| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 2699646 | 317 (0.890) | 8 (0.030) | 5/122 | NT | 3.0% | intergenic (+53/+37) | copZ/ldhD_2 | Copper chaperone CopZ/D‑lactate dehydrogenase |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 2699665 | 281 (1.040) | intergenic (+72/+18) | copZ/ldhD_2 | Copper chaperone CopZ/D‑lactate dehydrogenase | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 534 total aligned reads displayed.
AAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTGCATC > USA300TCH1516_ALE/2699556‑2699736 | gACGCAATTGACGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTTATGAGAAt > 2:3031236/1‑91 (MQ=255) gACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAAt > 1:3846480/1‑91 (MQ=255) aCGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATc > 2:1075773/1‑91 (MQ=255) cGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATcc > 1:6048962/1‑91 (MQ=255) aTTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCcaac < 2:4991834/91‑1 (MQ=255) ttGAAGATCAAGATTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCcaaca < 2:4491771/91‑1 (MQ=255) tGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCcaacac > 2:6703906/1‑90 (MQ=255) gAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAAt < 2:2465093/91‑1 (MQ=255) gAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAAt < 2:3379825/91‑1 (MQ=255) gAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAAt < 2:6906967/91‑1 (MQ=255) tCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCaaa < 2:1612813/91‑1 (MQ=255) tCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCaaa < 2:5309570/91‑1 (MQ=255) actaGGTGACGATATCGTATAATTAGGCAATATTCAACGACATCAACAACAAATAAAAAAATCGAACTGTTGAGAATCCCAACAATCCaaa < 2:1771354/88‑1 (MQ=255) cAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAAt < 1:6359863/91‑1 (MQ=255) aGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTa > 1:1299114/1‑91 (MQ=255) gTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAtaatttggattgttgggattc < 1:5194976‑M1/91‑22 (MQ=255) ttACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTAtct > 2:1266568‑M2/1‑88 (MQ=255) tACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAtaatttggattgttgggattctc < 2:2620054‑M1/91‑24 (MQ=255) tACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTAtctc < 2:2240478‑M2/91‑5 (MQ=255) cGATGTCGTTTAATTAGGAAATATTCAACGTAATCAAAAACAAAATAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTAtctcat > 2:5981934‑M2/1‑85 (MQ=255) aTGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTAtctcatca > 1:3888845‑M2/1‑83 (MQ=255) aTGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTAtctcatca > 1:1359599‑M2/1‑83 (MQ=255) tCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTAtctcatcagtt > 1:4402709‑M2/1‑80 (MQ=255) cGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTAtctcatcagttc > 1:167351‑M2/1‑79 (MQ=255) gTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTAtctcatcagttcg > 1:4329488‑M2/1‑78 (MQ=255) tttAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTAtctcatcagttcga > 1:529361‑M2/1‑77 (MQ=255) tAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTAtctcatcagttcgatt > 1:1987345‑M2/1‑75 (MQ=255) tAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTAtctcatcagttcgatt < 2:4674088‑M2/91‑17 (MQ=255) tAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTAtctcatcagttcgatt < 2:4797629‑M2/91‑17 (MQ=255) tAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTAtctcatcagttcgatt < 1:562902‑M2/91‑17 (MQ=255) aTTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTAtctcatcagttcgatttt > 2:3124216‑M2/1‑73 (MQ=255) aTTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTAtctcatcagttcgatttt > 1:2825165‑M2/1‑73 (MQ=255) ttAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTAtctcatcagttcgattttt > 2:3539714‑M2/1‑72 (MQ=255) ttAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTAtctcatcagttcgattttt > 2:5879192‑M2/1‑72 (MQ=255) tAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTa > 2:3097078/1‑91 (MQ=255) aGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTaa > 1:1137170/1‑91 (MQ=255) ggCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAAt > 2:4275882/1‑91 (MQ=255) ggCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAAt > 1:1638351/1‑91 (MQ=255) gCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAAtt < 2:1414374/91‑1 (MQ=255) gCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAAtt > 1:2149620/1‑91 (MQ=255) atatTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAGTCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTAc > 1:6837313/1‑91 (MQ=255) tatTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACt < 2:375451/91‑1 (MQ=255) tatTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACt < 2:6371867/91‑1 (MQ=255) atTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTc < 2:5581296/91‑1 (MQ=255) cGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAAcc < 1:1106692/91‑1 (MQ=255) cGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAAcc > 1:2981330/1‑91 (MQ=255) tcatcaACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTa < 1:713072/91‑1 (MQ=255) tcatcaACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTa < 2:2298642/91‑1 (MQ=255) tcatcaACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTa < 1:4731233/91‑1 (MQ=255) catcaACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAg > 2:60913/1‑91 (MQ=255) atcaACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGt > 1:5959852/1‑91 (MQ=255) aaCACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTAtc < 2:570235/91‑1 (MQ=255) aaCACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTAtc < 1:5618513/91‑1 (MQ=255) acacCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTAtct < 2:6320984/91‑1 (MQ=255) acacCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTAtct > 1:2315026/1‑91 (MQ=255) acacCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTAtct < 1:3259780/91‑1 (MQ=255) acCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTcc < 1:3097078/91‑1 (MQ=255) acCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTcc < 2:3262415/91‑1 (MQ=255) aagttAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGt < 2:2353114/88‑1 (MQ=255) aaaTTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGt > 1:1007886/1‑91 (MQ=255) aaTTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTc > 2:4035986/1‑91 (MQ=255) aTTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCt > 2:5167481/1‑91 (MQ=255) tAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGc < 1:4035986/91‑1 (MQ=255) aaaaaTCGAACTGATGAGAtaatttggattgttgggattctcatcagttcgattttttaatttggtgttgatgacgttgaatattgcctaa > 1:890192‑M1/1‑19 (MQ=255) aaaaaTCGAACTGATGAGAtaatttggattgttgggattctcatcagttcgattttttaatttggtgttgatgacgttgaatattgcctaa > 2:4544424‑M1/1‑19 (MQ=255) aaaaaTCGAACTGATGAGAtaatttggattgttgggattctcatcagttcgattttttaatttggtgttgatgacgttgaatattgcctaa < 2:4148494‑M1/91‑73 (MQ=255) aaaaaTCGAACTGATGAGAtaatttggattgttgggattctcatcagttcgagtttttaatttggtgttgatgacgttgaatattgcctaa > 1:5795138‑M1/1‑19 (MQ=255) aaaaTCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAAt < 1:4621802/91‑1 (MQ=255) aaaaTCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAAt < 1:3501279/91‑1 (MQ=255) aaaaTCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAAt < 2:1512691/91‑1 (MQ=255) aaaTCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATa > 2:4925797/1‑91 (MQ=255) aaTCGAACTGATTAGAATCCTAACAAGCCAAATTAACTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATAc < 2:5807271/91‑1 (MQ=255) aaTCGAACTGATGAGAtaatttggattgttgggattctcatcagttcgattttttaatttggtgttgatgacgttgaatattgcctaatta > 1:6525954‑M1/1‑16 (MQ=255) aTCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACa < 1:3698461/91‑1 (MQ=255) aTCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACa < 1:3312305/91‑1 (MQ=255) aTCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACa > 1:1415274/1‑91 (MQ=255) aTCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACa < 2:1953278/91‑1 (MQ=255) tCGAACTGATGAGAtaatttggattgttgggattctcatcagttcgattttttaatttggtgttgatgacgttgaatattgcctaattaaa < 2:4733450‑M1/91‑78 (MQ=255) tCGAACTGATGAGAtaatttggattgttgggattctcatcagttcgattttttaatttggtgttgatgacgttgaatattgcctaattaaa > 1:3038441‑M1/1‑14 (MQ=255) tCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACAt < 1:2809368/91‑1 (MQ=255) tCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACAt < 2:5050283/91‑1 (MQ=255) cGAACTGATGAGAtaatttggattgttgggattctcatcagttcgattttttaatttggtgttgatgacgttgaatattgcctaattaaac > 2:1903039‑M1/1‑13 (MQ=255) cGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATc < 1:4013394/91‑1 (MQ=255) gAACTGATGAGAtaatttggattgttgggattctcatcagttcgattttttaatttggtgttgatgacgttgaatattgcctaattaaacg > 1:2671750‑M1/1‑12 (MQ=255) aaCTGATGAGAtaatttggattgttgggattctcatcagttcgattttttaatttggtgttgatgacgttgaatattgcctaattaaacga < 1:6586709‑M1/91‑81 (MQ=255) aaCTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTa < 2:2124099/91‑1 (MQ=255) aCTGATGAGAtaatttggattgttgggattctcatcagttcgattttttaatttggtgttgatgacgttgaatattgcctaattaaacgac < 2:529416‑M1/91‑82 (MQ=255) aCTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTaa < 2:76450/91‑1 (MQ=255) cTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAAt < 2:3846480/91‑1 (MQ=255) tgatgaGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATg > 2:3194065/1‑91 (MQ=255) gatgaGAtaatttggattgttgggattctcatcagttcgattttttaatttggtgttgatgacgttgaatattgcctaattaaacgacatc > 1:5247478‑M1/1‑7 (MQ=255) gatgaGAtaatttggattgttgggattctcatcagttcgattttttaatttggtgttgatgacgttgaatattgcctaattaaacgacatc > 2:6828575‑M1/1‑7 (MQ=255) gatgaGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGt < 2:6445592/91‑1 (MQ=255) gatgaGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTCACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGt < 2:6471086/91‑1 (MQ=255) atgaGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGtt < 1:3548523/91‑1 (MQ=255) tgaGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTg < 2:2806702/91‑1 (MQ=255) gaATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTGCAt < 1:6088430/91‑1 (MQ=255) gaATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTGCAt > 1:4147953/1‑91 (MQ=255) aaTCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTGCATc < 1:1220327/91‑1 (MQ=255) aaTCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTGCATc < 1:4871980/91‑1 (MQ=255) | AAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTGCATC > USA300TCH1516_ALE/2699556‑2699736 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |