAACAGTGTAg < 1:3269758‑M1/12‑1 (MQ=255) aCTAAATTTGAAATTGACAGTTTCCATAAATAAAATGCTATAATTTCCTACTCCGTGGATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGcaca > 2:2615136/1‑91 (MQ=255) cTAAATTTGAAATTGACAGTTTCCATAAATAAAATGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACaa > 1:732397/1‑91 (MQ=255) tAAATTTGAAATTGACAGTTTCCATAAATAAAATGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAg > 2:5181140/1‑91 (MQ=255) gaagtatggtgctattaatagtttgccaacattacaagaggttgaacaagcattttagataattcatttatAAAACAGTGTAGCACAAGAt > 1:6952079‑M1/72‑91 (MQ=255) aaTTTGAAATTGACAGTTTCCATAAATAAAATGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGAt > 2:345763/1‑91 (MQ=255) tttGAAATTGACAGTTTCCATAAATAAAATGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTc < 2:3076814/91‑1 (MQ=255) ttGAAATTGACAGTTTCCATAAATAAAATGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCa < 1:3060044/91‑1 (MQ=255) tGAAATTGACAGTTTCCATAAATAAAATGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCaa < 1:5572251/91‑1 (MQ=255) gAAATTGACAGTTTCCATAAATAAAATGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAAc > 2:5443752/1‑91 (MQ=255) aaaTTGACAGTTTCCATAAATAAAATGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACt < 1:1948965/91‑1 (MQ=255) aaTTGACAGTTTCCATAAATAAAATGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACtt > 1:2157210/1‑91 (MQ=255) aaTTGACAGTTTCCATAAATAAAATGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACtt > 1:6001075/1‑91 (MQ=255) gACAGTTTCCATAAATAAAATGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGttt > 2:2124773/1‑91 (MQ=255) gACAGTTTCCATAAATAAAATGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGttt > 2:2076297/1‑91 (MQ=255) aCAGTTTCCATAAATAAAATGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTc < 1:4215775/91‑1 (MQ=255) cAGTTTCCATAAATAAAATGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCc > 2:5033911‑M2/1‑90 (MQ=255) cAGTTTCCATAAATAAAATGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCc > 2:4255588‑M2/1‑90 (MQ=255) cAGTTTCCATAAATAAAATGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCc > 1:657393‑M2/1‑90 (MQ=255) gTTTCCATAAATAAAATGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCcta > 1:879711‑M2/1‑88 (MQ=255) tttCCATAAATAAAATGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCctac > 1:1057653‑M2/1‑87 (MQ=255) tgaccaaaAATAAAATGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCctac > 1:5848932‑M2/4‑87 (MQ=255) tCCATAAATAAAATGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGgaaacaagttgaatcttgtgctacac < 1:2761879‑M1/91‑27 (MQ=255) ccATAAATAAAATGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCctacact < 2:1078937‑M2/91‑8 (MQ=255) gtttgccaacattacaagaggttgaacaagcattttaaataattcatttatAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTg > 2:357111‑M1/52‑91 (MQ=255) cATAAATAAAATGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCctacactg < 1:3939823‑M2/91‑9 (MQ=255) cATAAATAAAATGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCctacactg > 1:1401824‑M2/1‑83 (MQ=255) ataaataaAATGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTCTTAAAAAACCGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCctacactgt > 2:6734940‑M2/1‑82 (MQ=255) aagtaaaGTGCTATAATGTCCTCCGCCGCGCATCGTATTTTGTTTTAAGAAACAGTGTAGCACAAGAGTCAACGTGTATGCTACACTGttt < 2:805013/88‑1 (MQ=255) aaataaaATGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCctacactgttt < 1:2087717‑M2/91‑12 (MQ=255) aaataaaATGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCctacactgttt < 1:1212895‑M2/91‑12 (MQ=255) aataaaATGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAAc < 1:4133301/72‑1 (MQ=255) ataaaATGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTta > 2:1190139/1‑91 (MQ=255) aaaaTGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTtata < 2:219860/91‑1 (MQ=255) aaaTGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATaa > 1:4568312/1‑91 (MQ=255) aaTGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATaaa > 2:6805329/1‑91 (MQ=255) aTGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAAt < 2:2807650/91‑1 (MQ=255) gCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCTCAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGa < 2:4106504/91‑1 (MQ=255) cTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGaa < 1:1111983/91‑1 (MQ=255) tataATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAat < 1:4774352/91‑1 (MQ=255) taATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAatta < 1:6198582/91‑1 (MQ=255) taATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAatta < 1:6104730/91‑1 (MQ=255) taATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAatta < 1:5157560/91‑1 (MQ=255) aaTTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAattat < 1:4657364/91‑1 (MQ=255) aTTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAattatt > 1:5299990/1‑91 (MQ=255) aTTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAattatt < 1:3188829/91‑1 (MQ=255) aTTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAattatt < 2:3954372/91‑1 (MQ=255) tttCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTAttt < 1:6695909/91‑1 (MQ=255) ttCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTa < 2:1302349/91‑1 (MQ=255) gttgaacaagcattttaaataattcatttatAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTa > 1:2348809‑M1/32‑91 (MQ=255) tCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTaa < 2:4454525/91‑1 (MQ=255) ccTACTCCGTGCATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTaaa > 1:2673416/1‑91 (MQ=255) ccTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTaaa > 2:3740982/1‑91 (MQ=255) ccTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTaaa < 2:4941407/91‑1 (MQ=255) cTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTaaaa > 1:6403056/1‑91 (MQ=255) tACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAAt > 2:3260392/1‑91 (MQ=255) cTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGc > 2:4746430/1‑91 (MQ=255) tCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCt > 1:2569805/1‑91 (MQ=255) tGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGtt < 1:1023318/91‑1 (MQ=255) tGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGtt < 2:5981926/91‑1 (MQ=255) ttATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACct > 2:2671901/1‑91 (MQ=255) aTTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACctct > 2:5344855/1‑91 (MQ=255) aTTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACctct < 2:1057947/91‑1 (MQ=255) ttttGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACCTCtt < 1:1485327/91‑1 (MQ=255) ttttGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACCTCtt < 1:3605784/91‑1 (MQ=255) tttGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACCTCTTg < 1:5928775/91‑1 (MQ=255) ttGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACCTCTTGt < 1:3339891/91‑1 (MQ=255) tGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACCTCTTGTa < 2:615604/91‑1 (MQ=255) gTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACCTCTTGTaa > 2:18660/1‑91 (MQ=255) ttttAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACCTCTTGTAAt < 2:2039994/91‑1 (MQ=255) ttttAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACCTCTTGTAAt > 2:3864443/1‑91 (MQ=255) tttAAACACCAGTGTAGCACAAGATTCCACTTGTTTGCTACACAGTTTTATAAATGACTTATTTACAATGCTCGTTCAACCTCTTGTAATg > 2:5090915/1‑91 (MQ=255) ttAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACCTCTTGTAATGt < 1:5427504/91‑1 (MQ=255) ttAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACCTCTTGTAATGt > 2:1418377/1‑91 (MQ=255) aaaaaaCAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACCTCTTGTAATGTTg < 2:5729263/91‑1 (MQ=255) aaaaaCAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACCTCTTGTAATGTTgg < 2:2920111/91‑1 (MQ=255) aaaaaCAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACCTCTTGTAATGTTgg < 1:3718523/91‑1 (MQ=255) aaaaCAGTGTAGgaaacaagttgaatcttgtgctacactgttttttaaaacaaaataagattcacggagtaggaaattatagcattttatt < 2:6353558‑M1/91‑80 (MQ=255) | TTTTTAACAAAATATACTAAATTTGAAATTGACAGTTTCCATAAATAAAATGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACCTCTTGTAATGTTGGC > USA300TCH1516_ALE/2150557‑2150737 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |