| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 2731249 = | 346 (0.970) | 17 (0.060) | 11/138 | NT | 5.8% | intergenic (+45/+36) | USA300HOU_RS14055/USA300HOU_RS14060 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 2731282 = | 254 (0.830) | intergenic (+78/+3) | USA300HOU_RS14055/USA300HOU_RS14060 | hypothetical protein/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 462 total aligned reads displayed.
TCGTTGGATGTTACATGGTCAAGACTATACTGCAATCCAACAATAATGTTATTGATAAAGATATCATTTAATAAGCTTATGTTATTTAGCAAGGCAAGCCACTCTCGATTCATGGCTTGCCTTATTTTATTGTATATTTTTAATTATCGTTGCTGGCCCTTGATTGACAATCGTATTAAAA > USA300TCH1516_ALE/2731159‑2731339 | accgtatagacaaagttgacttaataaggcattttaatacgattgtcaatcaagggccagcaacgataattaaaaatatacaataaaataa > 1:6355694‑M1/90‑91 (MQ=255) ccgtatagacaaagttgacttaataaggcattttaatacgattgtcaatcaagggccagcaacgataattaaaaatatacaataaaatAAg < 2:3363242‑M1/3‑1 (MQ=255) ccgtatagacaaagttgacttaataaggcattttaatacgattgtcaatcaagggccagcaacgataattaaaaatatacaataaaatAAg > 2:1522424‑M1/89‑91 (MQ=255) tatagacaaagttgacttaataaggcattttaatacgattgtcaatcaagggccagcaacgataattaaaaatatacaataaaatAAGGCa > 1:1105664‑M1/86‑91 (MQ=255) tatagacaaagttgacttaataaggcattttaatacgattgtcaatcaagggccagcaacgataattaaaaatatacaataaaatAAGGCa < 1:5735458‑M1/6‑1 (MQ=255) ggATGTTACATGGTCAAGACTATACTGCAATCCAACAATAATGTTATTGATAAAGATATCATTTAATAAGCTTATGTTATTTAgcaaggca > 2:1190982/1‑91 (MQ=255) atagacaaagttgacttaataaggcattttaatacgattgtcaatcaagggccagcaacgataattaaaaatatacaataaaatAAGGCaa > 1:2611941‑M1/85‑91 (MQ=255) tagacaaagttgacttaataaggcattttaatacgattgtcaatcaagggccagcaacgataattaaaaatatacaataaaatAAGGCAAg < 1:6139143‑M1/8‑1 (MQ=255) tGTTACATGGTCAAGACTATACTGCAATCCAACAATAATGTTATTGATAAAGATATCATTTAATAAGCTTATGTTATTTAGCAAGGCAAGc > 1:994922/1‑91 (MQ=255) tGTTACATGGTCAAGACTATACTGCAATCCAACAATAATGTTATTGATAAAGATATCATTTAATAAGCTTATGTTATTTAGCAAGGCAAGc > 2:3973368/1‑91 (MQ=255) agacaaagttgacttaataaggcattttaatacgattgtcaatcaagggccagcaacgataattaaaaatatacaataaaatAAGGCAAGc < 2:6576790‑M1/9‑1 (MQ=255) acaaagttgacttaataaggcattttaatacgattgtcaatcaagggccagcaacgataattaaaaatatacaataaaatAAGGCAAGCCa < 1:5572171‑M1/11‑1 (MQ=255) acaaagttgacttaataaggcattttaatacgattgtcaatcaagggccagcaacgataattaaaaatatacaataaaatAAGGCAAGCCa > 1:3858306‑M1/81‑91 (MQ=255) aCATGGTCAAGACTATACTGCAATCCAACAATAATGTTATTGATAAAGATATCATTTAATAAGCTTATGTTATTTAGCAAGGCAAGCCAct > 2:846279/1‑91 (MQ=255) aCATGGTCAAGACTATACTGCAATCCAACAATAATGTTATTGATAAAGATATCATTTAATAAGCTTATGTTATTTAGCAAGGCAAGCCAct > 1:1010010/1‑91 (MQ=255) aCATGGTCAAGACTATACTGCAATCCAACAATAATGTTATTGATAAAGATATCATTTAATAAGCTTATGTTATTTAGCAAGGCAAGCCAct > 1:4192504/1‑91 (MQ=255) aCATGGTCAAGACTATACTGCAATCCAACAATAATGTTATTGATAAAGATATCATTTAATAAGCTTATGTTATTTAGCAAGGCAAGCCAct > 2:5420050/1‑91 (MQ=255) cATGGTCAAGACTATACTGCAATCCAACAATAATGTTATTGATAAAGATATCATTTAATAAGCTTATGTTATTTAGCAAGGCAAGCCActc > 2:2892680/1‑91 (MQ=255) cATGGTCAAGACTATACTGCAATCCAACAATAATGTTATTGATAAAGATATCATTTAATAAGCTTATGTTATTTAGCAAGGCAAGCCActc < 2:3547736/91‑1 (MQ=255) tGGTCAAGACTATACTGCAATCCAACAATAATGTTATTGATAAAGATATCATTTAATAAGCTTATGTTATTTAGCAAGGCAAGCCACtctc > 1:1162164/1‑91 (MQ=255) gTCAAGACTATACTGCAATCCAACAATAATGTTATTGATAAAGATATCATTTAATAAGCTTATGTTATTTAGCAAGGCAAGCCACTCTCGa < 1:5476392/91‑1 (MQ=255) tCAAGACTATACTGCAATCCAACAATAATGTTATTGATAAAGATATCATTTAATAAGCTTATGTTATTTAGCAAGGCAAGCCACTCTCGAt > 1:2172959/1‑91 (MQ=255) tCAAGACTATACTGCAATCCAACAATAATGTTATTGATAAAGATATCATTTAATAAGCTTATGTTATTTAGCAAGGCAAGCCACTCTCGAt < 1:2931779/91‑1 (MQ=255) attaataagacatttaaatacgattgtcaatcaagggccagcaacgataattaaaaatatacaataaaatAAGGCAAGCCACTCTCGATTc > 2:6225472‑M1/71‑91 (MQ=255) ttaataaggcattttaatacgattgtcaatcaagggccagcaacgataattaaaaatatacaataaaatAAGGCAAGCCACTCTCGATTCa > 2:5292777‑M1/70‑91 (MQ=255) aGACTATACTGCAATCCAACAATAATGTTATTGATAAAGATATCATTTAATAAGCTTATGTTATTTAGCAAGGCAAGCCACTCTCGATTCa < 1:6748747/91‑1 (MQ=255) aGACTATACTGCAATCCAACAATAATGTTATTGATAAAGATATCATTTAATAAGCTTATGTTATTTAGCAAGGCAAGCCACTCTCGATTCa > 1:6051561/1‑91 (MQ=255) aCTATACTGCAATCCAACAATAATGTTATTGATAAAGATATCATTTAATAAGCTTATGTTATTTAGCAAGGCAAGCCACTCTCGATTCATg > 1:1195618/1‑91 (MQ=255) aCTATACTGCAATCCAACAATAATGTTATTGATAAAGATATCATTTAATAAGCTTATGTTATTTAGCAAGGCAAGCCACTCTCGATTCATg > 2:4322766/1‑91 (MQ=255) ataaggcattttaatacgattgtcaatcaagggccagcaacgataattaaaaatatacaataaaatAAGGCAAGCCACTCTCGATTCATgg > 1:814017‑M1/67‑91 (MQ=255) tataCTGCAATCCAACAATAATGTTATTGATAAAGATATCATTTAATAAGCTTATGTTATTTAGCAAGGCAAGCCACTCTCGATTCATGGc > 2:4550555/1‑91 (MQ=255) ataCTGCAATCCAACAATAATGTTATTGATAAAGATATCATTTAATAAGCTTATGTTATTTAGCAAGGCAAGCCACTCTCGATTCATGGCt < 2:2849419/91‑1 (MQ=255) aCTGCAATCCAACAATAATGTTATTGATAAAGATATCATTTAATAAGCTTATGTTATTTAGCAAGGCAAGCCACTCTCGATTCATGGCTTg > 2:1766015/1‑91 (MQ=255) aCTGCAATCCAACAATAATGTTATTGATAAAGATATCATTTAATAAGCTTATGTTATTTAGCAAGGCAAGCCACTCTCGATTCATGGCTTg > 2:5055894/1‑91 (MQ=255) cTGCAATCCAACAATAATGTTATTGATAAAGATATCATTTAATAAGCTTATGTTATTTAGCAAGGCAAGCCACTCTCGATTCATGGCTTGc > 2:2711593/1‑91 (MQ=255) cTGCAATCCAACAATAATGTTATTGATAAAGATATCATTTAATAAGCTTATGTTATTTAGCAAGGCAAGCCACTCTCGATTCATGGCTTGc > 1:2408039/1‑91 (MQ=255) cTGCAATCCAACAATAATGTTATTGATAAAGATATCATTTAATAAGCTTATGTTATTTAGCAAGGCAAGCCACTCTCGATTCATGGCTTGc > 1:3546013/1‑91 (MQ=255) gCAATCCAACAATAATGTTATTGATAAAGATATCATTTAATAAGCTTATGTTATTTAGCAAGGCAAGCCACTCTCGATTCATGGCTTGCCt < 2:759995/91‑1 (MQ=255) gCAATCCAACAATAATGTTATTGATAAAGATATCATTTAATAAGCTTATGTTATTTAGCAAGGCAAGCCACTCTCGATTCATGGCTTGCCt < 2:5770085/91‑1 (MQ=255) attttaatacgattgtcaatcaagggccagcaacgataattaaaaatatacaataaaatAAGGCAAGCCACTCTCGATTCATGGCTTGCCt > 1:2710378‑M1/60‑91 (MQ=255) cAATCCAACAATAATGTTATTGATAAAGATCTCATTTAATAAGCTTAAGTTATTTAGCAAGGCAAGCTACTCTCGATTCATGGCTTGACtt > 2:2496801/1‑91 (MQ=255) aTCCAACAATAATGTTATTGATAAAGATATCATTTAATAAGCTTATGTTATTTAGCAAGGCAAGCCACTCTCGATTCATGGCTTGCCttat > 1:1541324/1‑91 (MQ=255) aTCCAACAATAATGTTATTGATAAAGATATCATTTAATAAGCTTATGGTATTTAGCAAGGCAAGCCACTCTCGATTCATGGCTTGCCttat < 1:4818814/91‑1 (MQ=255) tCCAACAATAATGTTATTGATAAAGATATCATTTAATAAGCTTATGTTATTTAGCAAGGCAAGCCACTCTCGATTCATGGCTTGCCttatt > 1:2990874/1‑91 (MQ=255) caacaaTAATGTTATTGATAAAGATATCATTTAATAAGCTTATGTTATTTAGCAAGGCAAGCCACTCTCGATTCATGGCTTGCCttatttt > 1:3124594/1‑91 (MQ=255) acaaTAATGTTATTGATAAAGATATCATTTAATAAGCTTATGTTATTTAGCAAGGCAAGCCACTCTCGATTCATGGCTTGCCttattttat > 1:6269241/1‑91 (MQ=255) acaaTAATGTTATTGATAAAGATATCATTTAATAAGCTTATGTTATTTAGCAAGGCAAGCCACTCTCGATTCATGGCTTGCCttattttat > 1:4924430/1‑91 (MQ=255) aataatGTTATTGATAAAGATATCATTTAATAAGCTTATGTTATTTAGCAAGGCAAGCCACTCTCGATTCATGGCTTGCCTTATTTTATTg > 1:3363242/1‑91 (MQ=255) ataatGTTATTGATAAAGCTATCATTTAATAAGCTCATGTTATTTCGCAAGGCAAGCAACTCTCGATTCATGGCTTGCCTTCTTTTATTGt > 2:6745204/1‑91 (MQ=255) taatGTTATTGATAAAGATATCATTTAATAAGCTTATGTTATTTAGCAAGGCAAGCCACTCTCGATTCATGGCTTGCCTTATTTTATTGta < 1:5167394/91‑1 (MQ=255) taatGTTATTGATAAAGATATCATTTAATAAGCTTATGTTATTTAGCAAGGCAAGCCACTCTCGATTCATGGCTTGCCTTATTTTATTGta < 2:5008912/91‑1 (MQ=255) aatGTTATTGATAAAGATATCATTTAATAAGCTTATGTTATTTAGCAAGGCAAGCCACTCTCGATTCATGGCTTGCCTTATTTTATTGtat > 1:5074083/1‑91 (MQ=255) gTTATTGATAAAGATATCATTTAATAAGCTTATGTTATTTAGCAAGGCAAGCCACTCTCGATTCATGGCTTGCCt > 2:4687020/1‑75 (MQ=255) gTTATTGATAAAGATATCATTTAATAAGCTTATGTTATTTAGCAAGGCAAGCCACTCTCGATTCATGGCTTGCCTTATTTTATTGTATAtt > 2:4032217/1‑91 (MQ=255) ttATTGATAAAGATATCATTTAATAAGCTTATGTTATTTAGCAAGGCAAGCCACTCTCGATTCATGGCTTGCCTTATTTTATTGTATAttt < 2:1894680/91‑1 (MQ=255) tcaTTGTTAAAGATAACATTTAATAAGCTTATGTTATTTAGCAAGGCAAGCCACTCTCGATGCATGGCTTGCCTTATTTTATTGTatatgt < 1:5855401/89‑3 (MQ=255) tATTGATAAAGATATCATTTAATAAGCTTATGTTATTTAGCAAGGCAAGCCACTCTCGATTCATGGCTTGCCTTATTTTATTGTATAtttt > 2:5917631/1‑91 (MQ=255) tGATAAAGATATCATTTAATAAGCTTATGTTATTTAGCAAGGCAAGCCACTCTCGATTCATGGCTTGCCTTATTTTATTGTATATTTTTaa > 1:1683829/1‑91 (MQ=255) tGATAAAGATATCATTTAATAAGCTTATGTTATTTAGCAAGGCAAGCCACTCTCGATTCATGGCTTGCCTTATTTTATTGTATATTTTTaa < 1:3987222/91‑1 (MQ=255) tGATAAAGATATCATTTAATAAGCTTATGTTATTTAGCAAGGCAAGCCACTCTCGATTAATGGCTTGCCTTATTTTATTGTATATTTTTaa > 1:6846463/1‑91 (MQ=255) gATAAAGATATCATTTAATAAGCTTATGTTATTTAGCAAGGCAAGCCACTCTCGATTCATGGCTTGCCTTATTTTATTGTATATTTTTAAt < 1:5279989/91‑1 (MQ=255) gATAAAGATATCATTTAATAAGCTTATGTTATTTAGCAAGGCAAGCCACTCTCGATTCATGGCTTGCCTTATTTTATTGTATATTTTTAAt < 1:6524384/91‑1 (MQ=255) aTAAAGATATCATTTAATAAGCTTATGTTATTTAGCAAGGCAAGCCACTCTCGATTCATGGCTTGCCTTATTTTATTGTATATTTTTAAtt < 1:3685105/91‑1 (MQ=255) aaaGATATCATTTAATAAGCTTATGTTATTTAGCAAGGCAAGCCACTCTCGATTCATGGCTTGCCTTATTTTATTGTATATTTTTAATTAt < 2:6909307/91‑1 (MQ=255) aaGATATCATTTAATAAGCTTATGTTATTTAGCAAGGCAAGCCACTCTCGATTCATGGCTTGCCTTATTTTATTGTATATTTTTAATTATc < 2:1280959/91‑1 (MQ=255) aaGATATCATTTAATAAGCTTATGTTATTTAGCAAGGCAAGCCACTCTCGATTCATGGCTTGCCTTATTTTATTGTATATTTTTAATTATc > 2:2259830/1‑91 (MQ=255) aGATATCATTTAATAAGCTTATGTTATTTAGCAAGGCAAGCCACTCTCGATTCATGGCTTGCCTTATTTTATTGTATATTTTTAATTATCg < 2:3256776/91‑1 (MQ=255) atCATTTAATAAGCTTATGTTATTTAGCAAGGCAAGCCACTCTCGATTCATGGCTTGCCTTATTTTATTGTATATTTTTAATTATCGTTGc > 2:4156330/1‑91 (MQ=255) atCATTTAATAAGCTTATGTTATTTAGCAAGGCAAGCCACTCTCGATTCATGGCTTGCCTTATTTTATTGTATATTTTTAATTATCGTTGc > 2:4385145/1‑91 (MQ=255) tCATTTAATAAGCTTATGTTATTTAGCAAGGCAAGCCACTCTCGATTCATGGCTTGCCTTATTTTATTGTATATTTTTAATTATCGTTGCt > 2:6445327/1‑91 (MQ=255) tCATTTAATAAGCTTATGTTATTTAGCAAGGCAAGCCACTCTCGATTCATGGCTTGCCTTATTTTATTGTATATTTTTAATTATCGTTGCt > 2:3729011/1‑91 (MQ=255) tCATTTAATAAGCTTATGTTATTTAGCAAGGCAAGCCACTCTCGATTCATGGCTTGCCTTATTTTATTGTATATTTTTAATTATCGTTGCt > 1:225731/1‑91 (MQ=255) cATTTAATAAGCTTATGTTATTTAGCAAGGCAAGCCACTCTCGATTCATGGCTTGCCTTATTTTATTGTATATTTTTAATTATCGTTGCTg > 1:1777903/1‑91 (MQ=255) cATTTAATAAGCTTATGTTATTTAGCAAGGCAAGCCACTCTCGATTCATGGCTTGCCTTATTTTATTGTATATTTTTAATTATCGTTGCTg > 1:1936808/1‑91 (MQ=255) cATTTAATAAGCTTATGTTATTTAGCAAGGCAAGCCACTCTCGATTCATGGCTTGCCTTATTTTATTGTATATTTTTAATTATCGTTGCTg < 2:5505323/91‑1 (MQ=255) aTTTAATAAGCTTATGTTGTTTAGCAAGGCAAGCCACGCTCGATTCCTGGCTGGCCTTATTTTATTGTATATTTTTAATTATCGTTGTTgg < 2:5983752/91‑1 (MQ=255) aTTTAATAAGCTTATGTTATTTAGCAAGGCAAGCCACTCTCGATTCATGGCTTGCCTTATTTTATTGTATATTTTTAATTATCGTTGCTgg > 1:3253342/1‑91 (MQ=255) aTTTAATAAGCTTATGTTATTTAGCAAGGCAAGCCACTCTCGATTCATGGCTTGCCTTATTTTATTGTATATTTTTAATTATCGTTGCTgg > 1:2000403/1‑91 (MQ=255) aTTTAATAAGCTTATGTTATTTAGCAAGGCAAGCCACTCTCGATTCATGGCTTGCCTTATTTTATTGTATATTTTTAATTATCGTTGCTgg > 2:2009001/1‑91 (MQ=255) tttAATAAGCTTATGTTATTTAGCAAGGCAAGCCACTCTCGATTCATGGCTTGCCTTATTTTATTGTATATTTTTAATTATCGTTGCTGGc > 1:4494981/1‑91 (MQ=255) tttAATAAGCTTATGTTATTTAGCAAGGCAAGCCACTCTCGATTCATGGCTTGCCTTATTTTATTGTATATTTTTAATTATCGTTGCTGGc > 2:5696642/1‑91 (MQ=255) ttAATAAGCTTATGTTATTTAGCAAGGCAAGCCACTCTCGATTCATGGCTTGCCTTATTTTATTGTATATTTTTAATTATCGTTGCTGGcc < 2:3910271/91‑1 (MQ=255) ataaGCTTATGTTATTTAGCAAGGCAAGCCACTCTCGATTCATGGCTTGCCTTATTTTATTGTATATTTTTAATTATCGTTGCTGGCCCtt > 2:3177728/1‑91 (MQ=255) aaGCTTATGTTATTTAGCAAGGCAAGCCACTCTCGATTCATGGCTTGCCTTATTTTATTGTATATTTTTAATTATCGTTGCTGGCCCttga < 1:5930716/91‑1 (MQ=255) aaGCTTATGTTATTTAGCAAGGCAAGCCACTCTCGATTCATGGCTTGCCTTATTTTATTGTATATTTTTAATTATCGTTGCTGGCCCttga > 2:1395434/1‑91 (MQ=255) gCTTATGTTATTTAGCAAGGCAAGCCACTCTCGATTCATGGCTTGCCTTATTTTATTGTATATTTTTAATTATCGTTGCTGGCCCttgatt > 1:5652265/1‑91 (MQ=255) cTTATGTTATTTAGCAAGGCAAGCCACTCTCGATTCATGGCTTGCCTTATTTTATTGTATATTTTTAATTATCGTTGCTGGCCCttgattg < 1:4662670/91‑1 (MQ=255) cTTATGTTATTTAGCAAGGCAAGCCACTCTCGATTCATGGCTTGCCTTATTTTATTGTATATTTTTAATTATCGTTGCTGGCCCttgattg > 1:6247012/1‑91 (MQ=255) ttATGTTATTTAGCAAGGCAAGCCACTCTCGATTCATGGCTTGCCTTATTTTATTGTATATTTTTAATTATCGTTGCTGGCCCttgattga > 2:560923/1‑91 (MQ=255) tATGTTATTTAGCAAGGCAAGCCACTCTCGATTCATGGCTTGCCTTATTTTATTGTATATTTTTAATTATCGTTGCTGGCCCTTGATTGAc > 2:6061128/1‑91 (MQ=255) tGTTATTTAGCAAGGCAAGCCACTCTCGATTCATGGCTTGCCTTATTTTATTGTATATTTTTAATTATCGTTGCTGGCCCTTGATTGACaa > 2:2604602/1‑91 (MQ=255) ttATTTAGCAAGGCAAGCCACTCTCGATTCATGGCTTGCCTTATTTTATTGTATATTTTTAATTATCGTTGCTGGCCCTTGATTGACAATc > 2:69766/1‑91 (MQ=255) tttAGCAAGGCAAGCCACTCTCGATTCATGGCTTGCCTTATTTTATTGTATATTTTTAATTATCGTTGCTGGCCCTTGATTGACAATCGTa < 1:4156330/91‑1 (MQ=255) ttAGCAAGGCAAGCCACTCTCGATTCATGGCTTGCCTTATTTTATTGTATATTTTTAATTATCGTTGCTGGCCCTTGATTGACAATCGTAt > 1:283581/1‑91 (MQ=255) gcaaggcaagCCACTCTCGATTCATGGCTTGCCTTATTTTATTGTATATTTTTAATTATCGTTGCTGGCCCTTGATTGACAATCGTATTaa < 2:4888522/91‑1 (MQ=255) AAGGCAAGCCCCTCTCGATTCATGGCTTGCCTTATTTTATTGTATATTTTTAATTATAGTTGCTGGCCCTTGATTGACAATCGTATTaaaa > 1:6963519‑M1/1‑91 (MQ=255) AAGGCAAGCCACTCTCGATTCATGGCTTGCCTTATTTTATTGTATATTTTTAATTATCGTTGCTGGCCCTTGATTGACAATCGTATTaaaa > 1:4581919‑M1/1‑91 (MQ=255) AAGGCAAGCCACTCTCGATTCATGGCTTGCCTTATTTTATTGTATATTTTTAATTATCGTTGCTGGCCCTTGATTGACAATCGTATTaaaa < 2:1734999‑M1/91‑1 (MQ=255) AAGGCAAGCCACTCTCGATTCATGGCTTGCCTTATTTTATTGTATATTTTTAATTATCGTTGCTGGCCCTTGATTGACAATCGTATTaaaa > 2:3402545‑M1/1‑91 (MQ=255) AAGGCAAGCCACTCTCGATTCATGGCTTGCCTTATTTTATTGTATATTTTTAATTATCGTTGCTGGCCCTTGATTGACAATCGTATTaaaa > 2:4609806‑M1/1‑91 (MQ=255) | TCGTTGGATGTTACATGGTCAAGACTATACTGCAATCCAACAATAATGTTATTGATAAAGATATCATTTAATAAGCTTATGTTATTTAGCAAGGCAAGCCACTCTCGATTCATGGCTTGCCTTATTTTATTGTATATTTTTAATTATCGTTGCTGGCCCTTGATTGACAATCGTATTAAAA > USA300TCH1516_ALE/2731159‑2731339 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |