New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | = 161203 | 321 (0.900) | 18 (0.050) | 11/150 | NT | 5.3% | coding (730/816 nt) | phnE_1 | Phosphate‑import permease protein PhnE |
? | USA300TCH1516_ALE | = 161213 | 338 (1.010) | coding (720/816 nt) | phnE_1 | Phosphate‑import permease protein PhnE |
Only 100 of 417 total aligned reads displayed.
AATACGTTTTCGGATTGAACCGGAAATTAAATCGACAATTGCGACCATTAGTACTAAACCGATTAATATAATACCTACACGGTCCCAAGAACGTGTTTGAATGGCAAATATGAGTGGTGTCCCGATACCACCAGCCCCAATTAGCCCCAGTATAGAAGCTGAACGTAAGTTTAGTTCAAAG > USA300TCH1516_ALE/161123‑161303 | aTACGTTTTCGGATTGAACCGGAAATTAAATCGACAATTGCGACCATTAGTACTAAACCGATTAATATAATACCTACACGGTCCCAAGAAc > 1:6788014‑M2/1‑90 (MQ=255) aTACGTTTTCGGATTGAACCGGAAATTAAATCGACAATTGCGACCATTAGTACTAAACCGATTAATATAATACCTACACGGTCCCAAGAAc > 2:2896472‑M2/1‑90 (MQ=255) tACGTTTTCGGATTGAACCGGAAATTAAATCGACAATTGCGACCATTAGTACTAAACCGATTAATATAATACCTACACGGTCCCAAGAAcg > 2:6060923‑M2/1‑89 (MQ=255) tACGTTTTCGGATTGAACCGGAAATTAAATCGACAATTGCGACCATTAGTACTAAACCGATTAATATAATACCTACACGGTCCCAAGAAcg > 1:4254795‑M2/1‑89 (MQ=255) aCGTTTTCGGATTGAACCGGAAATTAAATCGACAATTGCGACCATTAGTACTAAACCGATTAATATAATACCTACACGGTCCCAAGAAcgt < 1:6357574‑M2/91‑4 (MQ=255) aCGTTTTCGGATTGAACCGGAAATTAAATCGACAATTGCGACCATTAGTACTAAACCGATTAATATAATACCTACACGGTCCCAAGAAcgt < 2:4244287‑M2/91‑4 (MQ=255) ttttCGGATTGAACCGGAAATTAAATCGACAATTGCGACCATTAGTACTAAACCGATTAATATAATACCTACACGGTCCCAAGAACGTGtt > 2:5022589/1‑91 (MQ=255) aTTGAACCGGAAATTAAATCGACAATTGCGACCATTAGTACTAAACCGATTAATATAATACCTACACGGTCCCAAGAACGTGTTTGAATgg < 1:2065226/91‑1 (MQ=255) aTTGAACCGGAAATTAAATCGACAATTGCGACCATTAGTACTAAACCGATTAATATAATACCTACACGGTCCCAAGAACGTGTTTGAATgg < 2:320145/91‑1 (MQ=255) aTTGAACCGGAAATTAAATCGACAATTGCGACCATTAGTACTAAACCGATTAATATAATACCTACACGGTCCCAAGAACGTGTTTGAATgg > 1:2828417/1‑91 (MQ=255) aTTGAACCGGAAATTAAATCGACAATTGCGACCATTAGTACTAAACCGATTAATATAATACCTACACGGTCCCAAGAACGTGTTTGAATgg < 2:6249786/91‑1 (MQ=255) aTTGAACCGGAAATTAAATCGACAATTGCGACCATTAGTACTAAACCGAGTAATATAATACCTACACGGTCCCAAGAACGTGTTTGAATgg < 2:2650603/91‑1 (MQ=255) ttGAACCGGAAATTAAATCGACAATTGCGACCATTAGTACTAAACCGATTAATATAATACCTACACGGTCCCAAGAACGTGTTTGAATGGc > 1:403995/1‑91 (MQ=255) ttGAACCGGAAATTAAATCGACAATTGCGACCATTAGTACTAAACCGATTAATATAATACCTACACGGTCCCAAGAACGTGTTTGAATGGc > 2:5263901/1‑91 (MQ=255) ttGAACCGGAAATTAAATCGACAATTGCGACCATTAGTACTAAACCGATTAATATAATACCTACACGGTCCCAAGAACGTGTTTGAATGGc > 1:5616798/1‑91 (MQ=255) tGAACCGGAAATTAAATCGACAATTGCGACCATTAGTACTGAACCGATTAATATAATACCTACACGGTCCCAAGAACGTGTTTGAATGGCa > 2:5600896/1‑91 (MQ=255) tGAACCGGAAATTAAATCGACAATTGCGACCATTAGTACTAAACCGATTAATATAATACCTACACGGTCCCAAGAACGTGTTTGAATGGCa < 1:2443574/91‑1 (MQ=255) tGAACCGGAAATTAAATCGACAATTGCGACCATTAGTACTAAACCGATTAATATAATACCTACACGGTCCCAAGAACGTGTTTGAATGGCa < 1:3959779/91‑1 (MQ=255) tGAACCGGAAATTAAATCGACAATTGCGACCATTAGTACTAAACCGATTAATATAATACCTACACGGTCCCAAGAACGTGTTTGAATGGCa < 1:6873191/91‑1 (MQ=255) tGAACCGGAAATTAAATCGACAATTGCGACCATTAGTACTAAACCGATTAATATAATACCTACACGGTCCCAAGAACGTGTTTGAATGGCa > 1:2513087/1‑91 (MQ=255) aaCCGGAAATTAAATCGACAATTGCGACCATTAGTACTAAACCGATTAATATAATACCTACACGGTCCCAAGAACGTGTTTGAATGGCaaa < 2:6578536/91‑1 (MQ=255) ccGGAAATTAAATCGACAATTGCGACCATTAGTACTAAACCGATTAATATAATACCTACACGGTCCCAAGAACGTGTTTGAATGGCAAata > 2:4954267/1‑91 (MQ=255) ccGGAAATTAAATCGACAATTGCGACCATTAGTACTAAACCGATTAATATAATACCTACACGGTCCCAAGAACGTGTTTGAATGGCAAata < 1:5258059/91‑1 (MQ=255) cGGAAATTAAATCGACAATTGCGACCATTAGTACTAAACCGATTAATATAATACCTACACGGTCCCAAGAACGTGTTTGAATGGCAAatat > 1:4743643/1‑91 (MQ=255) ggAAATTAAATCGACAATTGCGACCATTAGTACTAAACCGATTAATATAATACCTACACGGTCCCAAGAACGTGTTTGAATGGCAAATATg < 1:788878/91‑1 (MQ=255) ggAAATTAAATCGACAATTGCGACCATTAGTACTAAACCGATTAATATAATACCTACACGGTCCCAAGAACGTGTTTGAATGGCAAATATg < 1:1590667/91‑1 (MQ=255) aaaTTAAATCGACAATTGCGACCATTAGTACTAAACCGATTAATATAATACCTACACGGTCCCAAGAACGTGTTTGAATGGCAAATATGAg < 1:2307088/91‑1 (MQ=255) aaTTAAATCGACAATTGCGACCATTAGTACTAAACCGATTAATATAATACCTACACGGTCCCAAGAACGTGTTTGAATGGCAAATATGAgt > 2:1738005/1‑91 (MQ=255) aTTAAATCGACAATTGCGACCATTAGTACTAAACCGATTAATATAATACCTACACGGTCCCAAGAACGTGTTTGAATGGCAAATATGAgtg < 2:3362015/91‑1 (MQ=255) ttAAATCGACAATTGCGACCATTAGTACTAAACCGATTAATATAATACCTACACGGTCCCAAGAACGTGTTTGAATGGCAAATATGAgtgg < 2:5349207/91‑1 (MQ=255) ttAAATCGACAATTGCGACCATTAGTACTAAACCGATTAATATAATACCTACACGGTCCCAAGAACGTGTTTGAATGGCAAATATGAgtgg > 2:925212/1‑91 (MQ=255) ttAAATCGACAATTGCGACCATTAGTACTAAACCGATTAATATAATACCTACACGGTCCCAAGAACGTGTTTGAATGGCAAATATGAgtgg > 1:118959/1‑91 (MQ=255) aaTCGACAATTGCGACCATTAGTACTAAACCGATTAATATAATACCTACACGGTCCCAAGAACGTGTTTGAATGGCAAATATGAGTGgtgt > 1:1958246/1‑91 (MQ=255) aTCGACAATTGCGACCATTAGTACTAAACCGATTAATATAATACCTACACGGTCCCAAGAACGTGTTTGAATGGCAAATATGAGTGGTGTc < 1:877733/91‑1 (MQ=255) aTCGACAATTGCGACCATTAGTACTAAACCGATTAATATAATACCTACACGGTCCCAAGAACGTGTTTGAATGGCAAATATGAGTGGTGTc < 2:3013689/91‑1 (MQ=255) aTCGACAATTGCGACCATTAGTACTAAACCGATTAATATAATACCTACACGGTCCCAAGAACGTGTTTGAATGGCAAATATGAGTGGTGTc > 1:6179268/1‑91 (MQ=255) tCGACAATTGCGACCATTAGTACTAAACCGATTAATATAATACCTACACGGTCCCAAGAACGTGTTTGAATGGCAAATATGAGTGGTGTcc > 1:3503410/1‑91 (MQ=255) cGACAATTGCGACCATTAGTACTAAACCGATTAATATAATACCTACACGGTCCCAAGAACGTGTTTGAATGGCAAATATGAGTGGTGTccc > 2:2783257/1‑91 (MQ=255) aCAATTGCGACCATTAGTACTAAACCGATTAATATAATACCTACACGGTCCCAAGAACGTGTTTGAATGGCAAATATGAGTGGTGTCCCGa > 1:1485957/1‑91 (MQ=255) ttGCGACCATTAGTACTAAACCGATTAATATAATACCTACACGGTCCCAAGAACGTGTTTGAATGGCAAATATGAGTGGTGTCCCGATacc < 2:1513308/91‑1 (MQ=255) tGCGACCATTAGTACTAAACCGATTAATATAATACCTACACGGTCCCAAGAACGTGTTTGAATGGCAAATATGAGTGGTGTCCCGATacca > 1:982759/1‑91 (MQ=255) gACCATTAGTACTAAACCGATTAATATAATACCTACACGGTCCCAAGAACGTGTTTGAATGGCAAATATGAGTGGTGTCCCGATAccacca > 1:1803964/1‑91 (MQ=255) gACCATTAGTACTAAACCGATTAATATAATACCTACACGGTCCCAAGAACGTGTTTGAATGGCAAATATGAGTGGTGTCCCGATAccacca > 2:4324237/1‑91 (MQ=255) ccATTAGTACTAAACCGATTAATATAATACCTACACGGTCCCAAGAACGTGTTTGAATGGCAAATATGAGTGGTGTCCCGATACCACCAGc < 1:6845170/91‑1 (MQ=255) cATTAGTACTAAACCGATTAATATAATACCTACACGGTCCCAAGAACGTGTTTGAATGGCAAATATGAGTGGTGTCCCGATACCACCAGcc > 2:3613036/1‑91 (MQ=255) cATTAGTACTAAACCGATTAATATAATACCTACACGGTCCCAAGAACGTGTTTGAATGGCAAATATGAGTGGTGTCCCGATACCACCAGcc < 1:3777715/91‑1 (MQ=255) aGTACTAAACCGATTAATATAATACCTACACGGTCCCAAGAACGTGTTTGAATGGCAAATATGAGTGGTGTCCCGATACCACCAGCCCCaa < 1:5755690/91‑1 (MQ=255) gTACTAAACCGATTAATATAATACCTACACGGTCCCAAGAACGTGTTTGAATGGCAAATATGAGTGGTGTCCCGATACCACCAGCCCCAAt < 1:3874677/91‑1 (MQ=255) aCTAAACCGATTAATATAATACCTACACGGTCCCAAGAACGTGTTTGAATGGCAAATATGAGTGGTGTCCCGATACCACCAGCCCCAATTa > 2:5880230/1‑91 (MQ=255) aCTAAACCGATTAATATAATACCTACACGGTCCCAAGAACGTGTTTGAATGGCAAATATGAGTGGTGTCCCGATACCACCAGCCCCAATTa > 2:6703641/1‑91 (MQ=255) cTAAACCGATTAATATAATACCTACACGGTCCCAAGAACGTGTTTGAATGGCAAATATGAgtg > 2:5813081/1‑63 (MQ=255) tAAACCGATTAATATAATACCTACACGGTCCCAAGAACGTGTTTGAATGGCAAATATGAGTGGTGTCCCGATACCACCAGCCCCAATTAGc < 2:1899742/91‑1 (MQ=255) aaaCCGATTAATATAATACCTACACGGTCCCAAGAACGTGTTTGAATGGCAAATATGAGTGGTGTCCCGATACCACCAGCCCCAATTAGcc > 2:3427747/1‑91 (MQ=255) aaaCCGATTAATATAATACCTACACGGTCCCAAGAACGTGTTTGAATGGCAAATATGAGTGGTGTCCCGATACCACCAGCCCCAATTAGcc < 2:4114529/91‑1 (MQ=255) aaaCCGATTAATATAATACCTACACGGTCCCAAGAACGTGTTTGAATGGCAAATATGAGTGGTGTCCCGATACCACCAGCCCCAATTAGcc > 1:1002128/1‑91 (MQ=255) aaaCCGATTAATATAATACCTACACGGTCCCAAGAACGTGTTTGAATGGCAAATATGAGTGGTGTCCCGATACCACCAGCCCCAATTAGcc > 2:6543407/1‑91 (MQ=255) aaaCCGATTAATATAATACCTACACGGTCCCAAGAACGTGTTTGAATGGCAAATATGAGTGGTGTCCCGATACCACCAGCCCCAATTAGcc > 1:1346395/1‑91 (MQ=255) aaCCGATTAATATAATACCTACACGGTCCCAAGAACGTGTTTGAATGGCAAATATGAGTGGTGTCCCGATACCACCAGCCCCAATTAGccc < 1:2768860/91‑1 (MQ=255) aaCCGATGAATATAATACCTACACGGTCCCAAGAACGTCTTTGAATGGCAAATATGAGTGGTGTCCCGATACCACCAGCCCCAATTAGccc > 1:6734673/1‑91 (MQ=255) aCCGATTAATATAATACCTACACGGTCCCAAGAACGTGTTTGAATGGCAAATATGAGTGGTGTCCCGATACCACCAGCCCCAAt > 1:4324985/1‑84 (MQ=255) aCCGATTAATATAATACCTACACGGTCCCAAGAACGTGTTTGAATGGCAAATATGAGTGGTGTCCCGATACCACCAGCCCCAATTAGcccc < 1:3613036/91‑1 (MQ=255) gATTAATATAATACCTACACGGTCCCAAGAACGTGTTTGAATGGCAAATATGAGTGGTGTCCCGATACCACCAGCCCCAATTAGCCCCAGt < 2:1567767/91‑1 (MQ=255) gATTAATATAATACCTACACGGTCCCAAGAACGTGTTTGAATGGCAAATATGAGTGGTGTCCCGATACCACCAGCCCCAATTAGCCCCAGt > 1:3311150/1‑91 (MQ=255) ttAATATAATACCTACACGGTCCCAAGAACGTGTTTGAATGGCAAATATGAGTGGTGTCCCGATACCACCAGCCCCAATTAGCCCCAGtat > 2:1990993/1‑91 (MQ=255) taatataataCCTACACGGTCCCAAGAACGTGTTTGAATGGCAAATATGAGTGGTGTCCCGATACCACCAGCCCCAATTAGCCCCAGtata > 1:2193062/1‑91 (MQ=255) taatataataCCTACACGGTCCCAAGAACGTGTTTGAATGGCAAATATGAGTGGTGTCCCGATACCACCAGCCCCAATTAGCCCCAGtata < 1:5991562/91‑1 (MQ=255) aatataataCCTACACGGTCCCAAGAACGTGTTTGAATGGCAAATATGAGTGGTGTCCCGATACCACCAGCCCCAATTAGCCCCAGTATAg < 2:2250425/91‑1 (MQ=255) aatataataCCTACACGGTCCCAAGAACGTGTTTGAATGGCAAATATGAGTGGTGTCCCGATACCACCAGCCCCAATTAGCCCCAGTATAg < 2:4306149/91‑1 (MQ=255) atataataCCTACACGGTCCCAAGAACGTGTTTGAATGGCAAATATGAGTGGTGTCCCGATACCACCAGCCCCAATTAGCCCCAGTATAGa > 2:5698905/1‑91 (MQ=255) atataataCCTACACGGTCCCAAGAACGTGTTTGAATGGCAAATATGAGTGGTGTCCCGATACCACCAGCCCCAATTAGCCCCAGTATAGa > 2:368263/1‑91 (MQ=255) ataataCCTACACGGTCCCAAGAACGTGTTTGAATGGCAAATATGAGTGGTGTCCCGATACCACCAGCCCCAATTAGCCCCAGTATAGAAg > 1:512375/1‑91 (MQ=255) ataCCTACACGGTCCCAAGAACGTGTTTGAATGGCAAATATGAGTGGTGTCCCGATACCACCAGCCCCAATTAGCCCCAGTATAGAAGCTg > 2:2547367/1‑91 (MQ=255) cTACACGGTCCCAAGAACGTGTTTGAATGGCAAATATGAGTGGTGTCCCGATACCACTAGCCCCAATTAGCCCCAGTATAGAAGCTGAACg < 2:1092448/91‑1 (MQ=255) cTACACGGTCCCAAGAACGTGTTTGAATGGCAAATATGAGTGGTGTCCCGATACCACCAGCCCCAATTAGCCCCAGTATAGAAGCTGAACg > 1:1893774/1‑91 (MQ=255) cTACACGGTCCCAAGAACGTGTTTGAATGGCAAATATGAGTGGTGTCCCGATACCACCAGCCCCAATTAGCCCCAGTATAGAAGCTGAACg < 2:1372969/91‑1 (MQ=255) acacGGTCCCAAGAACGTGTTTGAATGGCAAATATGAGTGGTGTCCCGATACCACCAGCCCCAATTAGCCCCAGTATAGAAGCTGAACGTa < 1:4541718/91‑1 (MQ=255) acacGGTCCCAAGAACGTGTTTGAATGGCAAATATGAGTGGTGTCCCGATACCACCAGCCCCAATTAGCCCCAGTATAGAAGCTGAACGTa < 1:5491250/91‑1 (MQ=255) acacGGTCCCAAGAACGTGTTTGAATGGCAAATATGAGTGGTGTCCCGATACCACCAGCCCCAATTAGCCCCAGTATAGAAGCTGAACGTa > 2:4846354/1‑91 (MQ=255) acGGTCCCAAGAACGTGTTTGAATGGCAAATATGAGTGGTGTCCCGATACCACCAGCCCCaa < 1:2603995/62‑1 (MQ=255) acGGTCCCAAGAACGTGTTTGAATGGCAAATATGAGTGGTGTCCCGATACCACCAGCCCCAATTAGCCCCAGTATAGAAGCTGAACGTAAg < 2:732188/91‑1 (MQ=255) cGGTCCCAAGAACGTGTTTGAATGGCAAATATGAGTGGTGTCCCGATACCACCAGCCCCAATTAGCCCCAGTATAGAAGCTGAACGTAAGt > 1:5910510/1‑91 (MQ=255) ggTCCCAAGAACGTGTTTGAATGGCAAATATGAGTGGTGTCCCGATACCACCAGCCCCAATTAGCCCCAGTATAGAAGCTGAACGTAAGtt < 1:5018813/91‑1 (MQ=255) ggTCCCAAGAACGTGTTTGAATGGCAAATATGAGTGGTGTCCCGATACCACCAGCCCCAATTAGCCCCAGTATAGAAGCTGAACGTAAGtt < 2:399931/91‑1 (MQ=255) tCCCAAGAAcgtgtaggtattatattaatcggtttagtactaatggtcgcaattgtcgatttaatttccggttcaatccgaaaacgtattg < 1:3129450‑M2/91‑83 (MQ=255) cccAAGAAcgtgtaggtattatattaatcggtttagtactaatggtcgcaattgtcgatttaatttccggttcaatccgaaaacgtattgt < 2:4610439‑M2/91‑84 (MQ=255) cccAAGAAcgtgtaggtattatattaatcggtttagtactaatggtcgcaattgtcgatttaatatccggttcaatccgaaaacgtattgt < 2:6889644‑M2/91‑84 (MQ=255) cccAAGAACGTGTTTGAATGGCAAATATGAGTGGTGTCCCGATACCACCAGCCCCAATTAGCCCCAGTATAGAAGCTGAACGTAAGTTTAg > 2:1182883/1‑91 (MQ=255) ccAAGAAcgtgtaggtattatattaatcggtttagtactaatggtcgcaattgtcgatttaatttccggttcaatccgaaaacgtattgtt < 1:3992834‑M2/91‑85 (MQ=255) cAAGAACGTGTTTGAATGGCAAATATGAGTGGTGTCCCGATACCACCAGCCCCAATTa < 2:385663/58‑1 (MQ=255) cAAGAACGTGTTTGAATGGCAAATATGAGTGGTGTCCCGATACCACCAGCCCCAATTAGCCCCAGTATAGAAGCTGAACGTAAGTTTAGtt > 1:2935111/1‑91 (MQ=255) cAAGAACGTGTTTGAATGGCAAATATGAGTGGTGTCCCGATACCACCAGCCCCAATTAGCCCCAGTATAGAAGCTGAACGTAAGTTTAGtt > 2:3491573/1‑91 (MQ=255) cAAGAACGTGTTTGAATGGCAAATATGAGTGGTGTCCCGATACCACCAGCCCCAATTAGCCCCAGTATAGAAGCTGAACGTAAGTTTAGtt > 2:4729275/1‑91 (MQ=255) aGAACGTGTTTGAATGGCAAATATGAGTGGTGTCCCGATACCACCAGCCCCAATTAGCCCCAGTATAGAAGCTGAACGTAAGTTTAGTTCa > 2:6165029/1‑91 (MQ=255) aGAACGTGTTTGAATGGCAAATATGAGTGGTGTCCCGATACCACCAGCCCCAATTAGCCCCAGTATAGAAGCTGAACGTAAGTTTAGTTCa > 1:1390869/1‑91 (MQ=255) gAACGTGTTTGAATGGCAAATATGAGTGGTGTCCCGATACCACCAGCCCCAATTAGCCCCAGTATAGAAGCTGAACGTAAGTTTAGTTCaa > 1:65206/1‑91 (MQ=255) gAACGTGTTTGAATGGCAAATATGAGTGGTGTCCCGATACCACCAGCCCCAATTAGCCCCAGTATAGAAGCTGAACGTAAGTTTAGTTCaa < 2:6754860/91‑1 (MQ=255) aaCGTGTTTGAATGGCAAATATGAGTGGTGTCCCGATACCACCAGCCCCACTTAGCCCCAGTATAGAAGCTGAACGTAAGTTTAGTTCaaa < 2:4467890/91‑1 (MQ=255) aaCGTGTTTGAATGGCAAATATGAGTGGTGTCCCGATACCACCAGCCCCAATTAGCCCCAGTATAGAAGCTGAACGTAAGTTTAGTTCaaa > 1:6100591/1‑91 (MQ=255) aaCGTGTTTGAATGGCAAATATGAGTGGTGTCCCGATACCACCAGCCCCAATTAGCCCCAGTATAGAAGCTGAACGTAAGTTTAGTTCaaa < 1:3673802/91‑1 (MQ=255) aCGTGTTTGAATGGCAAATATGAGTGGTGTCCCGATACCACCAGCCCCAATTAGCCCCAGTATAGAAGCTGAACGTAAGTTTAGTTCAAAg < 2:6357574/91‑1 (MQ=255) | AATACGTTTTCGGATTGAACCGGAAATTAAATCGACAATTGCGACCATTAGTACTAAACCGATTAATATAATACCTACACGGTCCCAAGAACGTGTTTGAATGGCAAATATGAGTGGTGTCCCGATACCACCAGCCCCAATTAGCCCCAGTATAGAAGCTGAACGTAAGTTTAGTTCAAAG > USA300TCH1516_ALE/161123‑161303 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |