| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 2699646 | 317 (0.890) | 8 (0.030) | 5/122 | NT | 3.0% | intergenic (+53/+37) | copZ/ldhD_2 | Copper chaperone CopZ/D‑lactate dehydrogenase |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 2699665 | 281 (1.040) | intergenic (+72/+18) | copZ/ldhD_2 | Copper chaperone CopZ/D‑lactate dehydrogenase | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 422 total aligned reads displayed.
AGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTGCATCTAATGCATCGACAATTAGA > USA300TCH1516_ALE/2699575‑2699755 | aGGTTTCGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTa < 1:607520/91‑1 (MQ=255) ggTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTAt < 1:4020946‑M2/91‑2 (MQ=255) ggTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTAt < 1:3548274‑M2/91‑2 (MQ=255) ggTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTAt < 2:4963341‑M2/91‑2 (MQ=255) ggTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTAt < 2:4871980‑M2/91‑2 (MQ=255) tACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTAtctc < 2:1659749‑M2/91‑5 (MQ=255) cGATGTCGTTTAATTAGGAAATATTCAACGTAATCAAAAACAAAATAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTAtctcat > 2:5981934‑M2/1‑85 (MQ=255) gATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTAtctcatc > 2:6828575‑M2/1‑84 (MQ=255) aTGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTAtctcatca < 1:5238393‑M2/91‑9 (MQ=255) aTGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTAtctcatca > 1:1359599‑M2/1‑83 (MQ=255) tGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTAtctcatcag < 1:1187150‑M2/91‑10 (MQ=255) gTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAGATTAtctcatcagt > 2:231933‑M2/1‑81 (MQ=255) gTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTAtctcatcagt > 1:4847066‑M2/1‑81 (MQ=255) cGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTAtctcatcagttc < 1:2906276‑M2/91‑13 (MQ=255) cGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTAtctcatcagttc > 1:167351‑M2/1‑79 (MQ=255) gTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTAtctcatcagttcg > 1:4329488‑M2/1‑78 (MQ=255) tttAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTAtctcatcagttcga > 1:529361‑M2/1‑77 (MQ=255) ttAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTAtctcatcagttcgat < 2:5300779‑M2/91‑16 (MQ=255) tAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTAtctcatcagttcgatt < 1:562902‑M2/91‑17 (MQ=255) tAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTAtctcatcagttcgatt > 1:6525954‑M2/1‑75 (MQ=255) ttAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAACTCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTAtctcatcagttcgattttt > 1:5795138‑M2/1‑72 (MQ=255) ttAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTAtctcatcagttcgattttt > 2:5879192‑M2/1‑72 (MQ=255) ttAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTAtctcatcagttcgattttt > 2:5031709‑M2/1‑72 (MQ=255) ggCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAAt > 1:1638351/1‑91 (MQ=255) gCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAAtt < 1:3260987/91‑1 (MQ=255) gCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAAtt > 1:2149620/1‑91 (MQ=255) aaTATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTa < 2:3815142/91‑1 (MQ=255) atatTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTAc < 2:2786784/91‑1 (MQ=255) atatTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTAc > 2:326016/1‑91 (MQ=255) tatTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACt < 2:375451/91‑1 (MQ=255) tatTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACt < 1:6855365/91‑1 (MQ=255) tatTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACt < 1:4129932/91‑1 (MQ=255) tatTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACt < 2:6378907/91‑1 (MQ=255) atTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTc > 1:3512109/1‑91 (MQ=255) atTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTc > 2:3438837/1‑91 (MQ=255) ttCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCg < 1:4403264/91‑1 (MQ=255) ttCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCg < 1:3951367/91‑1 (MQ=255) aaCGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTaa > 2:3117371/1‑91 (MQ=255) cGTCATCAATACCAAATGAATAAATCGAAATGGTTATAATCCCAACAATCCAAATGATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAAcc < 2:4644610/91‑1 (MQ=255) cGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAGCGATCCAAGTTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAAcc < 2:5067149/91‑1 (MQ=255) cGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAAcc < 1:1106692/91‑1 (MQ=255) cGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAAcc > 2:6337466/1‑91 (MQ=255) tcatcaACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACGATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTa < 1:713127/91‑1 (MQ=255) tcatcaACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTa < 1:4731233/91‑1 (MQ=255) tcatcaACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTa < 2:2509235/91‑1 (MQ=255) atcaACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGt > 1:5962426/1‑91 (MQ=255) atcaACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGt < 1:3016189/91‑1 (MQ=255) tcaACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTa < 1:3068557/91‑1 (MQ=255) aaCACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTAtc < 2:570235/91‑1 (MQ=255) aaCACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTAtc < 1:336273/91‑1 (MQ=255) cacCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTAtctc > 2:5818684/1‑91 (MQ=255) acCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTcc < 2:2364137/91‑1 (MQ=255) acCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAAGCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTcc < 1:6176102/91‑1 (MQ=255) cAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCGAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAg < 2:1578764/91‑1 (MQ=255) aaaTTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGt < 1:3872344/91‑1 (MQ=255) aaaTTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGt > 1:1007886/1‑91 (MQ=255) aaaTTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGt < 1:5618144/91‑1 (MQ=255) aaaTTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTGCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGt < 2:1864206/91‑1 (MQ=255) aaaaaTCGAACTGATGAGAATCCCCACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCaa > 2:6991242/1‑91 (MQ=255) aaaaaTCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCaa > 1:2308388/1‑91 (MQ=255) aaaaTCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAAt < 1:4621802/91‑1 (MQ=255) aaTCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATAc < 2:2123215/91‑1 (MQ=255) aaTCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATAc > 2:3165546/1‑91 (MQ=255) aTCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACa < 2:1953278/91‑1 (MQ=255) aTCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACa > 2:5179442/1‑91 (MQ=255) aTCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACa < 1:3698461/91‑1 (MQ=255) tCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACAt < 1:2809368/91‑1 (MQ=255) tCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACAt > 2:644863/1‑91 (MQ=255) cGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATc < 2:3055155/91‑1 (MQ=255) gAACTGATGAGAATCCCAACGATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTAATCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCt < 2:4725941/91‑1 (MQ=255) gAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCt < 2:1318774/91‑1 (MQ=255) aaCTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTa < 2:4172775/91‑1 (MQ=255) aCTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTaa < 2:75859/91‑1 (MQ=255) aCTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTaa > 2:399639/1‑91 (MQ=255) cTGATGATAATCCCAATAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAAt < 2:6670488/91‑1 (MQ=255) cTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAAt > 2:4532326/1‑91 (MQ=255) cTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAAt > 1:2028245/1‑91 (MQ=255) tgatgaGAATCCCAACAATCCAAAGTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATg < 1:6626063/91‑1 (MQ=255) gatgaGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTCACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGt < 2:6471086/91‑1 (MQ=255) atgaGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGtt < 2:5474943/91‑1 (MQ=255) gagaATCCCAACAATCCAAATTAtctcatcagttcgattttttaatttggtgttgatgacgttgaatattgcctaattaaacgacatcgta < 2:2620054‑M2/91‑69 (MQ=255) gaATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTGCAt > 1:1220423/1‑91 (MQ=255) ccAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTGCATCTAAt > 1:2661552/1‑91 (MQ=255) caacaaTCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTGCATCTAATg < 1:3165546/91‑1 (MQ=255) aacaaTCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTGCATCTAATGc > 1:141439/1‑91 (MQ=255) aacaaTCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTGCATCTAATGc > 1:584524/1‑91 (MQ=255) caaTCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTGCATCTAATGCAt > 2:2236674/1‑91 (MQ=255) caaTCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTGCATCTAATGCAt < 2:562902/91‑1 (MQ=255) aaTCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTGCATCTAATGCATc > 2:449439/1‑91 (MQ=255) aaTCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTGCATCTAATGCATc > 1:5013908/1‑91 (MQ=255) ccAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTGCATCTAATGCATCGAc < 1:6033910/91‑1 (MQ=255) cAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTGCATCTAATGCATCGACa > 2:3205181/1‑91 (MQ=255) aaTTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTGCATCTAATGCATCGACAAt > 2:6113092/1‑91 (MQ=255) aaTTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTGCATCTAATGCATCGACAAt > 1:1929442/1‑91 (MQ=255) aaTTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTGCATCTAATGCATCGACAAt > 2:4318494/1‑91 (MQ=255) aTTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTGCATCTAATGCATCGACAAtt > 2:1498394/1‑91 (MQ=255) ttATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTGCATCTAATGCATCGACAATTa < 2:6280865/91‑1 (MQ=255) ttATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTGCATCTAATGCATCGACAATTa < 1:642901/91‑1 (MQ=255) ttATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTGCATCTAATGCATCGACAATTa < 2:1401335/91‑1 (MQ=255) aTCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTGCATCTAATGCATCGACAATTAGa > 2:1040993/1‑91 (MQ=255) | AGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTGCATCTAATGCATCGACAATTAGA > USA300TCH1516_ALE/2699575‑2699755 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |